pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-3128 |
Genomic Coordinates | chr2: 177255945 - 177256010 |
Description | Homo sapiens miR-3128 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-3128 | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 5| UCUGGCAAGUAAAAAACUCUCAU |27 | |||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | DRVs in miRNA |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | CAMK4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CaMK IV, CaMK-GR, caMK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | calcium/calmodulin dependent protein kinase IV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001744 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on CAMK4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of CAMK4 (miRNA target sites are highlighted) |
>CAMK4|NM_001744|3'UTR 1 ACAGCTTCCTTCAGATCTGGAAGCCAAACACCGGCATTTTATGTACTTTGTCCTTCAGCAAGAAAGGTGTGGAAGCATGA 81 TATGTACTATAGTGATTCTGTTTTTGAGGTGCAAAAAACATACATATATACCAGTTGGTAATTCTAACTTCAATGCATGT 161 GACTGCTTTATGAAAATAATAGTGTCTTCTATGGCATGTAATGGATACCTAATACCGATGAGTTAAATCTTGCAAGTTAA 241 CACAACGTAACACTTAAAAGCATACATTTTCAGCAACCAGTGGCACATATTTGAAGTGAATAGTAGCAAATTGTTTTTGC 321 TTTGAAAATCTAGCCATCCTACATCCTTTGGATTTCTTCACAAGGCAGTAATTCCTTTGAACTACTGCTTAGCTAATACT 401 AGGTAGTGCTAAAAGACATGTTCCCATAACTTTTACAACATTTTACTTTTTATCATTGATGTGTTCAAACTGTTTACAAG 481 GAGATGCTTATAGATGATAGTTGTACATATGTGCAAAAAAAAATCCACTTGCAATGGTAAGAAATTGAAGTATCCTTAAA 561 GGCCATGAAGCCATATGTCCCTAAAGCCTGTGTGGAGAATGCTTTATTTTATTCTTATTTATATACACTATATTAATAAT 641 AACCAAAATGTTCTAAGATTCTGCCATTTTACAACCCTGGAGGAAGTAATTTACAAACTCACGCTGAGTTCCATTCTTTC 721 CTTCACCTGCTCTCCAATAAGATGACTTTCTGATAGACAAAGCTTAGGGTGTAATAAACAGGGAAGAAAAGAAGGTAAGA 801 CTGTACTTAAACTGATGAAGATAAGATTGATTCCTTTTCATTTTCCAGATAAAATTGTATTTACTCATGAATTTATACAA 881 CTTTACAGATAAGAACATTTTAATGGATAAACTCTATAATTACCAAGTTGCAAATATTTAGAAAATTCTATTTCACAGGT 961 TAGTGCCAAAATGTCTTCATAGAGTAGGAATAATATTCCATTTTAAGATTATTCATTATTGACTTTAATAGAGTAAGAAA 1041 ACATTATTGTTTATCAAAGCTCTTTTTTTATCCAATTGATGGTTATCTACACATATCACTTATAAACTAAAGTTATTTAT 1121 GAAAAGCTAGTATGTCTTTTTCTCGTATTTGGAATGAAAGTACCCACATTTTACAATGTAGTGTTGAGAATGTGGCTGCC 1201 AATAAATTTAGCACAATGCAATTTATTTACCTTAAAAAACAAACAAAAACAAAAATAAAGAAAAATACTGATTTCAAATC 1281 AGACTCTTAAAAAGCTGGAACATTAGACCTGATATTTTATTATGATTTTTCCCAGAATAAGTTTAATTTCTCTTTGACTT 