Gene Symbol |
IL6ST
|
Synonyms |
CD130, CDW130, GP130, IL-6RB |
Description |
interleukin 6 signal transducer |
Transcript |
NM_175767
|
Other Transcripts |
NM_002184
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on IL6ST |
|
3'UTR of IL6ST (miRNA target sites are highlighted) |
>IL6ST|NM_175767|3'UTR
1 AGCCAATGGAAAAATCTTGGATTATGAAGTGACTCTCACAAGATGGAAATCACATTTACAAAATTACACAGTTAATGCCA
81 CAAAACTGACAGTAAATCTCACAAATGATCGCTATCTAGCAACCCTAACAGTAAGAAATCTTGTTGGCAAATCAGATGCA
161 GCTGTTTTAACTATCCCTGCCTGTGACTTTCAAGCTACTCACCCTGTAATGGATCTTAAAGCATTCCCCAAAGATAACAT
241 GCTTTGGGTGGAATGGACTACTCCAAGGGAATCTGTAAAGAAATATATACTTGAGTGGTGTGTGTTATCAGATAAAGCAC
321 CCTGTATCACAGACTGGCAACAAGAAGATGGTACCGTGCATCGCACCTATTTAAGAGGGAACTTAGCAGAGAGCAAATGC
401 TATTTGATAACAGTTACTCCAGTATATGCTGATGGACCAGGAAGCCCTGAATCCATAAAGGCATACCTTAAACAAGCTCC
481 ACCTTCCAAAGGACCTACTGTTCGGACAAAAAAAGTAGGGAAAAACGAAGCTGTCTTAGAGTGGGACCAACTTCCTGTTG
561 ATGTTCAGAATGGATTTATCAGAAATTATACTATATTTTATAGAACCATCATTGGAAATGAAACTGCTGTGAATGTGGAT
641 TCTTCCCACACAGAATATACATTGTCCTCTTTGACTAGTGACACATTGTACATGGTACGAATGGCAGCATACACAGATGA
721 AGGTGGGAAGGATGGTCCAGAATTCACTTTTACTACCCCAAAGTTTGCTCAAGGAGAAATTGAAGCCATAGTCGTGCCTG
801 TTTGCTTAGCATTCCTATTGACAACTCTTCTGGGAGTGCTGTTCTGCTTTAATAAGCGAGACCTAATTAAAAAACACATC
881 TGGCCTAATGTTCCAGATCCTTCAAAGAGTCATATTGCCCAGTGGTCACCTCACACTCCTCCAAGGCACAATTTTAATTC
961 AAAAGATCAAATGTATTCAGATGGCAATTTCACTGATGTAAGTGTTGTGGAAATAGAAGCAAATGACAAAAAGCCTTTTC
1041 CAGAAGATCTGAAATCATTGGACCTGTTCAAAAAGGAAAAAATTAATACTGAAGGACACAGCAGTGGTATTGGGGGGTCT
1121 TCATGCATGTCATCTTCTAGGCCAAGCATTTCTAGCAGTGATGAAAATGAATCTTCACAAAACACTTCGAGCACTGTCCA
1201 GTATTCTACCGTGGTACACAGTGGCTACAGACACCAAGTTCCGTCAGTCCAAGTCTTCTCAAGATCCGAGTCTACCCAGC
1281 CCTTGTTAGATTCAGAGGAGCGGCCAGAAGATCTACAATTAGTAGATCATGTAGATGGCGGTGATGGTATTTTGCCCAGG
1361 CAACAGTACTTCAAACAGAACTGCAGTCAGCATGAATCCAGTCCAGATATTTCACATTTTGAAAGGTCAAAGCAAGTTTC
1441 ATCAGTCAATGAGGAAGATTTTGTTAGACTTAAACAGCAGATTTCAGATCATATTTCACAATCCTGTGGATCTGGGCAAA
1521 TGAAAATGTTTCAGGAAGTTTCTGCAGCAGATGCTTTTGGTCCAGGTACTGAGGGACAAGTAGAAAGATTTGAAACAGTT
1601 GGCATGGAGGCTGCGACTGATGAAGGCATGCCTAAAAGTTACTTACCACAGACTGTACGGCAAGGCGGCTACATGCCTCA
1681 GTGAAGGACTAGTAGTTCCTGCTACAACTTCAGCAGTACCTATAAAGTAAAGCTAAAATGATTTTATCTGTGAATTCAGA
1761 TTTTAAAAAGTCTTCACTCTCTGAAGATGATCATTTGCCCTTAAGGACAAAAATGAACTGAAGTTTCACATGAGCTATTT
