pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4433a |
Genomic Coordinates | chr2: 64340759 - 64340839 |
Description | Homo sapiens miR-4433a stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | |||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4433a-3p | ||||||||||||
Sequence | 51| ACAGGAGUGGGGGUGGGACAU |71 | ||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||
Experiments | Illumina | ||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | IKZF3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AIO, AIOLOS, ZNFN1A3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | IKAROS family zinc finger 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_012481 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_183228 , NM_183229 , NM_183230 , NM_183231 , NM_183232 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on IKZF3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of IKZF3 (miRNA target sites are highlighted) |
>IKZF3|NM_012481|3'UTR 1 ATATCTGGTCTCAGGGATTGCTCCTATGTATTCAGCATCGTTTCTAAAAACCAATGACCTCGCCTAACAGATTGCTCTCA 81 AAACATACTCAGTTCCAAACTTCTTTTCATACCATTTTTAGCTGTGTTCACAGGGGTAGCCAGGGAAACACTGTCTTCCT 161 TCAGAAATTATTCGCAGGTCTAGCATATTATTACTTTTGTGAAACCTTTGTTTTCCCATCAGGGACTTGAATTTTATGGA 241 ATTTAAAAGCCAAAAAGGTATTTGGTCATTATCTTCTACAGCAGTGGAATGAGTGGTCCCGGAGATGTGCTATATGAAAC 321 ATTCTTTCTGAGATATATCAACCACACGTGGAAAAGCCTTTCAGTCATACATGCAAATCCACAAAGAGGAAGAGCTGACC 401 AGCTGACCTTGCTGGGAAGCCTCACCCTTCTGCCCTTCACAGGCTGAAGGGTTAAGATCTAATCTCCCTAATCTAAATGA 481 CAGTCTAAGAGTAAGTAAAAGAACAGCCATAAAATAAGTATCTGTTACGAGTAACTGAAGACCCCATTCTCCAAGCATCA 561 GATCCATTTCCTATCACAACATTTTTAAAAAATGTCATCTGATGGCACTTCTGCTTCTGTCCTTTACCTTCCCATCTCCA 641 GTGAAAAGCTGAGCTGCTTTGGGCTAAACCAGTTGTCTATAGAAGAAAATCTATGCCAGAAGAACTCATGGTTTTAAATA 721 TAGACCATCATCGAAACTCCAGAAATTTATCCACTGTGGATGATGACATCGCTTTCCTTTGGTCAAGGTTGGCAGAGCAA 801 GGGTATAAAGGGGGAAATTGTTTGGCAGCACCAACAGAAAACAAACAAACAAAAAACAGCTACCTAAAACTTCTTGAAAG 881 AGTTCATGGAGAATTGGTGATACAGACCCAAAGCAAATTTGCCAATGATATTTTCCACAAAAAAAGTCCAAAAAGTATGG 961 CTCAGCCTCCCCCTCCCCACAGGAGAGGAATTGGAGATAGATGGCATGTGTGTTTAGATCGGAGTTGAGCTCCGGAATGG 1041 GGTGAGGAGGGACACCTCTATTGAGAGGTTCTCCTTGATCAGGCAGGCTTCGGCCCTTTTTTTCCCATTTAAATGGAACT 1121 GCTGTATTCCATGAAAATTCCTGAAAGTCTGATCACGGTTCTGCAGATGTATAAGTCATCCTTGTCACTCATAATATGTA 1201 CATACTATCAGGAGGAGTGCTGTTATCATGGTAAAATTAGCACTGGAATAGGAGGTCACAAAATGCTGGCTAATTAGCTA 1281 TGTGACTTTGAGAAATCGTTTAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGATCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGT 1361 GCAGTGGTGCAATCATGGCTCAGTGCAGCCTCGACCTCCCCAGGCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCTTGAGTACT 