pre-miRNA Information | |
---|---|
pre-miRNA | hsa-mir-4524a |
Genomic Coordinates | chr17: 69099564 - 69099632 |
Description | Homo sapiens miR-4524a stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Mature miRNA | hsa-miR-4524a-5p | ||||||||||||
Sequence | 6| AUAGCAGCAUGAACCUGUCUCA |27 | ||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||
Experiments | Illumina | ||||||||||||
SNPs in miRNA |
|
||||||||||||
Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene Symbol | SNTB2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | D16S2531E, EST25263, SNT2B2, SNT3, SNTL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | syntrophin beta 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_006750 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on SNTB2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of SNTB2 (miRNA target sites are highlighted) |
>SNTB2|NM_006750|3'UTR 1 GCAACAAAAAATCAGAAAAGAGCCTTGACTGTCACAAGAAATATTTCCACCTCAAAAAAAAAAAAGCACAAAAAGAAACT 81 CTTTGCTCTCCTTCAGCACAGTGCCTTCCCAAGGACCTGCAAATAACTGCTGAACCATAACCGTGTTTAAAGAAGAGCCT 161 ACCTTTCACAGTCTACCTTGGCCAGATATTCTAGCACTCTAAAAGGCTCCAAAATGAAGCTGTTGATTTATTCTCATTTC 241 AAAATATGGTTTATGAGTAATTAGGTTTATTTCTACTGCTAAAAAGAATGGCTCATTGTTTTCTTTTTTTTTCATTGTTT 321 TCATTTTTAGACATAATCAAATACCCAAGCATTGTTTTCTTTTTCTTCTCCCTGTAGGATTTGTGTTGTGCTTAGCCTTG 401 ATCTCTTGTTCAGAACAATTGTCCCTTCCCAGGTGCTAGCTTGCAGCAGCCTGTTGCTTCCTGAGCATTCCAGATAGGTC 481 GTATGTCTTGGAATTTACTGTCCTCACTAGCTCCTTCCACCATAGGAAGTCCTTGAATTGTATCACCAAAGGGTTGTTCC 561 ATTTGCCCTGGATCTCCCTCTATCTCAGCCTGGCCATCACTTCCCACCTTATCCCAAGCTTTGCCACTGTCTCTAGGACT 641 TAGAACTTGTAAATTTGATTTGCCTTGCCTTCTACTTCCTTTCTAGTGGTGACTGAGTTGAAAAGCAAGTTGGAAGCCAC 721 TGCTTTTAAAGAAAAGTTTTGCTTGGTTTAGGTTTTTCCAATTTTATTTTTGTTAGGAGCCAGGGGATAAGATTTATTTT 801 AAATGAAAATCCTCTTCCTAGGTTAAGCCATTTTTTTTATTGCTTACCAAATGTGCCTTTGGTTAGGGTTAGTGGAGCTT 881 TATTAGTCACTATTTGAATAACTGGAAATCACTGCCATTTCCAGGAGATCACCTATCCTAGTTTTGAGGAATAGTCATTG 961 AGGTGGGTTTCCTTAATGGCATCTCTTCTAGTAGGCAGATCTGTTTGAACAAGATAAATCCTAAAGAGCCAGCCTGCTTG 1041 AGGAGTAGACTTGGTGGGTGAAGCCAGCAATTCCGCACAAACGTCATGTTGAATTGTTTTGGGCTGCCCAAAAACAACAG 1121 GATGCAGCATCCTGGCTGTGGCCTGGCCCTTTGTGGCAGCAGTGGCATGGACAAGCAACTGCTAATTCGAGACTTACTAT 1201 TGGCTTCACAGCACACCCTACAGTGAGCAGGGTGATGAGACCGTGGAACAGCTACCTGCTTTTGGTTAAGATTGCCAGAT 1281 ATCATTAGGACACAGTAGCAGCAAGAATGCTGATTTTGTAGTGTTAGAAAATGAACTCAGCTTGTTTTTCCTAATTTTGA 