pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4699 |
Genomic Coordinates | chr12: 81158388 - 81158461 |
Description | Homo sapiens miR-4699 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4699-3p | |||||||||||||||
Sequence | 46| AAUUUACUCUGCAAUCUUCUCC |67 | |||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||
Experiments | Illumina | DRVs in miRNA |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | SKI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SGS, SKV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | SKI proto-oncogene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_003036 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on SKI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of SKI (miRNA target sites are highlighted) |
>SKI|NM_003036|3'UTR 1 ATTCCGTGCCTGCCGCCGCAGCGCCGCCGACAACGCGGGTGCAGGGGGGCGCGGCTGGGCGGTGCAGCTCCGCCCGGCTC 81 CGCCCCTGCAGCCCACACAGCACAACGTCTTACCGTGCCTATTACCAAGCGAGTGTTTGTAACCATGTAGTTTTGGAACC 161 CACTGCAAAATTTTCTACTGGCCAAGTTCAAGTGAGTAAGCCGCGTCCCCCAACTACAGCTGGAGACGGGGCCAGCTCGG 241 CGGCCTGCTGGTCCTCTGCTTGCTGGAACATTCTAACATTTACACTTTTGTTATAAGCTATTTAAAACCAGTAAGGAGAC 321 TTGAAATTCAGAAAATCAACACATTTTTAAATGACTAACTTCTAAAAGCCCCAACACATGACGCCATCTGAAGACCCGCA 401 ACGGAGTGGGGGTGGCGGCCGCCCCACCCTCCCCACCCGGGGAAGCCATCACAGCTCATCTGCCCGCGGCTGCGTGAGGA 481 CAGCAGGGGTTTTTCTTCAGAGTCTATTTTTTCAGCGACAAGGACCCAGGTCTTCCTGCTGCTGCCAGGGAGAGCAGGGA 561 CAGTGCCGCGTGCGAGATGAGCTCGAACACTGCCCGCCTTACTGCCGCCTACCCCGCCCGCCACGCCGCCGTCGATGCCA 641 GCGCTGTCCCCACGGGTACCAGGAAGTGCAGAGCCGCACAGGAGCTGCCCCGGAGCTGAGGGGACGGTCTTCGGCTCCTC 721 TGCACCCCGTGATTCTGCCCACGCTCCTCCACCACGAGGCACTGACCTGCGTCGGGTGGTGACCGTGGCTGGCGGTCACG 801 CCCTCAGCCCCTCCGGGCACACGTGCCGCCTGACCGGGCGACCCTTTTCAGTTCGGCAAACGTCGCTCCCTTCATTTTGG 881 GACTGAGGCTGCAGCATTGGAACAAAAGAGCATTATTTCAATTTTTCTTTCTTTTTTTTTGTTCGTTCATTTAAACGTAT 961 ATTTAGAACTGCACTTTGTCCACAACCTTCCCTTCTCTTTCTATTCCCCAGTGAACTGAGGTTTTTACCGATTTATAGAG 1041 CAGTCAAATCCGAAGTGCTCGAGTGCTTAGAAACCCCCTCTGGTGCTTGGTTGAACAAGGGAATCACAAGAAAACGAAAA 1121 TGCAAAAACTGAACTTCGGGGGTCGTTCTGTGCCTTCCAGCATCTTGTACAGCAAATCCTGACTCGTGTCTTTTTACCCC 1201 CAAGATATCTGTCTTCAGTAGCGACTGAATCTGCCACTCTCAGAATAAGTTCCTTGCATTTATTCCAAATAATCTCGTTT 1281 ACTCTCACCTGTTTATGCAAATTGTATAAGGTTTCTTATGCCCAAGCTTGAAAAATGATTTCCCAGTAGACAAGAGGCGG 1361 CTACCTATCCTACAGTTACGGTATTTATTTACATAAGAAGATCTTACAGGAGTTCTTTGCTTGAATCCGTTCTAACACCC 1441 GCGGCAGCTGCACGCGCTCACAGAAGGTGGAGGTTACTTGCCCAGGTACAGACGACCTCGGGGCAGTGACGAGCAAAGAC 1521 CAGAGACTGCTGAGCCCTCGCATCTGGGTGGCGGAATTGCCTGCGGGGTTTTGCCCTTGGTTTACTGAGGGGGGTCTTGG 1601 TTGCTGCTGAAGCCCCCCACCCCTTCTAAAGTGCAATGCAAAAGGGACATCATGTATATGCAGCGTTTGTTTGGAATTTT 1681 CTTTGCTTTTGTTTTCTTTGCGGTTGTTCTGTGTGCATGGATTCCACACCTCTGCCGTAGGTAGATCCGTCAGCGGGCAT 1761 TATTACCGTGTCTTGTAAAGGGTCGGTTTTGTTATGCAACATGCAGAATGCTGTTTTTAGCCTTGTTTTACCAGAGTTGT 1841 TTTTTTTTTCAGTTATTTCTTCAAGGGAAACTAAATGATTTAGTTGGAGCAAAGCTTTAAGTGTGTTGGCGTGCTTCTGT 1921 GTGGCTGTCCTGTGTCGCCAGGTCGAAGATCACAGTGAGGTAGAGGCCCTGCCCCATCCCCAGGGCCGCCAGGCTTGCTC 2001 CGTTTGCTTTGAGTTTTTAGACCCCAGAGGGAGATGAGCTTTTCCAAGCTGTGTCTGGGCCAGAGCCTCTCCTTGCCCTT 2081 GCTCCATCCCGACGGTCACCGTTGGGTCCACGCCTCCACCGCCCCATCTTGCCCCAAACGGAAAGCGCTGTATCTGCAGT 2161 GGCAGCCCTTCCCCACTTCGGCTCTGGGAGGGTCCAGCCAGTGTCACCTGGGCCCACCCTTTCCTGCAGCTGCCAGGCCC 2241 GTGCGGTCAGTGGGACCCGGACGTGGGCAGGCGAGCTCGGGACCCTCCCAGGCAGTTCCCACAGCTCTTGCCTCGGCTCA 2321 CCAGGGTCACTTCCACTGTCAGGGGCCTGAGGGGGCAGCTGTGGCTGCAGGGCTGCTCTGGACTGAGGGGTCCCAGGCCC 2401 CGAGGGGTGCACGCCTGGCTCCCCTTGGCACAGGTGCGAGTCCGTTTCTTTTCAGCAGAAGGGGGAAGAGGTGTCCGCTG 2481 TGTGGGCTGCTGACTCCTCTGTGTGTGAGGCCCTTCATCTAAGTGATTGTGTATTCAGTTTAATTCTCATTATATTTCTA 2561 TACTGAAAGAAGATTTTTAACGAAGGGAAAAACAACAGCAATAACATTCATATCTCTGGAGCAGCTAACTCATACACGTA 2641 ATGTCTGCTTTTCGTACAGAACTAGCCAATGTAAAAACAGTTCACCTGTAAATACTTTTTCCTTTTTCACCGTTGTATTA 2721 TACATGTATATGCTGGGTCCTTTTTCAGAAACTCTTTTCTTACCTGAGAGTTGTCTTGTTTTCTGGGCTGTTTTTAACTG 2801 AGGAAAAAAAAAATGCTTTCCTGCCGGGGGGCAGGGGAGACGGAGAAACCCATGTGCGTTTCCCATGTGACCCCCTCCTC 2881 CCTGTGGGTCTGAGCCCCGGCCCCCCCCACCTCCTCCTCCCTGTGGGTCCGAACCCCGGCCCCCCCACCCCCTCCTCCCT 2961 GTGGGTCCGAACCCCGGCCCCCCCACCCCCTCCTCCCTGTGGGTCCGATCCCCGGCCCCCCCCACCCCCTCCTCCCTGTG 3041 GGTCCGAACCCCGGCCCCCCCCCCACCCCCTCCTCCCTGTGGGTCCGAACCCCGGCCCCCCCACCCCTCCCTCAGCCCAC 3121 CAGGGTCCAGGGAGATGTTCGTTCTCGCTTTAAGTCAGGAGTCACAAATGACTTTTTTTTTTCAATTAAGGAAAAAGCTC 3201 CATCTCTACCTTTAACATCACCCAGACCCCCGCCCCTGCCCGTGCCCCACGCTGCTGCTAACGACAGTATGATGCTTACT 3281 CTGCTACTCGGAAACTATTTTTATGTAATTAATGTATGCTTTCTTGTTTATAAATGCCTGATTTAAAAAGAAAAGAGCTT 3361 GGCATATTTATCTATTTCGCTGTGTACCTGTTAGTCCTTCCCCGACCCCGAAACAGATGACATTGTACAATAAAGGACTT 3441 TGAGAGGA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | TZM-bl |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
