pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4753 |
Genomic Coordinates | chr1: 235190034 - 235190116 |
Description | Homo sapiens miR-4753 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4753-5p | |||||||||||||||||||||
Sequence | 10| CAAGGCCAAAGGAAGAGAACAG |31 | |||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | WAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BM-016, DESSH, PRO1741, Wwp4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | WW domain containing adaptor with coiled-coil | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_016628 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_100486 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on WAC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of WAC (miRNA target sites are highlighted) |
>WAC|NM_016628|3'UTR 1 AGATGTGAATAATTGCACATGGTTTTGAGAACAGGAACTGTAAATCTGTTGCCCAATCTTAACATTTTTGAGCTGCATTT 81 AAGTAGACTTTGGACCGTTAAGCTGGGCAAAGGAAATGACAAGGGGACGGGGTCTGTGAGAGTCAATTCAGGGGAAAGAT 161 ACAAGATTGATTTGTAAAACCCTTGAAATGTAGATTTCTTGTAGATGTATCCTTCACGTTGTAAATATGTTTTGTAGAGT 241 GAAGCCATGGGAAGCCATGTGTAACAGAGCTTAGACATCCAAAACTAATCAATGCTGAGGTGGCTAAATACCTAGCCTTT 321 TACATGTAAACCTGTCTGCAAAATTAGCTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGGGGGGGTTAATTTATCATTCAGAA 401 ATCTTGCATTTTCAAAAATTCAGTGCAAGCGCCAGGCGATTTGTGTCTAAGGATACGATTTTGAACCATATGGGCAGTGT 481 ACAAAATATGAAACAACTGTTTCCACACTTGCACCTGATCAAGAGCAGTGCTTCTCCATTTGTTTTGCAGAGAAATGTTT 561 TTCATTTCCCGTGTGTTTCCATTTCCTTCTGAAATTCTGATTTTATCCATTTTTTTAAGGCTCCTCTTTATCTCCTTTCT 641 TAAGGCACTGTTGCTATGGCACTTTTCTATAACCTTTTCATTCCTGTGTACAGTAGCTTAAAATTGCAGTGATTGAGCAT 721 AACCTACTTGTTTGTATAAATTATTGAAATCCATTTGCACCCTGTTAAGAATGGACTTAAAAGTACTGCTGGACAGGCAT 801 GTGTGCTCAAAGTACATTGATTGCTCAAATATAAGGAAATGGCCCAATGAACGTGGTTGTGGGAGGGGAAAGAGGAAACA 881 GAGCTAGTCAGATGTGAATTGTATCTGTTGTAATAAACATGTTAAAACAAACAAAAATTGTTATTTTTCTTTTCCTTCGG 961 TCAGTGCACATTAGCATTTGAACTACCTGGGGATTCTTTATCAGAACTGTTCTTGTTGAATATTTATACTTAATTGAAAT 1041 AATTCCTTAAGGGAGGTTTTGTTTAAAACGTATTAACAGGAAATTGTGTATGAGATATTTAATGAAATAAGAAATTCAAC 1121 AAGAATGATTAAGTCACTTCCCAAGTGGTTGTCATTTGTTAAACCCTGGTTTACCTGTCTTGCTATTATGACATTTCATT 1201 TGGAAGGATGTTTGTGTTGTAGCTAACTGTTCAAGTCTGGTGCTGACTGCTGTTCTTAGCCATCACAAAACGCTAAATTT 1281 GTGTAATTGGAGCTTCCTGCTGTTATCTGGAAATAGCAGGAAAGCGCAGCTTTGTATATTGTTTCCTAAAGTATATTAAA 1361 ATAAAAAAAGAAACTATTGCTACTATAAAATTACCTTGACTTTTTTTTTCCTTTGCTGAAATATTAGTCACATAGCCTTA 1441 GCTTCACACTGCCAGTAATGTATCAAATCACAAGGGTTTCCGCATGAAAAAAATCTTTTCTTCCCCCACAAAAAAACCTT 1521 TACCATCAAAATCTTGCCATCTGATTTAGAAAGGTGTTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTCTTTAAATTGGTTTAGGGTT 1601 TTTTGGTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGTTGGGGCAGATAAGTGCTTCCAAAACTGGCAGCACCAAGGGCTTATTT 1681 TTTATGTTAGACATCAATGTCAATGTTACTACATTCTCGGATGCTAACATAAATTTTGAAATTGCTCTTGTGCTTTAAGC 1761 ATATATTGAAAGTATGGAAGTTAAATGTTCAGGCTTTTCAGTAAGCTCAAAAAGTTAACTGTAAGCGATAGTGTTGGTGT 1841 TTTCTAAAATACAAAAATGTTCCAGTGTAATTAAAAGGAATTAAAATCTTGAAGATATTTTCCTGTAATTTAAGGATACT 1921 TTTTAAATGTAAGAAAAGACATGTCATTAATTTATTGTCATGTTTATACCTCTGTGAGATTGTTAACATCTGCTGAATTT 2001 AACTAGTGCATGTAAATGAAACCCCAAAGAGCTGTGTGTTCAGCTAGAAACCTTACTGTATCTTTCCTGGAAAGAAGTGA 2081 GCAATTTGTTGTAATAGGCAAATGTTTCCTGATCAGATGGCAATTTGTGATTTAGGTAAATTTGAATTTGATTTGCTTAT 2161 AGTCTACTGGTCTGTGTACCTATGTTTTGTTTTTCAAAAAAGTTTACATCCCTAAATGAATTAGTCACATATATTTAGGA 2241 GAAGATGCCTAATTTGGTATTTCTTAATAGTGAATTTTTTTTTTTCTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTG 2321 GAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCACCGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCGGCGTTCCGAGT 2401 AGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCA 2481 GGCTGGTCTTGAACTGCCAACTTCAGGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 2561 