pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-500b |
Genomic Coordinates | chrX: 50010672 - 50010750 |
Description | Homo sapiens miR-500b stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Associated Diseases | ![]() |
Mature miRNA Information | |||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-500b-3p | ||||||
Sequence | 51| GCACCCAGGCAAGGAUUCUG |70 | ||||||
Evidence | Experimental | ||||||
Experiments | Illumina | ||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | ZBTB7A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | FBI-1, FBI1, LRF, TIP21, ZBTB7, ZNF857A, pokemon | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | zinc finger and BTB domain containing 7A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_015898 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on ZBTB7A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of ZBTB7A (miRNA target sites are highlighted) |
>ZBTB7A|NM_015898|3'UTR 1 AAACCAAAAAGAGAAAACAGAAACCCGAGAAAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAAAAAAAATCACCCACCACCCCCCCAAAA 81 ACACAAAAAAAGAAAATCTATCTATATACAGATATCTATATCTATATATATATATACAGATATATATATATGACGCGTCA 161 CAGAATCTAGGGTAGCGCTTTCTCAGATTTCCCTCCTTTCTGACGTTTTTCTCCCTCCGCAGGGGCCCCGGCCCTCCCTG 241 GCTCCCCTTCCCCCCACCACCCCATCGCTGGGTTTCGGGGCTTGGTTTGGGGTTTTTTGTAGGACACAAGGAATCCGAGA 321 CCCCGCACAGCCCCCTGGGCACCCGGCATGGGGCCTGGGGCCCGATCCGAGGCCCTGGGCTGGGGGGAGGGTAGACGTGG 401 GGGCGCTGGGGGGGGACTGGGGTGGGCTTTTAATTTCCTCCCCTCGCTGGTTTCTATGAGTCTTTCAGACAAGACCTTAA 481 ATGATTTCTGTCTGCTCTGAGCGGACGTTAAAATGGGCCCCCGTCCCCCGACCCGCACCCTCCTTCCTCAGGGCACTTAC 561 TAAGGGAGGGGTCTCCCTCTCCATCTCCCCAGTGGCCTCCCCGCCTCCAACCCTGCCTGCGGCCTCCCCCCGTCGCCCAC 641 CCCACGTCTCCTGGCCACTGAGACACAAACCTATTTATTTCTAGGCCTGGAGAAAGGAGATCGGACTGGGGTTCCCGGTG 721 GGGCGCCAGGATGGCTCCTGGGGGTGCTCCTGCCGCCTTCCTTCACGGCACTTACAACCGGCGGGACCCCCAGGGACCAC 801 CCCTCAGGGCGCCCCCCCACCCCCGCCCGGTCCACCTAGACCCCCACGTTTGGAGATTCAAAACTTCTGTCTTCGTCCTC 881 TCCCCCGAGCCCCCTCTCCCAAATTTTTAAAGCACTTTTTAGATTTTTTTTTCTCTTTCCTCCTTAAAAACAAAATTTAT 961 ATATAGATATATATATATATATAAATAATATACTTTTCCTCAGAGGAGCAGGCAACAGTGTGGGATAAACAGAGTCACGA 1041 TCAGAGGAACCCCAGGGTCTGGTGATGGCAGGGATGGGGGGAGAGAGAGAAAATCCACAAATTCCAATGTCACAAAAGCA 1121 ATAAAACAAACTAGAAAAAAAAAAGGTTTTACAAAATGAAAGGAAGGAAAAAAAAAAAGGCAACCAACCACATTAGAAGT 1201 CTTGGCACTTTGTAACGGAACGGGTACTACACTTTATCTTAATTCTTAATTTAAAAACATGTTTACAAGTTACAACCAAC 1281 TTCTATGAAAAGTTGAAAAGACAAAAAAAAAAAAAAAAAGCGAGCGAGAGAGAGAGCGAGAGAGAGAGCGAGAGCAGAAG 1361 AAATTCCTAAAAGTCGATTTATTTTTGTACAAAATAATAAAAAAAAAAACCCACCACAAACGTAGAATCCACTTCTGTTC 1441 CCCAAAAAGCGAGAAGGGGGGTTCAGGAGGAAGCCATCGCAGGGGACCTGGGAGACGCCCCGAGGTGTTTGTGCTTCACC 1521 CCCAGACGTCAGCCTCGAAGGCAGGACTGTGGGGTGTTCGTGCTGTGTTCCCCCCGCTCCCCCTTTCTGTCCCCTTTTTT 1601 GGTTCTGACGTGAAGAGGTCTTAGCGCCCGCTTCTGTCCACGGGGTCTCTCCTTCCTCCTCCCTAGCTCAGGGATGGGCC 1681 TTCCAGCCGGAGCACCCCGATCCCCATCCGGCACCCCCCAATCCCCCAACACGCCTGTCCCTCCCGCATGGCCACCAAGG 1761 AGCTGGACCTTGGATGCGCCTACCCTGCTGAGGTGGGTGACAGGGGCCCCCCACCTCCAGGGCCTTAGAACCACCGCCCC 1841 TCTCCCCACCCCAGGCACCCCTCTTTTTACTCAAAGGCACTGACTGTAATCCAGGGGGACTGGGACCTGCCTCCCCCCAA 1921 CCTCTGGCTCCCACAAGGCCCGGTGTTGACCGAGCCACAGGCCACGGACAGGGGCCGGGGTTGGGGAGACTATGTCGCCA 2001 GATGCCAGGACGCCCTCACCCCGTTTGCATATGCAATGCTAGCATGGGACCCCGAAAATAGACGCTCTGCTGCACTGAGA 2081 CTTCTTGTCAATGCCCAACCGGCGGGGGGGTGTCTCCCTGCCCCCGACCCCCCCATACCCCCTTCTCTGTGACACACACA 2161 TCTTCTCGTCTCTTTTTCTTTCATTGTTAAAGGGAAGCTTTTTAAGAAGGCAATTTTCATATTGTTTCTACAGGATGGTT 2241 TTGGTTCCCTTCCCTTCCCACCCCCCCTTAAGCCTGTCAGCCCCCTCCAAATGTCTCAGGATCCCCCCTCTCCCCTGGGG 2321 CTGGGTGACAGCACCCCGGCTGCGTTCACACCCCAGTGTCACAGGGCGAGCTGTTCTGGAGAGAAAACCATCTGTCGTGG 2401 CTGAGCGGGGAGCTTGAACACCCAGGCCAGGGACACCCCTCCCCAGCTCCCAGAGAGGCCCCCTGAGGGGTGAGCCCTCT 2481 TTCCACCTTCCCCTATCCATGCACCCCCTCGCAATAAAACCAACTCTAAAATCACAGCTGTCGTCCTAGCCAGTGGGGGC 2561 GACCGGACTTGGGGGGTGGAGCCCTCTGGGACTTCCGTAGGAACAAGGGCTGCGGCCCACCGCGACACTTACACAGACCT 2641 CGGGGATTGCACTAAACCCTCGTTCCTAGCTCCGCACTCAGCTTCGCCTGTCCTGCCCGCCCACTTTGCCTTAACTACCC 2721 GCCCGTCCTGGGGGCCACAGCCTCTGCATGGGCCCAGAGCCGGGACCCCCCCAGCCCAGCCCCGCCCTCCCCAGACTCCG 2801 CGCAATCACATACTGTATATAGACGTGAATCGATTTTATTTTTATTCTTTAAATTAAGGTCGTGATAAAGTGTTGCCAAA 2881 GATACCTGCTGAATTCTCGCGTTTCAGGAAACAAACAAACAAAAAAAAATGATATTTGAGGAGGGTCGTGTTGACTCCAT 2961 ATGAAAGGACACAGCTCAAAGCTTTTTTGTTTGGTTGTTTGGGGTTTTTTGTGTTTTCTTTTTTTGGGGTGTTTTTTTTT 3041 TAACTGCCTGGTACAAAAAAAAAAAGAGAAAAAAAAAAAAGAAAAACAATGCGAAATTGTTATTTCCATTCTCATGGTGA 3121 AGTTGCGTGGACGCGTGTGTGCGTGTGTGCAAGAGAGCGGGAGTGAGGTCCAGGCTGGGGTTGGGGGGCTTCAGGCGGGG 3201 