pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-190b |
Genomic Coordinates | chr1: 154193665 - 154193743 |
Description | Homo sapiens miR-190b stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | |
Associated Diseases |
Mature miRNA Information | |
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Mature miRNA | hsa-miR-190b |
Sequence | 11| UGAUAUGUUUGAUAUUGGGUU |31 |
Evidence | Not_experimental |
Experiments | |
Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | IGF1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | IGF-I, IGFI, MGF | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | insulin like growth factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001111283 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_000618 , NM_001111284 , NM_001111285 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on IGF1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of IGF1 (miRNA target sites are highlighted) |
>IGF1|NM_001111283|3'UTR 1 AGGGAGTGCAGGAAACAAGAACTACAGGATGTAGGAAGACCCTCCTGAGGAGTGAAGAGTGACATGCCACCGCAGGATCC 81 TTTGCTCTGCACGAGTTACCTGTTAAACTTTGGAACACCTACCAAAAAATAAGTTTGATAACATTTAAAAGATGGGCGTT 161 TCCCCCAATGAAATACACAAGTAAACATTCCAACATTGTCTTTAGGAGTGATTTGCACCTTGCAAAAATGGTCCTGGAGT 241 TGGTAGATTGCTGTTGATCTTTTATCAATAATGTTCTATAGAAAAGAAAAAAAAAATATATATATATATATATCTTAGTC 321 CCTGCCTCTCAAGAGCCACAAATGCATGGGTGTTGTATAGATCCAGTTGCACTAAATTCCTCTCTGAATCTTGGCTGCTG 401 GAGCCATTCATTCAGCAACCTTGTCTAAGTGGTTTATGAATTGTTTCCTTATTTGCACTTCTTTCTACACAACTCGGGCT 481 GTTTGTTTTACAGTGTCTGATAATCTTGTTAGTCTATACCCACCACCTCCCTTCATAACCTTTATATTTGCCGAATTTGG 561 CCTCCTCAAAAGCAGCAGCAAGTCGTCAAGAAGCACACCAATTCTAACCCACAAGATTCCATCTGTGGCATTTGTACCAA 641 ATATAAGTTGGATGCATTTTATTTTAGACACAAAGCTTTATTTTTCCACATCATGCTTACAAAAAAGAATAATGCAAATA 721 GTTGCAACTTTGAGGCCAATCATTTTTAGGCATATGTTTTAAACATAGAAAGTTTCTTCAACTCAAAAGAGTTCCTTCAA 801 ATGATGAGTTAATGTGCAACCTAATTAGTAACTTTCCTCTTTTTATTTTTTCCATATAGAGCACTATGTAAATTTAGCAT 881 ATCAATTATACAGGATATATCAAACAGTATGTAAAACTCTGTTTTTTAGTATAATGGTGCTATTTTGTAGTTTGTTATAT 961 GAAAGAGTCTGGCCAAAACGGTAATACGTGAAAGCAAAACAATAGGGGAAGCCTGGAGCCAAAGATGACACAAGGGGAAG 1041 GGTACTGAAAACACCATCCATTTGGGAAAGAAGGCAAAGTCCCCCCAGTTATGCCTTCCAAGAGGAACTTCAGACACAAA 1121 AGTCCACTGATGCAAATTGGACTGGCGAGTCCAGAGAGGAAACTGTGGAATGGAAAAAGCAGAAGGCTAGGAATTTTAGC 1201 AGTCCTGGTTTCTTTTTCTCATGGAAGAAATGAACATCTGCCAGCTGTGTCATGGACTCACCACTGTGTGACCTTGGGCA 1281 AGTCACTTCACCTCTCTGTGCCTCAGTTTCCTCATCTGCAAAATGGGGGCAATATGTCATCTACCTACCTCAAAGGGGTG 1361 GTATAAGGTTTAAAAAGATAAAGATTCAGATTTTTTTTACCCTGGGTTGCTGTAAGGGTGCAACATCAGGGCGCTTGAGT 1441 TGCTGAGATGCAAGGAATTCTATAAATAACCCATTCATAGCATAGCTAGAGATTGGTGAATTGAATGCTCCTGACATCTC 1521 AGTTCTTGTCAGTGAAGCTATCCAAATAACTGGCCAACTAGTTGTTAAAAGCTAACAGCTCAATCTCTTAAAACACTTTT 1601 