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PAR-CLIP data was present in GSM1462574. RNA binding protein: AGO2. Condition:TZM-bl ami BaL
... - Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al., 2013, mBio. |
Article |
- Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al. - mBio, 2013
UNLABELLED: The question of how HIV-1 interfaces with cellular microRNA (miRNA) biogenesis and effector mechanisms has been highly controversial. Here, we first used deep sequencing of small RNAs present in two different infected cell lines (TZM-bl and C8166) and two types of primary human cells (CD4(+) peripheral blood mononuclear cells [PBMCs] and macrophages) to unequivocally demonstrate that HIV-1 does not encode any viral miRNAs. Perhaps surprisingly, we also observed that infection of T cells by HIV-1 has only a modest effect on the expression of cellular miRNAs at early times after infection. Comprehensive analysis of miRNA binding to the HIV-1 genome using the photoactivatable ribonucleoside-induced cross-linking and immunoprecipitation (PAR-CLIP) technique revealed several binding sites for cellular miRNAs, a subset of which were shown to be capable of mediating miRNA-mediated repression of gene expression. However, the main finding from this analysis is that HIV-1 transcripts are largely refractory to miRNA binding, most probably due to extensive viral RNA secondary structure. Together, these data demonstrate that HIV-1 neither encodes viral miRNAs nor strongly influences cellular miRNA expression, at least early after infection, and imply that HIV-1 transcripts have evolved to avoid inhibition by preexisting cellular miRNAs by adopting extensive RNA secondary structures that occlude most potential miRNA binding sites. IMPORTANCE: MicroRNAs (miRNAs) are a ubiquitous class of small regulatory RNAs that serve as posttranscriptional regulators of gene expression. Previous work has suggested that HIV-1 might subvert the function of the cellular miRNA machinery by expressing viral miRNAs or by dramatically altering the level of cellular miRNA expression. Using very sensitive approaches, we now demonstrate that neither of these ideas is in fact correct. Moreover, HIV-1 transcripts appear to largely avoid regulation by cellular miRNAs by adopting an extensive RNA secondary structure that occludes the ability of cellular miRNAs to interact with viral mRNAs. Together, these data suggest that HIV-1, rather than seeking to control miRNA function in infected cells, has instead evolved a mechanism to become largely invisible to cellular miRNA effector mechanisms.
LinkOut: [PMID: 23592263]
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Experimental Support 2 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | Prostate Tissue |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
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PAR-CLIP data was present in SRX1760597. RNA binding protein: AGO2. Condition:AGO-CLIP-LNCaP_C
... - Hamilton MP; Rajapakshe KI; Bader DA; Cerne et al., 2016, Neoplasia (New York, N.Y.). |
Article |
- Hamilton MP; Rajapakshe KI; Bader DA; Cerne et al. - Neoplasia (New York, N.Y.), 2016
MicroRNA (miRNA) deregulation in prostate cancer (PCa) contributes to PCa initiation and metastatic progression. To comprehensively define the cancer-associated changes in miRNA targeting and function in commonly studied models of PCa, we performed photoactivatable ribonucleoside-enhanced cross-linking immunoprecipitation of the Argonaute protein in a panel of PCa cell lines modeling different stages of PCa progression. Using this comprehensive catalogue of miRNA targets, we analyzed miRNA targeting on known drivers of PCa and examined tissue-specific and stage-specific pathway targeting by miRNAs. We found that androgen receptor is the most frequently targeted PCa oncogene and that miR-148a targets the largest number of known PCa drivers. Globally, tissue-specific and stage-specific changes in miRNA targeting are driven by homeostatic response to active oncogenic pathways. Our findings indicate that, even in advanced PCa, the miRNA pool adapts to regulate continuing alterations in the cancer genome to balance oncogenic molecular changes. These findings are important because they are the first to globally characterize miRNA changes in PCa and demonstrate how the miRNA target spectrum responds to staged tumorigenesis.
