pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-2355 |
Genomic Coordinates | chr2: 207109987 - 207110073 |
Description | Homo sapiens miR-2355 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | |
Associated Diseases |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-2355-5p | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 11| AUCCCCAGAUACAAUGGACAA |31 | |||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||||||||
Experiments | SOLiD | |||||||||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | TAOK1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | KFC-B, MAP3K16, MARKK, PSK-2, PSK2, TAO1, hKFC-B, hTAOK1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | TAO kinase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_020791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on TAOK1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of TAOK1 (miRNA target sites are highlighted) |
>TAOK1|NM_020791|3'UTR 1 CTTAATAATTGAGAGTGGCAATTCCGCTGGAGCTGTCTGCCAAAAGAAACTGCCTACAGACATCATCACAGCAGCCTCCT 81 CACTTGGGTACTACAGTGTGGAAGCTGAGTGCATATGGTATATTTTATTCATTTTTGTAAAGCGTTCTGTTTTGTGTTTA 161 CTAATTGGGATGTCATAGTACTTGGCTGCCGGGTTTGTTTGTTTTTGGGGAAATTTTGAAAAGTGGAGTTGATATTAAAA 241 ATAAATGTGTATGTGTGTACATATATATACACACACATACACATATATTATGCATGTGGTGAAAAGAATTGGCTAGATAG 321 GGGATTTTTCTGAACACTGCAAAAATAGAACGTAGCAAAATGGCTTCAGTTATCACTTTTGGGTGTCTGTATCCTAAGAA 401 GTTTCTGAAAAGATCTAAAGCCTTTTTATCCCATATCCCAAATTCTTATGAGCCACTCACAGCAGGCAGCATATGTTGAA 481 ATAAGTTATTACTGGTACACACCTGCATTGCCTCACCAGTGTATTTATTTGTTATTAAATTGATCTGACTTCTCAGCCTC 561 ATTTGGACTAAAAAAAGAAAGCAGAAATCCATGAACACATTGCTTCTCGGCCTTTTGGCTAAGATCAAGTGTAGAAATCC 641 ATGAACACTAAAGGACTTCATTGATTTTTTCAGAGAGTAGAAAACAACTTAGTTTTTCTTTTTTCCTGAATGCGTCATAG 721 GCTTGTGAGTGATTTTTGTCCATTCAATTGTGCCTTCTTTGTATTATGATAAGATGGGGGTACTTAAGGAGATCACAAGT 801 TGTGTGAGGATTGCATTAACAAACCTATGAGCCTTCAATGGGGAAGACCAGAAGGGTGAGAGGGGCCCTGAAAGTTCATA 881 TGGTGGGTATGTCCCGCAGCAGAGTGAGGAGATGAAGCTTACGTGTCCTGACGTTTTGTTGCTTATACTGTGATATCTCA 961 TCCTAGCTAAGCTCTATAATGCCCAAGACCCCAAACAGTACTTTTACTTTGTTTGTACAAAAACAAAGACATATAGCCAA 1041 TACAAATCAAATGCCGGAGGTGTTTGATGCCATATTTGCAAATTGCCATCTATTGAAATTCTCGTCACACTACATAGACA 1121 TAATTGTTATCTCCTTTTGGCTTATGTGATTTTCTGTTTACAAGTAGAATAGCCAATTATTTAAATGTTTAGTTGCCACA 1201 