Gene Symbol |
CSRNP3
|
Synonyms |
FAM130A2, PPP1R73, TAIP-2, TAIP2 |
Description |
cysteine and serine rich nuclear protein 3 |
Transcript |
NM_001172173
|
Other Transcripts |
NM_024969
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on CSRNP3 |
|
3'UTR of CSRNP3 (miRNA target sites are highlighted) |
>CSRNP3|NM_001172173|3'UTR
1 TAGCTTAAATTATTCTAGGACCAACTCTTCTCTTATTTAAGGCACTGTATTTAATTGGATTTCCTGGGCTCATCATTGTT
81 TAAACTGAAGACCAAGAAAACTTGGACGGTGGTTAATCTTCCAGACTGTATTTTGTTTTTTCCTTTCTAGCCACATGACT
161 GTGGCATTGCACAAATACAGTCTCTGTAGGGATTTTAAAAGATTTCAGACTGTTTTGATAGAAAAAGCTAAATTTTAAAA
241 TGCATATCTCACAGTTGCCTACCTGTCAAACTGTGTGAAACCTGCCAATCTGTGTAGATCAGAGCTCCAAATTTTGGATT
321 ATCGGGCCTGTGCAAGATTGTTAACTAAGGCTGGGAAATAATAAGATTTAGAGTCCTAATTTTCAATATATCTGAAGATA
401 ATGATGACTTTTTAATGTAAAAGTAATTATTGTAAGAAAAAGATTTAATTGTTCCATGTGTATTTTATTTATGGTAGTTT
481 AGAAGACATGTTTTGATGAAAATGAACAGCCGCATGTTCATTCAAGCTGAAGATGCATAGCTAGTTCCACAGAGCATGCC
561 CACATGGATTGCATCTGGAATCCATTCACATTTTTATGATCATGACTGATCAGATTTGCAAATTCTTAAGGGTGAAATAG
641 GCCTATTTTTGCTATTTTGGACAAATAAATGATTCTATATGTGCAGGTCCTTACACAGTTTTCTCTAAAGTTAAGAGTTA
721 GGACAATCCTCTGGGGAGAGTCTAGTTCACTGCCCTCCCTCAGCTGACTCCAGAGATGGAGGTAGAAGGAATTGCCTTTC
801 TTTTTTAAACAGCATCATCTTGATTCTTAGCTTGGACAGCACCTTTAAGCTCTACCCCCTACATCAAAATGCACTTTAGT
881 GCCCCTTCACGGTACCTCGTGTGGGGTGGGGACTGAGAACTCTTTGAGATGAAAAAATTTAAAAAAAAATTAAAAAGATC
961 TTTAACTATTATAAGGTTCATATAATTAATATAGAGGAATCATCCAATGATACTTATGAAGGGAAAATGACCTATTTTCC
1041 TTCACCACTCTGAGGACCTAACTCAGTAAATGCAGAGGAGGCTGAGGAAACATGGAAGAGACACGACCTCAGCAACCAGC
1121 CTTTTCTCCAGCGTGATCAATCCATCTCTACAAAATCAGTGTATAATGAGATTTCCACTTAGTGACTAGCTGATTGAAGG
1201 GGGGCCTCTACCCAAATACTCAACTAGGCCTTTCTTTTCTGAAGCATTTTGATTTGTCTTGCCTGGGACAACTAGCAGAA
1281 CAGTCCAGAATGCATTGCATACTTTCTAATTACCTCACATTCTCTTATTAAAGAGAACAGATAGAAATAAAACATGCACT
1361 CCCCACCTTTAGATTACCTGCACTTGGTTCGTCGGAGGACTTCTAGGATCCCGTTTCCCTGTAAATTAATTTAGGTAACT
1441 AAATAGTGTAATTCTGCCTTTTTTTTTCCAATGCAATATGACTATGCTAAACCTGTTTCATATTTTTGACCTTCTATTGT
1521 TATATCACTTCACATGTTTTATAACTATTTGAAATGCGGACATGACTTGCTATTCAGTGACTGCATCGCTACTTATTTTT
1601 TATGTCTTTTAGACTTGGGTGTTTAGAATTATGGATATAAATATATTGTAGATCTCAATTTCTAAAAAAAATATTTTATT
1681 TAATTGAACTTAAAAATGCTTGATCTAGAGAAAGTCCTCCAGTGGAAAAGTTTCTACTAAACTTTGTTTTGGGGAAAAAA
