Gene Symbol |
NUFIP2
|
Synonyms |
182-FIP, 82-FIP, FIP-82, PIG1 |
Description |
NUFIP2, FMR1 interacting protein 2 |
Transcript |
NM_020772
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on NUFIP2 |
|
3'UTR of NUFIP2 (miRNA target sites are highlighted) |
>NUFIP2|NM_020772|3'UTR
1 AGGACCAGACTGCCTATTCGTAACCTTTCTGCAGCATTAGAGCCATCGTTCATGGGGGACACAAGGCTTTTATGCTCCTA
81 GATCTTCAACGCAGCAGAGGAACCATAAGTAGAATCACAGGATAATATATACAAATATATATATATACATATATATATAT
161 ATAGTTATTTAAAAAAGGCAACTGAAAGTAATTAGACTTCTTAAGGAATCAAATTTATTTCAAGAGACTACACATGGTTA
241 TTTAATCTCCGGTACTGAATAGGTTTTTTTTCTTCTGTTAGTTTTTGTTTTTAAGTGTGAATGCAAGTGATTAATGAATA
321 CAGACTTAACAAGTGTGGTTCTAAAGTTCCTGCTGTCATCAACTTGGGCAACAAATGACCCACTGGAAAGGCAAATCCAC
401 TTAAAAGATCTCTGTATCTTGTTCTGTGACTGAAGTGATACACTAATCACGGGGAACCCAGAATGATTCAACATTTTCCC
481 CCCACTCCTCCCTTGATCTTTTTGGTTTTACTTTAATTAAGCCCTGCGAGAATGCTGGATAAATGCCTTGAAGTTAGCAG
561 GGTGTATTTTTTTAGCGAATATGATTTGCATGTCTTGCCAGGAGTTAAGCGGCCTCTGGGGTGTTGGGGAAATACTTTAT
641 TTCTTTCCATTTATTTTTTGTGGGGCGGGGATAGGGGAGGGCATTGAAGTTCTACAATTCTGGAATAGTTAGTTGATGGT
721 ACATAGTTAACTTGGCTTCGGTTACATATTGGACTTTAACAACTGAAGAATCTATGCGTGTCATTTAAAGAAAAGTTGCA
801 GAACAAGCAATTGGCTTAGATATACAATCTGGAAAAATATTCCTGTGCCCATATTTTAATGTAATTGTATAACTGGGAGC
881 AAAAATATATTCTGCTTTTCAACTGTAGGTGCTCCAGACTTGCTCTCCGTCACTAACACTAAATGTGCTGTTTTCCTTGT
961 TTTTCATCAAACATTTAAGACAAACTTAGACCTTTCTGTAAATTATCTTTTAATTTCTCAGCAAAATCTAAAAGGGGAAG
1041 AAAAAAGTCCATGAAAACTAAAACTTTTCATGTTTTTAGCCAGTGAGAAGATAATAAACCCTGACTGTAGAAGGTGTGTT
1121 TTCATGCAAACTATACTTCTGAGCTTGTTAGCTTCTAATTATATCTTAATAAATATATTTTATTACTAGAGCAAGATGGG
1201 TTTTTAAGGAAAATAATGTGAAATTCTGGAAATTTTCTTTGGGGCAGAGAAGAGCATTAGCCCTGTCTTATCATTACATT
1281 GCCATCCTGTTGCACTGCAGCTTGTGTATAGCATGCTAAAATAAATTTTTGTGTGTGTGTGCAGAAATTAAGGGTCCAAT
1361 TGAGATTGGGTGATGTTAGTAACATAATAACAAGTTGTCTGGCCTGACACAGCATCACATCACACACACAGAAATTAGTA
1441 TATCCATGTATGTCAAATACAGGTTAAAATATCAGGGCATTTATATAAAGAGTTGTAGTCTTCTGATAAAAGTAGACTGG
1521 ATCCCCTGGGGTATTTGGGGAGAAAGTAACTACTTTGGCTCTACCCCTAGAAATGTCCAGTTTTGAGTGACTGTAGTATG
1601 GATGGGTTTTCTTGTTTTGTTGATTATTTGAGGCTTTTAAAACAAGTAGTTCATGAAAGAAGCTGTTGGACTCAACATAG
