pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4251 |
Genomic Coordinates | chr1: 3127975 - 3128035 |
Description | Homo sapiens miR-4251 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4251 | |||||||||||||||
Sequence | 35| CCUGAGAAAAGGGCCAA |51 | |||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||
Experiments | SOLiD | |||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | PRRC2B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BAT2L, BAT2L1, KIAA0515, LQFBS-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | proline rich coiled-coil 2B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_013318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on PRRC2B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of PRRC2B (miRNA target sites are highlighted) |
>PRRC2B|NM_013318|3'UTR 1 CAGTGCCTGGCTGCCACCTCGCCTCTCCCTACTGAGGACGGTGCCGCCATGCGGCCTCGACACAGCCGACACTCGGGAGC 81 CTCACCAGATCCACCGTCCAAATGCGTGGCCCAGACTGAGAGACCTCCCTCCTCTCCACTCCCGAAAGCTCCGTTGTCAA 161 CCAGCTTGCACCCGTGGATATATGGCATTGACCCGCTTGCTTTGATACGAAACAAAAAAGCAGACGACTCCTTCATCCCA 241 TCTGCTCCTACCGTGACTGTGGAGTGACGCCTCCTGTGCAGTGCAGATTTGCCCTCCCTGCCTCCTCCCTGTCCTGCCGC 321 GCAGCCAGGGCGCCTTCTCAGCAGTGCTTCCGGCCCAGCCGCCCATCCCTAGGCACAGTGATTTGGCAGCAGGGTCATTT 401 TACTTTGAGGCTTTTTGTTTTAAAATGTAGCCAAGGTTTTTACAAAGGGGAAAGGAAAAGAAAACAAAAACGCAAGCTCC 481 ATGTGTATAGCTGAACTTTTATATGTTTCTTGCCAGCCCCTCCGCTCCCTTCCATCTCTAGCCTCTGTCCTGTTTAGTTT 561 GATACGTCACTGCAGTACCTTAAGAGGTGACTCTTAAGAATGCATCCCCTCCTGATTCCTCAGCTGGTTCACCCTTGAGG 641 TTATTTGCAAAAAGAAAAGGAGGTTCTTGAGGGCACCGATTGCGAGCATTCTGGTGCCTGGCTCCCCGCCTGGGAAGCGA 721 TGGGGTGCTCAGAGCAGCAGGCAGGTTGGGGGAGGGGGGGGGTCATAGTTGGGTTCCAGCTCCTGGCTTGATGAGCCCAG 801 GGCGCTTACAGGCAGCCCATGAAGTTGATGACAGTTTTAGCATGAGAATCACACAGGGTCCCTGTCCTGGGCTCCTCTAA 881 AGCCAGTGGATGTGCTGGGCACCAGAGACAAATCATGGAGATGGCTGCTGGTGGCTCCCAGGTTGGCCCAGATGGGGTGA 961 GCTGACATACCACAGGCCCATCCCAGGCCCCGTGGGCTCTGCTTCTGGGGCTCCATACCCTGCCCTGCAGGGGTGCTGTG 1041 TTTTTCACACATTTCTTTCCCTGAAGCCTTCTGTAACCTGTCATTTTCCTTCCTTCCTCTTCCGGAGCCTGCTGCTTTCT 1121 CTGGACCTGTCTCCACCTCCCACACAGCTCATCGTGAACACCACTTGGTGATGGAGGGAGTGGACCCGTGTGTGGTCCCC 1201 AAGTGAGGCCACTGGGAGTTTGTCCTTTTCCTCCTTTGCTTCACTCCCAGCAGCAGACCCAGGTTGTCAGGACAGGAGGG 1281 CCTGAGCTAAGCAGTAGGCATCAGTCTCGTTTGTCTTCAGACGGCGGGGGCAGGTCCAGGGTGAGGCTGGGTGGAGGGCT 1361 GACCAAGGTCCAAAGGGCCTGCGCAGCCTCCGGGAGGGCAGCTTCTCCAGCCAGAGGCTTGTGTGAGCCATCGTGTGCTG 1441 GGCTTGTTTTTAAGTAAGAAACAAGGAAATCACTCCAGATTCTGTCATTCCAAGGAAAGGGAAGGGGACAGTTCAGGTTT 1521 CTCAGCTGTTCTTAGGGGTCACTGAGCGTCTACCTCCTCCTCCAGAGGAGGCTGGCTCAGAACACCTAGAGGAGGGGGCC 1601 GGGGATGCACCCCCCACCAGAGGCTGCCTTCAGCGTCTCACGGGTGCAGGACAGCGCTCAGGCTTGGGCTCTAAGCTCTG 1681 TGTCTAGTGTAGAACATGGGGAAGGAGCATCTTAGGAACTGCTGAAGTAACTTCTTACTGCTCTCACAATTCTAAGGAAG 1761 