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pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-122 |
Genomic Coordinates | chr18: 58451074 - 58451158 |
Synonyms | MIR122A, MIRN122, MIRN122A, hsa-mir-122, miRNA122, miRNA122A, MIR122 |
Description | Homo sapiens miR-122 stem-loop |
Comment | The mature sequence shown here represents the most commonly cloned form from large-scale cloning studies . |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Associated Diseases | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-122-5p | |||||||||||||||||||||
Sequence | 15| UGGAGUGUGACAAUGGUGUUUG |36 | |||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||
Experiments | Cloned | |||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
miRNAs in Extracellular Vesicles |
Circulating MicroRNA Expression Profiling | Circulating MicroRNA Expression Profiling |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | ZFP14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ZNF531 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | ZFP14 zinc finger protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_020917 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on ZFP14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of ZFP14 (miRNA target sites are highlighted) |
>ZFP14|NM_020917|3'UTR 1 TAGAAGAAAGCCTTCAAATGTATATGATGTTACAGAACATCAGAAAATTCATTTTTGAGAAAATGTGTTTCATGCTCAAT 81 TCCAAGCATAATAAATTTTATATTAGAGAAAGAATATGTTGATTTAAAAGCCTTCCAACACCATTTAAACATGGTTTATC 161 TTCAGCAAATTCCTATGAGAGAATAATGTAATGAATGTAGGAAAATCTTTAGCCTTATCTGTCATTATCTCCCTTTCTCC 241 ACTTGATTACCAGTTTGATTTATTGGACAAGATACTAAGCTTCTGTGCCTCATTTTGCTGACTTGTAAAATGGTAATAAT 321 AGTACTTATATGTATTAGTTATTTATTGCTGCGTAATAAATTACCACAGACTTAGTAGCATAAAATAACATATAATTATA 401 TCTTATAATTTGGATCAGGAGTATAGGCATGACTTAGTTGGGTCCTCTGCTTCAGGGTCTCTTGCAAGGCTACAGATTTC 481 AGCCAGGGCTGAGGTCTCATCTGAAGGCTCAACTGGGGAAGGATCCACATCCAGACTAACATAGTTGTTACCCAATGTAT 561 TTCCGTGAGGCCTGTTGCATTGAGATTCTCAGTTTCTAGCTGGCTGTTGGCTGAACGCTGACTGCAGCTCCTGGCCACAA 641 TAGCCTCATCAACATGGCTGCTTGCTTCATCAAGGCATGCAAGCCAAAAGGGAGGACAGTCTGCTAGCAAGATGGAAGTT 721 ACCATCTTGTGTAATCTAATCATGGAAGTAACATTCCCTCACCTTCTACTGGTAGAAGTAAGTTACTAGGATAGTCCACA 801 CTCAAGAGAACGGGATGATACAAGAGTGTGAATAAGTCCTGGAGACAGGACCACTGGGGGGCCTGTTTAGAGTCAGCCTG 881 CCACACTGTGGAATAGGATTGTTGCAAGGAGTAAGTAGTTAATACTTGGAGGAATCACAGTCATATAGCATGTATTCTGT 961 AAATATTATCTGTAATTGTTATTATTGTCATTAGTATTAGTGAATTCACGTAAAAGGAAGATCTGTAGACATAATAAATG 1041 TAGAAATGCCTCCTGTCACCTCTCAGAAATTATTAAACATAATTTATTCTAGGTAAAATTTAGATTGTAGTGAATGTAGG 1121 AAGTTCTTCAGCACTTGAGCTGCATTAGAAATTTCATGCCAAAAATGAATTTCATGAATGTGAGGTCACTAGTAATACAG 1201 CTGTTGAAGAATTAGAGGGAAATAGGAAATGATTTTCCCATAATTCCAGAAAGCAAAAGGCTTACAATCCCTGTTGTCTG 1281 ACCACAGTTTAAAATTAATTAGAAACTATCAAAAATGTGGCTTAAAAGAAATTAACCACCTAGGAATTTAATATTGTTGT 1361 GTATATTTATGTGTGTGTATAAAACTCCTGTGGGAAAGAAACAAAACATCATTCTATAAGTCAGTATACTTTTGGATGCT 1441 CAAAATGCCATATCTTCAACCAGTAGGAGTTGTTTCAAGTTGAGTTTTTGATGTGATCCCACCAATAATTTGATAGTTTA 1521 CTTGATTGTGGCTGCATAATTTGGTAACCTATGAAAGATGCTAGAGCACCAATGTATAATTTTTTTGAGACAGGGTGTCA 