1361 TCATAGAAACACTTTCCCCTTATAGAAATTGCACTATCTCCAATTTATTTCTAGTTTGAGTTGAAATGAATATTTTATCA 1441 GATTAATTATGTGTCACATTTTTGGTGGGTTTTCTCAATTTTAAAAAAGAATTCATTTTAAAAAATAATTATTTTCAGAG 1521 ACCAAATAAAGACAATAAAAATGACTATCACATAAAAATCCTTGTTAAAAAAGAGATCTTAAATTATGTTGGCTCTCCCT 1601 CAAAACTATTAAATTAGAAAACGAAACTAAAGCTCCAGTTTGTAGAGGCTGTTGGACCTCAGTAGACATTCTTCTTTTCA 1681 ATCACAAATCTCTCTCTACTACTGTTCTCATGGGAAGAAAACAAGGTAGGACTTCTTATCTTTCATAGTTTAAGAATCTG 1761 ACAGGTCACTGATATGGAGCCCCTGAAGAAGCACATCATCTGGGCTCAGAAGATTATTTTTTGTTTTGTTTTATTTGTAC 1841 TATCTAGTAGAGAGCACTTTTCTTATTCCCTCTTTCCTTCCTTCCTCATTTAATTATTCCCTCTCAGAATTCCCATGTTG 1921 TCCATTATAAGGGGCTCGCTATTTTTAACCTTTAAGAATGTCTTCTTTGTTAAGCATTAAGATTTCCATTTAAGAGGATC 2001 AATTTCCTGTTGTACTTTTTACCATGAGACTGAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGTGT 2081 TGGAAGAGCAAAGAGAGGGAAGGGGGTCTTTTTAGAAAGTGGCACTTGGCGCTTAGCTGAAAGATCAGAACACATCATTC 2161 CTCCCTGCCCACCCCCATATTGTTCCAAGGGCAGTTGTTACATTATTTCAACACTAGAGTAGGGCGGACTGCATTGTTTG 2241 GCCCTGAGAACTATAGAAACAACGTTGCAAATACCATGCCCAATGTGTATTTTAGAATTTACTCATTTAAATGAGTGCAT 2321 ATTACCATTCCTCCATGTGAGTACTCGAGTTGATAATTCCCTCTATCTTTTTAAACCCATAAACTACATTTTTAAAAAAA 2401 TCAATGGGAGTTTTAAATTTTGACTCATGTTAAAGATAAGATTCTGATAATGACTATATAGTGACTAATTTCATTGTTTC 2481 AGTAGGAAACAAATCAAACTTTCAAAAATGTTGGTCATTTCAGTCAAATTATTCAAAGATTTCATATACATACATCCTAA 2561 GTTAGGATAATTATGTTAACATTTTTGAAAGAACAGCCAATGTTTATATTGCTTGTTAAAATGGAATGTATTGTCTATCT 2641 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CAAAGTATTCAGTCATGTTGTCTAGATTTACTTTAGATGGTGCAAAATTTCCAGATAGTAACCTATGTAAAAGGATTTGT 4481 AATTTCCTTGTAATTCCTGCCTATTAGTCCATATTCTGATTTCCTTATGTTCATCACTGATATGTTCCTGATCAGGGTCA 4561 TTGCTAGTAGTTGAGCATTTACTGGTTGAACATTGTTTAATGGTTAGATGTTATGTGTGTCTGCATTTAAAAAAATTGTG 4641 TACATGTTATTTCACTATTGGTATTACAATATTCATAACCACATGATAAACAGAAATGTACCCAATAATTTCCTATAAAA 4721 TTTTTCAAAGTCCTTTTATTCCCCTGACACACTCAGGGTGAATTTTTGTCTCCTTGGCAAATAAGAAAAAAAAGGAGAGA 4801 GACCACTGGAGAGATATCAGCAAACCACCCACAGTAACCAAGTTCAGTATTTCCTCTTTCTATATTTTGACCAATATATT 4881 AAGAGCAAATTTTGTCATTATTACTCCTTGTGGCTATTACCTGAGATCAGATAATATAATCTCAGCTCATAAAGCTTGGC 4961 CATGTCTATACTTATCTTGGAGAGCAATAACAAACTTGATTAATTTGTTTGGTTATTTAAAATTCCAACTTTCATAAATG 5041 CTCTGTGATGTACTCAAGACGATTGGGTTGTGTGATACTAACTTCCTTCAAGAACTCAGTCTGTTCCCTGTTGTCTGGTT 5121 CAGAGGTCCACCAGGGCAAAATAGAAGCCTTGCCGAGAAAGTGAACTGTCTTACTCCTTCAAAGGAATCAGATGTTGCTC 