Gene Symbol |
AGO2
|
Synonyms |
CASC7, EIF2C2, LINC00980, PPD, Q10 |
Description |
argonaute 2, RISC catalytic component |
Transcript |
NM_001164623
|
Other Transcripts |
NM_012154
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on AGO2 |
|
3'UTR of AGO2 (miRNA target sites are highlighted) |
>AGO2|NM_001164623|3'UTR
1 CATGTTTTAGTGTTTAGCGATTGTGTACCGAGTGGGATTCACGAGACCAGCTACACTCAGACCAACAGATGGCCAGCCCT
81 TCCGTGACAGCCAGCATCGAACATGAGACGTCATTGATTTTATTAGATTCTCCGTTTTCCAGAATGCCTTCCGTCCCAGA
161 TTTCAAACTTGGATTTTGAACTGCAGACCTGTATGAGAACCCAATGTCATAGGAAATATGGTTTGCTAAAATCTATAAGC
241 TGCTTATTAAAACAGAGTCCCGTGTGTCCTAAAAATCTCCTAAAACCAGTCTATGAACTCAGGGCTTTAAAACATTTTTA
321 ATTTATTTGGTCATTCAATTTACTTGTTTTTAATACATGATTCTCTATGAAATTGATGGGCTCAAACTAGCTGTGAATCT
401 TCTGAGAGTGAAAGCAACACAAAACACAAGTGTGGTTTTAAAGCCTTGAACATTCTGATGTTGTCACTAAAGTTGATTTC
481 CAGGCGATGCTCGTGTGCCCCTGGCGTGGCTCACCCAAGTTCCTCGACTGAGGGCCGGTGGCCATGCAGAGGCGTCCGCA
561 GGTGCCGTGTTCTGCCAGCACCGCCCTTCACCCGGCCTGAACTAAGGAGCAGTGGCAGAAGGTGGGCCCCGTGTGTTTAC
641 AGCATTTCCAGGTCCAGAGAGGTTGGCAGACAAGTGCCATTTTAATAAAAAATGTATTTAAAAAAAGAAAAAAGACAATA
721 TACTGACAGTCTAATCATCAGATTTGTCCTATAGGACTGTGACATTTATTTTCCAAAGTTTTTAAAGAATACGGGTCTGT
801 GGTGATAAATACAGTACAATCCTTTTTCACTGTTATGTCTTTAATGTAAGAGAAGAATATATATATCTGGTTTGCAGTAT
881 TAATGTGATAGATAGATGCTGTTTTTTCATTTTATTGACTATGGGGTGCTTCTGTGATCTGTTTGGCATATCAAGAGTGT
961 TTTGGAGCCTGGAGATGGGACCGCCTCTCAGTTCTTAGTGCTTAAGGACAGGAATATGCAATTGACTTAATGTGACAGCA
1041 ACCCGCTTCCCCCGTGGAGACTGTGCAGCGTGTACCCATGGGAGGGACGGATGTGCCCTCCGCGCCGCTCGCCACCCTCC
1121 CTGCCGCCTCATCCCCGTGTGTCACTCACTCAGCTGATGAAGCACAAGTGGAAATTATTTATTCTTGCATTGCTGGGAAA
1201 CATTGATGTGTGGGGACTCACTCCTCTCCGTGTGCTCTTTTGTCAGATGACTTCCATAGATCTATGCACTGAGATTCGTA
1281 GAAAGCTGTTGGTGGTGGCTCTGCTGGGCGTGAGGCCGTCGGTCACAGCGAAGGAGCTTGCCTGGCCCTGGGAGGCCCAA
1361 GGATAGCAGGGCCAGCAGAGGGCATGGGCCGTTCTTCTGGGGTTTGCATTTGGGGCCCCAGACTTGGGTTTGCCAATCTA
1441 GAAACTGTTGCACTAAGAGTGACACCACGGACGATTTTGAAGGCTAACAACAGACAACTCTGTTTGTGCTGAGTGGGCTT