1601 CTTTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTACAAGCACAGTTCACTGTACCCTGTTCCTCCTGGGCTCAAGTGATTCTTCC 1681 ACCTAAATTTTTTTTTTTTTTTTAGAGAAAGGGTCTCACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGGGCTCAAGTGA 1761 TCCTCCCTCCTTGGCCTCCAAAGGTGCTGGGGTTACAGGTATGAGCCACCACACCCAGCCCAACTCATTATTCTTGAAAT 1841 CAATAAATCAGAGGAAAAATTGTCATTTAGTTTCCTTTTCCCATGTGAACCAAATTTCAGGGTCACCAGAAGTTCATCAA 1921 ATTCAAATGAATTTGGCCTGGCACAGGGGTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGACAAGGTGGGTGGATCACTTG 2001 AGGCCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGTTAACATGGTGAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAATTTAGCCAGGCATGG 2081 TGGCACACACCTGTAGTCCCAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAAGAGGCAGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATCG 2161 TGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAATTTGTTTTTTGAATGGGTTTTTCTTT 2241 TTTGAAGAAGTCTAATAAATCTAGAAGGAATTAGAGGATTAGAAAAATCACCATTTTCTAGACCTTAATGGAATAATGGG 2321 TCCAGAAAACATGATCTTCAATGGGTACTACAACTAATAGGTGAAATATTTTATAGCGAGATTTTTATGGTGGATCTATC 2401 AAACTGGCCACCTCTGAACCCTTTGATCTGTTTTAACCTTAATAAAAATGGGTCTATCAGACAACACACTTCCTGACGTA 2481 ATGCAATAGGAAGTCCACACCACCATCTACAAAGCCTTATTGCTGGAATAATGAACTGAAAGCAGACAGGGACTAGATGA 2561 ACAGTATATGGTCATCCCTTGGTATCCATGGGGAATTGGTTCCAGGATCCTCCACTGATGGTAAAATCTGAGGATGCTCA 2641 AGTCCCTTGTATAAAATGGCATAGTATGTATTTGCATATTACCTACTCACATCTTCCTGTATACTTTAAATTATCTTTAG 2721 ATCACTTATACCTATCACAATGTAAATACTATGTAAATAGTTGTTATACTGTATTTTTCAATTTGCATTATTTTTATTGT 2801 ATTTTATTTTTATTGTTTTTTTTTGAGTATTTTCTATTTGAGATTGGTTGAATCTGCACATATGGAGGGCTGGCTATAAA 2881 GGGCACCACAAGGAAGAAGCCAAACAGATCCAGAATGTGTGAAATTCTACAGAGCAAATTACCTGATTTCTTCAACTAAC 2961 AGGTAGCATGAAAATACAAGGGGAAGGGCAACCATTAACAGATTAAAAGAGACTTAAAGAGACATATCAACTAAATTCAG 3041 TATGTTGGCATTACTTGGACCTGGTTTGAACAAAACATAAAAAGCCATTTTGGAGACAGTGAGGGAAGTGTGGACATGGA 3121 CTAAATATTAAATGATATTTACATATATTAATTTGGTTAGGGATTATGTCAGTGTGATTATAAAAAATAAAAGATCGTAT 3201 GATATGAGATACATACTATGAAATGAAGATAGACACATTTGGATTAAAATATTCTAGCAAAAGAAATAATTGGCAAAGAG 3281 AGCTGGAAACTAAATTGGCAACATGTTGATAATTTAAGTGGAGTGTTTTGTTCATGGAGACTTATTGTTCTAATATTTCT 3361 ACTTTTGTATGTGTTTGAAATTTCAATAATAAAATGTTTAAAATCAAAACCAAAATTATAGACTATGTAGAAATGAATGA 3441 CAGTGAGATGCCTGCACATCTAACCTTGTCAGATATAATCAAAGTTCTGTTCAGTGACAAATTAATGCCCTGTAATGTGG 3521 TAAGGAAATCTTATTTGTGGATACAGTCTTCATCTTCTTCACTTACCCACAGCAGCAACACCAGGCCTGTCACACAGATG 3601 AATGTGTTGAGGGAATGAATAAGTATTTCCGTCAAGAAAAAGGAAACAACAAAATAAAACCAACCCAAGTAAAGAACAGC 3681 CAAGTGGCCAGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCATGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCGGG 3761 ATTTTGAGACCAGCCTGACCAACACTGAGAAACCCCATCTCTATTAAAGATACAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATG 3841 CCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAATCACTTGAATCCAGGAGGCGGAGTTTGTGGTGAGTTGAGAT 3921 CGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGAGCAAGAGTCTGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAACAGCCAAGTAA 4001 