pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4480 |
Genomic Coordinates | chr10: 12578753 - 12578823 |
Description | Homo sapiens miR-4480 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4480 | |||||||||||||||||||||
Sequence | 44| AGCCAAGUGGAAGUUACUUUA |64 | |||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | ALPK3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | MAK, MIDORI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | alpha kinase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_020778 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on ALPK3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of ALPK3 (miRNA target sites are highlighted) |
>ALPK3|NM_020778|3'UTR 1 CCTCCGCAGAGGCTGGGGGCCTCCACCCAGCAGCAGACCAACCAGGAAGCAGCTTGAACTGGATGGAGACTTTCCAAATA 81 TGGAACTAACTGGAGAAGGTGCACGAAGGAGACACCACTTGGGGACCTCTCTGAGCAGGCTCTCGTGAATCAGCTCGTCA 161 TCAGATGGCTTTGGTGCATGGCACATAGCCCACTGGCCTCTTCTGGTGCCACTGTCACCCAGGGCTCCCGGGCCTCAAGC 241 AGTCCCCACCTCCAAGTGCCTGGCAACCTAGGCCCTCCTTGAAGTTTACACTTTGCCACTGCTGGAGGCTCCCCTGAGTC 321 CTCTGCATGAGTTCTGCACCCCAAGCCCTTGCCCCAGCCCAGTCCAGCAGCAGATGTTACAATCTGAGTGAGGACATGCA 401 GGCCAACTTTTACCCTCCTGCATTTGCCTGGCCCTGATCTCGCCTGTCCTCAGGGATCCAGACTTCCTCTGCTGGTCTGG 481 CCTGGTGACTCTCAGGGTATCTTCTCCTTCCAGCTACTTTCGCTCACTGATCTCAGCTTATCCTGCAACTAACCATCCTT 561 GAGCCCAGATGGGGCTCAGGGCCCTTCCAGAGCCTGTCATGTCCTTGTGCAGTGGCCTTTGATGTGTGTTCACGCTCTTC 641 CCCCTTCACTCACTCGCCTGCTTCCCATGCTCCCTTGTACCCCCTCGCCACATCCCTGTCTTGGGGCCCAGCTGCAGCCT 721 GCTGCCTGCCCTTCATGGCTCTGCACATGGCCCTTTGCTTGAGGGCTCCCCACTCCCTGCCCACCAATACCCAGGTGAGG 801 AACAGACCCTCTGGCCTCTCACCCCACTTCAGTGCTCTCTTCCCCAACTTCTCTCGGGCTCTTTGCTCATGAGGTGAGAG 881 CTGGTGTGAGGGTTGTGTCAGCAGCTGTAGCCAGAGAGAGGTGTTGACTCTGAGAGACCTTGCACTCCATACTGAAAGGA 961 GGTGGGGTCACAGTGAATTTCACATCCCCTCTCAACCAGGAGTGGAGGGCTAGGTCCCTTCCCCATGGGGAGTACACTTG 1041 GGTGTTCTAGGAGGGATGCAGTCTATCCATGCACTTGGGTGGAGGGGAGTCTCTGTGCCTGGGAATTAGGACCCCTGCTC 1121 CAACCATCGCTCTTGATCCTGGGGCCCCAGCTCTGGGTCCTCATGTATGGGCTCCCAAGGACCCAGCAGCCTGGATCCTT 1201 CCAGAGCATCCCTCCTGGAGGCCTGGGATGGGGTAGGTCTGCAGCTAGCCTACTCCCTTTGGAATGCAATAAAGGCAGCA 1281 TTGTGTGCCCTGCTTGCCCTCATCTGGTGTGGTTGGAGGTCTGTGGAGTCAAGGTCCCCCTCTCCCAGGCAGGCTCTCTG 1361 AGGGCATTCTGTAGTCCCAGGCCCACTGGAAAAATGAATCTATATTTTGGTTCCTGGACCGAAGTTCAGTCGCAGCCTTC 1441 TGTGGCCACAGAAAGACAGCTTGTGCTGCTTGCACAACTGAGCTGCTGGTGTGTACCCCTTAGCAGGGTGTCTGGGGACT 1521 TACGCCTTTGGAATTGCTCTTCATTCAGAAGAGGAACACAAAGGAAGCCACCCAGGAAGGAAGCACAGAGCTGGGGGCTC 1601 TGGAAACGCCCTGTGTCTCTGGCTACAGCAAGACCAGCCCAGGAGCCCACCAGCACCTGCCTCTCAGCTACTTGCTGACC 