5201 TAGAGAAGACTCCAGGCATCTACCTGGTTGAGCTCAAATGAGGCAAGTGGGAGAAAACCTCTTCTCATCCTCTGATTGAA 5281 AGTGATACAATTTGAATATTGGTATATTGTCATTGGTCAGTAATGGAAAAATGAGATTCCACCAGTGGGTTACTCTTTTC 5361 TTGTCTTGGTTTGCTATGCCTTATCCCAGATCAGTGTTTTGTTCCATCCCTATGGTCATCTCTAAAGCCCTGACAGGAGC 5441 ATCCCAGACTGGAGAAATGCAGCGTATCTGTGGCCCAGAATTTTGTTTGATACTCTAAACAGCAATGCAAAGACTGCAAA 5521 ATCACACTATTCTAAACAGTTGTTTTCAGCTCATTTTGAAGATTGACCTGGAAAACATATAGATACAGAATATATACATT 5601 TAATCGTTGCTTGTGATTCATTGTGTCAAAATAACATTTAATTTTCACTCTGATTAATCTTTATTTTCCATTTAAAAGAT 5681 TATTTCAGGCTACTTAAATACAAGACCTTGCATTCTAATTTTTGAAAGCGGTTGTTTTCCCTGAGCTCTCTCTCAACTTT 5761 GACAGTTTGTGAATGATAAAAAGTTACTAGGTTTGTCCTTTCCTTGATAGATGTAGAGCAGTTCATCTGTTTTGTAAAGG 5841 TACAGTTAAGCATAACTATAGGCTGGGCGTGATAGTTCATGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGTTGGCAGA 5921 TCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACGTGGTGAAACCCCTAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 6001 ACGCTCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCC 6081 AAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAAGAGCGAAACTCCGTCAAAAAAAAATATATATATATGACCATAAAT 6161 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TTTTGGGAGTCACCAGGTTAAAGCAAAGCCTCAGTCACTGAAAGCAAAAACTGAATTGGCCAGGTCTCCACTGACAAAAC 8881 AGAGTAAATGATAGTATGACAGATAATTTCAAGTTTTCCAAGACTCCAATTTCTGAAAAATGTCTCATGACTCCAAAAAA 8961 TCACGTACTTCCTAAAATGTTGCCAGTGGAGGACCGAATCAAGGTTATTGCTGACCTCATTTTTTCAACCTTTTCAGTTA 9041 TTTGACCTGAATAGGCAATCCCCCAGGATTTCTGATTGAATTCTACCTGAAAGTTTAGATTTTAAAAGACAACCTGTAGG 9121 AAGCTAAGTCTCAGGCAACAAAATTTAAAACCATCAGAACTTGTTTCTCCAAACATCAACCTGCTCCTGTCAAGTCCTTT 9201 TTCATCTCTCCCTTTTGTCCCTTTACATACTGTTTTGTAAGTTCCTTTTGATATCATTTATTGCAGGCAGTATTTTTACA 9281 TCCATCTTCAAGAAACTTGGGAGACATTTAGACATTTAGTATGTGTACTTTTAGTTGTCTTGCCTCTTTATTTCAGATAA 9361 TGCCTGTGATTAGTGAATGGCGGCATTATTCCTGAAGACAAATGAAGGAAGATAGGGAGCAAGATTGACTGTCATTTGAA 9441 TGATGGAAGAGAAGTAGAATTACTGTGAGGTTACAAAAATCGTAAGTTAGCAGACATTGAGAAAGGAAAACTTCCTACTT 9521 GGGCTTTTCAGGCTTATGTGACATTATCTGGATGTGTTTTCTAGTCTTTCCTAAAGGAGAAATTTTTATTCCTGGGTTGC 9601 TGAAAGCTTTCTGGACTAAAAGGATATAAGCAGCTCAATAGCAGCATAGAGGATTAGATTAATGGAACAGCACTGCATAC 9681 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Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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