GTGAACCAGGAGTCACTGAGCCAATGACTTTACCAGCTGCTGACTAATCTTCATCACCACTGTAGATTTTGCTGCATGTG 1281 CAGGTCCTCTATTTTTAATTGCTGTTTTCGTTGCTGCAGTACTTTACAAACTTCTAGTTCGTTGAGACTTAGTGACCATT 1361 TGGCATCAAGTTAACATCACACAATAGGAAACACCACTTCCACAAGTCTCAAGCCTCAGTGCTAAAGTACTACTGAAAAG 1441 GAACTAGGAAGTTTGGCCAATTAAAAAAAAAAAGTAAAATAAGTTATAGTGGTCAGGGAATCTCTTGACGAAAGCTAACT 1521 CTTATTTTTCAGGGGGCACATGTTTTGTTTTGTTATGTTTTGTTGTACAATGAAGGATGAACCCAATGCTAAAAAGTCAG 1601 TTATTTTCTTGGTTTTCCATTTCTTGTATATAAATTGTGTTGGAGGTGGGTAGGAAGCTGTGAGTATGACTTGAAGAAAA 1681 ATATCCTTTTCAGTGACAAATCAGAGTTTCTTACAAGTTATTGTCCTGCTCCCTTCCAAGTTGTCTTGAAGAATCCTTGC 1761 TGCTAACTCTGGATCCTGCTTTTCCTATAGTCAGAGGGCTCCAAGGTAGAACTCTCTAAGTCCCTCTCAATGGCACTCTT 1841 TGCCTAGACCAAACTAATGACCAAACAGTAATCAATCTATCACTGTTGAAGTCCTGGTTTTCTCAACCAAATTTTAAGTC 1921 TTTCCCAGGTATGTCAGTCGAGTTGCCATGAATCCTCACCTGTAGGAGTTTCTGGGATTCATTTTAAGGAAACTGGAAGA 2001 AAATTAATGTTTTAATGTAAATGTTTTTAAAACCAAGATCACCATAGAGTTCACACAAAATTTTAGGCAGTGTTTCAAGA 2081 AGCACTCTTATGTGTTGTTCTTTCAGCCCATGCTCCAGGTCACCGGTTTTTAGGTAAACATGACATGACATGTACTTGTA 2161 ATATCAGTGAAAGGGGCTTTTAGTCGTCTCAGTATCTTTTTTGCATTCAGGTATTATAGCGTTTCCAACAAATTGAGAAA 2241 TTACTTATTTGGTGTAAAATGACGAGAGAGCTTTAGAATTTAATAAAATGTCAAAAATACAATTTGATACCCTTAAAAAT 2321 TATTCATAGATCTGGCTGCTCTGTACTACTGGATGGGTGGAATAGGGAAGCAGATCACTTTTGCATACAAAAACTCTTTC 2401 AAACCCAAAATATTATTGGTGGTACATTTTAAAGTCCAATTGTGGACTTAAATTAGTCAAATTGAGAGTTACTGAGTCCA 2481 TTCAGATCTCCAGTAGGGTTTTGTATCTAATGTATTTGGCCACCAGTTTTACATGTAGGTCATGACTATACCTGGATTTT 2561 ATCATTAAGTTAACTTTAAAGTATATACAGTTTGCAAAAAATGATTCAAATTAATTGGTTTGTATATGTTTGTGAGATCT 2641 AGCTTCTGAGGAATCTCATACATAGTAGGAACCATCATAGAGTAAAGCTTGTAGCAGAAAAATTGGAAGGGTTTTGAGAT 2721 ATCCTAGAGAAAGAGCAAGCACTTTCTGAATCAGTGGGGAAATATCAATATTTGATCAAATTAACACTACCTCCTTCCCA 2801 GTGTTGGTGTTCACTCACTATATGTCTTTAAGAAAATTAAAACTATGGAAAATTTGTCTAGCATATCAGAAGTTGTAAAT 2881 GCTATATCTGGTATCCAGAGGCTGGCTGTAAAAAGTTCCTTGGGGTCACTCTATCTCACATTTTTTTTGGTTAGCATTTT 2961 AAAAATGCAAAGCCACATACTTTGAAATATATTATTCCAAATTGAGCTCCCTTCCCTTTGCACATATTTTTTCCTCCCCT 3041 TATTGAAGTCAGCTCTAACCCCAAATTCTAGTATCCAAAAGTATTTTTATTTGTATAATGCTATCTGAAAAATGTGTTTA 3121 TATTATATTTTCAGAGCTGCAATTCTTATTCGCCATTTCAATACCTAGAGATAGAGAGTCTTGTATTTGAAGCCACACAC 3201 ACTGGTGTAATATGCTTAGTACTCTAGGTCAAGGATTTGTTGGTAAATGGAACATTTTAGCATAGTCATGATTTTTGGTT 3281 