pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-548x |
Genomic Coordinates | chr21: 18686090 - 18686164 |
Description | Homo sapiens miR-548x stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-548x-5p | |||||||||||||||
Sequence | 8| UGCAAAAGUAAUUGCAGUUUUUG |30 | |||||||||||||||
Evidence | Not_experimental | |||||||||||||||
Experiments | ||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | AGFG1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HRB, RAB, RIP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | ArfGAP with FG repeats 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001135187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_001135188 , NM_001135189 , NM_004504 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on AGFG1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of AGFG1 (miRNA target sites are highlighted) |
>AGFG1|NM_001135187|3'UTR 1 CCTTATATAGACAATTTACTGGAACGAACTTTTATGTGGTCACATTACATCTCTCCACCTCTTGCACTGTTGTCTTGTTT 81 CACTGATCTTAGCTTTAAACACAAGAGAAGTCTTTAAAAAGCCTGCATTGTGTATTAAACACCAGGTAATATGTGCAAAA 161 CCGAGGGCTCCAGTAACACCTTCTAACCTGTGAATTGGCAGAAAAGGGTAGCGGTATCATGTATATTAAAATTGGCTAAT 241 ATTAAGTTATTGCAGATACCACATTCATTATGCTGCAGTACTGTACATATTTTTCTTAGAAATTAGCTATTTGTGCATAT 321 CAGTATTTGTAACTTTAACACATTGTTATGTGAGAAATGTTACTGGGGAAATAGATCAGCCACTTTTAAGGTGCTGTCAT 401 ATATCTTGGAATGAATGACCTAAAATCATTTTAACCATTGCTACTGGAAAGTAACAGAGTCAAAATTGGAAGGTTTTATT 481 CATTCTTGAATTTTTCCTTTCTAAAGAGCTCTTCTATTTATACATGCCTAAATTCTTTTAAAATGTAGAGGGATACCTGT 561 CTGCATAATAAAGCTGATCATGTTTTGCTACAGTTTGCAGGTGAAAAAAAATAAATATTATAAAATATGCTATTGTTTTT 641 GTGTTCTTGCTGCAATGCCTTTACCAAAGTGGCCTTAAATATGAGTAGTGAATTGAGAACATCTTGAATTCTTAAAAGAC 721 TTCTTAGTGACTTTTTATAAAAAGGCCATGTAGAAAATTTATTAAAACTACTATGACTGCTACATTCAGGAATATGCCAG 801 TGGTAAAGCATTTAAATGTAGCTTGTCAGATTTACCATAATCCTACTAATTTCTTTGCAGCTTATTAATTTTGTGAAATT 881 TGTATATATGAAGAATTTGCATGTATGTGTATTTACAAATTTTTCTAAGTATCTTGAATTCTCAGACTGCAAAAGGCCTA 961 TTTTAACTATTGATTTTTTTTAAAAAAAATTGTCTTTGAATGTATTGGAAGTAGACATGCATTAACTGTGACATTATTGC 1041 ACCTCAGTTTTTTTCTTTCTTTTTTTGGGCAAACTGATATTATCTATAGGATATTTGTTTATGTTTGTTTTTTGGGGGAA 1121 AGAAACTGGAACTCAGTGTTACCTTAAAGTTACGGAATACTTTGTTTTAAAGGAAAAGATAATAAGTTTAGTTATATCTT 1201 TTTGTTAATATTCAAATGAACTTGTTTAAGTATCTATGTACAGTAATGCCTCATTCATCTAGAGGTAATCTGGCAGTCTT 1281 GTGAAAACCGAACACAACTCAGAAACTTGGAATCGTTTTTTTTAAAAATGCCTCTGAGCAACCCATATAAGTCACAAAGT 1361 CTGTGTGTTAGAGCTTATGCATTTGTTTTTATGAGAGATTTTAATAAATTTAATTATTTGCTTGTCCAGACTATAGCATA 