pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-412 |
Genomic Coordinates | chr14: 101065447 - 101065537 |
Synonyms | MIRN412, hsa-mir-412, MIR412 |
Description | Homo sapiens miR-412 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-412-3p | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 54| ACUUCACCUGGUCCACUAGCCGU |76 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Not_experimental | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | DRVs in miRNA |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | XIAP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | API3, BIRC4, IAP-3, ILP1, MIHA, XLP2, hIAP-3, hIAP3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | X-linked inhibitor of apoptosis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001167 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on XIAP | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of XIAP (miRNA target sites are highlighted) |
>XIAP|NM_001167|3'UTR 1 TCTAACTCTATAGTAGGCATGTTATGTTGTTCTTATTACCCTGATTGAATGTGTGATGTGAACTGACTTTAAGTAATCAG 81 GATTGAATTCCATTAGCATTTGCTACCAAGTAGGAAAAAAAATGTACATGGCAGTGTTTTAGTTGGCAATATAATCTTTG 161 AATTTCTTGATTTTTCAGGGTATTAGCTGTATTATCCATTTTTTTTACTGTTATTTAATTGAAACCATAGACTAAGAATA 241 AGAAGCATCATACTATAACTGAACACAATGTGTATTCATAGTATACTGATTTAATTTCTAAGTGTAAGTGAATTAATCAT 321 CTGGATTTTTTATTCTTTTCAGATAGGCTTAACAAATGGAGCTTTCTGTATATAAATGTGGAGATTAGAGTTAATCTCCC 401 CAATCACATAATTTGTTTTGTGTGAAAAAGGAATAAATTGTTCCATGCTGGTGGAAAGATAGAGATTGTTTTTAGAGGTT 481 GGTTGTTGTGTTTTAGGATTCTGTCCATTTTCTTTTAAAGTTATAAACACGTACTTGTGCGAATTATTTTTTTAAAGTGA 561 TTTGCCATTTTTGAAAGCGTATTTAATGATAGAATACTATCGAGCCAACATGTACTGACATGGAAAGATGTCAAAGATAT 641 GTTAAGTGTAAAATGCAAGTGGCAAAACACTATGTATAGTCTGAGCCAGATCAAAGTATGTATGTTTTTAATATGCATAG 721 AACAAAAGATTTGGAAAGATATACACCAAACTGTTAAATGTGGTTTCTCTTCGGGGAGGGGGGGATTGGGGGAGGGGCCC 801 CAGAGGGGTTTTATAGGGGCCTTTTCACTTTCTACTTTTTTCATTTTGTTCTGTTCGAATTTTTTATAAGTATGTATTAC 881 TTTTGTAATCAGAATTTTTAGAAAGTATTTTGCTGATTTAAAGGCTTAGGCATGTTCAAACGCCTGCAAAACTACTTATC 961 ACTCAGCTTTAGTTTTTCTAATCCAAGAAGGCAGGGCAGTTAACCTTTTTGGTGCCAATGTGAAATGTAAATGATTTTAT 1041 GTTTTTCCTGCTTTGTGGATGAAAAATATTTCTGAGTGGTAGTTTTTTGACAGGTAGACCATGTCTTATCTTGTTTCAAA 1121 ATAAGTATTTCTGATTTTGTAAAATGAAATATAAAATATGTCTCAGATCTTCCAATTAATTAGTAAGGATTCATCCTTAA 1201 TCCTTGCTAGTTTAAGCCTGCCTAAGTCACTTTACTAAAAGATCTTTGTTAACTCAGTATTTTAAACATCTGTCAGCTTA 1281 TGTAGGTAAAAGTAGAAGCATGTTTGTACACTGCTTGTAGTTATAGTGACAGCTTTCCATGTTGAGATTCTCATATCATC 1361 TTGTATCTTAAAGTTTCATGTGAGTTTTTACCGTTAGGATGATTAAGATGTATATAGGACAAAATGTTAAGTCTTTCCTC 1441 TACCTACATTTGTTTTCTTGGCTAGTAATAGTAGTAGATACTTCTGAAATAAATGTTCTCTCAAGATCCTTAAAACCTCT 1521 TGGAAATTATAAAAATATTGGCAAGAAAAGAAGAATAGTTGTTTAAATATTTTTTAAAAAACACTTGAATAAGAATCAGT 1601 AGGGTATAAACTAGAAGTTTAAAAATGCTTCATAGAACGTCCAGGGTTTACATTACAAGATTCTCACAACAAACCTATTG 1681 TAGAGGTGAGTAAGGCATGTTACTACAGAGGAAAGTTTGAGAGTAAAACTGTAAAAAATTATATTTTTGTTGTACTTTCT 1761 AAGAGAAAGAGTATTGTTATGTTCTCCTAACTTCTGTTGATTACTACTTTAAGTGATATTCATTTAAAACATTGCAAATT 1841 TATTTTATTTATTTAATTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGAGTGATCTCTGCT 1921 CACTGCAACCTCCGCCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCAGGTGCCA 2001 CCATGCCCGACTAATTTTTTTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCAAACTCCTGAC 2081 CTCAAGAGATCCACTCGCCTTGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCACGCCCGGCTAAAACATTGCA 2161 AATTTAAATGAGAGTTTTAAAAATTAAATAATGACTGCCCTGTTTCTGTTTTAGTATGTAAATCCTCAGTTCTTCACCTT 2241 TGCACTGTCTGCCACTTAGTTTGGTTATATAGTCATTAACTTGAATTTGGTCTGTATAGTCTAGACTTTAAATTTAAAGT 2321 TTTCTACAAGGGGAGAAAAGTGTTAAAATTTTTAAAATATGTTTTCCAGGACACTTCACTTCCAAGTCAGGTAGGTAGTT 2401 CAATCTAGTTGTTAGCCAAGGACTCAAGGACTGAATTGTTTTAACATAAGGCTTTTCCTGTTCTGGGAGCCGCACTTCAT 2481 TAAAATTCTTCTAAAACTTGTATGTTTAGAGTTAAGCAAGACTTTTTTTCTTCCTCTCCATGAGTTGTGAAATTTAATGC 2561 ACAACGCTGATGTGGCTAACAAGTTTATTTTAAGAATTGTTTAGAAATGCTGTTGCTTCAGGTTCTTAAAATCACTCAGC 2641 ACTCCAACTTCTAATCAAATTTTTGGAGACTTAACAGCATTTGTCTGTGTTTGAACTATAAAAAGCACCGGATCTTTTCC 2721 ATCTAATTCCGCAAAAATTGATCATTTGCAAAGTCAAAACTATAGCCATATCCAAATCTTTTCCCCCTCCCAAGAGTTCT 2801 CAGTGTCTACATGTAGACTATTCCTTTTCTGTATAAAGTTCACTCTAGGATTTCAAGTCACCACTTATTTTACATTTTAG 2881 TCATGCAAAGATTCAAGTAGTTTTGCAATAAGTACTTATCTTTATTTGTAATAATTTAGTCTGCTGATCAAAAGCATTGT 2961 CTTAATTTTTGAGAACTGGTTTTAGCATTTACAAACTAAATTCCAGTTAATTAATTAATAGCTTTATATTGCCTTTCCTG 3041 CTACATTTGGTTTTTTCCCCTGTCCCTTTGATTACGGGCTAAGGTAGGGTAGAGTGGGTGTAGTGAGTGTATATAATGTG 3121 ATTTGGCCCTGTGTATTATGATATTTTGTTATTTTTGTTGTTATATTATTTACATTTCAGTAGTTGTTTTTTGTGTTTCC 3201 ATTTTAGTGGATAAAATTTGTATTTTGAACTATGAATGGAGACTACCGCCCCAGCATTAGTTTCACATGATATACCCTTT 3281 AAACCCGAATCATTGTTTTATTTCCTGATTACACAGGTGTTGAATGGGGAAAGGGGCTAGTATATCAGTAGGATATACTA 3361 TGGGATGTATATATATCATTGCTGTTAGAGAAATGAAATAAAATGGGGCTGGGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAG 3441 CACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTC 3521 TACTAAAAAACAGAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 3601 GGTGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCTCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTC 3681 TGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATAAGAAAATGGGAAGCAATATTTGACATAGTTCTTTTTAGTCAAATCTACTTGT 3761 TAAAAAAAGGGTAGCAGTTTATTCATCTGTGAAAGGAAAATAATACTTATCTTACAAGGTTGCAAGAGCTCAAGGAGACC 3841 ATGTATGTAAAGTTCCTGCTGTAAATATGAACTCCCATCCTAATACCCTTTTACCTCTCTGTGGGTTTGTCTTGACCTGG 3921 AAATTTGGGCTAAAACTTAGAAAAAATTCTTACATGATAACTCAGTGATGCTTACTCATAGTTTTTGGTGTTTCTCATAG 4001 ATAAGATATAAATCAGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCT 4081 GAGGTCGGGAGGTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGG 4161 TGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGTGGTG 4241 AGCGAAGATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAGATATAAATCA 4321 CAATAAATAAATAGGTCAATACAAATGTTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCCATAGTCGCAGCTACTCTGGAGGCAGAG 4401 GCAGGAGGATCACTTGAGCCCATGAATTTGAGGCAGCAGTGAGCTATGATTGTGCCACTGTACTCCAGTCTGGGTGACAG 