pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-155 |
Genomic Coordinates | chr21: 25573980 - 25574044 |
Description | Homo sapiens miR-155 stem-loop |
Comment | Human mir-155 is predicted based on homology to a cloned miR from mouse (MIR:MI0000177) . |
RNA Secondary Structure | |
Associated Diseases |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-155-3p | ||||||||||||||||||
Sequence | 43| CUCCUACAUAUUAGCAUUAACA |64 | ||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||||||||
Experiments | Cloned | ||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Biomarker Information |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | PTEN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 10q23del, BZS, CWS1, DEC, GLM2, MHAM, MMAC1, PTEN1, PTENbeta, TEP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | phosphatase and tensin homolog | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_000314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on PTEN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of PTEN (miRNA target sites are highlighted) |
>PTEN|NM_000314|3'UTR 1 ATTTTTTTTTATCAAGAGGGATAAAACACCATGAAAATAAACTTGAATAAACTGAAAATGGACCTTTTTTTTTTTAATGG 81 CAATAGGACATTGTGTCAGATTACCAGTTATAGGAACAATTCTCTTTTCCTGACCAATCTTGTTTTACCCTATACATCCA 161 CAGGGTTTTGACACTTGTTGTCCAGTTGAAAAAAGGTTGTGTAGCTGTGTCATGTATATACCTTTTTGTGTCAAAAGGAC 241 ATTTAAAATTCAATTAGGATTAATAAAGATGGCACTTTCCCGTTTTATTCCAGTTTTATAAAAAGTGGAGACAGACTGAT 321 GTGTATACGTAGGAATTTTTTCCTTTTGTGTTCTGTCACCAACTGAAGTGGCTAAAGAGCTTTGTGATATACTGGTTCAC 401 ATCCTACCCCTTTGCACTTGTGGCAACAGATAAGTTTGCAGTTGGCTAAGAGAGGTTTCCGAAGGGTTTTGCTACATTCT 481 AATGCATGTATTCGGGTTAGGGGAATGGAGGGAATGCTCAGAAAGGAAATAATTTTATGCTGGACTCTGGACCATATACC 561 ATCTCCAGCTATTTACACACACCTTTCTTTAGCATGCTACAGTTATTAATCTGGACATTCGAGGAATTGGCCGCTGTCAC 641 TGCTTGTTGTTTGCGCATTTTTTTTTAAAGCATATTGGTGCTAGAAAAGGCAGCTAAAGGAAGTGAATCTGTATTGGGGT 721 ACAGGAATGAACCTTCTGCAACATCTTAAGATCCACAAATGAAGGGATATAAAAATAATGTCATAGGTAAGAAACACAGC 801 AACAATGACTTAACCATATAAATGTGGAGGCTATCAACAAAGAATGGGCTTGAAACATTATAAAAATTGACAATGATTTA 881 TTAAATATGTTTTCTCAATTGTAACGACTTCTCCATCTCCTGTGTAATCAAGGCCAGTGCTAAAATTCAGATGCTGTTAG 961 TACCTACATCAGTCAACAACTTACACTTATTTTACTAGTTTTCAATCATAATACCTGCTGTGGATGCTTCATGTGCTGCC 1041 TGCAAGCTTCTTTTTTCTCATTAAATATAAAATATTTTGTAATGCTGCACAGAAATTTTCAATTTGAGATTCTACAGTAA 1121 GCGTTTTTTTTCTTTGAAGATTTATGATGCACTTATTCAATAGCTGTCAGCCGTTCCACCCTTTTGACCTTACACATTCT 