pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-628 |
Genomic Coordinates | chr15: 55372940 - 55373034 |
Synonyms | MIRN628, hsa-mir-628, MIR628 |
Description | Homo sapiens miR-628 stem-loop |
Comment | The mature sequence shown here represents the most commonly cloned form from large-scale cloning studies . |
RNA Secondary Structure | |
Associated Diseases |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-628-3p | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 61| UCUAGUAAGAGUGGCAGUCGA |81 | ||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | Microarray | ||||||||||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
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DRVs in miRNA |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | JMY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | WHAMM2, WHDC1L3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_152405 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on JMY | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of JMY (miRNA target sites are highlighted) |
>JMY|NM_152405|3'UTR 1 CAAGTGACATAACAGAAGAAAAATATCATTCAAGATTGGTTCTGATTCTTTTGGAAAATGACAGTTTAAGCACTTGGTTC 81 CTCAGTTGGATAACATTAGATCCAAAGTTCATTGGTTCAGTGGTGTGAAGAAAGGAAGCACAATTGGCAGGTTATCACTT 161 TCCAGTCGTTCCAATAGATGATGGTTAACATGAATTTTACATGTGCAATGTTCCTGACTGCAATGAAGAAAAGGCCTTCT 241 GGAGATTTCTGTTTTTTAAGCACATTCTCCTTCCATCCACATATTTACATCCTTGTAATGGCCAGTTAAGCTAGGGCTTG 321 CTGTAAGTTGGAAGAACACTGGGTTGACAGAGATCTACTGTGAGCTGTATTGGGACTGCTTTGAGAACCATCTTTCAATG 401 CACTGAAAAGTCATCTGAAAAAATAGCTTCTTCCATATCAGCTTATATTAAATACTGTGACACTCTGAGAAAGTTTATCA 481 TCATGATAGCTGTAAGTCAGGCATTAAAATCAAATGGAAATACACCTAAAATGTCCGCATTACTCATTTCCAAAGGATTT 561 TTCATAAAGATGTTCAGCAACATCTGAAAAGCTGCATTTATGGAGATACATCTATTAATATGTTCACAACATGATACATT 641 TAACATGGCATATTTTTAGGAGTCTTATACTTTGTAAGGTTTTGAAGTTTCCGTGCTTTTAAATCACTCTTCATATTTCT 721 TGAATTTATAATAGTTTGAATTTTATGTGCATCCTTGTTTATGGAAGGCAGTACTTTGATAATATTTCAAATTATTTTTA 801 TTTTGTTTGAATTATTGCTTGATTGCTATGACTGACATGACTTTCCTATTGAGAATCAAAAATCAAGATTCAATCATAGG 881 GATGCAGATCTTAACTCTTTTCACAAATTACCATTTTAAGTTTTTATTTTTATGCTCCACAGTGAAAAGCATGTGCTCTA 961 CAAAGATAGAAAGTAGAGACAAGTCTCCGTGGCTGGCATTTCACCATCTTCACATGCACTGAATGGAATTTTGGGAGAAT 1041 GCCTTTGTTATAGTCACTAAAATTTTAAACTTATACACAGCTTTAGGTGCTGATTTTGGCTGTGATGGAGTCCTGAAGGA 1121 CACATTTATATGTTCCAGATTTTCAGCAGGATTGTTGTGGGCTTGAATACATGTAGATCATTGGACTCAGTGTGCAGTAC 1201 