GCGCCCGGGGGCCGGGGAGGTGGCCGGGCCGGAGCCCCCGTCTGCAGTGCCCCCCAGCCTGCCGGGCCCAGGAGAGAGAG 3281 AGAAGCATCTTTGCTACTAGCTGTTGCTGCTACCTGCCTCTGCCCCCCGACGCCCCCCGCCTTTTGAGATTAAGGAAAAA 3361 AAAAAAAAGTCAAAAAAGTTTTTAAAAATGAAAAAAAAAAATTATAAACCAGTGAATGTAAAATGCCGGAGCAGGCCCGG 3441 CCTGGCATGGGTGTGGACCTGCAGCCAGGCAGGCTCGAGCGGGCGATACCAAAGTCTGCCCCCCCACCATTGTGGCCATG 3521 CAGTCCTGTCACTGTCTTTTTGCTTCCTTCCGAGGGGGGTCCCCCAGCCTCTTCCAGGGTCTTCCCCTGGAAGTGGGCGG 3601 CTGCAGGGAAGGTGGGGGACAGGGGTCTTTGCACGATTCAGACCCCGGGGCCGTGGCAGGAGCGGTCACCTCACAGGTGG 3681 TGACACTGAGGCAGGGGCCTCGGGGTGCCCCCTCCCGCCCGGCAACCAGAATGGTTGGAGGCAAGACAGAGAGAATGAAA 3761 GGAAAAACAGAAGAAAAAAAAATATTAAAAACCAACAAAAAAAGCAAAAATCCTATTTTTTGAGAAAGAAAGATATTTAT 3841 ATTTGCAGTTTTATTTTAAAAAGTTATTTAAGTTGAAGCAGCCTTCCTGGAGGTGGGGGGGGGGGGGTGGTGGGTGGCTG 3921 GCGCAGGACGGGTCAGGGGCCTGGAGGCTGGGGGTGCCCCAGGAGCTACAACCTCAGAGTTAAGACTAGCTCGCATTAAA 4001 TACATAGATTTACGGGGGGGGGGGGGGGGGGCCGGGCCCAGGGGGTGGAGGGGGCCAGGGAGACCCCCATCCCTCGCCGG 4081 GGCTGCCTGGAGGCTGTGGACCAGGATCCGATGCCCAGGTCCCGCCCCCCACCCCACCCCAGGCCCAGAATCGAGGTGCC 4161 TTGGACTTTGGAGGGGCCAGGCCTGGTGAATGGGGGGCGGGGCGGCGCCCTCAGGGTACAGAGCACAGACAGATAGACAT 4241 TCCAGAGACTGTATTGAGAGTCTTTATAAAGTGTGGGAGATTTAAAAAAAAAAAAAACTGATAAAAATGCACTTTTTGGG 4321 AGTGGGGAGGGAGAAGCTTTAAAAGTAATAAAAAACAAACAAAAACACAAAAGATGAAAAAACAAAAAAATTCATTTTTC 4401 TTGTACATAAAAAAAAAAAAAGAACCACTAAACGCAGCCTGTTACGAC Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | ||||||||||
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miRNA:Target | ---- | |||||||||
Validation Method |
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Conditions | TZM-bl | |||||||||
Location of target site | 3'UTR | |||||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | |||||||||
Original Description (Extracted from the article) |
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PAR-CLIP data was present in GSM1462574. RNA binding protein: AGO2. Condition:TZM-bl ami BaL
... - Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al., 2013, mBio. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al. - mBio, 2013
UNLABELLED: The question of how HIV-1 interfaces with cellular microRNA (miRNA) biogenesis and effector mechanisms has been highly controversial. Here, we first used deep sequencing of small RNAs present in two different infected cell lines (TZM-bl and C8166) and two types of primary human cells (CD4(+) peripheral blood mononuclear cells [PBMCs] and macrophages) to unequivocally demonstrate that HIV-1 does not encode any viral miRNAs. Perhaps surprisingly, we also observed that infection of T cells by HIV-1 has only a modest effect on the expression of cellular miRNAs at early times after infection. Comprehensive analysis of miRNA binding to the HIV-1 genome using the photoactivatable ribonucleoside-induced cross-linking and immunoprecipitation (PAR-CLIP) technique revealed several binding sites for cellular miRNAs, a subset of which were shown to be capable of mediating miRNA-mediated repression of gene expression. However, the main finding from this analysis is that HIV-1 transcripts are largely refractory to miRNA binding, most probably due to extensive viral RNA secondary structure. Together, these data demonstrate that HIV-1 neither encodes viral miRNAs nor strongly influences cellular miRNA expression, at least early after infection, and imply that HIV-1 transcripts have evolved to avoid inhibition by preexisting cellular miRNAs by adopting extensive RNA secondary structures that occlude most potential miRNA binding sites. IMPORTANCE: MicroRNAs (miRNAs) are a ubiquitous class of small regulatory RNAs that serve as posttranscriptional regulators of gene expression. Previous work has suggested that HIV-1 might subvert the function of the cellular miRNA machinery by expressing viral miRNAs or by dramatically altering the level of cellular miRNA expression. Using very sensitive approaches, we now demonstrate that neither of these ideas is in fact correct. Moreover, HIV-1 transcripts appear to largely avoid regulation by cellular miRNAs by adopting an extensive RNA secondary structure that occludes the ability of cellular miRNAs to interact with viral mRNAs. Together, these data suggest that HIV-1, rather than seeking to control miRNA function in infected cells, has instead evolved a mechanism to become largely invisible to cellular miRNA effector mechanisms.
