pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-8066 |
Genomic Coordinates | chr4: 101240795 - 101240872 |
Description | Homo sapiens miR-8066 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-8066 | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 48| CAAUGUGAUCUUUUGGAUGUA |68 | |||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | SLC5A3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BCW2, SMIT, SMIT1, SMIT2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | solute carrier family 5 member 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_006933 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on SLC5A3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of SLC5A3 (miRNA target sites are highlighted) |
>SLC5A3|NM_006933|3'UTR 1 ACTTAAGGATATGGTGAGACACTAACTTAAGACAATACTGACTGGTCTTTGGGGAAAAAAGTTATGTAACTGTGCATCTC 81 TCAGGCATTGTTTACGCTGTAGGTTTTAGCCAAATTTTACTTAGCAGAAAATCATCTAATTACAAGACTTTATTTTCCCA 161 GAGATGGATTAAAGTAAATCTTCAACTTAAGTGAAGCCAAACCTAACAGACTGAATTGTGCAAATGTGGTTTTAAATTTT 241 GCATACCAAAGTAAGAAGAGACCAATTATTCTCACAGAGCACTTAGAGCAGAATATATGTTAAGTTACCATGAATTAAGG 321 TATACTGTCTGCACTGCCAAGTCTTGGCAGACCTTACCCTGAAGTAGAAGATTTGCTCATTTCTAAATTTTTTTTTCTGT 401 CTCTGTAATCCCTCCTACCATTAAGAAAAACTTATTTCTTAGACATTGTACAATCAGTTATGTACTGAAAATCGAATGTG 481 CTTGTGTGATACTTGTTTCAGGACAAGTTCATTTGCCAGGTTCATTTTGTTAGCATGAGCCTACGGATTCTGATTTCCCA 561 AAGAAAGAATGTTTTCCTGTAGGTATTTTTGTACCACCAGTATATGGAATGTTAGGGAAAAACTTTGTTCCAGTTCCTTT 641 TTTTTTTTCTTTCTACTTTCAAGTTTAAGTGAACCATACTGAAATGACCAACAAGTCTGCCTGTAAAGTTACATGTCATG 721 ATTGTGTTGTTAAATGATTATGGGGGAGAAAATGAAGTAAATGTTGCTGATGATCCCCATATTTATTGATCATATTAAGG 801 TTGTTTATATAGTTTGGAAATGACCAGCCCCCTAAGCAGTGTTTGATTAACTTATGCTAATCAGATGATTACTCATATAT 881 TCTGCTAATTTTCTAGCTTTATTCTTGTTATTTGGAAAAATTATTAGCCAAATGCCTTCCTAGGTGGATCCAGTTGGAAG 961 ATATGTCCAGAAACCTGAAGAAAAATTGACGCTGCCTTTGTGTGCTGGATTGCTCTACTTGATTAGATCATGATATATCA 1041 AGGTTGAATTTTTAGAGGGAAAATTTAATTCTGATATCTTATTGCATCCTTGATAAGTTTTTCCCTGATTTTTTTTTTCC 1121 TCAAAAGACTTTCCATCTGTACACAGCCTCTACATTTTTGTTGTAGTGACTTAGAGCATAAGGATGTTTCAGTGCAAACT 1201 GGCCGTCGGTAACAGAAAACTCAGTGCATACTTTGCTGTTGTTAGGTTGTCAATATAGTCTTTCTGTAGGATGGATAGCA 1281 TGTTTGAGAGGTGCCAAACAAGAACTTTTGGGGTTAGTAGTGTGTCTTGTGGAGGGTATTACAGGACTGTGTAATTATAG 1361 