pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4307 |
Genomic Coordinates | chr14: 26908642 - 26908725 |
Description | Homo sapiens miR-4307 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4307 | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 56| AAUGUUUUUUCCUGUUUCC |74 | |||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||||||||
Experiments | SOLiD | |||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | SEC62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Dtrp1, HTP1, TLOC1, TP-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | SEC62 homolog, preprotein translocation factor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_003262 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on SEC62 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of SEC62 (miRNA target sites are highlighted) |
>SEC62|NM_003262|3'UTR 1 TCTGACTAATTTTGGGACTGAATGAATAAGTACAAGAGGTTGGATTTTCTATGTTGGCTGATTACCATATTGAACACATG 81 GCATTTGTAGCATTCTTTAAATCTATCTACTGAAATGTATTTGACATTCAAGCAGTTATATTCGGTCCTTCATTTTATAG 161 AATATTGGCACTATTATTGGTACAGTTTAAAGCCATTAATATGTTTTATCCATTTGATAATTTTACAGTAAGTAGGTCTC 241 ATTCATTTTGACAGTTATCAAAGATGTACTTTCCACAGTTAAATTTACATTAATGGCAATTTTTGATAGTTTTATGGCTT 321 TTTACTGTTAGACTAATCAAAAATAACTTTAAAAGGAACAAAGAAACTCCAACATTTCACATTATGCATAGTTATGTAGC 401 CATTTCACAGTTTCTTTAAGATGTGTAAACTCATTGTCCTTGATAGTTTTTATTTTTCATTATAAAATTATACCAGGAGA 481 TTTCTTTTAAGATTCTGAGTTAGCAGAGTTCAAAACTATTTTGTGGAAACAAGCCAACTAGTAACAATGCAGCAACACTT 561 CTGGTTTAGCTAAATTATTTTTCCAATGTAGGAAATCCACACTGATTTGTACGTCTGACTGAGAGAAAGATGGTCGTCTC 641 CAGCAGAGAAAGTGAACAGCATTTGTTGGAAGGTGATGGCTCTCCCTCCTCCCTCCCCATTTCATTGGCGTAACGTAAAG 721 TGTATTCTGTACATAATTTACAAATAAAACATTTTATTTTAATTGTTACTTATTATTTAGATATTTCTCAACACTTAAAT 801 TCATAAAATTAAGACCATGTAAGGGTATGTTTTTAGAGAAATGGAAGTTTGAGTAACCCACAGAACATCTGTGATCTTTC 881 TACAGCAGCTTCAGTTTTGTGCCAACATTCCATGTATTTTGAATATGAGCAAAAACTGATCTTAAGAGCAGACTTAAAGT 961 AGCTTTGTACGCCTTAATGTTCATTTTGATTTATTTTAAATCTTTACATTCAGAAATGAGATACTGTATTATCAGACCAG 1041 GAGGCATTGCTGTGAAAGATAATTTCCTATTCTAAAATATCAAATTTAAAATAAAGATAATGAAAGAAAACATAAGAGAA 1121 CTATTGGACTCTAATTGCTTTGAACTAGTTTTGCAGTTTGACTTTACGTCTTATACATCTTAGTTACAAGTCTTTGGAAA 1201 CTCTTGTTTACTTATGAGCATAATCATTCCTTGGAGTTATACTAACTAATAATGAATATTAAATGATTTTTCTTCAGTCA 1281 CAGTGAGAGCATCTTGCTTTGTGGTTGAAATAGGTAGTGTATGTCAGTCTTTGCTTTAGGCTGTTTCTCATCTAAGTGTT 1361 TGAATTAAAGATGTTAAATTTTTCTAATTGTGAAAAATATGTTTTCTGTATCGACACATTTTATTAAACTTGGCTTGATT 1441 GCTTCTTTATAGTAGTCCCTGTAAGTGGACATAAATGTGGCTATTTGATGTTAATGCAACTATGTCAAGGCTGCAATCAC 1521 TTTAATAGTTTCTTTTTAGCAAATAAATGTTCATTGATGAAGTGCCTGGGTATTTTCCCGTCCCATTTGCAGAGCTCTAC 1601 TACTTCATTTCCACAGTAAGCATATATATAATGATCACTTCTGAGTTTATCACCAGTAACATTGATACCTATTTTGGGGT 