pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-527 |
Genomic Coordinates | chr19: 53754018 - 53754102 |
Synonyms | MIRN527, hsa-mir-527, MIR527 |
Description | Homo sapiens miR-527 stem-loop |
Comment | miR-527 cloned in has a 1 nt 3' extension (A), which is incompatible with the genome sequence. |
RNA Secondary Structure | |
Associated Diseases |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 14| CUGCAAAGGGAAGCCCUUUC |33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | Array-cloned | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression Profile | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | ANKRD50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | ankyrin repeat domain 50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_020337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_001167882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on ANKRD50 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of ANKRD50 (miRNA target sites are highlighted) |
>ANKRD50|NM_020337|3'UTR 1 AAGTTTCCTATTCTGTGAAACAGAAGACATTGTGATGGAGTGGTTCTTCAGCTACTGGATGGAAACATATGCCTGTTGAT 81 TTGCTGAAAAAACAAAAAAAATGAAGAATGTGATCTCTGCAGTACAGTTACCTTAATTACTGTAATGTGCCTAAATAGTA 161 AGGCTGCCTTCTCAATGTAACCCTCTGTGCTTAAAAAATTTCATTTTGTGTGCTTTGTATTCACTACACAGGAATAAGCA 241 CTTTTTAAAAATGCAGATACATACTGCAGTTCCCTGATAAAAGCTGAAAAGAAAATTTGAGTATTTTAAGTTAAGATGTG 321 ATAAAAAATGTGCATGTGCCATAATCAAATATATATGAAAAGGCAGTGTTCCTTGTATTTATTTTTTTTTCTTTTTGTGG 401 CAAAAGAAACTTAAACATACTGTTTCAGTCACATTGCATTGTAGTGTATGGCCTGTTTCTTGTATCTTTAAAGACGTTGC 481 TCAATAAAACAAATCTTGCAACTGTTCTATGTTCACTACACCTTCAGCATTGGATAAAAATCATTTTCTATATAAATATC 561 ACATTGAAATGAAAAAATGATTTCTTGGCAGTTTAAAAAAAATATTTTATAGTAGTTTAGGGAGCTGCTTTAAGTAGTTT 641 AAATCTGGATTTTCCCAGTAGAATTCTTCTCATCTCTGGCTAAACATGTCAGAACAAACAACCAACCAGTCTGTAGGCAG 721 AACAAAGTCCTATTTCATCCGCTGGGATACAATTTCATCTTCCATTCACTTTGTCATTCCACCTCTAAGAAGACAGACTA 801 TCATTCCTGAGGCATGAAAATTCTCAGGGACAAAGCCATGCCTCAGTCACATGTGTGTGCAGAGAGAAATGCACCTGTCT 881 ATCTAAGGGTAGATTTTTGATCCCTGAATAATTCATTGACTAAACTGACCTCTTCCTCCTGGCTAAATAAATTAATTTTG 961 CTGGCTTCTCTCTCAGCGGTTTCTATTTTGTAAATTGCTGCATGACCAAAATAGCCCCACTCAAAATCAATTGGATTAAT 1041 TTTAATGGTTTGGTTGGATGAATATTCTGGATGAATATAAAATGTGCTGCCCTTCACAGATGACACCACTCCCCTGTCAA 1121 TCATAGCACATGTGTACTTTTTATTGTTACTTAATAGTGATGGATTTGCACTTTTCTATCCTCATACTCTTTCCTGTTTT 1201 CTTCTTTGTACAATTGCATGCAGGAGGGCTGGATGCCAGGGTTAAGAGAGAAATTCATGACAAGGAAGGTAAAATTGGTT 1281 CAAATGAGCATGTGTCCCACAGCCTTAGTCTCCTTACTCTTAAATCAGTGGAGCTGTAGCTTAGATGGGTCGTTTATATG 1361 TCTGGAAAAGTTGTCATAACAGTTTAGAAGCCAAGGTTGTGGATTTGATCTTAGAATGGGCCTGTTAATCTTATAGAACC 1441 CAGAAATTCTGTTCTTTTCATGTACTGTTGATGAGGAATGAGGAAAGAGAATTTGGAGATTCAGCACAAAACCATTGCTA 1521 CTTCTAGAACAAAATCTTTAGAATATGTCCTAATAACAAAGGTCAGTAATGTCATCTTCATATATGAAGGACACATGTGA 1601 TACATTGTTCGTGGAAATAGAAATGTATAATTATGATAAATGTTTCACTTGAATCTTATTGTAAGGCTTTTCTTGCTTTT 1681 ATTTTTTAAAGTCAGCAAAACTCATTTTGTCTGTCATCTATAAGTCATAGTGAGGACTACGAGATAAGTTGATAAGTTCA 1761 ATTGATATTAAGGTGACATGGCAATATTAATAACTCAAATGTGAATGTTTCAAGTATTGAATTCTTGTCCCTATGGGACA 1841 TTTATTAAATAAAATTAATGGGACTCTTGCAAAGTAGCCTTAAAAGTGTTAATGAGTCTATTAATAAATATGAACACATA 1921 CTATTATTAGAACCAACTTTACTCATATCTCAAATACAGTACATTTACATTACTGTAGAGGATGAAGCTCTAATTTCTAT 2001 TACATGTAATTTTCTTTAGAAAGAGAACCCTGAAAGCTGCCAGTTTTTCTATTAACTTTGAATTATTGAAATTGTATTTA 2081 TTTAATTTTATTGTTTTTACAAAATTGCACCTTGTGTCCAAAGGGCGAAGATATGACATTGCATAAGGGATTTATGTTTT 2161 TCAAAGAGCTAACTGTTTTCATATCCATACTATATACACTTGAAGCAATTGGTAGGAAGAGAACCTATTGGAAAAATACG 2241 ATTTTCAAAAGTAAGTATTCCTCGGGATGTTTTTATATAAATTATGTTTTGGAATAGAACATAAATGACTTTGAGTTAGG 2321 ATAAGGATGATAGGATGGGTGCTGGAGATGCCCTGCCTTGCTTATTTGTTTCTGTGGGGGATTTAATACTATAAATGAAA 2401 ATGGCTTCTGCTCCATTAAAAAGTAAAAATTGTCCTCCAAATATAAAACTCCTTAATAGATATTTTTGAAATTAAAATCT 2481 TTAAATTTTATAAATCAGCTGTTGCCACTACACAACTATGATGGCATGTGCTTATAACATTTTTATAACATTCCGTCTGT 2561 GTCTATTCCCTAAATATCATGAGTTTATAATAAGGAAAGTGATAAAAATACAGTAATGAAATAAAAATCTGAATGTTTCT 2641 AAGAAAGGTTTTGGAAGGAAAAATGACCTGAAATCAGTGCGTACTGCAAAGTACAGCCAATAATTTTTGTTCTTTGTTTT 2721 CACCCCCACCCTCACTGGAATTCTCACCAAAAATAGTTTGATACTTAAAAAACAGAAGTAAATACTTTTCTCAATATTGT 2801 TTTGGCTATGCAAATATTTGTTTTGCTTAATGTCCTCCATTTACACTTCTCAGCAAATGTAGTTGCAAACAAATGCTTTC 2881 