pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-let-7e |
Genomic Coordinates | chr19: 51692786 - 51692864 |
Synonyms | MIRNLET7E, hsa-let-7e, let-7e, MIRLET7E |
Description | Homo sapiens let-7e stem-loop |
Comment | The mature sequence shown here represents the most commonly cloned form from large-scale cloning studies . |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Associated Diseases | ![]() |
Mature miRNA Information | |||||||
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Mature miRNA | hsa-let-7e-5p | ||||||
Sequence | 8| UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGUU |29 | ||||||
Evidence | Experimental | ||||||
Experiments | Cloned | ||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | ZNF587 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ZF6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | zinc finger protein 587 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_032828 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on ZNF587 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of ZNF587 (miRNA target sites are highlighted) |
>ZNF587|NM_032828|3'UTR 1 GTGCAGTGAATATGGGAAATCGTTTGCTGAAGCATCCCGTCTCGTTAAACACAGGAGAGTTCATACTGGAGAAAGGCCTT 81 ATGAGTGCTGTCAATGTGGAAAACATCAGAATGTCTGCTGTCCTCGGTCTTAAGCGACTTCGTGTTGAGATGGAGTCTTG 161 TTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTTGGCTCGCTGCAACTTGGGCCTCCTGGGTTCATGCAATCCTCCT 241 ACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTATGAGTACACACCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTGGAGATGGG 321 GTTTTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTTGACTCCCAAAGTGCTGAAAT 401 TACAGGCATGAGCCTCTGCACCTGGCCTTCATTCTTTTCGTATTGCTTAGAATATGACATGCTGAACCAGGCATGGTGGC 481 TCATGCTTGTAAACCTGATGCTTTGGGAGGACAAGGTGGTTCATTGGAGGCCAGGAGTTAGAGATCAGCCTGGGCAACAT 561 AGCCAGACCTCCTCTCTACAAAAAGAAAAAAGAATGACATGCTTCTTGTTTTTGTCTGTTATAAATGAAACTGCTATATT 641 TGAATGCAGTTGTTCATGTAGGTATGTTTCACTATGGTAATATGGTGGTGTGCAGTGCCTGAGTCACGTGATAGATTAAA 721 GTACAACTCTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCGGGAGTTAGGTGGCATGATTTCGGCTCACTGCAACC 801 TCTGCCTCCCAAGTTCAACTGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCAGGGATTACCGGTGTGCACCACCATGCCTGG 881 ATAACTTTTTTTTTTATTTCTATTAGCAATGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTTGTTATGAACTGACCTCAAGTGATC 961 TGCCTGCCTCAGCTTCTCAGGTGTGACCTACTGTGCTTGGCCTAATGTACAACTTTTTAAGCAATGCCAAACTATGACTT 1041 AAGAATGAAATTATTGCTCATTTGTATATCTATCTACCATCAGTGTCCAAGAATTTCTGTTCTATCTTACCAAGAGGGAG 1121 TATGGTTAGTATTTGAAATTGTTTATTATTTTAATAAGTGGTTATAACTTTTGAGTCAGTGGTTTATGTTTTGCATTTTT 1201 TTTGTTTTGAGACAAAGTCTCGCTCTGTCTCCCAGGCTAGAGTACCGTGGCACAATCTCAGCTCATTGCAACCTCTGCTT 1281 CCTGGGCTCAAGCACTCTGCCCACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGAAATACAGGTATGCACCACCACAACTGGATAACTT 1361 TTGTATTTTCTGTAGAGAGGGTTTTACCTTTTTGCCCAGTCTGATCGCGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCACTTGCCTA 1441 GGCTCCAAAAGTGCTTGGTCTACAGGGGTGAGGCACCCTGCCTGGCCTCACCTGTAGGCTTGTTTTTTAAAATGAATTTT 1521 ATCTATTTCCCATTTCATTAATATATTTAAAAATAATGAAATAACAAAGACGTATGTTGGACTTCATTCATTCTTCAGTG 1601 ATGTCACTTTGCTGCAAGGAATATTTGGTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGATGGAGTCTAGCTCTGTCTCCTAAGCT 1681 ACAGTGAAGTGGCATGATCTCGGCCCACTGCAACCTCCACCTCCTGTGTTCAAGCGATTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAG 