pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-544a |
Genomic Coordinates | chr14: 101048658 - 101048748 |
Description | Homo sapiens miR-544a stem-loop |
Comment | The mature sequence shown here represents the most commonly cloned form from large-scale cloning studies . |
RNA Secondary Structure | |
Associated Diseases |
Mature miRNA Information | |||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-544a | ||||||||||||
Sequence | 55| AUUCUGCAUUUUUAGCAAGUUC |76 | ||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||
Experiments | Cloned | ||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | TPT1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HRF, TCTP, p02, p23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | tumor protein, translationally-controlled 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_003295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on TPT1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of TPT1 (miRNA target sites are highlighted) |
>TPT1|NM_003295|3'UTR 1 CAAATGTGGCAATTATTTTGGATCTATCACCTGTCATCATAACTGGCTTCTGCTTGTCATCCACACAACACCAGGACTTA 81 AGACAAATGGGACTGATGTCATCTTGAGCTCTTCATTTATTTTGACTGTGATTTATTTGGAGTGGAGGCATTGTTTTTAA 161 GAAAAACATGTCATGTAGGTTGTCTAAAAATAAAATGCATTTAAACTCATTTGAGAGAATGCCTTTTAGTTTAATGCATA 241 TTTAAACTAAATTGATCCTGTAGTGTTCCTGGAGAAGCTAGAGCCTGATTGTAGGCTACTACTCATCAATTAACTTCTAC 321 AGTGGAGACTACTTCTGGGACTGGAATATAAAAAAGAATCAAAGGTTCTGATTTTGAGTTGCAATAAAGGGAAAGACCAT 401 GCTCATAGCAGTGCCAACATCTGAAGTGTGGAGCCTTACCCATTTCATCACCTACAACGGAAGTAGTTAACTGGAAGAGA 481 TTACCAAGAGAATAAAAAGAGACTCATTCAGTGGAAGCAACTTTGTCTCAGCTTATTTCACATAAAGAGAGCGAAGTCTT 561 TTGGGATGAATGTTAATTAAACTCCCTGGTAACTAGAACAGGGACTGGCAAACTAGCCTATCTGACCACCTGTTTTGTAC 641 ACTTTAAGGTGGTTGGTTGCCTTTTTAAATGGTTGAGGGGAAAAGAATACCTTGTGGGATATGGAATTTAAGTTCGAGTC 721 CAGTTTTATTGGAACGTGGCTATGCTTATTCATTTATGGATTGACTGTGGCTGTTGTCAGTGCATGAGCAGAGTTGTGTC 801 TAACAGACTAGAGCCTGCAAGTTTGCCAGCCCCTGATTTAAAAGATGAAGGTACACAGAATGTGGGCTGGCTGGTGGGCA 881 AAGGGGTAAAAATGTTCTCTATATTGTATCTGAAAAGATGGGGTGTCTGAATAAGAAAATGCATCTATTTGACAGACCTG 961 GAGCAGTTGCTATCTGCTGCTATGGTTTCCACCACAGATGCAAGAAGAACATGTCCTTGCGCTTTCCGTCTGTCTAATTG 1041 TGGCAGCTGAGATTGAATAGAGGAATACAGGAGGAAAAAAAGCGGGAAGAGTTTTTGAGGCAGGTCGGTCACCCAGGCTT 1121 GTAGTGCAGTGGCACAAGCAACTCACTGCATTCTCTGCATCCTGTGCTCAAGCCATTTTCCCACCTCAGTCTCACTAGTT 