pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4662a |
Genomic Coordinates | chr8: 124821985 - 124822051 |
Description | Homo sapiens miR-4662a stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4662a-5p | |||||||||||||||||||||
Sequence | 6| UUAGCCAAUUGUCCAUCUUUAG |27 | |||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | KDM5A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | RBBP-2, RBBP2, RBP2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | lysine demethylase 5A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001042603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on KDM5A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of KDM5A (miRNA target sites are highlighted) |
>KDM5A|NM_001042603|3'UTR 1 CAGATGCTTGGTTAGTTTGGGACATGGGGGGACATGGACCACATTGAGACCTTAGTCATCAAGTAGAGTGGTTTATATCC 81 ACTTGGAATGTTGCTTCCAAAGATGAATGGCCTTCAGAGAAAGTCCCCTTAGTGCTGGCTTCCTCTTTGCATGGACTCTG 161 TGGGTTACATTCTCTATCAACATATCTATGCAGAGGGTGTCTTCTTTGGTACAACAGCCAATATTTCATGTCTCCTTTGA 241 GTGTGGTTTACTGCATTAAGGCCAGATGCTTAATTGAGCTCTAGGGTGGCTGGTTAGTATTAATACATTGGTGTGCTAAC 321 AGGGCATATAGGATGTGGCTTTTGTCCAGCTGATAGTAGTTAGAGGCTTACAACTTAGGAGCAGCACCAACTGAAGGTGC 401 TAATTGCTTGGATCTCCTTCATTGGGATAGTTGGAGAGGGATTGGAGTACCACTTTCCTTCCACTGTTACCTGGTACTTA 481 ATGCCCTAAAGATACAACTAGGAGTAACAGGGCCAAAGTTATTTCTGTTAGACGTCAAGGAATGGTATCACAGTCTATTG 561 ACCTCAGCGATTTGTGCTTGTTTGTGCTAGAAGAACATCCCAAATAGGAGAACCTCTCACAAGCTGGGGCAGGTCACCTT 641 ATCTTTGTAAGATGAGGATATCATCTAGATCAGAAATCTGACTAGATTGGATTCTGAGGAGAAGAACCTACTACAAGGCA 721 AGGAGCCGTTTTTTGGCTTTGAAAAGTCTTGCTGTCTTGGGTCTACATTTTAGGGAAGAGCAGGTACATGGATCCAGGCT 801 TCTGCCAAAAAAAAAAAGAGAAGAAGATGACGATGATGACCAGTCGTACTATCTTACTGAGCCACAGTGATGCATGCTTT 881 TCGGGGAAAACTTCATTCACAAGTATTCCAGACACCAGGCTTCAGGCATGGCCATGAGCAAGACCAGCAAATAACAGCTT 961 TTTGCCTTGCAGCCCTGACCCCAATGTCTGCTGTTTCCAACACTGGTGATTTCTAACTACGGCCCACAGCAGATGCTGTT 1041 GAATAACACCATGGCTTCATCAGAGGATGTGGGGTTGTAGTACCTCTGGGTGATGAAGTTGTTTTAGTAAATCCATTTTT 1121 AAAAAAAAAAAAGGACTTGTTTTTACTTTTTTCTAAATGTCTCTGACTACTGACTGTTCTATACATAGATTATTTTTCCT 1201 TTTTTAATATACATATATGAATATATAAATATATATATTTACTGTTACCAGCAGCATATGACAGAGTTTCAACATCAAAA 1281 ATCCATTTGGGGGCTTGCTTTTTCTTTTTTGCTTTAAAAAAAAAAATCCCATTCCTTCTTTGTAGTACAAGGAGTTAGCA 1361 CTCCCTCCTCCATCCCAGCCTGACCAGATCTTCCATTTTGCTTTTGTTCATATAGATAATTATATGTCCTTTGTGTGTTG 1441 GGACTTGTCCCTGTCTGTTGGGAAACTTGGTCTCACTCTAGTCTGTGCTGGCTCTTTTTTCTTTTGTGTGTGAATGTTTG 1521 AAACTATGGTGCTGTGTCCTCTTCCCTCCTGTTGTGTTCTCTGTTCTTCTTAAGGTATTAGGTAAGCTGTATGTAAACTC 1601 TTATTAGAAGGGGACTAATTTTTTTTTAAAGGACAAAAAAAAAAATGACTAAAAATAGTGTTTTGTCATCACTGTCTGGT 1681 GTCTTTATTTTGGTTTAAAAAAATCTGTGGTTTGACTTAAATTCATCAGTTTTCCTTTTAAAGGGGGGATTGGGGTGGAC 1761 CTAGCAACAGCTTATAGTTTCCTCTTCCCTTTTTGCCCCAGTCTCTTTTAAAGAACTGTCTTCTAGTAACTAGAAGTGAA 1841 ATGTACTGTCCAGTTACAGTTTGAGTGGGTATGAGATTTAACTCAAAAGGAATCTTACAAAAAAAAAGATGTTTTCTTAT 1921 AAAATCCAATTTCTGTAAATGTTTTCTCTGAAGTTCATACTACCTACTTTTTATTCATTCTTAATACTGTATAACATTTT 2001 GAGTGTTTTGACTTGTTCAGAGGTTTGTTAGTGTTGCTGTGCATATGTCTTGAGGTCTCATCTGAAGTAAGTTTGTGTAT 2081 GATCGAAGATTTCAATGGATATTGCAAGGTAACTAATTAACTGATTTCATAAGTTTTCGTTTTGCCAAGCTAACGATTAT 2161 CAATTAAGAATTTCCTCTGGTTGATGTTATACAAGAAAGCACAATATTTTTTGCCTGTTGATCTTCTTTGTAACAGTCTT 2241 CAGATATTTGTGGGTTAAAAATTGAATGTAATTTTAAGTGACAGATGCCTGGAATACATTTAAAATTTTTATTTTTCCTT 2321 CCTAATCATCCATTAACTATTCCACTATCAGTGGAGAGTCATGAGGATGCTGAGAAAGTATGAATAGCTTCCTGTCACCT 2401 TCTGACGTTTTGAAACTTAAATATGTCTTTTCGTTGATACTGTGGGATTTTCTGTATTTACTTGACAGTCATGGAGGATT 2481 TGGTATGACTTGACCACAGGTTTAGACCAAGGCTGAGAAGAACAGAAGGGAGAAATTAATGGCAAAACAAAAAATACACA 2561 AATCTGCGGTTTTGGAATTAATGAAACAAGATTCATCTATTTAAAGAAATGTTGGTGTTCTAATACAAAGCATTATTTTC 2641 ACTTAGAGAAAATTACTTACTTGCTCCCTTCTGTATTGTAATATTTTGTATTAAGACATGATTTAAAATGTCTTTCTACC 2721 