1361 AGGTGGTATATATCTGCAAACATTTAAAATGGTATAATATCATATAAAATGTCAAAATTAGCACAGTCCCTGGATCTCAA 1441 AGAATAGGTAATATTGACTTGGATGTTCTTTATGCTCTCTGAAGAAAGGTCTAGGGAAAGTTCTTGTTTGCTTGATTGAT 1521 CAAGAGTGCCACGGAAGAATGTGAGCGCTGTGGAGGGTGGAGGAGGGTGTCACTTCAGATGGGGCAGGCACAGGGGGAGA 1601 AAAGAAGAGAAAAACACACCTGTGTGCAAAATGAGCTATTTGGTTTCAGTGCGGCCTGACCGATGGGGAGGACCCATGAG 1681 CAGAGAGAGTTCTAGGTCAACATTGTAACTCCATTGTCCTCCTTCACCCATAAGTCAGTCCTCCTTCCTCATTACAGTGA 1761 AACCAACAATATGCAGAGGTTGGGGAGAGATGCCTGTTCTTCCCCCAGCTTCATATAATTGTCAAAGTTCCAAAAATGAA 1841 TTATCTGAACTGCTTAAAACTGGAAATTAAAATCTAGACAAGAATATGTCTTTCAAGAGCTTTTTATGTTTTGAAAGTTC 1921 ATAAACCTAAGATTGGCTCCATCTGAGATAAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGTTCTGTCTCCCAG 2001 GCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTAGGTTCAAGTGATTCTCCTGAGTAGCTGGGGT 2081 TATAGCTACCCACCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCAGGTTTTCACCATGTTGGCTAGGCTGGTC 2161 TTGAACTCCCGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCCCCGTGCCTGG 2241 CCCACAATAAATTTTCATTTCAGAGAAGGAAAAAAATCTCTTGAACGTCCAGAAATGATTTCTGGAATCAGAATTTCAAT 2321 ATGTAATACCCTCAGGTAGGCAATCTTGAACCCTCTATGCAGTGAGAGCATTATTAATATGAGATGTTGAATGATGCCTT 2401 TACAGACTTCAGCAGCAAAGCCATTTGGTTGAGGTTTTCTGTGTTAATGTGAAAAGCTAAGCCACTGAGATTTGCAGGGG 2481 AGCTTCTGAGCCACCCTGCTTGTTGGTTATATGAGGATGTAAAATAGGTGGAATTAAAATGTGAGCAGGAAAGGCAAGGC 2561 ATGTGTGCATTTTCACTCATTTTGGTCAAGGTTAAACTGACATGTATAGCACTGAGGTCTGTAGGGTTCTTAATATCTTT 2641 TGAGTCTTGCTGTGAAATGAAAGTGTGGGAGGTTTCCTTTGTCCATTAGCAGCCCCAAGAACCAGAACCCTTTTGCTGCT 2721 TTTCTTACATACCTAACAGCTCTCCAGTCATGATGACCAAGGTTGTTCTTCAATCAAATGTGTTTGTGGGATTTTCAGTC 2801 CGCAAATGAAGTGCTCTCTAATGAATGGGACACCATGATAAATATGTATTTATATTTAGATGCCAAAGTATGGCAAATTA 2881 TTTCCAAATGATAACTACAAATGGGAATTTTCGATATTCTACCTTTTTTATAGAACCAGCTCACTTTTCATTTCTTTTTC 2961 ATTTTGAATTAAGAAAATTGTTGAGGATGTGGTGGGTTCCAGTGTGTGGAATGGAAAGGAAACTGCAGAATAGTGTCTGC 3041 TCCCCATTCAGAGGGACTGCTTCCTGTGCCCCCCAGACCCGGGGCTTCGACAGCTTCTCCACATTCCACACAGATGCCTA 3121 GGAGCAGCGAGTTGGTATATGAAAAGTCTCCCACCTTTTCTCCTAAAACTTCTCTCCTTTCTCTCCATAAAAAGAAAAGG 3201 AAAGGAACAAAAGAAAAACATTCAGTTTTTCTTTTTCTGAAAAAGGTAAGTCCTTTCCTGAAGTCATCAAATGAAACATT 3281 ATCTGGAAATTAGTTTCTAATGTTGTATATGAAGAAATACTTAAATATAAGTTCCTGCAGTATTTATTAGATAGTTGTAA 3361 CTGTAAACTCACCTCCCTAGTAGATAAGAGTTTCAGGTTAAATACTGGAACATATATAGGCAGTCAAAAATACTACTTTA 3441 