GCTCCTGGCCAGTAGTGAATTTTTAAACACAGAAAATCTAAAATTTTGTGGAAATATTTTAAATATTGCACCTTAATACA 2641 AGGTATCCAGCTCCTAACCTTAACTAGGGAATATCTATTAAAATAAGCATAATGTTCTGGACTAGAGTATTCCTTATCTA 2721 GTTGGTTATGGATTTGAACATGTACCTTGGTTTAGATACTTTGAAAATAGAAGTACTGAATAGCCTCTAGGGAACTTGAG 2801 TGGCCTTTCCCTCCCCCTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGTTTTAAAAGATCAGTAGTCTCTATTCAAACTTTTAAAATGT 2881 CGTGGTATTGTAACAATATATTTGATGAAAGAAGGTTACAGACTCCCCTGAAGAACCAGCTTTCCTACGCTTTTTATTTT 2961 TCTAACTTGTCTAACCTGATTTTAAAATGACTGCAATTCCAGACTAAAAACATGCTTCAGCCCTGTTTCAAGACATTATG 3041 CTTCTTTTAACAGTCCAAATTAGTAGTTTTATTTTTCTTCTAAATCTTTGTTTCACACTTGTAAAATCTTGGGAAGGAGG 3121 TTCTTAAAACTTTGCCAGGAATTGTTACCCATTTCCAAAAACAGTTTATTATGTTCAAAAACCACCATATCTTTGAGGGA 3201 CTGTTTGAAAGGGGAGAGGGCAACGCGGGAAATAATTCACTCTGCGCACCGGAACTATTGTAGTTCAGGACTTCCAGCTA 3281 CTGTATTTAGATGTTGGGTTTGAATATACAGATTTCTTTTCAATACCTGTAAATATGGCTATATTCTTGTATTTGTACGG 3361 GAGTGTACAAAATGACACTGAAAAGTAATAAATATGTTTTGACTATATTGTGCAGTTATTTCAGAACTGTGTTTTGAAAG 3441 TCTTAGAATGCATAATTTGCATTTGAGTAAGGAAATTTAAAATACAGATTACTGCTGAGATTTTAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | TZM-bl |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
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PAR-CLIP data was present in GSM1462574. RNA binding protein: AGO2. Condition:TZM-bl ami BaL
... - Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al., 2013, mBio. |
Article |
- Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al. - mBio, 2013
UNLABELLED: The question of how HIV-1 interfaces with cellular microRNA (miRNA) biogenesis and effector mechanisms has been highly controversial. Here, we first used deep sequencing of small RNAs present in two different infected cell lines (TZM-bl and C8166) and two types of primary human cells (CD4(+) peripheral blood mononuclear cells [PBMCs] and macrophages) to unequivocally demonstrate that HIV-1 does not encode any viral miRNAs. Perhaps surprisingly, we also observed that infection of T cells by HIV-1 has only a modest effect on the expression of cellular miRNAs at early times after infection. Comprehensive analysis of miRNA binding to the HIV-1 genome using the photoactivatable ribonucleoside-induced cross-linking and immunoprecipitation (PAR-CLIP) technique revealed several binding sites for cellular miRNAs, a subset of which were shown to be capable of mediating miRNA-mediated repression of gene expression. However, the main finding from this analysis is that HIV-1 transcripts are largely refractory to miRNA binding, most probably due to extensive viral RNA secondary structure. Together, these data demonstrate that HIV-1 neither encodes viral miRNAs nor strongly influences cellular miRNA expression, at least early after infection, and imply that HIV-1 transcripts have evolved to avoid inhibition by preexisting cellular miRNAs by adopting extensive RNA secondary structures that occlude most potential miRNA binding sites. IMPORTANCE: MicroRNAs (miRNAs) are a ubiquitous class of small regulatory RNAs that serve as posttranscriptional regulators of gene expression. Previous work has suggested that HIV-1 might subvert the function of the cellular miRNA machinery by expressing viral miRNAs or by dramatically altering the level of cellular miRNA expression. Using very sensitive approaches, we now demonstrate that neither of these ideas is in fact correct. Moreover, HIV-1 transcripts appear to largely avoid regulation by cellular miRNAs by adopting an extensive RNA secondary structure that occludes the ability of cellular miRNAs to interact with viral mRNAs. Together, these data suggest that HIV-1, rather than seeking to control miRNA function in infected cells, has instead evolved a mechanism to become largely invisible to cellular miRNA effector mechanisms.