CAAAATATGTGGGAAGCATTTGATTTTCAATTTGATTTTGAATTCTGCATTTGGTTTTATGAATACAAAGATAAGTGAAA 1681 AGAGAGAAAGGAAAAGAAAAAGGAGAAAAACAAAGAGATTTCTACCAGTGAAAGGGGAATTAATTACTCTTTGTTAGCAC 1761 TCACTGACTCTTCTATGCAGTTACTACATATCTAGTAAAACCTCGTTTAATACTATAAATAATATTCTATTCATTTTGAA 1841 AAACACAATGATTCCTTCTTTTCTAGGCAATATAAGGAAAGTGATCCAAAATTTGAAATATTAAAATAATATCTAATAAA 1921 AAGTCACAAAGTTATCTTCTTTAACAAACTTTACTCTTATTCTTAGCTGTATATACATTTTTTTAAAAGTTTGTTAAAAT 2001 ATGCTTGACTAGAGTTTCCAGTTGAAAGGCAAAAACTTCCATCACAACAAGAAATTTCCCATGCCTGCTCAGAAGGGTAG 2081 CCCCTAGCTCTCTGTGAATGTGTTTTATCCATTCAACTGAAAATTGGTATCAAGAAAGTCCACTGGTTAGTGTACTAGTC 2161 CATCATAGCCTAGAAAATGATCCCTATCTGCAGATCAAGATTTTCTCATTAGAACAATGAATTATCCAGCATTCAGATCT 2241 TTCTAGTCACCTTAGAACTTTTTGGTTAAAAGTACCCAGGCTTGATTATTTCATGCAAATTCTATATTTTACATTCTTGG 2321 AAAGTCTATATGAAAAACAAAAATAACATCTTCAGTTTTTCTCCCACTGGGTCACCTCAAGGATCAGAGGCCAGGAAAAA 2401 AAAAAAAAAGACTCCCTGGATCTCTGAATATATGCAAAAAGAAGGCCCCATTTAGTGGAGCCAGCAATCCTGTTCAGTCA 2481 ACAAGTATTTTAACTCTCAGTCCAACATTATTTGAATTGAGCACCTCAAGCATGCTTAGCAATGTTCTAATCACTATGGA 2561 CAGATGTAAAAGAAACTATACATCATTTTTGCCCTCTGCCTGTTTTCCAGACATACAGGTTCTGTGGAATAAGATACTGG 2641 ACTCCTCTTCCCAAGATGGCACTTCTTTTTATTTCTTGTCCCCAGTGTGTACCTTTTAAAATTATTCCCTCTCAACAAAA 2721 CTTTATAGGCAGTCTTCTGCAGACTTAACGTGTTTTCTGTCATAGTTAGATGTGATAATTCTAAGAGTGTCTATGACTTA 2801 TTTCCTTCACTTAATTCTATCCACAGTCAAAAATCCCCCAAGGAGGAAAGCTGAAAGATGCACTGCCATATTATCTTTCT 2881 TAACTTTTTCCAACACATAATCCTCTCCAACTGGATTATAAATAAATTGAAAATAACTCATTATACCAATTCACTATTTT 2961 ATTTTTTAATGAATTAAAACTAGAAAACAAATTGATGCAAACCCTGGAAGTCAGTTGATTACTATATACTACAGCAGAAT 3041 GACTCAGATTTCATAGAAAGGAGCAACCAAAATGTCACAACCCAAAACTTTACAAGCTTTGCTTCAGAATTAGATTGCTT 3121 TATAATTCTTGAATGAGGCAATTTCAAGATATTTGTAAAAGAACAGTAAACATTGGTAAGAATGAGCTTTCAACTCATAG 3201 GCTTATTTCCAATTTAATTGACCATACTGGATACTTAGGTCAAATTTCTGTTCTCTCTTCCCCAAATAATATTAAAGTAT 3281 TATTTGAACTTTTTAAGATGAGGCAGTTCCCCTGAAAAAGTTAATGCAGCTCTCCATCAGAATCCACTCTTCTAGGGATA 3361 TGAAAATCTCTTAACACCCACCCTACATACACAGACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATTCACCC 3441 TAAGGATCCAATGGAATACTGAAAAGAAATCACTTCCTTGAAAATTTTATTAAAAAACAAACAAACAAACAAAAAGCCTG 3521 TCCACCCTTGAGAATCCTTCCTCTCCTTGGAACGTCAATGTTTGTGTAGATGAAACCATCTCATGCTCTGTGGCTCCAGG 3601 GTTTCTGTTACTATTTTATGCACTTGGGAGAAGGCTTAGAATAAAAGATGTAGCACATTTTGCTTTCCCATTTATTGTTT 3681 GGCCAGCTATGCCAATGTGGTGCTATTGTTTCTTTAAGAAAGTACTTGACTAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAAGA 3761 AAGCATAGACATATTTTTTTAAAGTATAAAAACAACAATTCTATAGATAGATGGCTTAATAAAATAGCATTAGGTCTATC 3841 TAGCCACCACCACCTTTCAACTTTTTATCACTCACAAGTAGTGTACTGTTCACCAAATTGTGAATTTGGGGGTGCAGGGG 3921 CAGGAGTTGGAAATTTTTTAAAGTTAGAAGGCTCCATTGTTTTGTTGGCTCTCAAACTTAGCAAAATTAGCAATATATTA 4001 TCCAATCTTCTGAACTTGATCAAGAGCATGGAGAATAAACGCGGGAAAAAAGATCTTATAGGCAAATAGAAGAATTTAAA 4081 