pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-744 |
Genomic Coordinates | chr17: 12081899 - 12081996 |
Synonyms | MIRN744, hsa-mir-744, MIR744 |
Description | Homo sapiens miR-744 stem-loop |
Comment | This sequence was identified as a miRNA candidate by Berezikov et al. using RAKE and MPSS techniques . |
RNA Secondary Structure | |
Associated Diseases |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-744-5p | |||||||||||||||
Sequence | 11| UGCGGGGCUAGGGCUAACAGCA |32 | |||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||
Experiments | Cloned | DRVs in miRNA |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Biomarker Information |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | TNRC6B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | trinucleotide repeat containing 6B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001024843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_001162501 , NM_015088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on TNRC6B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of TNRC6B (miRNA target sites are highlighted) |
>TNRC6B|NM_001024843|3'UTR 1 ACTTAGAACTTTCAACTCTGACCTCGTGACCTTTTTTGGAACAGCAGCAGCACTAACTTGACCTTTTCGTTTTTTTTTTC 81 AACTTGCAATAAATACATTTTTAAAAGGAAAAAAGAAAACGGAGAGAAAAAAAGGTGGGTCATTGACAGACTGTCTGAGC 161 ACATAGTTGCCTCCCTTATAACTTCAGTTTTTTCGTTTGGAATATGAATCCAAAAAGAGAACATATCACTCTTGAAATAC 241 TTGAATCATGAACGCCAACCTAGAAAGACAATGTGAAGCAAGTACACATACCATTTAAATTTAAACACAAAAAAATTAAA 321 AAAATTAGTTTCTAGTTTTTCACTTTTTTCATGTTATATGGAAGTTGTTGCTAAGAAACATATATACTGAAAAAAAATAG 401 CTTTTTAACTTTGTTTGCACTGGGTGTGTTTCCGTCCTTAGGTCTACCATGTTTGGGAGGGAGGGAAATTCAAAAGAATT 481 GTTGGGGGAGGGGGGAGGGAAGACTTGACGGAGCCTCACTTTAAAAACAAAAACACAAAAAACCTAAAAAAAAAAAAAAG 561 GAAAAAATTTGTGATTGGCTGGTTGATAAATACCAGTGTGTTCTGGCACATGTAACTGCCCAGGCATGCTCGTTCTGGTG 641 TGTGTGTGCACGTGTGTTCATGTGCATTCGCGTGCATCCTTCTCTGTCTCTGTGTGTGTGCCTGTGTTCTTCCCTTCTCC 721 CCTGCCCCACCCTGACTTCTCAGAAAGCTGCATCGCTGACAGTCTGCAGGCTGGCTGGCCGGCCCATCTGCTTTTTATTT 801 TATTTTTTTAACTATGAGAACACACAGGCCCGGAGAGCCACTGCTACTAAAGCAACTCCATTGGGCTGCATTAAGATGAA 881 CAGAGTGCTTTTTAATGATGAAAGCAGGGAGCTCCTTTCCATTTGCAACTTAGCCTGAATGTGGGGTTTCTCTGGCTGTT 961 CTTTTGACCTAGCAGTAGAGTGGAGCACTGCCAAGTCCAAAAAACTAGAGCAGGAGGTACCTCTTGGAGCAACGGTGTGT 1041 TTATTTCTGTTTTTTTTTTTTTTTAAGTGAATGGCCACCAGGCACATCTGAGTATCTGTTAAGTTTCATGCAGGCCTTTT 1121 CGTTAGTTTGAAATGGGAACGGAAGATAACTTTTGATGATGCGATGTCTCAAAAACAGAGAAACTTTGTTCCCTCTTTCC 1201 TTATGATCAGGTTTGAGAAATTCTTCAAAAAATTAGGTGAAGTTGAGTTACATATTTCTGTTGGTTGGTTCTCTTTTTCA 1281 TTTTATGAAAACAGAAAAGAATAAGTGGTGAGCAGCCTCCTGAAAGCATCTGCAGCTACTCCCTCTGCTCCTTTCTCGCC 1361 GAGCGTTACCTGTGCCAGGCCGTGGCGCGTTACAGCACCAGGCCATCACTGACAGAAACGTTTACTTAACGAATGTTCTT 1441 AAACCAGTGTGTACTTCAAGCGTTTCCTTTTGTTTCTCTGTGTTGTGTATTTCCTGTGTATGTGGTTTTGCTTAGGCAGG 1521 TATAACTTAGCGAAGACTTTTAAGTATTGCACCTTTTTTTGATTTTTGACCTCTTCCCCCCACCTTGTAATTTTGCTTTT 1601 TTAATTTCGGTATTTAAATACTTTTTTTTTTTTTTAAGCATCAATGTAGTAGTACTCTGGGCCGAACAGGGGTCAACGTT 1681 TAATCTACAGTTATCACCAACATGTATGTACTTATGTCGGAATCAAAATGTATCAAACTGCTTATTGTGAAGAGAATTAT 1761 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TCCTTACGATACTACGGTGAAAGCCGGGTGCTAGAGCCCCTCTTGTTTACAAGACATAATGAGGGATTTGAAATATGTAA 