1441 TTAGCTGTTTAGAAGGGATGGCTTGAAAGGAAGGAGACTGAAAAACACTCTGAGAGCATACACTGTCCAAGGCCATTAGT 1521 GTAAGGACCGCTACCCAGCCTAGAGGACATCACTATACTACATCATCTGATGATTATTCTTTATTATGCCTCTAGGTAAT 1601 TAAGTAAAGGTGAAATTGCATACACAGATATGTAGTACATATTTTAAAAGTTTTATCTTAAATTGATTAAAACTTTTTAA 1681 AAAGCTTTGGTATTAAAAGAGGTAAACATCAGTTTCCTCAAACATTTTATTCATGTTGAATGCCTTTTTGCAATGATGAC 1761 TGAGTTGTTATCATAGTATTTTAAAACCTGTATAGTGTTTTAGACTTGTTAAAACATTGCTGTCTAGTGTACATCTAGCT 1841 AAAAGTGTGGTTTATCTAAACCGTTTTAATAAGCAAGATGACTGGGAAATCTCTGCCCCTTTTCTGAGCAGTATGCCTCT 1921 TCTTTTAGAATTAAATGAATGCTGCACAGGTCCAGATGTGTGTTGATGTAGACTTGAAATGTCTCCACATTTTGGAGGAC 2001 TTCCTCAGCCCTTTTCATTGAGGGAAAATATATTTGAATTTCTGTTTTAGATTGTATCGGGTCCCAGTTGATTCATGTGT 2081 ACAAAGTTATGCTACCTAATTACAGACCATTACCCAAATATCCTACCAGGCTTTCCATCTGAATAGTAAATTAAACAGTT 2161 GTTATCAAAATGATTTTAAAGACTATTTCTTTTTCTGGGTAACTATTGAAGTTTGTAATTAAATGGGGGCTCTTACTGAC 2241 TTTAAATTAGCGCTTATAAAATAAAAATGTTTAGTTCAAGAAGAGACCCAAGCTGGGTATGGTGGTGTGAGAGCCTGTGA 2321 GTCCTAGCTACCTGGAGGTGAGGTGGGAACATCACTTGAGCCCAGGAGTTGGAGGCTGCAGTGCGCTACGATCACACCAC 2401 TGCACACCAGCCTGGGGATAGAGTGAGATCCCATCTCTAAAAAATGAAAAAAAGAAGAGAGGTAGCTTTAAAGTGGTTTT 2481 TCTCATGATATTCACTGTTTATTATTAAAGAAAATCAGCTTTCGTTAGACTTTTACATTTAGATTTATTCTAGTTTTATA 2561 TAGACCATCAAAATTATGTTGAGTACTAAAAAGGAGAAAAAATCCTGGAAGGTAACAAGGCTGAAGACCTTCAAATTTCC 2641 TGGCTTACTGGTTTAGTCACATCATTTTTCCTGTTCAGGTATCTGCAGATATCCCTGTTCAGGAAAGATCTTTTTTCAGG 2721 ATGGCAAACTTTTGACATAGTTTAAAGACATTTTTTCCCCATTTTTTGAAATAGAGAATATTTTATTATTTTTGTGAAAA 2801 TAGAGTTTTGGTAATCACTTTCTTCCTCAAAATAAGTCCTTCTGTTAATTTGTAAAAGCACATTAGTGCTTTACCTGTGA 2881 AATTCCCCGCCCCCCTGCACACACACCCACTTTAGTACAGTTCCTGTCAATTGGCAACATGGAGAGGGTGACCTGGCTGC 2961 TGGTTTACCACTGTACCAACATCTCTGGAGCATTTTAGTTTCAGAACCTTAACACTCCCCAACAGCTTTGTTGATGTAGC 3041 TTGTATCTCTGAGAATTTATTGTATTAAAATTAATACTGAGATATTTTTAAAACATGTTTATTTATTTAAGTATAACAGT 3121 AATAAACTAATAACTTGCTAACATAAATACCATTTTTGATAAAAATAACTTTTCCAAAACAAAAACTAATGAGAACAGGA 3201 ACATTGTTTTACATTTTATGCATTTAAATCTGGCTTAATAAAAGCAGTGAGATTTTCATGCTGCTTTTGCATTCCAACTT 3281 AAAAATTACACAGCATACACACGCTGGAAAACTCCACTGTGCACTTGTGAGATCAGGAGAATGAAAACTATGTAATATCT 3361 CAGTAGTACAATGAAAATAGTTTGACTTTTCACAGCCTTTCAAAGAAAGGGTTGTAGGGACCATTAAGGGTCTCCAGACT 3441 CTTTGAGAACCACTATACTTTAAATTTGTGTATTTCTAGAACAGTATTTACTTGCAGGGCAAACATAACTATTCCCTGGG 3521 TTTTTTTTGTTTGCTAGTGAGAACTGAAATTGCAGACTTTTTAACACTACTTCAAGGTAATAATAGCAGTGGTATTATGG 3601 GCTGTGTATGAGATAGTCATTTGTAAAACAATTTTCATATTTCATCTCTTACAATCCCTGCAGTGGACCTATACTTTTAG 