pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-3123 |
Genomic Coordinates | chr1: 241132272 - 241132346 |
Description | Homo sapiens miR-3123 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-3123 | ||||||||||||||
Sequence | 49| CAGAGAAUUGUUUAAUC |65 | ||||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||||
Experiments | Illumina | ||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | ID4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | IDB4, bHLHb27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | inhibitor of DNA binding 4, HLH protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001546 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on ID4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of ID4 (miRNA target sites are highlighted) |
>ID4|NM_001546|3'UTR 1 GCCGCGCTGTCCAGGTGTGCGGCCGCCTGAGCCCGAGCCAGGAGCACTAGAGAGGGAGGGGGAAGAGCAGAAGTTAGAGA 81 AAAAAAGCCACCGGAGGAAAGGAAAAAACATCGGCCAACCTAGAAACGTTTTCATTCGTCATTCCAAGAGAGAGAGAGGA 161 AAGAAAAATACAACTTTCATTCTTTCTTTGCACGTTCATAAACATTCTACATACGTATTCTCTTTTGTCTCTTCATTTAT 241 AACTGCTGTGAATTGTACATTTCTGTGTTTTTTGGAGGTGCAGTTAAACTTTTAAGCTTAAGTGTGACAGGACTGATAAA 321 TAGAAGATCAAGAGTAGATCCGACTTTAGAAGCCTACTTTGTGACCAAGGAGCTCAATTTTTGTTTTGAAGCTTTACTAA 401 TCTACCAGAGCATTGTAGATATTTTTTTTTTACATCTATTGTTTAAAATAGATGATTATAACGGGGCAGAGAACTTTCTT 481 TTCTCTGCAAGAATGTTACATATTGTATAGATAAATGAGTGACATTTCATACCATGTATATATAGAGATGTTCTATAAGT 561 GTGAGAAAGTATATGCTTTAATAGATACTGTAATTATAAGATATTTTTAATTAAATATTTTTTTGTAAATATTATGTGTG 641 TGTTTTTTTTTAATCTATGGGAATATTTCTTTTGGAAAATCATTTTTCAGCTCAATTACAGAGCTCTTGATATCTTGAAT 721 GTCTTTTCTGTTTGGCCTGGCTCTTAATTTGCTTTTGTTTTGCCCAGTATAGACTCGGAAGTAACAGTTATAGCTAGTGG 801 TCTTGCATGATTGCATGAGATGTTTAATCACAAATTAAACTTGTTCTGAGTCCATTCAAATGTGTTTTTTTAAATGTAGA 881 TTGAAATCTTTGTATTTGAAGCATACATGTTGAAAATACACCTTATCAGTTTTTAAGTACAGGGTTTTATAGTGTAATAT 961 ATACAGAGTAAGTGTTTGTTTTTGTTTTTCAACTGAGGTCAAAATGGATTCTGAATGATTTTGCATATGGGATGAGGAAA 1041 TGCTTGGATCCTTAAGGAGTTTACGAAATCTGCTGTTTTATCAAAGTGAAAAAAAATTGCTTATTACTCTTCATTTTACA 1121 CTAAAGCTTAATGTCACTAAGTTTCATGTCTGTACAGATTATTTAAATCATGGAAATGAAAAAAATGTTCTCTGCTTGCT 1201 ACCAAAGGACAAACTCTTGGAAATGAACACTTTCTGCTTTCCTTCCTCCAAAGAATTAATAGGCAACAGTGGGAGAAAAA 1281 AAAGGCATAATGGCAAATCCTTCAAGCAGGGATAAAAGTCGATCTTCAAACATTAACTTAAGCAGACCAAAAATTCTGAT 1361 GACCGCATCTAGATTATTTTTTTATAAAAATGATTTTCACTATAGCTATGTTACGCTAAGCTACTGTCCAATCTCTTGTG 1441 ATGTGTAACTTTTACATGTGAATATTAAAGTAGATTTCTCTGTCTTGTACTGTGATTTCTGGTCTCATTTCTTTAAAACC 1521 TTACTCTTATTTTTCTTTTAAGGCTCTTTTTTCTCCTTAAGGAAGGTAATATTTTCTAGGTTAGATAGGACTATCAGGGT 1601 TTGTGAACATTATGCATTTAATGTTATGGGTACTTTACACACAAGTTAGATGGAATTTTTAGAGTGAAAGAATTAAGTAG 1681 GATTTAATTGGGTGCTTTGTAAATAGTCAACTGTGTGTATAACGTGGTCTGTTTGATTTTTAAAAGGAAAGGATTTGTTT 1761 CAGATTATACAAGAATAAAAGTATTATAGACCCAAGGGACTTCTTATGAGGTCAAATTCAGATATTTATATGAATATGAA 