1841 CCATTCCAGAATATCTGGGATTCTACTTTAAGCACTACATAAACTGACTTTATCCTCAGACTAGCTGAATGATTTTGTGC
1921 TGTTTCAGGATGTTTGCACTGAAGAAAAACAGAAAGCTTATCTGAAATTTATAAAACTTTTTGTTTTGCTACATAGAAAA
2001 CAGAAGGTATTTGAATAATAAGCAGTGATATGCTTAGTGAGCACAGCTATACTGATTTTGATTAGAATAGTCATCAGAGT
2081 GGCTTAGGGACAGTTAATATAAAAGAGGAGCAAGGTGTAGACCATCATCTACTTCTGCTAAAATAACTTAAAAAGAGGTC
2161 CATAGGCCATAACTACATGAGCCCAGCTTTTGTAATCTGACAAAAAAATGAGGAGCAGCTTCGTGTATATCAGTGTACAC
2241 GGTATTCCTTAGGTCCCTTCCATTGGTAGTGATGCTGCGAGTTATTACTGGAGAAAAGGAATTCTAGAGCTTTAACTTGG
2321 CAGATTAAAAGTACTCATTTTTTATTCATCAATAATTAGTAATCTCACTAGTTTTCAAAAATTTGCATATTATTGACAAC
2401 CTCTTTGAAGATGCATTTCACAAACTCAACAGAGTGCCATGATAAGAGCTAGGGATCCCCCAAACTATCTCAAGCATCTA
2481 AAAAATTGCCATTTTTAAAGGCTTAAATTGTAGTAGTAAAGGGGAAAACAGGAAGTAGTAGTAAAGGGGAAAAAAAACCA
2561 ATAAAGCATCTAAAAAATTGGCATGTTAAAAGGCTTAAATTGCTAATGTGTGTATATATATATATATATATACACACACA
2641 TATCATTGACTTTTCTTAAGACTTCAGAGTACTGGGTAGATGAACACTTTATACAGTATATATCTTCAGCTTAAATTTGT
2721 TTTGAGTATTTTTTTTATTTTTAAATAAGTAGGCAAAGATTTAAATTTTTTTATTTTTAGTAAATGTTTGAGGCACACTA
2801 AGACAACTTGGGCAATATTTGCCAAAACAAAACAGAACCCCAAAAAATGTACATCTTGTTCTTAGCAAATATCATTATTG
2881 TAGAGACACTTAATAAAGAGATGGTATTTTAATGTCTGCAGTTCTGAGGTAGGGTGGAACTTAGTTCTACATTGTGATTT
2961 AGGAATTTTTAAAACCTTTTTTCTTCAAGGGAGAAGTGACCCAGGCCTCGAGTTTAGTGCTAAAGCCGCTAGTGTACTTA
3041 TGCTGTCCCCTAACCACCACGTGCGATATGGAAGCAGATGCTAAATATAGGGGTTTTCTTAGAAAGTAAGAGGAAATTAG
3121 CAAGCGTTATTAGTGATTGACTACTGCTATCAAGTGAATTCAAAGGAAACAGGTTTTTATGCCATATTTAAGTTACAGAA
3201 ACCAGGCATGCTTAGAATAGTTTCTAGAGGTTATTGGAGAATAGAAAGCTAAGAAAACTTGGTATACATTTACAATGGAA
3281 ATATAATTACACTTTTTACTCTCAGAATATTGTTCACATTAGACTTCCTGTTTATCTTTTATATTCTTGCATTTATATAA
3361 TGCCTCATCCTTTCAAAGTTCTTTCACATATTATATGATCTTCTTTATGAAAAAAATAGATGTTTCATTCTGATATATTC
3441 AGTTTCCCACTTTAGGCAAAAGTAGATTAATAGAATGACGAATTCAAAGTAGATGAGGAAAATCAGGCACAGAGAAGTAA
3521 AGGTAGGGATAGACCCAAATTTACACAACAAGATAATGACATCTCCAGCTTTTAAGTTGATCATCAAAGGCTGGGCTGGA
3601 TTTGTCTTGCTGTATGTGTCAGGAAATTTATACCTATTACATTTTCCATTTTCTCAAAATTTAAGTCACATGACTAATAT
3681 TTAGCTGCAACTTTCCTCATAACAAATAGTGTCATGAAGAATGTTGTAGTGTGAAGTTTGTACATTTCAGGGTCAGATAT
3761 ACAATATGAACTCTTAATCTACAGGAATGAGAATGGAGGATCATTGAAGGCCATGATATAAACAAATTTGCATGTTGAAG
3841 CCTGTATAAAACATGGTACAGTGAGTGAATATACCCCCATCCCCAAGAACACTTTATACATATTAAATGGATATATGATT
3921 ACTGTGCAAAAATTCATTCTGGAAATGAACATATATTTGAGCACTAATATGTAATGTACACCTGCCCTAAGGAGAAAATA
