pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-382 |
Genomic Coordinates | chr14: 101054306 - 101054381 |
Synonyms | MIRN382, hsa-mir-382, MIR382 |
Description | Homo sapiens miR-382 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | |
Associated Diseases |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-382-3p | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | 47| AAUCAUUCACGGACAACACUU |67 | ||||||||||||||||||||||||
Evidence | Not_experimental | ||||||||||||||||||||||||
Experiments | |||||||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | UHMK1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | KIS, KIST, P-CIP2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | U2AF homology motif kinase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_144624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_001184763 , NM_175866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on UHMK1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of UHMK1 (miRNA target sites are highlighted) |
>UHMK1|NM_144624|3'UTR 1 GTATGCAAATGCTGGTGATTCCAAAGCTGCGCAGAAATTACTGACTGGAAGGATGTTTGATGGGAAGTTTGTTGTGGCTA 81 CATTCTACCCGCTGAGTGCCTACAAGAGGGGATATCTGTATCAAACCTTGCTTTAATCAGTAACCTAAGGACTGTTTCCT 161 TTTTCTCCTCTTCCATTTCTTGGGTTATTCCACATATGAATGCAGGACTACCCCCTTACCATTTTAAGAAGGTACTTTAT 241 ACATTTATTTAATCCTACTAATGTGCAGCCATTGCCCAAGCAGTGACTGCGTTGCATACATTTGGCACTGAGTAGGACAA 321 GACCTCTCAGCTATACATTGAGGGGTTTTAGAGCATCCATGTGGGCAACCCTTTTTTGTGCGGGAGAGCAGGTGTTGCTC 401 TTCAGTATGTAGCCTAAAAAAATCTTAATTATTTCATGGATCATGAAGCAAGGATGAATAATATCATGTCTTGGTAAATA 481 CTAACAAATTTGTTAGGTTTGGTGACATCATTTACAGATTATTTCTTTATGTTGTCCAGTGGTTCTTCCTTATTGTTGAT 561 ATCCATAAGCTGGCACTGGATGCTCTCAGTAATGTTAAGTAATTGTCAAGCAGCAGTTACCTACTGTGTTCTTAACACTG 641 AGTTGTGAATTTTTTCTTAAAGCAGTACTGTAGTACTGAATATTCCTTTAAAGGAACTGCAGTGAGCCTATCTAAGTTTT 721 TTTAAATTAAGGCTTTTAAAATAGAAAGCTGATGCTTGATCTTGCACAATTTTTATGTCTAGTATGTATGCTTGAGTGAA 801 TGTGCGAGTATGAATGATTAGAGAAAATTTGAGTCAGTGTACTTTATAGTGTGAATCCTGTGAGCTAATACAGTCTATAC 881 TTATTTCTTCCCTACCTGTTTCACATCCGTAAGATTTAAGATATACATTTTTTGAGAGGTAGTCTGTCTGATACAATGTA 961 AATGACAAAACATAATTCCTGAGAGGCCCAGAACAAACTGGAGTCTAGCCTGGAGTTAAATTGAGACTTCTAAAATGATT 1041 GGAACAAAGACTAAGTTGTGCCAGATGTAAATCAACCCCTCTTTTAGTTTACTTTAGACTTTGTATTAGCTCATCTTTTT 1121 TGTAGTAAATCTATAGTTTTAAGGTTTCTCAAGATGTGGCTCTACCTACTATGATGAAAATTGAAGTGGGTCAAAAGAAT 1201 TAGATGTACAGTGAAGGGAAAAGAAAAAAAATGGGCGAAGAGAGGGTGGAAAATAAAAGGATTCTTTTTTCTTCCTTTCT 1281 GTTTCTCGTATCCCTGCTCCCTTTTTCCTCCCCTTCCCTCATTCTTTGCCTCTATCCTTAGCTGAAGACAAACTAGAGGA 1361 GCAGCATCCCAGGTAGTTTGGCTTTTGACTGCAAGGTAGTTAAGAAAGGTGTAGATATAATGAGGTAGAAGTAGAAAGGA 1441 AGAAAAACTCAAAGAATTCTTAAAAGGATTCATAGCAACATAATGTGTCCCTGAGTAGAGGATGCTGCTATGCGTGAGTT 1521 CATGGACACAAGTTGATTACATGGTTTTTAGAATTATAATTATGGATTCTTCTTATTTCATGGTAGGTTGTCTTTAAAGA 1601 TATAAAAATTAGGATGCCTTTATGAAGCACTGATTATACCAAAAAAAAAAGACAAGTTATATACAGGTTATTAATTTTTT 1681 TATTTATTTATTTTTTCCTAAGGAAAAAGTCTTCTATCTTTCCCTGCTGGAAGCCTCCTCATATTTCCTTATGTTTGCCA 1761 TGCAGGTTGCTGAGAGTCCAGTTAGAATTTGCATTTTACAGAATGAAATACTTTACCCCATTCAAACAATTATTGTTTGA 