GACTCTAACTTGACATGGCTTGGCACCCACTTGCAGCTAGTGGGTACAGGGTACAAAAGATGTTAGAGAAAAGCTCTACA 1441 GATTACGTACTTCTGTGTCTTCGTATGCTCAACACTGTCCTTTGTCCTCCATGAAAGATGAAGGAAGCAAATTATGTATG 1521 TACTTTCTTTGACCTTCTTTAATCTCTGATACTTTTTAGATTGCATGATTTTACTAGGCTTGTATTTAGGGAAATTACTT 1601 TCATAAATACTTTTGTAGATTTTGAATCAAAACTCAGTCTTTTTAATTTTTTTGTAGTCTATAAACTAGTTTCATTATGA 1681 TGGACTTGATTAGTCCAAAGTTAATTTTAGAAATTGTCAGGTAGCATAGTGTCTTCCCATGATCAGGAGGCTTTCTGAAG 1761 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GGTTACCTGGGTTCACAGCTTGCTTGAAGAGAAAGGATGCTAGAATAAAGTAAGCAGCTGAAGAGCGAGCAAATCAAGAC 5361 AAAACACAGTGGTCTCAGATTTTTCGTAGTGTGGGAACAGTGGTTTTGCTCTATACCACTGAAAAGCACTATAACATAAT 5441 TGTTGTCCATGATACTGAAGCTTTTCCCCTCACTTCTAGGTTGTTTACATTCAGAGCTCTATCAATAAGAGGAATACATA 5521 TTACAGTGAATTCGACAACCGCACAAGTTGGCAGTAGGTATCCCCAACCTAATTTATCTTGGTAAATTCACCCTGTTTCC 5601 TAGTGCTGCTGGATAAAAGAGTGTTTACTTTTTATTGCTCTTAGACAGAGTAGTCTAGATAAGTTTTCAATTTATCAACA 5681 TAGCCTAGACTTCTGTAAGTGGAATGTTCATTAGTAACTCATCTTTTTGTTGTTATAATTGGAAACAGAAACGAGGCTTA 5761 TTGCTATTGCAGAAATCCCAAACTGGCAAAGGCCAGTATATATGGTATTCCATAATATAACCAGCTTTTGAAATTTATGT 5841 GTTTGGATTAGTGCCTTCTGGTTACCAGTATTGACTCTGCTAGTTTGCACCTTTCCGTTCTTAACAGAAAATTTGTATTT 5921 GTTATTCCTCTTAAATTTTGTCGTAACTAGTGAAGGAAGTAAAAAAAAAAAAAAAACATGCATTACATTGACATACTTTA 6001 TGTGCAGCCTTTATTTAGGTTCAGTGAAACCAGGTAGTTCTGTATTTGTGTTGTAGCCTAAATGTTGTTTCTTTTATATC 6081 CATTAAAAACTTAAAGTTACTTATGTTCTGTGATCTTAATTTTGTTGTGTTTCCATTGTAGGTTGATAGGTATATCGAGA 6161 ACAGGTACGTGACAACAGTTTATATTCCATGATAGAAAGCTAAAGTCCATAGAAAGCACAAAATCGTGTTCACACATTAG 6241 TGTACCCACACATAGAAAGCACAAGACTAATAGTATTCTCTGTATCCCACAAGTGCCAGTCATAAAGGCCACCAGGTATT 6321 TGTCTCAGAGTTGCTATGAGCACTACAGTATTGATAAGCCCAAGACAATGCGGTATCTAAACTGGTCCTAATGGTAAGGG 6401 ACCCAAAGGAATAATCTCAATAAGTTTGTACCACATTGATGGAGGGAGAGAATATAAATGTCAAGAATGCCAAAATTATA 6481 TTTGGGGGTTACTAGCTAAAATGGGGTTTGAGGGCTTTTTACTGCAACTTGAAACTGGAGAAATAGGGACAGATGTCTAG 6561 GTTTTTGGTGGGTGGAACAGGTGACATATTTCTGTTTTAAGCTGTAGTGTGATTGGGGTTTTTTGTAAAAAATCTTAAAT 6641 CTTTTAGGAAATATTACCTCTTAACAGTGCCCCCCCAAACATGCAGAAAGTCATACTTTAACAGGGCAAATACTACTTGT 6721 CTTTGATTTTTTTTGTGTACGTTTGTATGTGAGAGATGAAGTTACCTTTATTTTTTTCCTATACTTGACTGTGCTTCATT 6801 TTAATAAAGGATAATTTGATCTGAGTGTTCTGAGCATCAGACTAATTCTGAAGCATATTTGCTAGAGGAGCTACTTTGCT 6881 TTTCACAATGGGGTGGAGAGGATTCTTTCACTTGTCCCATTAACCCTCTTCTAGTCTAGATGAGATGAAATCTGTTAATG 