1761 CTGGGACTACAGGCATGTGCCATTATACCTGGCTAATTTTATTTATTTATTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAC 1841 CCAGGCTGCTCTCTACCTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTCAGCC 1921 ACTGTACCTGGCTGAATACTTGGTTTTCAGTACCACAAGAACTATGAGCTGGTTATCCACTTCATGTGGAATCATAAGCG 2001 TCCCAAAGTGACAATACATATAGATTGCCAGGCAGTGAAACAGTTAAGATGCCACCATAGCTTTCTTTTCAACATCTTTC 2081 TAAGATTACCTTACTATTTCTTTTGTTCCAAGTTTGTACTTCCTCACAGTTCTCACATATGGAAAGGATACACACTTTGT 2161 AGAAACAAGAACTTTATGTTATCCAAGTTCTAGGATAGCCATGAGCTCCAATTATCTCAGAGCTCTGAGTCCTCTACTCA 2241 ATACCCATTGAGATTTATGTGTTCTGAGGCTTTTGTCTTCTAGCTACTTACTTCATTCTCCATGGGTAACGTCATTCATC 2321 CACATTAACTAATTTCCTCACTCCAAGCTCTTTTCTAGAGATAATCTCCAGTCCCTGTGCAGAAACTGTCATTGCACTTT 2401 CTGCTGAAATGGCAGTTTCTTCTCAGCAAGGTGAGATTATGGAATCCAGAATCTTTTTTCAGGGGTCACATGCCCATTTC 2481 CCCACTTGCATGAATGTCGACACTGCAGCCACAGTTTTGGCCGTAAATGTGAATTTGGCAAGTAACCACTGTTCCCAGGG 2561 AAATGTCCCAATCAGAAGAAGATTATCTGGGACACTGATACTGACAGGGAGATGGGACATTCTGAGGGACCCGGAGGCAG 2641 GGTGCCACCTCCTCAACTTCCCTGAGGGCTGCCTAGAATCTGTTTCCTCTCACTCTGAATTATTCTTCCTCTTATGGCTG 2721 ACCAAAAACATGGAACCTCACAAAGTCCACTGTAACAGCTTTATATTTGTGAAGTGAAGAACATGAAGACAGTTTCAAGC 2801 AAAGTTATTGAGTGGACACTTTGTGTTTTTTTTGAGAAGTCTCACTCTTTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCT 2881 CGGCTCACTGCAACTCCACCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAAGCGCCC 2961 ACCACGTCAGCTTAATTTTTTTGTTTTGTTTCTTGAGACAGAGTCTTGCTCTCTTGCCCAGGTTGGAGTGCCGTGTCGCA 3041 ATCTCAGCTCACTGCAACTTCTACCTCCTGGATTCAAGCACTTCTCCTTGCCTCAGCCACCTCTTTAGCTGGGATTACAG 3121 GTGCGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGCAGAGACCAGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAA 3201 CTCCTGACCTCGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCTGGCCTGTAT 3281 TCTTTTCTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACTGTATTTGCCAGGATGGTCTCGATCTCCAGACCTCGTGATCCGCCCGCCTT 3361 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCAACACGCCCTGGCCACTTCTTGTCTTTGCAACATTTTTTAGATAT 3441 GTATTTGTGTTTTTTGGGGAGCTTAATTTGCTAATGGAATCTCTGTTATTTTCCTAACATGCTTGGTGGATACAAGAGTT 3521 AAGACTTCCTGTCCCGTTTAGTGTAACAAAAGAAAGTTAAGAAATGTGGATAAAAGATTGTAAGTTAGAAATGGCAAGAT 3601 AATCAGCTATATGAAGAATCTTGGCCAGGTGTGGTGGCTGAGGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCG 3681 GATCACAAGGTCAGGAGTTCAAGACCACCCTGGCCAATATTGTGAATTCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGTCG 3761 GGCATGGTGGCGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCAGAAAATCGGTTGAACCTGGGAGGTGGAAGG 3841 TGCACTGAGCCAATATCACACCAGTGCACTCCAACCTGGTGACAGAGAGACACATCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAACTC 3921 AATCCATAAATGTTATACTTTATAACTTTATAACAGCATGTTATATGGGCTTAGATATTATCCCTAAATTTTTTTTTTTT 4001 TTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAATGGCATGGTCTCGGCTCACTGCAACCTCCG 4081 CCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGCCTATAGGTTCCCTCCACCACGCCCAGCTAA 4161 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGCTTTCACTACGTTAGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCCACCCCC 4241 CTCGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCATCTGCCACCGCACTCGGCTTATCCCTAGAAATCCTATGATAGCATGAT 4321 GTATAGGCACCTAAAGGCATGGCACTTGAGAAATGTGAATAAGATTGTAAGTTACAAATAGCAAGGTACAGTCAGATGTT 4401 