4001 AATTATAAAACTTTTTACATTCAAAATTACTTTCCCAAGCATGTCTTAGAATAATCTATGTGTTGATGCATGTAAATTGT
4081 ACTTTAGGTAGGCAAAGAAATCTGGTTATTTATGTAAAAACTAGTCTAATAAAGTTAGTTAGTGGCTTTATCACTTTAAA
4161 TCTTTAGTGTCCAAAAGTGGTGTTTAAAGTAATAGCACATCAGAAAACCTTGTCTGGACAAAACTAGTTCACTCACTGCT
4241 TCTGCACCTGCAGTTGCTCCCTTTAGGGTTATAAAATAATGACCCAAATGTTACATGTGTTGATATTATAACTTGTCAGT
4321 TACTGATGTCTGTGGTATCCTACCCTCATCTCTGAAAGGGATAATACTGAATAATTATTAGAAAACTATAAAACTTCACA
4401 CTTTGTACCATTAAAACCTAAAATTTTAATCTTGTCCTTTTTTACTATGGATCAGTCGGCACTCGGGAACAGCAGCAAGG
4481 AAAAAAAGCAAATTTCATTCACATGTTCTGTGTTCATACCTCTTCTCTACCTAATTGTTCATTTAAATTTCAGCCTTATT
4561 CCTTGATAAGGGATTTTACCACATGAAGTCATCCAGTGACCCTAGCTCTTATTGTGAAGTTAGTGGAGTATACTTAGAAA
4641 TGTTACAACTTTAAAATGTTACAAAACATTCATTAAAGCTCATATTTAAAGTAGAGCATCTAGTTTGAGAAATAGAAATC
4721 AATTATTAAAGATGTCTTTTTTCTACCCATTTAACTAGTTAAAACCATGACATGTAAATGTAGAAGTAGAATAATCATAG
4801 AATTCCCTAAAATATTTCTGTTTACTAACATATATTGACCAAGTACATCAAGCAGGAGAGATCTTCCTTCATTCTGTTAT
4881 AGTCCACATCATTCTAATTTTGCTCAGTTGTTATTAAGAGCATATTCCTAAACCATACACTTTTGTTTCAATAAAGTTTT
4961 ATTTTGTTGAGATGAATAAAATAACAAAGTTATAAGCTGCATAAGACAAAAGTTCAATTGTTCAAAAAAAATTTACTGGG
5041 ATAGCTTTCTATTACAGGTATTGTTAGATTATATTGTGCTGATAAGATTACTTTCTAAAAAATTTGTACTTTTCTGTAAA
5121 TTAAAAGAATATGGAGTCATAAAATGGCAAGTGTTTTAGGATTAGCCTAAAATTGGACATTGTCATTGATTTCAAAGAAG
5201 GTATGAACTAGCAGTCTTACAGCCTAATTCTTCTTTGGACTGGTCCTTGGCAGCAGTTCCTTTTCAGACTCGATAAACAG
5281 AATTCAGATGATGTAAGTCAAAACAAAACTTTACAAAGCCAAGCGTATTATCTTTTGCATTAACCTATTTTTTTCCATCA
5361 TACATGCTACTAGTATGTGCATTAGCATGATATTCTCATATACATTGCATTAAAAATTAAAAGGTGGCAGCTCAGGGTGA
5441 GCTCTTCTGTTGCTCATTTGTTCCTAAATTTTTAAGGGCTTTTTCTCAGTCAATAGTTTGTACAAACTGGTTAGTTTAAC
5521 TTCATTACCCATTTCATTAAAGTTGATGGGTCGTGTGATGAGATGCATTTAAGGCCGATAGTGATAGATGTTTTTTTTAT
5601 TTCTTGAACACAGGCTTTGTCTGAATGATGTTCTTTTATCTCTTGAACACAAGCTTTGAATGATAACTACAGGTTTTAAG
5681 TGCTGTTACATTAATACCATAATGTGATGTGTTAGAAACAAAGGGATATTTCAAAGGTAGATATTTGAAAATTCTCTAGT
5761 CTCAATATGTATGTGTATTGAATATACTCTAAAAATAAATGTGCAATTTGCTAGTAGGACAATGCAGTGACTGACTAGCA
5841 TTAGGTATGTTTCTTTTATATCCTAGCTATGTCCCACTTTCTTCTAAGTGCAATCCTTTCATGTTCACTTGCTGTTTTAC
5921 CCCATCTACTCTAACTTCATTTGGAAGGCTTGTCTAGAGTATAGCATGTATTTTTACCTTTGCAGTGAATTGCATGTGCT
6001 AATTGTAACCACAGCTATTTTTATGTTGACATAACTCCAAATGTTATATTAAATGTTCTATTATATATTAGCTCTAATCC