1201 ATTACAATGAATTTTGCAGTTTTGCACATTTTTTAAATGTCATTAACTGTTAGGGAATTTTACTTGAATACTGAATACAT 1281 ATAATGTTTATATTAAAAAGGACATTTGTGTTAAAAAGGAAATTAGAGTTGCAGTAAACTTTCAATGCTGCACACAAAAA 1361 AAAGACATTTGATTTTTCAGTAGAAATTGTCCTACATGTGCTTTATTGATTTGCTATTGAAAGAATAGGGTTTTTTTTTT 1441 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATGTGCAGTGTTGAATCATTTCTTCATAGTGCTCCCCCGAGTTGGGACTAGGGCTTCAA 1521 TTTCACTTCTTAAAAAAAATCATCATATATTTGATATGCCCAGACTGCATACGATTTTAAGCGGAGTACAACTACTATTG 1601 TAAAGCTAATGTGAAGATATTATTAAAAAGGTTTTTTTTTCCAGAAATTTGGTGTCTTCAAATTATACCTTCACCTTGAC 1681 ATTTGAATATCCAGCCATTTTGTTTCTTAATGGTATAAAATTCCATTTTCAATAACTTATTGGTGCTGAAATTGTTCACT 1761 AGCTGTGGTCTGACCTAGTTAATTTACAAATACAGATTGAATAGGACCTACTAGAGCAGCATTTATAGAGTTTGATGGCA 1841 AATAGATTAGGCAGAACTTCATCTAAAATATTCTTAGTAAATAATGTTGACACGTTTTCCATACCTTGTCAGTTTCATTC 1921 AACAATTTTTAAATTTTTAACAAAGCTCTTAGGATTTACACATTTATATTTAAACATTGATATATAGAGTATTGATTGAT 2001 TGCTCATAAGTTAAATTGGTAAAGTTAGAGACAACTATTCTAACACCTCACCATTGAAATTTATATGCCACCTTGTCTTT 2081 CATAAAAGCTGAAAATTGTTACCTAAAATGAAAATCAACTTCATGTTTTGAAGATAGTTATAAATATTGTTCTTTGTTAC 2161 AATTTCGGGCACCGCATATTAAAACGTAACTTTATTGTTCCAATATGTAACATGGAGGGCCAGGTCATAAATAATGACAT 2241 TATAATGGGCTTTTGCACTGTTATTATTTTTCCTTTGGAATGTGAAGGTCTGAATGAGGGTTTTGATTTTGAATGTTTCA 2321 ATGTTTTTGAGAAGCCTTGCTTACATTTTATGGTGTAGTCATTGGAAATGGAAAAATGGCATTATATATATTATATATAT 2401 AAATATATATTATACATACTCTCCTTACTTTATTTCAGTTACCATCCCCATAGAATTTGACAAGAATTGCTATGACTGAA 2481 AGGTTTTCGAGTCCTAATTAAAACTTTATTTATGGCAGTATTCATAATTAGCCTGAAATGCATTCTGTAGGTAATCTCTG 2561 AGTTTCTGGAATATTTTCTTAGACTTTTTGGATGTGCAGCAGCTTACATGTCTGAAGTTACTTGAAGGCATCACTTTTAA 2641 GAAAGCTTACAGTTGGGCCCTGTACCATCCCAAGTCCTTTGTAGCTCCTCTTGAACATGTTTGCCATACTTTTAAAAGGG 2721 TAGTTGAATAAATAGCATCACCATTCTTTGCTGTGGCACAGGTTATAAACTTAAGTGGAGTTTACCGGCAGCATCAAATG 2801 TTTCAGCTTTAAAAAATAAAAGTAGGGTACAAGTTTAATGTTTAGTTCTAGAAATTTTGTGCAATATGTTCATAACGATG 2881 GCTGTGGTTGCCACAAAGTGCCTCGTTTACCTTTAAATACTGTTAATGTGTCATGCATGCAGATGGAAGGGGTGGAACTG 2961 TGCACTAAAGTGGGGGCTTTAACTGTAGTATTTGGCAGAGTTGCCTTCTACCTGCCAGTTCAAAAGTTCAACCTGTTTTC 3041 ATATAGAATATATATACTAAAAAATTTCAGTCTGTTAAACAGCCTTACTCTGATTCAGCCTCTTCAGATACTCTTGTGCT 3121 GTGCAGCAGTGGCTCTGTGTGTAAATGCTATGCACTGAGGATACACAAAAATACCAATATGATGTGTACAGGATAATGCC 3201 TCATCCCAATCAGATGTCCATTTGTTATTGTGTTTGTTAACAACCCTTTATCTCTTAGTGTTATAAACTCCACTTAAAAC 3281 TGATTAAAGTCTCATTCTTGTCATTGTGTGGGTGTTTTATTAAATGAGAGTTTATAATTCAAATTGCTTAAGTCCATTGA 