CAGTAGAAAGTAGAAATTAAGAGAATGGAGAATATTAGACTTGATTCAATGTTAATAGTGATTAGATTTTGGCAGTTATA 4081 ATCAAGGAAGAGAAAATGAAAGATAATACATTTAGAGTATTAATGATGATAAAAGAGACACAACTCTAGATTATATCAAG 4161 CAGATTTTTAAAATTATAAGGCAAAACTAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAACCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 4241 GTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATAGCAAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAA 4321 AATTAGCCTGTCATGGTGGCGGGCACCTGTAATCTAAGCTACTGGGGAGCCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 4401 GGCAGAGGTTGCGGTGAACCAAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTGTCTCAAAAATAAT 4481 AAACATAATATGGTAAAACTATACATGCACACATGCACAAACGTGTATATTCATTCCAGTACAAGTAAAAATGTAGGATT 4561 GCATTTTTCCCCCAAAAGGAATATGTTTTACAATTAACTCACCGTATAACCCAAATAGATTAACAAAAAATGTGTGTGTG 4641 TGTGTGTGTGTGTGAACTCCCTGTTTAAAAAATCTGATACTTATAAAAACTTTAAGGAATAGATAATCCTAAAGATTTTA 4721 CCAATTAATTCTGCAAGGTAAAATAATCCTAATAAAAATTAGATGAAGATAGTTTCTGAAAGCAAATTCTAGACCACCTT 4801 CATTATGAAGATTCTATTTTTCACAATTCTAAATAAAGTTTATTTAGAATTTATTACAAAATCTATCTTTGCTAATAGGT 4881 CAGTGTTTCTTTTCCCAAGCACCAAATACCTCCAGAAAGCCTGTGTTTGACCCCTAAATTCAACATTCTCCAGAAGTTTG 4961 CTTCAAGGAATATTAATTCTCGATGGTATTTGAAAAAAAGATTTCTTGGGAAAATAGGCAAATGAAGCAAAACATAAAAC 5041 ATCTACTTTTGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACATTTTGGGAGGCCAAGGCGAGCAGATCACTTGAGG 5121 TCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGC 5201 TTGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAAATGGAGATTGCAGTGAGCT 5281 GAGATTTTGCCATTGCACTCCAACCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCAGTCTCAAATAAAATAAAATAAAAATCTACTTTT 5361 GAGGAATTCAAAGTATACATGATCAGTTTGCCAAAGATTTAGTAAAGACATTTTTATTTAACTGAGTGTATCTCAAATTT 5441 ATTGTGGAATTCTCAGTCCGAATATCTGGAATAGGAACAGCTTTGTTAGATGCTACCATAACCACAATGAATGTCTTCAA 5521 GGGTGTAATTTTAGATATGGTGAGTGGTTGTGTTGGGGGCGGCATAAGTCAGGGCAATTTTTTGCAGCTCATATCATGCT 5601 CTGAAAGTAGCTACCTGCTTTAATGGATGGTTAGTGCTTTTCTATAGAATGGAAAAGATTCCAGCCCGATCCTTGATATG 5681 TTTGTGTTAAACATGCTTATATATTATATTAAACAATGATTAAGGACATAAATGAGTTTCTGTGGTAATAAAGATGCTAT 5761 ATTGAATATCAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | BT474 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in GSM1395167. RNA binding protein: AGO. Condition:BT474 AGO HITS-CLIP Replicate 2
... - Pillai MM; Gillen AE; Yamamoto TM; Kline E; et al., 2014, Breast cancer research and treatment. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Pillai MM; Gillen AE; Yamamoto TM; Kline E; et al. - Breast cancer research and treatment, 2014
miRNAs regulate the expression of genes in both normal physiology and disease. While miRNAs have been demonstrated to play a pivotal role in aspects of cancer biology, these reports have generally focused on the regulation of single genes. Such single-gene approaches have significant limitations, relying on miRNA expression levels and heuristic predictions of mRNA-binding sites. This results in only circumstantial evidence of miRNA-target interaction and typically leads to large numbers of false positive predictions. Here, we