1761 TGTTTACTTGGCAGCTCTTCCACTGTGCAGTTGGTTTCTGCCCCTTCTCTTCCCCCCTACATTGGGCCAAATTTATAACT
1841 CTTAATATTAACATTAAAAGAGCTTTGGGTTTGTCTTTATGTAGGTTGCAGTAATGAGAGCAGGGTTGTTCCTTTTGAAT
1921 GATTGGCCCTTTGGGCTAATCAGAATGAGGATTTGTTGAAATCTCAAATATACATATATATATATATATATATATATATA
2001 TATATATACACACACACACACACATACACATATATATACACATATATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATA
2081 TATATATATCCCATGTTGTCTGCAAAGTGACAGTTTTTAGTGCTTAATCTCCAAAATTTTCCCCCTACTGATACAATCTA
2161 AAGAGCACAGGCCCAAAGAGAAAATGACAAGAGGCTATTGTTCCTTCATTCAAGCACATGAAAGGATCATGTGTACTGTA
2241 TTTGCTGGACCATTACAAGCTCTTGAAGGATCTGCTTGTGAAGTACTCTGAGGTTATTCTTGGAACACAGAGTGTGGGAG
2321 AGTGGGGAAGAGCCAGCTCCAGCCTGAGCAAAGCTGAAGGGTAGAATGACAGTCCAGTTTCTGAAAAGAGATATTTTAAT
2401 TTTAGTTCAGCTTTATTTTCCTAAGACGATATGAAGCCTACTTTTTTATTTTTGGCTAGGTCTTTGTTTTCTAGCTTTGT
2481 TTCCAAAAGGATGCTTAAGAAAACAGAGTTTTTTTCCCCTATCCATTTATCTAGGGTAGAAAGTCACTGCCCTGTGAGAA
2561 GAATTACCCTTCCAATCATGACAGCTTCTATTCCAACTTTTCATATACCTGACTAACCTGTAAACATATCCCACAAACCA
2641 CATACACAGGCTACCTATTAAAACTCTCCCATATACCTAACACATACACATGCACACACATACAAAATATATACATATCA
2721 CACACTTAGAGAATGACAGATTTCAGGCAATGGCCAATAGTCAGTATTGAGTTTTTCTAACCCCAGAATCTGGTTGGGCT
2801 TTATGATCTAAAAAAATGTGGTTTAGAAAAGAGGATAATTGGTAGAGCTGTAGTTTGAAAATATCAGGTCAAAGTTGCAA
2881 ACATACTTATGATGGAATCATTTCATTTTTAGTTCCTTTCCCAGAAAAGCTGAGAGAGCACACTGTTCCAGCTGACTTTT
2961 TTTTCCATTAATAGCCGTTCTATTCAACAAAGAGCTGCCCACATGCCAGGAAAGTGCTACAGTCCTTCTAAGCTTTTAAA
3041 AATGGGGATCAAGCTACATGCAGCCAGTTGGAATACTTAAGATCTTTATGCCAAGACACAATAACCTGACCTGCAGCTGT
3121 TGTATTGCCTCCATAGTATATCTAGCCAAACTGTAGTCTTTGACACACAACTTTTTAGTCATTCACTATCAATTGCAAAG
3201 CTTCATGCTCCAGCCCTGGCTATTCTAGTACCAGTCCTATACCTTTAAATGGGACTTAATTCCCAGTTATAATCCTGGCC
3281 GAATTGATTTGAAAGTCAAGTGGCTGAAGCAGCTTGCATCTCCTTTGTCATTCCCAATTTCCTTTGGGAGAAGTCAATGA
3361 AAGAGATTTACTTAAGTTTTTCCTCCTTATCTCTTGATCATTAATTATTAAGACATGGGTAAAATTCATTTGTCTCATGT
3441 CTTTTGGTTGATTGAATAATATAGTTACTTTTTGAAAGCCCATCATTTCTTTGTGATAAAACCATTTTCTCAATGTGACA
3521 GCCACATGTAAAATGTGAAACTAATGTTTCTTAGTATGTTTAAAATCTTCACAATCATATATGGCCCTGCAATACTCCCT
3601 GAATTCCTTCCCTCCAAAAAAAAACTATGAGTTGCAAAAACACTAGTTACGAATTAATCAAGAAGCAAAGAGAGTATGTT
3681 AAGTGGCTATGTTCTTTAAAATTTTACATTCTAATAGATGACTTCTAGGCAAAATTTTGGTATGATTACCATTAAACAGG
3761 AAAACATACCATGATTTACTTTCTATAACTTGCTAATCACTGTTTCTTTTATTTCAATTTTTGATATTGTTGCACAAGTT