AATGTCATTCACCTATTTTAAAGCCATGTTTTAGCACTTTTTAGGCCAAAGAAGGTCTGATAGTGCCTGTTTTTATGTTC 3521 TGTACTCTCACAAACTTTGTTACTCAAAATTATTGCATGGCAGGAGAGATTGGATTATTTATTTCTTATATTTTTATAAG 3601 TAAAAAAATCTTTCTAAACAACAAATACCTAACATTATTACTGATTGTTTTCCTAATTTATCCTCCTAAGTTGAATGGTA 3681 ACAAAGCTTTTCCAGCTGAATGAATGCACTTAGCTGATAAACCAGAATTTGTTCTTTTTTTTCCTTCTTTTTTTTTTGAG 3761 ACAGGTTCTCACTCTGTCACCGAGGTTGGAGTGCAGTGGTATGATCATAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCTGGGCTCAA 3841 ATGATCCTTTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGTGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATGGATTTT 3921 TTTTTCTTTTTTTTTTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCTTGGCACTCAAGCAGTCCTTCTGCCTCAGCCT 4001 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGATGTGAGCCACTGCACCTGGCCCCAGAAATTATGCTTAAAAAAAAAATTAAGCTGTGTG 4081 GAATCTGGACAAGGCTATGTTTCTCCTAGAAACAGGTTTTGCTGTAAATGGTTTTGATGGGCGAAAGTGTGAGAAAAGGT 4161 TATAATAGATTCTTTTTTTTAATTTTGTGAGAAATTCCAGGTCTTCTTGCTTAACTTATATGCATGTGGATATATTTGTT 4241 TTCAAAGCCATGGAAGAATCTCTGTTCATATATTTTAATGCAAATTACCTTGTATGCTGCTATGCAAATTCTATTAAAAG 4321 GCCTACCTGCTTAAGAATTAAACATTTTTGAAACTTTCAGGGAAGACCTGTAGACTCAAGCACTTTCTCTGCTTTTTTGT 4401 ATCTTATCTTGGACACTTATGCTGAATTATGTTCTTATTATTTTCACTGGTTATAAGCTATTCCTTGTACATAATATTTA 4481 AACTATCCAAATATCCAGCATACATTTCCATGTGGCTGCCATCGGCTGTTGATGCCATGAATGAAATGGCTGGTTAGAAA 4561 GCCAAAGGTCTTCTTTTTTCAATTCCTAATGAATAAGTAAAATGCCAGATCTCTTTGGTCTCAAAGCAAATTGCTCTGAT 4641 CAGATCAAATATCTATGTAATGAAAAGAGACTTACTTAAATTTGGGATTCTGCTTAAACTTTAAGTTGAATTTGACTGTA 4721 GTCATTCATTCTTTTTATATATCTCTGTCAGGTATGACATTAATTACCAGGTGGTATTATACTCTACTTTGAGTTTGGAC 4801 ATCACTTTCAGTTAAATTTCTGTTGTTATTGTGGCTTTTTTTTTTTTTTAACCCCACTGAAGATGGAAGTAGAGCAGTCT 4881 GCCATCTCCTGCTGTTCTTTCTCTGTGCCCCCTAATTGCTTGGTAATCTAAAATTATTCTGACTTTCCACATACTGTCTT 4961 TAAAAACCAATTGTAGCAATCTGCCCGCCTCCACCCTTTAAGCTAAATCTTTCACTGTGCTGGATACATAGACACTCGAT 5041 AAATGTGTGATGATAGTTCTAAAATAATTATGCTATATATCAGGGTTCTGTATTTTTGAGCAATATCATTATTCCTATGC 5121 TGTGATGTTAAATGGAATTTATTTTACACTAGTAATAGACTGCTTAAGTGGCTGATTTGAAACCTTTCTCTAAAAAAACA 5201 AAAACATCTGGCAGATGAGTGACACAAATTCATTCTCTTAAAGGATAGAATTTCAAGTTAAGGATAAGGCACAATAAATA 5281 GGCACATAGAGGACATCTGTTTTTGTTTTTGGTTTTGGTTTTGTTTTTTTTTGTCTCTCTGACTAGCTAAACTGCCAACT 5361 AGAAGAATGGTTGTTATGTAGTAACTCAGAAGAATCTTTTAATAAGTTTCTTCTTTTGTTTCAAAACAAACTTGAGCTTC 5441 ATTTCTTGCCACCTCTATTCTTTCTTCCCACGTTGGGTGACTGAACTGATGCTTATTCTAGTTTTAGAAGAGGATCCACA 