1681 ATAAACATGGTGTTTTTCAGAAATAAAAATTATTTCATTAACCTTTACTATTACTGTGATAATACCCAGGCACTCAATAT 1761 TCATCCTGAAATTTTTTATAATATATGTAATTTGTCTAGTCTTAAAGACATTTGGAGCATGGCCAACAGGAAGGTCAGCT 1841 TCTTACTGATGTGTGTGGATTCTTACAGAATGTTAGTACAAATTTTTATAAATATTTGGTGATCCCTGGGGGGAAATATC 1921 ATTCTTACTATGGTTAGAAAGTGAATTAGAAATTTCAGCTCAGTTTCTATTTTACTATTCAAGTTGTGTACTTTAAACAA 2001 ATATAAAAATCAAAAGGCTGCCTCTATTACAATCCTCAGTGGAATAGATGGCTATCTTTCTTGGCTAACATTAAATATTC 2081 TTGTACCAGAGCATGGAAAATCGTTTATAATTGTTAATAGAATGGCGATTTTTTTTTAAGAACTTCAGATTTGCTATGCT 2161 GCTGTAAGTAGAAAGCATGAAGCTTTTTGATCATGTAGGGCTTATTGTAGAGGGTATCAATTGGCCTAACTAAGCAGGAT 2241 TGAATTTACCAGAGGCTAAGTTCAGATAGTAAGAATAATGCATATGTGATTGTTCTTAAAGTCAATGTATTAAATAAGGT 2321 ATTTTTCCTTTTCCCTCTTACTGGATTTTTCAATTTTCAAACCATATGGCCTAGGTAACTTTAATTGAAATAATATAGAT 2401 TTAGTTGAATACTATTCAGGAAGTAATAAATTTTAATATATCACATTGAAATTATGCAGTGGTGATGAATTTTGGTGTTT 2481 CCCCCCTCTTTCTGGTTTTACATCATGAGGATCAGTTAGCTGCTGACAAGAAAAGTCATCTTGTGTCTTTTGTAAATTGA 2561 ATTTTTTTTTTAAATCTATTAGGAACTGGAAAACAGCAAGTATGGTTGATTCTCATTATTCAAGGTAGTTACGTTCTATA 2641 AAGTCACTGCGAACACTGAATTAGCAAATATAGAACCTAGGGGAAATACAAGGCTAGATTTCTGCAAGCCACTGGTCACA 2721 TTTTCATCAAGCAGTCAACATGTAAATTTCTGTTGTAAAGACACCTTATTTAATATAATCGATTCATTAACATTGAAGTC 2801 ATGACCAACAACACTGTAACTCATGCCTGAATGAAGCTTATCTGACACATAAGCTTCATAAGGCACACAACAGCCTTTTT 2881 ACCCTTAGGAACAGCTTTTTGCCCTTAGCACTATGCTTGGGGGCCATTTTAAACAGTGAAATCAAAAAAAGAACAGAAAT 2961 GCAAAAACCATGGCATTAGCGTAAAAAGGACACGTTTATAGTATGAAAGCTGGAACATGGCCTTGTTCAACCTCAGCTCA 3041 GAATATGTGTACAGCAAGTTTTTTGCTGTACCACAAAATTTTAGGTTAGGCAAATTCACAAATACGGAATCCATGAATAA 3121 CGAGGATCAACTGTACTTAACTATATTTTAAAGCTGTGACATTTATCTACCTGGTTTATGGAATAGAATTTATTGCTGAA 3201 TCATGCTCCAGTATTTGAGTGATGTTTTAAATATCCTATGTCTGAAAATAATTCCTCCTAATTGTGTGGTAATTTGCTTT 3281 TACTGTTTCCACAGTATTTCAGGTCTTTGCTCATTCACTCAGTAATACTGAGCACTTACCATGTACCAGAATTTTACTAG 3361 GCACAACCATGAATAAAAATACAATTCTCTTGCACCATTAAATAGTGTGTTAAGTGCTACGGCAGCAAATTGCTACATGT 3441 GCTGGATATCTCTTGTTTTCCCCTCCAGCTCCACTCTGCTCTTGCCCACAAAGCTGACCCGAATGGACCACAGCAGTGGG 3521 CTCCTATGCCTCCTGGCTTCTGAGTGGGTTTGGCCAAGGAGTGTCCTGGCCAGAGATCAGAGGATGGTAGGGTGCCTATT 3601 CTCGGCTCTTCTCCTGGGGTTGGGGGGCTGCCTTAGCAGCCAAAGGTCACTTCTCCCAAACTCCTTCCCTGCTTTCCAGG 3681 TTGCCAGTCCCTGCACTCTTCCTTTCTGGCCAAGGATGATGTCAGTTCTGCTGCTACTAGCCTGGAGTTGCAGAAGCTAC 3761 TGTGCTTCCTCTTTGGGTAGCCTATACCTATACTTATCTCCTCATAATATCTTCATGTAAAGAACCATCTGTTTCTTATT 3841 GGAATCAAGACCAATACCAAGGAGAAATTCCTAGGGAACAAAAATTCCAATGAGGAATTGACCTCTTTGTCAGATCCTTA 3921 TCACCAAACATTAGAAAAGATCTCATAACTTTATACAGCATGTTGTAAGCATTTTGATAACTAAAATCCTGTTCTAGTGA 4001 ATGTCATGCAGATAACTACACAAGGAGATTAATTTAAATTTGCCTTCTTTGGCAAGCCCTTAAACCAATGGCTAAAGCAG 4081 