4481 AGTGAGACCCCATCTCTAAATAAATAGGTCAAACCCTTAAAAATATTTAAATTCTTAAAAAATTGAAAAGATTATTCTTC 4561 TCAAATTTAGTTGAGCTTTCTAAGAGAAGCAATTGGCTTTTTCCCACTTCAATAATCATTTTCAGTTTGACTCATACAGT 4641 TAACACAATGTGAATTTCTTCCTCAGCATAACAGAGTTATAGAATGACAGGGCTGGAAGTGACCTTAGAGAGTATCCAGT 4721 TCTTTCATTTTACAGGTGAGGCAACTGAGACTCAAAGGTGATGTAATTTGTGCAAAGATTATAGCTAATTAGTAGCAGAG 4801 CCCTGACTGGGACATAGTTTGAAGGTGAAAAACTTCACCAAGCTACCTTTCTTGAAAGGTCCAAATGTTTATGTTTTCAA 4881 CTACTCTTTCCACTGTACCATAACTTTCACTACATATTAAATGACACTTTATAACTAATATAATAGGACAATCATCAATG 4961 CATATATAGCCAGCCCTTCATATCTGTGGGTTTTGCATCCATGGATTCAACCAAGGAGGAATTGAAAACACTGAGAAAAA 5041 AAAAAAAGACCACACAATAAAAAAAAAAAATACAAAATAATACAAAGAAAAAGCCAAAATTGTCATACTGTTGTTAAGCA 5121 ACAGTATAACAACTATTTACATAGCATTAAGGTTGGTGCAAAAATGCAAAAAAAAAAAAAGCAATTATTTTTAAACCAAC 5201 CTAATATATTGTATTAGGTATTAAAGTCATCTGGACATGAATTAAAGTATATGATGCCAGCCTGGACAAAAGGCAAAACC 5281 CTGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTAGTCCTGGCTACTCCGGAGCCTGAGGTG 5361 GGAGGATCGCTTGAGTCTGGGAGGCAGAGGCTGCATTGAGCTATGATCATGGCACTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGTGC 5441 AAGACCTTGTCTCAGAATAAATAAAGTATGTGATGAAGATGTGCATACATTATATGCAAATACTGTTTTTTTTTTTTTTA 5521 ATTTAAACAGTCTCACTGTGTTGCCCAGGATGGAGTGCAATGGCACAATCTTGGCTCATGGCAAACTCTGCCTCGCAAGC 5601 AGCTGGGACTACAGGCATGCTCCACGGTGCCCAGTTAATTTTTTTTGTATTCTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTG 5681 GCCAGGCTAGTCTTGAATTTCTGACCTCAAGTGATTCATCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGGCC 5761 GGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGTGACTGGTTTCGCGGTGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAGGTGAT 5841 CTGCCTGCCTCGGCCTCACAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGCTCCCGGCCTTGTGTGATTTTATCTAAGGG 5921 ACTTAAGCGTCCTCAGGTCCTAGGGGGTCGTGAAACCAAAACCCCAGGGATAGCAAGGGACAATTGTATCTTCAAAGTAG 6001 ACAAATGGCGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAGTTTCCGAGGCTGAGGCAGGCGGCTCACCTGAGGTC 6081 AGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGCTGAAACCCTGTCTGTACAAAAATACAAAAATAGCTGGGCATGGTGGCGCA 6161 TGCCTGTAGTCCCAGCTACTAGAGCGACTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGGGAGCCAAG 6241 ATGGCGCCACCGCACTCCAGCCTAGGTGATAGAGTGAGACTCCCTCTCAAAAACAAAACAAAACAAAAAAATTAGACAAA 6321 TGCTACATTAATGTTTGGGTGGTCAGATTCTACTTTGAATCTGAAGTTTGCAGATATGCCTATAGATTTTTGGAGTTTAC 6401 CACTTTCTTATTCTGTATCATTAATGTAATATTTTAAATTACTATATATGTTACCATTTTTCTGGATTTAGTAAGAAATT 6481 TGCAGTTTTGGTTTGATGTAACAAGGGTTTTAATGTAATTTATGTTAGATTTTGCATTTTTTTCATTACTGTTATATTTT 6561 AACCTGACTGACTGATCTAATTGTATTAGTATTGTGAATAATCATGTGAAATGTTTTGAGACAGAGTACTATATTTGTGA 6641 ATATAATTTTATGGTTTTTTTCACTTAGAACCTTTCTGTGTGGAAAACTAAGAAAATTGCTTTCTGCTGTATAATCTGGC 6721 ATTCATTGTAGATTAAAGCTTATTTTTCTGTGAATAAAACGTATTCAATAAAATACTATTCTTTAAAATTATATCATAAA 6801 AAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | islets |
Tools used in this research | TargetScan |
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in Supplenentary. RNA binding protein: AGO.