TTTTTATTTTTCCCTTGGTTTGAGGTATGTAAATAGCCAAAAATGTACATTGAATTTCACATTGTAAAAGTTTTATTTTA 2961 TCCCTTGTATGATATTACTCAAAAAATCCCTGTGTATATGAAAGTGCATAATAAATATATTTGCTTTACAGAGAAGATCT 3041 TGTTTTAATTTTGTCCTTGAACCAGTAGAACATGCATGATATGCATATAGCATAAACAACTGTTAGTTGTTTTAAGTTAT 3121 TATCTTAAATAAATCCTGAGCAAATGAATTTGGAAACATTTTGCAAAGAAGAAAGTGAAATATAACACTGTCCAAAGGAA 3201 GGTAGAAAAACAAAGATTTACTGTTTATGTCTTCCTAAGCCTTTTTAAAGACTTAATGTTCTTTTCCCCCCCGTGACTGA 3281 TTATATACTATATCACACCATGTCAGGTTTTGTGCCTCTGAGAATTGCAGTAATCCAATAACTTTTGTATATGTGTGCTC 3361 CTTGATCATCAGAATATTATGGCCATCTTATGGCGGATATTTTGGGAGTTTATTGCAAACATGGTCATTCATTTTCTAAA 3441 TAAAATTTGTGTGTTTCTTCACTCAGTAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | hESCs (WA-09) | ||||||
Disease | 57182.0 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
"PAR-CLIP data was present in SRR359787. RNA binding protein: AGO2. Condition:4-thiouridine
... - Lipchina I; Elkabetz Y; Hafner M; Sheridan et al., 2011, Genes & development. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Lipchina I; Elkabetz Y; Hafner M; Sheridan et al. - Genes & development, 2011
MicroRNAs are important regulators in many cellular processes, including stem cell self-renewal. Recent studies demonstrated their function as pluripotency factors with the capacity for somatic cell reprogramming. However, their role in human embryonic stem (ES) cells (hESCs) remains poorly understood, partially due to the lack of genome-wide strategies to identify their targets. Here, we performed comprehensive microRNA profiling in hESCs and in purified neural and mesenchymal derivatives. Using a combination of AGO cross-linking and microRNA perturbation experiments, together with computational prediction, we identified the targets of the miR-302/367 cluster, the most abundant microRNAs in hESCs. Functional studies identified novel roles of miR-302/367 in maintaining pluripotency and regulating hESC differentiation. We show that in addition to its role in TGF-beta signaling, miR-302/367 promotes bone morphogenetic protein (BMP) signaling by targeting BMP inhibitors TOB2, DAZAP2, and SLAIN1. This study broadens our understanding of microRNA function in hESCs and is a valuable resource for future studies in this area.
LinkOut: [PMID: 22012620]
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CLIP-seq Support 1 for dataset SRR359787 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | hESCs (WA-09) / 4-thiouridine, RNase T1 |
Location of target site | ENST00000504087.1 | 3UTR | CAAAUGAAUUUGGAAACAUUUUGCAAAGAAGAAAGU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 22012620 / SRX103431 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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147 hsa-miR-527 Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT060824 | CEP350 | centrosomal protein 350 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT072483 | RAB8B | RAB8B, member RAS oncogene family | 2 | 2 | ||||||||
MIRT076139 | WDR81 | WD repeat domain 81 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT076234 | SMCR8 | Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 8 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT082393 | HNRNPUL1 | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U like 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT090337 | SEC61A1 | Sec61 translocon alpha 1 subunit | 2 | 8 | ||||||||
MIRT091944 | ZBTB47 | zinc finger and BTB domain containing 47 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT092026 | ABHD5 | abhydrolase domain containing 5 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT095382 | UBE2D2 | ubiquitin conjugating enzyme E2 D2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT142425 | TNRC6A | trinucleotide repeat containing 6A | 2 | 6 | ||||||||
MIRT149879 | LDLR | low density lipoprotein receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT168657 | MAPK14 | mitogen-activated protein kinase 14 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT178932 | C11ORF57 | chromosome 11 open reading frame 57 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT179071 | PAFAH1B2 | platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT193029 | TMOD3 | tropomodulin 3 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT195759 | ATMIN | ATM interactor | 2 | 6 | ||||||||