AACAGTCTCAGCCCCTAAATGTCACCTTGTATTACAGCATGTTATATAAGCACATACAGGCACATACATGAAATAGTGAT 4481 ACTTCATTCTCAGTAATATCTTCATCCTTCTCACTGGAAAGATCTTTGATGATTTTTAATCAACATAGGAGTTTCAATGA 4561 TATCTAGAAGTTTAAAAGGGCTCGTTCAAACAAATTATGACCACACACACTGAAGAGTATGTTTGTCTCTTGTGGTGTAA 4641 ATTTTTTTTTATTACACCAAATTATGTTCACACAAAACCTTTGTAATCAGGGGGAATTAAAGAGCCTTCCTGGAAAATGG 4721 AGGTTGCAATCAGCCGAGATGGTGCCATCGCACTCTAGCCTGGGGAATAGAGTGAGATCCTGCCTCAAAAAAAACAAAAA 4801 AATTCTTTATTTTCTCCATAAACTACAGTTTATATAAGCAAAAGTTTCAGTACTAAGCAATTTTAGTCTCTGCAGTCTCT 4881 TGTCTTGAATTAATACAACTTTTGTTAATTCTCTTATGAAGTTAATCTTCCTGCTTGTATGTGAATTAAATATATGTCAA 4961 ACTTTTTTTGTACAAAAGATTCAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | TZM-bl | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
PAR-CLIP data was present in GSM1462574. RNA binding protein: AGO2. Condition:TZM-bl ami BaL
... - Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al., 2013, mBio. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al. - mBio, 2013
UNLABELLED: The question of how HIV-1 interfaces with cellular microRNA (miRNA) biogenesis and effector mechanisms has been highly controversial. Here, we first used deep sequencing of small RNAs present in two different infected cell lines (TZM-bl and C8166) and two types of primary human cells (CD4(+) peripheral blood mononuclear cells [PBMCs] and macrophages) to unequivocally demonstrate that HIV-1 does not encode any viral miRNAs. Perhaps surprisingly, we also observed that infection of T cells by HIV-1 has only a modest effect on the expression of cellular miRNAs at early times after infection. Comprehensive analysis of miRNA binding to the HIV-1 genome using the photoactivatable ribonucleoside-induced cross-linking and immunoprecipitation (PAR-CLIP) technique revealed several binding sites for cellular miRNAs, a subset of which were shown to be capable of mediating miRNA-mediated repression of gene expression. However, the main finding from this analysis is that HIV-1 transcripts are largely refractory to miRNA binding, most probably due to extensive viral RNA secondary structure. Together, these data demonstrate that HIV-1 neither encodes viral miRNAs nor strongly influences cellular miRNA expression, at least early after infection, and imply that HIV-1 transcripts have evolved to avoid inhibition by preexisting cellular miRNAs by adopting extensive RNA secondary structures that occlude most potential miRNA binding sites. IMPORTANCE: MicroRNAs (miRNAs) are a ubiquitous class of small regulatory RNAs that serve as posttranscriptional regulators of gene expression. Previous work has suggested that HIV-1 might subvert the function of the cellular miRNA machinery by expressing viral miRNAs or by dramatically altering the level of cellular miRNA expression. Using very sensitive approaches, we now demonstrate that neither of these ideas is in fact correct. Moreover, HIV-1 transcripts appear to largely avoid regulation by cellular miRNAs by adopting an extensive RNA secondary structure that occludes the ability of cellular miRNAs to interact with viral mRNAs. Together, these data suggest that HIV-1, rather than seeking to control miRNA function in infected cells, has instead evolved a mechanism to become largely invisible to cellular miRNA effector mechanisms.
