pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-548am |
Genomic Coordinates | chrX: 16627012 - 16627085 |
Description | Homo sapiens miR-548am stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-548am-5p | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 10| AAAAGUAAUUGCGGUUUUUGCC |31 | ||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Not_experimental | ||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | |||||||||||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | PDE12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2'-PDE, 2-PDE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | phosphodiesterase 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_177966 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on PDE12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of PDE12 (miRNA target sites are highlighted) |
>PDE12|NM_177966|3'UTR 1 ATGTGTGTTTAATGGAATTGAAGTCTGAAAAGGAAGTAGTTATTTTAGCAGAAAATTTAATATGAATCAAAGCTTATATG 81 TAAACTTCAAGGAGGAATGGTAAAATGTTCAGCCCTCCTAGTTATGTTCCTGATGTCTTCGTTATGAAACTGTTGATGTT 161 TGCATCATACATCTTCTCTTTCCTTGTTTTCCTCTACAATTGGAGGAGAAACAAATATATTTCTTACTAGCAAAATAGAA 241 AATTGAATTATTTTTCTCCAAATTGAGACTCTCAGAAAAGGAAGATTGAATTAGCGTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGT 321 TTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACAATCTCGGCTCACTGC 401 AACCTCCGCCCCCTGGGTTTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCGCCAACATGT 481 CTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAAATGGGGTTTCGCCACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTG 561 ATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCCTTGTGTACATTTTTATAA 641 GAGAATTTTTTTAGCTAGGAGTTCAGAATTTTTAAAGTACCATTTGAATGATCTTAATTTTTCTTTCATGACAACACATT 721 CCAAAATGAATCATGCTTATGTACTAAGAGGGAAAATGTATTTAAGTTAAGGGTGAGAGACTTAAGTTATAGGTGACCTT 801 AGAGACCTAAGGTGAGAGACTTGACACATGGAAGGAGTAACATTAGGGTCTACCTCTACCTCAATTTAGTTAGCGATTTA 881 CTACAATTTCAGAGCTTTAACAAAAGATAAAAATAAATCGTCACCAATTGTTATTGCTTCTCATCTTTCATTTTTCAATG 961 AACAAGTAAGGTATTTTCATTCTTATTTTTAGGATTTTAGTTTTTAGTGTATGGTACAAATGAACACAGTTTATATTCTA 1041 ATTCTTACTGCAGCTCATTTTAATTTTTAGGATGCAAGCACAATTTAGTATTCAAAGTGAGTAGCAACATATTCAACTTG 1121 ATCCCATTGTCTTCAGTTACTCTTGCCCATGAAAAATGTTCATAAATGAACAGGGTATTTGACCATATGATATTAGAAAA 1201 TACAGCACATTACTTTATGAGAAACTACCTACTGATATGGGCTTGAAATTTTGGATGAATCATTGAGCATTTCTACACTA 1281 GAAGTAATTTCAAAATTGTTGGTTTTTATAAACAGGAAAAAGGTTGAGTAGTGGGACTTTTAAGCATCTCTGAAATAAAA 1361 AACTTCTTTTTACAGACAAGCATTATAGTTTGAGTTACAGACAACAGTGTGTATATATGTAATATATATATAGTAAAATG 1441 AAATTTAAATATGAAGCCAAACTTTTTAAAATTAGAAACTACAAATGGTTATACTGATTAGTGTCTAGCCTAGAGTGGTA 1521 ACCATGCTTTACTAATTCAGTTATGAAATACATTATTTATAATGCATTAGCTGTATTAGCTGTTGCTTTTTTGATGTTCA 1601 GGATAACTATGTTATCTCATTTCTGCATTTAATTAATAGCTCGAGTATTAAAAGCCCACTCCCTTCAAGAAAAGCTTTGA 1681 TTTTCCCCAGTCATGAAAGCCCTTGTTTCAAATTCTTTAATCTCTGAACCTAGTATCATAAGAATTTCCTCTTTTGATAA 1761 CATCTGTACTTTCATATTCTGCTCACTATCAAATGTATTGTTAACACTTAGTAAGTTTGAAAATGAAGGGGTTTTATCTG 1841 CATTTGACATTGAACCTTGAAGTACTTTAAGTACTCCAAGGGGAAAATTAAAGTGGAAGTTTCTTCGGATCTTGTTTAGA 1921 AAAAACTATAAATAAAAAATTGATGCTACCAAATTGTGCCTTCCTAAATAACATTTTTGAGAGCATTTTAACAGCAGTTT 2001 ACAAATATGTAAATAATAGATTAAAACCAAATCTTGATTCTCTTGTGAATTTTTTTTTCATTTTAAAAATATGTTTTTGG 2081 GCTGTTTTCAAAGAAAGATGTTGATAGAACCCTTAGAGTGACTTGGGAGAAAACAAAGTGTCACATCAAAAAGTTGAGAA 2161 ACATTTTGAAAGAAAAAATTCGAACATGCCCATGAAAAAAGCATACAGCTTCCACATTAACACTGGCTAGATTAAACTCT 2241 AGTCAGAAAAACTCAGCACTTAACAGACATTCCATGTCCTATATCCTTAATTTTGATGTTTTCTGACTAAACAATATACT 2321 CAGATTGTATACAGGCATTTCACATTATTAGGACATGGAATGTTATTGTGAAGTGCCATATACTGTGATCAAATCTCCAG 2401 TATACGGATACGTTAAAATGATTGGAGTCCAAAGGTAGGGAACACTAAGAAAATGTATAAATAGCATACACATTTCTTTG 2481 TACTCATGAGTTAGAATGCAGTGTTATTCAGAAATGTCTGTTTAAAGCACCTATGTGATTGCATTTTTCTATTACATTTG 2561 GATTTTTTAGTACATTTAATTTTAAGAAAACATGGGAAATCTAGCGACTTTCTATGGTAAACCACATTTTATAATGTCAC 2641 AAGTTCTTGCTATAGGAATTAACATTCTAGAATTTTATATTGATTATAAAAGAGTATTTCAGAACATATTATTCTGTTAA 2721 AATGAACTCTTGCACAGTTGCCGCTACAGCAAATGTGTCTGCCAATAATCAAAATTCATGAGCAAACAATCGTTTCTGGC 2801 TGTAATGTATGTTCTTTTTGAAATTCTGTATGCTAAAATCAGTTGTTTCAAAATTTCAAGAATTCCACTGAGTAGTGATT 2881 TTTCTGAGTACTAAGCTATGATCTCATCAGAATGTGCTGGTTTCAGTCTGGAGATAGATTTCTGAGGAGCCTAATACAAG 2961 GGAGAGAATGTCCAAAGAACACTACTGTGGAAAGTTCTTACGATGGAAATTGACATCTTTTGTATCTCATTCTCCAGCCG 3041 TGAAATAAAGGCAGAGGTTCCCTGCAAACTAGTTTGGTTGGGATAAATCCAATATTTATATATAATGAAAAATAAAAGTT 3121 TGCATTATTAGTTTATCACAAGACCCATGTGACAACTCAGAAAATATTCTCAGCATAATTTTTTTAAGAGATAGAGTCTC 3201 ACTGTTACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCATAACTTACTACAGCCTCAAACTGCGGGGCTCAAATGATCCTCCTG 3281 CCTCAGCGTCCCAAGTAGTTGAGATTACAAGCCCAACCTTCCATAACTGAAAACTAACTTTCTTTTTTTCTTTTTTTATT 3361 ATTATACTTTAAGTTCTAGTGTACATGTGCCCAACGTGCAGATTTGTTACATAGGTATACATGTGCCATGTTGGTTTGCT 3441 GCACCCGTTAACTCGTCATTTACATTAGGTATTTCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCAGCCCTGAAAATGAATTTTTTAAA 3521 CACAAATAAAAAATATTTCAGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | HEK293 |