1521 TTTGTCTCTGTACACAGTTTTAGTAAGACTCAAATCCATGTTCCGTGTAGAGGCGTCAGGAAGGAGGCGAGCCTCCCCTA
1601 GTGCTGCTGTGCGCTCCGTAGGTCCCCTCTTCCTGCTGCTGTTCCCTCCCCGGCCCTGCGCGACACTTACCTCGGCACTG
1681 TGGTGGGGTGGGGTGCCAAAGGAGCTGCCTCCTGCTCAGCGGCACCCCCCCCCCCACCTTTGTGCTCAGCTGCTTTGGAG
1761 GCAGCAGGAGGGGCAGCAAGCCGCAGGTCGGGGGTCTCCCGATACCTCGCCTGGATATTGGCGGCAATGACAAAGGGATG
1841 ACTATTATTTGTGAAGATGTGTACTCAGAGTGGTGTGTGTGTGTGTGCATGCGTGTGTCCCTGTGTGTGAGTGTCTTATT
1921 AATGGCATTAGTCTCTTCTGGCTGTATTTTTTTTTAATCTTTTTAAATGACAGAAGCTCCCACTCTAAGAAATGGCAGTT
2001 CCTTTTGTTTTAGTGGCAAGTGGCACTTTCTCCTGTTTTCAGAAGGATACAGACATGCTCGTAGCTTAAATTAATGGATG
2081 CATTCAAGCTAAGGAGGGAATCTTGTGACTAATAACTTTTCAAATCTGAAATTAGATTAGTTTCCAGCCATTTTTACAAT
2161 CATCTGGAACCATGTGTCTCAAAGGTGTGTTTCTTCCACCTGCGTCAGGCTGTCTGGGGGATGGCGGTTCTTGTTTAACA
2241 TGCAGATTTGTGGGCCTGCTGCCACCTCCTGCGTGCGGTACTTCAGGGATGGCCAGGGCATCTGTGTCTAAGCGATGGCC
2321 TGCAGCCCTGGGCTCCCTGGGGTCTGAGGACCCAGCTCTGGTGGCACCCAGCAGGGAGGAGGTGCTTCCTGAGCAGATGC
2401 CTGAGACAGACTGGGCTGGCAGAAAAGTAGGACTACAATTTTTGTTTTTTTTAATCATTTTGAAGGAAAACTTTCATTTT
2481 TAGTGGGCCAGAGTACTTCGAAAAGGGTACTTTTTTATAGCCCTATGCTTGTTTTATAAAACTTTTAATACTAAAAACAT
2561 TAATAGACCAAACATCTCCAGCTGGGTCAGCTGCACACCTTTGTACATGTCTGATGATTCAGAGTTTAAATGGCTGTAGT
2641 TACAATTTCTCAGGTAAACAATTGTTTTCTCAAATTTTTACCAATCCCTGCATTATTAGGATAAATTTTGAGACAGTGTA
2721 AAAACCTCAAAGTACAGTAGGGTAAGTCCCAGCCCTGTTCACGTGAAAGCCAGAGGTGGCCCTTCCCCGGCATCTGATCG
2801 TCTGATCATGTGGGTGCCTGGGGCCTTGCCACCCTTCCCTGTCCACTGCTGCCCCCCTGGGCCTGTCAAGATTTGAGGGG
2881 TGCCCACTCGCTGGCTTTGTCCCCATCCCACTGTTAAGTAAGGTGTGCCTTGCTTTAAGCAAACTGAATGTGAAAATTAT
2961 GTGTAGAAGTCTGGGTTTGTTTAAAAGAAAAACTGGGATTTTATCTCATCTCTTTAAAAGAGGTCTCCCAATTCGATTTC
3041 TGTACTGGGACTCTTCCTGGTGTGTTTTTACATGTTCACTTTTTAAAAACATTGATGTACTCCCATCCTTTTACCACTAC
3121 CCTATCACATTTGACAAGTTCTTGCTGTAATGACGACGCAATTAACGAACACCAGGGGAGCGGTGGAAAGCTGCCCTCGT
3201 GTGTGAGCCCTTCGGTGACGCAAAGCCACCGTCCTGTTGTTTTGTGTGTCCTAAGCTCAGATTTTCCTGGTTTGGATAAA
3281 TTTTGTAAAACTGGGCATAGCTGTACTTTTAGAAAGGGATCGTTTTCCTTAAGTTTTGGTTTTCTCTGGTTCAAGCAGTC