CTTATCTCCTCTAAACTGCAACTGAAGTTGCAATTCTTCATCATTAGTATTTTAACTCTGGCAAAGGTTATAGAAAGAAA 2801 AATGGAAATATGGTAGGCCTGTGGTATTCTTAAAAGCTAAGTCATTAGAACTATGCAGATCCCCAAGTTTAAAAGTACAA 2881 ATACAGCACCAGTAGTTAGCTTTCTAGCTGGGGGAGAAGACAGGAGATTTTTCTTCCACAGATGTTTATTTTGCTTCCTG 2961 ATAGGTACTGCAGCAAAGCCATGTTGATGTGTAGATGCATGACTTCCTCACTAAGCTGCTGCACACCAGCTTTGCCTGCA 3041 TGATTCAAATTTGTGCCTCAGTAAAATTATAAATTATTGCATGTCATACCTTGAATAATGGAAACGGCAAACATTAAACC 3121 TGTGATTACCCATAATGTACTTTAATAATAAAAAACATGGCAGCCAGGTGCAGTAGAGTGCACCTGTGGTCAGGAGGCTG 3201 AAGTGGGAAGATTGCTTCAACCTGTGAGTTTGAGTCCCGCCTGGTCAACAGCGAGACCCCATGTGTCTGTCTGTCTCTCT 3281 CTTTTTTTAAAGGACAGAGGCTAAGCTGTAAGGTTAGCATGGTTCTGCCTGGGCTTTGCTTCTGTGCTTCTGTGCAGGCT 3361 GAGCTGTAAGGTTAGCATGGTTCTGCCTGGGCTTTGCTTCTGCGCTTCTGTGCAGGCTGAGCTGTAAGGTTAGCATGGTT 3441 CTGCCTGGGCTTTGCTTCTGCGCTTCTGTGCAGGCTGAGCTGTAAGGTTAGCATGGTTCTGCCTGGGCTTTGCTTCTGCG 3521 CTTCTGTGCTAGCAGGTGCCCACAAAATGTCTTTTTGAATTTCTTAATTTTTGGGTTCTGGATGCAATTCGTGCACGCCA 3601 AGAAACTACTTGCTTGTCAGTATTTTAATTCTGTAGTACATGTGTGTGAATATCAGCCAGTACTTACAGTAGGAGGATGA 3681 ACAGAAAAACTGAGAAGACCTGTCTTTCAAAAGATGGGTTTATCCACTTTTTAAGGGAAAAAGTGACAGTTTGGCATGGG 3761 ATTTGAAAAGTGGAAATTGTGGAAAAATTGAGCTGTTGAAGTCCCACATATAACCAGATTTAATAAAGCTTCACATGTGA 3841 ATTAGCTCCATATGTGTGTAGAAGGTTGCTTTTATAGCAGGTCCTTAAGTACTCCTTTTGAAATTCCTCCTTTTTTTTTA 3921 AGTCATACCATTACTTCTTTGGATATGAATGTCCCAAGTGGTATCTCCTACTGTAGTATGAGGAAGAATGGCTGTTAATG 4001 TATTTTTTGAATTTTGGTCTTGTCTTGGCCTGGATCATATCCAGTCACCACTATGCAACAAATGATGTGCACTGGGCAAG 4081 GATATGATGGGTTATGAAAGCTGTATCTTGTTTGTTTTTTCTTTTGCAGTACTCCAAGTGGTCTAAACAGGAATGTCTTG 4161 TAAAACCTCAAGACTCCCTATTGATTATTCCCTTACATATTTATTTACAATTTATCAGGGTAATTGGTGGTGCCTTATGA 4241 AAAGTATAACTCGATTTCTTGATCTTTGAGCATGTTTTGTGTTTCTTGTGTTTTCTAAAAGAATATTAGATATGGTTAAT 4321 TGCATTACATCTAAAAGATTTAAAAAATTGTGTGTATGCTCAGGTTCCCCACACCCATACCCACCCTAACCCCTGTCATT 4401 TACATTGGTGGCAACTTTAAATGGTAACCAAGCAAAAGTACATTTTGATAATGAGTATTGATAATCCTGAGGAAAACTAG 4481 TGAGTATATGGGAGCCACCTTTGACCTGTGCCAAAGCAGTTTCTAATTTCATTTGCTAACTATAAAATAAAGAACTGAGC 4561 CAAAATAATTTGATCAGTGGTGTGATTAGCCTATTATCATTGCTGAGAATAGTGTTTTTGGAGTGTGAAGTGATTCCTGA 4641 AGATTTCACCTGCCTTCTGTTTCCAGCAAGAATCCAGTGATGACCAACACATTTCCTCACTTTTGGTTCTTGAGAAGTTT 4721 ATCCCTTTGCAACAAACCATTAATAGGGAAAACAAGGAAATGCTTTCCCTTTCTCTTTGGCTTCTTAAAGCTCACAACCA 4801 ATTCAGACCCCAAGTTACTTCAGAGAAGCAAATGGCACCTTTTCCCCATTGCCAAGGATCCCAGCTTATGCAGATATGAA 4881 GGACGGATCATTTCTGAAAATGTTAAGACTCTGCTTGCAGTGGACTTGGCCTCAGTTTCATGAAATGTGTAACTCTGTAT 4961 GTGTATGTTAGGAGGAGGGTTGGTTGAAAGAGCGGGGGCAGGGAGGGGAATCTGATTACCTCTTGGGAAATAATTTTCTT 5041 GCCAACAAAAAGATACACTTGAAGTTTCTTAAGGTGGCAAGTCCATTAAAAAAAAAAATTGTGTTGGACCCTCCCAGTTT 5121 AGATCAAGTATTTCTTGGGGGTCTTGCTATTGTGGTTGATACCAATAAATGGAAGATCCAGAATATTTTCATTTAAAGCT 5201 CAACCATTAATTGGAACATGGTGAAACATTGTACACATTGTAAAAGTAGGGAACAGTACAAAAGAATGGAATCAAATACT 5281 ATATTATGTGAATAAACTAGAGTGATTTTGGAATTTCACTCTCTTCACCCCTTCTCACTTGTATGTTCTGTAAAGTGTAT 5361 TTCTACTTTGGTAGGAAGAAAGACTTGATTTAATATTTC Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | BC-3 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
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PAR-CLIP data was present in GSM796039. RNA binding protein: AGO2. Condition:4-Thiouridine
PAR-CLIP data was present in GSM796040. RNA binding protein: AGO2. Condition:4-Thiouridine
... - Gottwein E; Corcoran DL; Mukherjee N; et al., 2011, Cell host & microbe. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Gottwein E; Corcoran DL; Mukherjee N; et al. - Cell host & microbe, 2011
