pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4480 |
Genomic Coordinates | chr10: 12578753 - 12578823 |
Description | Homo sapiens miR-4480 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4480 | |||||||||||||||||||||
Sequence | 44| AGCCAAGUGGAAGUUACUUUA |64 | |||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | IRS1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HIRS-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | insulin receptor substrate 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_005544 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on IRS1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of IRS1 (miRNA target sites are highlighted) |
>IRS1|NM_005544|3'UTR 1 CTCAACTGGACATCACAGCAGAATGAAGACCTAAATGACCTCAGCAAATCCTCTTCTAACTCATGGGTACCCAGACTCTA 81 AATATTTCATGATTCACAACTAGGACCTCATATCTTCCTCATCAGTAGATGGTACGATGCATCCATTTCAGTTTGTTTAC 161 TTTATCCAATCCTCAGGATTTCATTGACTGAACTGCACGTTCTATATTGTGCCAAGCGAAAAAAAAAAATGCACTGTGAC 241 ACCAGAATAATGAGTCTGCATAAACTTCATCTTCAACCTTAAGGACTTAGCTGGCCACAGTGAGCTGATGTGCCCACCAC 321 CGTGTCATGAGAGAATGGGTTTACTCTCAATGCATTTTCAAGATACATTTCATCTGCTGCTGAAACTGTGTACGACAAAG 401 CATCATTGTAAATTATTTCATACAAAACTGTTCACGTTGGGTGGAGAGAGTATTAAATATTTAACATAGGTTTTGATTTA 481 TATGTGTAATTTTTTAAATGAAAATGTAACTTTTCTTACAGCACATCTTTTTTTTGGATGTGGGATGGAGGTATACAATG 561 TTCTGTTGTAAAGAGTGGAGCAAATGCTTAAAACAAGGCTTAAAAGAGTAGAATAGGGTATGATCCTTGTTTTAAGATTG 641 TAATTCAGAAAACATAATATAAGAATCATAGTGCCATAGATGGTTCTCAATTGTATAGTTATATTTGCTGATACTATCTC 721 TTGTCATATAAACCTGATGTTGAGCTGAGTTCCTTATAAGAATTAATCTTAATTTTGTATTTTTTCCTGTAAGACAATAG 801 GCCATGTTAATTAAACTGAAGAAGGATATATTTGGCTGGGTGTTTTCAAATGTCAGCTTAAAATTGGTAATTGAATGGAA 881 GCAAAATTATAAGAAGAGGAAATTAAAGTCTTCCATTGCATGTATTGTAAACAGAAGGAGATGGGTGATTCCTTCAATTC 961 AAAAGCTCTCTTTGGAATGAACAATGTGGGCGTTTGTAAATTCTGGAAATGTCTTTCTATTCATAATAAACTAGATACTG 1041 TTGATCTTTTCTTCTGTCCCCTCCCCCCACCACTTCTGTAAGTTTCCTGCTCTATTCCCACCATTTTTTTCTGTGCACAC 1121 ATTATGATATATTTCATTTCCTGCATTGTCTTGAGAAAGATGGTAAGGCAAGTGAGCTGTTGCTAACCAGAAATTAAAAT 1201 TCCAGTAAGTGTTTTTCATTATGACCAGGGCTATGTGTCACCTTCCCTAAGACTCTTACCTTATCTCATATTTTTTGAGA 