pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-6512 |
Genomic Coordinates | chr2: 177313806 - 177313882 |
Description | Homo sapiens miR-6512 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-6512-5p | |||||||||||||||
Sequence | 9| UACCAUUAGAAGAGCUGGAAGA |30 | |||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | KATNAL1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | katanin catalytic subunit A1 like 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001014380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_032116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on KATNAL1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of KATNAL1 (miRNA target sites are highlighted) |
>KATNAL1|NM_001014380|3'UTR 1 ATTTCTGTCAGCTCTTTAATTTCTGGTATTTTTGTTGATAAAATACGAAGAAATTCCTGCAATTTTTAAAAAACAAGTTT 81 GGAATTTTTTTCAGTGGAGTGGTTTTCGCTTAAAGGAAAAAAAAATCTAAAACTGCGAAGAATACTAAATGTAGTTGAGA 161 AATAATTGATGGCGAGAGTTTGCTAGTCTCCCTCCCCGGCTTTGTGCTGGTATTCCACGTATTCCTGCATTAATATTGCA 241 CACCCAAACCAGTCTATCAGGGAGGCTGAAGCAAGGGCGCAGTGTGATATTTTAGGAATACAGAAGATTTAGAAATACCC 321 CTATTTCTCATTTGCAGTTTTTTTTTCCAATTCTGTGCTCTGTCAACATGAGGGACCTATCTATGTATGTTGACTTTTAA 401 CATCAAAATTGGATTTGTGTCAAACATTCATTGTTAAGAGAAGAATGACAGTATATTTTGGAGGAAATAATGAATTTACT 481 AATTAAACCTTTAGAATTTATGACTTACTGTTAGAGTCTGTCATATGGTTAGAATTTTTACTTCCGCTACCCCTGCCATT 561 TCTTCTGCTAGCTACTTCATAATATCTTGAGCTTTACTGAGGAATATTCTCACGCTCTGTGGTATTTGAATCATTTTGCC 641 AGGTCATTTCTCTGTCTTTAGTATTTTTTGCTGGTGCTTCTTACATTTAATATGGAAAGGTGGGAAGAATATTACTGCAT 721 TAGATGTAATTCTTCATTCTAGACTTCCAAGTTTGTTTTCACTTTTTTGTGTGTGCGTGAAGGAGTCTGTGTCACCCAGG 801 CTGTGTAGTGCAGTGGTTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTAGATTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCCTCCC 881 AAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGCACCACCATGCCTGGCTGTGTTTTCACTTTTCTTTCAACATGTTCAACCAGATATAT 961 AGCCATTATTTTTCTCAGCTCCAGCATTGTTTGATTTTTCTTGAGTTTGATTTTAGTATTTGAGATAAATACTTTTACAT 1041 TCTAAACAAGTCCACTCTCTGTGGCTAACGCAAAACAAATGAAATCTTTATTGTTTTCCAAACAGCTAGTTTAACAAAAC 1121 AGCATCATACATAGTGAATGATGTTCATTGGAAAATTCTAAAATTTGTCCTTGTCTAGGTTGAGAACTTTTACACACACT 1201 AAGATAAAGATAGAAATCTGACATGCTCACTCAATTCAGCAGGAATTACACATTAGAAAGAAGCCAGAAAAATAAATGGC 1281 ATATATCCAATCACAAGTAAATGATCCTGGCGTTAGTTTTTATGATTACATGTGTCTCATTAGGCAATTTATGCTTTAAT 1361 GGTCAAGCTTTTAAAAATTTGTATTTGATAACATCCTGAATTCTCAGTTTCGAATAGTGCCTACTGGTTTAAAACTAAAA 1441 ATAATACAGCTTTTTGGACATTTAACCAAGATACTAAGAAGGTTTTTTTTAAAAAAAGAGATTTGATTATTTTTCCCTGC 1521 