pre-miRNA Information | |
---|---|
pre-miRNA | hsa-mir-488 |
Genomic Coordinates | chr1: 177029363 - 177029445 |
Synonyms | MIRN488, hsa-mir-488, MIR488 |
Description | Homo sapiens miR-488 stem-loop |
Comment | miR-488-3p cloned in has a 1 nt 3' extension (U), which is incompatible with the genome sequence. |
RNA Secondary Structure | |
Associated Diseases |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Mature miRNA | hsa-miR-488-5p | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 14| CCCAGAUAAUGGCACUCUCAA |34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | Array-cloned | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
|
DRVs in miRNA |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
---|---|
Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene Symbol | AR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AIS, AR8, DHTR, HUMARA, HYSP1, KD, NR3C4, SBMA, SMAX1, TFM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | androgen receptor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_000044 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_001011645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on AR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of AR (miRNA target sites are highlighted) |
>AR|NM_000044|3'UTR 1 AGCATTGGAAACCCTATTTCCCCACCCCAGCTCATGCCCCCTTTCAGATGTCTTCTGCCTGTTATAACTCTGCACTACTC 81 CTCTGCAGTGCCTTGGGGAATTTCCTCTATTGATGTACAGTCTGTCATGAACATGTTCCTGAATTCTATTTGCTGGGCTT 161 TTTTTTTCTCTTTCTCTCCTTTCTTTTTCTTCTTCCCTCCCTATCTAACCCTCCCATGGCACCTTCAGACTTTGCTTCCC 241 ATTGTGGCTCCTATCTGTGTTTTGAATGGTGTTGTATGCCTTTAAATCTGTGATGATCCTCATATGGCCCAGTGTCAAGT 321 TGTGCTTGTTTACAGCACTACTCTGTGCCAGCCACACAAACGTTTACTTATCTTATGCCACGGGAAGTTTAGAGAGCTAA 401 GATTATCTGGGGAAATCAAAACAAAAACAAGCAAACAAAAAAAAAAAGCAAAAACAAAACAAAAAATAAGCCAAAAAACC 481 TTGCTAGTGTTTTTTCCTCAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATACGTACATACATACACACATACATACAAACATATA 561 GAAATCCCCAAAGAGGCCAATAGTGACGAGAAGGTGAAAATTGCAGGCCCATGGGGAGTTACTGATTTTTTCATCTCCTC 641 CCTCCACGGGAGACTTTATTTTCTGCCAATGGCTATTGCCATTAGAGGGCAGAGTGACCCCAGAGCTGAGTTGGGCAGGG 721 GGGTGGACAGAGAGGAGAGGACAAGGAGGGCAATGGAGCATCAGTACCTGCCCACAGCCTTGGTCCCTGGGGGCTAGACT 801 GCTCAACTGTGGAGCAATTCATTATACTGAAAATGTGCTTGTTGTTGAAAATTTGTCTGCATGTTAATGCCTCACCCCCA 881 AACCCTTTTCTCTCTCACTCTCTGCCTCCAACTTCAGATTGACTTTCAATAGTTTTTCTAAGACCTTTGAACTGAATGTT 961 CTCTTCAGCCAAAACTTGGCGACTTCCACAGAAAAGTCTGACCACTGAGAAGAAGGAGAGCAGAGATTTAACCCTTTGTA 1041 AGGCCCCATTTGGATCCAGGTCTGCTTTCTCATGTGTGAGTCAGGGAGGAGCTGGAGCCAGAGGAGAAGAAAATGATAGC 1121 TTGGCTGTTCTCCTGCTTAGGACACTGACTGAATAGTTAAACTCTCACTGCCACTACCTTTTCCCCACCTTTAAAAGACC 1201 TGAATGAAGTTTTCTGCCAAACTCCGTGAAGCCACAAGCACCTTATGTCCTCCCTTCAGTGTTTTGTGGGCCTGAATTTC 