used a genome-wide approach (high-throughput sequencing of RNA isolated by crosslinking immunoprecipitation, HITS-CLIP) to define direct miRNA-mRNA interactions in three breast cancer subtypes (estrogen receptor positive, Her2 amplified, and triple negative). Focusing on steroid receptor signaling, we identified two novel regulators of the ER pathway (miR-9-5p and miR-193a/b-3p), which together target multiple genes involved in ER signaling. Moreover, this approach enabled the definition of miR-9-5p as a global regulator of steroid receptor signaling in breast cancer. We show that miRNA targets and networks defined by HITS-CLIP under physiologic conditions are predictive of patient outcomes and provide global insight into miRNA regulation in breast cancer.
LinkOut: [PMID: 24906430]
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Experimental Support 2 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | Cardiac Tissues | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
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HITS-CLIP data was present in GSM2202479. RNA binding protein: AGO2. Condition:S4_LV_29yo_Male_AGO2_bound_RNA
... - Spengler RM; Zhang X; Cheng C; McLendon JM; et al., 2016, Nucleic acids research. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
Elucidation of transcriptome-wide microRNA binding sites in human cardiac tissues by Ago2 HITS-CLIP.
- Spengler RM; Zhang X; Cheng C; McLendon JM; et al.- Nucleic acids research, 2016
MicroRNAs (miRs) have emerged as key biological effectors in human health and disease. These small noncoding RNAs are incorporated into Argonaute (Ago) proteins, where they direct post-transcriptional gene silencing via base-pairing with target transcripts. Although miRs have become intriguing biological entities and attractive therapeutic targets, the translational impacts of miR research remain limited by a paucity of empirical miR targeting data, particularly in human primary tissues. Here, to improve our understanding of the diverse roles miRs play in cardiovascular function and disease, we applied high-throughput methods to globally profile miR:target interactions in human heart tissues. We deciphered Ago2:RNA interactions using crosslinking immunoprecipitation coupled with high-throughput sequencing (HITS-CLIP) to generate the first transcriptome-wide map of miR targeting events in human myocardium, detecting 4000 cardiac Ago2 binding sites across >2200 target transcripts. Our initial exploration of this interactome revealed an abundance of miR target sites in gene coding regions, including several sites pointing to new miR-29 functions in regulating cardiomyocyte calcium, growth and metabolism. Also, we uncovered several clinically-relevant interactions involving common genetic variants that alter miR targeting events in cardiomyopathy-associated genes. Overall, these data provide a critical resource for bolstering translational miR research in heart, and likely beyond.