GCCTAGACATCAGGTAAACATTCAGTACACTAAAGAAACTATCCTGGACACTCCCTCCTGCTTCCACCAATTTTTTTCTC 3361 ACCCCCTTTTCAAAAATTGAAAACTCTATGAGTGTCTTTTTGAGACCATAAAGCAGACTTTAGTAACTTTCTATTTCTGT 3441 AAGTACTAAATGTCTGGCATTTTAAACTTTTGTAGAATACATTATGTTGGACACTGGAATAATACTATTTATTTTCACCT 3521 GTGAAAAATGACTTCATTGTACTTGAAACACCTCCTTTGCATTTCTCCATTTGTGCCATTCACTAGTGGAAATAAATTGT 3601 ATTATACCATGATCTACTGGCTTTTTAAAACTGTATTAAATATGCACATTTTTGGTATAGCTATTATCATTTGTATGTAT 3681 ATATTGTATATACATATGAGTGTCTGTATGTGTGTATAGATGGATGGATGTAACTCATACTGTACATTTCCATCAGGGCA 3761 CTTAAAAGTTCTGTTATTTTTGTTTGGTTTTGTTATTTCAGTCCTCAGTTAAGGCAAGAATGCATGTGTTTCTTAAGAAT 3841 GAGTACTCTGCGTTGATGTTTATGAGAAGGTGGTCATTAGATGCAGTCTTTTCCTTTTTAATCCCCTCTTAGCACTTCTG 3921 TGAGTGGAGAGGACATTAAGTAAAATTTGGAATCATAAGTTGCAATGCAGTAAAATGGTGCTGGGGAAGGAGCCAGTTAG 4001 TGTTTCTGTGAGTTTGTGTTGTGATGCAATAAGAGATAAGTAATGCAGAGAGAAATGAACCATGGAAAGTAAGAACACTG 4081 ATGGTGATTCCTCTGCAAAGATGATAAGAAAAAGAACCAATAAATCACACAATCTTTATGTGCTTTCTATATGTATTTCT 4161 TAGTAGTGATACCATTGATCCTCTTACTTTTTTTACTCCATTAATACTAATAATTATATACTTTGCTGAGGATCAAAACA 4241 GCCAAGAAAGGAATTACTGCTAAAGCATCTAAGATTCTCCTGAACTGTAAAATCAACAGGAAATGGCCACTGGGAGAGAA 4321 GGATTTGGTATTGGGTGAGGGGCTTTCTCCCTTTACCTGCCTCTTCTTGCTTGCTAATAGTAAGTTCTTTGTGCACCTTC 4401 CACCACTTCTGAGCCACTACTATTCAAGTAGAGATTTGCCCCAACACATTAACTTTTTCCTTGGAGATTTATATGGTCCT 4481 GCATTTTGTCCTGTGCTCACAATGTGAAGTGTCTTCTGTATTCAAATCAAAAAATAATATATTTAAGGTATATAAGTGTG 4561 AATCTCCTATAATGATGGAAGAAGAGGTTCTCTTGTCTTAGATAGAAAAGAGCCTTCTCCAAGAGCAATGTCAAAACTTG 4641 GGCTGTCATCTTTGAGCTGTTTACCAAAATACAGACCATTATTGAAGAAAAACAAATTATCTATTTTGTTTTCCCCCATC 4721 TAACATGATAGTGCCCCCAACCAGGTTGTAGCATTGCCTTTTAAAAGAGACTCACTCACTCTTAGTTTTTAAGAACTGGA 4801 AATTTCCCATCCTCAGATCCCTTAAAGGATGAAGAGTTGGCTGTACACTTAGCGGACTTGCCTCTTGTATGCAAGGACTA 4881 CTGATTGAAGTCTGTTTTGCTGTGTCTGGTTATGTTGTCTGCACTTTTATGAAATCACTACAATAGGTCTGCATTGGAAA 4961 TGACTATTAATTTGTAAAGAAGTAAGTTTTATTAAACACTGTCTAGAAAAAGAAAGTGAAGCTGAGAACTCTTCCTTTAT 5041 TGTGCATTTATATTTTCTGCTGAATTCCGGTAGTTCCCTTTAAAGTCATGTTGACTAATGTTTTCCTCCTTGTTTGTATT 5121 CAGATTTCCAAAATTTCACTCATACAAGGGAAGAGACTCCATTTAGCTTAACGGTAGTCTTTAGATCATAAGAAATATAT 5201 AAATTAGTATGCACCTTATCTGCCTGTTGTGGGTTTCTTAAACTTGCACTTCCTACCCACCCAAAGATAGATATCCTTTA 5281 AAGAAAATAAAGGCAGAGAATTAAAACTGGGGAGCCATTTACTATGTCACCATCACTGTTAACTGTTTCCCAGCAATCTA 5361 