TAAAAACTGTAAATGCCTTATGTTCTTTTCAGATAACTTAAGTCTGACCTAAACTCCAGTATTCATCTGATGCTGTAAAT 1601 TGCCCTTCTTTCTGAGACACAGATTATAAGATGCCAGATCATAAGACATCATGATTTTATTGTAATTGAATTCTTCCTAA 1681 AAATTGAGAGGTTTCCTTTTATTAACTTTTAAAATAAAGAAATAAGTAGTTTCATTACGATTATTTTGCAAACTATTGCC 1761 AGTCAGAAATGCACTTTTTTTTTCCCTGAAGTTTTAGGAGCCGTCACTAAAACATTAGTCTTGTGATTGTTAAAACTTGT 1841 TTGTAATGGGTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCATTACTTTCAATGGCAAAAACCGCAATTACTTTTGCACCAGC 1921 CTAACAATAGTTGATTAGTTAGACCTTTTCTGGGTTTTGTATTGATTATCTTGGTGTGCATTTAATTATTTTTCTGAATT 2001 CTTCATGGATAATGACATAGTAATTGTGATTCTTTTAATACCAGTTAAGCAGTATTTGGCAACTTAAACTTCCTGGGAGC 2081 CTAACTTTACTATGTTAAGTGAGTCAGGTGTGCTTTTTATTTCCCTTGTTTCTCATTTTGCCCTGTCAGTGGATGGTAGA 2161 TGCTTTGTATATCTTAAATCCCTTAAAGGATCTTAAAGACATCCCTCAGGTGTTCTATTTAACTTTTATTTTATTTTATT 2241 TTATTTATTTATTTATTTTGAGACTGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGC 2321 AACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCGGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGTTGCCGCCACACCCGG 2401 CTTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCAGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGATGAT 2481 CCGCCCACATTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGATCCACCGCACCTGGCCCTAACTTTTAATATACAACAC 2561 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTATTTCAGAAGACAGTGTGTTGCCTT 2641 ACCCAGAATGAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGACAGACACACATACACACACATACACACACACAGAGTCTTTATTGCA 2721 GAAGACAGTGTGTTGCCTTATAGGCGTGAGACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTCTTTATTGC 2801 AGAAGACAGTGTGTTGCCTTACCAGAATGAGTGCTTGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCCTAACTTTTAATG 2881 TACATCACACACACACTCACACTCACATACACACACACACACACACTCTGACTGTCTTTATTGCAGAAGACAGTGTGTTG 2961 CCTTACCCAGAATGAGATTGAATTGTTTTGCTTCGTTTTGTTTTGTTATTCAGTGTTGCGGTAGCAGATGCATTATCAAA 3041 GGAAAAATATTTGGCTCCTTTAATTCCTCTGAAAACATGAGTATTTTGAGTTCTGCAGCACAATGACTGTAGGACTAAGC 3121 TAAGTCTGCTTTGCAGATATCTGATCAGATAGTCCCTTCATTCTGTAGACGTGTATTGGTTGGTCCAAGACACAGTGAGT 3201 AGGAGCTCTGTGGACCAAGACAAAGCTGGACTAGAGAGTACAGTTCAAACTTGGCAGTTTCTCTAACGACTCTGTATAGC 3281 TTCTGGCTTCTACTACTGAAACAAGAGTTTAGATCACTGATGGAGAGGCATAGTAATCTGTTTGTGCTTTGGAAAAATAT 3361 ATAAAAGTTTTTTTCCCCTATTTTTTGCACTTTAAATCTGTTTTGAAATTAGAACTGATATACATTTATTTGAATAATGT 3441 GTAACTATTATGGATCTATTTTAATGAACAATTTTTACCATTTCCCAAGCTGCCTGTTTATTATAAGCATGACATGTTTA 3521 CTATAAACCTTTTGCCCCCATAATTTCTTTTTTTAAAGGAAATTAATATTAGTAAAATAAACACCTCTTTAATGGAAGCT 3601 GCAACCTTCTAGTGATCCAAGTAGACAATAGATGGTGGCATCACAGACTTTATCTACACACTTTCGGGTCTGACCACTAC 3681 