pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-2110 |
Genomic Coordinates | chr10: 114174105 - 114174179 |
Synonyms | hsa-mir-2110, MIR2110 |
Description | Homo sapiens miR-2110 stem-loop |
Comment | Zhu et al. incorrectly referred to this sequence as mir-1309 in . This sequence is unrelated to MIR1309 in plants. |
RNA Secondary Structure | |
Associated Diseases |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-2110 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 8| UUGGGGAAACGGCCGCUGAGUG |29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | 454 | DRVs in miRNA |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | SKI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SGS, SKV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | SKI proto-oncogene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_003036 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on SKI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of SKI (miRNA target sites are highlighted) |
>SKI|NM_003036|3'UTR 1 ATTCCGTGCCTGCCGCCGCAGCGCCGCCGACAACGCGGGTGCAGGGGGGCGCGGCTGGGCGGTGCAGCTCCGCCCGGCTC 81 CGCCCCTGCAGCCCACACAGCACAACGTCTTACCGTGCCTATTACCAAGCGAGTGTTTGTAACCATGTAGTTTTGGAACC 161 CACTGCAAAATTTTCTACTGGCCAAGTTCAAGTGAGTAAGCCGCGTCCCCCAACTACAGCTGGAGACGGGGCCAGCTCGG 241 CGGCCTGCTGGTCCTCTGCTTGCTGGAACATTCTAACATTTACACTTTTGTTATAAGCTATTTAAAACCAGTAAGGAGAC 321 TTGAAATTCAGAAAATCAACACATTTTTAAATGACTAACTTCTAAAAGCCCCAACACATGACGCCATCTGAAGACCCGCA 401 ACGGAGTGGGGGTGGCGGCCGCCCCACCCTCCCCACCCGGGGAAGCCATCACAGCTCATCTGCCCGCGGCTGCGTGAGGA 481 CAGCAGGGGTTTTTCTTCAGAGTCTATTTTTTCAGCGACAAGGACCCAGGTCTTCCTGCTGCTGCCAGGGAGAGCAGGGA 561 CAGTGCCGCGTGCGAGATGAGCTCGAACACTGCCCGCCTTACTGCCGCCTACCCCGCCCGCCACGCCGCCGTCGATGCCA 641 GCGCTGTCCCCACGGGTACCAGGAAGTGCAGAGCCGCACAGGAGCTGCCCCGGAGCTGAGGGGACGGTCTTCGGCTCCTC 721 TGCACCCCGTGATTCTGCCCACGCTCCTCCACCACGAGGCACTGACCTGCGTCGGGTGGTGACCGTGGCTGGCGGTCACG 801 CCCTCAGCCCCTCCGGGCACACGTGCCGCCTGACCGGGCGACCCTTTTCAGTTCGGCAAACGTCGCTCCCTTCATTTTGG 881 GACTGAGGCTGCAGCATTGGAACAAAAGAGCATTATTTCAATTTTTCTTTCTTTTTTTTTGTTCGTTCATTTAAACGTAT 961 ATTTAGAACTGCACTTTGTCCACAACCTTCCCTTCTCTTTCTATTCCCCAGTGAACTGAGGTTTTTACCGATTTATAGAG 1041 CAGTCAAATCCGAAGTGCTCGAGTGCTTAGAAACCCCCTCTGGTGCTTGGTTGAACAAGGGAATCACAAGAAAACGAAAA 1121 TGCAAAAACTGAACTTCGGGGGTCGTTCTGTGCCTTCCAGCATCTTGTACAGCAAATCCTGACTCGTGTCTTTTTACCCC 1201 CAAGATATCTGTCTTCAGTAGCGACTGAATCTGCCACTCTCAGAATAAGTTCCTTGCATTTATTCCAAATAATCTCGTTT 1281 ACTCTCACCTGTTTATGCAAATTGTATAAGGTTTCTTATGCCCAAGCTTGAAAAATGATTTCCCAGTAGACAAGAGGCGG 1361 CTACCTATCCTACAGTTACGGTATTTATTTACATAAGAAGATCTTACAGGAGTTCTTTGCTTGAATCCGTTCTAACACCC 1441 GCGGCAGCTGCACGCGCTCACAGAAGGTGGAGGTTACTTGCCCAGGTACAGACGACCTCGGGGCAGTGACGAGCAAAGAC 1521 CAGAGACTGCTGAGCCCTCGCATCTGGGTGGCGGAATTGCCTGCGGGGTTTTGCCCTTGGTTTACTGAGGGGGGTCTTGG 1601 TTGCTGCTGAAGCCCCCCACCCCTTCTAAAGTGCAATGCAAAAGGGACATCATGTATATGCAGCGTTTGTTTGGAATTTT 1681 CTTTGCTTTTGTTTTCTTTGCGGTTGTTCTGTGTGCATGGATTCCACACCTCTGCCGTAGGTAGATCCGTCAGCGGGCAT 1761 TATTACCGTGTCTTGTAAAGGGTCGGTTTTGTTATGCAACATGCAGAATGCTGTTTTTAGCCTTGTTTTACCAGAGTTGT 1841 TTTTTTTTTCAGTTATTTCTTCAAGGGAAACTAAATGATTTAGTTGGAGCAAAGCTTTAAGTGTGTTGGCGTGCTTCTGT 1921 