1281 ATCACACTGCATTTCAGCCATGGTCATCAAGCCTGTTTGCTTCTTTTGGGCATGTTCACAGATTCTCTGTTAAGAGCCCC 1361 CACCACCAAGAAGGTTAGCAGGCCAACAGCTCTGACATCTATCTGTAGATGCCAGTAGTCACAAAGATTTCTTACCAACT 1441 CTCAGATCGCTGGAGCCCTTAGACAAACTGGAAAGAAGGCATCAAAGGGATCAGGCAAGCTGGGCGTCTTGCCCTTGTCC 1521 CCCAGAGATGATACCCTCCCAGCAAGTGGAGAAGTTCTCACTTCCTTCTTTAGAGCAGCTAAAGGGGCTACCCAGATCAG 1601 GGTTGAAGAGAAAACTCAATTACCAGGGTGGGAAGAATGAAGGCACTAGAACCAGAAACCCTGCAAATGCTCTTCTTGTC 1681 ACCCAGCATATCCACCTGCAGAAGTCATGAGAAGAGAGAAGGAACAAAGAGGAGACTCTGACTACTGAATTAAAATCTTC 1761 AGCGGCAAAGCCTAAAGCCAGATGGACACCATCTGGTGAGTTTACTCATCATCCTCCTCTGCTGCTGATTCTGGGCTCTG 1841 ACATTGCCCATACTCACTCAGATTCCCCACCTTTGTTGCTGCCTCTTAGTCAGAGGGAGGCCAAACCATTGAGACTTTCT 1921 ACAGAACCATGGCTTCTTTCGGAAAGGTCTGGTTGGTGTGGCTCCAATACTTTGCCACCCATGAACTCAGGGTGTGCCCT 2001 GGGACACTGGTTTTATATAGTCTTTTGGCACACCTGTGTTCTGTTGACTTCGTTCTTCAAGCCCAAGTGCAAGGGAAAAT 2081 GTCCACCTACTTTCTCATCTTGGCCTCTGCCTCCTTACTTAGCTCTTAATCTCATCTGTTGAACTCAAGAAATCAAGGGC 2161 CAGTCATCAAGCTGCCCATTTTAATTGATTCACTCTGTTTGTTGAGAGGATAGTTTCTGAGTGACATGATATGATCCACA 2241 AGGGTTTCCTTCCCTGATTTCTGCATTGATATTAATAGCCAAACGAACTTCAAAACAGCTTTAAATAACAAGGGAGAGGG 2321 GAACCTAAGATGAGTAATATGCCAATCCAAGACTGCTGGAGAAAACTAAAGCTGACAGGTTCCCTTTTTGGGGTGGGATA 2401 GACATGTTCTGGTTTTCTTTATTATTACACAATCTGGCTCATGTACAGGATCACTTTTAGCTGTTTTAAACAGAAAAAAA 2481 TATCCACCACTCTTTTCAGTTACACTAGGTTACATTTTAATAGGTCCTTTACATCTGTTTTGGAATGATTTTCATCTTTT 2561 GTGATACACAGATTGAATTATATCATTTTCATATCTCTCCTTGTAAATACTAGAAGCTCTCCTTTACATTTCTCTATCAA 2641 ATTTTTCATCTTTATGGGTTTCCCAATTGTGACTCTTGTCTTCATGAATATATGTTTTTCATTTGCAAAAGCCAAAAATC 2721 AGTGAAACAGCAGTGTAATTAAAAGCAACAACTGGATTACTCCAAATTTCCAAATGACAAAACTAGGGAAAAATAGCCTA 2801 CACAAGCCTTTAGGCCTACTCTTTCTGTGCTTGGGTTTGAGTGAACAAAGGAGATTTTAGCTTGGCTCTGTTCTCCCATG 2881 GATGAAAGGAGGAGGATTTTTTTTTTCTTTTGGCCATTGATGTTCTAGCCAATGTAATTGACAGAAGTCTCATTTTGCAT 2961 GCGCTCTGCTCTACAAACAGAGTTGGTATGGTTGGTATACTGTACTCACCTGTGAGGGACTGGCCACTCAGACCCACTTA 3041 GCTGGTGAGCTAGAAGATGAGGATCACTCACTGGAAAAGTCACAAGGACCATCTCCAAACAAGTTGGCAGTGCTCGATGT 3121 GGACGAAGAGTGAGGAAGAGAAAAAGAAGGAGCACCAGGGAGAAGGCTCCGTCTGTGCTGGGCAGCAGACAGCTGCCAGG 3201 ATCACGAACTCTGTAGTCAAAGAAAAGAGTCGTGTGGCAGTTTCAGCTCTCGTTCATTGGGCAGCTCGCCTAGGCCCAGC 3281 CTCTGAGCTGACATGGGAGTTGTTGGATTCTTTGTTTCATAGCTTTTTCTATGCCATAGGCAATATTGTTGTTCTTGGAA 3361 AGTTTATTATTTTTTTAACTCCCTTACTCTGAGAAAGGGATATTTTGAAGGACTGTCATATATCTTTGAAAAAAGAAAAT 3441 CTGTAATACATATATTTTTATGTATGTTCACTGGCACTAAAAAATATAGAGAGCTTCATTCTGTCCTTTGGGTAGTTGCT 3521 GAGGTAATTGTCCAGGTTGAAAAATAATGTGCTGATGCTAGAGTCCCTCTCTGTCCATACTCTACTTCTAAATACATATA 3601 GGCATACATAGCAAGTTTTATTTGACTTGTACTTTAAGAGAAAATATGTCCACCATCCACATGATGCACAAATGAGCTAA 3681 