CGGGAGAACGGCCTCCTACCAACAGCGCCCACCCCAGAGCTGCCTGGGAAAGGGCAGTTTTACTGAAAGGTGCTTTACTG 1841 TTCACCTGCATCTTTCAGCAGCTCCCCTCCTGCCCTCACCTGGTCTTTTCCCTCTTTATCCCAAGCCTTTATGCTTGAGT 1921 CCCTTCCCCAGGGGCTGCCCACCCGACAGTTCCAGGCATTCCCTACCTGAGCTTCTTGTCTGCTTTTCCTTCTCCCACTG 2001 CAAGCGGCTGCTTGTGGGGCCTGGGATGAGCCCTCTCTGTCCCCACCGGCCCTCCTTGCCAAGCCATTCCTGGGTGAGTT 2081 CAGGCCTGCGGGAGCCACACATTCATCTCCACCTGGACACTTGAGCCGCATGGCCAGACCCCTCCCACCTGATGCGGTGG 2161 TGCGTGTGATTTGTCAAAAGAAAGCCTTCTGGATGCTGTTAAGATGTACCCTTCAGGTGAACCTGGTATCAGACCCACAG 2241 TACTTGCTGTTTGAGAAAAAATAAAAACAAAAAGGTCACCTGTTCTCCAGCCCTTTTCTCTTACCTGGTATTTCCTTCCT 2321 TTCTCCTCCCCCACCCCAAATAAAAAAACAAAAAACACTAGAATTTATTTATATGTATTGATGTTGTAGGTCTAGGTGAA 2401 AAAAAAAGAAGTAAATGTTTCACTGCTCTATTTATATATAATGTCTGAATTAATTCTGTGCAGGAAAGGCCAGGAAATTG 2481 CATGTGAAGTTCGGTGCAGTCACCACCTGTGTGTGACCTGAGCTGCAGTCTCTTCGCTGAGATGCAGGTTTTAAATGAGA 2561 CTTGGGGGGCTGAGGGCAGGCCTCAGGCCTCCCAGCGCCCCAACCCCTCCTTGGTCTAATGAAATGCAGTTCTTAGTGCA 2641 GAGATGTTTTAAGGTGCAATATATCTCTTCCTTTCCCGTGGTTTTAGAGCCAAGCTCAAGGTAGTAGGACGTAGGGTCTT 2721 ATTTTGTTTTCAAACCCCCATCCTCAGAGCGCAGATACATGCAGAGGCTTCTGCCAGGATACCACGGGGCCTTAGTGGGA 2801 ACAGGTGGAGACCAGCACTTCCCTTTCCTGCTGCTGAGGTAGGGATTGGGGGGTCAGAACCCACTCACTTTTGCCTGTTA 2881 AAGTTGCCCTCCTGACGCTGGCAGCTCTGCCTTGGTCACTGGGGATGCGGCTCGTTGCTCAGCCACCAGTGGCCTTGCGG 2961 TATTGTCCACCATCCACTAGAGTGGGATGAAGTCCAGAGTGTGGGTATACATCTCAGATGCCCATCTACCCACTGGGGAC 3041 TTCAATGCCAGCTGCATTTGGTTTGGTTTTCTTAACTGTTGGCTTCTCCCCACAGCGTTTTTTGTTTTTTTTTAAACATT 3121 CATATTGTTTTCAAACTTGGAATTCATAGACACTCTGGCTCTAGGTTCCTTAAGGGGGAAAACAAAAGATGACTTTATTT 3201 CACATTCAAGAAAATCAGTTCAGTTCCAAAGCTGTGGTCCTTCCAGCCACTTCTAGGGACACTGGGGAACCTTGTTAAAC 3281 GTTGACATCAGTGCTCTCCAGCCGTGCTGTCACCCTCCTATCTTCTGGATCTGCCTTCGCGATGGTCAGTGACAGCTTCT 3361 GGAAGCTGAGCACACACAGGTGCACAGCCATGCTGTGGTCTGGCCTGCTACGGCAGCATGGCAGCTCTGGTGGAGCCTTC 3441 TCCCTTGCCATTTGGTTCCCCTGTGCCAAGTAGCTGCAGGCTGCCCCTCAAATCTTCATTTGTCCCTTTTCACTTCCTGC 3521 AGAACAAGCCTGGGTTAGAGGGTCTGCTGGAAATGGCCTTTGAAGACCAAGGATACCAGGATGTGTGCACTCTGTCGTGT 3601 TCTGTGATGAATGGGAAACGTAGGCTTCCAGAAAGCCAGCTCTCTTCTGAAATGTGACGGACCTAAGCAGGAAGTCATCC 3681 AGGACAGGAGTGGCTCAGTGTTGGGGATGGACGCTGTCGCCCAGCCATGCTCCACCAGGGCCACCAATGTGTAGTTGGCT 3761 GGTGGTCTTCGGGCATGTGAGACCTGCTCTTCACTGTTTCCACCCCACTTGGTGGCCTCCAGGATGGTAGTGGCACCCTC 3841 AGAGCCCCATCTTCAGCATGTTCTGAAGCCTCAGAGTGGAAATTCCTGCTAAGGCTCTGTGTGGACGCCTTTCTCCCGTG 3921 ATCTAAAGGGGACACTGTACTCAAGCTTTTGACCTCATGCCTTGTGTAGTAAAAAAGGATTTGGGGGTTTTGTTTGGTTC 4001 CTGAGAGGGTTGTGTTTTGTTTTTGTTTCCTTTTGTTTATGTTTTGGCCTTTCCTCTTTGTCTTTCCATGTAGACCAGAT 4081 ATTTGAAAGGGCAGACGATGGCTAGAGGTGTAATGTGCAGCTTGTTTATACGGTATTTTGGGAAACTTACCTTGGATGGG 4161 AAATCGAATCGTGGATTCACCAGGCCGGTGCTGGCACACTCACCCTCGCCCTTTCCCTCCGGTTCAGTACCTATTGTTTC 4241 TCCTTTCAAATATGTGATTGTACTAGCTCTTTCCATATGAAAGAATTCTCCTTATTTAAATAAAAAAAGTTTAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | TZM-bl | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