1841 ATACCATGGTCCCTAGTAGTCAGTTGAAGTGGCAATGTCTAAACAGAAATGAACAAAACTAATGCTAGCAGGTTAAAATC 1921 AATCAAAATGTTTAAAAATTGATTCTGTCCTCAGCATGTTATTTCCTCAGCTCTGATAATTTACTGGTCTTGAGTATTTT 2001 GAGAATTTGATGTTGAACGTTATAAAGTCAAAGAACTGCTTGTTTAGATGAGGTTTATTTTTATTTTTGATATTATTCAT 2081 TCTTGTCACACATCAAGAAGAAAACACTAGAGTGCTGCTGGAATTCCAAATCTGAAGAATTCTAACGACTGCATTCTTTG 2161 TTATTAAAAAGGGCACAATCCTTCCTTTTTATTTGGCAGTTTAATTTCAGTAGGAAGCATGTCACATGTGCACTGTTGGT 2241 TAGAATTATGCATCTGTCATGCCTGACTGCTGAACCCTACCTAAGCCTTTTGGCGCAGTTTAAAACTTATACTGGTGGAC 2321 TGTGAACCTCAAAACAAATGGGTATTTTTGGGTTTTGAGGATAGATGTTACTCCTTAAAGTTTGTATTTGGGGCATGAAA 2401 AACTACTGAAAGAAGAAAAGTGCTACAGATACTACATTTCAAAGAGTTGGCATTTTCCCTTTGGCCACTCAAGCAGCATT 2481 TGATGTATCTAAAGAAACAAAGTCATTGTTTATTTTTTAAAAAATTATATGCAGTTGTACAAGATACTACATTCCATTGA 2561 AATGTTGGCTATGTCCTAACCAGGCAACCAGATAACAAAAACATTTTGAGTCTTTTATCTAGGTAGTTCTAATTATTCAG 2641 CTACTTAGTTTAACAAAGGAAAATATCCTGACTTCTCTCATTTCATTTGTAGACTTTTCATTGTATAGGCACAACCAAAG 2721 AGTCAGACTGGTTTAAAACTCCAGAAGGAAAAAAAGTATCCCACACAGTGGATGTTGTTTCTAAGAATGCTACAAAATCC 2801 TGACATCTCAGACATCTCAATGTTAAAGGAAGAAAAAAAATACCTTTTCATTTCAAAGAACTAATATACTTTGATATTGT 2881 GTAAACCTTACTCAAGTTTATTGTCAAGCTTTAACTGCCTTTTTAGAACTTTTTAAAATTTCGAGCCCACAAATCTATTG 2961 TATTAGTTGCCTTCTATAACAATAAATCTTCACTGAGCAAAAGGCAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | HEK293 |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
PAR-CLIP data was present in GSM545217. RNA binding protein: AGO2. Condition:miR-7 transfection
... - Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al., 2010, Cell. |
Article |
- Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al. - Cell, 2010
RNA transcripts are subject to posttranscriptional gene regulation involving hundreds of RNA-binding proteins (RBPs) and microRNA-containing ribonucleoprotein complexes (miRNPs) expressed in a cell-type dependent fashion. We developed a cell-based crosslinking approach to determine at high resolution and transcriptome-wide the binding sites of cellular RBPs and miRNPs. The crosslinked sites are revealed by thymidine to cytidine transitions in the cDNAs prepared from immunopurified RNPs of 4-thiouridine-treated cells. We determined the binding sites and regulatory consequences for several intensely studied RBPs and miRNPs, including PUM2, QKI, IGF2BP1-3, AGO/EIF2C1-4 and TNRC6A-C. Our study revealed that these factors bind thousands of sites containing defined sequence motifs and have distinct preferences for exonic versus intronic or coding versus untranslated transcript regions. The precise mapping of binding sites across the transcriptome will be critical to the interpretation of the rapidly emerging data on genetic variation between individuals and how these variations contribute to complex genetic diseases.