3361 AGTTTTAATTAATGGGCAGCCAAATGTGAATACAAAGTTTTCAGTTTTTTTTTTTCCTGCTGTCCTTCAAAGCCTACTGT 3441 TTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGGCCTGAGAGTAGAGTATCTGTCTACTCATGTTTAATTAAGGAAAAACACTTAT 3521 TTTTAGGGCTTTAGTCATCACTTCATAAATTGTATAAGCACATTAAATAGCGTTCTAGTCCTGAAAAAGTCCAAGATTCT 3601 TAGAAAATTGTGCATATTTTTATTATGACAGATGTTTGAAGATAATTCCCCAGAATGGATTTGATACTTTAGATTTCAAT 3681 TTTGTGGCTTTTGTCTATTATTCTGTACTCTGCCATCAGCATATGGAAAGCTTCATTTACTCATCATGACTTGTGCCATA 3761 TAAAAATTGATATTTCGGAATAGTCTAAAGGACTTTTTGTACTTGAATTTAATCATGTTGTTTCTAATATTCTTAAAAGC 3841 TTGAAGACTAAAGCATATCCTTTCAACAAAGCATAGTAAGGTAATAAGAAAGTGTAGTTTGTACAAGTGTTAAAAAAATA 3921 AAGTAGACAATGTTACAGTGGGACTTATTATTTCAAGTTTACATTTTCTCCATGTAATTTTTTAAAAAGTAAATGAAAAA 4001 ATGTGCAATAATGTAAAATATGAAGTGTATGTGTACACACATTTTATTTTTCGGTATCTTGGGTATACGTATGGTTGAAA 4081 ACTATACTGGAGTCTAAAAGTATTCTAATTTATAAGAAGACATTTTGGTGATGTTTGAAAAATAGAAATGTGCTAGTTTT 4161 GTTTTTATATCATGTCCTTTGTACGTTGTAATATGAGCTGGCTTGGTTCAGTAAATGCCATCACCATTTCCATTGAGAAT 4241 TTAAAACTCACCAGTGTTTAATATGCAGGCTTCCAAAGGCTTATGAAAAAAATCAAGACCCTTAAATCTAGTTAATTTGC 4321 TGCTAACATGAAACTCTTTGGTTCTTTTATTTTTGCCAGATAATTAGACACACATCTAAAGCTTAGTCTTAAATGGCTTA 4401 AGTGTAGCTATTGATTAGTGCTGTTGCTAGTTCAGAAAGAAATGTTTGTGAATGGAAACAAGAATATTCAGTCCAAACTG 4481 TTGTAAGGACAGTACCTGAAAACCAGGAAACAGGATAATGGAAAAAGTCTTTTAAAGATGAAATGTTGGAGCCAACTTTC 4561 TTATAGAATTAATTGTATGTGGCTATAGAAAGCCTAATGATTGTTGCTTATTTTTGAGAGCATATTATTCTTTTATGACC 4641 ATAATCTTGCTGTTTTTCCATCTTCCAAAAGATCTTCCTTCTAATATGTATATCAGAATGTGGGTAGCCAGTCAGACAAA 4721 TTCATATTGGTTGGTAGCTTTAAAAAGTTTGTAATGTGAAGACAGGAAAGGACAAAATAGTTTGCTTTGGTGGTAGTACT 4801 CTGGTTGTTAAGCTAGGTATTTTGAGACTACTTCCCCATCACAACAACAATAAAATAATCACTCATAATCCTATCACCTG 4881 GAGACATAGCCATCGTTAATATGTTAGTGACTATACAATCATGTTTTCTTCTGTATATCCATGTATATTCTTTAAAAATG 4961 AAATTTATACTGTACCTGATCTCAAAGCTTTTTAGCTTAGTATATCTGTCATGAATTTGTAGGATGTTCCATTGCATCAG 5041 AAAACGGACAGTGATTTGATTACTTTCTAATGCCACAGATGCAGATTACATGTAGTTATTGAGAATCCTTTCGAATTCAG 5121 TGGCTTAATCATGAATGTCTAAATATTGTTGACATTAGGATGATACATGTAAATTAAAGTTACATTTGTTTAGCATAGAC 5201 AAGCTTAACATTGTAGATGTTTCTCTTCAAAAATCATCTTAAACATTTGCATTTGGAATTGTGTTAAATAGAATGTGTGA 5281 AACACTGTATTAGTAAACTTCATCACCTTTCTACTTCCTTATAGTTTGAACTTTTCAGTTTTTGTAGTTCCCAAACAGTT 5361 GCTCAATTTAGAGCAAATTAATTTAACACCTGCCAAAAAAAGGCTGCTGTTGGCTTATCAGTTGTCTTTAAATTCAAATG 5441 CTCATGTGACTTTTATCACATCAAAAAATATTTCATTAATGATTCACCTTTAGCTCTGAAAATTACCGCGTTTAGTAATT 