6961 TGTGTGTAGAAGAAAACGTATGTTCTTCTACTCAGCATTGCCCTTTTCCACCTCCTCACTTCACCTCCGAGTAGCTTGTT 7041 TATCAAGAATGAATGAATGTCTTTGTCTTAAATTTTGCCCATGTGTTAAAAGATGTAATTCTCAGAATGGGAGAGAAATG 7121 ACTACCTTTGTTCCTACTCTTTTATATAATTATCCTTTTAGGGAAAGACTTGGTCAACTCTAATATATCTAGAAGGAAGA 7201 CTATATCTGGTGTAGACTAATATGAGATGTTTTAGAAGAGTTAACCTGAACACTTTGAGGGAGAGATTATTCTTGCCAGC 7281 AAAAAGCTAGCCAGGAATGAGCCTACCACATTATTTGAGAATATCAAACCTCAGGCCTGGGGGGATGAGGGGAAGAAGAT 7361 TACCAGAAGTGCAGGAAAGAGAAGTTTGAGGAACACCCTTGGCTTAGCAACATGTGATAATGCAAAGCTGTTATAACCTG 7441 TTAATCCTACGTACTATGTGTTCTGTACCTTTACATGTTTTTAAATTTAAGATAGTTTGTAAGAACTGTACAAAAAAATG 7521 CTTCTGGAGATTTCTTTGGCAGAAATGCCTTTCATCTATAATTTCATGGAGAACTGCTTTAATTAGCCTAGGTGAAAAGT 7601 AGTCCTAGCAGTGTAAATATGTATAATTAGAGTTTTCTAATTTCACTGTGAGATCTCTAACTTTTGAGTGGCAAACAGAT 7681 CAAGTCTTTTGCTCATAGACTTTTCTGTGGGGTTATTAAAATGCAAAAGCTTTATTTTTTTTAATAATGCCATACTCCAT 7761 TAGTGTCAGATGATGGTATGGAATTTGTTCCCTTGCTTTCCCCCACTGTTACTGCTTCAGTTTATAGATTGCCAGCAGAG 7841 TTCAGAAATAGAGCAGGGATTTACCCGTTCTTTGCTTGGACATCCCATTTTCTTTTGTCCAGACCCATGTTGGCAATCAT 7921 GTATGAACTGTGTTATACTTCTCAGTGCTTTCTTTTTTCTTTTTGATAAGATGGATATCAAAAATAGTTGCTGTGCAAAA 8001 GTTAGTAGTCTTCTTCAAGAAGAAAACCAATTCTTTTTCTAATAATATCCTGTGAAATTGCTTCATTCATTCATTTATTT 8081 TTAAGCCAAATGTCAGCAGAGTGCTGCTGCTTTTATCTAGTAATTTTGATATGTAAGTATTAATGCATTTTTAAAAGATG 8161 TCTACATTGAAACATGTTCTTCCCAGTGTCCTGCTTATGATGCTTTGTTCAGATTTTTTGTAAGAGACCAGTTAGTACAC 8241 TGGGGGTGTATATTGTGTACATGTGTCATTTTAGTTAGGCATTGTAGGCCAAATGTGATTATAAATGAAGTTGATGAACA 8321 TTAATTTTGTTATTAGTGAGTTTTTTGAATTGTAAATGGATTTCCAGTTTACCTTCTGTTGTCTACAGCTTTTTTAATTT 8401 TAAGGTTTGACTAATTGTATCCATCTCATTGTACAGTGTTTTAGTTGCAAGCAGAAAGTAGAATTTGGTATAAAGCAGGT 8481 TATTTCTATATTGAAAGGAGTACAGTTGAAATTGTAGATTTAAGATTGTTAAAATCATGACAATTCTAACTTGTCTATTC 8561 TAACCTATTGTGTACAATCTGATTTTTTAAAATTGTAAACATGTATGATCTTGGTTTCATGTGTTTTTGAAAGTGTTATT 8641 GTTTAAAAAATGAAAAAAGCATATCTGCTAAAGAGCTGTCAGTTTTCATTACTGACTCTGTAAAATACACTGTTCTTTGT 8721 GTACTGTGTGTTATTTTGCCAGCTGCTGCATTAGCCTTCAAAAGTATTTGGAAACTTAAGATGAACTACATTTCTTGCAA 8801 AGTACATTCCTTTCTGTGGTATTTTGTCCTGTAACTGAAGTATAGTAATTATTTTATGGAAATGTTAGCAATTCTGTACC 8881 AACTTTGAATAAAATGAAAAATTTATA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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