Disease | 201626.0 |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
"PAR-CLIP data was present in GSM714645. RNA binding protein: AGO2. Condition:completeT1
... - Kishore S; Jaskiewicz L; Burger L; Hausser et al., 2011, Nature methods. |
Article |
- Kishore S; Jaskiewicz L; Burger L; Hausser et al. - Nature methods, 2011
Cross-linking and immunoprecipitation (CLIP) is increasingly used to map transcriptome-wide binding sites of RNA-binding proteins. We developed a method for CLIP data analysis, and applied it to compare CLIP with photoactivatable ribonucleoside-enhanced CLIP (PAR-CLIP) and to uncover how differences in cross-linking and ribonuclease digestion affect the identified sites. We found only small differences in accuracies of these methods in identifying binding sites of HuR, which binds low-complexity sequences, and Argonaute 2, which has a complex binding specificity. We found that cross-link-induced mutations led to single-nucleotide resolution for both PAR-CLIP and CLIP. Our results confirm the expectation from original CLIP publications that RNA-binding proteins do not protect their binding sites sufficiently under the denaturing conditions used during the CLIP procedure, and we show that extensive digestion with sequence-specific RNases strongly biases the recovered binding sites. This bias can be substantially reduced by milder nuclease digestion conditions.
LinkOut: [PMID: 21572407]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM714645 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / completeT1, repB |
Location of target site | ENST00000311180.8 | 3UTR | UUUCUUUUUUUAUUAUUAUACUUUAAG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 21572407 / GSE28865 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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184 hsa-miR-548am-5p Target Genes:
Functional analysis:
ID![]() |
Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT057132 | DDIT4 | DNA damage inducible transcript 4 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT063379 | ETNK1 | ethanolamine kinase 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT072501 | RAB8B | RAB8B, member RAS oncogene family | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT082193 | ACTN4 | actinin alpha 4 | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT083043 | PTBP1 | polypyrimidine tract binding protein 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT085196 | SLC5A3 | solute carrier family 5 member 3 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT088913 | FOXN2 | forkhead box N2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT089506 | MTHFD2 | methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT092047 | ABHD5 | abhydrolase domain containing 5 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT094692 | FEM1C | fem-1 homolog C | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT095403 | UBE2D2 | ubiquitin conjugating enzyme E2 D2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT096509 | BRIX1 | BRX1, biogenesis of ribosomes | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT101303 | FAM135A | family with sequence similarity 135 member A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT103366 | CBX3 | chromobox 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT103883 | FOXK1 | forkhead box K1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT104343 | CLDN12 | claudin 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT104508 | PEG10 | paternally expressed 10 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT111808 | MPZL1 | myelin protein zero like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT177246 | BMI1 | BMI1 proto-oncogene, polycomb ring finger | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT177281 | COMMD3-BMI1 | COMMD3-BMI1 readthrough | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT177633 | UBE2D1 | ubiquitin conjugating enzyme E2 D1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT178049 | SAMD8 | sterile alpha motif domain containing 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT179109 | PAFAH1B2 | platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT179594 | CAPZA1 | capping actin protein of muscle Z-line alpha subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT195307 | LEPROT | leptin receptor overlapping transcript | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT203152 | BACH1 | BTB domain and CNC homolog 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT208437 | ZBTB38 | zinc finger and BTB domain containing 38 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT214585 | SMAD5 | SMAD family member 5 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT216112 | IL6ST | interleukin 6 signal transducer | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT216363 | CCNB1 | cyclin B1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT220059 | MDFIC | MyoD family inhibitor domain containing | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT226737 | ANP32B | acidic nuclear phosphoprotein 32 family member B | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT227706 | TBC1D13 | TBC1 domain family member 13 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT230079 | SH3BGRL | SH3 domain binding glutamate rich protein like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT248644 | HMGN2 | high mobility group nucleosomal binding domain 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT254799 | XRCC6 | X-ray repair cross complementing 6 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT264388 | YAP1 | Yes associated protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT266982 | LRRC55 | leucine rich repeat containing 55 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT273957 | SPRYD4 | SPRY domain containing 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT281809 | MAP2K1 | mitogen-activated protein kinase kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT293262 | DR1 | down-regulator of transcription 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT297105 | RGPD4 | RANBP2-like and GRIP domain containing 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT308178 | PDE12 | phosphodiesterase 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT309022 | USP53 | ubiquitin specific peptidase 53 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT311477 | PRRC1 | proline rich coiled-coil 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT312595 | G3BP1 | G3BP stress granule assembly factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT328137 | ZNF711 | zinc finger protein 711 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT329321 | FAM53C | family with sequence similarity 53 member C | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT334649 | NEK7 | NIMA related kinase 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT340680 | THRAP3 | thyroid hormone receptor associated protein 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT378865 | ITGB8 | integrin subunit beta 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT395798 | SPCS3 | signal peptidase complex subunit 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT405648 | WBP4 | WW domain binding protein 4 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT408294 | GRPEL2 | GrpE like 2, mitochondrial | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442112 | ZNRF2 | zinc and ring finger 2 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT442855 | GTF2H5 | general transcription factor IIH subunit 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443131 | VLDLR | very low density lipoprotein receptor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443162 | ZDHHC21 | zinc finger DHHC-type containing 21 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443313 | PRPS1L1 | phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1-like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT445095 | ZNF207 | zinc finger protein 207 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT445399 | PTCHD1 | patched domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT447085 | MCC | mutated in colorectal cancers | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT447315 | ZNF562 | zinc finger protein 562 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT447528 | MRPS5 | mitochondrial ribosomal protein S5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT449526 | TM6SF1 | transmembrane 6 superfamily member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT449917 | C11orf34 | placenta expressed transcript 1 | ![]() |