3681 GATGAAAGAAGCAAAGCATAGAGAGGTTAAGCTAGTGGCAGCTTTTTGCTCTGGGGAACAGATTTGGATTAAATGCTATC 3761 ACATTTATATATGAATGCATTCTTTCTTAATATTTTGAAATTCTGAACAAGTTAACGTTCTTGTCTTGTATATCTAAAAA 3841 AACTTTAATCACTTGAATTCCTTTCATAATTTGATGAAATCAGTACAGTTTATTCTTGGTTTTTTTTTTTAACTTTAGAA 3921 GTAAATTAATATGGTAACTAGTGGAGCGTGCTTTAGATTGAAGACTCATCTGAAGTATCACAGACTCCTATTTTGTAAAG 4001 CATTCCACCTTTATTGATACAGTTTGTGGCCTATACACTTTTAAAATTTATTTTTTAAAAGGTGATATTAAAATTTGTAT 4081 TTAACCTGTTGTATTCATCCTCATTAGTTAAGTTTTTCTTTTTATGTTTTAAAACTTAGTGACATTAAACTTTTCACGTG 4161 GTTGTTTGTGAACAGATGAATATATAACCACGATGTAATCCAGTGTTGTGCTGCTGAATGTTTAACAACCATCTTTCATG 4241 AAAGAAAAAAGGCCCTGTTTTGTAGCATTTACTAATATTTATGGTATAAATACTGTCTTCATGGTGATTTTACCTGCCAA 4321 TCTGATGTCATTAAATGCAGTTTGATGAAAGAGATAGCCAACCAGTGGCTTTCCCAAGCCTTGGCAAACCAGCTTCAGCA 4401 CAGCAAAGGACATACAATTCCACAACTCATTAATTAAATGTATTGGTCATTTGATGATTATATCCAGTATTTGGAGAGCT 4481 TTTATATTGTTAATTCATTTAGCAAGCATTTGAACACTTGTTTATTTTTAGAGATATACTGGGCACTGAGGTATTTAATC 4561 TGCAAAGACCCAAGTATCGTGAACCTTGGTTTTAAAAAGTCCAATTATTGTGCTCTTATAGGGGTTGCACATTCAAGGCT 4641 TACACTGAATTCTGTCTGCAGTTCTGTTTTGTGTGACCAGCACAGTGTTTTAAAACGTTGCATTCTGAATCCATCTTTTT 4721 GAAATGGGGCATGTACTCTTAAGGTGGCCACTAGCTTACCATTCCCAATTTTTCTTAGTCTCAAACATTCACATGTTTTT 4801 CAAGGCCTTGGAGTTGGCAAATCCTGAATATATAGTGAAGGTAGGAAATAGCTCTTCTTATGCCACATCTTAGTCTGATT 4881 TTGAAGTCAGTTGTGTAAGTTTGGGCTGACAGTGGTATTTTCCAGTGAAGACTATCGCCAAGAATGCATATCATTCTGCT 4961 TATTTTATTCTAGTGGATAAAAATTCAACGTATATTTAAGTGTATTTTTGACATCTGTGCTTGTCCAACACAGGGCTGTA 5041 GGGACTGATGAAAAGAGAATGTTGTGATTTGAGCTTTTATAAAAAAAGATAAGTGATCCTAGATAAAATATTTTAGATGG 5121 TGATTAAAATGCCCATAGATTAATTTTTTAATCGGTTCTCTGAAATCTTGAGATGTTATCCAAGTTACAATTTAAGCAAT 5201 GAGAGTAAAATTTGAATTCTAAATTCTCAGCATCTTCCCTCATTCTTGAGTGGAGAGACAGAGGAAGCAAACGCCAAGGA 5281 GCCTTCTAATTTTGACTATATGATCATTAACTAAAGGCAGCAAGGGATTGTAAACTAATCTTACATAGTCAATGTTTCAT 5361 AGAATGCTTTGGTTACAATCAGGTTTTTTAAAGACTTTAAAGGTTTTTTGTATGCTATAATATATGCTTATGATTTCTAA 5441 AAATTATGCAGTATACACAAAGGGCATAAAGTCAAAAAGTGTGTCTCCCTCTGTGACTTTATTCTCATACCCCAGAGGCA 5521 TATAATTTCTTGTATTCTTGTGTAGTCTTTAAGAAATGTTATCGTTTATTTTATATATGGCTCTCTCTCTGTATGCCTCT 5601 TCCTGTTCTTATTTTAAATGTTCAAGTTTGTGACTTGGTTCTTGTTTAACTTGGTTGTCTTTCCATATTGCCACCTTCCA 5681 GCTCTAACATTAATGTCTCCAGGATTCCATTATATGGATGTCCCTTTGGGAGAACATTTGTTTATAGACTTTTCTACTAA 5761 AAATATTGTTATAATGATAATATCCTTATGCATATATGAAGATTACTCTTGATTCTGCCTGACTGGAAACTTTATTAATA 5841 AAGTAGACATTATTCTATTTTGAGGCTCACCAGCTGTGTAGGTATGATCTTGTGCTTCCATTTAAGAAATTCTTCCATTT 