pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-382 |
Genomic Coordinates | chr14: 101054306 - 101054381 |
Synonyms | MIRN382, hsa-mir-382, MIR382 |
Description | Homo sapiens miR-382 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | |
Associated Diseases |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-382-5p | ||||||||||||||||||
Sequence | 11| GAAGUUGUUCGUGGUGGAUUCG |32 | ||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||||||||
Experiments | Cloned | ||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | PTEN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 10q23del, BZS, CWS1, DEC, GLM2, MHAM, MMAC1, PTEN1, PTENbeta, TEP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | phosphatase and tensin homolog | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_000314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on PTEN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of PTEN (miRNA target sites are highlighted) |
>PTEN|NM_000314|3'UTR 1 ATTTTTTTTTATCAAGAGGGATAAAACACCATGAAAATAAACTTGAATAAACTGAAAATGGACCTTTTTTTTTTTAATGG 81 CAATAGGACATTGTGTCAGATTACCAGTTATAGGAACAATTCTCTTTTCCTGACCAATCTTGTTTTACCCTATACATCCA 161 CAGGGTTTTGACACTTGTTGTCCAGTTGAAAAAAGGTTGTGTAGCTGTGTCATGTATATACCTTTTTGTGTCAAAAGGAC 241 ATTTAAAATTCAATTAGGATTAATAAAGATGGCACTTTCCCGTTTTATTCCAGTTTTATAAAAAGTGGAGACAGACTGAT 321 GTGTATACGTAGGAATTTTTTCCTTTTGTGTTCTGTCACCAACTGAAGTGGCTAAAGAGCTTTGTGATATACTGGTTCAC 401 ATCCTACCCCTTTGCACTTGTGGCAACAGATAAGTTTGCAGTTGGCTAAGAGAGGTTTCCGAAGGGTTTTGCTACATTCT 481 AATGCATGTATTCGGGTTAGGGGAATGGAGGGAATGCTCAGAAAGGAAATAATTTTATGCTGGACTCTGGACCATATACC 561 ATCTCCAGCTATTTACACACACCTTTCTTTAGCATGCTACAGTTATTAATCTGGACATTCGAGGAATTGGCCGCTGTCAC 641 TGCTTGTTGTTTGCGCATTTTTTTTTAAAGCATATTGGTGCTAGAAAAGGCAGCTAAAGGAAGTGAATCTGTATTGGGGT 721 ACAGGAATGAACCTTCTGCAACATCTTAAGATCCACAAATGAAGGGATATAAAAATAATGTCATAGGTAAGAAACACAGC 801 AACAATGACTTAACCATATAAATGTGGAGGCTATCAACAAAGAATGGGCTTGAAACATTATAAAAATTGACAATGATTTA 881 TTAAATATGTTTTCTCAATTGTAACGACTTCTCCATCTCCTGTGTAATCAAGGCCAGTGCTAAAATTCAGATGCTGTTAG 961 TACCTACATCAGTCAACAACTTACACTTATTTTACTAGTTTTCAATCATAATACCTGCTGTGGATGCTTCATGTGCTGCC 1041 TGCAAGCTTCTTTTTTCTCATTAAATATAAAATATTTTGTAATGCTGCACAGAAATTTTCAATTTGAGATTCTACAGTAA 1121 GCGTTTTTTTTCTTTGAAGATTTATGATGCACTTATTCAATAGCTGTCAGCCGTTCCACCCTTTTGACCTTACACATTCT 1201 ATTACAATGAATTTTGCAGTTTTGCACATTTTTTAAATGTCATTAACTGTTAGGGAATTTTACTTGAATACTGAATACAT 1281 ATAATGTTTATATTAAAAAGGACATTTGTGTTAAAAAGGAAATTAGAGTTGCAGTAAACTTTCAATGCTGCACACAAAAA 1361 AAAGACATTTGATTTTTCAGTAGAAATTGTCCTACATGTGCTTTATTGATTTGCTATTGAAAGAATAGGGTTTTTTTTTT 1441 