AACTTTTTGAAGTTTCAGAGGTGTATTTTTTTTTTGTATATATGTCTGTGTGATTGTATTGTTTTGTTTCTAAATATACA 5441 AGGAATTCTTTAAATAGAGAAAAAGGTTAATCCTCACTGAAACACCAGGATGCCCACTGGATATACTAATCTGAACATCT 5521 GTAGGTAGTTTGTCATGAAAAAGTGGAGAGAAGATGAGACTTTTGAATGAATGAAAAAGGGTATCTTGATACCCAGAATT 5601 CCCCCCAAAGTACGGGTAATTCAACCTGCACAGTTTTCTTTCACTCAAAGTGTTCAGCACTTGTGAGTGAAAAATCATGT 5681 AATTATCTGTAAATATGTAGCTAACAAATTGACCTAGTTTCTGTATTTTTTTGTTTTTGTACTAAAGTTTATAGGTCTGT 5761 GCCAGCTAGAGAGAAGTTGCTGTCATTACCAGTTGTGGTCCTAGCATCTAACCCTGAAACCATCCTAGGTGACATTTTTA 5841 GAATTAATACTTAAATGTTAAACAGGGGGAAATGAAGCTTAATCATGGTCAGGTTTGAGATCTTTTGCAGTGAAATAATT 5921 TTATTTAATATAAATGATCACATGTCCTCAATCATGAATGAGGTAGGGAGCCTCTCTCCCCCAGTGGCCATGTTTACAAA 6001 AGTGTGTTTTGTCTATAAAGTGCAAGTGTTTTAATGTTTATGTAAATTATGCAGGTGATAACATGGTTTGGAACTGTTTA 6081 TTGGGCTCTTTAACTGAATTTTCAAATGAAATGAACTATGCTTATTGCTGGCACATTGATCCCATTTCTGGAACATTTTT 6161 CCTATTTCCAGAGTTACATATGTTCTTTTGTCATTACCCAATTTAACCTCCCTTTCTCTGATATGCCTTGTAGCCAAAGT 6241 ATTAAAGGCTGATGAACATAGACAAGGGAAATGCATTTCTTAGAAATCCGTGAACCCTCAGTTGTATGCTTTCAGTACTC 6321 GTGTTAATATGTTTCTATGGCAACTCTGAGGTCAGTGGTTTAGAAATGAGATACCAGTGTTAATGAAAAGTGTGTGCTCT 6401 TTGCTTTTGCATGGCTTGGCTTAGTATCCAAGGTATATTAGGGCCACTTGAAAGCATGAAGACCAGTTATATAGGGAACA 6481 GGTTTCTCTCAGTGGCACATTTTGCTTTTTCTGAGCCCCAAATACATTGCCTGGGCATGAACATTGTTACCGTAAATTGC 6561 ACATGGTCATGGACTGAATTATGTGACTTTAAAGGATGTAACTGCCCAACATTTGCAGATTCTGGGTGGTCTATGTGACC 6641 ATTTGTCTCGTATCCAAAAACCCCGGGGCTATTGGAACCCTTCCAACACTTTTTCCTTTGTCATAGACAAGTTTATATAT 6721 AACTTACCAAGATGTTGGCTGTCCTGGTGTATTGCCAGACAGCTCTCTTTTGGTTCCCATTCCAAATGTGCTGCTGTCCT 6801 TCTTTGCATTTCACAATATCAAAGAAACCACCACCCTTCTTCCTAACAGCATTTTATGCCTTTTATTCCACATTAAATGG 6881 GAATTGTGCCTACTTAGGAGTGCCCCTCCAATTAATTACATGTGTCCAAGAATAATCCAAGCTAGAGACACAAGGTGGGA 6961 AAACATTTCAAAAAAAAAAAGTCCTCTTAAGGCCAGTAATTTATCTGAAAAGGTATTTTATCACACCTTGACACCTTATA 7041 TATGAGCCTATTAGGAGCTGCAGGTGGTTTCATAGGGTAAAATCCAAGAAAAGAGAAGGATGTGTGGGGTTTCTATTAGA 7121 AGATAATTTTGTTCTCATTTTACCTTTTCTTTTATGATCCTTCTCTGCTAGAACAGGTTAATTCTCCAAATTTGTTTTGT 7201 TTTGTTTTGTTATTTTTTAGGGAACTCTTTTGCAAAAGCAATGGTCGGATGTAAATAACATTTAAAGTATAGTGCACATA 7281 ACTTCCCCGGACTGTTCCAATCTGATAATTTGTAAATGCTTTAGAGTTTTTTTAATTAACACTTGTGTTGCTAAATTCTA 7361 TTTATGTAAGTCTGCTAAAGTTTTTTAGCCCACTTAAAACTTAAGACAACCATTTAAAATAATGGATGGGTTACTATGAG 7441 