LinkOut: [PMID: 27418678]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1395167 | |
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
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Cell line / Condition | BT474 / BT474 AGO HITS-CLIP Replicate 2 |
Location of target site | ENST00000270001.7 | 3UTR | UUGCGGUGAACCAAGAUCACGCCACUGCACUCCAGCCUGG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 24906430 / GSE57855 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ID![]() |
Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT000012 | CYP7A1 | cytochrome P450 family 7 subfamily A member 1 | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT000364 | IGF1R | insulin like growth factor 1 receptor | ![]() |
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4 | 3 | ||||
MIRT000365 | SRF | serum response factor | ![]() |
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4 | 1 | ||||
MIRT000663 | RAC1 | Rac family small GTPase 1 | ![]() |
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5 | 2 | |||
MIRT000717 | RHOA | ras homolog family member A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT003006 | CCNG1 | cyclin G1 | ![]() |
![]() |
![]() |
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4 | 4 | ||||
MIRT003079 | GTF2B | general transcription factor IIB | ![]() |
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2 | 1 | ||||||
MIRT003080 | GYS1 | glycogen synthase 1 | ![]() |
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4 | 2 | ||||
MIRT003081 | ANK2 | ankyrin 2 | ![]() |
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![]() |
3 | 1 | |||||
MIRT003082 | NFATC2IP | nuclear factor of activated T-cells 2 interacting protein | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT003083 | ENTPD4 | ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 4 | ![]() |
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4 | 2 | ||||
MIRT003084 | ANXA11 | annexin A11 | ![]() |
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4 | 2 | ||||
MIRT003085 | ALDOA | aldolase, fructose-bisphosphate A | ![]() |
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3 | 2 | |||||
MIRT003086 | RAB6B | RAB6B, member RAS oncogene family | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT003087 | RAB11FIP1 | RAB11 family interacting protein 1 | ![]() |
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5 | 3 | |||
MIRT003088 | FOXP1 | forkhead box P1 | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT003089 | MECP2 | methyl-CpG binding protein 2 | ![]() |
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3 | 2 | |||||
MIRT003090 | NCAM1 | neural cell adhesion molecule 1 | ![]() |
![]() |
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4 | 3 | ||||
MIRT003091 | UBAP2 | ubiquitin associated protein 2 | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT003092 | TBX19 | T-box 19 | ![]() |
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![]() |
3 | 1 | |||||
MIRT003093 | AACS | acetoacetyl-CoA synthetase | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 1 | |||||
MIRT003094 | DUSP2 | dual specificity phosphatase 2 | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT003095 | ATP1A2 | ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 1 | |||||
MIRT003097 | MAPK11 | mitogen-activated protein kinase 11 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 1 | |||||
MIRT003098 | FUNDC2 | FUN14 domain containing 2 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 1 | |||||
MIRT003099 | AKT3 | AKT serine/threonine kinase 3 | ![]() |
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![]() |
3 | 3 | |||||
MIRT003100 | TPD52L2 | tumor protein D52 like 2 | ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
4 | 3 | ||||
MIRT003102 | GALNT10 | polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 | ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
4 | 2 | ||||
MIRT003103 | G6PC3 | glucose-6-phosphatase catalytic subunit 3 | ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
4 | 2 | ||||
MIRT003104 | AP3M2 | adaptor related protein complex 3 mu 2 subunit | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 1 | |||||
MIRT003105 | SLC7A1 | solute carrier family 7 member 1 | ![]() |
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4 | 4 | ||||
MIRT003106 | XPO6 | exportin 6 | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT003107 | FOXJ3 | forkhead box J3 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 1 | |||||
MIRT003108 | SLC7A11 | solute carrier family 7 member 11 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 1 | |||||
MIRT003109 | TRIB1 | tribbles pseudokinase 1 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 1 | |||||
MIRT003110 | EGLN3 | egl-9 family hypoxia inducible factor 3 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 1 | |||||
MIRT003111 | NUMBL | NUMB like, endocytic adaptor protein | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 1 | |||||
MIRT003112 | ADAM17 | ADAM metallopeptidase domain 17 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 5 | |||||
MIRT003727 | DSTYK | dual serine/threonine and tyrosine protein kinase | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 2 | |||||
MIRT003728 | FAM117B | family with sequence similarity 117 member B | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 1 | |||||
MIRT004364 | BCL2L2 | BCL2 like 2 | ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
4 | 2 | ||||
MIRT004527 | PRKAB1 | protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1 | ![]() |
![]() |
2 | 1 | ||||||
MIRT004879 | ADAM10 | ADAM metallopeptidase domain 10 | ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
5 | 1 | |||
MIRT005782 | ACVR1C | activin A receptor type 1C | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT006123 | PRKRA | protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2 | ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
4 | 1 | ||||
MIRT006421 | WNT1 | Wnt family member 1 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 1 | |||||