MIRT210002 | LIMD1 | LIM domains containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT211286 | ANKRD50 | ankyrin repeat domain 50 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT217609 | NUS1 | NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT230981 | PRRG4 | proline rich and Gla domain 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT248251 | SP1 | Sp1 transcription factor | 5 | 2 | ||||||||
MIRT249363 | BCL2L2-PABPN1 | BCL2L2-PABPN1 readthrough | 2 | 2 | ||||||||
MIRT257800 | CDC5L | cell division cycle 5 like | 2 | 4 | ||||||||
MIRT267985 | UCK2 | uridine-cytidine kinase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT301222 | SH3BP4 | SH3 domain binding protein 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT312574 | G3BP1 | G3BP stress granule assembly factor 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT315533 | MARCKS | myristoylated alanine rich protein kinase C substrate | 2 | 2 | ||||||||
MIRT343049 | ABHD2 | abhydrolase domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442634 | TBC1D12 | TBC1 domain family member 12 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443424 | MAPT | microtubule associated protein tau | 2 | 2 | ||||||||
MIRT444152 | ZNF701 | zinc finger protein 701 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT444500 | ZNF525 | zinc finger protein 525 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT445202 | CRYBG3 | crystallin beta-gamma domain containing 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT447063 | MCC | mutated in colorectal cancers | 2 | 4 | ||||||||
MIRT448125 | CCDC80 | coiled-coil domain containing 80 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT460407 | TNFRSF10B | TNF receptor superfamily member 10b | 2 | 4 | ||||||||
MIRT462940 | ZNF800 | zinc finger protein 800 | 2 | 12 | ||||||||
MIRT463575 | ZBTB38 | zinc finger and BTB domain containing 38 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT466373 | TGOLN2 | trans-golgi network protein 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT469270 | RHOB | ras homolog family member B | 2 | 8 | ||||||||
MIRT469300 | RGS16 | regulator of G protein signaling 16 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT469803 | RAB14 | RAB14, member RAS oncogene family | 2 | 2 | ||||||||
MIRT470062 | PTGES2 | prostaglandin E synthase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT470993 | PITPNA | phosphatidylinositol transfer protein alpha | 2 | 2 | ||||||||
MIRT474950 | KCTD10 | potassium channel tetramerization domain containing 10 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT475188 | IMPDH1P11 | inosine monophosphate dehydrogenase 1 pseudogene 11 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT475863 | H3F3C | H3 histone family member 3C | 2 | 10 | ||||||||
MIRT475897 | H3F3B | H3 histone family member 3B | 2 | 8 | ||||||||
MIRT481939 | ANKRD11 | ankyrin repeat domain 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT485555 | FOXQ1 | forkhead box Q1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT491003 | ATF7IP | activating transcription factor 7 interacting protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT492191 | SOCS1 | suppressor of cytokine signaling 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT493271 | LPP | LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma | 2 | 2 | ||||||||
MIRT495272 | NICN1 | nicolin 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT495674 | PRKD3 | protein kinase D3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT497540 | PPTC7 | PTC7 protein phosphatase homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT500397 | ZMAT3 | zinc finger matrin-type 3 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT500483 | ZBTB4 | zinc finger and BTB domain containing 4 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT500585 | UQCRFS1 | ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT500634 | TUBB2A | tubulin beta 2A class IIa | 2 | 8 | ||||||||