LinkOut: [PMID: 27292025]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM4903829 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Human neurons / CTLTD_shCTL_a |
Location of target site | NM_003036 | 3UTR | AUACUUUUUCCUUUUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161238 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM1462574 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | TZM-bl / TZM-bl ami BaL |
Location of target site | ENST00000378536.4 | 3UTR | UUCACCUGUAAAUACUUUUUCCUUUUUCACCGUUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23592263 / GSE59944 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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88 hsa-miR-4699-3p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT056239 | RAB18 | RAB18, member RAS oncogene family | 2 | 2 | ||||||||
MIRT080536 | PMAIP1 | phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT095600 | NR3C1 | nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT128911 | KMT2A | lysine methyltransferase 2A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT161904 | FXR1 | FMR1 autosomal homolog 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT177614 | UBE2D1 | ubiquitin conjugating enzyme E2 D1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT231364 | EDEM3 | ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT285164 | SERBP1 | SERPINE1 mRNA binding protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT307337 | SEC22C | SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT317083 | DEK | DEK proto-oncogene | 2 | 2 | ||||||||
MIRT347692 | LSM14A | LSM14A, mRNA processing body assembly factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT358438 | STC2 | stanniocalcin 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT362592 | PURB | purine rich element binding protein B | 2 | 4 | ||||||||
MIRT441441 | HAVCR1 | hepatitis A virus cellular receptor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT445264 | LOH12CR2 | loss of heterozygosity, 12, chromosomal region 2 (non-protein coding) | 2 | 4 | ||||||||
MIRT447097 | SNRPD1 | small nuclear ribonucleoprotein D1 polypeptide | 2 | 2 | ||||||||
MIRT449013 | ANKRD17 | ankyrin repeat domain 17 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT450358 | SETD9 | SET domain containing 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT454976 | MYC | MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT461922 | NECAB3 | N-terminal EF-hand calcium binding protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT465191 | TRPS1 | transcriptional repressor GATA binding 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT467685 | SLC38A2 | solute carrier family 38 member 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT468003 | SKI | SKI proto-oncogene | 2 | 2 | ||||||||
MIRT473127 | MLLT10 | MLLT10, histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT476370 | GIGYF1 | GRB10 interacting GYF protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT477067 | FAM208B | family with sequence similarity 208 member B | 2 | 4 | ||||||||
MIRT479950 | CBX4 | chromobox 4 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT481092 | B3GNT2 | UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT481932 | ANKRD11 | ankyrin repeat domain 11 | 2 | 12 | ||||||||
MIRT482239 | AHCY | adenosylhomocysteinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT485804 | ARPP19 | cAMP regulated phosphoprotein 19 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT492026 | TWF1 | twinfilin actin binding protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT494389 | CALM3 | calmodulin 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT504115 | GPR158 | G protein-coupled receptor 158 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT506346 | NUP54 | nucleoporin 54 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT510081 | PPWD1 | peptidylprolyl isomerase domain and WD repeat containing 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT521019 | SLC8A1 | solute carrier family 8 member A1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT524709 | BTBD3 | BTB domain containing 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT524989 | AGO2 | argonaute 2, RISC catalytic component | 2 | 6 | ||||||||