LinkOut: [PMID: 23592263]
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Experimental Support 2 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | HCT116 |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
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PAR-CLIP data was present in ERX177600. RNA binding protein: AGO2. Condition:p53_V_Ago_CLIP_2_2
PAR-CLIP data was present in ERX177624. RNA binding protein: AGO2. Condition:p53_V_AGO_CLIP_4_2
PAR-CLIP data was present in ERX177622. RNA binding protein: AGO2. Condition:KO_V_AGO_CLIP_3_12
... - Krell J; Stebbing J; Carissimi C; Dabrowska et al., 2016, Genome research. |
Article |
- Krell J; Stebbing J; Carissimi C; Dabrowska et al. - Genome research, 2016
DNA damage activates TP53-regulated surveillance mechanisms that are crucial in suppressing tumorigenesis. TP53 orchestrates these responses directly by transcriptionally modulating genes, including microRNAs (miRNAs), and by regulating miRNA biogenesis through interacting with the DROSHA complex. However, whether the association between miRNAs and AGO2 is regulated following DNA damage is not yet known. Here, we show that, following DNA damage, TP53 interacts with AGO2 to induce or reduce AGO2's association of a subset of miRNAs, including multiple let-7 family members. Furthermore, we show that specific mutations in TP53 decrease rather than increase the association of let-7 family miRNAs, reducing their activity without preventing TP53 from interacting with AGO2. This is consistent with the oncogenic properties of these mutants. Using AGO2 RIP-seq and PAR-CLIP-seq, we show that the DNA damage-induced increase in binding of let-7 family members to the RISC complex is functional. We unambiguously determine the global miRNA-mRNA interaction networks involved in the DNA damage response, validating them through the identification of miRNA-target chimeras formed by endogenous ligation reactions. We find that the target complementary region of the let-7 seed tends to have highly fixed positions and more variable ones. Additionally, we observe that miRNAs, whose cellular abundance or differential association with AGO2 is regulated by TP53, are involved in an intricate network of regulatory feedback and feedforward circuits. TP53-mediated regulation of AGO2-miRNA interaction represents a new mechanism of miRNA regulation in carcinogenesis.
LinkOut: [PMID: 26701625]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1462574 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | TZM-bl / TZM-bl ami BaL |
Location of target site | ENST00000375664.4 | 3UTR | GCCUUUCCCUCCCCCUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23592263 / GSE59944 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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94 hsa-miR-4753-5p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT064916 | ZBTB18 | zinc finger and BTB domain containing 18 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT161166 | SLC25A36 | solute carrier family 25 member 36 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT285542 | CDT1 | chromatin licensing and DNA replication factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT308266 | LRIG1 | leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT311425 | LMNB1 | lamin B1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT373989 | PEBP1 | phosphatidylethanolamine binding protein 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT383141 | CRY2 | cryptochrome circadian clock 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT405243 | ADIPOR2 | adiponectin receptor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441620 | ROCK1 | Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT441789 | SRPK1 | SRSF protein kinase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441804 | NOC3L | NOC3 like DNA replication regulator | 2 | 2 | ||||||||
MIRT441832 | ALG14 | ALG14, UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442005 | NDUFV3 | NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit V3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442411 | LIMD1 | LIM domains containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442708 | UBE4B | ubiquitination factor E4B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442714 | TNRC6B | trinucleotide repeat containing 6B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442738 | SERINC5 | serine incorporator 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442793 | CEP170 | centrosomal protein 170 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442984 | ZNF736 | zinc finger protein 736 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443055 | THRB | thyroid hormone receptor beta | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443288 | ZC3H12A | zinc finger CCCH-type containing 12A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443325 | SLC35G1 | solute carrier family 35 member G1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443331 | OCRL | OCRL, inositol polyphosphate-5-phosphatase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443593 | ZNF439 | zinc finger protein 439 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT443696 | KCNN3 | potassium calcium-activated channel subfamily N member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443748 | ELL2 | elongation factor for RNA polymerase II 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT443866 | HDLBP | high density lipoprotein binding protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT461185 | LTBP2 | latent transforming growth factor beta binding protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT464074 | WAC | WW domain containing adaptor with coiled-coil | 2 | 2 | ||||||||