2721 AAATAAACATGAGAAGCTAAAATGTTCTTCCATCATAAGCTTAAAGGGAAAAAAACTAAAAACTTTAAAAAAAAAAGACC 2801 AAAAAGTGCGTATATATATACATATAAATATATATTTTAGATGAAGACTAACTCTGGGAGCATTTAACAGTGTTTTTTGT 2881 TTCTGTTTTTAACATTTGTTTTCCTGCTTTAAAATTTGCAAGCATTCTCAGGAATTCTAGGGTAGGAAGCCAGTTTTTTG 2961 AAGATGGTTTATTTAACCATATCTTATCCTAGAGAGATGGCTGTTTCTTTCCTGTTAATAAACTTTTACAAGTTCCTGAA 3041 ACTTCAGAAAGTTTAAACAATTTTTACTTAAAAAAATGTAAAAAGAAAAGTCTCCAAACATTATTGTCATACTGGGGATC 3121 ACACATTTTAAAACACATAGAAATATTTTTTAAAAATTATCAATTTAGCAGCAACAGGTAAATTCATTATCTTAAAAATA 3201 TGGGAGAAGGATTAAGCTTTGTAAGAGCTCGATCATGGATTCTTTTGAAATTGTGTGTAGTTTAATGGGAGAGTGTTTGG 3281 TGTATATAGATGAGAATGCCATCACTTTGTTCCTTTCCATTTGAGACTGAACTGAAATCTCCCCTAGTAATTTTTATTTT 3361 TTTAAAGGAACCCTTCTCCTTGTCCCCACAACCCCAGCAACAAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGAAACAACAGCTTAAAAAA 3441 AAAAGTAATCTGTAAAATAGTACAGTTGGATTGCTGAGAATCTATGTAAAGAGTTAGGAAATATAGGTTAATAATTTTTG 3521 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CCAGTGTTCTCTGGAAAAAGTACTCATCCTTTCCTGAATTCAGAGCCCTTCAAGCTCAGGAAACCACGCTTCACTCGTGC 8881 TGACCTGAAAGTTAATCTTTAGGTCGATTTTGAAAAACTCCGCCTCCTCTCTCCTTTTTAATATTTCTTTCTTCCTTTTT 8961 AATCATGTTTAAGTGAACTTACTCTTAGTTATAAGGAACTGTCCTGCTTTGTGGGGAAGAGGGCTGTTGCTTGTCAGGCA 9041 AAAAAGTTTTCTCTTCCTACCCACCATCCCTCTCTCTGCTTCCCTTGCATTTGGCAGGCTGTATGAAGCCAATGAGCTGC 9121 GAGGTGTTTTGACAGGGGAGGTCTGCATGCAGCCTCTTCTTTGTCCTAACAATTCCTTTGTTGATCTTGCCTGTGATGAA 9201 TCATAGCGCCTGCATTGCTCTGGTCTAGGCATTATTTGCAACACACAGTATCGTAAGCGAGAGATTGTTCTGCCTATATT 9281 CAGTGTTTTCCATGCAGCAATTCTTCTTGTTGACGTTCACAGTACTGTAACGAGTAACAGACTTGATCACAGTCTCCTCG 9361 TGCCTGTGCAGGGCTGCACAGGCATGATCTTATCAGGGTTCCAATCTGTTAGATTGCCTTTAAACAAAAAAAACAACAAA 9441 AAAATAAAATCCTGACGTTTCAACTGTCTCACACAAAATAATACCTCGAGGTACATTTCCCCCTGCAATGTAAACCCTTA 9521 ACTCCTCTCTCCTTTCTGACATCAGTGGATTATCCTTTTTAAAATATGAACATGTAAATAGCAGGATAACTTTAAAAAAC 9601 ATTTTCTTTGCTGTGAAAGTAACCCTAAAATATGTTTTCTTCTTTTGTATTTTTTTGGTTTTTGTTTTTAAGCCATCAGA 9681 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ATGTGGATCTGTCAGCTATTGCTTGCCTAGATTTGGGCACCCATGAAGCAGGGTTGGAATGGATCATTTTGAATTGCTTC 10641 TTTGCAGACACCCCCTTCGCCCCCATCTTTAAGATAAACCCTTTACTAGTCAAGAAGCCCTTTTCAGTTGGATCTCACTG 10721 ATCTTGTATAGTGACGACTTCCTTTGAAGGAAGAAGCTTGATTATAAGTGCATGCATATTATCCACCCACCTTCTGATTT 10801 GGGCACTGTTCACCTTGGAATTTTATTTATTTTGTTTATCTGGAGGCCCTTTTTCTATCAGTCTCTGATCCCTCATGGGT 10881 TCTGCCTGCCCTTGTATCTCTTGTACAATGCTCCCAAAGGGCTTTGCTGATCTCTGCACTTCTTTCCTGGGACACTCCCC 10961 CCACCACCACCCTTTGCACACACCAGTGACCAAAGTGTATGCAGTGATCTCACAGAAGACATCAAAAATGGTGCATGCAC 11041 CGTGAATGTGCTCACAGAGACACGTGCACAAGATTCTGCACCCTTGGCCTTAATCTCAGTATGACTTAAGGTGCAGGAAC 11121 ATTTTTAACAGGTTTTAAAAAAACAAAAAACCCTTCTGGGAGGAAAAAAATAAAAAGCAGATACAACAGCTCAACTGTTC 11201 CCACTCCTAACTCTCCACTATGTGCTTATAACTTCACATTCTATGCCCTCCCCGCCACCCACCTCATCCCTGTTCTGCGT 11281 AACCAAAAAACAGACAACAAAAGCAACCTGAGGAGAGGTTTCTGGACTATTTTATCTGTCTCCATTTAGATGGAGATATA 11361 AATGCTGCTTTGGGTTCCATAATCCTAGGGGGCTATGTTTACATAGTAAAATACATCCTACCAAATCAGGAAACAGTGAA 11441 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Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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