TTAGTTGTGAGTTTCTGAGTAGGTCCCAATGCGTTTATTTCATTTGTCCAACCTAGCACAGAGATCCTTTGATACTTTAA 4161 TTGCATGGCTTTTCCAATCAGACGAAATTTCAGTCTGAGAGAGGACATATTTTCTGAGGTTTATAGTTTTAGGATTGTCC 4241 AAAAGGCCTATGATCTCTTCTTAGCATGACAGAAAGAGGGAAAGATAAGTTAAATTTCAAGGGGGTCATATCATCACACT 4321 TTGGTCTTATTTCATTTTCAATGATTTCCTAGATCACTTTAACTTTTTTGTGTCATGGACTCCTCAGAATAATGGGTTTT 4401 TTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGAAATCTCAGCTCACTG 4481 CAACCTCCGCCTCCTGAGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACATGCCACCAC 4561 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTGGCGAGACTGATCTTGAACTCCTGACATCAG 4641 GTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCAGAATAATGTTTTTAA 4721 ATGCAGAAAAGGAAATGCATGGGGTTACAAGGGAAACGAATTACACTGAAGTGTAAGCTACCAAATAATTTATGATGTGG 4801 TAGTTATAGGTGTGCATTTAATAGCCAGATCTACGAGTGGATGTAATAACTGCTATGATGTTGAAGTAGCATAAAACATA 4881 TATTAGATATCTGCAACAACTGTGATGTAACATGAAAATACCTGATTTCTGTTGACAAAGTTACTGCTAGTACAACTGTG 4961 GATTGTTGTCTGCACTCGTCATTGAAGGAAATACTAAATTTTAGTTTTAGGCTAGTGAAATTAAAGTTAATTTTTCCCAT 5041 CCAAGTTCATGTATCTTCTGAATTCTATCCGTGAATCCCTTAGAGGTCTGTGAATTGTAGGTTAAGAACCCCTGCCCTAG 5121 CTAATCAGATCCACCAATGTTTCAAATAGGACTATAACTTATTCAAAGGCCAATGATACTTCGCATAATTCAATTTTAAT 5201 ATTATTCACATTTCATGTCACAAATTTAGTAAGTTACATGTGTTATGTGATGTTTTGTTTTGATAGATTATATCTTACTC 5281 CTAAATAAAAAGTCAAGATTTTTGTAGCAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | HeLa |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in Chi_124A_2A8_130_50. RNA binding protein: AGO. Condition:HeLa cell miR-124 + A
... - Chi SW; Zang JB; Mele A; Darnell RB, 2009, Nature. |
Article |
- Chi SW; Zang JB; Mele A; Darnell RB - Nature, 2009
MicroRNAs (miRNAs) have critical roles in the regulation of gene expression; however, as miRNA activity requires base pairing with only 6-8 nucleotides of messenger RNA, predicting target mRNAs is a major challenge. Recently, high-throughput sequencing of RNAs isolated by crosslinking immunoprecipitation (HITS-CLIP) has identified functional protein-RNA interaction sites. Here we use HITS-CLIP to covalently crosslink native argonaute (Ago, also called Eif2c) protein-RNA complexes in mouse brain. This produced two simultaneous data sets-Ago-miRNA and Ago-mRNA binding sites-that were combined with bioinformatic analysis to identify interaction sites between miRNA and target mRNA. We validated genome-wide interaction maps for miR-124, and generated additional maps for the 20 most abundant miRNAs present in P13 mouse brain. Ago HITS-CLIP provides a general platform for exploring the specificity and range of miRNA action in vivo, and identifies precise sequences for targeting clinically relevant miRNA-mRNA interactions.