1201 GCTGGGACTGCAGGCATGCACCCCTATGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACCGAGTATCGCTTAGTTGCCCAGGGTGGTCT 1281 CAACTCCTGGGCTCAAGGAGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCAGGCCTAGCCTGGGAGGGGAATTTTCAAAACG 1361 TGAGTTTTGGGAAATAGTCTATCAGCCTTACCTGGTTGATTACACTTGTAAAAGAAAGATTAAAAGCAGGCCAGTGACTC 1441 TGGTCTGCTTGAACATGTGAATGTAGTGGTTTGAGCAATCTGGAGTTTGCCCTAGTGTCAAATTCCAGACTGTCCATAGT 1521 GTCCAAAACCTGAGGCAGATACTAATGTTAACCCCCAGCACCCCGTGATTGGAAACAAACCTAAATACGTATTGGGAACT 1601 TAATAGCAATTTTAAGCATTCTGATAGATTTTTTGTAGGGATGGGGTCATGCCATGTGGCCCAGGCTGGTCTGAAAACTC 1681 TGGCCTCAAGTGATCTCAAGCTTTGGCCTTCTAAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGGCATTGCACCTGGCTTAGCGTTC 1761 TGATTTGACATTGTAATGAAAAGTGTGAGTCTCATCTACAGGGCCTTTTGTCCTCTGAAATGATAGCAGGAAGGGAATTT 1841 TCAGGCAGTGGTCAAAGCTGGGGAAACCAGGATAGTGAAGAAGGCCTTGAGGTGAGAGATGGAAGCTAATTGGTGAACTA 1921 GCCTTGGAAGCCTGAAACAGACAAGTAGCAATTCAGAGACTTTGTGGGCTCCACTGCTCCAACTTGTTTTGAAGATTTTC 2001 AGTTCTGCAGAAGAGGTATTTCCCCAGTTGTCCTTTCAGTGCTCTTAGCTGTTTTCCCAACATCCAGATCCAATCAAGGC 2081 TGGGACATAGCATTTTATCATGTCTATTTAAGTCAGAAGTGATGAACCCCAGCTGTTTACCTCATGGTAAACCTTTGAAG 2161 ATTCCAGGTAGAATCTTCTCAGACTTTGAAGACTGTCTCATTTTATATCTTTTTCTCGTTATTCCTAGGGTCAAGACGTT 2241 TTGGGCAAGAATAAGGATGTGAACATCAGAAAGCTCATAACATTTTGTTTTTGATGCTAAGTTTAACAAAGGCATGCTTT 2321 AGTAGCCTGTGGGCCCTAGGGTTTGTTAAAGTGTGGAGAACAACTGAGTGGAGCAAGAGGACTTTTCTAGGAAGGTCCTT 2401 GTAATGTGACATTTGAAAACAAATGAAGGTGTGGAAGTAGGCCATGTGGATATCAGGACAAACCATTCCAGGCCAAGACA 2481 ACAGCAGTTAGTCTGGAGTGTGATGTGTTCTGGGAAAAAAGTGGCCACTTTGCTAACCCAAGAAGACAGGAAGGGTTGTA 2561 AAGCAGTGGGAGTGTGCAAGGAAGGAAGACCAGACCTCAAGGAAACCACAGGCGCTCTGAGCAGAAGAGTTACATGATAT 2641 GACTCAAATTTTTAAAGGATCACTTTGGCTGCCAGGTGGCAGGGTAAAAGCATAGAATAATTGTGTATAATGTGTTTTTA 2721 AGGCAAAGATAGTGGCTTAGTCTAGGGTAGTAGACTGAGGTGGTAGGAAATGAAGATAGAGACAACAGGATATGCTGGTG 2801 GGTGAGGATGGATTTAATGTTGATACAAGTATTTTGGTCTGAGCGTTTGGAAGAAAGTTGGCACTGAGGTGGGAAGTCGA 2881 GTTTAGTTTTGTTAGTTTTGGATGTGTTAAGTTTGAGATGCTGATTCTTCAGAGAAGTCTAAGCTGGAGAACTATATAGA 2961 GAGTGGAAAGATAACAATAGACATTGAAAGCCATGATACAGGATAAGGTCATTTGGAGAGAGGATAGACTGCATTCCAAC 3041 ATGAGATTGGTTGACAAAGAGAAACCAACAAAGGTAATTAAGAGGTGCTCCCACTGCACTTGTACTCAGAAGGCTGAGGT 3121 AGGATTGTTAGAGGCCAGCCTGGGCACCACAGGGAGACCCCATCTCTAAAATTTAGCCAGGAACCATGGCTCATGCCTGT 3201 