AGATAAGTAAGTTCCTTATTGATTTTTGTGCACTCTGCTCTAAAACAGATATTCAGCAAGTGGAGAAAATAAGAACAAAG 4161 AGAAAAAATACATAGATTTACCTGCAAAAAATAGCTTCTGCCAAATCCCCCTTGGGTATTCTTTGGCATTTACTGGTTTA 4241 TAGAAGACATTCTCCCTTCACCCAGACATCTCAAAGAGCAGTAGCTCTCATGAAAAGCAATCACTGATCTCATTTGGGAA 4321 ATGTTGGAAAGTATTTCCTTATGAGATGGGGGTTATCTACTGATAAAGAAAGAATTTATGAGAAATTGTTGAAAGAGATG 4401 GCTAACAATCTGTGAAGATTTTTTGTTTCTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTATACAGTCTTTATGAATTTCT 4481 TAATGTTCAAAATGACTTGGTTCTTTTCTTCTTTTTTTATATCAGAATGAGGAATAATAAGTTAAACCCACATAGACTCT 4561 TTAAAACTATAGGCTAGATAGAAATGTATGTTTGACTTGTTGAAGCTATAATCAGACTATTTAAAATGTTTTGCTATTTT 4641 TAATCTTAAAAGATTGTGCTAATTTATTAGAGCAGAACCTGTTTGGCTCTCCTCAGAAGAAAGAATCTTTCCATTCAAAT 4721 CACATGGCTTTCCACCAATATTTTCAAAAGATAAATCTGATTTATGCAATGGCATCATTTATTTTAAAACAGAAGAATTG 4801 TGAAAGTTTATGCCCCTCCCTTGCAAAGACCATAAAGTCCAGATCTGGTAGGGGGGCAACAACAAAAGGAAAATGTTGTT 4881 GATTCTTGGTTTTGGATTTTGTTTTGTTTTCAATGCTAGTGTTTAATCCTGTAGTACATATTTGCTTATTGCTATTTTAA 4961 TATTTTATAAGACCTTCCTGTTAGGTATTAGAAAGTGATACATAGATATCTTTTTTGTGTAATTTCTATTTAAAAAAGAG 5041 AGAAGACTGTCAGAAGCTTTAAGTGCATATGGTACAGGATAAAGATATCAATTTAAATAACCAATTCCTATCTGGAACAA 5121 TGCTTTTGTTTTTTAAAGAAACCTCTCACAGATAAGACAGAGGCCCAGGGGATTTTTGAAGCTGTCTTTATTCTGCCCCC 5201 ATCCCAACCCAGCCCTTATTATTTTAGTATCTGCCTCAGAATTTTATAGAGGGCTGACCAAGCTGAAACTCTAGAATTAA 5281 AGGAACCTCACTGAAAACATATATTTCACGTGTTCCCTCTTTTTTTTTTTCCTTTTTGTGAGATGGGGTCTCGCACTGTC 5361 CCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTTAAGCGATTCTCCTGCCTCAG 5441 CCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCACCACTATGCCCGGCTAATTTTTTGGATTTTTAATAGAGACGGGGTTTTA 5521 CCATGTTGGCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTGACCTTGTGATTTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGATTACAGGC 5601 ATGAGCCACCACACCCTGCCCATGTGTTCCCTCTTAATGTATGATTACATGGATCTTAAACATGATCCTTCTCTCCTCAT 5681 TCTTCAACTATCTTTGATGGGGTCTTTCAAGGGGAAAAAAATCCAAGCTTTTTTAAAGTAAAAAAAAAAAAAGAGAGGAC 5761 ACAAAACCAAATGTTACTGCTCAACTGAAATATGAGTTAAGATGGAGACAGAGTTTCTCCTAATAACCGGAGCTGAATTA 5841 CCTTTCACTTTCAAAAACATGACCTTCCACAATCCTTAGAATCTGCCTTTTTTTATATTACTGAGGCCTAAAAGTAAACA 5921 TTACTCATTTTATTTTGCCCAAAATGCACTGATGTAAAGTAGGAAAAATAAAAACAGAGCTCTAAAATCCCTTTCAAGCC 6001 ACCCATTGACCCCACTCACCAACTCATAGCAAAGTCACTTCTGTTAATCCCTTAATCTGATTTTGTTTGGATATTTATCT 6081 TGTACCCGCTGCTAAACACACTGCAGGAGGGACTCTGAAACCTCAAGCTGTCTACTTACATCTTTTATCTGTGTCTGTGT 6161 ATCATGAAAATGTCTATTCAAAATATCAAAACCTTTCAAATATCACGCAGCTTATATTCAGTTTACATAAAGGCCCCAAA 6241 TACCATGTCAGATCTTTTTGGTAAAAGAGTTAATGAACTATGAGAATTGGGATTACATCATGTATTTTGCCTCATGTATT 6321 TTTATCACACTTATAGGCCAAGTGTGATAAATAAACTTACAGACACTGAATTAATTTCCCCTGCTACTTTGAAACCAGAA 6401 AATAATGACTGGCCATTCGTTACATCTGTCTTAGTTGAAAAGCATATTTTTTATTAAATTAATTCTGATTGTATTTGAAA 6481 TTATTATTCAATTCACTTATGGCAGAGGAATATCAATCCTAATGACTTCTAAAAATGTAACTAATTGAATCATTATCTTA 6561 CATTTACTGTTTAATAAGCATATTTTGAAAATGTATGGCTAGAGTGTCATAATAAAATGGTATATCTTTCTTTAGTAATT 6641 ACATTAAAATTAGTCATGTTTGATTAATTAGTTC Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Non-Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | xx |