LinkOut: [PMID: 19536157]
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CLIP-seq Support 1 for dataset Chi_124A_2A8_130_50 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | HeLa / HeLa cell miR-124 + A |
Location of target site | ENST00000337002.4 | 3UTR | AUAAGAGAACUAUUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 19536157 / Chi_HITSCLIP |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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107 hsa-miR-4307 Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT091681 | RARB | retinoic acid receptor beta | 2 | 6 | ||||||||
MIRT097311 | AGGF1 | angiogenic factor with G-patch and FHA domains 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT099878 | SOX4 | SRY-box 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT114514 | ARF6 | ADP ribosylation factor 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT163479 | WNT5A | Wnt family member 5A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT186633 | COX20 | COX20, cytochrome c oxidase assembly factor | 2 | 8 | ||||||||
MIRT194921 | TNRC6A | trinucleotide repeat containing 6A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT230189 | AKAP17A | A-kinase anchoring protein 17A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT281397 | MAPK6 | mitogen-activated protein kinase 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT328018 | RLIM | ring finger protein, LIM domain interacting | 2 | 2 | ||||||||
MIRT354896 | SEC62 | SEC62 homolog, preprotein translocation factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT361422 | PNRC1 | proline rich nuclear receptor coactivator 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442526 | MOB3B | MOB kinase activator 3B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442629 | NUDT12 | nudix hydrolase 12 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442685 | SLC39A9 | solute carrier family 39 member 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT444131 | BRCA2 | BRCA2, DNA repair associated | 2 | 2 | ||||||||
MIRT444174 | RBM7 | RNA binding motif protein 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT446045 | TPR | translocated promoter region, nuclear basket protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT447984 | LINC00598 | long intergenic non-protein coding RNA 598 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT460527 | S100A11 | S100 calcium binding protein A11 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT466861 | STX6 | syntaxin 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT468806 | SAP18 | Sin3A associated protein 18 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT480269 | C8orf4 | chromosome 8 open reading frame 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT493119 | MKNK2 | MAP kinase interacting serine/threonine kinase 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT499168 | YRDC | yrdC N6-threonylcarbamoyltransferase domain containing | 2 | 8 | ||||||||
MIRT500507 | ZBTB34 | zinc finger and BTB domain containing 34 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT503021 | CAND1 | cullin associated and neddylation dissociated 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT505314 | TOR1AIP2 | torsin 1A interacting protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT506123 | PMAIP1 | phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT509346 | CYP20A1 | cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT509446 | POU2F2 | POU class 2 homeobox 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT509598 | PEX26 | peroxisomal biogenesis factor 26 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT516008 | GPN2 | GPN-loop GTPase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT516120 | SRPX2 | sushi repeat containing protein, X-linked 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT522126 | NELL2 | neural EGFL like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT523018 | IL1RAPL1 | interleukin 1 receptor accessory protein like 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT524015 | DONSON | downstream neighbor of SON | 2 | 2 | ||||||||
MIRT526307 | JAKMIP2 | janus kinase and microtubule interacting protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT526789 | SGCD | sarcoglycan delta | 2 | 2 | ||||||||
MIRT529141 | CLCC1 | chloride channel CLIC like 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT531336 | GDPD1 | glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT531573 | ILDR1 | immunoglobulin like domain containing receptor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT531831 | MTPAP | mitochondrial poly(A) polymerase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT534994 | PRR11 | proline rich 11 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT535419 | PDZD8 | PDZ domain containing 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT535534 | PAK2 | p21 (RAC1) activated kinase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT536649 | INIP | INTS3 and NABP interacting protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT543498 | MDM2 | MDM2 proto-oncogene | 2 | 4 | ||||||||
MIRT545392 | PM20D2 | peptidase M20 domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT545881 | ZNF200 | zinc finger protein 200 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT547931 | HNRNPR | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R | 2 | 2 | ||||||||