PAR-CLIP data was present in GSM1462574. RNA binding protein: AGO2. Condition:TZM-bl ami BaL
... - Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al., 2013, mBio. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al. - mBio, 2013
UNLABELLED: The question of how HIV-1 interfaces with cellular microRNA (miRNA) biogenesis and effector mechanisms has been highly controversial. Here, we first used deep sequencing of small RNAs present in two different infected cell lines (TZM-bl and C8166) and two types of primary human cells (CD4(+) peripheral blood mononuclear cells [PBMCs] and macrophages) to unequivocally demonstrate that HIV-1 does not encode any viral miRNAs. Perhaps surprisingly, we also observed that infection of T cells by HIV-1 has only a modest effect on the expression of cellular miRNAs at early times after infection. Comprehensive analysis of miRNA binding to the HIV-1 genome using the photoactivatable ribonucleoside-induced cross-linking and immunoprecipitation (PAR-CLIP) technique revealed several binding sites for cellular miRNAs, a subset of which were shown to be capable of mediating miRNA-mediated repression of gene expression. However, the main finding from this analysis is that HIV-1 transcripts are largely refractory to miRNA binding, most probably due to extensive viral RNA secondary structure. Together, these data demonstrate that HIV-1 neither encodes viral miRNAs nor strongly influences cellular miRNA expression, at least early after infection, and imply that HIV-1 transcripts have evolved to avoid inhibition by preexisting cellular miRNAs by adopting extensive RNA secondary structures that occlude most potential miRNA binding sites. IMPORTANCE: MicroRNAs (miRNAs) are a ubiquitous class of small regulatory RNAs that serve as posttranscriptional regulators of gene expression. Previous work has suggested that HIV-1 might subvert the function of the cellular miRNA machinery by expressing viral miRNAs or by dramatically altering the level of cellular miRNA expression. Using very sensitive approaches, we now demonstrate that neither of these ideas is in fact correct. Moreover, HIV-1 transcripts appear to largely avoid regulation by cellular miRNAs by adopting an extensive RNA secondary structure that occludes the ability of cellular miRNAs to interact with viral mRNAs. Together, these data suggest that HIV-1, rather than seeking to control miRNA function in infected cells, has instead evolved a mechanism to become largely invisible to cellular miRNA effector mechanisms.