1681 ATTTCCTGCTTCTCAAGCTGCAGAGAAGCTTTTCATTCCCACCCCCACCCGGAACCTCCCCTTGCCTAACATTTCCCCTC 1761 TATGGTAACATCTCTGACTTCTCTACCTCCTCTGTGCTCAGGTGACTCCACATCTTCTGCCCCAGTGTGTCCCCACCTCT 1841 CCCAGCCTGTATACCCAGATTACTTTGGTGAACTGAGAGCTGGAGTACTGTTCATTCATTTATTCATTCACCCACTCATT 1921 CAGCAGACATATACTGAGTGCTACTTTATGCCAGACCCTGGGCTGGCAGCTGTTTGGAGGCAAAGATGTATGAGGCCATC 2001 TCAGGAGAGACTACTTGTTAGGATTCTTGAGTTTTGACCAACAGAAATGAACTTGGACCAACTTAAGCAAGGAAAAAGCG 2081 TTCATGGGAAGGATGCTGGGATAGCTCACAAAACCAAAAGAATAGCTGAACAATTAATTGGCCCTGGGAAGGGTGGGAGC 2161 TGGGGCAACTACGAGGCTTGCCTCCCAGGAGCTGCTGCGGTTGGCAGATCAACACCAACTTGCCATTGGTTCTAGTGGGT 2241 CCCCTTCCACTCAAGATTCAAATTCCAAGTGAAAGAACCTGGCCTGGAGCTCAGGGCTTCATAGAGTGGGAGGGGGGCAG 2321 TCTTCCAAAAGATGCGGACTCTTGCCACATGGAATGGTGGAGTACGGAAGGGTGGAAAGGGTTTGGTAGGTAAACCCTGA 2401 AGATGCTTCTAACACACGTGCTGTTCTCCCATCTCACGTATGACGACTCTCCCACAGGTAACCAAAACCACATTTCTCTC 2481 TGCTTAGGGAATTCAAGATCATATCTAACTTCGAATTCCAGGGGTAATGACACGGCTTCTATTCTCCAAAGTCCAGTGTC 2561 ATTAGGGATAATCTCCCTCTTTCAGTTTTATCACAATTCCATTTTGAAATTCTACAACCTGTAGATTAACTGGTAAAATT 2641 AACCATATTCAACCAAAATTGTATAACCCAGCAAGAATGGAAGAATGGGTAAAGTCTACAGTCCATTTCTAGAACTGGTC 2721 ATGAGAACTCATGTTTATGATGATGGACTTTTGATCTGGTGGAGGGACCCAAACCTTCAGTTCTGAAGCTCATTAGTGGT 2801 CCTACCTGTGTGACAGGCATTTACTATTGGACTGGCAGTCCCAGGACAAACTCCAGGAATCCCCCCATGTCCATCTCTAC 2881 TCCTGCCCTCTTTTACGTAGCAGCAATCATATTTTCCCTTGATAGGGTTCATCATTCTAGATACTCCGATGACTTCTTTA 2961 TAATGAGCCTGAAGTGGCCTGGTGGCTGCCTCAGCTTCCAGTTCAGTTGAATAGCTACTACGTCTTTGAGGATGTGCTCC 3041 TTGCTGGGGGACTAAACTCTCCACGCCAGCCCAGTCCCAAACCTAAACCTCGGGTATGAGAAAAGCATTGAGATCTAGCA 3121 ATAGCAGGGCCATGTCCACACTGCGTCCTATCCCTGAAGGAGAAACAGCGCCAGGTATGGTTGCCGGCTCCAAGCGCATG 3201 CTGCCTCCTGCAGGCCTGACCCAGCCTCTCGGGGTGTTGTTTCTGGTGCCATAGTTGAATTTTCAACAAACCATTTCACC 3281 ACCCTCTCAAGACAGCTGCTGCTGGTTTGTGGGTTCCTGACAAGATGAGTGAATGCCTGCCCATCAACCCGTTACTATTC 3361 TTTTAGCTGTAAAGTGAATTCTCTGGTTGGGTGCAGTATGTGAGGAGGTCACATGATGTTTATGGCATTTGAGAATTCCA 3441 TGGATATTGATGGCAGGAGAGGCATGATGGGTTAGAAAAGCAAATCCAAATCCAGAACAAGGGCCCAAAAGGGCCAAGAC 3521 AAATTACTGCCCCTCTCAGAGCCACAGGTGTAGACAGGTGAAAACACTGGACAGTGAGTGAGCTACCCACACACGACCCA 3601 CTGGTGCCTTCAGAGCCTTAGCCTGGAGCGACAGTGTACCGTTGATAATGGAACGCACTGGCCATGCCAGACTTTATGGC 3681 TAGGCGGTCAGATAACACTACGAGGGGCAGCATGGCCACCAAGTGTGCCAGGGCCAAGTGTTCAGGCTCTCCCAGAGCCC 3761 AGTGGTGAGCCAGAAGGGCATTTTGTACAAGGATAATGGTTACTTTTTGGCCAGAGCATCACTTGGCTCCAAATCCTGGG 3841 TTCCCGTATCATATTTTCTTGTCAGGACTTACCGCAAGCTATGTATGGCTCCGCGGTATGCCACCCATGGAAAGACACCT 3921 CATGCACCATTGACCTGCCAGGTCACGTGGCCTGATGGCAGCGTCGGCTGCACAAAAGACTTTCCCAGCTGCAATGCCTT 4001 