1681 AGTAGAGTAACTATCTTTTTAGTCTGGATTTCTGCCCTGCTTAGATTTTAAAAGTATAAGCATGGATTGCCAATTCCACT
1761 TGATGTAAACAAAACTTTTTTTTATACATAATATATATATATATATATAAAATAACTTATTGTATCAGTCCAGGTTCAGA
1841 AACTTGTGGTAGGCCAGTTCCAGATAGTTTCATTTCACCTGTAAACTGTATCACTTTGACTGATATTGTAATTTTCAAAT
1921 GTATAATATGTTTACAGATGTGCCCTGCATTTAGTCTGCCTTGTTCCTATTTTGATTTTTGTTGAGTCTCCTGCCTGCTT
2001 GCCAAAAGCTAGGATGCTTCAGGCCCATGTACAATTGAAAGCAGAGGCATCCTTGAGCTTTAAAGCATTGAACAAACTGG
2081 AAAATGCAACATACCACATAACTGAAGTGAAAAAAGTCTGTGTTTTTGTGTTTTTTTAAATAAAAATTTTCAAAAAGTTA
2161 AAAAAAAAGACATATAAGGTTGATTAAAGGGAAAAAAGGCTCCAGTTTGTTTTACAGGTTTTAAAGTTCTGCTGTGTGTT
2241 CAATTGCCTTGTGTAACCACTTGTCGCCTTAGGGCCAGATTCCCCTCTCTAGTCCCCTTTTTTAAATGTCCATTTTGCTT
2321 GCCTGGAATTTTAAAGTTCTTCCGTCTCACAACTCACAAGAAACTTTCTGGGTTTGTGACATACAGAGGTTGAATTGAGT
2401 ATATATTTGAAAAGGAAAAAACAAAAAACAAACCCAGACCCCACCTGAATTGGGCTTTTTAACTTAGAAGCAACACTTGA
2481 TTAAACATCTTTAGAAAGCTATTGCTTTTCTAATTTCCTTCCATATCCCTCAGGCCTCAGTGTTCAGAGAAGCCAAAAAG
2561 AATGTATCACTTCTCTGTCTGTCCAAAGGTTTTTGAGAGTCTCACTTCTAAATGAAACAATGCAACATTTCACTTTGATT
2641 TCTCCACTGAAATTTCCTTGATTATATGGTTAGAGGTATGTAGTTAGGAATGTCTGTTAACTTTCTGAGAACCCTAGTGC
2721 CCCATCATATTAACTGTCAGTATTTTGGGGGCATTAGGTTAATAGACTTAATTGCCTAGGTACAAGCAGGACTTTGGGAC
2801 AAATCTCTTTGTGCTGTTTGGTAACACTTAACTCTATTTGTTGCAATCTTTCTCCTTAGGTCCTCACACAATTCCTTACA
2881 GAGCACTTATTAAAAAAAAATCTTAAGAGTTGATCTGTTTTCTGATTATTTTGTGTAAGCTTCTAAACAAACTTCAGCTG
2961 TGATTAATTTAGCACATTTAAATAACGTGTTATTGTTTGGTATAAAGAATTTTCCTTCAACTCAGAGTATTAGTACTGTA
3041 GCATAAACCAAATACAGTCTAGAGGGGATTTTTAACATCCCTCCATTATAAAGACTGAAAAAGGGGTGTGTGTGTGTGTG
3121 TGTGTTTATGTATGTATGTATGTGTGTGTGAGGAAAAGATGGAGATATTAAAAATTAGTAAATGAATGTGTATAAGACAT
3201 TAGTATTCAGAGAATGAACTTGTATTTATTTTGTGCCATTTGTTTTCATTACACAGAAAAAAGTCAGGTGGTTTAAATCC
3281 TTAAAAGGGTAGTATTGAAAAATGGCACTAAGAATGAAATTATGACCTATTTTTTTAATAGCTATGAAGATACTAATTAT
3361 GGGTGAAGATTTCTTTTTAAATCTGTTTTGATTATTGTAGGCTTCTGTGTCACATACCACTCTTGTAGGTGTCCTCAATA
3441 ATCCCCTTTTCCCACAAAATACACAGGGTGTATTATCTTTCTCTTTATTCACCCCCACTTTGCTGAACTGAAGTTAATTA
