pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-7515 |
Genomic Coordinates | chr2: 6650373 - 6650439 |
Description | Homo sapiens miR-7515 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-7515 | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 46| AGAAGGGAAGAUGGUGAC |63 | |||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||||||||
Experiments | Cloned | |||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | SKI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SGS, SKV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | SKI proto-oncogene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_003036 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on SKI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of SKI (miRNA target sites are highlighted) |
>SKI|NM_003036|3'UTR 1 ATTCCGTGCCTGCCGCCGCAGCGCCGCCGACAACGCGGGTGCAGGGGGGCGCGGCTGGGCGGTGCAGCTCCGCCCGGCTC 81 CGCCCCTGCAGCCCACACAGCACAACGTCTTACCGTGCCTATTACCAAGCGAGTGTTTGTAACCATGTAGTTTTGGAACC 161 CACTGCAAAATTTTCTACTGGCCAAGTTCAAGTGAGTAAGCCGCGTCCCCCAACTACAGCTGGAGACGGGGCCAGCTCGG 241 CGGCCTGCTGGTCCTCTGCTTGCTGGAACATTCTAACATTTACACTTTTGTTATAAGCTATTTAAAACCAGTAAGGAGAC 321 TTGAAATTCAGAAAATCAACACATTTTTAAATGACTAACTTCTAAAAGCCCCAACACATGACGCCATCTGAAGACCCGCA 401 ACGGAGTGGGGGTGGCGGCCGCCCCACCCTCCCCACCCGGGGAAGCCATCACAGCTCATCTGCCCGCGGCTGCGTGAGGA 481 CAGCAGGGGTTTTTCTTCAGAGTCTATTTTTTCAGCGACAAGGACCCAGGTCTTCCTGCTGCTGCCAGGGAGAGCAGGGA 561 CAGTGCCGCGTGCGAGATGAGCTCGAACACTGCCCGCCTTACTGCCGCCTACCCCGCCCGCCACGCCGCCGTCGATGCCA 641 GCGCTGTCCCCACGGGTACCAGGAAGTGCAGAGCCGCACAGGAGCTGCCCCGGAGCTGAGGGGACGGTCTTCGGCTCCTC 721 TGCACCCCGTGATTCTGCCCACGCTCCTCCACCACGAGGCACTGACCTGCGTCGGGTGGTGACCGTGGCTGGCGGTCACG 801 CCCTCAGCCCCTCCGGGCACACGTGCCGCCTGACCGGGCGACCCTTTTCAGTTCGGCAAACGTCGCTCCCTTCATTTTGG 881 GACTGAGGCTGCAGCATTGGAACAAAAGAGCATTATTTCAATTTTTCTTTCTTTTTTTTTGTTCGTTCATTTAAACGTAT 961 ATTTAGAACTGCACTTTGTCCACAACCTTCCCTTCTCTTTCTATTCCCCAGTGAACTGAGGTTTTTACCGATTTATAGAG 1041 CAGTCAAATCCGAAGTGCTCGAGTGCTTAGAAACCCCCTCTGGTGCTTGGTTGAACAAGGGAATCACAAGAAAACGAAAA 1121 TGCAAAAACTGAACTTCGGGGGTCGTTCTGTGCCTTCCAGCATCTTGTACAGCAAATCCTGACTCGTGTCTTTTTACCCC 1201 CAAGATATCTGTCTTCAGTAGCGACTGAATCTGCCACTCTCAGAATAAGTTCCTTGCATTTATTCCAAATAATCTCGTTT 1281 ACTCTCACCTGTTTATGCAAATTGTATAAGGTTTCTTATGCCCAAGCTTGAAAAATGATTTCCCAGTAGACAAGAGGCGG 1361 CTACCTATCCTACAGTTACGGTATTTATTTACATAAGAAGATCTTACAGGAGTTCTTTGCTTGAATCCGTTCTAACACCC 1441 GCGGCAGCTGCACGCGCTCACAGAAGGTGGAGGTTACTTGCCCAGGTACAGACGACCTCGGGGCAGTGACGAGCAAAGAC 1521 CAGAGACTGCTGAGCCCTCGCATCTGGGTGGCGGAATTGCCTGCGGGGTTTTGCCCTTGGTTTACTGAGGGGGGTCTTGG 1601 