3841 TATGACTCTTTGGTCTTTATATTCAAAATTTATTAAGTATCAATTCTTTCTTTCAACAAATATGTACTGAACACATGCTG
3921 TGTTAGAACAACTGTCTTGGGTAGTAAAAAGAGGGGAACACTACAAATTATAATGGATAATATTAATGAAGGGTGGCATG
4001 AAATAATCAAGCTTTCTCAAATCCTCTTAATATGTGATTTTATCAAGTGACATTAGAAAAACTGACATCAGTTCTTGTCT
4081 AATTATATGTGAGCTGCAACTAAAAGATGCTTCCTTTACCTAAATTATAGAACTCACTGGATCGCCCTTCATCTCTCTCC
4161 CTCCATCTGAAATGTATGAATTAAATCAGGACTCAGCTAGGACTGAATCAAATGAAAAAGAAATTTTCGATTAATTGCTT
4241 CTTCAATGTTAGACCTATATAAGTGATGCTAAATTTACACCAGCAAACTCCTATCAGACAGTTTCAAGGAGGATTTGACT
4321 CATGCATAACCCAGGAAACATTTCAGGAAACTTTTAAGACAACAGTGTGGAACACAATCACTCTTACTTCTATTTATAAA
4401 AAGCCTATCAAAACAGCAAAATCCTGTTGCAAATTCCAAAGACATCACTTTGCAGCAGGTGGAAAACAGAGAGGTTGTTA
4481 GACTCCATCACTTTCAGCTGGAGTTACAAACCATCAAATTAGCAGGTGGAAAATTTATATTCTCAGAAGCCAACAGGAGA
4561 CTGCCTTTTTAAAAGGTGTCATGAAGCCTTCTATTTCTCCAAACAACTCAATATTTCTCTTTAAAATGGCATCTCTGTTC
4641 CTTATTCTCTTGATGACAGTTTGCAGTGCCATTATAGCCAGTGTATTAAATACCAGGCTTTAATGGGAAGCACCTTTGTG
4721 CTTTCAAAGGCAAGACTTGTCTGTAATTTTAAATTAGAACTGTTGGTTGTATTCTTACCACAACCAAAACCCAAAGTTTA
4801 AAGGCTTGATTACTCTATATTAGGTCTAATATGAATTTTCACCTTCTGATTGCATTACTTTTTCTGAAATCTGCTAACTA
4881 GTGCTGGAATAACAAAAATGCCTAAGCCAAAATGCTGTAGCTCTGCACCAACAGCACAGCTCATCAGATGTTTTCTATAG
4961 TAGTAAAGAATTTGATTGACTTAATTGAATATCAGCAATTTTAATACCCACTAGAATTATGGAAGTATCAGAGTGGAAGT
5041 GAGGACGCAATAAAAGCTTAATAAGTGGTGGTGTCTTCTAGGAATTATGAAAAAAAAAGCTCAGCAGAGCTAAGCCAGAT
5121 CTTATTACATCATAAAGACTAGAGTTACAAATGGCAGCCCCAAACCTAGAAGGGGCAGTTACAATGTGGACACCCTTTCA
5201 GCCCAGTTGGTGCTCACATCTGCTGACCAACATTCATATCAATTACATTTTTACAGTCTGTAAGTCATTTGATGCTTTAG
5281 AAAATAAAAACACACACCTACAGCATTCTAAAGAAACTATTTTGTTAAAAAATTTAAACACATTTTATATTAAAATAAGT
5361 GATCAATGACTTTCATGATTGTCAAAAGTAAAAAGTGCAGACATTTAAAAAAGCTCTTCTTTCACATTTTACCTACCAAA
5441 TCTAGATATTCAACGTGAGTCCTTAAAACAGTCACTTCTAAATTTTATTTTGACTCCTTTCTTGGCTTTTTCAAACTGGA
5521 CCATGAGACCCCCTTCCTAAACAATGCAGTTGTTTTGTTTTATTCTTTTTTTCCAGAAATTCAAGCTGAAACATTTGATA
5601 TGACCTGTGTTTTACCTGGTGATCAGTTCTCAGGCTAGTCTAAGTCTGTGCTGTCTTGGCATGCCTTGGGTTTCCTATCC
5681 TGAGAGTGGTAATGCCAGTAGAATGATGGGAACCAGGAGAGTGAATACGACCAGATTCAAAGCCTAAAACAATATGTTTC
5761 AGTTTACTTTTATATGTAGATTTTTTAAATATTCACATCTAGCCTGGAATTTTAGTAAATACAGATACTTGTTGTATCCA
5841 TGGGAAATGAGGTCATTTCAAAGATGTAAGTCACGTTGGTGACTACTTTCTTTTACTTGTGATAAATATATCACTATACA