1841 CATTTTAGTTATTTATAATTGTCAAATTCAGGACTCTCCTTTAATGTTTATTATGAAACCAAATTTGGCATAAGGAGGCT 1921 GATTTATGAATTACCAAAGGGTCTTGTGGCATGTTCCCCAATACATGCCCTTAGAAGGAAGAACTATTATTTTTTATTTT 2001 GGCCCTTTCAGGAGTTGATTATAAATTGGTTTGTTTTCAAGTCAGAATTCAAGTGGGCAGAACCCGTATTGTGAAGACCT 2081 AAACTTTCCTAAATGTTCATATGGGTAGCAGATTTTGTGGTGATTAGAAACATCAGGTCCTTAAATACGATGAACATGGG 2161 ATACAAAGGAATTCTTTATAAGGGCAAGTATCCTAAGTTAGCACATTTACTTTTCTCTCCCCTCCGCCCCCAAAAGAAAA 2241 ATCCTTACAAATAAACTGCAGGTAGGCTTCTAAGCCTAGTCCTGCAGTATGCTGCTAACATCTTGATGCCAATCTTCACA 2321 GCATTCTTTGATTGTCATCTTATTGCTGATACATTCATACATATATTTAGTGCTTGACACTGTAGAATTTTGTTACAGAA 2401 GATGGTTACTAGATTTTAAGGGAGCTGAGGGAATAATTGATGAGCCTTGAATTAACCATGCATTTAATTAGATTTTTTGT 2481 TGTTGTTGTTGTTGTTTTGAGATGATGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCAATCTCGGCTCACTGCA 2561 ACCTCTGCCTCGCAGGTTTGAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGTTTACAGGCGCTTGCCACCACACC 2641 TGGCTAGATGTTTTATATTAAAGCCAGAGAATTGAAAAAGAAATGCCTCCTGTGATTGAAATTATTTTATAGCTCTTAGC 2721 CCGTTCTACCAAAGATCACATTAGCAGATTACCCCTCCCTCCTGTGATATTATCTTTCTTAAACCTGAACCAAATATCAA 2801 AAGATACAAGTTTCATGATTAGGATGAAATATATACATAGGGATTTTGGTTTATTGAAGTTATTGAAAGACCTAGAAATT 2881 TTCTTTTTGAGAGAAAGGGTAAAGAGGTGAGGGTTCATGTCACTTAACCCCTACCCTTTTGGGCAAATTTTGTCTCAGGT 2961 AGTGTTTCATTCCCTAAATTAATACCTGTGCTTCCTTGCCTCTCACCTTCCCAGTTACTTCTTTGGGGTATTACTGTGGC 3041 ACATTGTACACCCAGAAAAGGCACATACAGTGATTATTTTGTGGGAAATACTTGATTCTTTTGAAATATATTTGGAGGGG 3121 GTAGCTAGCTAGCCACTGTCAAAACTAATGCTGTATTTACAGGACAAAAACAAGTAGAGTTGGACACCTCAGTAAGAGAC 3201 AGCATTAACTAAAAGTACTGACTGCCTTTTAAAGGAATTTTTAAAACTATTCTCTTGCAATAAGAGATCCGCATTTATTA 3281 CCACTGGATGTCTTCCTTTTTTGTGGCCACCAATATAGCAGCTCTCTTTAGAGGGATTCCCTTTCTGCTATGCCTTGAGC 3361 CAAACTGGCTGCTTTTAGAACAAAAACCATAAGTATGGTTTTACTCGAACTTCTCTTTGTTTTTATTGAGAGAAATATTG 3441 CCTTCTTTTTGGTACTCCAGCTGCTAAAGAGTGCTGAGATATGTTAAATTATTTTTTAAAAGAAAATCTCCAAATACTTA 3521 TTTAACTTGTCTTCTAGATTCATGTTGCTTATATTTTAACTATTGAGCAAGTTTATTATAAGGAATGCTGCCATATAGAG 3601 AAAGCTGAAGAGAAACCATGGGCAGAAGGCTTTTTTCTGTCTTATTACACTGGACCTTCACTCTGGTAAGGGCATCAGTT 3681 ACTTTTCTGGAATAAAAGGCGGAGTTAGAGCACTTATCAGATGCTGTTTCATGGCTTGTTTTAGTTAATTTATCATGCAG 3761 ATAACTAACATTTGGGTATCTTTTTGTTTTAGGTCTTATTTTCTGACTGTTAGGCCTATCTTACACATAAGTTCTACTAT 3841 CAGTATACTTGGCAGCATGACTTTTTTTTTTTTTTACAGTTAATTTAATGAAAATCAGCACCATTGTAAATGATAGTAAT 3921 TGTAACAACATAGTTACTGGGTGAAGGAGTAGGGGAGACACTCAGTAACCATCTATTTACCTAGACACTTATGCAGGGGT 4001 ACATGCTAGGTGGCTTTATTCAGATTCGGGTACATTGGAATCACATCATGACTTTGAGTCTGATGGCTGTGTAGATAAAG 4081 ATTTAAGCAAGTGCCTTGTGTTTGCTGGAAAATATTAAAACTCATTTGGGTGAAAGCTTCCCAGATGATGATAATTAATA 4161 GCACTTCTGCCTTTTTCCTGGAGTAACTTTTAGATTGAGTCACATATGATAGTATAAAAGTCCAAAATTTTCTGGGTTTA 4241 CCTTTGTTTTATTTTTCATATATATATTCACTGTCTGCCTGGAAATAGCCTTGGTTTACCTTATTTTTTTGTATATGTAA 4321 AACTATTCATATTTGATTTTATTCCAATATTATATATGATGGAAAAGCCAGAATTGTCTGGCAGAATTTAATTCTTCCTT 4401 GGATCTCTAGTTCTGTTTTTAATATCAGGTTCCTTCATCAAATTTTACTACTGTAGCTCTGTGATATAATTTCATTTCTT 4481 GTCAATTATGGTCACATATAGACAAGTACTTGGTCACAATTAGCTCAAAAGAATCCCCATTTCTTAAGGTGCTCAGTCAA 