TTGCTGCTGAAGCCCCCCACCCCTTCTAAAGTGCAATGCAAAAGGGACATCATGTATATGCAGCGTTTGTTTGGAATTTT 1681 CTTTGCTTTTGTTTTCTTTGCGGTTGTTCTGTGTGCATGGATTCCACACCTCTGCCGTAGGTAGATCCGTCAGCGGGCAT 1761 TATTACCGTGTCTTGTAAAGGGTCGGTTTTGTTATGCAACATGCAGAATGCTGTTTTTAGCCTTGTTTTACCAGAGTTGT 1841 TTTTTTTTTCAGTTATTTCTTCAAGGGAAACTAAATGATTTAGTTGGAGCAAAGCTTTAAGTGTGTTGGCGTGCTTCTGT 1921 GTGGCTGTCCTGTGTCGCCAGGTCGAAGATCACAGTGAGGTAGAGGCCCTGCCCCATCCCCAGGGCCGCCAGGCTTGCTC 2001 CGTTTGCTTTGAGTTTTTAGACCCCAGAGGGAGATGAGCTTTTCCAAGCTGTGTCTGGGCCAGAGCCTCTCCTTGCCCTT 2081 GCTCCATCCCGACGGTCACCGTTGGGTCCACGCCTCCACCGCCCCATCTTGCCCCAAACGGAAAGCGCTGTATCTGCAGT 2161 GGCAGCCCTTCCCCACTTCGGCTCTGGGAGGGTCCAGCCAGTGTCACCTGGGCCCACCCTTTCCTGCAGCTGCCAGGCCC 2241 GTGCGGTCAGTGGGACCCGGACGTGGGCAGGCGAGCTCGGGACCCTCCCAGGCAGTTCCCACAGCTCTTGCCTCGGCTCA 2321 CCAGGGTCACTTCCACTGTCAGGGGCCTGAGGGGGCAGCTGTGGCTGCAGGGCTGCTCTGGACTGAGGGGTCCCAGGCCC 2401 CGAGGGGTGCACGCCTGGCTCCCCTTGGCACAGGTGCGAGTCCGTTTCTTTTCAGCAGAAGGGGGAAGAGGTGTCCGCTG 2481 TGTGGGCTGCTGACTCCTCTGTGTGTGAGGCCCTTCATCTAAGTGATTGTGTATTCAGTTTAATTCTCATTATATTTCTA 2561 TACTGAAAGAAGATTTTTAACGAAGGGAAAAACAACAGCAATAACATTCATATCTCTGGAGCAGCTAACTCATACACGTA 2641 ATGTCTGCTTTTCGTACAGAACTAGCCAATGTAAAAACAGTTCACCTGTAAATACTTTTTCCTTTTTCACCGTTGTATTA 2721 TACATGTATATGCTGGGTCCTTTTTCAGAAACTCTTTTCTTACCTGAGAGTTGTCTTGTTTTCTGGGCTGTTTTTAACTG 2801 AGGAAAAAAAAAATGCTTTCCTGCCGGGGGGCAGGGGAGACGGAGAAACCCATGTGCGTTTCCCATGTGACCCCCTCCTC 2881 CCTGTGGGTCTGAGCCCCGGCCCCCCCCACCTCCTCCTCCCTGTGGGTCCGAACCCCGGCCCCCCCACCCCCTCCTCCCT 2961 GTGGGTCCGAACCCCGGCCCCCCCACCCCCTCCTCCCTGTGGGTCCGATCCCCGGCCCCCCCCACCCCCTCCTCCCTGTG 3041 GGTCCGAACCCCGGCCCCCCCCCCACCCCCTCCTCCCTGTGGGTCCGAACCCCGGCCCCCCCACCCCTCCCTCAGCCCAC 3121 CAGGGTCCAGGGAGATGTTCGTTCTCGCTTTAAGTCAGGAGTCACAAATGACTTTTTTTTTTCAATTAAGGAAAAAGCTC 3201 CATCTCTACCTTTAACATCACCCAGACCCCCGCCCCTGCCCGTGCCCCACGCTGCTGCTAACGACAGTATGATGCTTACT 3281 CTGCTACTCGGAAACTATTTTTATGTAATTAATGTATGCTTTCTTGTTTATAAATGCCTGATTTAAAAAGAAAAGAGCTT 3361 GGCATATTTATCTATTTCGCTGTGTACCTGTTAGTCCTTCCCCGACCCCGAAACAGATGACATTGTACAATAAAGGACTT 3441 TGAGAGGA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | HEK293 |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
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PAR-CLIP data was present in GSM545216. RNA binding protein: AGO2. Condition:miR-124 transfection
... - Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al., 2010, Cell. |
Article |
- Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al. - Cell, 2010