5921 GGGTAATTGCTTTTATAAATTTGATCCTTTGCATTGGCTTATAATTCAAGAAATGTCAACTTCACTGTGTCACTTTATGT
6001 CATCTCTCATAAAAGTTTCTGGCAGGACTAAAGTTTCAAAGGAATGTGATAGAATTTATTTTGGATAACATTTGTATTCA
6081 GCATGCTAATGATGTAACTCCTCTCTTTATCATTACCACGGTGATAGTTAAGTTCATTCGTTAACTCATTTTAGTGACAT
6161 GTGAGGCCATTTAAATATTTTTAAGATAATGTATATTGATTAGAAAGGGTTAGAAGGAGACAAATTTATGGTAGAAATTA
6241 GCCTTGCCATTGTCTAAGTTAATTTATGTGACCTGATTGAACAGTTTTAGTTGTAACTTTAGAGTAGCTTCTTTGTTAGA
6321 GGATCTCTTTCCTTTCTCTTTTGGTTTTCTCCCAATATTTTTATCTGTCTTGGGATTATCTTAAAAGGTATTTATTAATG
6401 AGTATTTGGAAGAAAATTGACCTAGAAAATGTCTCTTTTAAATTTATCTAGGTACTTGTATCACCAGAGACCTTCATCAA
6481 GTCCTACTGCCACACTGGATAAGGCCACTACCCCCGACCCTTCTTGTCAGGGACATGGCTTCCTAATAATGGTTTTGCTG
6561 TTGTCTCTACATAGGGGACCTATGGAAAAGGAGTTTGAAATTTCTACCTTTGTAGTACATTGTATCCAATTTTGTTTTGC
6641 TCCTCCTTTTCATGTGGTCACCAAGCTTTTTTCCTTAGCCATTAAAAAAGCCACCCCTCTTTAAAACAAATTTAAAGATC
6721 TATATACATTTTTGCAACTTTATTTAATAAAAAAGAGAAGAAAAAATAAAATCTAAATCTCAATTACCCTAAAGTGGAAA
6801 AACCTAAGTATCTAACCTAGGAACTTGTTGCCTGGTGGTGGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTTTAATTTATTTAGTGTTGAT
6881 CCTTGAGTTATTTAATGGTATCCAAATGATATCTGAAAGTGATTGATTTTAAGATGTAATAGTTGGCAAAGTCATTTCAT
6961 TTGTGTCTCAAACAAATAAAGCCCACTGCCATGGGTTACCATCTGAACCCTGATTCATTAGGCACTAGTCATGCCAAATG
7041 GGGATCTCAGAATAGTTTAATCTTTTCAAAGATACTCACAATGGCCAACTGTGTGTGAATACTGGAAAGTTTGAGATTCT
7121 TCTATATTCTTCAAATTTATGGTCCTGAGACTAGGAGGGATCTCCAGAGGTCATATGGCTCATCGATCTACCACCAGGGA
7201 AGACTGTCACTTAGGCATGCCCAACAGGAGAGATCGCCATCTATTCTTAACATCTCTAGGGAAGGCAGTTTCCTTGGCAA
7281 CACAATTCAGCTCTCTTAGGTTTTCTCACAATAAGAAAATATCTTGGCCAGTCTTTGAGGGTTAGGCACCTGGCAACAGT
7361 TGTGGTGATTTGGGCCATTGTACTAGGGGATTCAAGGGAAGTTGGGTTTCCCCCTACATTTGGTGATTATTACATTAATA
7441 TATGATCATTCCATAAGTCTCCTAAGAAATCAGATTTTTAAAGAAAGACACGGATTCAGAGACAATGGTCTGTAACATGA
7521 CCAACTTTTGACAAATATGGCTGTACTAGGTTTTCATTTTTGCTGTTGTTGTTGTTTGTTTTTGTGATTGCTCTTATGTC
7601 GGTAGGTAATGTCAGGAAAAGTGACTGTTTCAGATCCCCAGTACAAACATCAGAACTAGGATCAAATGACTTGACTTTTA
7681 AGCTGTTCCATTTTCTAAGAAGTTACAATTACAAAAAGTAAGCATTTTCTACATTCTTACTTCTAAGTAATGACCTTCTC
7761 ATTAATCTTTCCTTGGCTTAAAATGACAAATAAGAATCCAAAGTTTTTCCACTCCTCCTGTGGGAGATAGGAATAGTTGT
7841 GAAGAGTCTGATGGAATAAAATGACTCCAGAGATTTACACAGCCACCATTTGATCCCAGCCTTTGTCCTTGTGTTATTTA
7921 AACAATGGCTTCCTGCTTTCTCAGGGGTCAGGAAAATGATTTAAAAATTTGTCTTCTTGACAAGGCCTGAAAACGAAGGG