LinkOut: [PMID: 20371350]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM545217 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / miR-7 transfection |
Location of target site | ENST00000378700.3 | 3UTR | AUUCUCUUUUGUCUCUUCAUUUAUAACUGCUGUGAAUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 20371350 / GSE21578 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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113 hsa-miR-3123 Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT058369 | TBCEL | tubulin folding cofactor E like | 2 | 4 | ||||||||
MIRT059816 | EFNA1 | ephrin A1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT066850 | TMEM19 | transmembrane protein 19 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT071503 | CALM1 | calmodulin 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT073758 | NUBP1 | nucleotide binding protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT074324 | TNRC6A | trinucleotide repeat containing 6A | 2 | 10 | ||||||||
MIRT094805 | LMNB1 | lamin B1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT099173 | MAP3K4 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT099545 | ID4 | inhibitor of DNA binding 4, HLH protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT122643 | E2F3 | E2F transcription factor 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT180918 | RPRD2 | regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT192844 | BLOC1S6 | biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT224984 | BAG4 | BCL2 associated athanogene 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT246065 | NRAS | NRAS proto-oncogene, GTPase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT357085 | PRRC1 | proline rich coiled-coil 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT378170 | C5ORF51 | chromosome 5 open reading frame 51 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441636 | KDM5A | lysine demethylase 5A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441802 | BCAS1 | breast carcinoma amplified sequence 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443019 | C21orf91 | chromosome 21 open reading frame 91 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443445 | SERPINB4 | serpin family B member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443661 | SERPINB3 | serpin family B member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443776 | STS | steroid sulfatase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT444663 | TSPAN14 | tetraspanin 14 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT444924 | KIAA1522 | KIAA1522 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT445378 | FOXO1 | forkhead box O1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT447920 | PAIP2B | poly(A) binding protein interacting protein 2B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT449202 | PTPLAD2 | 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT449713 | TSPYL1 | TSPY like 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT450403 | TMEM47 | transmembrane protein 47 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT450787 | PAPOLG | poly(A) polymerase gamma | 2 | 2 | ||||||||
MIRT451381 | C19orf43 | telomerase RNA component interacting RNase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT452507 | WDR1 | WD repeat domain 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT453264 | PARP11 | poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT454642 | FAM83H | family with sequence similarity 83 member H | 2 | 2 | ||||||||
MIRT455513 | C6orf106 | chromosome 6 open reading frame 106 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT456709 | LDB1 | LIM domain binding 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT457231 | AP3D1 | adaptor related protein complex 3 delta 1 subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT459235 | MRPS21 | mitochondrial ribosomal protein S21 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT460553 | IFNAR1 | interferon alpha and beta receptor subunit 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT461424 | CTSL2 | cathepsin V | 2 | 3 | ||||||||
MIRT462869 | CYP51A1 | cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT467178 | SPTY2D1 | SPT2 chromatin protein domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT469233 | RHOBTB3 | Rho related BTB domain containing 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT474125 | LIPC | lipase C, hepatic type | 2 | 2 | ||||||||
MIRT475509 | HSP90B1 | heat shock protein 90 beta family member 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT478134 | DHX36 | DEAH-box helicase 36 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT481326 | ATP5A1 | ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, alpha subunit 1, cardiac muscle | 2 | 2 | ||||||||
MIRT482003 | AMOTL2 | angiomotin like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT482230 | AHCYL2 | adenosylhomocysteinase like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT483436 | RHOXF2B | Rhox homeobox family member 2B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT483824 | ZC3H12B | zinc finger CCCH-type containing 12B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT492051 | TNFSF9 | TNF superfamily member 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT494114 | DLX6 | distal-less homeobox 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT498882 | ZNF12 | zinc finger protein 12 | 2 | 10 | ||||||||