3521 CATAGCCTTTCTTCTAACCTCCTTAGTAATGAACCTTCACATAAAGTGTATTTACAGCGTCTGTGGTAGCCAGCCCTTCC
3601 TCCTCTACTTTCTAGGAGGGGATAGCCAATAACTAGGAATTTAATGACAGATTTTTTTTTCTTTGAAATAAATGGCCAGA
3681 GTTTCTCCATTTTAGAATTTTGTTGTCCTCCTTAATCATCTGCTTACCTAGTCATTACTCAATCTGCAGAAACTTCATAA
3761 AGGAAAAGTGCTGCATTGTTTTTACAAATAACAGTTTGTAGGGAAAATATGACAAACCTCAACTATGGGAGTTGTCCACA
3841 ATACAAAATTTTGAAAAAACATTACATAGTGATAATATCATACTTGGTTGTTAGGCTTGTTGCTTCCCCACATCAGAGGC
3921 ATCTAATGATTTATCTTTTGTAATTGCTGTGAACTTTTTTAAATAAGCCATTTAGTGTGAAATTGTCATGTATCAAATGG
4001 CTATTGGAAATGGACTTTACTCAATTTTAATTCCACTGTAAATAAGGACGGAGTCATTCCTACAAGGCTCTCTTCAGAGA
4081 AATAGATTAAAAGTCCAATTTCCAGGTATTATTAGTATAGTTATGCCGCTGGGCCACATCCTCAACAACAGCTGATCCCT
4161 CTTGTATAAATATGTTAACTGTGCAGAACAGTTATGTTATGGGACAAATATAATGGTCATTATGGTCAGATTGGTTGATG
4241 CCACACCAGTCAAGGTAGAGTCTGATAGGGCAGTATCTTAATAACCCTACCCATGACTTAACTGTTGGATTTGAAAGGAA
4321 AACGTAGGATTTGCTCTTGTCCCCTTACCCGCCACAAAATTTTGATAATTTGTTTAAAAGGGAGAGGCAGAGGAAAAGAC
4401 TAGAAGCATAAATAGCTGCTTTAGGTTTGCCAGAGGCACATAGCTTAACATTAGTTCTTAATATCGATGTTATTTTTACT
4481 AATGTAATTAATCAACAGAGCACCAAGATTCTTTCATGGTGAAAAGGGTGGGCTTCTGTTTTGGTATCTTAAAATGTTTC
4561 TTTTAAAATATACATCACCTGTGTGAGAACCAGGACCACCTGGGAGAGTGATGAATCATTGGCTCCACTCAAAAGCATTG
4641 CTTTACTGAGTTTTAAATTTCACACTGTTTTGCCGCTCAAGAAAGGTCTTAAAGTAGTTAAAGGATGCCAGCAATAGTGC
4721 GAATAGAATTTTCGGTTGTCTGCATAATAAAAACACCCATTGCAGCATGATTGGTATGTTGCTCTTGCATTATTGGGAAT
4801 GGTAAATCAGTTATGGGCTAGAAACTATGGAATGGCCGTCCTCATATGTGATGGGATTGCTGATTCAGACTTCCCTATTT
4881 TCCATACAATTTTGTTATGTGCAGAGTTCTAAAGCCATTTTATAATACTGCAGTATCCCCCCCCCCCCCACCTTTTTTTT
4961 TTTGAGACGGACTGTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCTGGTTC
5041 AAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTCCCATGTAGCTGGGATTACGGGCGCACACCACCACACCTGGCTAATTTGTATTCTTA
5121 GTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGACCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCA
5201 AAGTGCTGGAATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCAAGTATCTCTTTTCTACAGCCTTATTAAACTAACTACAAAC
5281 ATTTATTTTCCAATTTAGTTTTACTTTCAGTGCATATCAAAGTTGTTGTACTCTTCAGACCAACAAATTAACTTGAGGGC