4561 TCACCTTTATTTTGAGATGGTAGTTTTTCAAGTTAGTATTACTTACTAGCTTTCTTGATGAATATAAAAATGTTGTCTCC 4641 ATCATACAGAGCTGAGCCTCTTGTGGTATATTAAGATAAGTCCCATTCTTAATCACAGAAGAACATGGATATTTTAGTTT 4721 TTGGAGTACCCAGAATTGTAAAGATTTTGTTTCATTTTGTTTTAGGATAGCTTCTCTGCCTAATACTATAGGATATGTCA 4801 TGTTCGTTATTGTAGCCACCTCCCTCAGATGTTTTTCACTATTTTTAAATTATATAATGACCAGTAGATTCACAGTAGCA 4881 TGTACTTGACAAGTGCCATGGATATTTAAGAAGAAGGTAAATAATTTTAATATTTTTTGCTGTAATTTTATAGGAGCAGT 4961 GGACTGTAAGAGAAATATCTATAAATCAGAGAGTATTTAGGAAACTTTGTATTTTATAGGTGGTCATTAAAGTGATCTTC 5041 AGGATATAAGATAGTTTACACAAACTTTATTCTCCTGATAGGAAATTTTTATTCATTTTCCTACCACTCAGCACTTTTGT 5121 TCTGCCTTGTACTGCTTATGAGGATTAATGTTTTAAATTTGCTTTATTTGTGCTTTTCAGAGAGTTGTCATAATTGTGGC 5201 AGTTGTGTTTGTGGCACTGTAAATGCTGAAATTCATGGGAAACTTACCAAATGACTGCTTGAGTGTTATTTCCCATTAAA 5281 TTGGGTAGCTGTCACAATAACCAGAAGAAATCTTGTGGCCCTTTTGAAGAAAGCCATGTATGTTTTGTTACCTAGGTTCA 5361 TAGTATTTTAATTTAAAGGCAAAGAGAAGCATTCTACTTATTTGTCTTATAAACCATTAATCGTTTTTTGTGCAGAAGAG 5441 AGCTTATTTTGTTATACTGCTTTGTATAATGGAAATAAGTCACATTCTGGGGGAAAAAAACTGGAATTGTTTGTATTTTG 5521 TTTTTTTGGGGGGGGATCTTTATGTGAAAAATCAGAGCTACTTGTTACCATAAGCCCTTACTATCAACAAGATAATTATT 5601 TGTAATCACTTTTTTATCCCAGGTTGGAATTGCTTTCCCCTTCTAAGTTATCTTCCCTTAATAATATTTATGATACCAGG 5681 ACAGTGAGGGTATAAGAGCAAATGTAGTGAGGTATTCAAAAATCCTGCATATATGGACTCAAAAGTTCTTTAGTTATTTG 5761 AATTATATATAGCTATATTATTTTATTAGCTTGGGTTGTCAGAAGATTGCCAATTTTAAGAGTAAAGAGGAGAGAGATAA 5841 GTAATAAAAATAGAGGAGGGGAAGAAAATGGCTCCCTTACTGGTCTTAGTAATCTTCTATATAGTTAATGAGCTAAAAAA 5921 TGATACTTAAAGTTCCAGGTTTGGTACCGCTAGCATAGAAACATTGCCTTTCCTACACATTCCTCATCATTGTTTCCTCA 6001 GAAAATTATTTTAAGAGTTTGTGAAACCAGATTAAATATCTATATTCAGTTTGGCCTAATTTTTAAAAATAAATATTTAT 6081 ACTCCAGCTTTTGTGTATTTGGTGTACATCACCACTTATGCAAATCAAGGATCAGAAAACTGGAGGTTAGCCATCTCCAT 6161 TATTTCCTTTTGCACATTGGGTACAGTGGGTGGCATTAGTATGCACTAGCTGCAAAGTCACAGCACCTTATGGAAATAAG 6241 TATGTTTATTATAATAAAAAAAAGTTAAGCTGCATCTCTGTAGATTATTTACTTTGCAGACTGTAAAGCTGCCCTATCTT 6321 TTCCAGCAGAATTTACTCTTCCATTCTTAATTCTTTTTTGAAATATCTTAAATAATTTAACATTCCTTTATAACTTCTTA 6401 ACAGTGTCAAAACTGGGGTAGAAGGGATTTTATTTTTTCCCAAAAGGGTTCCATCTTTGCTATCTGTTGATCAGCCTTAG 6481 AAAATCTAAGTATGATCAATAAATTTTAATGGTTGATGGCATCCTGTGTCAGCTGGAGTAGTTGGTTGTGAATATTAAAA 6561 CCTAGTACTATTTTCCCTCAGTAACATGTAATTGCTACATTTTTTATAAGAAGGTATGGTTAGAAAAAAATGTGAAAGAT 6641 CACTTAAACCAAAGCCAGTTACAAGGAGTAATCTCTCCTGTTGGTTTACCTTCACCTCAGAACTACAAGAATATTACAAT 6721 ACATAGTGAATAGTTGTCTGTAACATTTCTACCAGTTGTTTCAGTAGCATATTGGTCTTGGCATTTCTTGGCACTGTGGT 6801 TCTGCTGTATTATTTGTGATGTCTTATTGTTTGTGAGCTTTTGTTTTTTTTTTAAAGAAAAAACAAAAACTAAGTGGGAC 6881 TATGTATGTAGATGTGTGTCAGTACCAAAAAGTTATTTTCTCAAATCCCTAAATTTCTGATTTCCATTCAAGTCTTTTAA 6961 ACTCTTTCCTGCTGAATAGCAAAGAACTTTTATTTTCCACTTTCCTATATTCCTAAAAAGTGTGAACAATGCGTTTCAGT 7041 TGACTGTATTGCATACTTTTTTGCTGAAGACTTTTTCTGTAAACACAATTGCCTTGTTCAGTTTTGTTGTAAACTGACTT 7121 ACCATAAGATGCACTGTTGATAATGCTTTCTGATGTGTGTTTGATAAGAGTGATAAAATAAAAGCTTAAAAATAAAGGAG 7201 TTGCTTTTTAATTTC Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | islets |
Tools used in this research | TargetScan |