5521 TTTAATGTAAGGCATAAATATGCCTTTTGCAAATTATTGCTTGTTCTCCAGTGAACATTTGATCATATTCAACAGAAATC 5601 CACCATATAAACCATAATCCTTGAATTGCCCCTTTTAAAATAGATTGGTTAAAACCAAAAACCTATAAGAGAGAAATGAT 5681 ATTTCATTGTATTGTAGGTTTGGGAATCCTGGTTAGATTTATAATTTCTGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTATTCC 5761 CAGTACTTTGGGAGCCCAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTAAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCC 5841 ATCTCTACTAAAAATACAAAAAGTTAGCTGGGCATGGTGGTGCGCGCCTGTGGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG 5921 GAGAATCCCTTGAACCCAGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCG 6001 AGACTTCATCTCCAAAAAAAGAAAAAGAAGAAAAAGATTTATAATTTCTGAGTCCCCTAAGTCCCTTTCTCAGTTTGCAA 6081 TAATCTTACGTCCATGCTATTGACACTAATTTTGAAACTGGAAAGCTAATTAATGACATATTCATGTGTTCTTTCATCTA 6161 ATAAACATTTATTAATGTATAGTTCTACACCAGGCATTCTGAAGGGTCCAAAAGAAAGTTCCTGCCCTCTAGTAGCACAT 6241 AATCCGTTATTTCTCAGCACACCATGCCATCTGTTTATCATTCAGCAGTTAAGTAATTCATCACTTCATATTTTTACCAA 6321 AGTATATTTACAAGTCTGTTTATCTGGATCTGGCAAACTGGAAAATGTTTGAAGGGATACTCAGGCTTTGATCCATGCCA 6401 ACATGAAAGGACTCCAAGCACATTTAAGTAGGCTGGTCTTTTCATCATGCATGATTTTTTTTTTAGTGCAAATTTAGACT 6481 TTAGTTTGGGAAAGAGAACAGTATACAGTATCCTTTGTAAGATAAATCACAACAACAAAAATTAAGTTTTATTGCACAAA 6561 GTAGATAAATGAGAAAGTCTTTCTTAAAAAATGCTTCTTTAACTGTAACAGCAAAACTAAATGCATATTTTATCAACCCC 6641 TTATTTCTAATTGCTGTATTCATTTCCACCCTTAAACTATTTAAGCATTTCATCTGCTGAAAGTCCTTATATACATGGTA 6721 GACGGAATATTTCTCCATTAATGATAGATCAAAATGAAGATATTTAAAAATTAACAAAATCAGGCCAAGGCAGGAGGATC 6801 ACTTTAGCCCAGGAGGTCCAGACCAGCCTGGGCAACACAGCGGGACCCCGACTCCATTTAAAAAATTAAAAAAAAAAAAA 6881 AAACTTTTAACATTTAAAAAATAAAAATTAACAAAATTTCACTTATTCCAGGACACGCTGGCATTTGGACTCAATGAAAA 6961 GGGCACCTAAAGAAAATAAGGCTGACTGAATGTTTTCCATAATTTTCACACAATAACAGTCCCTTTCTATCCAGCTTGCC 7041 TTCCATTTATCTCTAGGGTTAGCTTTTCAGGCAACATCCTTGGTCATTGCCCAGAAAGTACCTGAGCTATCAGTGATTGG 7121 AATGGCACAGGAAACCGAATCACATGGGTGCCCTCCCCTTGGTTTTCAAGTATCTTGGAGTTGTGCACAAAAATTAGGTC 7201 ATGCCTTCAGTGTCTTGTTCTTTAAACCTACCCTTTGACAATCAGGTGCTAATGATTGTATACTATTAAAACCAGCACAT 7281 AAGTATTGTAAATGTGTGTTCCTCCTAGGTTGGAAGAAATGTCTTTCCTTCTATCTGGGTCCTGTTAAAGCGGGTGTCAG 7361 TTGTGTCTTTTCACCTCGATTTGTGAATTAATAGAATTGGGGGGAGAGGAAATGATGATGTCAATTAAGTTTCAGGTTTG 7441 GCATGATCATCATTCTCGATGATATTCTCACTTTGTCGCAAATCTGCCCTTATCGTAAGAACAAGTTTCAGAATTTTCCC 7521 