5521 ATAGTGGGCTTATAAAAACATGCAACTCTTTTTGATAGTTATTTGAGAATTTTGGTGAAAAATATTTAGCTGAGGGCAGT 5601 ATAGAACTTATAAACCAATATATTGATATTTTTAAAACATTTTTACATATAAGTAAACTGCCATCTTTGAGCATAACTAC 5681 ATTTAAAAATAAAGCTGCATATTTTTAAATCAAGTGTTTAACAAGAATTTATATTTTTTATTTTTTAAAATTAAAAATAA 5761 TTTATATTTCCTCTGTTGCATGAGGATTCTCATCTGTGCTTATAATGGTTAGAGATTTTATTTGTGTGGAATGAAGTGAG 5841 GCTTGTAGTCATGGTTCTAGTGTTTCAGTTTGCCAAGTCTGTTTACTGCAGTGAAATTCATCAAATGTTTCAGTGTGGTT 5921 TTCTGTAGCCTATCATTTACTGGCTATTTTTTTATGTACACCTTTAGGATTTTCTGCCTACTCTATCCAGTTGTCCAAAT 6001 GATATCCTACATTTTACAAATGCCCTTTCAGTTTCTATTTTCTTTTTCCATTAAATTGCCCTCATGTCCTAATGTGCAGT 6081 TTGTAAGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGAATTTGATTTTCAAGAGTGCTAGACTTCCAATTTGAGAGATTAAA 6161 TAATTTAATTCAGGCAAACATTTTTCATTGGAATTTCACAGTTCATTGTAATGAAAATGTTAATCCTGGATGACCTTTGA 6241 CATACAGTAATGAATCTTGGATATTAATGAATTTGTTAGTAGCATCTTGATGTGTGTTTTAATGAGTTATTTTCAAAGTT 6321 GTGCATTAAACCAAAGTTGGCATACTGGAAGTGTTTATATCAAGTTCCATTTGGCTACTGATGGACAAAAAATAGAAATG 6401 CCTTCCTATGGAGAGTATTTTTCCTTTAAAAAATTAAAAAGGTTAATTATTTTGACTAAAAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | HTR-8/SVneo | ||||||
Disease | 5728.0 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
"Our study further proved that miR-155*-targeted PTEN 30-untranslated region (30UTR) increased IRAKM and NKIRAS1 expression by competing for miR-155* binding
... - Xue P; Zheng M; Diao Z; Shen L; Liu M; Gong et al., 2013, Placenta. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Xue P; Zheng M; Diao Z; Shen L; Liu M; Gong et al. - Placenta, 2013
Among miRNAs, miR-155 is a known regulator of immune system. Accumulating studies have revealed the connections between miR-155 and activator protein 1 (AP-1)/nuclear factor (NF)-kappaB. However, miR-155*, a miR-155 paralog, has so far been less studied. Here we demonstrated that miR-155*, induced by lipopolysaccharide (LPS) in an AP-1/NF-kappaB dependent manner, played a positive feedback role in AP-1/NF-kappaB pathway via targeting interleukin-1 receptor-associated kinase M (IRAKM) and NF-kappaB inhibitor interacting Ras-like 1 (NKIRAS1) in trophoblasts. Our study further proved that miR-155*-targeted PTEN 3'-untranslated region (3'UTR) increased IRAKM and NKIRAS1 expression by competing for miR-155* binding, thereby suppressing AP-1/NF-kappaB activation induced by LPS.