5361 AAATTACATAGCTTTCCATGTACCCTTTTTTCCTCAGGTGCTAATCAAAGGCTCTGAAAATGGATACTGCTTTAGTGATG
5441 TCTGCTTTATTCTTAAAATGCTTATTTCTTTTGCTAGATGTAAAGATTTGGTGTTAACAAAAGTGGTTTTAATATGTAAA
5521 TATGAATGAATGCCTTTAGTTTACCCTGTTTGTCTATTATTAATCTGTTTTCATTTATCCTTCATAGAGGAGGATCCTTT
5601 CATGATCTTGAATACATTTCATTAGATATTGTTGCATTTTAAGAATGAAAATACAACTGTTTTCTGTCTTAGATTAATCC
5681 TGCTGCTATGAGAAACTGAAAATCAAGAATGTGATGCACTTTTTACATTACTATATACCATACATATACCATAGGTTGCT
5761 TTGATACCTTTCCTGTAGCACAGCCACTAACAAGAGTGAATGAATTATAAAATTCTTTTTGGGAGGGAATCAATACAAGT
5841 AACTAATTCTTAGCTGATATTGTCCTATGAAGGACAATAACTTAGGAATATAAGAATTCTGTTAATAGTACACTTTTTGG
5921 CCTTAAATGTCTTCTACTACTGAAAATAGTTTAAATCTTAGCTTTGTTTCTATTATTCCCTCTCTCTGCCTCAGAAAGAG
6001 GAATTGGGAAGAATGGCTTAAAGGACGTGGTGTCATTGATTTGTTGCTGATCTTTTAGAAAACATTTGTCTATGTAAGCT
6081 GGGGACTTATTTTTTGTTTGTATATAGAGGGGAAATAGTGCTGCCCTGAACCAATCAGATTTAGTTTAAATCAAATCAAT
6161 CAAAACTCCAGCTGTTTCTCTTGTCTTTTTACTTAGCAAAGGAAAACTTTAGTGAATGCTACTTGACAAGAAGAAAAGTC
6241 ATTTCTCAAGCACATACCCAAACTTGAAGGTGATTGAACCCAAAATAATGGGTGGGAAACACCAAATGAGGTGGAGGAAT
6321 GAGAAAGATGTGTGGGCCAAAGCTATCTGGTTATATTTTGATGTTGCCAATATCGCAAAGCCAAAATTTTAATTTGCTTA
6401 TTTAATATATTTGTTGGCCAGAGATCTATTTTTATATCAATGTGCCTTGCATGTATATTAAAAAAAAAAAATTGGAAACG
6481 CCATGTAGTAATGCCTGAGATAGTCGATGGTTCTTACCACCTCACTAATTTTTATGCAGTATGAAATGCTCATTCTATTG
6561 CCCAACTGGTGCTCTCTGTTTAAAGTTACAGATCTTGCGAAACTGGAACTATTTTATAAGCTGGGGAAGTGATTTACTTT
6641 TTTTGTTGTATCTTTTTTGTTCTTAGTCTGTTAGTGGCTGTCCTGTAGTGGGAAATAGTAAAAGGATTCTTCACTCCCTT
6721 CTCCCCTCAGCACCTTCTTCAAGTAAACATTTCTTGTGTGCTTTGAAAAAAGTTTCAGCTTGCTGTCTCTTTTAGTGTTT
6801 TAAAGAAGTGTTATACAAAGCATTGTTTGCAAAATATAGGGAGATAATGGAGTCCACTTTAATTTGGAATTCTGTGTGAG
6881 CTATGATCCAAGTTATCAGCTCTTTCCAACTTTAAAAATTTTGTTAAAAGCACCTTGCTTAGAAAATTTTAAATATTTAT
6961 GTCTGCAACAATTGTCTCAAAATAATAAACTGTGCAATTCTTGTCATTAAAAAAAAAAAAGATCTGAATTTTCCCTAATG
7041 TGACTTGTTAGTTTCTCTCTGTATTTCCTGCCAGTGTAAATGTGAAAGCTTTGCTTGCATTACGTTTTAGAAATGCATTT
7121 TGCACACTCGAATTTTGCCGAAGCTCCGTGAAAAGGTTAGATCTAAGTAGATGAATAAAGCTATGCACATGTTTTGAAAG
7201 TTTAATTTGTGTGTCATTACCAAAAGTGACCGATTTGTCCTTACTACTTTGCTGTTGTTAGCTTTACCATCTTTGGAAAC