RNA transcripts are subject to posttranscriptional gene regulation involving hundreds of RNA-binding proteins (RBPs) and microRNA-containing ribonucleoprotein complexes (miRNPs) expressed in a cell-type dependent fashion. We developed a cell-based crosslinking approach to determine at high resolution and transcriptome-wide the binding sites of cellular RBPs and miRNPs. The crosslinked sites are revealed by thymidine to cytidine transitions in the cDNAs prepared from immunopurified RNPs of 4-thiouridine-treated cells. We determined the binding sites and regulatory consequences for several intensely studied RBPs and miRNPs, including PUM2, QKI, IGF2BP1-3, AGO/EIF2C1-4 and TNRC6A-C. Our study revealed that these factors bind thousands of sites containing defined sequence motifs and have distinct preferences for exonic versus intronic or coding versus untranslated transcript regions. The precise mapping of binding sites across the transcriptome will be critical to the interpretation of the rapidly emerging data on genetic variation between individuals and how these variations contribute to complex genetic diseases.
LinkOut: [PMID: 20371350]
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Experimental Support 2 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | HEK293 | ||||||
Disease | 6497.0 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
"PAR-CLIP data was present in GSM714645. RNA binding protein: AGO2. Condition:completeT1
... - Kishore S; Jaskiewicz L; Burger L; Hausser et al., 2011, Nature methods. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Kishore S; Jaskiewicz L; Burger L; Hausser et al. - Nature methods, 2011
Cross-linking and immunoprecipitation (CLIP) is increasingly used to map transcriptome-wide binding sites of RNA-binding proteins. We developed a method for CLIP data analysis, and applied it to compare CLIP with photoactivatable ribonucleoside-enhanced CLIP (PAR-CLIP) and to uncover how differences in cross-linking and ribonuclease digestion affect the identified sites. We found only small differences in accuracies of these methods in identifying binding sites of HuR, which binds low-complexity sequences, and Argonaute 2, which has a complex binding specificity. We found that cross-link-induced mutations led to single-nucleotide resolution for both PAR-CLIP and CLIP. Our results confirm the expectation from original CLIP publications that RNA-binding proteins do not protect their binding sites sufficiently under the denaturing conditions used during the CLIP procedure, and we show that extensive digestion with sequence-specific RNases strongly biases the recovered binding sites. This bias can be substantially reduced by milder nuclease digestion conditions.