TCCACTATACGACTCCAGTATTATGTTTACAATCCATTGGATGAGTGCAGCATTATAAGACCTTGGTGCCCAGAAAAATC 7601 TGTCCTTTTTGGTACCAAACCTGAGGTCTTTTGGAAGATAATGTAGAAAACCACTACCTATTGAAGGCCTGTTTTGGCTA 7681 ATCTGTGCAAACTCTGATGATACCTGCTTATGTGGATTCTTTTCCACACTGCTTTCATTTTTAAGTATAAAGACTTAGAA 7761 AACTAGAATAATGCTTTTACAAATAATTAAAAGTATGTGATGTTCTGGGTTTTTTCCTTCTTTTTAGAACCCTGTATTTA 7841 AACAAGCCTTCTTTTTAAGTCTTGTTTGAAATTTAAGTCTCAGATCTTCTGGATACCAAATCAAAAACCCAACGCGTAAA 7921 ACAGGGCAGTATTTGTGTTCCTAATTTTAAAAAGCTTTATGTATACTCTATAAATATAGATGCATAAACAACACTTCCCC 8001 TTGAGTAGCACATCAACATACAGCATTGTACATTACAATGAAAATGTGTAACTTAAGGGTATTATATATATAAATACATA 8081 TATACCTTTGTAACCTTTATACTGTAAATAAAAAAGTTGCTTTAGTCA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DRVs in gene 3'UTRs |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in gene 3'UTRs |
|
Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
|
||||||
Conditions | HEK293 | ||||||
Disease | 6645.0 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
"PAR-CLIP data was present in GSM714644. RNA binding protein: AGO2. Condition:completeT1
... - Kishore S; Jaskiewicz L; Burger L; Hausser et al., 2011, Nature methods. |
||||||
miRNA-target interactions (Provided by authors) |
|
||||||
Article |
- Kishore S; Jaskiewicz L; Burger L; Hausser et al. - Nature methods, 2011
Cross-linking and immunoprecipitation (CLIP) is increasingly used to map transcriptome-wide binding sites of RNA-binding proteins. We developed a method for CLIP data analysis, and applied it to compare CLIP with photoactivatable ribonucleoside-enhanced CLIP (PAR-CLIP) and to uncover how differences in cross-linking and ribonuclease digestion affect the identified sites. We found only small differences in accuracies of these methods in identifying binding sites of HuR, which binds low-complexity sequences, and Argonaute 2, which has a complex binding specificity. We found that cross-link-induced mutations led to single-nucleotide resolution for both PAR-CLIP and CLIP. Our results confirm the expectation from original CLIP publications that RNA-binding proteins do not protect their binding sites sufficiently under the denaturing conditions used during the CLIP procedure, and we show that extensive digestion with sequence-specific RNases strongly biases the recovered binding sites. This bias can be substantially reduced by milder nuclease digestion conditions.