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in Supplenentary. RNA binding protein: AGO.
... - Kameswaran V; Bramswig NC; McKenna LB; Penn et al., 2014, Cell metabolism. |
Article |
- Kameswaran V; Bramswig NC; McKenna LB; Penn et al. - Cell metabolism, 2014
Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a complex disease characterized by the inability of the insulin-producing beta cells in the endocrine pancreas to overcome insulin resistance in peripheral tissues. To determine if microRNAs are involved in the pathogenesis of human T2DM, we sequenced the small RNAs of human islets from diabetic and nondiabetic organ donors. We identified a cluster of microRNAs in an imprinted locus on human chromosome 14q32 that is highly and specifically expressed in human beta cells and dramatically downregulated in islets from T2DM organ donors. The downregulation of this locus strongly correlates with hypermethylation of its promoter. Using HITS-CLIP for the essential RISC-component Argonaute, we identified disease-relevant targets of the chromosome 14q32 microRNAs, such as IAPP and TP53INP1, that cause increased beta cell apoptosis upon overexpression in human islets. Our results support a role for microRNAs and their epigenetic control by DNA methylation in the pathogenesis of T2DM.
LinkOut: [PMID: 24374217]
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MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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79 hsa-miR-382-3p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT062248 | HP1BP3 | heterochromatin protein 1 binding protein 3 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT068067 | SPATA13 | spermatogenesis associated 13 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT142409 | TNRC6A | trinucleotide repeat containing 6A | 2 | 6 | ||||||||
MIRT257487 | ABT1 | activator of basal transcription 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT439244 | ZCRB1 | zinc finger CCHC-type and RNA binding motif containing 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439345 | UHMK1 | U2AF homology motif kinase 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439466 | TGFBR3 | transforming growth factor beta receptor 3 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439506 | SURF4 | surfeit 4 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439733 | RPS4X | ribosomal protein S4, X-linked | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439888 | PRUNE2 | prune homolog 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439984 | PHLDB2 | pleckstrin homology like domain family B member 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440132 | NCOA3 | nuclear receptor coactivator 3 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440291 | MAP2 | microtubule associated protein 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440434 | IPPK | inositol-pentakisphosphate 2-kinase | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440515 | HERC2 | HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440723 | ENO2 | enolase 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440898 | CPEB4 | cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT441013 | CAPN7 | calpain 7 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT448953 | CDK19 | cyclin dependent kinase 19 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT466663 | TAF1D | TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit D | 2 | 4 | ||||||||
MIRT471447 | PDIA5 | protein disulfide isomerase family A member 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT496398 | ZSCAN16 | zinc finger and SCAN domain containing 16 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT497519 | EXOC8 | exocyst complex component 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT501782 | NRBF2 | nuclear receptor binding factor 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT504199 | KIAA1586 | KIAA1586 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT505076 | ZC3H12C | zinc finger CCCH-type containing 12C | 2 | 8 | ||||||||
MIRT509814 | SULT1B1 | sulfotransferase family 1B member 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT518477 | C8orf37 | chromosome 8 open reading frame 37 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT520345 | UBN2 | ubinuclein 2 | 2 | 10 | ||||||||
MIRT527579 | BRD7 | bromodomain containing 7 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT531742 | TXK | TXK tyrosine kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT533354 | UBE2W | ubiquitin conjugating enzyme E2 W | 2 | 2 | ||||||||
MIRT535735 | MYO6 | myosin VI | 2 | 2 | ||||||||
MIRT537113 | GP5 | glycoprotein V platelet | 2 | 4 | ||||||||
MIRT542398 | TFCP2 | transcription factor CP2 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT547560 | LRIG3 | leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT551649 | CCDC127 | coiled-coil domain containing 127 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT554959 | RACGAP1 | Rac GTPase activating protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT555202 | PRRX1 | paired related homeobox 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT555768 | PCTP | phosphatidylcholine transfer protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT558971 | CALM1 | calmodulin 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT559668 | AGO3 | argonaute 3, RISC catalytic component | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566688 | MYLIP | myosin regulatory light chain interacting protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT568588 | AGO2 | argonaute 2, RISC catalytic component | 2 | 2 | ||||||||
MIRT568643 | ACTB | actin beta | 2 | 2 | ||||||||
MIRT568775 | LY6K | lymphocyte antigen 6 family member K | 2 | 2 | ||||||||
MIRT573442 | APOPT1 | apoptogenic 1, mitochondrial | 2 | 2 | ||||||||