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATGTGCAGTGTTGAATCATTTCTTCATAGTGCTCCCCCGAGTTGGGACTAGGGCTTCAA 1521 TTTCACTTCTTAAAAAAAATCATCATATATTTGATATGCCCAGACTGCATACGATTTTAAGCGGAGTACAACTACTATTG 1601 TAAAGCTAATGTGAAGATATTATTAAAAAGGTTTTTTTTTCCAGAAATTTGGTGTCTTCAAATTATACCTTCACCTTGAC 1681 ATTTGAATATCCAGCCATTTTGTTTCTTAATGGTATAAAATTCCATTTTCAATAACTTATTGGTGCTGAAATTGTTCACT 1761 AGCTGTGGTCTGACCTAGTTAATTTACAAATACAGATTGAATAGGACCTACTAGAGCAGCATTTATAGAGTTTGATGGCA 1841 AATAGATTAGGCAGAACTTCATCTAAAATATTCTTAGTAAATAATGTTGACACGTTTTCCATACCTTGTCAGTTTCATTC 1921 AACAATTTTTAAATTTTTAACAAAGCTCTTAGGATTTACACATTTATATTTAAACATTGATATATAGAGTATTGATTGAT 2001 TGCTCATAAGTTAAATTGGTAAAGTTAGAGACAACTATTCTAACACCTCACCATTGAAATTTATATGCCACCTTGTCTTT 2081 CATAAAAGCTGAAAATTGTTACCTAAAATGAAAATCAACTTCATGTTTTGAAGATAGTTATAAATATTGTTCTTTGTTAC 2161 AATTTCGGGCACCGCATATTAAAACGTAACTTTATTGTTCCAATATGTAACATGGAGGGCCAGGTCATAAATAATGACAT 2241 TATAATGGGCTTTTGCACTGTTATTATTTTTCCTTTGGAATGTGAAGGTCTGAATGAGGGTTTTGATTTTGAATGTTTCA 2321 ATGTTTTTGAGAAGCCTTGCTTACATTTTATGGTGTAGTCATTGGAAATGGAAAAATGGCATTATATATATTATATATAT 2401 AAATATATATTATACATACTCTCCTTACTTTATTTCAGTTACCATCCCCATAGAATTTGACAAGAATTGCTATGACTGAA 2481 AGGTTTTCGAGTCCTAATTAAAACTTTATTTATGGCAGTATTCATAATTAGCCTGAAATGCATTCTGTAGGTAATCTCTG 2561 AGTTTCTGGAATATTTTCTTAGACTTTTTGGATGTGCAGCAGCTTACATGTCTGAAGTTACTTGAAGGCATCACTTTTAA 2641 GAAAGCTTACAGTTGGGCCCTGTACCATCCCAAGTCCTTTGTAGCTCCTCTTGAACATGTTTGCCATACTTTTAAAAGGG 2721 TAGTTGAATAAATAGCATCACCATTCTTTGCTGTGGCACAGGTTATAAACTTAAGTGGAGTTTACCGGCAGCATCAAATG 2801 TTTCAGCTTTAAAAAATAAAAGTAGGGTACAAGTTTAATGTTTAGTTCTAGAAATTTTGTGCAATATGTTCATAACGATG 2881 GCTGTGGTTGCCACAAAGTGCCTCGTTTACCTTTAAATACTGTTAATGTGTCATGCATGCAGATGGAAGGGGTGGAACTG 2961 TGCACTAAAGTGGGGGCTTTAACTGTAGTATTTGGCAGAGTTGCCTTCTACCTGCCAGTTCAAAAGTTCAACCTGTTTTC 3041 ATATAGAATATATATACTAAAAAATTTCAGTCTGTTAAACAGCCTTACTCTGATTCAGCCTCTTCAGATACTCTTGTGCT 3121 GTGCAGCAGTGGCTCTGTGTGTAAATGCTATGCACTGAGGATACACAAAAATACCAATATGATGTGTACAGGATAATGCC 3201 TCATCCCAATCAGATGTCCATTTGTTATTGTGTTTGTTAACAACCCTTTATCTCTTAGTGTTATAAACTCCACTTAAAAC 3281 TGATTAAAGTCTCATTCTTGTCATTGTGTGGGTGTTTTATTAAATGAGAGTTTATAATTCAAATTGCTTAAGTCCATTGA 3361 AGTTTTAATTAATGGGCAGCCAAATGTGAATACAAAGTTTTCAGTTTTTTTTTTTCCTGCTGTCCTTCAAAGCCTACTGT 3441 TTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGGCCTGAGAGTAGAGTATCTGTCTACTCATGTTTAATTAAGGAAAAACACTTAT 3521 TTTTAGGGCTTTAGTCATCACTTCATAAATTGTATAAGCACATTAAATAGCGTTCTAGTCCTGAAAAAGTCCAAGATTCT 3601 TAGAAAATTGTGCATATTTTTATTATGACAGATGTTTGAAGATAATTCCCCAGAATGGATTTGATACTTTAGATTTCAAT 3681 TTTGTGGCTTTTGTCTATTATTCTGTACTCTGCCATCAGCATATGGAAAGCTTCATTTACTCATCATGACTTGTGCCATA 