LinkOut: [PMID: 23592263]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM4903833 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Dermal fibroblasts / CTL_TD_21_a |
Location of target site | NM_013318 | 3UTR | GCCUCCUCCCUGUCCUGCCGCGCAGCCAGGGCGCCUUCUCAGCAGUGCUUCCGGCCCAGCCGCCCAUCCCUAGGCACAGUGAUUUGGCAGCA |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161239 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM4903835 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Dermal fibroblasts / CTL_TD_21_c |
Location of target site | NM_013318 | 3UTR | CUCCCUGCCUCCUCCCUGUCCUGCCGCGCAGCCAGGGCGCCUUCUCAGCAGUGCUUCCGGCCCAGCCGCCCAUCCCUAGGCACAGUGAUUUGGCAGCA |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161239 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 3 for dataset GSM1462574 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | TZM-bl / TZM-bl ami BaL |
Location of target site | ENST00000372249.1 | 3UTR | CCCUUUUCUCUUACCUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23592263 / GSE59944 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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98 hsa-miR-4251 Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT056156 | OTUD1 | OTU deubiquitinase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT080004 | MYL12B | myosin light chain 12B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT080407 | ONECUT2 | one cut homeobox 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT081901 | KCTD15 | potassium channel tetramerization domain containing 15 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT090342 | SEC61A1 | Sec61 translocon alpha 1 subunit | 2 | 8 | ||||||||
MIRT096824 | ZSWIM6 | zinc finger SWIM-type containing 6 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT140185 | CHAC1 | ChaC glutathione specific gamma-glutamylcyclotransferase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT149716 | LDLR | low density lipoprotein receptor | 2 | 6 | ||||||||
MIRT205293 | STK11IP | serine/threonine kinase 11 interacting protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT213265 | REST | RE1 silencing transcription factor | 2 | 6 | ||||||||
MIRT254069 | BACH1 | BTB domain and CNC homolog 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT256251 | ANKRD33B | ankyrin repeat domain 33B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT264966 | TMEM136 | transmembrane protein 136 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT267496 | FEN1 | flap structure-specific endonuclease 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT285077 | MIER1 | MIER1 transcriptional regulator | 2 | 2 | ||||||||
MIRT296167 | NCOA3 | nuclear receptor coactivator 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT316073 | ABRACL | ABRA C-terminal like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT360286 | HIST1H3E | histone cluster 1 H3 family member e | 2 | 2 | ||||||||
MIRT364793 | PRRC2B | proline rich coiled-coil 2B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443277 | TSPAN15 | tetraspanin 15 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443453 | CLIC5 | chloride intracellular channel 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT445938 | KLHL32 | kelch like family member 32 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT448012 | HLA-DOA | major histocompatibility complex, class II, DO alpha | 2 | 2 | ||||||||
MIRT448382 | TP53INP1 | tumor protein p53 inducible nuclear protein 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT448499 | RYBP | RING1 and YY1 binding protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT449896 | C11orf34 | placenta expressed transcript 1 | 1 | 2 | ||||||||
MIRT450457 | ZDHHC2 | zinc finger DHHC-type containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT450849 | HTR2A | 5-hydroxytryptamine receptor 2A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT453774 | NUCB1 | nucleobindin 1 | 2 | 10 | ||||||||
MIRT464399 | URM1 | ubiquitin related modifier 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT465008 | TUBB2A | tubulin beta 2A class IIa | 2 | 8 | ||||||||
MIRT465145 | TSC22D2 | TSC22 domain family member 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT467799 | SLC2A14 | solute carrier family 2 member 14 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT472597 | NACC1 | nucleus accumbens associated 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT477969 | DPM2 | dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 2, regulatory | 2 | 2 | ||||||||
MIRT486586 | ZNF619 | zinc finger protein 619 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT487739 | MICAL2 | microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT492529 | PTMA | prothymosin, alpha | 2 | 6 | ||||||||
MIRT496845 | KCNIP2 | potassium voltage-gated channel interacting protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT499064 | CTBP1 | C-terminal binding protein 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT502046 | LAMTOR1 | late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT503907 | ZSCAN25 | zinc finger and SCAN domain containing 25 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT506776 | KLHL15 | kelch like family member 15 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT510003 | UCP1 | uncoupling protein 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT513040 | BRIX1 | BRX1, biogenesis of ribosomes | 2 | 2 | ||||||||
