pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-3529 |
Genomic Coordinates | chr15: 88611847 - 88611924 |
Description | Homo sapiens miR-3529 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-3529-3p | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 46| AACAACAAAAUCACUAGUCUUCCA |69 | |||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Not_experimental | |||||||||||||||||||||||||||
Experiments | ||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | SMAD3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HSPC193, HsT17436, JV15-2, LDS1C, LDS3, MADH3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | SMAD family member 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_005902 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_001145103 , NM_001145104 , NM_001145102 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on SMAD3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of SMAD3 (miRNA target sites are highlighted) |
>SMAD3|NM_005902|3'UTR 1 AGACATCAAGTATGGTAGGGGAGGGCAGGCTTGGGGAAAATGGCCATGCAGGAGGTGGAGAAAATTGGAACTCTACTCAA 81 CCCATTGTTGTCAAGGAAGAAGAAATCTTTCTCCCTCAACTGAAGGGGTGCACCCACCTGTTTTCTGAAACACACGAGCA 161 AACCCAGAGGTGGATGTTATGAACAGCTGTGTCTGCCAAACACATTTACCCTTTGGCCCCACTTTGAAGGGCAAGAAATG 241 GCGTCTGCTCTGGTGGCTTAAGTGAGCAGAACAGGTAGTATTACACCACCGGCCCCCTCCCCCCAGACTCTTTTTTTGAG 321 TGACAGCTTTCTGGGATGTCACAGTCCAACCAGAAACACCCCTCTGTCTAGGACTGCAGTGTGGAGTTCACCTTGGAAGG 401 GCGTTCTAGGTAGGAAGAGCCCGCAGGGCCATGCAGACCTCATGCCCAGCTCTCTGACGCTTGTGACAGTGCCTCTTCCA 481 GTGAACATTCCCAGCCCAGCCCCGCCCCGCCCCGCCCCACCACTCCAGCAGACCTTGCCCCTTGTGAGCTGGATAGACTT 561 GGGATGGGGAGGGAGGGAGTTTTGTCTGTCTCCCTCCCCTCTCAGAACATACTGATTGGGAGGTGCGTGTTCAGCAGAAC 641 CTGCACACAGGACAGCGGGAAAAATCGATGAGCGCCACCTCTTTAAAAACTCACTTACGTTTGTCCTTTTTCACTTTGAA 721 AAGTTGGAAGGATCTGCTGAGGCCCAGTGCATATGCAATGTATAGTGTCTATTATCACATTAATCTCAAAGAGATTCGAA 801 TGACGGTAAGTGTTCTCATGAAGCAGGAGGCCCTTGTCGTGGGATGGCATTTGGTCTCAGGCAGCACCACACTGGGTGCG 881 TCTCCAGTCATCTGTAAGAGCTTGCTCCAGATTCTGATGCATACGGCTATATTGGTTTATGTAGTCAGTTGCATTCATTA 961 AATCAACTTTATCATATGCTCTTTTAAATGTTTGGTTTATATATTTTCTTTAAAAATCCTGGGCTGGCACATTGACTGGG 1041 AAACCTGAGTGAGACCCAGCAACTGCTTCTCTCCCTTCTCTCTCCTGAGGTGAAGCTTTTCCAGGTTTTGTTGAAGAGAT 1121 ACCTGCCAGCACTTCTGCAAGCTGAAATTTACAGAAGCAAATTCACCAGAAGGGAAACATCTCAGGCCAACATAGGCAAA 1201 TGAAAAGGGCTATTAAAATATTTTTACACCTTTGAAAATTGCAGGCTTGGTACAAAGAGGTCTGTCATCTTCCCCCTGGG 1281 ATATAAGATGATCTAGCTCCCGGTAGAGGATCACCGGTGACAACTATAGCAGTTGTATTGTGTAACAAGTACTGCTCCCA 1361 GCAGCAATTAGGGAGAAAACTAGTCTAAATTATTTCAACTGGAAAAAAGAAAAAAGAGTCCTCTTCTTTTCCCAGCCTTT 