MIRT525003 | ACVR1B | activin A receptor type 1B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT528064 | OLAH | oleoyl-ACP hydrolase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT528865 | C1orf147 | chromosome 1 open reading frame 147 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT532182 | DOCK7 | dedicator of cytokinesis 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT533592 | TOB1 | transducer of ERBB2, 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT538835 | C16orf70 | chromosome 16 open reading frame 70 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT539488 | ACVR1C | activin A receptor type 1C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT539542 | ABCD2 | ATP binding cassette subfamily D member 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT542123 | VENTX | VENT homeobox | 2 | 2 | ||||||||
MIRT542993 | ELOVL5 | ELOVL fatty acid elongase 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT543067 | ATXN7L3B | ataxin 7 like 3B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT543370 | CYB5B | cytochrome b5 type B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT545080 | TSEN34 | tRNA splicing endonuclease subunit 34 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT545258 | TRIM36 | tripartite motif containing 36 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT549144 | BRIX1 | BRX1, biogenesis of ribosomes | 2 | 2 | ||||||||
MIRT549403 | AKAP1 | A-kinase anchoring protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT552143 | MRPL34 | mitochondrial ribosomal protein L34 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT554781 | RHEBP1 | RHEB pseudogene 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT555991 | NFYB | nuclear transcription factor Y subunit beta | 2 | 2 | ||||||||
MIRT556425 | LONRF3 | LON peptidase N-terminal domain and ring finger 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT558325 | DNAJC28 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C28 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT561357 | YWHAH | tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein eta | 2 | 2 | ||||||||
MIRT562240 | HMGB1 | high mobility group box 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT562269 | GOLT1B | golgi transport 1B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT564020 | FAM103A1 | family with sequence similarity 103 member A1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT564832 | ZBTB16 | zinc finger and BTB domain containing 16 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT565350 | TMED2 | transmembrane p24 trafficking protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT565678 | SET | SET nuclear proto-oncogene | 2 | 2 | ||||||||
MIRT576547 | Txlna | taxilin alpha | 2 | 2 | ||||||||
MIRT609358 | ZNF664 | zinc finger protein 664 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT610646 | CTGF | connective tissue growth factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT624681 | ARAP2 | ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT637118 | AGTPBP1 | ATP/GTP binding protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT639955 | PRRC2B | proline rich coiled-coil 2B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT644051 | WWC2 | WW and C2 domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT650463 | SLC35B1 | solute carrier family 35 member B1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT651094 | ZNF516 | zinc finger protein 516 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT655268 | PER2 | period circadian clock 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT657450 | HEYL | hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif-like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT692248 | POLR3F | RNA polymerase III subunit F | 2 | 2 | ||||||||
MIRT695239 | PBK | PDZ binding kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT696024 | NDUFS3 | NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT698486 | TIAL1 | TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT700581 | PRSS22 | protease, serine 22 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT704540 | CNEP1R1 | CTD nuclear envelope phosphatase 1 regulatory subunit 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT704723 | CEP135 | centrosomal protein 135 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT705194 | BTG1 | BTG anti-proliferation factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT710286 | CSNK1G3 | casein kinase 1 gamma 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT719623 | TUBGCP3 | tubulin gamma complex associated protein 3 | 2 | 2 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||
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