MIRT468738 | SDC4 | syndecan 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT470540 | COASY | Coenzyme A synthase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT476458 | GBA2 | glucosylceramidase beta 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT479470 | CDK6 | cyclin dependent kinase 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT486351 | TACC2 | transforming acidic coiled-coil containing protein 2 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT495126 | CXorf67 | chromosome X open reading frame 67 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT495166 | CNGA2 | cyclic nucleotide gated channel alpha 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT495432 | ATG7 | autophagy related 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT495922 | FBXO41 | F-box protein 41 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT496572 | DGCR6L | DiGeorge syndrome critical region gene 6 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT498277 | POFUT1 | protein O-fucosyltransferase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT498431 | DDX39A | DExD-box helicase 39A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT530149 | HADHB | hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/3-ketoacyl-CoA thiolase/enoyl-CoA hydratase (trifunctional protein), beta subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT530313 | TNFRSF10D | TNF receptor superfamily member 10d | 2 | 2 | ||||||||
MIRT530880 | TRUB1 | TruB pseudouridine synthase family member 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT531177 | ZNF626 | zinc finger protein 626 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT533395 | TYRP1 | tyrosinase related protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT533709 | TMEM64 | transmembrane protein 64 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT533954 | TAF1D | TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit D | 2 | 2 | ||||||||
MIRT535616 | NSD1 | nuclear receptor binding SET domain protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT539472 | ADARB2 | adenosine deaminase, RNA specific B2 (inactive) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT542878 | NR6A1 | nuclear receptor subfamily 6 group A member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT559077 | C19orf47 | chromosome 19 open reading frame 47 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT559465 | ARPP19 | cAMP regulated phosphoprotein 19 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT561233 | ZNF772 | zinc finger protein 772 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT563477 | POLE3 | DNA polymerase epsilon 3, accessory subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT563995 | SLFN11 | schlafen family member 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT564222 | SDE2 | SDE2 telomere maintenance homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566017 | RHOA | ras homolog family member A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566028 | RFX1 | regulatory factor X1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566591 | NUFIP2 | NUFIP2, FMR1 interacting protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT567874 | CTDSP1 | CTD small phosphatase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT568552 | AKT2 | AKT serine/threonine kinase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT569357 | EFHC1 | EF-hand domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT569973 | DNAAF2 | dynein axonemal assembly factor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT614423 | ZNF440 | zinc finger protein 440 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT628831 | SLC25A34 | solute carrier family 25 member 34 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT630142 | ZFYVE9 | zinc finger FYVE-type containing 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT634479 | PAFAH1B2 | platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT634498 | OR7D2 | olfactory receptor family 7 subfamily D member 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT637394 | R3HDM2 | R3H domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT641840 | TCF7L2 | transcription factor 7 like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT644397 | CDKL1 | cyclin dependent kinase like 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT644888 | C2orf50 | chromosome 2 open reading frame 50 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT647124 | ZNF446 | zinc finger protein 446 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT647420 | SSTR3 | somatostatin receptor 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT650297 | PYCARD | PYD and CARD domain containing | 2 | 2 | ||||||||
MIRT655488 | PAK3 | p21 (RAC1) activated kinase 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT658185 | FBXO9 | F-box protein 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT660931 | ADAM19 | ADAM metallopeptidase domain 19 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT665317 | ZBTB3 | zinc finger and BTB domain containing 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT670350 | C1orf106 | chromosome 1 open reading frame 106 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT670823 | NICN1 | nicolin 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT671825 | TRPM6 | transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT672732 | NETO2 | neuropilin and tolloid like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT674841 | GLRX2 | glutaredoxin 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT675930 | CYP51A1 | cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT686786 | AZF1 | azoospermia factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT697723 | USP8 | ubiquitin specific peptidase 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT702357 | KLHL26 | kelch like family member 26 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT704361 | DBR1 | debranching RNA lariats 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT709242 | RANGAP1 | Ran GTPase activating protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT714433 | SNED1 | sushi, nidogen and EGF like domains 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT717000 | ARL6IP4 | ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT720875 | ADCY5 | adenylate cyclase 5 | 2 | 2 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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