3761 TAAAAATTGATATTTCGGAATAGTCTAAAGGACTTTTTGTACTTGAATTTAATCATGTTGTTTCTAATATTCTTAAAAGC 3841 TTGAAGACTAAAGCATATCCTTTCAACAAAGCATAGTAAGGTAATAAGAAAGTGTAGTTTGTACAAGTGTTAAAAAAATA 3921 AAGTAGACAATGTTACAGTGGGACTTATTATTTCAAGTTTACATTTTCTCCATGTAATTTTTTAAAAAGTAAATGAAAAA 4001 ATGTGCAATAATGTAAAATATGAAGTGTATGTGTACACACATTTTATTTTTCGGTATCTTGGGTATACGTATGGTTGAAA 4081 ACTATACTGGAGTCTAAAAGTATTCTAATTTATAAGAAGACATTTTGGTGATGTTTGAAAAATAGAAATGTGCTAGTTTT 4161 GTTTTTATATCATGTCCTTTGTACGTTGTAATATGAGCTGGCTTGGTTCAGTAAATGCCATCACCATTTCCATTGAGAAT 4241 TTAAAACTCACCAGTGTTTAATATGCAGGCTTCCAAAGGCTTATGAAAAAAATCAAGACCCTTAAATCTAGTTAATTTGC 4321 TGCTAACATGAAACTCTTTGGTTCTTTTATTTTTGCCAGATAATTAGACACACATCTAAAGCTTAGTCTTAAATGGCTTA 4401 AGTGTAGCTATTGATTAGTGCTGTTGCTAGTTCAGAAAGAAATGTTTGTGAATGGAAACAAGAATATTCAGTCCAAACTG 4481 TTGTAAGGACAGTACCTGAAAACCAGGAAACAGGATAATGGAAAAAGTCTTTTAAAGATGAAATGTTGGAGCCAACTTTC 4561 TTATAGAATTAATTGTATGTGGCTATAGAAAGCCTAATGATTGTTGCTTATTTTTGAGAGCATATTATTCTTTTATGACC 4641 ATAATCTTGCTGTTTTTCCATCTTCCAAAAGATCTTCCTTCTAATATGTATATCAGAATGTGGGTAGCCAGTCAGACAAA 4721 TTCATATTGGTTGGTAGCTTTAAAAAGTTTGTAATGTGAAGACAGGAAAGGACAAAATAGTTTGCTTTGGTGGTAGTACT 4801 CTGGTTGTTAAGCTAGGTATTTTGAGACTACTTCCCCATCACAACAACAATAAAATAATCACTCATAATCCTATCACCTG 4881 GAGACATAGCCATCGTTAATATGTTAGTGACTATACAATCATGTTTTCTTCTGTATATCCATGTATATTCTTTAAAAATG 4961 AAATTTATACTGTACCTGATCTCAAAGCTTTTTAGCTTAGTATATCTGTCATGAATTTGTAGGATGTTCCATTGCATCAG 5041 AAAACGGACAGTGATTTGATTACTTTCTAATGCCACAGATGCAGATTACATGTAGTTATTGAGAATCCTTTCGAATTCAG 5121 TGGCTTAATCATGAATGTCTAAATATTGTTGACATTAGGATGATACATGTAAATTAAAGTTACATTTGTTTAGCATAGAC 5201 AAGCTTAACATTGTAGATGTTTCTCTTCAAAAATCATCTTAAACATTTGCATTTGGAATTGTGTTAAATAGAATGTGTGA 5281 AACACTGTATTAGTAAACTTCATCACCTTTCTACTTCCTTATAGTTTGAACTTTTCAGTTTTTGTAGTTCCCAAACAGTT 5361 GCTCAATTTAGAGCAAATTAATTTAACACCTGCCAAAAAAAGGCTGCTGTTGGCTTATCAGTTGTCTTTAAATTCAAATG 5441 CTCATGTGACTTTTATCACATCAAAAAATATTTCATTAATGATTCACCTTTAGCTCTGAAAATTACCGCGTTTAGTAATT 5521 ATAGTGGGCTTATAAAAACATGCAACTCTTTTTGATAGTTATTTGAGAATTTTGGTGAAAAATATTTAGCTGAGGGCAGT 5601 ATAGAACTTATAAACCAATATATTGATATTTTTAAAACATTTTTACATATAAGTAAACTGCCATCTTTGAGCATAACTAC 5681 ATTTAAAAATAAAGCTGCATATTTTTAAATCAAGTGTTTAACAAGAATTTATATTTTTTATTTTTTAAAATTAAAAATAA 5761 TTTATATTTCCTCTGTTGCATGAGGATTCTCATCTGTGCTTATAATGGTTAGAGATTTTATTTGTGTGGAATGAAGTGAG 5841 GCTTGTAGTCATGGTTCTAGTGTTTCAGTTTGCCAAGTCTGTTTACTGCAGTGAAATTCATCAAATGTTTCAGTGTGGTT 5921 TTCTGTAGCCTATCATTTACTGGCTATTTTTTTATGTACACCTTTAGGATTTTCTGCCTACTCTATCCAGTTGTCCAAAT 6001 GATATCCTACATTTTACAAATGCCCTTTCAGTTTCTATTTTCTTTTTCCATTAAATTGCCCTCATGTCCTAATGTGCAGT 6081 TTGTAAGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGAATTTGATTTTCAAGAGTGCTAGACTTCCAATTTGAGAGATTAAA 6161 TAATTTAATTCAGGCAAACATTTTTCATTGGAATTTCACAGTTCATTGTAATGAAAATGTTAATCCTGGATGACCTTTGA 6241 CATACAGTAATGAATCTTGGATATTAATGAATTTGTTAGTAGCATCTTGATGTGTGTTTTAATGAGTTATTTTCAAAGTT 6321 GTGCATTAAACCAAAGTTGGCATACTGGAAGTGTTTATATCAAGTTCCATTTGGCTACTGATGGACAAAAAATAGAAATG 6401 CCTTCCTATGGAGAGTATTTTTCCTTTAAAAAATTAAAAAGGTTAATTATTTTGACTAAAAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Non-Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | xx |
Validation Method |
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Conditions | MKN1 |
Disease | gastric cancer |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | miRanda , TargetScan |
Original Description (Extracted from the article) |
...
miR-382 induced by hypoxia promotes angiogenesis and acts as an angiogenic oncogene by repressing PTEN//PTEN is a target of miR-382
... - Seok JK; Lee SH; Kim MJ; Lee YM, 2014, Nucleic acids research. |
Article |
- Seok JK; Lee SH; Kim MJ; Lee YM - Nucleic acids research, 2014
Recent studies have revealed that microRNAs (miRs) play important roles in the regulation of angiogenesis. In this study, we have characterized miR-382 upregulation by hypoxia and the functional relevance of miR-382 in tumor angiogenesis. miRs induced by hypoxia in MKN1 human gastric cancer cells were investigated using miRNA microarrays. We selected miR-382 and found that the expression of miR-382 was regulated by HIF-1alpha. Conditioned media (CM) from MKN1 cells transfected with a miR-382 inhibitor (antagomiR-382) under hypoxic conditions significantly decreased vascular endothelial cell (EC) proliferation, migration and tube formation. Algorithmic programs (Target Scan, miRanda and cbio) predicted that phosphatase and tensin homolog (PTEN) is a target gene of miR-382. Deletion of miR382-binding sequences in the PTEN mRNA 3'-untranslated region (UTR) diminished the luciferase reporter activity. Subsequent study showed that the overexpression of miR-382 or antagomiR-382 down- or upregulated PTEN and its downstream target AKT/mTOR signaling pathway, indicating that PTEN is a functional target gene of miR-382. In addition, PTEN inhibited miR-382-induced in vitro and in vivo angiogenesis as well as VEGF secretion, and the inhibition of miR-382 expression reduced xenograft tumor growth and microvessel density in tumors. Taken together, these results suggest that miR-382 induced by hypoxia promotes angiogenesis and acts as an angiogenic oncogene by repressing PTEN.