Validation Method |
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Conditions | Huh7 , HepG2 |
Disease | 3479.0; hepatocellular carcinoma |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan |
Original Description (Extracted from the article) |
...
"Overexpression of miR-190b in Huh7 cells attenuated the expression of IGF-1 whereas inhibition of miR-190b resulted in the up-regulation of IGF-1//Restoration of IGF-1 expression reversed miR-190b-mediated impaired insulin signaling in Huh7 cells
... - Hung TM; Ho CM; Liu YC; Lee JL; Liao YR; Wu et al., 2014, PloS one. |
Article |
- Hung TM; Ho CM; Liu YC; Lee JL; Liao YR; Wu et al. - PloS one, 2014
BACKGROUND & AIMS: Insulin-like growth factor, (IGF)-1, is produced mainly by the liver and plays important roles in promoting growth and regulating metabolism. Previous study reported that development of hepatocellular carcinoma (HCC) was accompanied by a significant reduction in serum IGF-1 levels. Here, we hypothesized that dysregulation of microRNAs (miRNA) in HCC can modulate IGF-1 expression post-transcriptionally. METHODS: The miRNAs expression profiles in a dataset of 29 HCC patients were examined using illumina BeadArray. Specific miRNA (miR)-190b, which was significantly up-regulated in HCC tumor tissues when compared with paired non-tumor tissues, was among those predicted to interact with 3'-untranslated region (UTR) of IGF-1. In order to explore the regulatory effects of miR-190b on IGF-1 expression, luciferase reporter assay, quantitative real-time PCR, western blotting and immunofluorecence analysis were performed in HCC cells. RESULTS: Overexpression of miR-190b in Huh7 cells attenuated the expression of IGF-1, whereas inhibition of miR-190b resulted in up-regulation of IGF-1. Restoration of IGF-1 expression reversed miR-190b-mediated impaired insulin signaling in Huh7 cells, supporting that IGF-1 was a direct and functional target of miR-190b. Additionally, low serum IGF-1 level was associated with insulin resistance and poor overall survival in HCC patients. CONCLUSIONS: Increased expression of miR-190 may cause decreased IGF-1 in HCC development. Insulin resistance appears to be a part of the physiopathologic significance of decreased IGF-1 levels in HCC progression. This study provides a novel miRNA-mediated regulatory mechanism for controlling IGF-1 expression in HCC and elucidates the biological relevance of this interaction in HCC.