Primary effusion lymphoma (PEL) is caused by Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV) and frequently also harbors Epstein-Barr virus (EBV). The expression of KSHV- and EBV-encoded microRNAs (miRNAs) in PELs suggests a role for these miRNAs in latency and lymphomagenesis. Using PAR-CLIP, a technology which allows the direct and transcriptome-wide identification of miRNA targets, we delineate the target sites for all viral and cellular miRNAs expressed in PEL cell lines. The resulting data set revealed that KSHV miRNAs directly target more than 2000 cellular mRNAs, including many involved in pathways relevant to KSHV pathogenesis. Moreover, 58% of these mRNAs are also targeted by EBV miRNAs, via distinct binding sites. In addition to a known viral analog of cellular miR-155, we show that KSHV encodes a viral miRNA that mimics cellular miR-142-3p function. In summary, this study identifies an extensive list of KSHV miRNA targets, which are likely to influence viral replication and pathogenesis.
LinkOut: [PMID: 22100165]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM796039 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | BC-3 / 4-Thiouridine |
Location of target site | ENST00000399788.2 | 3UTR | UUGGCUAUUUCUCUAGA |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 22100165 / GSE32109 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM796040 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | BC-3 / 4-Thiouridine |
Location of target site | ENST00000399788.2 | 3UTR | UUGGCUAUUUCUCUAGA |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 22100165 / GSE32109 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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137 hsa-miR-4662a-5p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT106793 | TMEM245 | transmembrane protein 245 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT148293 | RNF138 | ring finger protein 138 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT231332 | KLHL20 | kelch like family member 20 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT301381 | PDXP | pyridoxal phosphatase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441375 | PAPOLA | poly(A) polymerase alpha | 2 | 4 | ||||||||
MIRT441444 | MTX3 | metaxin 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441500 | SPG20 | spartin | 2 | 6 | ||||||||
MIRT441517 | ZBTB10 | zinc finger and BTB domain containing 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441562 | LMOD3 | leiomodin 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441619 | ROCK1 | Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT441633 | KDM5A | lysine demethylase 5A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441705 | ZIC4 | Zic family member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441713 | FGF9 | fibroblast growth factor 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441779 | TXN | thioredoxin | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441917 | ACADSB | acyl-CoA dehydrogenase, short/branched chain | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441963 | BACE2 | beta-site APP-cleaving enzyme 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441974 | KPNA1 | karyopherin subunit alpha 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441977 | ZNF70 | zinc finger protein 70 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT442043 | SEC62 | SEC62 homolog, preprotein translocation factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442050 | KLHDC10 | kelch domain containing 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442150 | INTS6 | integrator complex subunit 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442186 | HOOK3 | hook microtubule tethering protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442255 | SPRED1 | sprouty related EVH1 domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442280 | CCDC108 | cilia and