LinkOut: [PMID: 21572407]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM545216 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / miR-124 transfection |
Location of target site | ENST00000378536.4 | 3UTR | CCACAACCUUCCCUUCUCUUUCUAUUCCCCAGUGAACUGAGGUUUUUACCGAUUUAUAGAGCAGUCAAAUCC |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 20371350 / GSE21578 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM714645 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / completeT1, repB |
Location of target site | ENST00000378536.4 | 3UTR | UCCACAACCUUCCCUUCUCUUUCUAUUCCCCAG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 21572407 / GSE28865 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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116 hsa-miR-7515 Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT063460 | SKI | SKI proto-oncogene | 2 | 4 | ||||||||
MIRT089615 | MAT2A | methionine adenosyltransferase 2A | 2 | 10 | ||||||||
MIRT100238 | PRR3 | proline rich 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT159239 | NRBP1 | nuclear receptor binding protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT183526 | BTG2 | BTG anti-proliferation factor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT266866 | SLC25A44 | solute carrier family 25 member 44 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT304116 | CNNM4 | cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 4 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT331077 | EIF5AL1 | eukaryotic translation initiation factor 5A-like 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT350659 | PDIA6 | protein disulfide isomerase family A member 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT438442 | MET | MET proto-oncogene, receptor tyrosine kinase | 3 | 1 | ||||||||
MIRT443555 | ZFP3 | ZFP3 zinc finger protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT447969 | MSH6 | mutS homolog 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT448635 | ONECUT1 | one cut homeobox 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT451778 | USP36 | ubiquitin specific peptidase 36 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT452615 | REPIN1 | replication initiator 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT453433 | GLG1 | golgi glycoprotein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT454015 | ALKBH5 | alkB homolog 5, RNA demethylase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT454961 | TPM2 | tropomyosin 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT455364 | KDM5C | lysine demethylase 5C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT455434 | ID3 | inhibitor of DNA binding 3, HLH protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT455456 | EPB41L4B | erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT455595 | TAF12 | TATA-box binding protein associated factor 12 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT455689 | GLO1 | glyoxalase I | 2 | 2 | ||||||||
MIRT455949 | CYP4A22 | cytochrome P450 family 4 subfamily A member 22 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT456135 | SAMD10 | sterile alpha motif domain containing 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT456821 | PIGP | phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class P | 2 | 2 | ||||||||
MIRT457441 | NOL10 | nucleolar protein 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT458048 | TSEN54 | tRNA splicing endonuclease subunit 54 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT458237 | NXPH3 | neurexophilin 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT458671 | GPR35 | G protein-coupled receptor 35 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT458741 | CES2 | carboxylesterase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT459102 | CYP4A11 | cytochrome P450 family 4 subfamily A member 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT459676 | VPS37C | VPS37C, ESCRT-I subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT459776 | IDH3A | isocitrate dehydrogenase 3 (NAD(+)) alpha | 2 | 2 | ||||||||
MIRT461975 | PACSIN1 | protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT462267 | TPI1 | triosephosphate isomerase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT463296 | ZFP91 | ZFP91 zinc finger protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT463446 | ZC3HAV1L | zinc finger CCCH-type containing, antiviral 1 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT464379 | URM1 | ubiquitin related modifier 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT465552 | TOB2 | transducer of ERBB2, 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT467359 | SP2 | Sp2 transcription factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT467638 | SLC7A5 | solute carrier family 7 member 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT467795 | SLC2A14 | solute carrier family 2 member 14 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT468466 | SET | SET nuclear proto-oncogene | 2 | 4 | ||||||||
MIRT468725 | SDC4 | syndecan 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT468784 | SCAMP5 | secretory carrier membrane protein 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT469154 | RNF121 | ring finger protein 121 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT473436 | MDM4 | MDM4, p53 regulator | 2 | 2 | ||||||||
MIRT473636 | MARK2 | microtubule affinity regulating kinase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT474242 | LCLAT1 | lysocardiolipin acyltransferase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT474654 | KLF13 | Kruppel like factor 13 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT475384 | ICOSLG | inducible T-cell costimulator ligand | 2 | 2 | ||||||||
MIRT475400 | ICMT | isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase | 2 | 4 | ||||||||