LinkOut: [PMID: 21572407]
|
Experimental Support 2 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
|
||||||
Conditions | hESCs (WA-09) | ||||||
Disease | 6645.0 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
"PAR-CLIP data was present in SRR359787. RNA binding protein: AGO2. Condition:4-thiouridine
... - Lipchina I; Elkabetz Y; Hafner M; Sheridan et al., 2011, Genes & development. |
||||||
miRNA-target interactions (Provided by authors) |
|
||||||
Article |
- Lipchina I; Elkabetz Y; Hafner M; Sheridan et al. - Genes & development, 2011
MicroRNAs are important regulators in many cellular processes, including stem cell self-renewal. Recent studies demonstrated their function as pluripotency factors with the capacity for somatic cell reprogramming. However, their role in human embryonic stem (ES) cells (hESCs) remains poorly understood, partially due to the lack of genome-wide strategies to identify their targets. Here, we performed comprehensive microRNA profiling in hESCs and in purified neural and mesenchymal derivatives. Using a combination of AGO cross-linking and microRNA perturbation experiments, together with computational prediction, we identified the targets of the miR-302/367 cluster, the most abundant microRNAs in hESCs. Functional studies identified novel roles of miR-302/367 in maintaining pluripotency and regulating hESC differentiation. We show that in addition to its role in TGF-beta signaling, miR-302/367 promotes bone morphogenetic protein (BMP) signaling by targeting BMP inhibitors TOB2, DAZAP2, and SLAIN1. This study broadens our understanding of microRNA function in hESCs and is a valuable resource for future studies in this area.
LinkOut: [PMID: 22012620]
|
CLIP-seq Support 1 for dataset GSM714644 | |
---|---|
Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / completeT1, repA |
Location of target site | ENST00000336278.4 | 3UTR | UUCAUAUAUUUUAAUGCAAAUUACCUUGUAUGCUGCUAUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 21572407 / GSE28865 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset SRR359787 | |
---|---|
Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | hESCs (WA-09) / 4-thiouridine, RNase T1 |
Location of target site | ENST00000336278.4 | 3UTR | UUCAUAUAUUUUAAUGCAAAUUACCUUGUAUGCUGCUAUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 22012620 / SRX103431 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
180 hsa-miR-4524a-5p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT055251 | CNNM2 | cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT055826 | PLEKHA1 | pleckstrin homology domain containing A1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT060573 | CCND1 | cyclin D1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT061013 | C1ORF21 | chromosome 1 open reading frame 21 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT064694 | CCND2 | cyclin D2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT075268 | SNTB2 | syntrophin beta 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT079668 | NAPG | NSF attachment protein gamma | 2 | 12 | ||||||||
MIRT081651 | CCNE1 | cyclin E1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT082996 | PNPLA6 | patatin like phospholipase domain containing 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT083463 | RALGAPB | Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit | 2 | 4 | ||||||||
MIRT085755 | RIF1 | replication timing regulatory factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT086022 | UBR3 | ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 (putative) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT087431 | ZNRF3 | zinc and ring finger 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT088786 | SOCS5 | suppressor of cytokine signaling 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT089221 | ACTR2 | ARP2 actin related protein 2 homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT093696 | PI4K2B | phosphatidylinositol 4-kinase type 2 beta | 2 | 6 | ||||||||
MIRT095090 | SEC24A | SEC24 homolog A, COPII coat complex component | 2 | 4 | ||||||||
MIRT096249 | CANX | calnexin | 2 | 2 | ||||||||
MIRT100215 | PPP1R11 | protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT100746 | VEGFA | vascular endothelial growth factor A | 2 | 12 | ||||||||
MIRT100904 | CD2AP | CD2 associated protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT102647 | UBN2 | ubinuclein 2 | 2 | 10 | ||||||||
MIRT103882 | FOXK1 | forkhead box K1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT104246 | DMTF1 | cyclin D binding myb like transcription factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT106310 | ZFHX4 | zinc finger homeobox 4 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT107696 | RECK | reversion inducing cysteine rich protein with kazal motifs | 2 | 2 | ||||||||
MIRT114943 | CHAC1 | ChaC glutathione specific gamma-glutamylcyclotransferase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT117671 | SCAMP4 | secretory carrier membrane protein 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT133799 | SKI | SKI proto-oncogene | 2 | 2 | ||||||||