MIRT007007 | PTPN1 | protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT007081 | NT5C3A | 5'-nucleotidase, cytosolic IIIA | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT007082 | P4HA1 | prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT007083 | ZNF395 | zinc finger protein 395 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT007084 | SOCS1 | suppressor of cytokine signaling 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023217 | SSR3 | signal sequence receptor subunit 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023218 | PHOX2A | paired like homeobox 2a | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023219 | DZIP1L | DAZ interacting zinc finger protein 1 like | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023220 | GSTM2 | glutathione S-transferase mu 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023221 | RAI14 | retinoic acid induced 14 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023222 | STARD13 | StAR related lipid transfer domain containing 13 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023223 | CNN3 | calponin 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023224 | A2M | alpha-2-macroglobulin | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023225 | EFCAB6 | EF-hand calcium binding domain 6 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023226 | GLOD4 | glyoxalase domain containing 4 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023227 | CALR | calreticulin | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023228 | POFUT1 | protein O-fucosyltransferase 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023229 | PYGO1 | pygopus family PHD finger 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023230 | CDY2B | chromodomain Y-linked 2B | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023231 | CDC42EP3 | CDC42 effector protein 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023232 | CS | citrate synthase | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 3 | |||||
MIRT023233 | RNF170 | ring finger protein 170 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 3 | |||||
MIRT023234 | GTF3C6 | general transcription factor IIIC subunit 6 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023235 | ZNF321P | zinc finger protein 321, pseudogene | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023236 | LAMP1 | lysosomal associated membrane protein 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023237 | SLC52A2 | solute carrier family 52 member 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023238 | ZNF658 | zinc finger protein 658 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023239 | ATP13A3 | ATPase 13A3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023240 | CPNE5 | copine 5 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023241 | KATNAL1 | katanin catalytic subunit A1 like 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023242 | TMEM136 | transmembrane protein 136 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023243 | ATP11A | ATPase phospholipid transporting 11A | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023244 | TMEM74 | transmembrane protein 74 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023245 | ANKRD10 | ankyrin repeat domain 10 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023246 | TBL1XR1 | transducin beta like 1 X-linked receptor 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023247 | USP10 | ubiquitin specific peptidase 10 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023248 | AKAP11 | A-kinase anchoring protein 11 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023249 | BACH2 | BTB domain and CNC homolog 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023250 | HCCS | holocytochrome c synthase | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023251 | Slc7a1 | solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023252 | GTDC2 | protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023253 | CTPS1 | CTP synthase 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023254 | SLC44A1 | solute carrier family 44 member 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023255 | CLSPN | claspin | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023256 | RABGEF1 | RAB guanine nucleotide exchange factor 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023257 | FBXO7 | F-box protein 7 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023258 | NCDN | neurochondrin | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023259 | SOX2 | SRY-box 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023260 | ZNF618 | zinc finger protein 618 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023261 | ABLIM1 | actin binding LIM protein 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023262 | ZBTB4 | zinc finger and BTB domain containing 4 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023263 | LUZP1 | leucine zipper protein 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023264 | NLGN3 | neuroligin 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023265 | PRR11 | proline rich 11 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023266 | HHAT | hedgehog acyltransferase | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023267 | UBE2L3 | ubiquitin conjugating enzyme E2 L3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023268 | DNAJC18 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C18 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023269 | FAM102A | family with sequence similarity 102 member A | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023270 | PFKFB2 | 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023271 | DENND2C | DENN domain containing 2C | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023272 | HMOX1 | heme oxygenase 1 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 2 | |||||
MIRT023273 | USP28 | ubiquitin specific peptidase 28 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023274 | KRT18 | keratin 18 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023275 | BPGM | bisphosphoglycerate mutase | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023276 | ZNF233 | zinc finger protein 233 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023277 | SLC25A30 | solute carrier family 25 member 30 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023278 | ANKRD9 | ankyrin repeat domain 9 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 3 | |||||