LinkOut: [PMID: 23592263]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1462574 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | TZM-bl / TZM-bl ami BaL |
Location of target site | ENST00000322357.4 | 3UTR | CCCCCUCCAAAUGUCUCAGGAUCCCCCCUCUCCCCUGGGGCUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23592263 / GSE59944 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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172 hsa-miR-500b-3p Target Genes:
Functional analysis:
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Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT059905 | HDGF | heparin binding growth factor | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT235394 | KDELR1 | KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 1 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT442246 | PYGO1 | pygopus family PHD finger 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT443591 | ZNF439 | zinc finger protein 439 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT453280 | EFTUD2 | elongation factor Tu GTP binding domain containing 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT463540 | ZBTB7A | zinc finger and BTB domain containing 7A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT465589 | TNRC6B | trinucleotide repeat containing 6B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT469462 | REL | REL proto-oncogene, NF-kB subunit | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT485449 | KCTD15 | potassium channel tetramerization domain containing 15 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT486682 | WDR81 | WD repeat domain 81 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT489078 | POLM | DNA polymerase mu | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT493734 | GREM2 | gremlin 2, DAN family BMP antagonist | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT494872 | DYNLL2 | dynein light chain LC8-type 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT496130 | RNF103-CHMP3 | RNF103-CHMP3 readthrough | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT496489 | CHMP3 | charged multivesicular body protein 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT496924 | CLMN | calmin | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT497297 | TMEM119 | transmembrane protein 119 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT499103 | AGRN | agrin | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT508979 | CXorf38 | chromosome X open reading frame 38 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT509911 | NIPAL1 | NIPA like domain containing 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT512820 | ARRDC2 | arrestin domain containing 2 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT512827 | KBTBD6 | kelch repeat and BTB domain containing 6 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT515360 | MRPL52 | mitochondrial ribosomal protein L52 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT516610 | TRIM58 | tripartite motif containing 58 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT517053 | TLDC1 | TBC/LysM-associated domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT517637 | ZNF491 | zinc finger protein 491 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT518270 | LEAP2 | liver enriched antimicrobial peptide 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT518625 | STAR | steroidogenic acute regulatory protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT518887 | N4BP2L2 | NEDD4 binding protein 2 like 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT519026 | PAICS | phosphoribosylaminoimidazole carboxylase and phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT520365 | UBE2G2 | ubiquitin conjugating enzyme E2 G2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT521106 | SLC1A5 | solute carrier family 1 member 5 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT521943 | PHC3 | polyhomeotic homolog 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT522253 | NPEPPS | aminopeptidase puromycin sensitive | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT522853 | KIAA1551 | KIAA1551 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT522868 | KIAA1549 | KIAA1549 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT524207 | DDX19B | DEAD-box helicase 19B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT526004 | ARHGAP27 | Rho GTPase activating protein 27 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT527769 | RRAD | RRAD, Ras related glycolysis inhibitor and calcium channel regulator | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT527827 | TMEM74B | transmembrane protein 74B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT527861 | SMOC1 | SPARC related modular calcium binding 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT528040 | WT1 | Wilms tumor 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT529802 | ZDHHC8 | zinc finger DHHC-type containing 8 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT531723 | TARS | threonyl-tRNA synthetase | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT531996 | BARD1 | BRCA1 associated RING domain 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT533338 | UNC119B | unc-119 lipid binding chaperone B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT533621 | TNFRSF13C | TNF receptor superfamily member 13C | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT533652 | TMOD2 | tropomodulin 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT534397 | SENP3 | SUMO1/sentrin/SMT3 specific peptidase 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT538686 | CCDC80 | coiled-coil domain containing 80 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT540444 | RBM43 | RNA binding motif protein 43 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT542586 | ZC3H12C | zinc finger CCCH-type containing 12C | ![]() |
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2 | 8 | ||||||
MIRT542796 | PLEKHA3 | pleckstrin homology domain containing A3 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT542991 | ERC1 | ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT544424 | ZNF460 | zinc finger protein 460 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT545740 | ESF1 | ESF1 nucleolar pre-rRNA processing protein homolog | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT552618 | ZBTB8A | zinc finger and BTB domain containing 8A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT554456 | SAMD8 | sterile alpha motif domain containing 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT569663 | PRIM1 | DNA primase subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT569924 | PCSK9 | proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT570140 | IL1RL2 | interleukin 1 receptor like 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT573558 | TMEM120B | transmembrane protein 120B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT574282 | OPRD1 | opioid receptor delta 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT575335 | Fbxo6 | F-box protein 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT607057 | IDS | iduronate 2-sulfatase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT607078 | POM121L7 | POM121 transmembrane nucleoporin like 7 pseudogene | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT607500 | HEBP2 | heme binding protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT607530 | ABL2 | ABL proto-oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT607808 | RHBDL2 | rhomboid like 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT608079 | ZFP14 | ZFP14 zinc finger protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT609119 | NUDT3 | nudix hydrolase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT609745 | PTCH1 | patched 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT612904 | HIF1AN | hypoxia inducible factor 1 alpha subunit inhibitor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT618720 | PCSK2 | proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT618778 | HLA-E | major histocompatibility complex, class I, E | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT619015 | SLC2A6 | solute carrier family 2 member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT623223 | MSANTD4 | Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT623819 | GEMIN6 | gem nuclear organelle associated protein 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT625704 | OPTN | optineurin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT626437 | CHDH | choline dehydrogenase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT628087 | KAT7 | lysine acetyltransferase 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT628936 | APOB | apolipoprotein B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT633543 | PGBD5 | piggyBac transposable element derived 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT634348 | SGOL1 | shugoshin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT634611 | KIAA1919 | major facilitator superfamily domain containing 4B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT635243 | QPRT | quinolinate phosphoribosyltransferase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT636681 | BTLA | B and T lymphocyte associated | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT636923 | ZNF845 | zinc finger protein 845 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT637606 | ZNF554 | zinc finger protein 554 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT639242 | RANGAP1 | Ran GTPase activating protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT640835 | POLR3A | RNA polymerase III subunit A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT642098 | FBXL2 | F-box and leucine rich repeat protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT643087 | PTPLAD2 | 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT643934 | C17orf104 | meiosis specific with coiled-coil domain | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT644353 | FXN | frataxin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645628 | SF3A3 | splicing factor 3a subunit 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645754 | FAM213A | family with sequence similarity 213 member A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT646329 | MVB12B | multivesicular body subunit 12B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT646817 | COX19 | COX19, cytochrome c oxidase assembly factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT647019 | ADCY2 | adenylate cyclase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT647621 | IGSF9B | immunoglobulin superfamily member 9B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648517 | PIGG | phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class G | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648871 | ABCA6 | ATP binding cassette subfamily A member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT649620 | ITPKC | inositol-trisphosphate 3-kinase C | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT650062 | CCDC134 | coiled-coil domain containing 134 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT650734 | TNFSF8 | TNF superfamily member 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652389 | TMEM55A | phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT654352 | RBM27 | RNA binding motif protein 27 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655796 | NOVA2 | NOVA alternative splicing regulator 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657329 | HNRNPK | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657734 | GOSR1 | golgi SNAP receptor complex member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT660613 | ANO6 | anoctamin 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT661243 | ARL17B | ADP ribosylation factor like GTPase 17B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662245 | PGBD4 | piggyBac transposable element derived 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662921 | MED18 | mediator complex subunit 18 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662963 | JPH2 | junctophilin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663347 | ZNF74 | zinc finger protein 74 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663528 | MASTL | microtubule associated serine/threonine kinase like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663547 | CCR6 | C-C motif chemokine receptor 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663977 | ZNF786 | zinc finger protein 786 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT664084 | METTL2B | methyltransferase like 2B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT664358 | C16orf45 | chromosome 16 open reading frame 45 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT664421 | TIGD6 | tigger transposable element derived 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT664476 | ZYG11B | zyg-11 family member B, cell cycle regulator | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT664979 | TDRD1 | tudor domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT665128 | PYCRL | pyrroline-5-carboxylate reductase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT666259 | SLC31A1 | solute carrier family 31 member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT666321 | SLC16A10 | solute carrier family 16 member 10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT666881 | POLQ | DNA polymerase theta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT668469 | FADS6 | fatty acid desaturase 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT669554 | ALG14 | ALG14, UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT669835 | ISCA2 | iron-sulfur cluster assembly 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT670185 | CCDC142 | coiled-coil domain containing 142 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT672020 | PXMP4 | peroxisomal membrane protein 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT672070 | KIAA0930 | KIAA0930 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT672475 | RTTN | rotatin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT672851 | ICOSLG | inducible T-cell costimulator ligand | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT673090 | AK1 | adenylate kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT673581 | KDELC2 | KDEL motif containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT674586 | SLC35B4 | solute carrier family 35 member B4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT675001 | STRN3 | striatin 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT679018 | MTMR10 | myotubularin related protein 10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT679680 | STAT3 | signal transducer and activator of transcription 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT682833 | FLG2 | filaggrin family member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT682886 | SAR1A | secretion associated Ras related GTPase 1A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT683442 | AP3B2 | adaptor related protein complex 3 beta 2 subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT687040 | RNF115 | ring finger protein 115 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT691957 | RHOH | ras homolog family member H | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT694625 | ZFPM1 | zinc finger protein, FOG family member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT695637 | SLC26A2 | solute carrier family 26 member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT697640 | WRN | Werner syndrome RecQ like helicase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT702009 | MIDN | midnolin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT702034 | MOGAT1 | monoacylglycerol O-acyltransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT704789 | CDK6 | cyclin dependent kinase 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT705728 | AMMECR1L | AMMECR1 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT705879 | ADM | adrenomedullin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT706220 | ACOT9 | acyl-CoA thioesterase 9 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT708418 | CERS4 | ceramide synthase 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT709114 | C3orf18 | chromosome 3 open reading frame 18 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT709595 | ITPA | inosine triphosphatase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT710945 | MRPL45 | mitochondrial ribosomal protein L45 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT712345 | NLN | neurolysin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT712530 | CYTH2 | cytohesin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT714019 | ASCC1 | activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT717287 | ARMC12 | armadillo repeat containing 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT717733 | FGF1 | fibroblast growth factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT718083 | CLIC5 | chloride intracellular channel 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT718562 | MUC20 | mucin 20, cell surface associated | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT721639 | MYLK3 | myosin light chain kinase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT722632 | C8A | complement C8 alpha chain | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT723177 | CDCA4 | cell division cycle associated 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT725523 | FAM229B | family with sequence similarity 229 member B | ![]() |
![]() |
2 | 2 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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