1441 TGCAGAACACAGTAGACAGAACTGCCACCTTCAATTGGTACTTTATTCTTTGCTGCTGTTTTTGTATAAAATGACCTATC 1521 CCACGTTTTTGCATGAATTTATAGCAGGAAAAATCAAGGGATTTCCTATGGAAGTCCTGCTTTATTCCAGGTGAAGGGAA 1601 GGAAGTGTATATACTTTTGGCAAGTCATACAGCTCAAATGTGATGAGATTTCTGATGTTAGAGGGAGATGGAGAGGCTTC 1681 CTGATGCCTCATCTGCAGGGTCCTGTGCCTCTGAAGTTCTAGCCATGAGGTTTCCAGGTAGGACAGCTGCTCCCCAAGCC 1761 TCCTGAGGACACAGGAAGAGACGGAAGGAGCACCTTGACAGACTTGTGTGAGTCTTCTCGAAGGAGGGTTGACTCAGAAC 1841 CCAGAGACAATACAAAACCCCTCACTTCCTCTGAGAGGGCCAAATGCTGTGAGTCTGAAGTATGTGCCTGGTGTGAAATG 1921 ATCTATGGCCTGTTTCTTACACAGGAAGCCCCCTGAACCTCCTGTACATGTGTTCATGTTCCCAGCCAGCTCTGAGACCC 2001 AGGAACCAAATATTCCATTTTGGCTTCTGCTAGAGCAGTCATGGTTCCTCTCCTAAAAGCCATGGGCAGCAGTTTCCGAG 2081 GGCCTGCATGATCCACCTGCTGCACGATCCTATGAGGGCTTCCTGTGGCACACAGCCCTCTGGGTGCTTGGGAACTAGCT 2161 TCAGGCACAGCCTGATTCTGGTGATCCAGTGATCTATGGAAGTCGTGTCTTACTCCAGGTGAAGGGGGAAAAAAAAAGCC 2241 TATACTTTGGCAGGTTATGAACTTTGAATGTGATGAAATGACACGTTTGGCTGCATTTGGATGGTGTCTTAGAACCCTCA 2321 TTGCTCAGACCTGAAGGCTACTTCTAGGAGCATGAAGTTTGAGTTTTGTGTTTTTCCAAAGGATACTTCCTTGGCCCTTT 2401 TTCTTTATTGACTAGACCACCAGAGGAGGATGTGTGGGATTGTAGGCAAACCCACCTGTGGCATCACTGAAAATAAATTT 2481 GATCATACCTAAGAGGTTAGGAAATGGTGCCATTCCCACCTTAGAGTGCTACATAGGTGCTTTGGGCGTATGTAACATTA 2561 GTGTCCTTCCTTGAAGCCACAAGCTAGTTTTCTTAGTTTTAAAATCCTGTTGTATGAATGGCATTTGTATATTAAAACAC 2641 TTTTTTAAAGGACAGTTGAAAAGGGCAAGAGGAAACCAGGGCAGTTCTAGAGGAGTGCTGGTGACTGGATAGCAGTTTTA 2721 AGTGGCGTTCACCTAGTCAACACGACCGCGTGTGTTGCCCCTGCCCTGGGCTCCCCGCCATGACATCTTCACCTTGCAGC 2801 TTGTGCTGAGACTGACCCAAGTGCAGCTAGCACTGGGACACAGATCCTTGTCTTCAGCACCTTCCAAGGAGCCAACTTTT 2881 ATTCCCTTTCCTCTCTCCCCTCCCCACCTCGCTTCTTCCCAATTTAGTAACTTAGATGCTTCCAGCACATACGTAGGTAG 2961 CTACCCCAGCCGGTTTGGATTACAGGCCTGTGCTGGAACATCATCTCAGTTGGCCACCTTCCTGGCAGGCTGTAGACCTG 3041 ACATTTTGAGACAAGCCTAGAGTCAGGAGCAGGGACTTTGACTCTTAGGAAGAGCACACATGAGGGCAAGGCTGCTGGCA 3121 GACGTCTCCATTGTCCTTATGTTGTCTGTGTTGTATTTTTTTTTTTTTATTGACCATGGTGATTATTTTTTTAAACCATC 3201 GTTAATATACTGAAGTGAGCTATAGCACATATCATGTGCTTAGTTTGTTTATTTTTCTCCATCTCCCCTTGGCTTCCTAG 3281 AGTTTGGACATATTCCAGGCTAAATGCTTTTACTCAAGACTACAGAAAGGTTTGAAGTAGTGTGTGCATGGCATGCACGT 3361 ATGTAAGTAATCTGGGGAAGAAGCAAAGATCTGTTTCATTCTTAGCCTCAGGCCTCATGAGGGTCTCCACAGGGCCGGAG 3441 CTCAGGTTACACCACTCCTTCGTCCTTACAGGAGATGTAGGGAGAAGAATCTGCAGGCTGCTTGTAGGACTGTTCACCAA 3521 GGGGGATACCAGCAGCAAGAGAGTGCACCCGTTTAGCCCTGGACCCTGTTTCTTACTGTGTGACTTGGCTAGAGTTGGGA 3601 GTTCCCCCAAAATAAACGTGTCCCCATTTTACCAGAACCAAACCTCAACACAGCGAAGCTGTACTGTCTTTGTGTGGCAA 3681 AGATGTTCCCTTGTAGGCCCCTTTCAGGTAACCGTCTTCACAATGTATTTTCATCACAGTTTAAGGAGCATCAGCCGCTT 