1281 ACTTCCAGTGTTACATTATTTAACTGAATGTAATTGGCCCATTTGCCTTGGTGGGTGCTGGCCTATTAGTGATTAGTTAA 1361 CAAAACACAGCGTACAGAGAGCACAGAAAAGCTTAATGACCTGCTACTGAAACACCTAGCCAGCAGTGAAAATGTTAATT 1441 CTTTTCTTGTTTGGAAAGTATACACGTCTTGGAATTTTTTCCACGTGAAAAACAAATGGCAATGAATGCATTTAAAGATA 1521 TTGCCGACAGATTTTTAAATCTTTTTACCAGGAAACTTCCTAAAGGTTAAATGAATTAATGCAAATATCAGGCTCCCTCT 1601 GAGTCTGTGGGAGCCTCTATCTCTCTATCAGGAATTCGCATCCCTACTATTGGGAGGAGCAACATTTTATTTCTCTGAAC 1681 GCCTAAGCTCCCTGGGTGGGAGTGGGGACTACAAGGTAGGGGCCAGGGTTGGAGGGCATTGTAGTGGCTGCTGCCTCCTG 1761 ATGAACTGTTTGGGGACCCCAGCTCTACTCAAAAGGGAGCGGAGATAAATGGAACCCCTCACACTGCTGAGGCCCGTGTT 1841 ACTGTTCATTCAGCCAGGTGGCATGTACCTCACAGACTGTTGTGCAGTGTCCGTTATTGCAGATTTTAATCATTTGCATG 1921 CTCATCAATTTCTAAGATAAATAGGGTCTAGAGTCATAAGAATCCATTGTTTTCAAGGAACTTGCAGAATTACATCATTT 2001 CCTATTAGTAGAGAGCACTACCCATTTTGAAAATCTGATATGAAAGTTGTTTTTTACTCTTGTAAAAAAAGACTTTCTTA 2081 GTCAAACTAACTTTTCATATTTTCAAGCATTCTGATTCATACTCTTGCTAGTGGAAGAAGAGAGCAAGCTGCCCTGCTCT 2161 TTTCCTTTGAGGACTGAAATAGTTAAAGAGAAATCAATGAACAAAGTCACTCCCAACCATTTTCCTGTAAAGCTGGTTAT 2241 TATTTCTCAAGGAACCTACACTTTGAATATGTGTTACCGAGATACCTCTACATGTGGAATTATCAACATGTTTTGAATGA 2321 GAGCAGAAATGAACAGACTGGAAAAATCTATCTCTTGGTTTCTATTTCTCTGACTTTTTGAGTCGAAAAGCATAAAGGTA 2401 GAAATTCTTATTTAAGCTGCTTCTAGTGGTGCCTGAGCTGGTTTTGATGGTGGCATCAAACTACCGATTTAAAACTGGAA 2481 GTTGCTGGTACTCAAACCAAAAGTTCATACTCTGGCGACACGAAGGGTTTCCTTTGAGCAACGTCAGCTGCTGAGTCCTT 2561 GTGTTCAGTTCCCATTGAGGAGAGTTGGCTTTTATCCATTTCAAAGCATTTGTAGGCCAGCCAAGGGCTTTCATTATTGA 2641 GGCTTCTAGTGGCCTCTGGTTAACCTAGAAGTTAGTGGGTTTTTCTTGATGACACCAACCTCTCACAGCGTTTTTCCTTA 2721 GAGACTTAAGCAGAGTTTTAAAATCCTCTTTTGCGAAAAGAACAAATATGTTTTATGACTTTGATGATATCTTCATTCTG 2801 GGCAAAAGAATGGCCCTAGAACCAGCTAGAAGTGAAGAGAATCCATTAATGATCAACCACCTGAGTCAATAATGAGAAAT 2881 CAGTACTGATGTTACATTTGTGGCTATTTCTTGCTGACTTTCAAAGGTCAAGGACTCTTGACTAATCCAGTGACTGCAAA 2961 AATGGATCTACTAAAAGTCATCTAGCCAGAAGTAGAGATTTTTAACCTTTCTTTCCCTGGCTTTTGTCTTCTAGCTATCA 3041 TTTAAATTTGAGACATTTGAAGTATTAAGAAACAATTTTTCTGTATGGTAAGAAACAGTATTTTACAATACTGAAGCCCT 3121 GTTTTATTCAATCTTGCATCTTGAATACAATATACCACAAAGTCGGAAACTTTATATTTATTTACTGCAGGTGGTTAAAA 