MIRT023279 | RLN1 | relaxin 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023280 | DDIT3 | DNA damage inducible transcript 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023281 | TRIM65 | tripartite motif containing 65 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023282 | B4GALT1 | beta-1,4-galactosyltransferase 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023283 | ANXA7 | annexin A7 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023284 | SLC19A2 | solute carrier family 19 member 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023285 | MARCKS | myristoylated alanine rich protein kinase C substrate | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023286 | CLEC11A | C-type lectin domain containing 11A | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023287 | CENPF | centromere protein F | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023288 | CLDN18 | claudin 18 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023289 | PFDN1 | prefoldin subunit 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023290 | SPAG9 | sperm associated antigen 9 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023291 | CEACAM8 | carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 8 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023292 | KRT10 | keratin 10 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023293 | SET | SET nuclear proto-oncogene | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023294 | SLC11A2 | solute carrier family 11 member 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023295 | MYCBP | MYC binding protein | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 3 | |||||
MIRT023296 | GPHB5 | glycoprotein hormone beta 5 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023297 | STAU2 | staufen double-stranded RNA binding protein 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023298 | NFATC1 | nuclear factor of activated T-cells 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023299 | ERP29 | endoplasmic reticulum protein 29 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023300 | MEP1A | meprin A subunit alpha | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023301 | SPTLC1 | serine palmitoyltransferase long chain base subunit 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023302 | GTF2H2 | general transcription factor IIH subunit 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023303 | C14orf39 | chromosome 14 open reading frame 39 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023304 | UBE2K | ubiquitin conjugating enzyme E2 K | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023305 | PPP1R9B | protein phosphatase 1 regulatory subunit 9B | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023306 | PSMD10 | proteasome 26S subunit, non-ATPase 10 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023307 | CALD1 | caldesmon 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023308 | TTYH3 | tweety family member 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023309 | NMNAT2 | nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023310 | SCN4B | sodium voltage-gated channel beta subunit 4 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023311 | C1orf122 | chromosome 1 open reading frame 122 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023312 | PAK1 | p21 (RAC1) activated kinase 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023313 | DNAJB1 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023314 | DMXL1 | Dmx like 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023315 | ZNF160 | zinc finger protein 160 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023316 | CSRP1 | cysteine and glycine rich protein 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023317 | PHKA1 | phosphorylase kinase regulatory subunit alpha 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023318 | RBBP5 | RB binding protein 5, histone lysine methyltransferase complex subunit | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023319 | ANKRD13C | ankyrin repeat domain 13C | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023320 | SUCLA2 | succinate-CoA ligase ADP-forming beta subunit | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023321 | PEA15 | phosphoprotein enriched in astrocytes 15 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023322 | MTPN | myotrophin | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023323 | YKT6 | YKT6 v-SNARE homolog | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023324 | MOB3B | MOB kinase activator 3B | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023325 | FAM118A | family with sequence similarity 118 member A | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023326 | ZNF264 | zinc finger protein 264 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023327 | HECTD3 | HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023328 | BATF2 | basic leucine zipper ATF-like transcription factor 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023329 | PIP4K2A | phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023330 | MAPRE1 | microtubule associated protein RP/EB family member 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023331 | TBC1D22B | TBC1 domain family member 22B | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023332 | SLC9A1 | solute carrier family 9 member A1 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 3 | |||||
MIRT023333 | NPEPPS | aminopeptidase puromycin sensitive | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023334 | BCL2L1 | BCL2 like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 1 | ||||||