CGCCTGCTCTAGGCCCACCCCAAAGCTGGCAGTCTTCTAGGTCAGTTGGTAAATGGGTTAGAACAAGATGCCCCAAAGTG 4081 GCATAAATTGCATGGAATTAGGCCTTAGTGGCGAGGGATTCGACATACAGTCATTTGTCCTACATTGTGAAGGAAACATT 4161 CTGACCTCAAACAGATCCCTCAACCCCAGAACTTTATAGAAGGGGCAGACCTTGGCATTTTCACATGATTTATCTCCCAC 4241 TCTGATTCACATATGTTTGACCAAGGCACTGGGCAGCTGCCAATTTCCCGTCCCTTCTGTAGTCCCAGATGAATGGATAC 4321 AGACCTCTTTGGGGAAGGCTGCAAGGAAGGTTCACAACATGCATCTAAGTGTTAAAATAAGTTTTTCCTTCAAAAATACA 4401 TTTGACTTCCTCTCCATTTAAGGTCTGGAAATCAAGTGGGAGATCTTGACTTTACCTTGGCACTTGAGACAGAACTGTTG 4481 GCCCAGAAGTCTTTAGTTAAGGTCATTACTAGGCCATATCTTAGGGGCGTCTGGCCTTTTTCATTCCTGGGACCCACAGC 4561 TCGAGGTCTGGTTTCCATGCCCTATCCCTTACGATGAGCGCCCTATTTTGTTCCTTCTGTCTATCTCTGTTGCTGAGATC 4641 AGGGAGCCCACGTTCACAGCAGCTCTTTCAAGCAGCCTCCCAGGCCTAGAGAGGAAAATCAGCAGAGCCTCGTGAATGTA 4721 TTTCTCGTGGCAAGAAGGGAGCTCATCTTCTGGGTCCTGCCAGAGGGCAGTGAGGGGGTTGATGGGCTGGGTGCATGCCA 4801 GGGACCCAATCAAGCATTTTTATCTTCTGAAATCTTTGAATTCCTGCCTTTCTTGGATGTTTGGTCTTTTGATATAATTT 4881 AGCATGGGCCAACATTTGGTCCAGATTTGTATTAGCCAAGCCCTCCTAAAATAGTAATAACAGTATCTGGCGATTTGAGC 4961 TTTTACGTAGAATGTAGAATCTCTGGTGAGTGAACATATCAATAAAGACAACCTGAACCAAAATTAAAAAAAAAAAAAAA 5041 AAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | BC-3 |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
PAR-CLIP data was present in GSM796039. RNA binding protein: AGO2. Condition:4-Thiouridine
... - Gottwein E; Corcoran DL; Mukherjee N; et al., 2011, Cell host & microbe. |
Article |
- Gottwein E; Corcoran DL; Mukherjee N; et al. - Cell host & microbe, 2011
Primary effusion lymphoma (PEL) is caused by Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV) and frequently also harbors Epstein-Barr virus (EBV). The expression of KSHV- and EBV-encoded microRNAs (miRNAs) in PELs suggests a role for these miRNAs in latency and lymphomagenesis. Using PAR-CLIP, a technology which allows the direct and transcriptome-wide identification of miRNA targets, we delineate the target sites for all viral and cellular miRNAs expressed in PEL cell lines. The resulting data set revealed that KSHV miRNAs directly target more than 2000 cellular mRNAs, including many involved in pathways relevant to KSHV pathogenesis. Moreover, 58% of these mRNAs are also targeted by EBV miRNAs, via distinct binding sites. In addition to a known viral analog of cellular miR-155, we show that KSHV encodes a viral miRNA that mimics cellular miR-142-3p function. In summary, this study identifies an extensive list of KSHV miRNA targets, which are likely to influence viral replication and pathogenesis.