3201 AAAGGGGGGAAAGGGTTTCACCATCCACTGACAACGAGAGCCATGACAAATAGTATCCATGTGCAGTCTTCCAACTGCTG 3281 GTGACAATGACCCCATATTTGGTCTCATGCTGCTTTTGCAGAGCACTCTGTAGGTTAGTCCATCACACAAGGAGGCCCTG 3361 AATCCAGACACTGTGAATTAAGACCTTGGCGGGGAGAGATGTGACCCTTTTGGTAGGAATGGGAAGAAGAATGGGTGGAA 3441 GCCAATATGAAATTTCTTCTTTGCAATGACTTGACAGGGGAGTTAATGTTCCTAGGATGCCATGAATGATGAATGTTAGT 3521 TGGAGGTAATGCTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTATATATATGTGTGTGTGTATATATA 3601 TGTGACATGTGTGTGTCTTTGTGTGTGTGTATATATATGTGACGTGTGTGTGGGATGTGTGTGTGTATATATAGATGAAT 3681 ATATACAAATATATAGATATATACACACATATATAGATATATATACACATATATAGATATATATACACACATATATAGAT 3761 ACACATATGTGTGTGTGTGTATATATATATATATATATATATAGATGTATAGGCTTGTGAGAAACTTGAGAGGAAGAAGC 3841 ATGCTCTTCTAGGAATGTGAGGAAATATGACCTTGCCAAGACTAAAAGACCTCTAGACTGTGAGCTCAGTTATGGAGAAC 3921 AAAAACAGCTTCATAGTGAGTAGAACACCGAGGATAAACACTGGGGCCATGGGTCCTTTCTGAGGCAGCGCCACAGAAGA 4001 TCTTTGTGGTCCTTCCGTAGTTCTGTAAGTCTGTCTCCTAAGTATGGGTAGAGAATATGTAGCCTGTTGTGTGTCTCCCA 4081 CTACTTGTAAACAGAGCATCACATTAGGGGCAGGGAGGAGGTGGAATGATATTGGAGGTGCTTAACCCTACTCGAGGAAT 4161 TAATTATGAATAAAGAGCTTATAATTAGCTAACATGACTAGAAAACACATGACTTAGGTGGAGAGTTAGCTTTCTTTTCT 4241 AGTTTGTGTATGACTTGCCATTTGTGACGTATACACCAAAAGATCTGGTGTTTTAGACTTCTGCCATTCACTTGGCATTT 4321 AAATCTCTCTTTGCTTATGCTGTTAACGAGTATGCCATAGGATAGGACAAATTCAGTAAACAGGAAAACTTGTCCATATT 4401 TGCATAGACATTTGTAGGGTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTAGAACTTCACCATTGGCTTAAGAATGTAGTTCCCAAAAC 4481 AATTTTTTCTTGCAAAGTACTTTCCTTACACCTCTTGGCTACAGGGTGGGCCAAATTAAACATATATGTATTTTCATTTA 4561 ATGTATGTGCAGTTTGGTTTATCATCTTAAGATGGTGGTGCTGCCCCGGTGCTACTTCATCTGTGTACACAAAGACCAAT 4641 GCATGGTCTGTATTGCTACCAAAACATTTACTGTATATATGTTTATAACATGTATTATGTATATATGTAATGGGTGCCAG 4721 GCCAGGTATATATTTTTTATTTAGAAGTGTTTCACTTTTCCAAGTTTTCTTTATAGTGTTATGCTTATTTTCAATTTTTT 4801 TTTTCCTGATTCTGTCTGGTACTTAGAATTGTAGTGTCTTCATCATCAATTAAAGAAAACTGTCTAAATGAATTCATGGA 4881 TGTAAATATTAGTGGTCCTTAATGTCTTTGATTGCTGGACATGAAACAAACTGCCAATTAAATTTTGCGGAGACAAAAAA 4961 AA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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