MIRT501640 | PHLDA3 | pleckstrin homology like domain family A member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT501768 | NRBF2 | nuclear receptor binding factor 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT503665 | SLC46A1 | solute carrier family 46 member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT504321 | ASGR2 | asialoglycoprotein receptor 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT505176 | VMA21 | VMA21, vacuolar ATPase assembly factor | 2 | 4 | ||||||||
MIRT506340 | NUP54 | nucleoporin 54 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT506434 | NACC2 | NACC family member 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT506666 | LZIC | leucine zipper and CTNNBIP1 domain containing | 2 | 4 | ||||||||
MIRT510973 | PFN2 | profilin 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT511141 | MRPL17 | mitochondrial ribosomal protein L17 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT512600 | EFCAB1 | EF-hand calcium binding domain 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT521036 | SLC30A4 | solute carrier family 30 member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT525735 | SOD2 | superoxide dismutase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT526750 | GAS7 | growth arrest specific 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT526902 | ZNF772 | zinc finger protein 772 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT527345 | FAM69C | family with sequence similarity 69 member C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT531900 | GLP2R | glucagon like peptide 2 receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT532366 | LINC00598 | long intergenic non-protein coding RNA 598 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT534252 | SLC12A7 | solute carrier family 12 member 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT534743 | RAVER2 | ribonucleoprotein, PTB binding 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT535340 | PFN1 | profilin 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT535971 | MESDC1 | talin rod domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT536507 | KCTD15 | potassium channel tetramerization domain containing 15 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT536884 | HIC2 | HIC ZBTB transcriptional repressor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT537038 | GRAMD4 | GRAM domain containing 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT537424 | FBXL7 | F-box and leucine rich repeat protein 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT544577 | AP5Z1 | adaptor related protein complex 5 zeta 1 subunit | 2 | 4 | ||||||||
MIRT546422 | SNX5 | sorting nexin 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT546753 | RLIM | ring finger protein, LIM domain interacting | 2 | 2 | ||||||||
MIRT547984 | HCFC2 | host cell factor C2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT548407 | ENPP5 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (putative) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT549444 | ACSL4 | acyl-CoA synthetase long chain family member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT549670 | ZNF598 | zinc finger protein 598 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT550525 | MYZAP | myocardial zonula adherens protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT551213 | CIDEC | cell death inducing DFFA like effector c | 2 | 2 | ||||||||
MIRT552306 | ZXDA | zinc finger, X-linked, duplicated A | 2 | 4 | ||||||||
MIRT552429 | ZNF460 | zinc finger protein 460 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT553197 | UBE2A | ubiquitin conjugating enzyme E2 A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT553336 | TRPC3 | transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT554806 | REL | REL proto-oncogene, NF-kB subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT555179 | PRUNE2 | prune homolog 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT556150 | MECP2 | methyl-CpG binding protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT557862 | FGFR1OP | FGFR1 oncogene partner | 2 | 2 | ||||||||