7281 TTGGCTCAAAGTTACATAGTTCTGGGCTAGCTCATCAGTGGAACTAGGAGAGAGGAAAACTGGCACCTATTTTAATAAAG
7361 TTCAATTTAAACGAGAGCTTGACTTGTATCTATTAAAGAGCTTTTCTTGAAACAGGGCAGTTTTATCAGCTTTACAAATC
7441 ATTGGATGCTCTTCCTTAGTAATATTTTGGTTTATTTGATCAAATAGAAATGGAAAGTAATTCAAACTGAAAGACCCTTT
7521 TTTGTCATATGGAACTTGGTGACGATTTTTTGTCTTAAAGCTGGTTTAAAGGTAGGATAGGCTTTTACCTTTATTGCTTT
7601 AGCATAAATTTGGTTTACTGAATTGACTGGCTTGAGATTAGAATTATTCAGTTGTTTGTAAGATCAAAGCACTGGTTGTT
7681 TTAAAGATAACGTGTATCTTTTAAAAAATTGCCCAAGCTGATTAGAACAAGTTTAGGAGTTGGGTACATTTGGTTCAAGT
7761 GCTGCAATCTGTATGTACTAAATAGCTTTACTTTGTGTATGTGTACTTATAATGTGTAGATGTACTACTACCCAGGTTTT
7841 GTCAAATCATCTTTTTTAAAGTTTTTTTTTTTTTAATTGGTTCAGGACCTTTGTAGGAGAGGCTAATATGTTTAAGTAGA
7921 AGATATTACTGATAGCATTTTCCCCATGCTCCTACATAAAAAATAAATATTTCCATTTTATAGCTTTTTCAATATACAGA
8001 AGAGGGTTACTTCTTCATCAAGTATATTGTTGCCTTTGAGGACACAGCAAAACCCTTCTATATGTATCTTCATTGATAGT
8081 GGCAGTTAAAAACTAAGTTATCCAGTTAAGACTTAAAAGGTGACCCATATTAATTGCATGGCCTTAAAAGGCAGAAATGC
8161 AGGAGTGTAGCAAGCATCATTTTAGATGGCTATGGTTCCTCTTCCGCATCTGTCAGTAGTTCACTTATGTTCAGTCTTAG
8241 AACCTACTGGAGGAGTGAAGTAATTTCTCTGTCTCGTGCAGAGGCACTAAGGAGCTGAGTTACCTCTTAATCTGGGGGAA
8321 TGGATAATAAGTGGAGTACAGTTATGTTAAAGGATGTTCCCCCCGCTCAAAAAAAAGTTTCAATGTTTGTTTTGCCCAGT
8401 CAAAAATATAGGTCTTTTCTACATATAAGAACAGTCACCAGAAATTTTCCCTTTTGCTAAATGCTTAGGTATTTGCTATA
8481 GCTGTTTCTGATGTCATGGATTCTGAGGAAGTGTCATTTACGTGATGATCTTCCTTTATTGATGTCTTCATCATGTTCAG
8561 TGTTTTAAAAATATAAATTACAAACACTCTACAACCATACCCAGATTTACTTATTTTATCAGAAAAAAAACTTGAGAAAT
8641 TTGTAGATCAAATTGAGAGACAATAAGTGTACATTGTTGAATAAAAAATTTTAAAGTTTCTGAAAAAAAAAAAAAAAAAA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' uacauuaUGACAA--UAGACUUu 5'
|||||| ||:||||
Target 5' tgacttaACTGTTGGATTTGAAa 3'
|
4294 - 4316
|
144.00 |
-10.90 |
2
|
miRNA 3' uacaUUAUGACAAUAGACUUu 5'
|| | | |||||||
Target 5' aaaaAAAAAAG--ATCTGAAt 3'
|
7011 - 7029
|
141.00 |
-6.00 |
3
|
miRNA 3' uaCAUUAUGA---C-AAUAGACUuu 5'
||||||:| | ||||:|||
Target 5' taGTAATATTTTGGTTTATTTGAtc 3'
|
7457 - 7481
|
135.00 |
-8.70 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|