pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-3973 |
Genomic Coordinates | chr11: 36010098 - 36010204 |
Description | Homo sapiens miR-3973 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-3973 | ||||||||||||||||||
Sequence | 84| ACAAAGUACAGCAUUAGCCUUAG |106 | ||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | ||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | BNC2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BSN2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | basonuclin 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_017637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on BNC2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of BNC2 (miRNA target sites are highlighted) |
>BNC2|NM_017637|3'UTR 1 TCTCAGAATGGACACTACAAATGCCAGCTCTCACCAGATGGCCTACGTGTTTGAACTGCCATAGTCAGTGTGCGCTTATG 81 TACTTGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATTTATGTATGCTCTGTGGCTACATATACACACACGTATTTCCT 161 TGAGATAAACAAGATAAACACTAGGTGCTTTTGAATTTTTTTCACTTCCCTTTATAGTTTTGGGAAAGGAGTGGGATCTT 241 TGATTTCAGGGTGAAAACAGAGTACCCCTTTAAACACACACACACACACATGCACATACACACACACACACACACACACA 321 CACAGTGTGCAACTAGCCCCAGTTTTGACAGAATAATTCTTGGTCTTCCCCAAAGAGACAATTTGTTGTACCCATGACTG 401 TTGCCTGCAAAAATAAAAGGGAAAAAAAAGAAAAAAGAAACAAAAAGGAACTTCTTATAGTTGTCTTTTGTGAACTTTAA 481 GGTTTTGAAAGAATCTTCAATTAAAGCATGGCAGATTCACCTGTAAATATTTAGCCTTGAGGGGCCATTGATGTAAAACA 561 ATTGTATTGATGGTTGTTTAACTTTTTTGTTTAATTTTTACAGTTACATCCAGCTGTTAGATATGCAGGAAAAGATAGTT 641 TGCTGGCTAGCTCTATTCATTTATGTTAGCATTAATGCACATTTTTAAAAAAAGAAAAAAACATGGTCTTGTTTTTACTA 721 CCTGTTAGATATAGTGCTAAAGAGGTGCTGGCATGCTTTACAGCACAGATCTGATTTTTTAAAATGTCCTGTACTAGTAC 801 ATAAATCCCGTCATGCACTTTTTTTCATACACTACAAGGGGATGTGTAATAACCATGCTTCTTTTTTATCCTTAAACTAT 881 TGCCATACTTCAGTAAGTGTCTTTTTTAAAAAAAATTCACTTGTATAAAAATGGTCTGGTCAGTATAGGGCACAAATGCC 961 AAACAAAGTATTAGTGTTAACACAAAACTGCCAACTTTGCACAAGTTTCCAGAAAAGAAAATACAATTAGTCACTCAACA 1041 TAACCACAGGCCAATTTGTTGGCCACCAGAAAACCGCTTTTTAAAAAAACACTTGGTGATTCTTTCAAGTGCCGAATGTT 1121 ATTAGAATCAACATTGCATCCTTCTTGCTTATACGTTAAGTTACATAAAAGGAAAACAAAATTATGTGGTGTGAAACAGC 1201 CAAGGCATTTATTCTTCAGAGGCAGGATAATATTTCAGGATACAAAAGCCCAAATTACCCGCTACGGAACAAAGATGAAT 1281 ACAGTAAAAGAGTCGAACACTCATTTCCAAGGCCCTAACCCTTATCCTTTAAAAAGAAATCCTCTGAACTGGGTCGGTCT 1361 GTTGTATGGCTGTCTAATTTGTTGCAAATTCTGCAGTCGTACTATAATTCAGGCCTGTTTGGTAGACAAAATCAAAAGGC 1441 ATTTAACAGCAGCAGTACTTGGAAGCTTTGAAAACATGTGCTAAACTTGAATGGAGCAACACTCCTTTCTGAAAAGCCAG 1521 AAGAAGGGGGTTTTAAAGCAGGATCTCTCAATGTTCAGTGTTTTGTGTTTCCCCACACGATTTGTCAGAGAGAAATGAAA 1601 GCAAGCCTGAAACCAAGCAATTGAGAGTGAGAAAGAGGAGAGAGACTATTCTCCAAACCTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTC 1681 CGATGTTTACACATGTTGCCTGAGCTGGTTAACCACATCGGCAGCCTCAGCTACCACAACATACTGACTAAATGATGATA 1761 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AGATTCAAAAAGGGTGGGAAAAGATTTTTAATATCCCAACAAAACATTATAGAAACTCTGGCTTTTGCAGTGTGCATAGA 