LinkOut: [PMID: 24586785]
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MiRNA-Target Expression Profile | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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60 hsa-miR-190b Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT054581 | IGF1 | insulin like growth factor 1 | 4 | 1 | ||||||||
MIRT066966 | ATXN7L3B | ataxin 7 like 3B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT192449 | SPRED1 | sprouty related EVH1 domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT250414 | TNRC6A | trinucleotide repeat containing 6A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT306294 | KLHL24 | kelch like family member 24 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT355845 | SGMS2 | sphingomyelin synthase 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT437770 | MTMR6 | myotubularin related protein 6 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT437771 | MTMR6 | myotubularin related protein 6 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT437772 | Mtmr6 | myotubularin related protein 6 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT444672 | CDKL2 | cyclin dependent kinase like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT446389 | PCDHB11 | protocadherin beta 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT446634 | SDC3 | syndecan 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT449410 | TRIM5 | tripartite motif containing 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT449560 | GPC5 | glypican 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT469928 | PTPRJ | protein tyrosine phosphatase, receptor type J | 2 | 6 | ||||||||
MIRT473736 | MAP3K9 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT474210 | LDHA | lactate dehydrogenase A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT474583 | KLF6 | Kruppel like factor 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT476732 | FOXN2 | forkhead box N2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT478455 | DAB2 | DAB2, clathrin adaptor protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT495327 | ADAMTS8 | ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 8 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT498615 | MTRNR2L10 | MT-RNR2-like 10 | 2 | 12 | ||||||||
MIRT501734 | OVOL1 | ovo like transcriptional repressor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT501849 | MTRNR2L8 | MT-RNR2-like 8 | 2 | 14 | ||||||||
MIRT504678 | CYGB | cytoglobin | 2 | 4 | ||||||||
MIRT506517 | MSANTD4 | Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils | 2 | 6 | ||||||||
MIRT507984 | BCL2L13 | BCL2 like 13 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT508444 | ZNF608 | zinc finger protein 608 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT511366 | IL6ST | interleukin 6 signal transducer | 2 | 4 | ||||||||
MIRT520515 | TRA2B | transformer 2 beta homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT524571 | CALML4 | calmodulin like 4 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT531896 | INVS | inversin | 2 | 4 | ||||||||
MIRT533916 | TATDN2 | TatD DNase domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT537503 | FAM13B | family with sequence similarity 13 member B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT541689 | CCDC160 | coiled-coil domain containing 160 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT544419 | ZNF460 | zinc finger protein 460 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT544615 | CSDE1 | cold shock domain containing E1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT545076 | IL7R | interleukin 7 receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT545849 | ZNF264 | zinc finger protein 264 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT547436 | MED4 | mediator complex subunit 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT550157 | ZNF223 | zinc finger protein 223 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT553948 | STAMBP | STAM binding protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT554395 | SERP1 | stress associated endoplasmic reticulum protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT555667 | PGAM4 | phosphoglycerate mutase family member 4 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT564193 | PM20D2 | peptidase M20 domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566792 | MKL2 | MKL1/myocardin like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566843 | LRRC58 | leucine rich repeat containing 58 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT572516 | KIAA0232 | KIAA0232 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT607428 | NOTCH2NL | notch 2 N-terminal like | 2 | 10 | ||||||||
MIRT627779 | RAB30 | RAB30, member RAS oncogene family | 2 | 2 | ||||||||
MIRT635159 | ENO4 | enolase family member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT642159 | ADCYAP1R1 | ADCYAP receptor type I | 3 | 2 | ||||||||
MIRT646205 | DUSP10 | dual specificity phosphatase 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT657007 | KCNMB4 | potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT665817 | TMEM161B | transmembrane protein 161B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT667488 | MAP3K2 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT707098 | ZNF850 | zinc finger protein 850 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT708719 | PTPLAD2 | 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT735521 | HUS1 | HUS1 checkpoint clamp component | 3 | 0 | ||||||||
MIRT736644 | AGPAT3 | 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 3 | 2 | 0 |
miRNA-Drug Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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