CTCCCACAATACCTAGCCATTTTGGAAGGGGAAAACATGCGGTGGTCTAGCTGTATAGCTCAGGGCTTAATTTCAGCTTC 3761 TGAGATTGTGATGTCATATTTCACTCTCAAAACATAGGCTGAAAGCACGAATTACTCAAAAAGTAAGCAAACCAATACCT 3841 GGTGAATCTATGGACAGTCATACACATACATCAGGGGAAAATGTGTGTGTACAACCCAAATTTACAGTATGATTGTCATT 3921 CTTTGACTTTGTTTTGTATAGCCTGACTCTGTTGAACATGAAATTATTAGTACTCTAGGTTTTGGACAGCTTGAGTTCAT 4001 TTGAATTCCTTCCTTAGGAATAAGTTTTTATATACACTGCTAAATGTGTGATGAGAATCATAAAACACTAACCAGCTGAG 4081 GTAGCTGTGATTCACTTTCCCCCCACCCTAACTTGAGATAAAATGAAGGACTAGGCAAGTATTTCATGTTGTGTGAGTGG 4161 ACTTCGGTTCCTTCAGTATTGTCTAGGTTATTGAGTCTTTCTTTGCCTAATAGTGGATTCCCACTCTTAAGATAACTTTT 4241 ATTAGTGATAAATCAGTTTAGGGTATATTCTGTATGACAGGCATAAAATGTTAAGGGTGAATGCTGGCCTTTTCCAAGAA 4321 AAGGCCACCTTAACTTGTATGAGGAAAAAATCCTAACTATTCTCTTTTTTGTATCTTTTTTTCCGTAACTGTTTTGATTG 4401 TATATTTTAAAGAAACCACTTAATTTGTGATGCACGTAATATTTGTGTGAACCTGAGAATATGTCACAATAGGAAAAAGC 4481 AGAAATTATACTTAGGGGACATGTTAGGGGGGTAAAAATATTTAAGCCTCGAATGTTTTACTGTCATCTCCACTAACTAT 4561 TTTTACAGAAAAAGCTAAAAACTCTGTTGTAATTATTGTAAGTTTACTTATTTATACTTTTAAATTAGGCTTTTCATACT 4641 TAAATTTTTTTGACATTTGCTTTTAATATTTGTTTCTTAATGTGGAAATTGTGTATTTTAATAATCAAATTATTAGGATA 4721 ATAGATATATTTTTAAACATTCACCTCATTAACAAATAGATCTTTGAATTTTTATTAGGTTTTTTGGCTCCAGACAACTG 4801 TTTAGCTTTAATGATATTTCTAAATTCCCAGTGACTTATTAATAAAAACAGGAAAAATATTTAGGTAATGTCATAAAATT 4881 TATTTTACCTTTCTCATTTTCTGAGAAAATAAATGAAAAAAACCCTAGATATTGCTTTATTACCAACAGTGTGTAGGTTT 4961 TTGTACATATGGAAATTTGACACAAAAAAATAGGGAATTTGTATAGAGAAGTTTCCCTCTTATAAAAGGACTCCCATTTG 5041 ATTGTTCGAAACTATAAAATGCACTTTTACTTTACCATATCTGAAATGACAAAATATCGCCCTTTGGAAAACCTGACTCT 5121 TTGCACGTGTAATTCCCAGAGTCTACCTCAGTTAACCAGGCTTAGTTTTAGGCAGGAATGAATTGAATTAAATTCAGTTC 5201 ATCATCTATGCAGATTTGTTTCTTTTAAGCACATCCTTCCCTCCTGCTGTTGCCCTCCTCCCATTAACTTTTCTTTTTAA 5281 TCTTGAAATTGTTTAAAATATTCCATCTTTCTTTCTCTAGCAAAGTGTTTGTATTCCAAATAAGGCCTCTGTGAAATGTC 5361 TGAATTACTTTTCCCGTCTTTGTTATGGTCAGCTTCATTATTTGGATGTATTGCATTCAAAGCAGCAGTTCCAAACATAA 5441 CACACATCTATTTTCTTAGAGTTTTGTAAATACAAACTAACCTGATGACATTAAAAATTGTGGATCCTACATGTTCCTAT 5521 GTTCATTCTCTAAAAACCTGAGTAACTTTATGAAAACACACAAACCTGGAAAAACATCACATTTTTGTCACATTTTTACT 5601 GACAAATGTATATTCATATGATGGTACGGCAGCAGGGAGTGGCCCCCAGTTAACATGGCTGTGAGTGGACACAGTGTCTC 5681 GCAGGATCACTGCATGTTATGATGGCTTGTAAGTGCGTTGTTAAGACTTTTGTTTCAGTGTTTGTCTCCCAGTATTTGAA 5761 CCTAATTTAAAGAAAAAGACGTTTCCAAGTTGTATTTATTAAATGTGTTTTTCCTTACCTTTTGTGCTGCTACTTTGCTA 5841 ATCTCATTAGCTTAGCTGTGTTTGTGCATAGGTTATATTTGGTAATAAATTTATAGAGTGTTGGTTGTCA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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