LinkOut: [PMID: 24914051]
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MiRNA-Target Expression Profile | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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112 hsa-miR-382-5p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT053778 | PTEN | phosphatase and tensin homolog | 4 | 1 | ||||||||
MIRT060847 | XPR1 | xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT064748 | CCND2 | cyclin D2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT066666 | DYRK2 | dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT077432 | PNPO | pyridoxamine 5'-phosphate oxidase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT082804 | ZNF264 | zinc finger protein 264 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT089341 | PCBP1 | poly(rC) binding protein 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT176641 | SMC3 | structural maintenance of chromosomes 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT223217 | ZKSCAN5 | zinc finger with KRAB and SCAN domains 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT229780 | GNL3L | G protein nucleolar 3 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT244332 | ARL4A | ADP ribosylation factor like GTPase 4A | 1 | 1 | ||||||||
MIRT326971 | EIF1AX | eukaryotic translation initiation factor 1A, X-linked | 2 | 4 | ||||||||
MIRT369626 | APCDD1 | APC down-regulated 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT407707 | MXD1 | MAX dimerization protein 1 | 2 | 1 | ||||||||
MIRT437905 | NFIA | nuclear factor I A | 2 | 1 | ||||||||
MIRT438103 | DRD1 | dopamine receptor D1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439190 | ZNF652 | zinc finger protein 652 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439248 | ZCCHC14 | zinc finger CCHC-type containing 14 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439276 | XPO1 | exportin 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439382 | TSPYL1 | TSPY like 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439494 | SYT13 | synaptotagmin 13 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439497 | SYNJ2 | synaptojanin 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439516 | STT3A | STT3A, catalytic subunit of the oligosaccharyltransferase complex | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439564 | SOGA2 | microtubule crosslinking factor 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439677 | SERGEF | secretion regulating guanine nucleotide exchange factor | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439709 | SAR1B | secretion associated Ras related GTPase 1B | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439802 | RBM39 | RNA binding motif protein 39 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439819 | RAPH1 | Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439894 | PRNP | prion protein | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439921 | PPM1A | protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439942 | PNMA2 | paraneoplastic Ma antigen 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439999 | PFKFB2 | 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440023 | PCNXL2 | pecanex homolog 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440041 | PARM1 | prostate androgen-regulated mucin-like protein 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440180 | MTRNR2L8 | MT-RNR2-like 8 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440191 | MTRNR2L2 | MT-RNR2-like 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440195 | MTRNR2L1 | MT-RNR2-like 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440198 | MTPN | myotrophin | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440303 | LUZP6 | leucine zipper protein 6 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440365 | KIF5C | kinesin family member 5C | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440376 | KIAA2022 | neurite extension and migration factor | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440514 | HERC2 | HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440626 | FNIP1 | folliculin interacting protein 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440679 | FAM199X | family with sequence similarity 199, X-linked | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440762 | DYNC1H1 | dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440814 | DICER1 | dicer 1, ribonuclease III | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440839 | DDOST | dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase non-catalytic subunit | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440851 | DAD1 | defender against cell death 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440909 | COPS4 | COP9 signalosome subunit 4 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440931 | CLTC | clathrin heavy chain | 1 | 1 | ||||||||
MIRT441003 | CASP3 | caspase 3 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT441121 | BBS4 | Bardet-Biedl syndrome 4 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT441181 | ARMCX3 | armadillo repeat containing, X-linked 3 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT441259 | ADM | adrenomedullin | 1 | 1 | ||||||||
MIRT441796 | EXOSC2 | exosome component 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443001 | SLC3A1 | solute carrier family 3 member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT445896 | FAM46A | family with sequence similarity 46 member A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT445930 | UFL1 | UFM1 specific ligase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT447479 | NYAP2 | neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT450664 | SMURF2 | SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT454105 | TMEM209 | transmembrane protein 209 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT459477 | HIST1H3G | histone cluster 1 H3 family member g | 2 | 2 | ||||||||
MIRT464867 | UBB | ubiquitin B | 2 | 8 | ||||||||
MIRT466300 | TM4SF1 | transmembrane 4 L six family member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT470024 | PTP4A2 | protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT472335 | NETO2 | neuropilin and tolloid like 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT472973 | MSANTD3 | Myb/SANT DNA binding domain containing 3 | < |