AGCCCCAGGAATTTGGGAGGCTGAGTGGGGAGGATCGCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGGGAG 3281 ACCTAAAAAAATTAATTGGGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGCGGCTGAGCTGAGAGGATGGCTTGAGTCCGAGAGAT 3361 TGAGGGTGCAGTGAGCTGTGATCATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGGCAGTGAGACACTATCTGAAAAAAGTTTAAAA 3441 ATTTTAAAAAAGAAGGAACTGCCCCTGAGGTAAGAACCAAGGGAGGGCCTCCCAGAGGTCAGGTGGAAAAAGTTTTAGGA 3521 AGGAGGAAGTAGTCAACAGGGTTACCTGTTGCAAAGTACTTAAGTAATATGAGGCCTGATAGTGGTAAACTTGACTACCG 3601 TTGGATTTCACTAGTGGGAAAGGAAGTCTAATTAAAATGCACTCAAGAGACTAACAGTCGCAGGCATGAAATACAATACA 3681 GGTACATGGTTTTTTATTATGTGTGCATCTGCTTCAGTAATAGGTGTGAATTACTCATTTGGATCATTAGGAGTTTCAAA 3761 ATCTAGTTAAATGACTAGATTTTTGTTGATGTAAATTCTGTCATTCTGAACTGCAGGGATTGTCAGTAACTTAACTGCAA 3841 ACTAAACTGGTGATAATTATGGTAAAATTGCAAGACGAGCAATAAATCTCAACCAACTTGAGAGAACACTGATAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | islets |
Tools used in this research | TargetScan |
Original Description (Extracted from the article) |
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HITS-CLIP data was present in Supplenentary. RNA binding protein: AGO.
... - Kameswaran V; Bramswig NC; McKenna LB; Penn et al., 2014, Cell metabolism. |
Article |
- Kameswaran V; Bramswig NC; McKenna LB; Penn et al. - Cell metabolism, 2014
Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a complex disease characterized by the inability of the insulin-producing beta cells in the endocrine pancreas to overcome insulin resistance in peripheral tissues. To determine if microRNAs are involved in the pathogenesis of human T2DM, we sequenced the small RNAs of human islets from diabetic and nondiabetic organ donors. We identified a cluster of microRNAs in an imprinted locus on human chromosome 14q32 that is highly and specifically expressed in human beta cells and dramatically downregulated in islets from T2DM organ donors. The downregulation of this locus strongly correlates with hypermethylation of its promoter. Using HITS-CLIP for the essential RISC-component Argonaute, we identified disease-relevant targets of the chromosome 14q32 microRNAs, such as IAPP and TP53INP1, that cause increased beta cell apoptosis upon overexpression in human islets. Our results support a role for microRNAs and their epigenetic control by DNA methylation in the pathogenesis of T2DM.