MIRT513174 | MOAP1 | modulator of apoptosis 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT517592 | ZNF579 | zinc finger protein 579 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT521825 | POLR1D | RNA polymerase I subunit D | 2 | 2 | ||||||||
MIRT530663 | TRIM56 | tripartite motif containing 56 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT531718 | TARS | threonyl-tRNA synthetase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT535154 | PLEKHG5 | pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT536385 | LEFTY1 | left-right determination factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT543847 | APIP | APAF1 interacting protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT546973 | PRKAB2 | protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT548667 | CSRNP3 | cysteine and serine rich nuclear protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT548799 | CLIP4 | CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT549610 | TMEM101 | transmembrane protein 101 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT549716 | NUP37 | nucleoporin 37 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT549873 | ZNF260 | zinc finger protein 260 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT555383 | PPP1CC | protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566976 | LBR | lamin B receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT568052 | CHSY1 | chondroitin sulfate synthase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT570970 | TMBIM4 | transmembrane BAX inhibitor motif containing 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT571174 | ZNF85 | zinc finger protein 85 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT571364 | ZNF45 | zinc finger protein 45 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT572309 | LSM4 | LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated | 2 | 2 | ||||||||
MIRT572493 | BTN2A2 | butyrophilin subfamily 2 member A2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT606783 | KIAA0040 | KIAA0040 | 2 | 5 | ||||||||
MIRT607952 | NFAM1 | NFAT activating protein with ITAM motif 1 | 2 | 10 | ||||||||
MIRT609978 | HERPUD2 | HERPUD family member 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT610069 | CD300E | CD300e molecule | 2 | 2 | ||||||||
MIRT610118 | IL17REL | interleukin 17 receptor E like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT610151 | PRMT8 | protein arginine methyltransferase 8 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT611075 | ZNF621 | zinc finger protein 621 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT612011 | COX17 | COX17, cytochrome c oxidase copper chaperone | 2 | 2 | ||||||||
MIRT617901 | PTCHD3 | patched domain containing 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT618052 | MRVI1 | murine retrovirus integration site 1 homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT619526 | ZNF74 | zinc finger protein 74 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT624276 | CRISPLD2 | cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT625357 | MGLL | monoglyceride lipase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT626756 | NDUFA9 | NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT628851 | FAM151B | family with sequence similarity 151 member B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT630458 | GMPS | guanine monophosphate synthase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT634536 | MRPS17 | mitochondrial ribosomal protein S17 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT638806 | DCTN3 | dynactin subunit 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT647607 | TMTC2 | transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT650885 | PPP1R15A | protein phosphatase 1 regulatory subunit 15A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT653507 | SLC43A2 | solute carrier family 43 member 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT658608 | ENTPD5 | ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT666345 | SKAP2 | src kinase associated phosphoprotein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT693743 | ACACA | acetyl-CoA carboxylase alpha | 2 | 2 | ||||||||
MIRT704049 | EDEM3 | ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT709789 | CYBRD1 | cytochrome b reductase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT711837 | AMOTL2 | angiomotin like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT711875 | VASP | vasodilator stimulated phosphoprotein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT717349 | RAB40A | RAB40A, member RAS oncogene family | 2 | 2 | ||||||||
MIRT717746 | MYLK | myosin light chain kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT725398 | LRIG2 | leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 2 | 2 | 2 |
miRNA-Drug Associations | ||||||||||||||||||
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miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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