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pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-122 |
Genomic Coordinates | chr18: 58451074 - 58451158 |
Synonyms | MIR122A, MIRN122, MIRN122A, hsa-mir-122, miRNA122, miRNA122A, MIR122 |
Description | Homo sapiens miR-122 stem-loop |
Comment | The mature sequence shown here represents the most commonly cloned form from large-scale cloning studies . |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Associated Diseases | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-122-5p | |||||||||||||||||||||
Sequence | 15| UGGAGUGUGACAAUGGUGUUUG |36 | |||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||
Experiments | Cloned | |||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
miRNAs in Extracellular Vesicles |
Circulating MicroRNA Expression Profiling | Circulating MicroRNA Expression Profiling |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | GK5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | glycerol kinase 5 (putative) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001039547 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on GK5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of GK5 (miRNA target sites are highlighted) |
>GK5|NM_001039547|3'UTR 1 CACTAAATGAAATGATCAAAACCATAGGTAGCTGGTTTATGTGACGTGCAGATGAGATGAAGCTCAGGGATAACCCATAT 81 GACAATGACTAAGAGGAGAAAATTTTAAATAAGCTTCATAACTTAAGAAGCATTGCTTTTAAAAAAACAAAACGGAACAA 161 AAAACTCTTATTTTTTTCCCCTAAACCATGGTAAGGCAGCAATACCTCAAAACTTTATATCTTCTATTTTGTAGCAAATT 241 CCAAAGGACATTAGTCATTTCCAACCACATTTTGACAGTTATGGGTCCTCTTCCTTTTTATACTGGGTCAGTGGTACATA 321 GGAACATAATGATTTACCATCCAAGCTAATAGTTCTGGGTCAAGTACCATGCACATATTGTTCCAAAATTATGTGAAACG 401 TATTTCTTTAATTCTTTAAGTGGGCTATTTGAAGTACATATAGCTAAAAAGAAAGAATAACTGAGAAAATGTGGAATTTT 481 GAAACATTAATATTTTATGTTTAAAGCCATAATTTCCTAATATTATATCCAAATATGAGCTTAATATGTCCCTCTCAGAT 561 AAGCTTATGAGATAGTTAATGCTTTCCTTTACTGGTCTTAAAGACACTGCCTTAATTTTTCCTTGTTCAACCAAAATCTG 641 AGCATTCTTTCTATGTTGAAAACACTGAAAAACTAATTTTAGTTAATGAACTAGAAAGAATATTGATTTTTAAGAAACAG 721 AAAAATACTACTTATTTTCCTTCTCAAATAACGTTTCTTTCAAAAACTTCTGGCTGAAGTATAACATGCTGGTAGTTAAC 801 ATAAATCTTGTCTTTCTCTTGTTCTTTATCTTTCTTTGTTATTTAGATGCTTGTATAAATGTCTTTTGTTTTTATTAAGT 881 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CTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCCTCTCCTGGGCTCAAGCAGTCCTCCT 2721 GCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTTCAGGTATACGTCACTACGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGG 2801 GTTTTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTGTGACCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATT 2881 ACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTTGTCCTTTCTGTCTTCCAAGTTTGTTTTTCATTTGTATGCTAATATTTGAAGTT 2961 TAGAAAAATTTGTGCTACTTCTCAGCATGTTTTATTTTCCCATTATAGATCTATCAGATATTTTTAGAAGGTCTGCAACT 3041 GTCTGATAAAGGAAGAGAATGTTCCTGTTCAATCTATCTTAAAGTGCTACTAATTGCTTTTATACTATAGACATACTGAT 3121 TTTTTCATCTTTTTTATCCAACCATGGCATGGTTTCCTAATCTCAGCATTGACATTTTGGACTGGATAAATCTTTATTTT 3201 GGGATGCTATGCTGTACTTTATAGGATGTTTAGCAATATCCCTGACCTCTGCCCTCTAGCTACAAGTACCATCCCCCTAG 3281 TTGTTATGGCCAAAAATGTCTTCAAACATTGCCATTCTGAGAGGCAAAATTGCCCCCAGTTGAGAGCCACTGATACAGGC 3361 TGTTAGAAGAAAATCGAAGACTCAGTGAATATAGTGTCATACTCCTTTTCTTTCTGCCTCATTTTACCTTAGGAAATGGT 3441 TGTTAGCAAAAAAATTAGTTAATCGTATCTTGAAATAAATAGGGTATCTATTTTGCTGATTAATAAAGAAAAAATAAATC 3521 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GGCTGAGGCAGGAGAACCGCTTGAACCCCTGAGGCAGAGGTTGCGGTTGAGCCGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTG 4481 GGCAACAAGAGTTAAACTCCATTTCAAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAAACAAAAGAAGAACTACTCTGTAG 4561 TGAGAGCTAGAATCCTCATGTTGTTTATTTAAAATTTTTGGCCAAGTACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTG 4641 GGAGGCTGAGGCCAGAGGATCACTTGAAGCCAGGAGTTCAGTTACAGCTTGGGCAGCAAAGTGAGACCTTGTCTCTACAA 4721 AAAAATTTTTTTTAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTATGCCCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAAACCGAAGCAGGAGAATC 4801 GCTTGAACACAGGAGTTTGAGGGTGCTATGAGCTATGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGGCAAGGCCCT 4881 GTCTTAATAAAATAAAATAAAATTCTTAATATGTTTATATATTTGAAAAACTATTTGTGTAGAGACACATGTCTGTAAAT 4961 ACACATAGATATATTAACTTTTTAAGCTTTAATTGAAGCCTTTCTCTTCACAGGTTTTATATATTTGACTGCAGATGACT 5041 AACAGATTGAATTTTAAGAGTGCGAAACACTCTGGTGCTATAGGGAAGGAACTTCATAAATAGCCCCTCCTGTAAGGGAC 5121 CAGTCTTTAATTTAAAACAGTCCAGCCCAGGAATCTTGCAAGAATTTTGTAATTATTTGAGGAGAGATGTAGATATACCC 5201 TGGAGTTCTTTGACTTTAAGTTATTCTAGAGTCATCCCAGAGATGGCCTAGAAGACTTGAATGTACCCCAAAGGATTCTG 5281 AATCCCTTTGGGAAATTTAGACTATGATTTTCAGTAAGAATTAAAAGCCCCAGGATAAGCGTGGTGGTTCACACCTGTAA 5361 TCCCAGCAATTTGTGAGGCCAAGGCGGGAGGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTAGGCAACATAGTGAGAC 5441 CCCACCCATCTCAATTTAAAAAAAGAGAGAAAAAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 5521 CCAAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGATCAATATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAAT 5601 ACAAAAATTAGCCAGTCCTGATGGCATGTGCCTGTGGTCCCAGCGACTTGGGAGGCTGAGACAGGAGAATTGCTTGAACC 5681 CGGGACGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGGGCCACTGCATTCCAGCCTGGGTGAGAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAA 5761 AAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGCCCCAAACATACCTTGGGCCTTTACAACCTACTTGGTCCCAGAAT 5841 CGTCTTATTGTAAACCCAAAGCCAGGTCTTCTGGTTCGAACCAGTCAAAATGGGTAATCTAAAAAAGTTAAATAGATGAT 