flagella associated protein 65 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT442353 | OLA1 | Obg like ATPase 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT442644 | NAMPT | nicotinamide phosphoribosyltransferase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442662 | GLRA2 | glycine receptor alpha 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442782 | HCN1 | hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442861 | SCARF1 | scavenger receptor class F member 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT442900 | SOD2 | superoxide dismutase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442922 | TFDP2 | transcription factor Dp-2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442930 | RWDD1 | RWD domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442939 | CA5B | carbonic anhydrase 5B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443014 | C21orf91 | chromosome 21 open reading frame 91 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443139 | ZDHHC21 | zinc finger DHHC-type containing 21 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443576 | PPIC | peptidylprolyl isomerase C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443584 | FAM84B | family with sequence similarity 84 member B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443596 | VAT1L | vesicle amine transport 1 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443771 | STS | steroid sulfatase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443870 | DDTL | D-dopachrome tautomerase like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT452489 | BANK1 | B-cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 | 2 | 16 | ||||||||
MIRT461187 | TRIP4 | thyroid hormone receptor interactor 4 | 2 | 16 | ||||||||
MIRT464093 | VPS36 | vacuolar protein sorting 36 homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT466637 | TAOK1 | TAO kinase 1 | 2 | 17 | ||||||||
MIRT466642 | TAGLN2 | transgelin 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT469936 | PTPRF | protein tyrosine phosphatase, receptor type F | 2 | 2 | ||||||||
MIRT489810 | LSP1 | lymphocyte-specific protein 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT490549 | TEX261 | testis expressed 261 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT495069 | PAQR7 | progestin and adipoQ receptor family member 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT496723 | SRGAP2 | SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT496881 | PLA2G16 | phospholipase A2 group XVI | 2 | 2 | ||||||||
MIRT497017 | INO80B | INO80 complex subunit B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT498347 | CISD1 | CDGSH iron sulfur domain 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT498353 | ABHD17B | abhydrolase domain containing 17B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT503294 | GTF2A1 | general transcription factor IIA subunit 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT504529 | ZNF620 | zinc finger protein 620 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT507283 | FEM1B | fem-1 homolog B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT507540 | DHX33 | DEAH-box helicase 33 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT509090 | SYNPO2L | synaptopodin 2 like | 2 | 4 | ||||||||
MIRT510083 | PPWD1 | peptidylprolyl isomerase domain and WD repeat containing 1 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT510702 | SREK1IP1 | SREK1 interacting protein 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT511355 | ITPRIPL2 | inositol 1,4,5-trisphosphate receptor interacting protein like 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT513119 | OSBPL3 | oxysterol binding protein like 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT515209 | CRCP | CGRP receptor component | 2 | 2 | ||||||||