3361 TTTACATGCAGCCTTTTGATTGCACATCAGGGTCTCCCTTTTCTTTTCCAGATGATGTTGCTTTTCGGTGGTGGTCTCAC
3441 ACTCCTTTGAATGAATGTTTGCACTCTAGAACCACAAACGATGCGTGACCATTGTACAGCTTGCCCAAGAGGGAACTGTT
3521 GGAAGCAGGCAGTGACCTCCACGCTGTTTGTTTGAGGCTGACCTAAACTGCTATCACTAATGTTTACCCCCGTGACGGAG
3601 TGCCCATTAGAACAGATCATGTCAGTTCAGTTCCTGTAGTGGGGTTAGTAGGTGGGGGGTTTTATTGTTGTTGTTATTTG
3681 TTACTTTTATTGCTGTTAAATGCAAATATTGCTATTTATTTTTTCCTTTCTGCTCTGGTTTGGTTTGGCCGACACAGATA
3761 TTCCAGTGCATGTGGTACCTAATGGATATGATAGAAATTATTTCCCCAACTTTTATAAATTGCCTAATGTTTACCTTCAA
3841 GTTTGCTGGATGATTTATTTTTGAAAGCCACAAATGTGATTTTTCTGGATGAATTGTTTTTCTTATATATGCAGCAATGT
3921 AATTTTACATTGATCTGCGGGGTGGTTTAAATTTTATTTTTACAAGGCAGTTTTTCAGTCAAATTATATATTTGATACAA
4001 TACGCTAGGATAGACCGGCCACACGTCAGGCAGCCGGGACACCGGAGTGTCCCCAGGAGGCCTTTGGGGCTGGGGTGGCC
4081 CGTGGCTTGTTCCCTGCGCCTCTGGGAACTGGATGAGTCCTTCGGCGGGACTGTGACCCGCTGGACAGTTAAAAGGATTT
4161 TTCATGGGCATTTTCCTACACATAAGGCAGTTCCATTAGGAGGAGCTTTAGAAGTCGACATAATCCAGACAGTGGACAAT
4241 CCCAGTGGCCCAGACAAGCCATACGACATTTTCCTGTGACCTCTCTCTGACCCATCTCTCACGCTCATGAGAAAAGGAAT
4321 GTACAATAAATAGAAACAGAAACTTCCTCAGTGCTCATGCGCCTCACTTGCAGAACGTGAGTATTTCATTTATGTTTGAA
4401 GCCCTTCCCCAAAGTGACCGAGGAGTTGCACTCTAGCTGCCGTGCCAGCAGTCTCGTCTGCTGTGACGCTTCTCGGTGCG
4481 GATGCAGTGCACCTGTGACTTTGTCATGGGGGTGCCCCTGTTACACACACACACGCTGACTCTTTTTTATGAGGAAAATC
4561 TTCGACTCAAAATAATTGCACTGATTTTTTGACAACTTCTTTTTACGATGTCCCACTTCGCATCTGCTGTACTTGTTTGA
4641 GATGATTGTAAATAGATTTGTGGTAGGAGAAGTGACATGAATGCAACACGTGGCTCTGTTGTGGAGACACTGCCTCGTAT
4721 TCAGTATTATGTGTTAAAGTTGTGTGGACTTAACTCTGTTCCGCCCTTTAGCTTCGTGTCTGTTGACCATTTATGAAGGA
4801 CAAGTTCGCCTCATTTTCTTTTTCTTCTGAAGGGAAGTTCTAGATCGGTTACTAGGAGAACATGGTCTCTTGGTGCCTGA
4881 TGATTTAGTCCTAAGCAGACTCGTTGCAGTCTTGTGAACACTGTTGTGGTCTGTTTGATTCCTCGTCGCTTACCGTGGCT
4961 CTCCAAAGCATGGTCTTTGAGTTCCACCCAGCCTGGGACAGTCCAGACGGGAGGCATCTGCTCCGCCTGCTACTAGGACG
5041 CAAGGGCCTCCTTGCATCTCTGTGGTCAGAGTCATCTTAAAGCCATGAGGTTACTGTCGTGTCAAAGCTGTCATTTGTGC