LinkOut: [PMID: 23592263]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1462574 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | TZM-bl / TZM-bl ami BaL |
Location of target site | ENST00000339656.5 | 3UTR | CUCACUGCAACUUCUACCUCCUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23592263 / GSE59944 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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581 hsa-let-7e-5p Target Genes:
Functional analysis:
ID![]() |
Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT002081 | HMGA2 | high mobility group AT-hook 2 | ![]() |
![]() |
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5 | 5 | |||
MIRT003932 | EIF3J | eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J | ![]() |
![]() |
2 | 1 | ||||||
MIRT004469 | SMC1A | structural maintenance of chromosomes 1A | ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
4 | 7 | ||||
MIRT005718 | WNT1 | Wnt family member 1 | ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
4 | 1 | ||||
MIRT006122 | CCND1 | cyclin D1 | ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
5 | 4 | |||
MIRT006404 | MPL | MPL proto-oncogene, thrombopoietin receptor | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT032098 | RABGAP1L | RAB GTPase activating protein 1 like | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT032099 | DAD1 | defender against cell death 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT032100 | MYCN | MYCN proto-oncogene, bHLH transcription factor | ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
4 | 2 | ||||
MIRT051413 | WDR67 | TBC1 domain family member 31 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051414 | FAM219B | family with sequence similarity 219 member B | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051415 | C11orf91 | chromosome 11 open reading frame 91 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051416 | CENPP | centromere protein P | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051417 | TMEM107 | transmembrane protein 107 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051418 | SREBF1 | sterol regulatory element binding transcription factor 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051419 | DAAM1 | dishevelled associated activator of morphogenesis 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051420 | DGCR8 | DGCR8, microprocessor complex subunit | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051421 | RAP1A | RAP1A, member of RAS oncogene family | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051422 | RPA1 | replication protein A1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051423 | SKIV2L | Ski2 like RNA helicase | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051424 | AGO1 | argonaute 1, RISC catalytic component | ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
4 | 2 | ||||
MIRT051425 | RPS27 | ribosomal protein S27 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051426 | ARNT2 | aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051427 | GPM6B | glycoprotein M6B | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051428 | TTLL12 | tubulin tyrosine ligase like 12 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051429 | HIST2H2BF | histone cluster 2 H2B family member f | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051430 | CELF2 | CUGBP Elav-like family member 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051431 | AGO2 | argonaute 2, RISC catalytic component | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051432 | VPS13D | vacuolar protein sorting 13 homolog D | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051433 | RPL10 | ribosomal protein L10 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051434 | SPCS2 | signal peptidase complex subunit 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051435 | DCAF8 | DDB1 and CUL4 associated factor 8 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051436 | CTC1 | CST telomere replication complex component 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051437 | NAA60 | N(alpha)-acetyltransferase 60, NatF catalytic subunit | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051438 | PHF3 | PHD finger protein 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051439 | TUBA1B | tubulin alpha 1b | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051440 | SHANK1 | SH3 and multiple ankyrin repeat domains 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051441 | SKA2 | spindle and kinetochore associated complex subunit 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051442 | SPTBN1 | spectrin beta, non-erythrocytic 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051443 | ND2 | MTND2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051444 | MED13L | mediator complex subunit 13 like | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051445 | RCOR3 | REST corepressor 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051446 | MACF1 | microtubule-actin crosslinking factor 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051447 | RDX | radixin | ![]() |
![]() |
2 | 5 | ||||||