... - Kameswaran V; Bramswig NC; McKenna LB; Penn et al., 2014, Cell metabolism. |
Article |
- Kameswaran V; Bramswig NC; McKenna LB; Penn et al. - Cell metabolism, 2014
Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a complex disease characterized by the inability of the insulin-producing beta cells in the endocrine pancreas to overcome insulin resistance in peripheral tissues. To determine if microRNAs are involved in the pathogenesis of human T2DM, we sequenced the small RNAs of human islets from diabetic and nondiabetic organ donors. We identified a cluster of microRNAs in an imprinted locus on human chromosome 14q32 that is highly and specifically expressed in human beta cells and dramatically downregulated in islets from T2DM organ donors. The downregulation of this locus strongly correlates with hypermethylation of its promoter. Using HITS-CLIP for the essential RISC-component Argonaute, we identified disease-relevant targets of the chromosome 14q32 microRNAs, such as IAPP and TP53INP1, that cause increased beta cell apoptosis upon overexpression in human islets. Our results support a role for microRNAs and their epigenetic control by DNA methylation in the pathogenesis of T2DM.
LinkOut: [PMID: 24374217]
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MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||||||||||||||||
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138 hsa-miR-412-3p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT005780 | ACVR1C | activin A receptor type 1C | 1 | 1 | ||||||||
MIRT062013 | YOD1 | YOD1 deubiquitinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT345112 | ATXN7L3 | ataxin 7 like 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT383735 | EDEM3 | ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT396956 | CELF1 | CUGBP Elav-like family member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT439280 | XIAP | X-linked inhibitor of apoptosis | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439313 | VAT1 | vesicle amine transport 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439375 | TUBA1A | tubulin alpha 1a | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439418 | TMOD1 | tropomodulin 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439503 | SURF4 | surfeit 4 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439563 | SON | SON DNA binding protein | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439598 | SLC3A2 | solute carrier family 3 member 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439670 | SETD1B | SET domain containing 1B | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439767 | RMND5A | required for meiotic nuclear division 5 homolog A | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439922 | PPL | periplakin | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439947 | PLEKHA6 | pleckstrin homology domain containing A6 |