CATTGAGCTTCAAGTAGCTTCTAAGTGTTTGTTTCATTAGGCACAGCACAGATGTGGCCTTTCCCCCCTTCTCTCCCTTG 3761 ATATCTGGCAGGGCATAAAGGCCCAGGCCACTTCCTCTGCCCCTTCCCAGCCCTGCACCAAAGCTGCATTTCAGGAGACT 3841 CTCTCCAGACAGCCCAGTAACTACCCGAGCATGGCCCCTGCATAGCCCTGGAAAAATAAGAGGCTGACTGTCTACGAATT 3921 ATCTTGTGCCAGTTGCCCAGGTGAGAGGGCACTGGGCCAAGGGAGTGGTTTTCATGTTTGACCCACTACAAGGGGTCATG 4001 GGAATCAGGAATGCCAAAGCACCAGATCAAATCCAAAACTTAAAGTCAAAATAAGCCATTCAGCATGTTCAGTTTCTTGG 4081 AAAAGGAAGTTTCTACCCCTGATGCCTTTGTAGGCAGATCTGTTCTCACCATTAATCTTTTTGAAAATCTTTTAAAGCAG 4161 TTTTTAAAAAGAGAGATGAAAGCATCACATTATATAACCAAAGATTACATTGTACCTGCTAAGATACCAAAATTCATAAG 4241 GGCAGGGGGGGAGCAAGCATTAGTGCCTCTTTGATAAGCTGTCCAAAGACAGACTAAAGGACTCTGCTGGTGACTGACTT 4321 ATAAGAGCTTTGTGGGTTTTTTTTTCCCTAATAATATACATGTTTAGAAGAATTGAAAATAATTTCGGGAAAATGGGATT 4401 ATGGGTCCTTCACTAAGTGATTTTATAAGCAGAACTGGCTTTCCTTTTCTCTAGTAGTTGCTGAGCAAATTGTTGAAGCT 4481 CCATCATTGCATGGTTGGAAATGGAGCTGTTCTTAGCCACTGTGTTTGCTAGTGCCCATGTTAGCTTATCTGAAGATGTG 4561 AAACCCTTGCTGATAAGGGAGCATTTAAAGTACTAGATTTTGCACTAGAGGGACAGCAGGCAGAAATCCTTATTTCTGCC 4641 CACTTTGGATGGCACAAAAAGTTATCTGCAGTTGAAGGCAGAAAGTTGAAATACATTGTAAATGAATATTTGTATCCATG 4721 TTTCAAAATTGAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTGTGTGTGTGTGTTCTGATAGCTTT 4801 AACTTTCTCTGCATCTTTATATTTGGTTCCAGATCACACCTGATGCCATGTACTTGTGAGAGAGGATGCAGTTTTGTTTT 4881 GGAAGCTCTCTCAGAACAAACAAGACACCTGGATTGATCAGTTAACTAAAAGTTTTCTCCCCTATTGGGTTTGACCCACA 4961 GGTCCTGTGAAGGAGCAGAGGGATAAAAAGAGTAGAGGACATGATACATTGTACTTTACTAGTTCAAGACAGATGAATGT 5041 GGAAAGCATAAAAACTCAATGGAACTGACTGAGATTTACCACAGGGAAGGCCCAAACTTGGGGCCAAAAGCCTACCCAAG 5121 TGATTGACCAGTGGCCCCCTAATGGGACCTGAGCTGTTGGAAGAAGAGAACTGTTCCTTGGTCTTCACCATCCTTGTGAG 5201 AGAAGGGCAGTTTCCTGCATTGGAACCTGGAGCAAGCGCTCTATCTTTCACACAAATTCCCTCACCTGAGATTGAGGTGC 5281 TCTTGTTACTGGGTGTCTGTGTGCTGTAATTCTGGTTTTGGATATGTTCTGTAAAGATTTTGACAAATGAAAATGTGTTT 5361 TTCTCTGTTAAAACTTGTCAGAGTACTAGAAGTTGTATCTCTGTAGGTGCAGGTCCATTTCTGCCCACAGGTAGGGTGTT 5441 TTTCTTTGATTAAGAGATTGACACTTCTGTTGCCTAGGACCTCCCAACTCAACCATTTCTAGGTGAAGGCAGAAAAATCC 5521 ACATTAGTTACTCCTCTTCAGACATTTCAGCTGAGATAACAAATCTTTTGGAATTTTTTCACCCATAGAAAGAGTGGTAG 5601 ATATTTGAATTTAGCAGGTGGAGTTTCATAGTAAAAACAGCTTTTGACTCAGCTTTGATTTATCCTCATTTGATTTGGCC 5681 AGAAAGTAGGTAATATGCATTGATTGGCTTCTGATTCCAATTCAGTATAGCAAGGTGCTAGGTTTTTTCCTTTCCCCACC 5761 TGTCTCTTAGCCTGGGGAATTAAATGAGAAGCCTTAGAATGGGTGGCCCTTGTGACCTGAAACACTTCCCACATAAGCTA 5841 CTTAACAAGATTGTCATGGAGCTGCAGATTCCATTGCCCACCAAAGACTAGAACACACACATATCCATACACCAAAGGAA 5921 AGACAATTCTGAAATGCTGTTTCTCTGGTGGTTCCCTCTCTGGCTGCTGCCTCACAGTATGGGAACCTGTACTCTGCAGA 6001 GGTGACAGGCCAGATTTGCATTATCTCACAACCTTAGCCCTTGGTGCTAACTGTCCTACAGTGAAGTGCCTGGGGGGTTG 6081 TCCTATCCCATAAGCCACTTGGATGCTGACAGCAGCCACCATCAGAATGACCCACGCAAAAAAAAGAAAAAAAAAATTAA 