5921 AAAGAAGAAAAAAAATCTCTCTGACTATCTGAAGATATATGAAAAAGCCTATGCTTTTAAATTAAACTGTTAAGACAGTC 6001 CATTGAAAGATTGTGGAAGTTCACATCTATTTTGCACCTTAATTTTTTCATTGTCCCTACTCATGACTCTAAAAAGTGCA 6081 TGGCTTGGGGCTATACTTTGTTTTGCAGTTTGTTGGTATCGTGCCTTTCCTTATCTACATTAGCTTAGACTATACCTTAT 6161 TTTTAAGAAGAGAAAGTGGAAATTAACTGTGGCAAAACCTATTTTGGCACAACCACATTTGTTCATTATACAAAATTAGC 6241 TTCCTATGCTTTAGAAAAAATGTGAGTTATTACTCTGAAAGTTGTGATTCTGATTCCTCATGGTTTGGAGCTCAGAAATT 6321 TCTTAACATGTCTTTGCTGTTAGTCAAGCACAGGATTTGTTTTCTGCAAAAGTTTATTTTCAATGAAGAATACTTGTCCT 6401 AATAGCTCATAAAAAGTACCTTTGCACTTTAAATCCTAGGAATAGGGAACAAGGAAACTTACTGGGAAGTTCAAAAGAAA 6481 GAATAACAGGACCTTCTAGTCAGCAGGGCATGTTTGGAAAATGTTAATACGCCATGATTTTTGAAGACCAATTTTAGTTC 6561 AGGAGGTGGTTTTAAATATTGGATGAAAACTTACAGGCTGTTTTCAATATTCATTTCTGAAATACTTTAGTATGATAGAT 6641 AAATTTGGTTAAGTTCTTGTTCATTGTGAAATACTGTTGGAAGAATTTTTTTCAAAATAAAGACTTCTGAATTTGTGTAC 6721 CATTTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | HEK293 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
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PAR-CLIP data was present in GSM545216. RNA binding protein: AGO2. Condition:miR-124 transfection
... - Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al., 2010, Cell. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al. - Cell, 2010
RNA transcripts are subject to posttranscriptional gene regulation involving hundreds of RNA-binding proteins (RBPs) and microRNA-containing ribonucleoprotein complexes (miRNPs) expressed in a cell-type dependent fashion. We developed a cell-based crosslinking approach to determine at high resolution and transcriptome-wide the binding sites of cellular RBPs and miRNPs. The crosslinked sites are revealed by thymidine to cytidine transitions in the cDNAs prepared from immunopurified RNPs of 4-thiouridine-treated cells. We determined the binding sites and regulatory consequences for several intensely studied RBPs and miRNPs, including PUM2, QKI, IGF2BP1-3, AGO/EIF2C1-4 and TNRC6A-C. Our study revealed that these factors bind thousands of sites containing defined sequence motifs and have distinct preferences for exonic versus intronic or coding versus untranslated transcript regions. The precise mapping of binding sites across the transcriptome will be critical to the interpretation of the rapidly emerging data on genetic variation between individuals and how these variations contribute to complex genetic diseases.