3761 CTCAAGTGGGTAGGGAAAGCAGAAAAACGTACGCAAGAGGACATGGATCCAAAATGATGATGAAGCATCTCCCATGGGGA 3841 GGTGATGGTGGGGAGATGATGGGCTAAACAGGCAACTTTTCAAAAACACAGCTATCATAGAAAAGAAACTTGCCTCATGT 3921 AAACTGGATTGAGAAATTCTCAGTGATTCTGCAATGGATTTTTTTTTAATGCAGAAGTAATGTATACTCTAGTATTCTGG 4001 TGTTTTTATATTTATGTAATAATTTCTTAAAACCATTCAGACAGATAACTATTTAATTTTTTTTAAGAAAGTTGGAAAGG 4081 TCTCTCCTCCCAAGGACAGTGGCTGGAAGAGTTGGGGCACAGCCAGTTCTGAATGTTGGTGGAGGGTGTAGTGGCTTTTT 4161 GGCTCAGCATCCAGAAACACCAAACCAGGCTGGCTAAACAAGTGGCCGCGTGTAAAAACAGACAGCTCTGAGTCAAATCT 4241 GGGCCCTTCCACAAGGGTCCTCTGAACCAAGCCCCACTCCCTTGCTAGGGGTGAAAGCATTACAGAGAGATGGAGCCATC 4321 TATCCAAGAAGCCTTCACTCACCTTCACTGCTGCTGTTGCAACTCGGCTGTTCTGGACTCTGATGTGTGTGGAGGGATGG 4401 GGAATAGAACATTGACTGTGTTGATTACCTTCACTATTCGGCCAGCCTGACCTTTTAATAACTTTGTAAAAAGCATGTAT 4481 GTATTTATAGTGTTTTAGATTTTTCTAACTTTTATATCTTAAAAGCAGAGCACCTGTTTAAGCATTGTACCCCTATTGTT 4561 AAAGATTTGTGTCCTCTCATTCCCTCTCTTCCTCTTGTAAGTGCCCTTCTAATAAACTTTTCATGGAAAAGCTCCTGTGC 4641 CAGGAGCTCAGTCTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | HEK293 |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
PAR-CLIP data was present in GSM545215. RNA binding protein: AGO4. Condition:Control
... - Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al., 2010, Cell. |
Article |
- Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al. - Cell, 2010
RNA transcripts are subject to posttranscriptional gene regulation involving hundreds of RNA-binding proteins (RBPs) and microRNA-containing ribonucleoprotein complexes (miRNPs) expressed in a cell-type dependent fashion. We developed a cell-based crosslinking approach to determine at high resolution and transcriptome-wide the binding sites of cellular RBPs and miRNPs. The crosslinked sites are revealed by thymidine to cytidine transitions in the cDNAs prepared from immunopurified RNPs of 4-thiouridine-treated cells. We determined the binding sites and regulatory consequences for several intensely studied RBPs and miRNPs, including PUM2, QKI, IGF2BP1-3, AGO/EIF2C1-4 and TNRC6A-C. Our study revealed that these factors bind thousands of sites containing defined sequence motifs and have distinct preferences for exonic versus intronic or coding versus untranslated transcript regions. The precise mapping of binding sites across the transcriptome will be critical to the interpretation of the rapidly emerging data on genetic variation between individuals and how these variations contribute to complex genetic diseases.