MIRT548109 | GDAP2 | ganglioside induced differentiation associated protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT549370 | ANKS1A | ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT549934 | RPL7L1 | ribosomal protein L7 like 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT550455 | MYADM | myeloid associated differentiation marker | 2 | 4 | ||||||||
MIRT550640 | AR | androgen receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT550815 | FAM229B | family with sequence similarity 229 member B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT551258 | OPCML | opioid binding protein/cell adhesion molecule like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT551768 | MED21 | mediator complex subunit 21 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT552214 | ATP5S | ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex subunit s (factor B) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT555472 | POGZ | pogo transposable element derived with ZNF domain | 2 | 2 | ||||||||
MIRT556008 | MZT1 | mitotic spindle organizing protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT557878 | FEM1B | fem-1 homolog B | 2 | 4 | ||||||||
MIRT558486 | DBN1 | drebrin 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT560859 | GAL3ST3 | galactose-3-O-sulfotransferase 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT561521 | AZF1 | azoospermia factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT562090 | KIAA0895 | KIAA0895 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT563065 | ZNF28 | zinc finger protein 28 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT563487 | ZWINT | ZW10 interacting kinetochore protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT564286 | CTCF | CCCTC-binding factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT565627 | SLC16A1 | solute carrier family 16 member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566508 | PAWR | pro-apoptotic WT1 regulator | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566978 | LBR | lamin B receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT567180 | IGFBP5 | insulin like growth factor binding protein 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT568432 | GDNF | glial cell derived neurotrophic factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT570092 | KANSL1L | KAT8 regulatory NSL complex subunit 1 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT570565 | PABPC1 | poly(A) binding protein cytoplasmic 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT571385 | JKAMP | JNK1/MAPK8-associated membrane protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT572053 | GPATCH8 | G-patch domain containing 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT572333 | CACNA1A | calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT574528 | PEG10 | paternally expressed 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT575818 | Igfbp4 | insulin-like growth factor binding protein 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT608587 | PPP2R1B | protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta | 2 | 4 | ||||||||
MIRT610442 | TSPAN15 | tetraspanin 15 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT614994 | GABRB1 | gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT615014 | ERGIC2 | ERGIC and golgi 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT615078 | CISD3 | CDGSH iron sulfur domain 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT616180 | SYT7 | synaptotagmin 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT617191 | CDH13 | cadherin 13 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT617287 | GTF2H3 | general transcription factor IIH subunit 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT618714 | ESD | esterase D | 2 | 2 | ||||||||
MIRT621825 | TIMM8B | translocase of inner mitochondrial membrane 8 homolog B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT624139 | DLX3 | distal-less homeobox 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT625991 | IBA57 | IBA57 homolog, iron-sulfur cluster assembly | 2 | 2 | ||||||||
MIRT626344 | BLOC1S4 | biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT634899 | ZNF701 | zinc finger protein 701 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT637848 | SLC2A9 | solute carrier family 2 member 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT639514 | FYB | FYN binding protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT642468 | RSL1D1 | ribosomal L1 domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT653670 | SLC26A7 | solute carrier family 26 member 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT655192 | PHAX | phosphorylated adaptor for RNA export | 2 | 2 | ||||||||
MIRT657011 | KCNMB4 | potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT661008 | ABCB11 | ATP binding cassette subfamily B member 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT665816 | TMEM161B | transmembrane protein 161B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT683852 | ZNF208 | zinc finger protein 208 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT700436 | PURB | purine rich element binding protein B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT700517 | PTPN14 | protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 14 | 2 | 2 |
miRNA-Drug Associations | ||||||||||||||||||
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miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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