LinkOut: [PMID: 20371350]
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Experimental Support 2 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | HEK293 | ||||||
Disease | 3267.0 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
"PAR-CLIP data was present in GSM1065667. RNA binding protein: AGO1. Condition:4-thiouridine
... - Memczak S; Jens M; Elefsinioti A; Torti F; et al., 2013, Nature. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Memczak S; Jens M; Elefsinioti A; Torti F; et al. - Nature, 2013
Circular RNAs (circRNAs) in animals are an enigmatic class of RNA with unknown function. To explore circRNAs systematically, we sequenced and computationally analysed human, mouse and nematode RNA. We detected thousands of well-expressed, stable circRNAs, often showing tissue/developmental-stage-specific expression. Sequence analysis indicated important regulatory functions for circRNAs. We found that a human circRNA, antisense to the cerebellar degeneration-related protein 1 transcript (CDR1as), is densely bound by microRNA (miRNA) effector complexes and harbours 63 conserved binding sites for the ancient miRNA miR-7. Further analyses indicated that CDR1as functions to bind miR-7 in neuronal tissues. Human CDR1as expression in zebrafish impaired midbrain development, similar to knocking down miR-7, suggesting that CDR1as is a miRNA antagonist with a miRNA-binding capacity ten times higher than any other known transcript. Together, our data provide evidence that circRNAs form a large class of post-transcriptional regulators. Numerous circRNAs form by head-to-tail splicing of exons, suggesting previously unrecognized regulatory potential of coding sequences.
LinkOut: [PMID: 23446348]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM545216 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / miR-124 transfection |
Location of target site | ENST00000310078.8 | 3UTR | UUCACAUCUAUUUUGCACCUUAAUUUUUUCAUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 20371350 / GSE21578 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM1065667 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO1 |
Cell line / Condition | HEK293 / 4-thiouridine, ML_MM_6 |
Location of target site | ENST00000310078.8 | 3UTR | UUCACAUCUAUUUUGCACCUUAAUUUUUUCAUUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23446348 / GSE43573 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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249 hsa-miR-548x-5p Target Genes:
Functional analysis:
ID![]() |
Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT057505 | CEP55 | centrosomal protein 55 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT060830 | CEP350 | centrosomal protein 350 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT062721 | MLEC | malectin | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT064767 | CCND2 | cyclin D2 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT075338 | SF3B3 | splicing factor 3b subunit 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT080209 | PRKACB | protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT080238 | SMAD4 | SMAD family member 4 | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT087397 | AGFG1 | ArfGAP with FG repeats 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT088230 | GRAMD4 | GRAM domain containing 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT089495 | MTHFD2 | methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT091224 | USP13 | ubiquitin specific peptidase 13 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT092960 | CYP2U1 | cytochrome P450 family 2 subfamily U member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT094093 | PAICS | phosphoribosylaminoimidazole carboxylase and phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT097470 | PAPD4 | poly(A) RNA polymerase D4, non-canonical | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT102253 | HBP1 | HMG-box transcription factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT105441 | ATP6V1B2 | ATPase H+ transporting V1 subunit B2 | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT107289 | FAM73B | mitoguardin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT113586 | ZDHHC18 | zinc finger DHHC-type containing 18 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT113887 | KPNA6 | karyopherin subunit alpha 6 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT126459 | ARL5B | ADP ribosylation factor like GTPase 5B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT135026 | ADSS | adenylosuccinate synthase | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT139893 | BTF3L4 | basic transcription factor 3 like 4 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT149712 | LDLR | low density lipoprotein receptor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT163234 | EDEM1 | ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT165202 | GRAMD3 | GRAM domain containing 2B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT172173 | FZD6 | frizzled class receptor 6 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT177397 | ZMYND11 | zinc finger MYND-type containing 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT179430 | TBRG1 | transforming growth factor beta regulator 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT195619 | FAM195A | MAPK regulated corepressor interacting protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT208729 | MED12L | mediator complex subunit 12 like | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT211511 | ELMOD2 | ELMO domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT213435 | MOB1B | MOB kinase activator 1B | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT240123 | NDRG1 | N-myc downstream regulated 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT243103 | LCLAT1 | lysocardiolipin acyltransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT247389 | HCFC2 | host cell factor C2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT248058 | ZBTB18 | zinc finger and BTB domain containing 18 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT249459 | ZNF691 | zinc finger protein 691 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT253422 | EVI5L | ecotropic viral integration site 5 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT254149 | ETS2 | ETS proto-oncogene 2, transcription factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT258908 | LAPTM4B | lysosomal protein transmembrane 4 beta | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT259394 | SLC6A8 | solute carrier family 6 member 8 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT266973 | LRRC55 | leucine rich repeat containing 55 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT279002 | GMFB | glia maturation factor beta | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT288803 | KCNJ2 | potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT325680 | ZNF367 | zinc finger protein 367 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT330544 | HNRNPF | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT334273 | RCC2 | regulator of chromosome condensation 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT350226 | PRNP | prion protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT400513 | SKIL | SKI like proto-oncogene | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT405640 | WBP4 | WW domain binding protein 4 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT408652 | QKI | QKI, KH domain containing RNA binding | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT444160 | ZNF701 | zinc finger protein 701 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT444508 | ZNF525 | zinc finger protein 525 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT445208 | CRYBG3 | crystallin beta-gamma domain containing 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT446843 | FOXP1 | forkhead box P1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT449025 | ADRB1 | adrenoceptor beta 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT450745 | POLI | DNA polymerase iota | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT450792 | OTUD7A | OTU deubiquitinase 7A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT454915 | ANKEF1 | ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 12 | ||||||
MIRT455265 | DDX39B | DExD-box helicase 39B | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT455714 | EIF4EBP2 | eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT456097 | MB21D1 | Mab-21 domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT463634 | YY1 | YY1 transcription factor | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT463890 | WNT7B | Wnt family member 7B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT466261 | TMBIM6 | transmembrane BAX inhibitor motif containing 6 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT466819 | STX6 | syntaxin 6 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT466878 | STX16 | syntaxin 16 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT467523 | SMG1 | SMG1, nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT468198 | SGK1 | serum/glucocorticoid regulated kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT468632 | SELT | selenoprotein T | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT470366 | PPP2R5E | protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT470997 | PITPNA | phosphatidylinositol transfer protein alpha | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT471558 | PATL1 | PAT1 homolog 1, processing body mRNA decay factor | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT472276 | NFIB | nuclear factor I B | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT472757 | MTMR6 | myotubularin related protein 6 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT474718 | KIF13A | kinesin family member 13A | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT475868 | H3F3C | H3 histone family member 3C | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT475902 | H3F3B | H3 histone family member 3B | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT477349 | EOGT | EGF domain specific O-linked N-acetylglucosamine transferase | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT477485 | ELL2 | elongation factor for RNA polymerase II 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT478095 | DLG5 | discs large MAGUK scaffold protein 5 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT479804 | CCNA2 | cyclin A2 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT480812 | BLCAP | bladder cancer associated protein | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT481946 | ANKRD11 | ankyrin repeat domain 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT483059 | EXT2 | exostosin glycosyltransferase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT484142 | LRRC45 | leucine rich repeat containing 45 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT484903 | ZFYVE26 | zinc finger FYVE-type containing 26 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT485079 | SOX4 | SRY-box 4 | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT485638 | DICER1 | dicer 1, ribonuclease III | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT485797 | ARPP19 | cAMP regulated phosphoprotein 19 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT486270 | SEC23A | Sec23 homolog A, coat complex II component | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT486739 | CNOT4 | CCR4-NOT transcription complex subunit 4 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT487166 | LFNG | LFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT491641 | PDRG1 | p53 and DNA damage regulated 1 | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT491933 | WDR45B | WD repeat domain 45B | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT492231 | SLC48A1 | solute carrier family 48 member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT493088 | MMGT1 | membrane magnesium transporter 1 | ![]() |