6161 AAAGTCCCCTCACAACCCAGTGACACCTTTCTGCTTTCCTCTAGACTGGAACATTGATTAGGGAGTGCCTCAGACATGAC 6241 ATTCTTGTGCTGTCCTTGGAATTAATCTGGCAGCAGGAGGGAGCAGACTATGTAAACAGAGATAAAAATTAATTTTCAAT 6321 ATTGAAGGAAAAAAGAAATAAGAAGAGAGAGAGAAAGAAAGCATCACACAAAGATTTTCTTAAAAGAAACAATTTTGCTT 6401 GAAATCTCTTTAGATGGGGCTCATTTCTCACGGTGGCACTTGGCCTCCACTGGGCAGCAGGACCAGCTCCAAGCGCTAGT 6481 GTTCTGTTCTCTTTTTGTAATCTTGGAATCTTTTGTTGCTCTAAATACAATTAAAAATGGCAGAAACTTGTTTGTTGGAC 6561 TACATGTGTGACTTTGGGTCTGTCTCTGCCTCTGCTTTCAGAAATGTCATCCATTGTGTAAAATATTGGCTTACTGGTCT 6641 GCCAGCTAAAACTTGGCCACATCCCCTGTTATGGCTGCAGGATCGAGTTATTGTTAACAAAGAGACCCAAGAAAAGCTGC 6721 TAATGTCCTCTTATCATTGTTGTTAATTTGTTAAAACATAAAGAAATCTAAAATTTCAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in gene 3'UTRs |
|
Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
---|---|
miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
|
Conditions | LNCAP , C4-2B , DU145 , CHO-K1 |
Disease | prostate carcinoma; |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | miRanda , PicTar , TargetScan |
Original Description (Extracted from the article) |
...
miR 488* targets the 3' UTR of AR mRNA// miR 488* negatively regulates AR expression by binding to the specific target site in 3' UTR of AR mRNA
miR 488* targets the 3芒鈧鈩UTR of AR mRNA.
... - Sikand K; Slaibi JE; Singh R; Slane SD; Shukla GC, 2011, International journal of cancer. |
Article |
- Sikand K; Slaibi JE; Singh R; Slane SD; Shukla GC - International journal of cancer, 2011
Androgen receptor (AR) is a ligand-dependent transcription factor, which plays a significant role in prostate carcinogenesis. Blockade of AR and its ligand, androgen is the basis for the treatment of prostate cancer (PCa). Nevertheless, a modest increase in the critical levels of AR mRNA and corresponding protein is sufficient for the development of resistance to antiandrogen therapy. A strategy to further downregulate AR mRNA and protein expression in combination with antiandrogen therapy may prevent or delay the development of androgen-independent PCa. Recent studies show that microRNAs (miRNAs) perform tumor suppressor functions in various cancers. In this study, we demonstrate that the overexpression of miR 488* downregulates the transcriptional activity of AR and inhibits the endogenous AR protein production in both androgen-dependent and androgen-independent PCa cells. In addition, miR 488* blocks the proliferation and enhances the apoptosis of PCa cells. Our data indicate that miR 488* targets AR and is a potential modulator of AR mediated signaling. Our findings provide insight for utilizing miRNAs as novel therapeutics to target AR in PCa.