GTGGCTGTCCTGTGTCGCCAGGTCGAAGATCACAGTGAGGTAGAGGCCCTGCCCCATCCCCAGGGCCGCCAGGCTTGCTC 2001 CGTTTGCTTTGAGTTTTTAGACCCCAGAGGGAGATGAGCTTTTCCAAGCTGTGTCTGGGCCAGAGCCTCTCCTTGCCCTT 2081 GCTCCATCCCGACGGTCACCGTTGGGTCCACGCCTCCACCGCCCCATCTTGCCCCAAACGGAAAGCGCTGTATCTGCAGT 2161 GGCAGCCCTTCCCCACTTCGGCTCTGGGAGGGTCCAGCCAGTGTCACCTGGGCCCACCCTTTCCTGCAGCTGCCAGGCCC 2241 GTGCGGTCAGTGGGACCCGGACGTGGGCAGGCGAGCTCGGGACCCTCCCAGGCAGTTCCCACAGCTCTTGCCTCGGCTCA 2321 CCAGGGTCACTTCCACTGTCAGGGGCCTGAGGGGGCAGCTGTGGCTGCAGGGCTGCTCTGGACTGAGGGGTCCCAGGCCC 2401 CGAGGGGTGCACGCCTGGCTCCCCTTGGCACAGGTGCGAGTCCGTTTCTTTTCAGCAGAAGGGGGAAGAGGTGTCCGCTG 2481 TGTGGGCTGCTGACTCCTCTGTGTGTGAGGCCCTTCATCTAAGTGATTGTGTATTCAGTTTAATTCTCATTATATTTCTA 2561 TACTGAAAGAAGATTTTTAACGAAGGGAAAAACAACAGCAATAACATTCATATCTCTGGAGCAGCTAACTCATACACGTA 2641 ATGTCTGCTTTTCGTACAGAACTAGCCAATGTAAAAACAGTTCACCTGTAAATACTTTTTCCTTTTTCACCGTTGTATTA 2721 TACATGTATATGCTGGGTCCTTTTTCAGAAACTCTTTTCTTACCTGAGAGTTGTCTTGTTTTCTGGGCTGTTTTTAACTG 2801 AGGAAAAAAAAAATGCTTTCCTGCCGGGGGGCAGGGGAGACGGAGAAACCCATGTGCGTTTCCCATGTGACCCCCTCCTC 2881 CCTGTGGGTCTGAGCCCCGGCCCCCCCCACCTCCTCCTCCCTGTGGGTCCGAACCCCGGCCCCCCCACCCCCTCCTCCCT 2961 GTGGGTCCGAACCCCGGCCCCCCCACCCCCTCCTCCCTGTGGGTCCGATCCCCGGCCCCCCCCACCCCCTCCTCCCTGTG 3041 GGTCCGAACCCCGGCCCCCCCCCCACCCCCTCCTCCCTGTGGGTCCGAACCCCGGCCCCCCCACCCCTCCCTCAGCCCAC 3121 CAGGGTCCAGGGAGATGTTCGTTCTCGCTTTAAGTCAGGAGTCACAAATGACTTTTTTTTTTCAATTAAGGAAAAAGCTC 3201 CATCTCTACCTTTAACATCACCCAGACCCCCGCCCCTGCCCGTGCCCCACGCTGCTGCTAACGACAGTATGATGCTTACT 3281 CTGCTACTCGGAAACTATTTTTATGTAATTAATGTATGCTTTCTTGTTTATAAATGCCTGATTTAAAAAGAAAAGAGCTT 3361 GGCATATTTATCTATTTCGCTGTGTACCTGTTAGTCCTTCCCCGACCCCGAAACAGATGACATTGTACAATAAAGGACTT 3441 TGAGAGGA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | HEK293 |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
PAR-CLIP data was present in GSM545216. RNA binding protein: AGO2. Condition:miR-124 transfection
... - Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al., 2010, Cell. |
Article |
- Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al. - Cell, 2010
RNA transcripts are subject to posttranscriptional gene regulation involving hundreds of RNA-binding proteins (RBPs) and microRNA-containing ribonucleoprotein complexes (miRNPs) expressed in a cell-type dependent fashion. We developed a cell-based crosslinking approach to determine at high resolution and transcriptome-wide the binding sites of cellular RBPs and miRNPs. The crosslinked sites are revealed by thymidine to cytidine transitions in the cDNAs prepared from immunopurified RNPs of 4-thiouridine-treated cells. We determined the binding sites and regulatory consequences for several intensely studied RBPs and miRNPs, including PUM2, QKI, IGF2BP1-3, AGO/EIF2C1-4 and TNRC6A-C. Our study revealed that these factors bind thousands of sites containing defined sequence motifs and have distinct preferences for exonic versus intronic or coding versus untranslated transcript regions. The precise mapping of binding sites across the transcriptome will be critical to the interpretation of the rapidly emerging data on genetic variation between individuals and how these variations contribute to complex genetic diseases.