5121 CCGTTATTTTGCTGGAGTAGCAGCGTGTGCTGTAGCCCCCGTGTGTCACTCTGTGGTCAGGCTACCCTGTGTCACACCCA
5201 GCAAGAAGTTTTTCAGCCCCAGACCAGTCTGTGTGTGTGTCCGAGTCACACCAGTGCCATTACGGTGCCCTCGCTTATGC
5281 TTCTTTCAGTATGTTTTGCCATGTTATTGTCTAAAGTGAATGTATTGGCTTAGCCAAATCACTACAGAAGGTGGTTCCTA
5361 AATACCTTTTAGTTTAAAAAAAAATGCAGATAAAGGCTACCTCTGAATTCTCAATAGATTCATCATGTTTGCTCTTAAGT
5441 GTAGCTGTCCACACTGAAAACAGCCAATATGTTGCCTGAATAAACTGAATTGTGAACATCTATCTGTTCAGTTCTGGCTT
5521 GAAAATGTGTGTGCCATACTGTGACCCACGGGCAGCCCCTCCTCCTCTACTGTGTCAGGTGGACCAGGGTCACCTCTGTT
5601 CTGCGCAGCTTTGAGATTCTAGGATTCTACGGCCGGCACGAATGGCATGGGAGGGTTCTCTGCACGGGACGGCATAACGG
5681 CATGCCATCCTTCAGGCTGGCAGGAGCCTGCGCAGGTGTGGCAAAATCTTGAAACAGCCTGTGTCCTGCCTGGCTTTTCA
5761 CTTTCCTATTTAATATAAGAAAGCACTTTTTTTTCTGCTTTACCTACAAATGGGTTGAAAATGGCCTCCTCTGTCCTCTC
5841 CTCTCTTTTATACACTCTGTAAAATCACAAAGGTGCTTCAACACCGACTGTCATGCAAATAATACATTTAAAATAGTTGC
5921 ATGGTTTCAAAGACAATGCAGACGTAATTGGCCTTTGACTTTGGGACCTCGGGTTACTCTCACTCCCTACTGCAAAACAA
6001 ACTAAGGGTTGAAAGCAAAGCATTCTGTTCAAATCCAGGGCCCTTTGTTTGAAAAGAACACAGGGCCCACAGCTGGTGTT
6081 TTGAAGTAGAAGTTCCCACTAGTGGCGCAGTGGACCGTCTGATGCAGACTTGCAGGAAGTCGGTCCTGGGAGGCTCTGAA
6161 CACCCCTCCCTGTGATTAACCACTTTGCTGTCAGAAATGTCATTTTCCCATACACTGTGCTGTGGGCCCGGGGCCTCCTT
6241 CGCTTCTTTCTTTGGGTTCCATATGTTGCCCGATCTTGAGGTTAGCGCTCGCCCCAATTTCTCCATGAGTTTACTCTGAG
6321 TTGACAGGCGATGATCTGACAGTTGGAGGTGTCTGGGTGTTTGGAGGTGGCCCCGTTCTCATGTTGGCTGCTCATCAGAC
6401 ATTGAGTTTGGCCCCGGCGGTTCTACTACGTCACTACCTGGAAGCAATTGCCTTTAACACTCTGCTGTTTGGGGTTTCGA
6481 TGCTTTTTATGCTGCGTTGCGTGCTTTCATTCCGGAAGAGCTAAGTGTCCTTTGCAGTCTCTCTGAGAATGTTTTGTAAT
6561 TCTGCCGCCACGCTGTTCTGTGCGGACCGACCTCAAGAGGCTTGGGCCCCCGTGGGTGTCCCACTGCCTGCCGGCCCAGG
6641 GTACAGGCTGCTTGGGTCCGCTGGGCTGGCCTTGGGCTGTCAGAATCTGGTCCAGGGTGTTTCGAGGGGACACTGCACAG
6721 CCGCTCGCCCCTCGACTCAGTCATGGGAGCTGCAGCACGCAGATCCACCGCAAGCTTCCTGCACGCGCATCTCCGGAATG
6801 CTGCGCTGGGCCCTCCCACCATCTTCGCGTTTGTGAGAATTTACTCAGAAGTGAGAGAACTGAAGATTCCTGGTGCTTTT
6881 GTTAACACGTTTCTATCTTATTGGTTGGTGTGGAAATGTTAGATGTGTTGTTAGGTTTTTAAATGCTGTGGGTGGTATGA