LinkOut: [PMID: 20371350]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM545215 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO4 |
Cell line / Condition | HEK293 / Control |
Location of target site | ENST00000327367.4 | 3UTR | UGUUGUAUUUUUUUUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 20371350 / GSE21578 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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101 hsa-miR-3529-3p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT061395 | WEE1 | WEE1 G2 checkpoint kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT066530 | HMGA2 | high mobility group AT-hook 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT072699 | SMAD3 | SMAD family member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT080963 | LRRC8B | leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT095081 | SAR1B | secretion associated Ras related GTPase 1B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT104782 | FZD6 | frizzled class receptor 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT161286 | U2SURP | U2 snRNP associated SURP domain containing | 2 | 2 | ||||||||
MIRT176138 | ATP7A | ATPase copper transporting alpha | 2 | 2 | ||||||||
MIRT221376 | DNAJB6 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT260611 | SOX4 | SRY-box 4 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT269640 | MDM4 | MDM4, p53 regulator | 2 | 4 | ||||||||
MIRT306853 | FYTTD1 | forty-two-three domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT315027 | TFAP2A | transcription factor AP-2 alpha | 2 | 2 | ||||||||
MIRT367278 | CRKL | CRK like proto-oncogene, adaptor protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT444211 | TMPRSS4 | transmembrane protease, serine 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT455829 | ZSWIM1 | zinc finger SWIM-type containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT466299 | TM4SF1 | transmembrane 4 L six family member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT467332 | SPATA13 | spermatogenesis associated 13 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT469830 | RAB14 | RAB14, member RAS oncogene family | 2 | 2 | ||||||||
MIRT470571 | POU2F1 | POU class 2 homeobox 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT472094 | NOLC1 | nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT482529 | ACTB | actin beta | 2 | 4 | ||||||||
MIRT495009 | KRTAP4-9 | keratin associated protein 4-9 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT495562 | ZNF169 | zinc finger protein 169 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT496742 | PBX2P1 | PBX homeobox 2 pseudogene 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT500811 | THBS1 | thrombospondin 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT500846 | SYPL1 | synaptophysin like 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT504267 | C1orf147 | chromosome 1 open reading frame 147 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT504320 | TUSC1 | tumor suppressor candidate 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT505533 | SPATA2 | spermatogenesis associated 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT505799 | RSBN1 | round spermatid basic protein 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT518201 | CLEC4E | C-type lectin domain family 4 member E | 2 | 2 | ||||||||
MIRT520019 | YTHDF1 | YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT527321 | NCAM2 | neural cell adhesion molecule 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT529005 | SIGLEC14 | sialic acid binding Ig like lectin 14 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT530312 | TNFRSF10D | TNF receptor superfamily member 10d | 2 | 2 | ||||||||
MIRT532324 | DUSP4 | dual specificity phosphatase 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT532497 | HOXA13 | homeobox A13 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT533203 | WASF3 | WAS protein family member 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT533376 | UBE2D4 | ubiquitin conjugating enzyme E2 D4 (putative) | 2 | 4 | ||||||||
MIRT534107 | SOWAHC | sosondowah ankyrin repeat domain family member C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT537381 | FGF2 | fibroblast growth factor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT537487 | FAM169A | family with sequence similarity 169 member A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT539210 | ANTXR2 | anthrax toxin receptor 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT540299 | GFPT1 | glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT544610 | FCF1 | FCF1, rRNA-processing protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT547382 | MPRIP | myosin phosphatase Rho interacting protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT551195 | GAB2 | GRB2 associated binding protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT554193 | SLC35D1 | solute carrier family 35 member D1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT554998 | RAB39B | RAB39B, member RAS oncogene family | 2 | 2 | ||||||||