MIRT476369 | GIGYF1 | GRB10 interacting GYF protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT478017 | DNAJC8 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT478459 | DAB2 | DAB2, clathrin adaptor protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT478791 | CRTC2 | CREB regulated transcription coactivator 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT478952 | COX15 | COX15, cytochrome c oxidase assembly homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT480412 | C19orf47 | chromosome 19 open reading frame 47 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT481455 | ARRB2 | arrestin beta 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT481556 | ARL10 | ADP ribosylation factor like GTPase 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT481740 | APH1A | aph-1 homolog A, gamma-secretase subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT483592 | SLC26A9 | solute carrier family 26 member 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT484423 | SNX19 | sorting nexin 19 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT484727 | HOXB8 | homeobox B8 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT487419 | CACNB1 | calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT487622 | C20orf96 | chromosome 20 open reading frame 96 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT488048 | PABPC1L2B | poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like 2B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT488064 | PABPC1L2A | poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like 2A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT488587 | ST7L | suppression of tumorigenicity 7 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT488696 | NAT9 | N-acetyltransferase 9 (putative) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT489175 | ANKRD45 | ankyrin repeat domain 45 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT490435 | MYL9 | myosin light chain 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT490452 | GLUD1 | glutamate dehydrogenase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT490704 | FSTL4 | follistatin like 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT491038 | ALPK3 | alpha kinase 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT491249 | HCN2 | hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium and sodium channel 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT491632 | SEMA4G | semaphorin 4G | 2 | 2 | ||||||||
MIRT492491 | RAPGEF1 | Rap guanine nucleotide exchange factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT492506 | RANBP10 | RAN binding protein 10 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT493917 | FAM127B | retrotransposon Gag like 8A | 2 | 4 | ||||||||
MIRT494012 | DUSP9 | dual specificity phosphatase 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT499188 | RBPJL | recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT499813 | LONRF3 | LON peptidase N-terminal domain and ring finger 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT501837 | NCOA2 | nuclear receptor coactivator 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT504067 | KCTD12 | potassium channel tetramerization domain containing 12 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT505313 | TOR1AIP2 | torsin 1A interacting protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT511829 | H2AFX | H2A histone family member X | 2 | 4 | ||||||||
MIRT515497 | GTF2F1 | general transcription factor IIF subunit 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT518629 | NONO | non-POU domain containing octamer binding | 2 | 2 | ||||||||
MIRT519774 | ZNF354B | zinc finger protein 354B | 2 | 8 | ||||||||
MIRT521806 | POM121C | POM121 transmembrane nucleoporin C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT522621 | MAP7D1 | MAP7 domain containing 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT532803 | CLDN11 | claudin 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT533783 | TMEM119 | transmembrane protein 119 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT536433 | KMT2B | lysine methyltransferase 2B | 2 | 6 | ||||||||
MIRT538700 | CASP16 | caspase 16, pseudogene | 2 | 4 | ||||||||
MIRT544603 | DCAF5 | DDB1 and CUL4 associated factor 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT556730 | KLHL15 | kelch like family member 15 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT560587 | LCE1B | late cornified envelope 1B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT560617 | ANKRD36 | ankyrin repeat domain 36 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT564348 | AKR1B10 | aldo-keto reductase family 1 member B10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT568925 | SMCR8 | Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT570946 | CPE | carboxypeptidase E | 2 | 2 | ||||||||
MIRT571235 | SCAMP4 | secretory carrier membrane protein 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT573805 | FRMPD4 | FERM and PDZ domain containing 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT574149 | MARVELD1 | MARVEL domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT575772 | Tnfrsf10b | tumor necrosis factor receptor superfamily, member 10b | 2 | 2 | ||||||||
MIRT576154 | Hmox1 | heme oxygenase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT611312 | CA8 | carbonic anhydrase 8 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT615891 | MT1A | metallothionein 1A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT669589 | AK2 | adenylate kinase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT687186 | PRKAR1A | protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha | 2 | 2 | ||||||||
MIRT692711 | MEAF6 | MYST/Esa1 associated factor 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT701346 | NR4A3 | nuclear receptor subfamily 4 group A member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT701997 | MIER3 | MIER family member 3 | 2 | 2 |
miRNA-Drug Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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