6961 TTAAAGGGTTAAGTCCTCACCTCAGCCCCCAGCCCCCTTTTGGGGGGTAGGAAGAGGCTGAGTTATCTCCTATTTAAAAC
7041 CTCCTTGGATTTAAGTAGTTCAGAGTTAAAGCTAAAACACCAAATATTAACTCTTTCCCCCAAGTGTCTCCAGGAACTGG
7121 ACGTTGGGGCCATTCTTATTCAGTTCTTTC TGTAGCTCCAAGGTCCTTAAAATGAGTGAGTTGATCCCAAGAACACCCCA
7201 CAGCACCAACCAGCAGGGCACAGTGCAAGCGACTTCATAGATCGGGGTGCTCGTGTAGGGGTCCGGGGCTCCTTTGAACT
7281 CTGGGAGTTGTGTGCGCAGTCTTGGGTGGGAGACGGCAGGTCCCTCTGTCCCAAGAAGCTGGTGGTGCCAAGGCCTTCCT
7361 CTGTCTCCATCAGTGCCAGCCTGATCGCGTTCTGGAAGACCCAGTCTCAGACTCTGTGCCTTTAAAGTCCGGTCCTCAGT
7441 GTCCTTTCAGAATCATGTTGGGGCTGCGTTTCTCTGGGGAACTAAGCCTGTGCCATTCCACAAGGCAGGCGTGGACCTCC
7521 AGCCTTGGAAGCTTTCTTTCCGCTCCTCAGCCCCTGACTTGTAAACTGTGATGCCATGCAGTCTGGAGCCGCGGGGGACG
7601 CACTCGGTCTCATTGCGGAAAACACTTGGTTCCAGTCGTGTGGTTTCTCCCATACCCTGACCAAGTCCACCTCTGCCAGG
7681 ATTGCAGGAGATTGGTGCAAGACCCATCTCTTATGCATTGACCATGACCATCAGCAAAGCCTGGTGGTCTTGTTCTCATA
7761 GTCACTCGAGAAGAATATTTATTGTAATGGAAGTAGATTTTTTAAAAAAGGAATTGGAATCATGTCTTTGTAGAATGTGT
7841 GTGTGTGAAGTCCTCAGCTGTAAGGTGCTATTCAGTCCTGTGACCCTTATTTTGGAATGCTCTTCATTACTGTTGCTCTG
7921 TTTTGTGACTTCCTGGGAAACCGCTTACTTTGGTGTGGTGTCACCTTGAGCTGTGCACATAGGACACCAGTTTTGACTTA
8001 ACCTAACAGGCAGTTTTTATCTCTAGCTTTTTCAAGCCAGGTATTGAGCAGTTTCTTGGCCAATGGCCTGAGAAACCACC
8081 TGTCCCTGTCAAGGGGTGATTTTATTGGTTTTAAGTGGGGAAGTAATCCCATGTACTTATTTCTTAAATACCTAGGAAGT
8161 TCTTCTTGGTGGCTCCTCTTGGCCCTCCCCTCTTTCTCCCCCAACCCACCATCCTGCAAGGCAAGGAATGGCCTCTCCCT
8241 CCACAGAGGCAACGGCTGCAGAGGGAGCACTGTGGCTGCCATCCCAGTTCCTCTTCAAAGCCAAACAGACACGCGTGACT
8321 CAAATCCTACAGTATGGAGGGTGGCGTTGCATTGAAATTCCAGGCCTGAGTTTGATAGTGGATTTTAATGTAGTTGTTAA
8401 AGGTATGAATTCATGTTTTATAACTGTAGAGGCAAGCAAGTTTTTATTTTTTAAAAAGTTTTGAGAGAATAATTTATAAG
8481 TTTCTGTGCAGCAAAGTGGCTAATTACTCATTAAATACAGGAAAAGAATGTAGTATCTAAATCCAGCTTTTTCTTACCTC
8561 TGGTACACTTCAGATTACTTACCTAATACATATTGAGGGCTTTTAACCCTTAGTTTTATCAATTTTTCTAGTTTTATTTT
8641 ATTTTTATAAAATAATTGAAAAAGAACCAAAAATGAATTCAGAAGTTCCATAGATGGATTTTTGCCCCTTCTTAATTTTC
8721 TCCCACAATGAAAACATTTTAGAAGACATTTTGAATCAAAATGTATTATGACCATTGAAAGTTCTCTATTTTCTAAGAAG