CCTGTACATATAATTCTGCATAAGACAGATCTTGGCCTTTCTGTGGAGGGAGTTAAGAACTAAAATACCAAAAATCACTT 1281 TATTTCTTTTAAGACAATTATCTGGCCTAAACCCAGAAAGCAGTACTGGAGCAAAAGCCCAGTGTATATGAATTGGTATT 1361 CCTAGAGAAAAAAAGAAATGCTCACACCTTTGTTATTTTAAAGTGTTTTCTTGAAAATAATTAGGGAGAAAATTTTCTGG 1441 CAACAGGTTATGTAAGACAACAACTTTTTTTATTATTTCAAAACAAAACAGGCACATGCCACCATGCCCCAGCTAATTTT 1521 TATATTTTTTATAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGGACTCAAGCAATCTGCCAGCCT 1601 CGGCCTGCTAAAGTGCTAGGATTATAGGCGTGAGCCTCTGTGCCCAGCCTGACAAAATCTTTTATTTATTTAAATGTTAG 1681 TAATACGTTTATTGATGAGACTAGGAGCTTCTCTGCAGCATCTTCATAATACATTGGTTTTAGTTCCCACACTATTCCCA 1761 CATCTTATCTGGGAAGATTAGAAATACAGATGTAATATGGAAGCTTCAACAGCATGGGGGTGGTGATAGTGTCCTATTTG 1841 CCCTTGGTAAAATATTAAAGCGTATTTCTTAACCCAAAGAGTGATTGGTTATATGAATATATTTGAAAAAGTTAAAGCAA 1921 ATTTGCAAACCTTTACAAAATCATGTATCAATTTTATGCTATCCAGTTTTTACGTACCCATGTGTCAACATTTCATATAT 2001 CCAGTTCTTTGGGTGCTGGTTCACTTTTTTTCATTTATTCAAATTCAGAAAAATACGGACGGATCTAATGTTAAATTAAC 2081 CAGAAACCCTGGAACATTCATATCTTGAGAGGGAATTTGCTACTCTTTTACTTTTGGGATTTCATTATAAAATAGGCTCA 2161 TTTTATACATATGTCCTGTGGTCTGTCTTCCAGAGTGTGCTGTAATCATAAGTCTCTAGCAAAGAGTGGAGGGTGGAGGG 2241 TGTGTAGAACTCCACTCAGCCTCATGGATACATCTACAAGTCTCTCAACCCATCCTGTTACAGTTCTCCATGAGAGTCAC 2321 CTCACACTTGGAAAAGAAGGAGGTTAAAGCAGAGTATTGTTGGCAGCCAGCTATGCCCATCCTCTTGTAAATAACTTTCC 2401 AACACACCCATTTCCTTGCCTTAAGGTGCAGGTTCCTACTTCTACAAAATTTCAAATGATTGCAGGTCAAAAACCTTTGG 2481 AGTTACTCACAAATAATAATAAAATTTCAAATAACTAGGGTCTACTTGTCCATCAAGATGACATTACCAGTGGAACCCAC 2561 CTGTTAATTTTAAAGTAGCTTCAGAACCCAACAAAAATTATGTAAGCCTGGTTAAATGTCCTTTTTTCTTCTTGCCTCTA 2641 ATAAAATCAGGATCTTCGGCCTTGATACTAAATATGTGTATATTTAGTTATGATGGTACTTGTAGATGCTCACATTTCCA 2721 GTTCCAAACTCGCCCGTACTTTTTATGTGCTTCAAAATATTGGACACATTTCTGTTAATATATGATTTCTGTATCCACAA 2801 ACCGCTGTTTGCTTATGCTGAGTCAATTTAGAAGTTAATTTCCAATCTAGTCTCAACTGCAATGCATTTAAAATAGGTAA 2881 AACAAGTAAATGAGTTTGGGACATTTTGAGATTAATGTTACTGCCCACTTGACTGTCAATTTCAAATGGCTCCTAATGCA 2961 ACCAAAATTATAACCAATGTAGCATGTGTAGGAAAGGTATTTTTAATTATTTAAAATCATTGTGTATATTACAGCAGTAT 3041 GAGGAATGCCTGGCTAAAGAGGATTTTTTAAAAGATGAAGAATGGTTTTGCTTGTATTATATAGGCTTACTGAGTTTGTG 3121 AGCAGCATAAAAACAATCATTCCTTAATTCTTCATTGTGGAACTGAAATATTTCTGTAATGCATTTTTTAAAAGGAGACT 3201 CCTAGACACAGCTGTAATAGTGGGAATAGAAATGTAGAGCTTTTCTCATAACACAAAACCAGAAAATAATTTTCAGCACT 3281 TTGACTTACTCTATGTAATAAGGAAAAAAATTGTTTCCACAAAGTTGAACTATGTAGTAATATTTGGTAACATATGGCAT 3361 GGCCACTTTATATCACAGAATGTGTGTCAAGTTGCAAAGCATACTTGGGCCATAGTAGACACTAAGAATTAAAACTCTTA 3441 