MIRT516376 | TRAF3IP2 | TRAF3 interacting protein 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT520307 | UBXN2A | UBX domain protein 2A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT521124 | SHROOM4 | shroom family member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT522049 | ORAI2 | ORAI calcium release-activated calcium modulator 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT522947 | IPO9 | importin 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT524418 | CNKSR3 | CNKSR family member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT525073 | FRK | fyn related Src family tyrosine kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT525150 | ZNF329 | zinc finger protein 329 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT528538 | TTC22 | tetratricopeptide repeat domain 22 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT530560 | AKNA | AT-hook transcription factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT530653 | TRIM56 | tripartite motif containing 56 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT530823 | TMED3 | transmembrane p24 trafficking protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT535689 | NEURL1B | neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT536881 | HIF1A | hypoxia inducible factor 1 alpha subunit | 2 | 4 | ||||||||
MIRT538295 | CSNK2A1 | casein kinase 2 alpha 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT538783 | C6orf89 | chromosome 6 open reading frame 89 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT540735 | FN3KRP | fructosamine 3 kinase related protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT540828 | GNAT1 | G protein subunit alpha transducin 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT549086 | C5orf51 | chromosome 5 open reading frame 51 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT549547 | CLPP | caseinolytic mitochondrial matrix peptidase proteolytic subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT550203 | MAVS | mitochondrial antiviral signaling protein | 2 | 4 | ||||||||
MIRT555299 | PPP4R2 | protein phosphatase 4 regulatory subunit 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT563173 | ZRANB3 | zinc finger RANBP2-type containing 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT563973 | HCFC1 | host cell factor C1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT564610 | ZNF703 | zinc finger protein 703 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT565345 | TMED4 | transmembrane p24 trafficking protein 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566437 | PHF16 | jade family PHD finger 3 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT573087 | APLN | apelin | 2 | 2 | ||||||||
MIRT617053 | ZNF677 | zinc finger protein 677 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT617404 | API5 | apoptosis inhibitor 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT617459 | CCS | copper chaperone for superoxide dismutase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT618191 | MACC1 | MACC1, MET transcriptional regulator | 2 | 2 | ||||||||