1 | 2 | |||||||
MIRT450566 | SHFM1 | SEM1, 26S proteasome complex subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT450734 | PVRL3 | nectin cell adhesion molecule 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT454938 | ANKEF1 | ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 12 | ||||||
MIRT455907 | KIF2C | kinesin family member 2C | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT463747 | YWHAE | tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein epsilon | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT471197 | PHB2 | prohibitin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT472779 | MTMR6 | myotubularin related protein 6 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT474472 | KLHL11 | kelch like family member 11 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT476000 | GTPBP2 | GTP binding protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT482291 | AGO2 | argonaute 2, RISC catalytic component | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT485873 | ALG9 | ALG9, alpha-1,2-mannosyltransferase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT486207 | ERH | ERH, mRNA splicing and mitosis factor | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT488624 | FAM3C | family with sequence similarity 3 member C | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT489999 | DDB1 | damage specific DNA binding protein 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT493491 | IPMK | inositol polyphosphate multikinase | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT494295 | CEP120 | centrosomal protein 120 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT498007 | ZBTB20 | zinc finger and BTB domain containing 20 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT498488 | PTBP2 | polypyrimidine tract binding protein 2 | ![]() |
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2 | 10 | ||||||
MIRT498575 | TMEM30B | transmembrane protein 30B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT499882 | SVOP | SV2 related protein | ![]() |
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2 | 10 | ||||||
MIRT500235 | INHBA | inhibin beta A subunit | ![]() |
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2 | 10 | ||||||
MIRT500709 | TRIM37 | tripartite motif containing 37 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT501003 | SPPL2A | signal peptide peptidase like 2A | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT501038 | SMG1 | SMG1, nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT502751 | CLIP1 | CAP-Gly domain containing linker protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT502813 | CELSR3 | cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 3 | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT502903 | CDK4 | cyclin dependent kinase 4 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT503498 | ZNF154 | zinc finger protein 154 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT503732 | GRM5 | glutamate metabotropic receptor 5 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT505152 | YOD1 | YOD1 deubiquitinase | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT505817 | RSBN1 | round spermatid basic protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT505856 | POLR1B | RNA polymerase I subunit B | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT509299 | NPM3 | nucleophosmin/nucleoplasmin 3 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT516844 | CYP20A1 | cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT520534 | TRA2B | transformer 2 beta homolog | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT520738 | TM9SF3 | transmembrane 9 superfamily member 3 | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT525418 | SHISA9 | shisa family member 9 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT525882 | ARL13B | ADP ribosylation factor like GTPase 13B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT526028 | RBM4B | RNA binding motif protein 4B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT526099 | TMEM41B | transmembrane protein 41B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT527946 | FRY | FRY microtubule binding protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT528833 | RAB32 | RAB32, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT531077 | SLC9A4 | solute carrier family 9 member A4 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT535510 | PANX1 | pannexin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT536697 | IKZF5 | IKAROS family zinc finger 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT536850 | HMBOX1 | homeobox containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT537217 | GDE1 | glycerophosphodiester phosphodiesterase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT537849 | EFNA5 | ephrin A5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT538360 | CSE1L | chromosome segregation 1 like | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT541257 | GPC4 | glypican 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT543250 | PEX7 | peroxisomal biogenesis factor 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT543465 | PARP15 | poly(ADP-ribose) polymerase family member 15 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT543726 | XKR9 | XK related 9 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT543922 | ESYT1 | extended synaptotagmin 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT544014 | KLRC3 | killer cell lectin like receptor C3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT544085 | METTL8 | methyltransferase like 8 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT544202 | ANGPTL3 | angiopoietin like 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT544823 | ACSM2B | acyl-CoA synthetase medium chain family member 2B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT545061 | PRELID1 | PRELI domain containing 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT545229 | HIST1H2BD | histone cluster 1 H2B family member d | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT545304 | SPC25 | SPC25, NDC80 kinetochore complex component | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT545565 | GIMAP4 | GTPase, IMAP family member 4 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT546512 | SIK1 | salt inducible kinase 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT546929 | PTP4A1 | protein tyrosine phosphatase type IVA, member 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT547690 | KPNA1 | karyopherin subunit alpha 1 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT547783 | KATNAL1 | katanin catalytic subunit A1 like 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT548702 | CRNKL1 | crooked neck pre-mRNA splicing factor 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT548916 | CHEK2 | checkpoint kinase 2 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT549972 | RPL7L1 | ribosomal protein L7 like 1 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT550504 | TMEM241 | transmembrane protein 241 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT551064 | MKLN1 | muskelin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT552826 | XIAP | X-linked inhibitor of apoptosis | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT553160 | UBE2H | ubiquitin conjugating enzyme E2 H | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT553845 | SYNCRIP | synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT554273 | SIX4 | SIX homeobox 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT555796 | PCMTD1 | protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT556333 | MAP2K4 | mitogen-activated protein kinase kinase 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT556514 | LIPA | lipase A, lysosomal acid type | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT556708 | KLHL28 | kelch like family member 28 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT556767 | KLF7 | Kruppel like factor 7 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT557005 | HPRT1 | hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT557161 | HOXA13 | homeobox A13 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT557502 | GPR27 | G protein-coupled receptor 27 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT558117 | ENPP5 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (putative) | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT559359 | ATP5G3 | ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex subunit C3 (subunit 9) | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT560350 | ZWINT | ZW10 interacting kinetochore protein | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT561314 | ZBTB43 | zinc finger and BTB domain containing 43 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT561898 | MSANTD4 | Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT561942 | MFSD9 | major facilitator superfamily domain containing 9 |