![]() |
2 | 12 | ||||||
MIRT494478 | BRWD3 | bromodomain and WD repeat domain containing 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT494985 | ROCK1 | Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT495670 | ARIH1 | ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT498466 | PTBP2 | polypyrimidine tract binding protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT499267 | NBPF11 | NBPF member 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT499853 | SVOP | SV2 related protein | ![]() |
![]() |
2 | 12 | ||||||
MIRT500306 | ZNF622 | zinc finger protein 622 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT500639 | TUBB2A | tubulin beta 2A class IIa | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT501221 | SEMA4C | semaphorin 4C | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT501525 | PPP1R15B | protein phosphatase 1 regulatory subunit 15B | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT501568 | PLEKHF2 | pleckstrin homology and FYVE domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT502429 | G3BP2 | G3BP stress granule assembly factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT502966 | CCNL1 | cyclin L1 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT503469 | ZNF154 | zinc finger protein 154 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT504571 | ERCC4 | ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT504955 | ZNRF2 | zinc and ring finger 2 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT505205 | UBN2 | ubinuclein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT505237 | UBE2D3 | ubiquitin conjugating enzyme E2 D3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT507569 | DEK | DEK proto-oncogene | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT509411 | MCM7 | minichromosome maintenance complex component 7 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT510714 | SPG20 | spartin | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT510858 | RAN | RAN, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT510913 | PSMA2 | proteasome subunit alpha 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT510943 | PPTC7 | PTC7 protein phosphatase homolog | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT511071 | NIPA1 | non imprinted in Prader-Willi/Angelman syndrome 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT511212 | LNPEP | leucyl and cystinyl aminopeptidase | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT511958 | ELOVL5 | ELOVL fatty acid elongase 5 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT512122 | CREBL2 | cAMP responsive element binding protein like 2 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT513685 | RNF111 | ring finger protein 111 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT513895 | GRB10 | growth factor receptor bound protein 10 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT516304 | F8A2 | coagulation factor VIII associated 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT516330 | F8A3 | coagulation factor VIII associated 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT517520 | ITM2C | integral membrane protein 2C | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT517929 | IMPA1 | inositol monophosphatase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT521367 | RNF11 | ring finger protein 11 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT525191 | ZNF93 | zinc finger protein 93 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT527215 | CCNL2 | cyclin L2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT527834 | NUPL1 | nucleoporin 58 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT529432 | MALT1 | MALT1 paracaspase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT530165 | C11orf44 | chromosome 11 open reading frame 44 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT530514 | C4orf32 | family with sequence similarity 241 member A | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT532371 | LINC00598 | long intergenic non-protein coding RNA 598 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT533854 | TEAD1 | TEA domain transcription factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT534749 | RAVER2 | ribonucleoprotein, PTB binding 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT534794 | RAB8B | RAB8B, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT538601 | CDK19 | cyclin dependent kinase 19 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT539246 | ANKRD50 | ankyrin repeat domain 50 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT539466 | ADARB2 | adenosine deaminase, RNA specific B2 (inactive) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT543099 | TNFRSF11A | TNF receptor superfamily member 11a | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT543896 | ESYT1 | extended synaptotagmin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT544979 | MFF | mitochondrial fission factor | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT545793 | ZNF772 | zinc finger protein 772 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT546008 | WDR26 | WD repeat domain 26 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT546377 | STOX2 | storkhead box 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT546680 | RORA | RAR related orphan receptor A | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT546946 | SFTPA1 | surfactant protein A1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT547033 | POGZ | pogo transposable element derived with ZNF domain | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT547396 | MKX | mohawk homeobox | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT547469 | MBNL3 | muscleblind like splicing regulator 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT547500 | MBNL1 | muscleblind like splicing regulator 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT548076 | GIGYF1 | GRB10 interacting GYF protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT548499 | E2F8 | E2F transcription factor 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT548882 | CHEK2 | checkpoint kinase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT549062 | CALM1 | calmodulin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT549165 | BMP3 | bone morphogenetic protein 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT549309 | ARHGAP12 | Rho GTPase activating protein 12 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT549344 | ARC | activity regulated cytoskeleton associated protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT549474 | ACBD5 | acyl-CoA binding domain containing 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT549677 | ZNF598 | zinc finger protein 598 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT550208 | MAVS | mitochondrial antiviral signaling protein | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT550355 | INCENP | inner centromere protein | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT550530 | MYZAP | myocardial zonula adherens protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT551155 | ZNF678 | zinc finger protein 678 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT552310 | ZXDA | zinc finger, X-linked, duplicated A | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT552879 | WASL | Wiskott-Aldrich syndrome like | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT553382 | TRIM33 | tripartite motif containing 33 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT554452 | SAMD8 | sterile alpha motif domain containing 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT554867 | RCAN2 | regulator of calcineurin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT556021 | MYBL1 | MYB proto-oncogene like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT556174 | MCC | mutated in colorectal cancers | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT556237 | MARCKS | myristoylated alanine rich protein kinase C substrate | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT556877 | ITGA2 | integrin subunit alpha 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT557574 | GNPTAB | N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase alpha and beta subunits | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT557689 | GATA6 | GATA binding protein 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT557905 | FBXO8 | F-box protein 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT558131 | ENPP4 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4 (putative) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT558480 | DBN1 | drebrin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT558743 | CHIC1 | cysteine rich hydrophobic domain 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT558759 | CFL2 | cofilin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT559121 | C11orf57 | chromosome 11 open reading frame 57 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT559405 | GDNF | glial cell derived neurotrophic factor | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT559475 | ARL8A | ADP ribosylation factor like GTPase 8A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT559676 | AGO3 | argonaute 3, RISC catalytic component | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT560048 | ZNF680 | zinc finger protein 680 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT560644 | ZNF107 | zinc finger protein 107 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT562580 | CBX3 | chromobox 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT564187 | CLVS2 | clavesin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT564529 | SNRPD3 | small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT564539 | CCDC80 | coiled-coil domain containing 80 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT565288 | TMPPE | transmembrane protein with metallophosphoesterase domain | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT565314 | TMEM41A | transmembrane protein 41A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT565949 | RRAGD | Ras related GTP binding D | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT566632 | NFYA | nuclear transcription factor Y subunit alpha | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT566817 | MAPK8 | mitogen-activated protein kinase 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT567528 | FGFR1OP | FGFR1 oncogene partner | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT568630 | ACVR2A | activin A receptor type 2A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT572140 | DESI1 | desumoylating isopeptidase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT616028 | TMTC1 | transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT620047 | ODF4 | outer dense fiber of sperm tails 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT620530 | AVPR1A | arginine vasopressin receptor 1A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT621877 | TAOK3 | TAO kinase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT623241 | MLLT6 | MLLT6, PHD finger containing | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT623993 | FAM104A | family with sequence similarity 104 member A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT624300 | COL12A1 | collagen type XII alpha 1 chain | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT626282 | PEX26 | peroxisomal biogenesis factor 26 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT627770 | RAB30 | RAB30, member RAS oncogene family | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT641138 | ZBTB33 |