CAATTTCGCTTTCAGAACCCCCTTGTTTTAGTATATGAAAAAGCCTAATGCGCATTAATGAGGTTGAAGAGACTATGAGA 7521 AATATGTATAGTGTATATTTTAAAACAGCTTTGCTTGTATTGTGAAGATTTAAAAACAAACTTGAGATTTTTAACGTAAC 7601 TATTAACACAGTTTTAACATAAGTTATCCCACTGGGTTTAAGAGCATCTTGAATGTATAATCCTTTTTGTAACCCAGGTT 7681 GGTTTCTACTTTTACCAGTCACCCAAACATATTTATGTTTTTAGTTTTATGTACTCATTTCCCTTTGTTTTCCTCAAACA 7761 GCATGATTTTTTTGCACATGTAGAAATTTTTTAAAAGAAAGAAATTAGTACATCATTTTCTCTGGATTTTCTTCACTTCC 7841 CTCTTCCTTTCTACTAACTCCTTCCTTAAAGGCCATATCACTCCATTTGCATTATTTGTGCAAATGCCAGGGTTGGTTTT 7921 TATTTTTATTTTTGCTATTTACCTAAAAAAAGAAAATGCTTCAGTCAATTGCTTTTTTATTTAAAAAAAAAAAGAAAAAA 8001 AGCTGTAACCTTATCATTTCTGAGTAGACCATTGAGCGATGAATGCACACCTGTAGTAGCCCAGGACCAGCTGTGGTGGC 8081 TAAAGGGAATATGTTAATTAAGCAAGAGGTTCTTTTCTAAAAGTGGTATCTGTTATCCACAATGTATTTTAGTTATTCCC 8161 ACAAGTCAGGGGTCCAGATAAAATGAGGGTTATCAGCTAACTGATATGCTATCATTGAGGTTCATCAATGAATTTGTACA 8241 TTTCTAGTTCCCTTTGGTGAAGGGAAAAATGATGATTTTGCAAGACCTAGATTTTGGCTTGGTTTCTTGCCTCCTTTTTT 8321 GGCAGCCTTCATCTTCTCATCTCCCAAACCCCCTGAGCCCGTAGGGTTTTCATAGTGGACAAAGAACTTGTGGTCTTTTA 8401 AAACTGGGACTGATACTTTTTTGAGAGAGTATCGTGTCGAAAGTGTGATGTTCTACCACTTTACCAATAACTAATTTTAA 8481 ATACACATTGTCCTCTCGATTTTTGGACCAAACAGACGCTCACAGTGGAGGCTTATCAAGGGTTGCATTGGGGAAGAAGC 8561 CTCTCCCTCTCTGTCAGCACCAGCTGGTAAAGGTGACTGTACAGATGTGCATTTTCCTTTTGGTATAAATGGTCCACAGC 8641 ACTAACTGGTAAGGCTTATTGTACAGTATATTGTCAGTATTCTTCTGGTTCAGCATACCTTATAGTTCATATATAACCTG 8721 TATTAATTGTATAGATTGTGCATTAAAAGCTGTTACCAAGTTGTCAGAACATAAGAGCGAAAACAAGGTCATATGTAATA 8801 TTTTGTTTGTAAGTATCCTTTGTATCATAGCAAAGGAAATGTTTAAAAAAATCAACTGTAATAAAGTAATTTTAGTACAC 8881 AAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | ||||
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miRNA:Target | ---- | |||
Validation Method |
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Conditions | HEK293 | |||
Location of target site | 3'UTR | |||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | |||
Original Description (Extracted from the article) |
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PAR-CLIP data was present in GSM545213. RNA binding protein: AGO2. Condition:Control
... - Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al., 2010, Cell. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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