LinkOut: [PMID: 20371350]
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Experimental Support 2 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | HEK293 | ||||||
Disease | 6497.0 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
"PAR-CLIP data was present in GSM714645. RNA binding protein: AGO2. Condition:completeT1
... - Kishore S; Jaskiewicz L; Burger L; Hausser et al., 2011, Nature methods. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Kishore S; Jaskiewicz L; Burger L; Hausser et al. - Nature methods, 2011
Cross-linking and immunoprecipitation (CLIP) is increasingly used to map transcriptome-wide binding sites of RNA-binding proteins. We developed a method for CLIP data analysis, and applied it to compare CLIP with photoactivatable ribonucleoside-enhanced CLIP (PAR-CLIP) and to uncover how differences in cross-linking and ribonuclease digestion affect the identified sites. We found only small differences in accuracies of these methods in identifying binding sites of HuR, which binds low-complexity sequences, and Argonaute 2, which has a complex binding specificity. We found that cross-link-induced mutations led to single-nucleotide resolution for both PAR-CLIP and CLIP. Our results confirm the expectation from original CLIP publications that RNA-binding proteins do not protect their binding sites sufficiently under the denaturing conditions used during the CLIP procedure, and we show that extensive digestion with sequence-specific RNases strongly biases the recovered binding sites. This bias can be substantially reduced by milder nuclease digestion conditions.
LinkOut: [PMID: 21572407]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM4903838 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Dermal fibroblasts / 124_TD_21_c |
Location of target site | NM_003036 | 3UTR | CGCCUCCACCGCCCCAUCUUGCCCCAAACGGAAAGCGCUGUAUCUGCAGUGGCAGCCCUUCCCCACUUCGGCUCUGGGAGGGUCCAGCCA |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161239 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM545216 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / miR-124 transfection |
Location of target site | ENST00000378536.4 | 3UTR | CCACAACCUUCCCUUCUCUUUCUAUUCCCCAGUGAACUGAGGUUUUUACCGAUUUAUAGAGCAGUCAAAUCC |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 20371350 / GSE21578 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 3 for dataset GSM714645 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / completeT1, repB |
Location of target site | ENST00000378536.4 | 3UTR | UCCACAACCUUCCCUUCUCUUUCUAUUCCCCAG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 21572407 / GSE28865 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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96 hsa-miR-2110 Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT035757 | BRD4 | bromodomain containing 4 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT035758 | NCOR2 | nuclear receptor corepressor 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT035759 | FASN | fatty acid synthase | 1 | 1 | ||||||||
MIRT035760 | C10orf118 | coiled-coil domain containing 186 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT055403 | SHOC2 | SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein | 2 | 6 | ||||||||
MIRT066205 | MARCH9 | membrane associated ring-CH-type finger 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT079365 | CCDC137 | coiled-coil domain containing 137 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT081180 | MIDN | midnolin | 2 | 4 | ||||||||
MIRT082397 | HNRNPUL1 | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U like 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT089000 | BCL11A | B-cell CLL/lymphoma 11A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT133706 | SKI | SKI proto-oncogene | 2 | 4 | ||||||||
MIRT160053 | TET3 | tet methylcytosine dioxygenase 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT180853 | RPRD2 | regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT263243 | SGPL1 | sphingosine-1-phosphate lyase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT285532 | CDT1 | chromatin licensing and DNA replication factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT317152 | E2F3 | E2F transcription factor 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT321166 | EIF4H | eukaryotic translation initiation factor 4H | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441482 | NCEH1 | neutral cholesterol ester hydrolase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443884 | CNKSR3 | CNKSR family member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT445877 | WBP1L | WW domain binding protein 1 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT446195 | GTPBP4 | GTP binding protein 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT449308 | MRO | maestro | 2 | 2 | ||||||||
MIRT450301 | DRAXIN | dorsal inhibitory axon guidance protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT450512 | EMX1 | empty spiracles homeobox 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT451534 | CIAPIN1 | cytokine induced apoptosis inhibitor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT451820 | ALDH3B1 | aldehyde dehydrogenase 3 family member B1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT452239 | TRAM1 | translocation associated membrane protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT454207 | HLA-A | major histocompatibility complex, class I, A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT455447 | EPB41L4B | erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT456496 | PFKFB2 | 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT457656 | SERINC1 | serine incorporator 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT459819 | TPP1 | tripeptidyl peptidase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT460556 | FEM1A | fem-1 homolog A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT462561 | STS | steroid sulfatase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT462986 | ZNF740 | zinc finger protein 740 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT464671 | UBE2V1 | ubiquitin conjugating enzyme E2 V1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT465432 | TP53 | tumor protein p53 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT465934 | TMEM189-UBE2V1 | TMEM189-UBE2V1 readthrough | 2 | 2 | ||||||||