8801 CTGAGCAGCTCCAAGGGCCTCGTTTCAGGTGGTACTCTATGTATTGTCTGTGGGCTTGTTTCTACCTGTACAGTGGAACC
8881 ATGTGACCATGTCTTGTGCTTGCAATATAGAAACCATGCAGTGCTGTTTTGTGAATTGGCAGTTTCTGTATAAACTCTTA
8961 TTTATATACATTGGCCTCTCTGTATGATTTTCCATTTGCTACATGAATTGTAAAATTAATTATAAAATTATAGTACCTGC
9041 TAAATACAATTCTGAGGCTTCATGTCATTGTCTTTAGTTGAATACCATGCTGTGTGTCTTGAAGATGTCCACGCTTGCAT
9121 GATGCTAGGTGGCAATGCCACTTTAAATTAAGCCTTAATCAGATGTTAAATTTGTGAGTTTCAGAGTATGCAAAAATATT
9201 AGGCAGAGTGAGTGTAAACTGTTCAGATCAAGATGCTGTATCATAATTCAAGTTATTTTTTTCTGGAGTTAAAGGGAAGC
9281 ATTCAGTGATACACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCCTCTCCCCCCTCCCCCTCCCTCTCTCTGTCTCTGTCTCTG
9361 TCTCTCTCTCTCTCTCTTGTCTAGCTTGGCTATGGCCATAGCTTGATGAAAATGGACCATTGTGCATTTCTGTGACAGTC
9441 AAAAAGACCTGTTCTAAAAGTCTTGCGACTTTTTCAGGGTTTTTTTTTTTTTTCATGTTTCTTTTTTTTTTTCCCCTCCA
9521 GTCTGAGATTTCTGTGTGGCTGATGGAGAGTGTGATTTGGGCGTAGGTCTTATTTGCAAACCTGCTCATGTTCTAAGCTT
9601 TCTTCAGGTAGTACCACCTGTCATCGCTTCTGCATATGATTTAAATGGATTTTTGTTTTTATAAAAGTATCATAAATTTA
9681 GAGATAAAATGGAGGGGACCCAGCTTTCTTTACAATGTGGATCTACCTCAGTTAAACAGTTGGGTGCTATTACTAAGTCT
9761 GTCAAATTAAATTGGAAAAAGTAACCAAACAGTGAGATACAACTCCACATGAAACTTGAAATTGTAATTTCCGTTTATTT
9841 AATGATATTTTTATTTATTTGTGCCTTTTATGTTGAACCCCAATGCATTGAAAAAATTCAGTATGAAACAGTACATATTT
9921 TATTTATATTACAGGTGGGAGAAAAGTCCAATTGGTCATGGAATTTGATAGACTTTTCCCCAGCCAACTGCTACAGTGTA
10001 TTATAATCCCGACTGCCCCCCTGTGAAAAGAAAAAAAAAAATGTCCAAGAGCAAATTTAACATTTTACAAACAATAAAGT
10081 CCAAACTCCTCTATGCACATATTTATAGCTTATCACTTCATTTTCTGTGCCAGTGAAGGGGTGGCCAGAAAAAAAATCCC
10161 AAGTACCCTCATCATTGCTTTTCTAGCCATTCATGCCCCCTCTTCCTCTGGCACATTTTCTAAGAGTTTATTTCATAAGC
10241 AGCAAACGGACTGTTGTCGATTTCATCTCTCCTGACCTACCTGGTGGAGGTGCTAATGGCCATGGACAGAAAGGGGCGAG
10321 CCAGAGCTCGTGGCTTTGTGGAGGCAGAGGCCTGCATTCAGCAGCGGCCCTGTGTGCCTGTAAGTTAGGAAGGCTTTCTG
10401 ACAGGTAAGAAAATGAGATAGGTTGATGACTTACCATGCTTTTATATTTGGCAGTTTACAATTCTAGACTTTTCCTACTA
10481 TGGCGATCTTTTTTTACTTAATTCTTTGGAGGTAACAATATTTTGGAGTCTTAAGAATTTGATTTTATACCAATAAGAAA