5921 TCAAAATCGTGTTGGTGGTTTTTTCTTTTTAAATCCCCTTTCCAAGTAAAAGGAATCTTTTTTTTTTTTTTAAGTTTTGA 6001 AGCCTCATAGCCATAAATATTTTGGCACCAGCATCTATTGGCACCTAAGTCATTGGCTGTATCATATTCCCATGGGACCC 6081 TTGTTCCTAGAGGAATGCAGGAATGATCTTGGAGTGGGAAGGACAGAAACAGGTGCTTGCAAAATCAGATATTTCTGAAA 6161 TTCTCTGTTATTCTATTTCTACTGTCTTTCCCCACTTTACTATAAATTTGATCTGTTATAAAATGGCTGTGTTTAGATAG 6241 ATACCCGTGATGTTTAGGAAACAAATGATATAGAGACTCCCATTTAAATGAATCTTATCTTTATAAGAAACAGCCAAACT 6321 GTTTTCCAGACTGGCTATACCATCTTACATTCCCACCAGGAATGTATGAGTGATCCAGTTTCTCTGCATGCTCGCCAGCA 6401 TTTGGTGTTGTCACTATTTCTTATTTCAACCATTCTGTTTATCCTTTTCAGTGAAATATCTGTTCATATCTTTTGCCCAT 6481 TTGCCAATTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGGCTGCAGTGAGATATGATCACTAAATGTTTGCTTAA 6561 TGAGCCATATCTTTAAATATCTTTTTTAAAGTTTTTAAAAGTCAGTCCAGTGGTTTATGTGATTATGTGGGATTTTTTAA 6641 ATCTTTCCAGGCAAAATGTGTATAGCATTTTGAACATATTTACACTGTACTGAGCCCAAGAGTTCTCATATTCTTTCTTT 6721 GCTCATTATAGAGTATGGTACTAATACTGTATAATAGTAAATTTTCAAAGATACCTTTATTTAGAATGTTAGAGTATACA 6801 GATATATACTTTGTACATAGTTATCATAATGTTTCTAACCTTTTTATTTAAAGCAGGCTGATTTGTGTAAAGGTTTCAGA 6881 ATGATTTTGTTAATAAGTTATTAGAAACTTTCCTATTTGTACAAGATGGTAAATGTAGATTCCAATTTGTATGCCTCAGT 6961 AAATTCATAATCTTATTTCTCTGATGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTTCTGTGATGCTCTTAATGAATTTTGCAGTTTTAT 7041 TAAATTGTCATTGAGAACCTCATAAATCATTGTTAAGATCTATACAAAAAATCAAGGATCCACAGTAATAGAATATTTTT 7121 CATCTGCATATGAATTTTTCCCTTCCCTTTTTGTCTACTTTTAGATTTAAAAAAAATTACCAGGACATTCTTATTAAATA 7201 CTATTACCTGTTTTGGTTTCTGCACATTAAGAAAGTCACAGAGAAGCCAGACACAGTGGCATGCTCTTCTATTCCCAGCT 7281 ACTCAGGAGGCTGAGGCTGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGATATCCTGGGCAACATGGTGAAACTTGGCAAA 7361 AACAAAAACAAGGCCGGGCATGGTGGCTCACACGTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCCACGGCTGGCGGATCACGAGGT 7441 CAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGG 7521 CGGGTGCCTGTACTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAAGAGAATGGCATGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 7601 TGAGATCGCGCCACTGCACTCCTGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAACAAAAACAACAACAAC 7681 AACAACAAAAAACAACCAGAGAAATAGCACTTGTTAACTACAATTGTGACTCTAGGTAAACTTGGGCCTTAATATGGTTA 7761 GACAAGAAGGGTTTTAGGTAACTTGCCTTTTTAGATCCTATTTAGGCTTATTAGTCTATATTCTACATTCTTGCACGATG 7841 GAAATTACTAGAGAAGTGGGATAATTCTTTGTTGTGGGGAAAATAAAATTTGTTGTGAAAATATACTGTATTTTAAAATA 7921 TTTAGAAAGATTATAAATAACTGGAGAAAAGATAATTTCATATACTAATATGATGGAATTAGCCTAGCAGATGTTAAAAA 8001 TCCTTTCTGAAAATTATAATCTAAAATTATTTGGGAAATTACAATGGAACTGAATAATCTGTACGTTGGTATATTAAAGC 8081 CATTTTTATATTGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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