MIRT140167 | SPRED1 | sprouty related EVH1 domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT142279 | DCTN5 | dynactin subunit 5 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT143288 | N4BP1 | NEDD4 binding protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT165939 | CREBRF | CREB3 regulatory factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT175251 | PSAT1 | phosphoserine aminotransferase 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT186381 | PNRC2 | proline rich nuclear receptor coactivator 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT191470 | PPM1A | protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT196480 | TAOK1 | TAO kinase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT201470 | SNRPB2 | small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B2 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT204615 | HSPE1-MOB4 | HSPE1-MOB4 readthrough | 2 | 8 | ||||||||
MIRT204646 | MOB4 | MOB family member 4, phocein | 2 | 8 | ||||||||
MIRT204749 | BZW1 | basic leucine zipper and W2 domains 1 | 2 | 12 | ||||||||
MIRT206031 | NUP50 | nucleoporin 50 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT211196 | FGF2 | fibroblast growth factor 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT229353 | ZNF449 | zinc finger protein 449 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT247138 | WEE1 | WEE1 G2 checkpoint kinase | 2 | 4 | ||||||||
MIRT249461 | ZNF691 | zinc finger protein 691 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT256314 | CDC42SE2 | CDC42 small effector 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT258419 | WIPI2 | WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT265083 | CHEK1 | checkpoint kinase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT270561 | SETD1B | SET domain containing 1B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT274749 | RAB3IP | RAB3A interacting protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT277515 | PPP2R5C | protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma | 2 | 4 | ||||||||
MIRT289642 | CBX2 | chromobox 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT301001 | MTMR3 | myotubularin related protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT307149 | CTDSPL | CTD small phosphatase like | 2 | 4 | ||||||||
MIRT309021 | USP53 | ubiquitin specific peptidase 53 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT314100 | PIK3R1 | phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT319338 | CAPZA2 | capping actin protein of muscle Z-line alpha subunit 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT320619 | ZNRF2 | zinc and ring finger 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT324285 | LURAP1L | leucine rich adaptor protein 1 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT446498 | ASCC1 | activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT448437 | TLL1 | tolloid like 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT461537 | ACTR3B | ARP3 actin related protein 3 homolog B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT463162 | ZNF367 | zinc finger protein 367 | 2 | 10 | ||||||||
MIRT463493 | ZC3H10 | zinc finger CCCH-type containing 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT465154 | TSC22D2 | TSC22 domain family member 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT466418 | TFAP2A | transcription factor AP-2 alpha | 2 | 8 | ||||||||
MIRT468278 | SFT2D2 | SFT2 domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT469399 | REL | REL proto-oncogene, NF-kB subunit | 2 | 6 | ||||||||
MIRT471941 | NR6A1 | nuclear receptor subfamily 6 group A member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT473688 | MAPK8 | mitogen-activated protein kinase 8 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT479618 | CDC25A | cell division cycle 25A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT482098 | AKT3 | AKT serine/threonine kinase 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT483995 | ATAD5 | ATPase family, AAA domain containing 5 | 2 | 12 | ||||||||
MIRT485205 | PRKAR2A | protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit alpha | 2 | 8 | ||||||||
MIRT498763 | C3orf38 | chromosome 3 open reading frame 38 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT498961 | ORC4 | origin recognition complex subunit 4 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT499440 | ODF2L | outer dense fiber of sperm tails 2 like | 2 | 8 | ||||||||
MIRT500080 | L2HGDH | L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase | 2 | 8 | ||||||||
MIRT500305 | ZNF622 | zinc finger protein 622 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT500410 | ZMAT3 | zinc finger matrin-type 3 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT500789 | TLK1 | tousled like kinase 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT500930 | SRPR | SRP receptor alpha subunit | 2 | 6 | ||||||||
MIRT500943 | SREK1 | splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT501068 | SMAD7 | SMAD family member 7 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT501711 | PARD6B | par-6 family cell polarity regulator beta | 2 | 2 | ||||||||
MIRT502627 | DDX3X | DEAD-box helicase 3, X-linked | 2 | 8 | ||||||||