MIRT023335 | OSMR | oncostatin M receptor | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023336 | CALU | calumenin | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023337 | BRI3BP | BRI3 binding protein | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023338 | PSPH | phosphoserine phosphatase | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023339 | APMAP | adipocyte plasma membrane associated protein | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023340 | WASF1 | WAS protein family member 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023341 | LCA5 | LCA5, lebercilin | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023342 | NODAL | nodal growth differentiation factor | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023343 | CASP7 | caspase 7 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023344 | CPA3 | carboxypeptidase A3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023345 | PALM | paralemmin | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023346 | TCP11 | t-complex 11 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023347 | NALCN | sodium leak channel, non-selective | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023348 | PLAGL2 | PLAG1 like zinc finger 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023349 | IDS | iduronate 2-sulfatase | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 3 | |||||
MIRT023350 | PARP11 | poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023351 | MAZ | MYC associated zinc finger protein | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023352 | CPNE4 | copine 4 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023353 | FAM19A3 | family with sequence similarity 19 member A3, C-C motif chemokine like | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023354 | KRT14 | keratin 14 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023355 | DYNC1H1 | dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023356 | GNL3L | G protein nucleolar 3 like | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023357 | HLA-DQA1 | major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023358 | EYA4 | EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023359 | GNPDA2 | glucosamine-6-phosphate deaminase 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023360 | BRCA2 | BRCA2, DNA repair associated | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023361 | ZSCAN4 | zinc finger and SCAN domain containing 4 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023362 | HSPA5 | heat shock protein family A (Hsp70) member 5 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023363 | SERAC1 | serine active site containing 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023364 | SLC15A2 | solute carrier family 15 member 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023365 | RABIF | RAB interacting factor | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023366 | ART3 | ADP-ribosyltransferase 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023367 | EP400 | E1A binding protein p400 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023368 | MT4 | metallothionein 4 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023369 | TRAM2 | translocation associated membrane protein 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023370 | PHPT1 | phosphohistidine phosphatase 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023371 | KIAA0101 | PCNA clamp associated factor | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023372 | VHL | von Hippel-Lindau tumor suppressor | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023373 | IFNA1 | interferon alpha 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023374 | FSTL3 | follistatin like 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023375 | PHF14 | PHD finger protein 14 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023376 | ZCCHC2 | zinc finger CCHC-type containing 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023377 | GSTM3 | glutathione S-transferase mu 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023378 | DCTN5 | dynactin subunit 5 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023379 | CHST3 | carbohydrate sulfotransferase 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023380 | HECW2 | HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023381 | ADO | 2-aminoethanethiol dioxygenase | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023382 | POMZP3 | POM121 and ZP3 fusion | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023383 | CHST12 | carbohydrate sulfotransferase 12 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023384 | ARSB | arylsulfatase B | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023385 | ATP7A | ATPase copper transporting alpha | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023386 | PMP22 | peripheral myelin protein 22 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023387 | TGFBRAP1 | transforming growth factor beta receptor associated protein 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023388 | ORC2 | origin recognition complex subunit 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023389 | CREB1 | cAMP responsive element binding protein 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023390 | CD83 | CD83 molecule | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023391 | TOB2 | transducer of ERBB2, 2 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 5 | |||||
MIRT023392 | LRP11 | LDL receptor related protein 11 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023393 | MPV17 | MPV17, mitochondrial inner membrane protein | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023394 | TRIM29 | tripartite motif containing 29 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023395 | OSBP2 | oxysterol binding protein 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023396 | PKM | pyruvate kinase, muscle | ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
6 | 4 | ||
MIRT023397 | FOXK2 | forkhead box K2 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 3 | |||||
MIRT023398 | CLIC4 | chloride intracellular channel 4 | ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
5 | 6 | |||
MIRT023399 | ST6GALNAC4 | ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 4 | ![]() |
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MIRT023400 | SMURF2 | SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT023401 | LMNB2 | lamin B2 | ![]() |
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3 | 5 | |||||
MIRT023402 | BAX | BCL2 associated X, apoptosis regulator | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT023403 | CDK4 | cyclin dependent kinase 4 | ![]() |
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3 | 3 | |||||
MIRT054362 | Cux1 | cut-like homeobox 1 | ![]() |
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