6081 CTTAAGTAAATTTTAAGAAATAAATACTTGTTCAAATTTTTTTTCTGTATGTGGTTACTATCATCTGACTATGCATATTT
6161 GTAACAGCATTTATCATTAGTGGTGTTAGCTAAATAAGCATCTTAGTGTAAATGAGATGCTTCGTGTGGGTTTTGTGACA
6241 TTTTAAATGACATAATGGAATGTGATTTAAAAGAAAACCAGTACACTATCTTGGTCTTAATAACATAGAATGGAGATGGC
6321 AAATTTATCCACTAGTTTTCCAGATTTACTATTTAATAGCTGAGGTCTGAAATCGTAGCATCCTCCCTCCTAGTGGACAT
6401 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACTTGGTTGTCAAGAGCCCAAGTATGGAGGTGCTGCGCCATCTTGTGGCCTGT
6481 CTGTGCCCACCCTGCACTCTGCTGGAGTCTCCATCCTTGTTGCAGTGAGACTTGAAGTTCAAGATTGATACATGGCATCC
6561 TCCTGCTACTTCTTGAGGTTACTAAGTAGTATATGAAACTAATCAGTCAGCAAGTCCACCTGGAAGGAAAAGAAAATCTC
6641 AACTATTAATGTGCCTTCACATTGTGATTTTGTCTAAAAAAATGTAGTGAGTCAAAAAACCCACAAGCCAGCCAACAGTA
6721 ACTCCTTCACATATATACCAGAGTTTATAGAAATAACATGTCAGCTTTGGGCTATGTGCTCCTTTGTTTAAAATCTTCTA
6801 TTTGGTTATGGCTTGTATAGGCTCAAGCCTGATTTCTTTAAGGTGTGGTGGCTCATCTTATCCTAATGTGTATGATAGAT
6881 ACAGTCCATCCTGCTTTGGAAAAGATTATGTAACTCCTTGAGAGCATACTCTTTCTCTAGCCCAAAGGCAGTGAGAGAGT
6961 TTTCTTGTTCAGGATTGCTTAACTTTCCATTTAAGCTTTTTCTTTTTAAATTAATACAAACTTCTACACTTTCAAAATAC
7041 GAAATATATTACAACTGCGTATAGGCTCTTCCATACTTAAGTCCAGTGCTTGGGCAAGTTAATGGAGTGAAAGACTACAA
7121 GCAAAGAGGAACTGAGGTAGAAAAAGAAGAATGTGTGAAAGCAGCAGGAAGCTCAGCCAACTCGAAAGCAGGGTGAACAG
7201 CTTGAGTCCTGTTGCTGCTGATCGGGGTTGGCTCTTGGACAACTTAGTAAGATCATGGAAAGGCTGCTTGGGTTCTCCAT
7281 AGAAAAGTTCTGTCTCCATCAAGGGAGGAAAATGTACCTTTCAACTCAAAATTCAATATTTGTTTTTAAATATAGCTATT
7361 TTCCCCAACCGCTAAAGATTTTCAACAGATACGAAGCCAGAGCTTAGTTTTAGAAACCTGTGGACATTCAAACCTGATTC
7441 TTTATTCCCTGTGACTATGGTTATGTCATTTTACATGTCAAAAAAGTGTATCTAGAATTGTCATTTCTTATTTTTGAGCT
7521 TTTTTTAGTGAGAATTATCCCCTCACTTAAATGGCTTTTTATTTAAACATCTGTGCATTCTGTATGAAATTGTAGTCTTT
7601 CTGGGATAACATGGTGAGCTATATGGTGGTAATCCACACACACAAAAATAAAAGCCAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAAAA
7681 AAAAA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' ccGUUUU------UGUCG---UUAAUGAAAg 5'
:|||| ||| : |||||||||
Target 5' taTAAAACTTTTTACATTCAAAATTACTTTc 3'
|
4004 - 4034
|
154.00 |
-9.10 |
2
|
miRNA 3' ccguuuUUGUCGUUAAUGAAAg 5'
:|:| :||||||||
Target 5' tgtgctGATA-AGATTACTTTc 3'
|
5075 - 5095
|
147.00 |
-9.00 |
3
|
miRNA 3' ccGUUUUUGU-CG-----UUAAUGAAag 5'
::||::|| || |:||||||
Target 5' gaTGAAGGCATGCCTAAAAGTTACTTac 3'
|
1619 - 1646
|
136.00 |
-10.49 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|