MIRT466015 | TMEM189 | transmembrane protein 189 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT468122 | SH3PXD2A | SH3 and PX domains 2A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT469652 | RAC1 | Rac family small GTPase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT469980 | PTPN14 | protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 14 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT473531 | MAX | MYC associated factor X | 2 | 2 | ||||||||
MIRT473596 | MARK2 | microtubule affinity regulating kinase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT473652 | MARCKSL1 | MARCKS like 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT474219 | LCOR | ligand dependent nuclear receptor corepressor | 2 | 4 | ||||||||
MIRT474771 | KIAA0895L | KIAA0895 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT479312 | VPS72 | vacuolar protein sorting 72 homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT481121 | AZIN1 | antizyme inhibitor 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT481682 | AR | androgen receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT482381 | AEN | apoptosis enhancing nuclease | 2 | 2 | ||||||||
MIRT483833 | UNC5B | unc-5 netrin receptor B | 2 | 4 | ||||||||
MIRT484693 | RNF11 | ring finger protein 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT485238 | POGZ | pogo transposable element derived with ZNF domain | 2 | 2 | ||||||||
MIRT488748 | FXYD1 | FXYD domain containing ion transport regulator 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT489147 | MRPL12 | mitochondrial ribosomal protein L12 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT489518 | MRE11A | MRE11 homolog, double strand break repair nuclease | 2 | 8 | ||||||||
MIRT498908 | SRCAP | Snf2 related CREBBP activator protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT506426 | NAGK | N-acetylglucosamine kinase | 2 | 6 | ||||||||
MIRT506640 | MAPK1 | mitogen-activated protein kinase 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT507332 | FAM168A | family with sequence similarity 168 member A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT513099 | DYNAP | dynactin associated protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT513514 | YIPF4 | Yip1 domain family member 4 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT521800 | POM121C | POM121 transmembrane nucleoporin C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT525078 | FRK | fyn related Src family tyrosine kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT530927 | SCIN | scinderin | 2 | 2 | ||||||||
MIRT533498 | TRIM71 | tripartite motif containing 71 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT536787 | HNRNPD | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D | 2 | 2 | ||||||||
MIRT544554 | CSNK2A1 | casein kinase 2 alpha 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT552977 | VAT1 | vesicle amine transport 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT557358 | HAND1 | heart and neural crest derivatives expressed 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT560401 | TMEM69 | transmembrane protein 69 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT565498 | SP1 | Sp1 transcription factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT568962 | CACNA1C | calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT569031 | IL21R | interleukin 21 receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT573224 | TRIM21 | tripartite motif containing 21 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT574312 | ZNF703 | zinc finger protein 703 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT620395 | MYO1H | myosin IH | 2 | 2 | ||||||||
MIRT620936 | OSMR | oncostatin M receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT638166 | TMED4 | transmembrane p24 trafficking protein 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT647743 | SAMD9L | sterile alpha motif domain containing 9 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT649991 | MSI1 | musashi RNA binding protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT669203 | CBX8 | chromobox 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT684546 | ZNF708 | zinc finger protein 708 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT685837 | ANGEL1 | angel homolog 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT688547 | DCAF16 | DDB1 and CUL4 associated factor 16 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT693252 | HBS1L | HBS1 like translational GTPase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT701970 | MIER3 | MIER family member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT706385 | MC2R | melanocortin 2 receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT707484 | UGT2B4 | UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT711882 | INSIG2 | insulin induced gene 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT716906 | CACNB2 | calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT717638 | HLX | H2.0 like homeobox | 2 | 2 | ||||||||
MIRT719058 | ZNF281 | zinc finger protein 281 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT723754 | NKIRAS2 | NFKB inhibitor interacting Ras like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT725479 | GPR26 | G protein-coupled receptor 26 | 2 | 2 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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