AATCAGTGAAACAAAAACTAATGGGCAGCATTCTCTCTGTTTGGAATGGGATCAGTATACAATTAATACAATTTAATTTT 3521 ACACATTCCCTAAGACACCATTTTTAAGTTACAGTCACATGAGTGTTTGTATAAATTTAAGTCAATGCTTTTAGCCTAGG 3601 CAAAGCTAAATACAAGGTTTTTGGGGTTTTCTTTTTTCAGCTTTATTATTGAAGTATTACAAACTTAACATCAGATACCA 3681 ATGTGTAAAAAGTACTATTGGGTCCTTAAGGGCTCTATCAGGGAGTTGAAATTTCATACGCTTTACCAGGTTACTTGTAA 3761 AAAATGAACAGCTGTAAGACATTTCAAAACCATTGCAGACACATTGTTAAAATGCAGCCATTTGATAATGAAAGCAGAAA 3841 CCTTAAGTTTTACCTAATTATTGCACTAAATGTAAATGATAACATAAAATTAAGTGTGCATTTTAAACAGATTCTATTTC 3921 CCACTTACTGCTTAGCATAGAAAAAGAGCTATGGTTAGAGGAGTGACCAGCAAGATTTATTTCAGATGGAAAAGGGGTGA 4001 GAAAGTGGAAGCACCTTACTGTTAGAGCATGTTGCATCTATTTAGTGCTACTGAACAATTCAGTAGTTATTTCTGAACTT 4081 TGCTGCAAAGTGCTCTTTAGTTAAAGCACATTAAGAAGGGTCACTGCTTAATTGCTTTGTAAAATGAAGCAATGGTATTT 4161 TTTATCCGATATAGTGTAATTTAAAAGTTTTCCTACAAAGTGAGTTTATATTGTTGCCTAAACTATGTTATGTAAGCAAA 4241 GGGTTTGGAAAGGCGGGAGGGAGTCTAGATTCGGCGAGAGTGTGCGTTTGTGTGTGTGAATGTATGAAAAGTTTCCCCAT 4321 TGGGTTATTCTTAAGATGTGTTTATTGTAAAGTTTTCTACGTTTTGCCCACAGTAAATGTACAACTTCGCAATTGTAGGA 4401 TTTAATTGATTGAATTCCAAATTTATACTGTCTCTTCCCTTCTGCAGAGACATTATGCCACTGTAAGGTGCATGTACAGA 4481 AAATACCTCTGAGGTTGACTTGTTAAATAACTGATGAATGTTATTTCACACTGAATCTCAAAGCAGTCATTTGTTTTGCG 4561 GGTTAGGGGAAAGTTTTGTTTTTTGCTGGTGTTTTTTGTTGTTTTTAATTAGGCACACTAAGAGTGGCTAAATTTGGGGG 4641 AATTGGTGGATAGGAAAGACCTTGAAAAGTGATGTGTAGATGAAAACACAAGGTATGGATGTTGGTTACAGAGTTCAGTT 4721 TTAACAAGGGAAATTTGGGGATTTTTTTTTTTTTTACTTGCATGTTCTATGGGTAGCTATCAAAGGGTGTAACAAATTAT 4801 TCCAGCTTTTCCCAATACTAATTATATTGGTTTTAAAAAGTCTGCATAATCACTAGGTGGCATTTTCCCTTCATTTGTGA 4881 ACCAAGAGGGGTAAATGATGCTACCCATACAGTGACTTCTGAGTTCTTTAACTTTGACAGAATCTCCATTGTTTCATTGA 4961 ATTTCTCATTGTATTATATGTCTTTCCAAGTGTGCAAACTATAATATGTAGTTAATGAAAAATGGAAGGCTGCAGATTAT 5041 TTTGCATGAATAATTAATTGCCCATTAGGGCTAAGGAGACTGACATGATTTTTATCGGTTCTGGGTAAATGAAAATTTTA 5121 ATGGAAAACTCATTCACCATTTACTAGCTTTGTGCAATATTATAAAAGGTAGAAGCAAAACACTAGCACATTGTGCTTTG 5201 CTTGGCTTGTAAGGATGGCTTTAGTACCATTACATTAAATGGACAGTGTGCACAGTGTATTGTAAATGCCAACTCTTGCA 5281 AATTTACAATACTTAAATATGTTCAATTAACATCCTAAAGTATTAAAAGTACAGAGGAAAAACTAAGCAAGCATTTATAG 5361 CAATACCATGAAATCTCCAGTAATCGTTTTGACTGTTGCCTTTTGCTCTTTAGTGCAGCTTTTCTGCATTGTAATTGTAT 5441 TGCTTTGTATTTCATGTTTTTTACACTCATGACTTCAGAGTTAAGTACTTGTACACCAAGTATTGCAATCACCTTTCTCT 5521 TGTTGTACATGCAATGTAACAACCTACAGTTTTGGTGCTTTTAACAATATTCCTCTTTTTCTTTAATAAAGGATATTTAT 5601 TTGAATTAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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