2721 CTACATGTAGTTTTATGAAAATAAATACACATTTTTATTTCAGCAACTTTGAAAAGTTACACTCAGTTGAGTTACTAGAA 2801 CTCATCTTGTACAACAGCAATGTTTAGTCTGTTTAATTTAATGTCAAATAAAAGGTCAGATAGCCCTCGTGAGTGAATTA 2881 CATAGCTGTCGGCAGTCACATCAGCAAATGCACCAGGCTTAGAACAAATGTTTGTTACTTGCTGCAAACCAAGCTAATGT 2961 GTATAGCCAGTTAGAAAAAGTCCAGAAGTAATGAGATTCTAGAAGTAGAGTTTCCCTTGCTTGGAAACATGAATGTGTTC 3041 ACCTGTGTTTTGTCAGAGAAGTGGCAATAAGTCCTGGACAGCTGACACTTTTTAAGTATCTCCCCTATTTGCTACTACTT 3121 TTGTGCCTCAAGTGCCCAGTCGTTACGGTGGCCTTCTAAATGAGTAAATAACATTTTCCAATATAAAGCCTATTTGCTTA 3201 AAAGGGACAGGGGAGTGGATGGATGTAGTACATGCAATGGAAAATCATAAAATGTACAATTCTTCTGTTTCCAAAGTATT 3281 GCTCGTTCTTGAGTGTGTGCCTGAGTGTCTTGTTTTGACTTAACTAGAATTCTAGTTAAGATGGTGATCCCATGGCTTAT 3361 TTGCAAACAGGAAGGATAAAGAGATCAGCGTTTTAGTCATGGAGCTCATCTTTGCCCATTCCTACTCATTTGCTTTTTCA 3441 TAGGAGTTTTTTGTTGTTAAACAGTTTCTCTCAAGCCACATGCATTCTATGCTGGCTGAAAATTAATAGTGATGTAGATG 3521 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CAGACGAGTCGCATATTTCCTGTAGCTGGAGTGTTGCTCACCATAAATGGTCATTTTCAAAAAGTATTGTGTAATTCCAG 5361 CTGTACAACTGACCAGTGAGTTATCTGTCATCACTGTTGCCCACATACCCGTCCTTCCTTGTGTAGTTTCATCATCCTCA 5441 TCCTTCCCACATCTTGCGCAAAATGATTTTCTGTGCTCATTCGGCAATAACTATGTTATTCGGCATACTGTCTTTTTGGC 5521 ATTTGTTGAAAAATCCAAATGCTTTTAATCCAAAAGATTAATCCAAATCTTTTTTAATCCAAATGATTTTAATCCAAATC 5601 CAAATAACAGGAGGTTAAAAAAAAAAAAAAAACTAAGCATTTTTACATGTACACTGAATTGGATCAGCATTATTGTTCAT 5681 TATAATGCTATATATATTTTTGGAGCAACATACTATAGTTGTCATAAAACTATCTTTATTCTTCTCCTCTAAAGTGCTGT 5761 TGTAAATTCATTTGACCTTTACTGCAGGAAAAAAAAAAATCTTTTTTATATAGGATATGAAGACCAAGGCTCAGTCTGTA 5841 ACAAATAGTGGACCATTACAAAAGAGGAAAGAAAAAAGCCAGGGCTGAGCAGCAAGAAGCTTCAGTTCAATTTCACCTCG 5921 TATCTTTCTAATAACATACTTGTCACTTTATTACCTTCCAGTAATGTGAACGCTGCTGACAAGACTGTCACACTAACAGC 6001 AGACAACACCCTCTCTGCTTCAGCCCAGCTCTCCTGGCTACTTATTGCCCTGGCCCTGAAGGGACACAAACTAATAGTGT 6081 GCTTTCCAGTTCAGCACTTGGCCATCAAATATAAAAGGATGCGTAATTGCCTGTTTATCCCCTTGTGAAGGAGAAATTGA 6161 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GGAAAGCCAGTTCTCTGTTCTCTCCTGCTGGTGATGGACTAGGCCTTTTAGAACTAGCAAGATCCCTCACACAGCTGGGA 8881 GAACACACACCTTTCTTACTCCAGACCCATTGGTGTGTCTCCAGTAACAAAATTATTGGACTCAGCCTCCATATTTGACA 8961 GCAAAAGTGGCCAGAGGGAGTTGAAATATCTTGAAGAAAAGGAATTTTCACTAAGATATGTCCTCTCCCTCTCCCAGAGT 9041 TTAGCTGTTTATTCCTTTTTTTTGTTTATATTGTTCTCATCTGCATAAAACCAGTCTCTTGCAATAAGCCTGCCGCAGAA 9121 TCAAAGTCTGTACTTCAAAAGGTAACTGCACCAAGGGATGGGACAGTGTGCATCACCCTGATCTAATCATTGTGACGTTG 9201 GTAGCTTCCTAAATACTGTATGTACCTTGAACAAGGGTTTTATTTTTGTTTTGTTCTGTTTTGCTTTTTGTTTTTATTGG 9281 TAGGCTAAGGTAATTAAATTTTTTAATTTGCTGTTACTTTGGTTGTATTTTCTGTACTATAACTGCCTACAGTATGTCTT 9361 TTGCATAAAATGCATAAGGGTTTGGGGATGTAAATGGAATTTTATTCATATTTTGTCCAAATACCTCTTGTAATTTGTAT 9441 CAAAATTCTTGTACAATTTTTATATTAAAGATTTATCAGTCACTGA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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