MIRT557252 | CRAMP1L | cramped chromatin regulator homolog 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT558440 | DDIT4 | DNA damage inducible transcript 4 | 2 | 3 | ||||||||
MIRT558687 | CMIP | c-Maf inducing protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT562111 | ITGB1 | integrin subunit beta 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT562312 | GATAD2A | GATA zinc finger domain containing 2A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT564781 | ZDHHC7 | zinc finger DHHC-type containing 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT565536 | SON | SON DNA binding protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT567294 | HNRNPA2B1 | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2/B1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT572337 | SOX5 | SRY-box 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT572389 | MTX3 | metaxin 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT575082 | Ddit4 | DNA-damage-inducible transcript 4 | 2 | 3 | ||||||||
MIRT576838 | Tgfbr3 | transforming growth factor, beta receptor III | 2 | 2 | ||||||||
MIRT607441 | SEMA6D | semaphorin 6D | 2 | 4 | ||||||||
MIRT609555 | TCEAL4 | transcription elongation factor A like 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT612890 | HOOK3 | hook microtubule tethering protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT613611 | TP53 | tumor protein p53 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT614708 | TNFRSF21 | TNF receptor superfamily member 21 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT616823 | HERC5 | HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT620652 | CXCL5 | C-X-C motif chemokine ligand 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT626770 | CDC14B | cell division cycle 14B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT633598 | IBA57 | IBA57 homolog, iron-sulfur cluster assembly | 2 | 2 | ||||||||
MIRT634853 | PTP4A2 | protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT638138 | TTC26 | tetratricopeptide repeat domain 26 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT639574 | GORASP1 | golgi reassembly stacking protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT643710 | ZNF736 | zinc finger protein 736 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT644969 | STEAP4 | STEAP4 metalloreductase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT645427 | NINJ1 | ninjurin 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT645939 | HIPK1 | homeodomain interacting protein kinase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT646142 | INTS7 | integrator complex subunit 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT658015 | GABRA4 | gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT658995 | DIP2C | disco interacting protein 2 homolog C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT675003 | SLC22A17 | solute carrier family 22 member 17 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT675553 | SIK1 | salt inducible kinase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT675621 | CSE1L | chromosome segregation 1 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT675952 | IDE | insulin degrading enzyme | 2 | 2 | ||||||||
MIRT692250 | POLR3F | RNA polymerase III subunit F | 2 | 2 | ||||||||
MIRT698738 | STX12 | syntaxin 12 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT699001 | SPAG9 | sperm associated antigen 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT703275 | GNG12 | G protein subunit gamma 12 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT706268 | MKLN1 | muskelin 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT707633 | TARDBP | TAR DNA binding protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT709622 | KBTBD6 | kelch repeat and BTB domain containing 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT712931 | RPF2 | ribosome production factor 2 homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT713807 | KCNK5 | potassium two pore domain channel subfamily K member 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT714036 | SYDE2 | synapse defective Rho GTPase homolog 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT714388 | PDP2 | pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT714404 | FBXO31 | F-box protein 31 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT714599 | HSPA4L | heat shock protein family A (Hsp70) member 4 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT714663 | TPCN2 | two pore segment channel 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT714882 | GOLPH3 | golgi phosphoprotein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT725043 | NDUFAF7 | NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 7 | 2 | 2 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||
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