LinkOut: [PMID: 24374217]
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MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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139 hsa-miR-544a Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT053511 | BMI1 | BMI1 proto-oncogene, polycomb ring finger | 4 | 1 | ||||||||
MIRT054802 | CDH1 | cadherin 1 | 3 | 2 | ||||||||
MIRT075814 | ZCCHC14 | zinc finger CCHC-type containing 14 | 2 | 3 | ||||||||
MIRT125570 | SCD | stearoyl-CoA desaturase | 1 | 1 | ||||||||
MIRT246745 | SF1 | splicing factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT259487 | TXLNG | taxilin gamma | 2 | 2 | ||||||||
MIRT307650 | SMARCC1 | SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT377046 | ASXL2 | additional sex combs like 2, transcriptional regulator | 2 | 2 | ||||||||
MIRT386936 | STAT3 | signal transducer and activator of transcription 3 | 3 | 1 | ||||||||
MIRT394127 | UBQLN1 | ubiquilin 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439199 | ZNF483 | zinc finger protein 483 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439207 | ZNF33A | zinc finger protein 33A | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439262 | ZBTB17 | zinc finger and BTB domain containing 17 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439263 | YWHAG | tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein gamma | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439281 | XAB2 | XPA binding protein 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439314 | VAT1 | vesicle amine transport 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439380 | TTC37 | tetratricopeptide repeat domain 37 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439397 | TPT1 | tumor protein, translationally-controlled 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439419 | TMOD1 | tropomodulin 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439491 | SYT5 | synaptotagmin 5 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439511 | STXBP1 | syntaxin binding protein 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439586 | SMAD7 | SMAD family member 7 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439727 | RPS6 | ribosomal protein S6 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439768 | RLIM | ring finger protein, LIM domain interacting | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439828 | RAD50 | RAD50 double strand break repair protein | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439840 | RAB21 | RAB21, member RAS oncogene family | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439846 | RAB14 | RAB14, member RAS oncogene family | 1 | 1 | ||||||||
MIRT439975 | PIK3C2A | phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 alpha | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440031 | PCDHAC2 | protocadherin alpha subfamily C, 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440135 | NCOA2 | nuclear receptor coactivator 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440173 | MTSS1L | MTSS1L, I-BAR domain containing | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440222 | MMP2 | matrix metallopeptidase 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440433 | IQGAP1 | IQ motif containing GTPase activating protein 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440443 | INTS3 | integrator complex subunit 3 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440449 | INS | insulin | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440512 | HERC2 | HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440534 | GPR56 | adhesion G protein-coupled receptor G1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440540 | GOLGB1 | golgin B1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440580 | GEM | GTP binding protein overexpressed in skeletal muscle | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440629 | FNDC3A | fibronectin type III domain containing 3A | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440667 | FBXL16 | F-box and leucine rich repeat protein 16 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440680 | CCSER1 | coiled-coil serine rich protein 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440696 | FADS1 | fatty acid desaturase 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440761 | DYNC1H1 | dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440764 | DUSP26 | dual specificity phosphatase 26 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440769 | DSTYK | dual serine/threonine and tyrosine protein kinase | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440774 | DSP | desmoplakin | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440792 | DNAJC3 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C3 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440801 | DNAJB9 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B9 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440888 | CPE | carboxypeptidase E | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440923 | CLTC | clathrin heavy chain | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440950 | CHD7 | chromodomain helicase DNA binding protein 7 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT440993 | CC2D2A | coiled-coil and C2 domain containing 2A | 1 | 1 | ||||||||
MIRT441014 | CAPN3 | calpain 3 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT441106 | BRD4 | bromodomain containing 4 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT441144 | ATP6V1B2 | ATPase H+ transporting V1 subunit B2 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT441173 | ASAP1 | ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT441258 | ADM | adrenomedullin | 1 | 1 | ||||||||
MIRT441279 | ACTB | actin beta | 2 | 5 | ||||||||
MIRT441298 | ACACB | acetyl-CoA carboxylase beta | 1 | 1 | ||||||||
MIRT443751 | SLC7A14 | solute carrier family 7 member 14 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT450469 | TRMT5 | tRNA methyltransferase 5 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT450852 | HMGN2 | high mobility group nucleosomal binding domain 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT454152 | HIST1H2BK | histone cluster 1 H2B family member k | 2 | 2 | ||||||||
MIRT465705 | TNFAIP1 | TNF alpha induced protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT466121 | TMEM170A | transmembrane protein 170A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT471376 | PDPR | pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT477475 | ELL2 | elongation factor for RNA polymerase II 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT481660 | ARAP2 | ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT502469 | FAM98A | family with sequence similarity 98 member A | 2 | 8 | ||||||||