MIRT562084 | KIAA0895 | KIAA0895 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT563331 | RPLP0 | ribosomal protein lateral stalk subunit P0 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT565308 | TMEM41A | transmembrane protein 41A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566134 | RACGAP1 | Rac GTPase activating protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT567023 | KLHL15 | kelch like family member 15 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT567241 | HSPA13 | heat shock protein family A (Hsp70) member 13 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT568559 | AKAP10 | A-kinase anchoring protein 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT570682 | FZD5 | frizzled class receptor 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT572220 | BTN3A3 | butyrophilin subfamily 3 member A3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT573304 | AKR7A2 | aldo-keto reductase family 7 member A2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT575741 | Zfp618 | zinc finger protein 618 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT613460 | B3GNT6 | UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT614733 | STAT5A | signal transducer and activator of transcription 5A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT615117 | BCL11B | B-cell CLL/lymphoma 11B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT623237 | MLLT6 | MLLT6, PHD finger containing | 2 | 2 | ||||||||
MIRT623486 | KCTD11 | potassium channel tetramerization domain containing 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT623989 | FAM104A | family with sequence similarity 104 member A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT624010 | EPHB1 | EPH receptor B1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT626277 | PEX26 | peroxisomal biogenesis factor 26 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT631415 | CRLS1 | cardiolipin synthase 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT641134 | ZBTB33 | zinc finger and BTB domain containing 33 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT647829 | RAB23 | RAB23, member RAS oncogene family | 2 | 2 | ||||||||
MIRT649063 | HSD17B12 | hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT650283 | PYCARD | PYD and CARD domain containing | 2 | 2 | ||||||||
MIRT651511 | WNT4 | Wnt family member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT651851 | UNC5D | unc-5 netrin receptor D | 2 | 2 | ||||||||
MIRT652214 | TRIM33 | tripartite motif containing 33 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT654703 | PRRC2B | proline rich coiled-coil 2B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT656792 | KNTC1 | kinetochore associated 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT656925 | KIAA1462 | junctional cadherin 5 associated | 2 | 2 | ||||||||
MIRT659157 | DCTN5 | dynactin subunit 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT663085 | METTL10 | EEF1A lysine methyltransferase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT676043 | AUTS8 | Autism, susceptibility to, 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT680128 | ADRBK2 | G protein-coupled receptor kinase 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT689530 | KIAA0513 | KIAA0513 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT691473 | FOXRED2 | FAD dependent oxidoreductase domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT692504 | SPIN4 | spindlin family member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT702404 | KITLG | KIT ligand | 2 | 2 | ||||||||
MIRT704531 | CNEP1R1 | CTD nuclear envelope phosphatase 1 regulatory subunit 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT714230 | ARMC10 | armadillo repeat containing 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT718760 | HOOK3 | hook microtubule tethering protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT725421 | HNRNPA3 | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT732824 | PCNA | proliferating cell nuclear antigen | 3 | 0 | ||||||||
MIRT734767 | GPC3 | glypican 3 | 2 | 0 |