MIRT502910 | CDCA4 | cell division cycle associated 4 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT502935 | CDC37L1 | cell division cycle 37 like 1 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT504531 | ZNF620 | zinc finger protein 620 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT505106 | YTHDC1 | YTH domain containing 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT505337 | TMEM245 | transmembrane protein 245 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT505383 | TMEM100 | transmembrane protein 100 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT505678 | SESTD1 | SEC14 and spectrin domain containing 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT506157 | PLAG1 | PLAG1 zinc finger | 2 | 8 | ||||||||
MIRT506183 | PHKA1 | phosphorylase kinase regulatory subunit alpha 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT506475 | MYO5A | myosin VA | 2 | 6 | ||||||||
MIRT506826 | KIF23 | kinesin family member 23 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT507160 | GAS2L3 | growth arrest specific 2 like 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT507511 | DYNLL2 | dynein light chain LC8-type 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT507845 | CCNE2 | cyclin E2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT510403 | ZNF507 | zinc finger protein 507 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT518078 | TRIM35 | tripartite motif containing 35 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT518982 | NNT | nicotinamide nucleotide transhydrogenase | 2 | 4 | ||||||||
MIRT521045 | SLC2A3 | solute carrier family 2 member 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT521190 | SBNO1 | strawberry notch homolog 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT522088 | NUFIP2 | NUFIP2, FMR1 interacting protein 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT524846 | ARPP19 | cAMP regulated phosphoprotein 19 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT527787 | TMEM44 | transmembrane protein 44 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT537803 | EFNB2 | ephrin B2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT540830 | GNAT1 | G protein subunit alpha transducin 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT541140 | PISD | phosphatidylserine decarboxylase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT541419 | CBX4 | chromobox 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT543517 | PRSS21 | protease, serine 21 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT543824 | GSG1 | germ cell associated 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT544959 | UGT2B4 | UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT545179 | MAP4K2 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT545335 | CCDC83 | coiled-coil domain containing 83 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT545518 | RSL24D1 | ribosomal L24 domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT545670 | DECR1 | 2,4-dienoyl-CoA reductase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT545931 | ZBTB44 | zinc finger and BTB domain containing 44 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT546102 | USP48 | ubiquitin specific peptidase 48 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT546598 | SALL1 | spalt like transcription factor 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT546626 | RTN4 | reticulon 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT547651 | KPNA3 | karyopherin subunit alpha 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT547987 | HCFC2 | host cell factor C2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT548717 | CRK | CRK proto-oncogene, adaptor protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT548931 | CDK17 | cyclin dependent kinase 17 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT549067 | CACUL1 | CDK2 associated cullin domain 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT549266 | ASH1L | ASH1 like histone lysine methyltransferase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT550460 | OSCAR | osteoclast associated, immunoglobulin-like receptor | 2 | 4 | ||||||||
MIRT550806 | FAM229B | family with sequence similarity 229 member B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT552024 | DNAJC10 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT552334 | ZNF704 | zinc finger protein 704 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT552732 | YRDC | yrdC N6-threonylcarbamoyltransferase domain containing | 2 | 2 | ||||||||
MIRT553795 | SZRD1 | SUZ RNA binding domain containing 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT554694 | RNF149 | ring finger protein 149 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT555133 | PTPRD | protein tyrosine phosphatase, receptor type D | 2 | 2 | ||||||||
MIRT555264 | PRDM4 | PR/SET domain 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT556848 | KANK1 | KN motif and ankyrin repeat domains 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT557474 | GPR27 | G protein-coupled receptor 27 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT558018 | EXT1 | exostosin glycosyltransferase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT558498 | CYP26B1 | cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 |