MIRT503952 | ZNF180 | zinc finger protein 180 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT505585 | SMARCE1 | SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT529936 | SYNGR1 | synaptogyrin 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT530626 | PPIC | peptidylprolyl isomerase C | 2 | 4 | ||||||||
MIRT536883 | HIC2 | HIC ZBTB transcriptional repressor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT546847 | RAB1A | RAB1A, member RAS oncogene family | 2 | 2 | ||||||||
MIRT548448 | EIF1AX | eukaryotic translation initiation factor 1A, X-linked | 2 | 2 | ||||||||
MIRT557130 | HOXA13 | homeobox A13 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT560089 | ERCC8 | ERCC excision repair 8, CSA ubiquitin ligase complex subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT560984 | GPBP1L1 | GC-rich promoter binding protein 1 like 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566340 | POLDIP2 | DNA polymerase delta interacting protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT567838 | DCAF8 | DDB1 and CUL4 associated factor 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT609236 | SERPINA4 | serpin family A member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT611452 | ZWILCH | zwilch kinetochore protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT612058 | PDGFRA | platelet derived growth factor receptor alpha | 2 | 2 | ||||||||
MIRT612783 | MAP3K9 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT615116 | BCL11B | B-cell CLL/lymphoma 11B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT616572 | C1orf56 | chromosome 1 open reading frame 56 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT616690 | LPL | lipoprotein lipase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT616986 | COL19A1 | collagen type XIX alpha 1 chain | 2 | 2 | ||||||||
MIRT619427 | CYB5R3 | cytochrome b5 reductase 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT623320 | MAP3K2 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT626897 | MON1B | MON1 homolog B, secretory trafficking associated | 2 | 2 | ||||||||
MIRT637554 | KDELR1 | KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT639473 | SLC6A4 | solute carrier family 6 member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT639753 | GPR45 | G protein-coupled receptor 45 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT640703 | MRS2 | MRS2, magnesium transporter | 2 | 2 | ||||||||
MIRT642489 | ALDOA | aldolase, fructose-bisphosphate A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT644578 | SPOP | speckle type BTB/POZ protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT645009 | NGRN | neugrin, neurite outgrowth associated | 2 | 2 | ||||||||
MIRT646533 | KLK2 | kallikrein related peptidase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT648625 | LEMD2 | LEM domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT650235 | ERI1 | exoribonuclease 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT651932 | UBN1 | ubinuclein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT652960 | SVEP1 | sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT654842 | PPM1L | protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L | 2 | 2 | ||||||||
MIRT656142 | MSH5 | mutS homolog 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT656730 | LMBRD2 | LMBR1 domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT657340 | HNRNPC | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C (C1/C2) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT658991 | DLGAP2 | DLG associated protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT660714 | AMER1 | APC membrane recruitment protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT666591 | RFX3 | regulatory factor X3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT667201 | NKX2-3 | NK2 homeobox 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT668732 | DIO2 | iodothyronine deiodinase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT669479 | ARL5B | ADP ribosylation factor like GTPase 5B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT681083 | GSTO2 | glutathione S-transferase omega 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT686736 | STX16 | syntaxin 16 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT687432 | NR3C1 | nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT689887 | SOD2 | superoxide dismutase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT695759 | WDR35 | WD repeat domain 35 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT698346 | TMEM127 | transmembrane protein 127 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT702752 | IGF1R | insulin like growth factor 1 receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT703137 | GPR137C | G protein-coupled receptor 137C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT705063 | C4orf32 | family with sequence similarity 241 member A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT709597 | IFT74 | intraflagellar transport 74 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT709997 | TXNDC12 | thioredoxin domain containing 12 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT710463 | ASTN2 | astrotactin 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT710468 | CDH5 | cadherin 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT715625 | ZBTB8B | zinc finger and BTB domain containing 8B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT720091 | SPTLC3 | serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT721054 | DCC | DCC netrin 1 receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT721961 | MCM8 | minichromosome maintenance 8 homologous recombination repair factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT722122 | EPB41 | erythrocyte membrane protein band 4.1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT722538 | AGPAT4 | 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT723325 | DGAT1 | diacylglycerol O-acyltransferase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT725330 | NEUROD1 | neuronal differentiation 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT731556 | HOXA10 | homeobox A10 | 2 | 1 | ||||||||
MIRT732380 | BCL6 | B-cell CLL/lymphoma 6 | 3 | 1 | ||||||||
MIRT736700 | E2F5 | E2F transcription factor 5 | 3 | 0 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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