LinkOut: [PMID: 22100165]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM4903830 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Human neurons / CTLTD_shCTL_b |
Location of target site | NM_020778 | 3UTR | CUUGGCAUUUUCACA |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161238 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM4903831 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Human neurons / 124TD_shELAVL3_a |
Location of target site | NM_020778 | 3UTR | CUUGGCAUUUUCACA |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161238 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 3 for dataset GSM796039 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | BC-3 / 4-Thiouridine |
Location of target site | ENST00000258888.5 | 3UTR | UUGGCAUUUUCACAUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 22100165 / GSE32109 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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117 hsa-miR-4480 Target Genes:
Functional analysis:
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Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT056040 | MLLT10 | MLLT10, histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT091259 | FXR1 | FMR1 autosomal homolog 1 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT117347 | MAPRE2 | microtubule associated protein RP/EB family member 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT234960 | ZNF439 | zinc finger protein 439 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT441356 | ZNF75A | zinc finger protein 75a | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT441426 | STXBP2 | syntaxin binding protein 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT441455 | ZNF488 | zinc finger protein 488 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT441524 | ZBTB10 | zinc finger and BTB domain containing 10 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT441576 | EXOC5 | exocyst complex component 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT441597 | ABCB5 | ATP binding cassette subfamily B member 5 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT441610 | ATP13A4 | ATPase 13A4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT441698 | CIT | citron rho-interacting serine/threonine kinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT441714 | FGF9 | fibroblast growth factor 9 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT441784 | MAPK8 | mitogen-activated protein kinase 8 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT441795 | EXOSC2 | exosome component 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT441868 | RNASEL | ribonuclease L | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT441900 | SLC9A8 | solute carrier family 9 member A8 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT441919 | FAM217B | family with sequence similarity 217 member B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT441928 | C1orf109 | chromosome 1 open reading frame 109 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT441938 | RIMKLB | ribosomal modification protein rimK like family member B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442157 | DPY19L1 | dpy-19 like C-mannosyltransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442172 | AZF1 | azoospermia factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442208 | IRS1 | insulin receptor substrate 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442237 | DDX19A | DEAD-box helicase 19A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442366 | ZC3HAV1L | zinc finger CCCH-type containing, antiviral 1 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442572 | SDC1 | syndecan 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442604 | ZNF391 | zinc finger protein 391 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442609 | MRC1 | mannose receptor C-type 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442647 | POP4 | POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442658 | OIP5 | Opa interacting protein 5 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT442686 | COX15 | COX15, cytochrome c oxidase assembly homolog | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442773 | JAG1 | jagged 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442785 | CHD8 | chromodomain helicase DNA binding protein 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442895 | PLCB3 | phospholipase C beta 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442941 | C17orf105 | chromosome 17 open reading frame 105 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442959 | SGCD | sarcoglycan delta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442998 | EDAR | ectodysplasin A receptor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443017 | C21orf91 | chromosome 21 open reading frame 91 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT443064 | CASP5 | caspase 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443069 | ABLIM1 | actin binding LIM protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443208 | VPS36 | vacuolar protein sorting 36 homolog | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443237 | ANKRD26 | ankyrin repeat domain 26 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443253 | A1CF | APOBEC1 complementation factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443329 | JUN | Jun proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443333 | NRAS | NRAS proto-oncogene, GTPase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443349 | STX7 | syntaxin 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443452 | CLIC5 | chloride intracellular channel 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443547 | GPR35 | G protein-coupled receptor 35 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443616 | AVPR1A | arginine vasopressin receptor 1A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443626 | CPSF2 | cleavage and polyadenylation specific factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443730 | ALPK3 | alpha kinase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443786 | ST13 | ST13, Hsp70 interacting protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443852 | RGS6 | regulator of G protein signaling 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT445483 | KLF5 | Kruppel like factor 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT471105 | PHLDA2 | pleckstrin homology like domain family