10561 TAAAAATTAGGGATCTTTCCTGTAGTATATAGTTTTACTATTTTAAAGAGATCTCTGAATTTTACAAGAGAACCAACATT
10641 CCTTAATGGCAGAACTTTGAAAGTTGATTTGGGAGGCTTTTTGCTGCAGGATCTCAAAAATAGAGAGAGAGATGATTCTA
10721 CTTAAATGTTTTTAATTTTCTAACTTCCATCAGGTTGATACTTAAGCTCTATTTTGTAAAGAGTAAATCATCCTTTAGTA
10801 TGCTGCATAAGATGATCAGCATTCTTGCACTTTCTCAGTAATAAGACGTGCCGGGCAATTGGCTCCCCAGGACGCATTGT
10881 GTTTTTAACCTAACGAGAGGACTTTGGGGCAGGTGATTAAATTTATATAGGTACCTCAAGAAAAAGAACCTGAATATGCT
10961 GCATTTTCTTTCTTTAGCTTTTACATGTAGCATTTTGTTTTGCTTTTGTTATTTTTGTTTTGATATATGCTTTTTGGACC
11041 CCAATAGACTGTTGAAAGAAATTTAAAAATTACTCTTGTAGGGATATAGTATCCTTAAAAAATAAAAATTTAAAAAAATT
11121 TAAAAAAATTGCTGCAATATCTGGCTCGAAGGTTGCCCTATATTAGAATAATACTTTAGCCAAATACACCTGAGGAGGCA
11201 GACACTGTGTTTATAAGCAGACAATAATGTTCTGAATCCTTCCTGTTCATGCTGCTTTCTTAATTCATTTCTCCATGTCA
11281 TCAAGAGGTTGGATAACTTATTTCTAAGCTCAAGGTTAAAAATCATGTCACCTTTTTTTTTTTCCCCCAACACAGACCTC
11361 AGAAAAATTGCGATTGAGGAAGTAGCATGATCCTAAATGTGTTGCTGAAATCAGGCAGCCCGAGCCTCTGGTCTCTCCAG
11441 AGAGCCCGTCTTCACATTTCTCTATTCCTCAGCACTCACCCGAAACTGAACAGATGGGGAGTGGTCTTGATTGTCAAGAT
11521 AAAACTGGTGAAGAAAGCTAAATGCTGAGAAACTGAGCATCTATTGTCGTGTTTAAGCTTAGCTGGGTCCTTTCTAGTTT
11601 GTTTTTACAGCTTACTAGGTGAAGTAGTTTGCACTATTTTTGCAATAAATTCATGGAAAACCTAACAGTTACTTGTTTTG
11681 TTTCTTACTGTGTGTATATAAACTAATACTAAAAGTTTGGCATAGTGTTTTTTCACCTCCTTACATAACCCCTAACATGC
11761 ACAGAATGCTGTAAATCTGATAAAATATGATGTGAATGATATTTTATAAAGTTATTTTGTATGGTGTCAATTTTGTTTTG
11841 CCTCATAGTATGTCAGCAAAAAATTAAATAAAAGTCCTCCTATTTACAGCTGC
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' uaACCC----AA-AAU-UCUCAAGAAAu 5'
|||| || ||| ||||||||
Target 5' gtTGGGGCCATTCTTATTCAGTTCTTTc 3'
|
7123 - 7150
|
154.00 |
-10.30 |
2
|
miRNA 3' uaacccAAAAUUCUCAAGAAAu 5'
|||| ||:|||:|||
Target 5' gcgactTTTTCAGGGTTTTTTt 3'
|
9465 - 9486
|
152.00 |
-8.30 |
3
|
miRNA 3' uaaccCAAAAU---UCUCAAGAAAu 5'
|||| : || |||:|||
Target 5' taaaaGTTTGGCATAGTGTTTTTTc 3'
|
11710 - 11734
|
137.00 |
-5.60 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|