MIRT611400 | ATP9A | ATPase phospholipid transporting 9A (putative) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT623867 | GABRB2 | gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT627266 | XKR4 | XK related 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT631666 | NDUFV3 | NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit V3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT635085 | LIMS3 | LIM zinc finger domain containing 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT635154 | LIMS3L | LIM zinc finger domain containing 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT639057 | FPR1 | formyl peptide receptor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT642763 | SDHAF2 | succinate dehydrogenase complex assembly factor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT643385 | CLMP | CXADR like membrane protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT647390 | ZNF616 | zinc finger protein 616 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT647435 | ZKSCAN2 | zinc finger with KRAB and SCAN domains 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT649067 | HSD17B12 | hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT653017 | STX7 | syntaxin 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT654321 | RBM47 | RNA binding motif protein 47 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT654773 | PRKAA2 | protein kinase AMP-activated catalytic subunit alpha 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT657853 | GJD3 | gap junction protein delta 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT662944 | MEAF6 | MYST/Esa1 associated factor 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT698739 | STX12 | syntaxin 12 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT699384 | SLC30A6 | solute carrier family 30 member 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT700215 | REL | REL proto-oncogene, NF-kB subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT702626 | ITGBL1 | integrin subunit beta like 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT709824 | STPG1 | sperm tail PG-rich repeat containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT711075 | NLGN2 | neuroligin 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT712835 | GJD2 | gap junction protein delta 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT713307 | TYRP1 | tyrosinase related protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT713726 | CD244 | CD244 molecule | 2 | 2 | ||||||||
MIRT715558 | EPT1 | selenoprotein I | 2 | 2 | ||||||||
MIRT717285 | TRAF1 | TNF receptor associated factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT724543 | RSL24D1 | ribosomal L24 domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT735691 | SMAD2 | SMAD family member 2 | 2 | 0 | ||||||||
MIRT755903 | SLIT2 | slit guidance ligand 2 | 3 | 1 | ||||||||
MIRT756166 | SAE1 | SUMO1 activating enzyme subunit 1 | 5 | 1 |
miRNA-Drug Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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