MIRT619003 | NTMT1 | N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT619853 | KIR3DX1 | killer cell immunoglobulin like receptor, three Ig domains X1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT622214 | SLC39A11 | solute carrier family 39 member 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT622455 | RNF19B | ring finger protein 19B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT622495 | RBMS1 | RNA binding motif single stranded interacting protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT623408 | KREMEN1 | kringle containing transmembrane protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT626501 | ZNF25 | zinc finger protein 25 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT636142 | WDR37 | WD repeat domain 37 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT640645 | IGF2 | insulin like growth factor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT644638 | ICA1L | islet cell autoantigen 1 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT646673 | CCDC69 | coiled-coil domain containing 69 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT650041 | VHL | von Hippel-Lindau tumor suppressor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT651907 | UEVLD | UEV and lactate/malate dehyrogenase domains | 2 | 2 | ||||||||
MIRT655712 | MLF2 | myeloid leukemia factor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT655965 | NDNF | neuron derived neurotrophic factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT656110 | MSRB3 | methionine sulfoxide reductase B3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT658154 | FCHSD2 | FCH and double SH3 domains 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT661945 | FAHD1 | fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT664457 | WDR92 | WD repeat domain 92 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT671622 | C20orf144 | chromosome 20 open reading frame 144 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT677168 | ZNF786 | zinc finger protein 786 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT679004 | UBN2 | ubinuclein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT679181 | XIAP | X-linked inhibitor of apoptosis | 2 | 2 | ||||||||
MIRT679343 | PPP1R3B | protein phosphatase 1 regulatory subunit 3B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT679439 | C19orf52 | translocase of inner mitochondrial membrane 29 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT682503 | GLP2R | glucagon like peptide 2 receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT683558 | SMIM12 | small integral membrane protein 12 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT687136 | QPCTL | glutaminyl-peptide cyclotransferase like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT687722 | KIAA1467 | family with sequence similarity 234 member B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT688411 | DUSP2 | dual specificity phosphatase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT694684 | CD300LG | CD300 molecule like family member g | 2 | 2 | ||||||||
MIRT695390 | WDR41 | WD repeat domain 41 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT696136 | ALG1 | ALG1, chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT699113 | SMU1 | DNA replication regulator and spliceosomal factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT702771 | IFNLR1 | interferon lambda receptor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT704096 | DST | dystonin | 2 | 2 | ||||||||
MIRT704279 | DENND5B | DENN domain containing 5B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT707692 | FAM118A | family with sequence similarity 118 member A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT708060 | LIX1L | limb and CNS expressed 1 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT710078 | BEND3 | BEN domain containing 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT725480 | GPR26 | G protein-coupled receptor 26 | 2 | 2 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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