A member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT472329 | NETO2 | neuropilin and tolloid like 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT472391 | NDRG3 | NDRG family member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT473522 | MAX | MYC associated factor X | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT473874 | MAFK | MAF bZIP transcription factor K | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT476021 | GTF2A1 | general transcription factor IIA subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT478320 | DDN | dendrin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT492049 | TNFSF9 | TNF superfamily member 9 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT494851 | ANKRD24 | ankyrin repeat domain 24 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT494991 | TSSC1 | EARP complex and GARP complex interacting protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT495034 | RASSF2 | Ras association domain family member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT495111 | NOL10 | nucleolar protein 10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT495113 | TRADD | TNFRSF1A associated via death domain | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT495131 | METTL24 | methyltransferase like 24 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT495147 | STAC2 | SH3 and cysteine rich domain 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT495297 | NUP54 | nucleoporin 54 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT495341 | RTN2 | reticulon 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT495347 | ATP5S | ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex subunit s (factor B) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT496682 | DUSP18 | dual specificity phosphatase 18 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT496743 | TGFBR1 | transforming growth factor beta receptor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT496841 | KCNIP2 | potassium voltage-gated channel interacting protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT496852 | GPAM | glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT496889 | FOXP1 | forkhead box P1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT496922 | CLMN | calmin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT496990 | TMEM231 | transmembrane protein 231 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT497002 | SNAP25 | synaptosome associated protein 25 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT497058 | C6orf223 | chromosome 6 open reading frame 223 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT500529 | YWHAZ | tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT506048 | PPP6C | protein phosphatase 6 catalytic subunit | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT512163 | CD164 | CD164 molecule | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT527051 | RDH13 | retinol dehydrogenase 13 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT532282 | TNFSF14 | TNF superfamily member 14 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT534083 | SPRY4 | sprouty RTK signaling antagonist 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT534605 | RNASEH1 | ribonuclease H1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT539509 | ACSS3 | acyl-CoA synthetase short chain family member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT543069 | ARID4B | AT-rich interaction domain 4B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT544233 | CCBL2 | kynurenine aminotransferase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT544686 | ZNF224 | zinc finger protein 224 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT546269 | TMEM30A | transmembrane protein 30A | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT559069 | C19orf47 | chromosome 19 open reading frame 47 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT562768 | RMI2 | RecQ mediated genome instability 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT563974 | HCFC1 | host cell factor C1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT564086 | NSA2 | NSA2, ribosome biogenesis homolog | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT564525 | PDXP | pyridoxal phosphatase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT564613 | ZNF703 | zinc finger protein 703 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT566252 | PTBP1 | polypyrimidine tract binding protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT614420 | ZNF440 | zinc finger protein 440 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT618789 | MTHFR | methylenetetrahydrofolate reductase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT619160 | PPDPF | pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT641778 | ZDHHC7 | zinc finger DHHC-type containing 7 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT653680 | SLC25A36 | solute carrier family 25 member 36 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657861 | GJD2 | gap junction protein delta 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT660879 | ADCYAP1R1 | ADCYAP receptor type I | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT668781 | DAAM1 | dishevelled associated activator of morphogenesis 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT688559 | DCAF16 | DDB1 and CUL4 associated factor 16 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT695393 | WDR41 | WD repeat domain 41 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT698680 | TCEA1 | transcription elongation factor A1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT700974 | PDIA6 | protein disulfide isomerase family A member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT705055 | C5orf15 | chromosome 5 open reading frame 15 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT705864 | AFF1 | AF4/FMR2 family member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT710586 | CDCA4 | cell division cycle associated 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT713904 | IGF2R | insulin like growth factor 2 receptor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT717133 | SKI | SKI proto-oncogene | ![]() |
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2 | 2 |
miRNA-Drug Associations | ||||||||||||||||||
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miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||
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