MIRT499674 | NPHP3 | nephrocystin 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT506932 | IGDCC4 | immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT509461 | ZNF587 | zinc finger protein 587 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT510048 | AKR1B10 | aldo-keto reductase family 1 member B10 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT514807 | NWD1 | NACHT and WD repeat domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT515217 | CRCP | CGRP receptor component | 2 | 2 | ||||||||
MIRT515486 | INCENP | inner centromere protein | 2 | 4 | ||||||||
MIRT517765 | ZNF366 | zinc finger protein 366 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT518216 | TRMT10B | tRNA methyltransferase 10B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT519602 | ZNF805 | zinc finger protein 805 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT523570 | GGCX | gamma-glutamyl carboxylase | 2 | 4 | ||||||||
MIRT525795 | SOD2 | superoxide dismutase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT533055 | ZBTB37 | zinc finger and BTB domain containing 37 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT534218 | SLC37A3 | solute carrier family 37 member 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT535633 | NR2E1 | nuclear receptor subfamily 2 group E member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT535863 | MRPL17 | mitochondrial ribosomal protein L17 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT536344 | LEFTY1 | left-right determination factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT537923 | DSTYK | dual serine/threonine and tyrosine protein kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT543114 | SKA2 | spindle and kinetochore associated complex subunit 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT544717 | ZNF529 | zinc finger protein 529 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT544847 | BASP1 | brain abundant membrane attached signal protein 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT545536 | ARF3 | ADP ribosylation factor 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT547124 | PHLPP2 | PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT548070 | GIGYF1 | GRB10 interacting GYF protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT548446 | EIF1AX | eukaryotic translation initiation factor 1A, X-linked | 2 | 2 | ||||||||
MIRT548626 | DAZAP1 | DAZ associated protein 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT550259 | FAM120AOS | family with sequence similarity 120A opposite strand | 2 | 2 | ||||||||
MIRT551940 | AKAP8 | A-kinase anchoring protein 8 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT552511 | ZIK1 | zinc finger protein interacting with K protein 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT554015 | SPIRE1 | spire type actin nucleation factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT556647 | KPNA2 | karyopherin subunit alpha 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT559744 | ACOX1 | acyl-CoA oxidase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT560393 | TMEM254 | transmembrane protein 254 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT562234 | HMGB2 | high mobility group box 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT563325 | ORC4 | origin recognition complex subunit 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT563697 | RPS26 | ribosomal protein S26 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT565066 | USP25 | ubiquitin specific peptidase 25 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT565349 | TMED2 | transmembrane p24 trafficking protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT565624 | SLC31A1 | solute carrier family 31 member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566379 | PNISR | PNN interacting serine and arginine rich protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT567575 | FEM1C | fem-1 homolog C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT569383 | DDX20 | DEAD-box helicase 20 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT570037 | FAM228A | family with sequence similarity 228 member A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT573269 | DCAF10 | DDB1 and CUL4 associated factor 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT573912 | PARP1 | poly(ADP-ribose) polymerase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT620034 | ST6GALNAC3 | ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT635606 | ZWILCH | zwilch kinetochore protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT644413 | FRMD6 | FERM domain containing 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT652528 | TM9SF4 | transmembrane 9 superfamily member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT656238 | MFSD6 | major facilitator superfamily domain containing 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT661373 | DYRK4 | dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT662530 | PNPLA4 | patatin like phospholipase domain containing 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT675551 | MALL | mal, T-cell differentiation protein like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT693650 | ACBD7 | acyl-CoA binding domain containing 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT696348 | SLC35D2 | solute carrier family 35 member D2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT705815 | AKNA | AT-hook transcription factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT707632 | TARDBP | TAR DNA binding protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT717902 | COPS8 | COP9 signalosome subunit 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT723626 | SOBP | sine oculis binding protein homolog | 2 | 2 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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