LinkOut: [PMID: 23684381]
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MiRNA-Target Expression Profile | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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73 hsa-miR-155-3p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT005808 | IRAK3 | interleukin 1 receptor associated kinase 3 | 4 | 1 | ||||||||
MIRT082844 | ZNF460 | zinc finger protein 460 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT256047 | UBE2K | ubiquitin conjugating enzyme E2 K | 2 | 4 | ||||||||
MIRT437787 | PTEN | phosphatase and tensin homolog | 2 | 1 | ||||||||
MIRT456168 | ZDHHC6 | zinc finger DHHC-type containing 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT464916 | TXNIP | thioredoxin interacting protein | 2 | 4 | ||||||||
MIRT475559 | HNRNPF | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F | 2 | 2 | ||||||||
MIRT499608 | DNAJA1 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A1 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT504220 | MYO6 | myosin VI | 2 | 4 | ||||||||
MIRT504256 | C1orf147 | chromosome 1 open reading frame 147 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT507642 | CREBRF | CREB3 regulatory factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT522858 | KIAA1551 | KIAA1551 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT527505 | MYD88 | myeloid differentiation primary response 88 | 5 | 2 | ||||||||
MIRT530713 | ORMDL3 | ORMDL sphingolipid biosynthesis regulator 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT532851 | ZNF699 | zinc finger protein 699 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT535952 | MIA3 | MIA family member 3, ER export factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT539041 | ATXN1L | ataxin 1 like | 2 | 4 | ||||||||
MIRT556391 | LUC7L | LUC7 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT558617 | CNOT6L | CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT559869 | ATXN3 | ataxin 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT569208 | SHC3 | SHC adaptor protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT573122 | C18orf25 | chromosome 18 open reading frame 25 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT575076 | Ddit4 | DNA-damage-inducible transcript 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT607597 | ABCF3 | ATP binding cassette subfamily F member 3 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT609386 | PHEX | phosphate regulating endopeptidase homolog X-linked | 2 | 2 | ||||||||
MIRT610550 | MDN1 | midasin AAA ATPase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT612390 | TCF7L2 | transcription factor 7 like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT612910 | GTDC1 | glycosyltransferase like domain containing 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT613314 | ARL5C | ADP ribosylation factor like GTPase 5C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT613356 | ADAMTS5 | ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT613541 | CLMP | CXADR like membrane protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT617029 | SYT6 | synaptotagmin 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT618044 | MRVI1 | murine retrovirus integration site 1 homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT619307 | KIRREL | kirre like nephrin family adhesion molecule 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT623209 | MTFR1L | mitochondrial fission regulator 1 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT625448 | RANGAP1 | Ran GTPase activating protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT634551 | MACC1 | MACC1, MET transcriptional regulator | 2 | 2 | ||||||||
MIRT640740 | EPB41 | erythrocyte membrane protein band 4.1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT640906 | RAB13 | RAB13, member RAS oncogene family | 2 | 2 | ||||||||
MIRT644025 | ZNF792 | zinc finger protein 792 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT651489 | WT1 | Wilms tumor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT652037 | LINC00598 | long intergenic non-protein coding RNA 598 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT669093 | CDK6 | cyclin dependent kinase 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT696720 | WNT3 | Wnt family member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT698085 | TPM1 | tropomyosin 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT703284 | GID4 | GID complex subunit 4 homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT707183 | ARHGEF33 | Rho guanine nucleotide exchange factor 33 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT710362 | CREB5 | cAMP responsive element binding protein 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT713501 | DCAF17 | DDB1 and CUL4 associated factor 17 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT717153 | LRRC3C | leucine rich repeat containing 3C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT719038 | ATP1A1 | ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT719489 | LSG1 | large 60S subunit nuclear export GTPase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT720284 | DPYSL3 | dihydropyrimidinase like 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT732474 | NLRP3 | NLR family pyrin domain containing 3 | 2 | 0 | ||||||||
MIRT732620 | MS | multiple sclerosis | 1 | 0 | ||||||||
MIRT732968 | TGFBR2 | transforming growth factor beta receptor 2 | 3 | 0 | ||||||||
MIRT733063 | AGTR1 | angiotensin II receptor type 1 | 3 | 0 | ||||||||
MIRT733206 | ADAM10 | ADAM metallopeptidase domain 10 | 1 | 0 | ||||||||
MIRT733302 | CRP | C-reactive protein | 2 | 0 | ||||||||
MIRT734202 | PDCD4 | programmed cell death 4 | 3 | 0 | ||||||||
MIRT734467 | SIRT1 | sirtuin 1 | 2 | 0 | ||||||||
MIRT734701 | Foxo3 | forkhead box O3 | 1 | 0 | ||||||||
MIRT734889 | SP4 | Sp4 transcription factor | 2 | 0 | ||||||||
MIRT735047 | BATF | basic leucine zipper ATF-like transcription factor | 1 | 0 | ||||||||
MIRT735048 | SPI1 | Spi-1 proto-oncogene | 1 | 0 | ||||||||
MIRT735734 | PICALM | phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein | 3 | 0 | ||||||||
MIRT735944 | TNF | tumor necrosis factor | 1 | 0 | ||||||||
MIRT736131 | MYLK | myosin light chain kinase | 2 | 0 | ||||||||
MIRT736780 | FOXP3 | forkhead box P3 | 1 | 0 | ||||||||
MIRT736781 | CEBPB | CCAAT/enhancer binding protein beta | 1 | 0 | ||||||||
MIRT736858 | WEE1 | WEE1 G2 checkpoint kinase | 2 | 0 | ||||||||
MIRT736873 | TLR3 | toll like receptor 3 | 2 | 0 | ||||||||
MIRT736902 | CFH | complement factor H | 2 | 0 |
miRNA-Drug Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||
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