LinkOut: [PMID: 21710544]
|
MiRNA-Target Expression Profile | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
53 hsa-miR-488-5p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT003789 | AR | androgen receptor | 4 | 1 | ||||||||
MIRT041622 | CYP2E1 | cytochrome P450 family 2 subfamily E member 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT080581 | PMAIP1 | phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT081895 | KCTD15 | potassium channel tetramerization domain containing 15 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT086202 | HOXD13 | homeobox D13 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT372238 | MAK16 | MAK16 homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443057 | ENAM | enamelin | 2 | 2 | ||||||||
MIRT445919 | SHOC2 | SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT457586 | NCOA3 | nuclear receptor coactivator 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT461689 | ZNF426 | zinc finger protein 426 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT463200 | ZNF148 | zinc finger protein 148 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT470582 | POTEM | POTE ankyrin domain family member M | 2 | 2 | ||||||||
MIRT470612 | POTEG | POTE ankyrin domain family member G | 2 | 2 | ||||||||
MIRT471142 | PHF19 | PHD finger protein 19 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT485233 | PRICKLE1 | prickle planar cell polarity protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT492251 | SLC35F5 | solute carrier family 35 member F5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT495640 | CDK1 | cyclin dependent kinase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT496379 | ATP2B4 | ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT502257 | HNRNPF | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F | 2 | 4 | ||||||||
MIRT513392 | TUBB4A | tubulin beta 4A class IVa | 2 | 2 | ||||||||
MIRT516855 | ATP5G1 | ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex subunit C1 (subunit 9) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT519449 | CSTF1 | cleavage stimulation factor subunit 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT520978 | SPATA2 | spermatogenesis associated 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT527525 | CD59 | CD59 molecule (CD59 blood group) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT528206 | NELFE | negative elongation factor complex member E | 2 | 2 | ||||||||
MIRT528260 | GPRIN2 | G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT536670 | IL6ST | interleukin 6 signal transducer | 2 | 2 | ||||||||
MIRT536751 | HOXD9 | homeobox D9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT544422 | ZNF460 | zinc finger protein 460 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT562453 | CSDE1 | cold shock domain containing E1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT562635 | ARL6IP1 | ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566506 | PAWR | pro-apoptotic WT1 regulator | 2 | 2 | ||||||||
MIRT572230 | ATG2A | autophagy related 2A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT613888 | CRB2 | crumbs 2, cell polarity complex component | 2 | 2 | ||||||||
MIRT615567 | JPH2 | junctophilin 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT615853 | RASGRP1 | RAS guanyl releasing protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT615938 | MAP1LC3B | microtubule associated protein 1 light chain 3 beta | 2 | 2 | ||||||||
MIRT617637 | RXRA | retinoid X receptor alpha | 2 | 2 | ||||||||
MIRT645856 | AFF2 | AF4/FMR2 family member 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT653531 | SLC38A9 | solute carrier family 38 member 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT653592 | SLC35B3 | solute carrier family 35 member B3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT654756 | PRKCB | protein kinase C beta | 2 | 2 | ||||||||
MIRT657213 | IGF1R | insulin like growth factor 1 receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT658747 | ELAVL4 | ELAV like RNA binding protein 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT690654 | RPF2 | ribosome production factor 2 homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT691746 | IKBKG | inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit gamma | 2 | 2 | ||||||||
MIRT692854 | ZSWIM1 | zinc finger SWIM-type containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT700080 | RNF38 | ring finger protein 38 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT704431 | CTNNBIP1 | catenin beta interacting protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT717145 | DLEU1 | deleted in lymphocytic leukemia 1 (non-protein coding) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT718664 | HNF4A | hepatocyte nuclear factor 4 alpha | 2 | 2 | ||||||||
MIRT722739 | BRMS1 | breast cancer metastasis suppressor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT733774 | PFKFB3 | 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 3 | 2 | 0 |
miRNA-Drug Associations | |||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|