MIRT051448 | PCBP2 | poly(rC) binding protein 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051449 | UBAP2L | ubiquitin associated protein 2 like | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051450 | CDCA3 | cell division cycle associated 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051451 | CABLES1 | Cdk5 and Abl enzyme substrate 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051452 | BTRC | beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051453 | C12orf49 | chromosome 12 open reading frame 49 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051454 | TIMP3 | TIMP metallopeptidase inhibitor 3 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051455 | WBSCR16 | RCC1 like | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051456 | SLC2A11 | solute carrier family 2 member 11 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051457 | NF1 | neurofibromin 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051458 | LRRC8A | leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit A | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051459 | RUNX1T1 | RUNX1 translocation partner 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051460 | DTNB | dystrobrevin beta | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051461 | SCMH1 | Scm polycomb group protein homolog 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051462 | YWHAG | tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein gamma | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051463 | RHBDD2 | rhomboid domain containing 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051464 | ND5 | NADH dehydrogenase, subunit 5 (complex I) | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051465 | NDST1 | N-deacetylase and N-sulfotransferase 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051466 | IGF2BP3 | insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 3 | ![]() |
![]() |
2 | 5 | ||||||
MIRT051467 | EIF4A1 | eukaryotic translation initiation factor 4A1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051468 | BAHCC1 | BAH domain and coiled-coil containing 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051469 | CARM1 | coactivator associated arginine methyltransferase 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051470 | DYRK2 | dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051471 | ND3 | NADH dehydrogenase, subunit 3 (complex I) | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051472 | PIGS | phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class S | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051473 | ALG13 | ALG13, UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051474 | RPN2 | ribophorin II | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051475 | RPL12 | ribosomal protein L12 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051476 | NME4 | NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051477 | IVD | isovaleryl-CoA dehydrogenase | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051478 | JAZF1 | JAZF zinc finger 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051479 | ND4 | NADH dehydrogenase, subunit 4 (complex I) | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051480 | VARS | valyl-tRNA synthetase | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051481 | RNF26 | ring finger protein 26 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051482 | LHFPL2 | LHFPL tetraspan subfamily member 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051483 | ARCN1 | archain 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051484 | COX1 | cytochrome c oxidase subunit I | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051485 | SLC12A4 | solute carrier family 12 member 4 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051486 | AEBP2 | AE binding protein 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051487 | PET112 | glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051488 | UROC1 | urocanate hydratase 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051489 | IGF1R | insulin like growth factor 1 receptor | ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
5 | 10 | |||
MIRT051490 | BSDC1 | BSD domain containing 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051491 | PTK2 | protein tyrosine kinase 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051492 | CDC5L | cell division cycle 5 like | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051493 | EN2 | engrailed homeobox 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051494 | SSB | Sjogren syndrome antigen B | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051495 | SLCO3A1 | solute carrier organic anion transporter family member 3A1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051496 | RRAGC | Ras related GTP binding C | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051497 | ZNF236 | zinc finger protein 236 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051498 | SEMA4B | semaphorin 4B | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051499 | SERBP1 | SERPINE1 mRNA binding protein 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051500 | XIAP | X-linked inhibitor of apoptosis | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051501 | GTF2I | general transcription factor IIi | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051502 | JMJD1C | jumonji domain containing 1C | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051503 | OTUD5 | OTU deubiquitinase 5 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051504 | NOLC1 | nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051505 | PPIG | peptidylprolyl isomerase G | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051506 | PSMD2 | proteasome 26S subunit, non-ATPase 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051507 | UGGT1 | UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051508 | VAMP2 | vesicle associated membrane protein 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT051509 | LSR | lipolysis stimulated lipoprotein receptor | ![]() |