8001 AGGTGTCGTGGAGAAATGGTGATTTTTCTGGTTACATCACTTGATTCAAGCACTCCCTGGAGCTTTCAAAGCCTTTTTTA
8081 TCTGCTCAGAGTTGACACCCAACTCAGAGTCAGAACTCACCAGAAGATGAGGAACACCCCCGAAATCAATGTTTCCTTTC
8161 TCCATGGGATTTTTTTCAATCTTGGTACAGCTGCATATCTCCCAAACTCGGATGCTCTTGTGAAATGACAGCCACATCAG
8241 TGTGGTTACTCCCCACAAATAACACTAGGGGGAAATGACCTTTTTTATTTAAAAAAAAAAAAAAGGCTAATGCTATAGAA
8321 TGATCATGTAAAGAATGTTGAATAAAATTTGGCCCATGTTTTAATTGACTCTAGGCACCTCTATTGAAATAAGTCTGAGG
8401 CATAGTTTGTGAAACATGTTTCAAAAGTGTTTGATGTATAATAAATGCTAGAAATTTACAGTACAGAAATAGTAAAAAAA
8481 TAAAATAAAAATAAACCTGTAGATTACAGCTCTGTTCCTAAGAACCTCAGCCTTTATTGTGTCTTAGTAAAGTTGATCTG
8561 CTTTATTTTTAGTTTATTGAATTTCTGGTGTACTAGCCTCTTAAGATAGAACTTTTAATACATATGTACTGGTTAATGCC
8641 TGTTTACGCAGAAAATGGCACTTTGTTCTTTCAGTGTGTTTCCCTCAGTGTCACAGGGTATATCAATTTGATAGATCATT
8721 TGACATTTGTCAAAAATACGTTTCCCATTTTAAAAATATGTATAATTGGTTGCATAGACATATGTCACTTTTTGCAGTGT
8801 CTTCATCTTGATCATAGTTTTAGACATCAACTATGTCTCACTTTCCAACTGCCATAGAAATTTGGTACATTTGCAAATTC
8881 TGGTGGAATCTAGTGAGCTGAATGTATTGGTAGATCAAATGATCCAAAGGACTTGGGTGTTATCCTTCAGTCTGTGTTGA
8961 ACCATTCAGATATTGGGAATGGTCCTTACACAAGGGAAGTCTTTTGAGAATATTTGTTCTCTTATTTTTTGTTTGTTTGT
9041 TGCTGGCAAAAAAAAAAGTAACTTTAAAAACTCAGAAAAGCCACTGAACTGTATTTTGTGACCTTATGATTAGTTTTATC
9121 TTTCAACTGATTTTTATTGTTACTTTTACTCAATATCAACAGTACTTCAATAGATATTTATTAGTTATGTTCAATCTAAT
9201 GACTTAAAACAGTTGAAAAGGAGGAAAATCAACTCCAGTCCACACATACAGTCATGTTACATTAAGATGTCATGTTGTAT
9281 GTCACACAGTTTCTAGATTGATTTCTCTTGTGTATAAGTTATAACATCAAAAATGCCAAAGGGTATATAAAATAAGCTAC
9361 AATAATATTCAACAGAACTTAACCTGGACCTTATGTTGTAATAATTTATTCATATTAGCTGTAGTCTTCTGTATTTATAT
9441 TTTCAGTATTTATTATGAATGACATGGAAATTCGTGTATTTATTGTGGCTTTTTATTGCAGTGTGTATATATATATAACA
9521 AATAAGCATTTTTAAGTCTTATCCTTAAGTTTCTTTTATTAGTGGCACTTGTATTATGCTGTACTTTTTATTACATATTG
9601 TACAATATCTTGTCCATTTGTTTGCAGCAGAGTAAAACCGGTTTCTAAGTTGTA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' aggguccuUGGUACUAUAGUGu 5'
|:::| |||||||
Target 5' gaccttctATTGTTATATCACt 3'
|
1508 - 1529
|
150.00 |
-9.70 |
2
|
miRNA 3' agGGUCCUUGGUACUAUAGUGu 5'
|: | :|: | |||||||
Target 5' taCTTGTGATAAATATATCACt 3'
|
5894 - 5915
|
148.00 |
-8.70 |
3
|
miRNA 3' agGGUCCUUGGUACUAUAGUGu 5'
|:||| || | :||||||
Target 5' atCTAGGTAC--TTGTATCACc 3'
|
6446 - 6465
|
144.00 |
-15.10 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|