1441 GGGACAACAAGTGCACACCACCATGTCTGGCTACATTTTGTTCTTTTTGTAGAGATAGGGGTCTCACTATGTTGCCCATG 1521 CTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAATCAGCCCGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCAC 1601 ACCCAGCCTTATTTAACTCTTAAAACTCAGTTTCCGGCCAGGCTCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAA 1681 GCCGAGGCAGGCGCATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCCACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAA 1761 TACAAAAATTAGCTGGGCAGTAGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCCGGAGGCTGAGGCAGAAAAATCGCTTAAG 1841 CCTGGGAGGTTGAGGTTGCGGTGAGTGGAGATCACACTACTGCACTCCAGTCTGGGCGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAA 1921 ACAAAACAAAACAAAAACAAACAAACAAAAACAAAAAAAACTCAGTTTCCTCATCCATAAAATAGGAATTAGATTTCAAT 2001 GTTCTCTTAGGTCCCTTCTAGCTTTAATTCATATGTGATTATGCAGTAACCACAAGGTATTTTTTAAACCTCCTAATGTA 2081 TGGATATTAAGCAGAAGAGTATTTATATGAATACATGTTTCACATTCCTTTGGTATGAAAATGGTGTGTTAAGTTTTTCC 2161 TTTAACCACTGAGTTGTGAATGTGAAGAAGGTGGTGGAGAGGAACAAAAAACAGAAAGGTATTTTGATCTTGCCACAAAG 2241 CATACACACAAATTGGCACATGCAGCTGTTTGCCAAAGCCTTCTTTTTTTTTTTACTTTTTAAGAAATTATGTTAGGGAA 2321 AATAAATTCTGCTTCCAGGGACAACTTCATGGAGCCTATTTACAAATTAAGAGTCAGCTTAATTTGTAACATTTCTACCA 2401 GAGCCAAGAATCCCAAATTCCTGGTAGATTAGTGTTTTATTTCTAAGGGGCTTATGCATTCGGCTCCAACTCAACTCGTC 2481 TATGTGCTGCCAGTAATTAAAATGTTCCACCTCAGACTGCACAAATGGCTTATCCTTCTTTGTGGCATGGCGTCTGTCTC 2561 AGGAAAAAAGGTTTTATGAAATTCCATGGCAACAGTCCCAACATGTTTGAGACTTCAGCTAAAGGAATGGATGTATTTTG 2641 GTGTGTAGTCTTCAGTATATCACTGTATTTCCGTAATACTAGACTCCAAGCTATGCCAGATTGCTTATTCCCTTTGTGAA 2721 AGAGGAGTTGCTCATTACGTTCTTGAAATATCGCACATCCTGTTGGTTCTTCAAGGGACAAGAGAAAGAGAATTTGGAAG 2801 CAGGGATTAGTAGAAGAGAAAACGAGGGAAAGGAAGCCTTTCCACCAGATTAGTGTTCAAGTCTTTGCAGAGGAGACCAA 2881 CTTTTTTTGTTTTCTTTTGTTTTGAGACAGTCTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCA 2961 CGGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACC 3041 AAGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCCAGTCTCAAACTCCTGACCTCA 3121 GGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCGCACCCAGCCTGAGACCACCTTTTG 3201 CATCTCAAGATTGTGAAACCAAGGCCCATTCCACCAGCCTGGGGACTCTTTTTATAGATATGATCCTCCTTTTTCCTGTG 3281 ACTAATGAATTTGCTGCATGATTTCTATTCTTCTGAGGTTAGTTTTCTGAGTAAGGTGACCACTCACAAAGGCACTTTCT 3361 TTGTGGCATTCTGAGCCTAGATTGGGGCCCATCAATTCCAGAAAAAATTTATGTGTGGAAACTCTGCATCCTTAAGTCTT 3441 GAAGTTGAACCAGATATGCAGTGGTTACCATCACACAGATAAACGCTGCCTTCTGTACATACCCCTTATGCTGTACTAAT 3521 TAACAAACCCCTTGCCAGGGCTGGGGAGGTGAGGGTGAAGGAGAATCTTAGCAGAAGGGCAGAGTCAGGACTTGCATCTG 3601 CCACTGCTGGGCACTGAAGCCCTGGAGCAGCTTCAGATAGTACCTGTACTTTCTCATGCAGACTCCCTCTGAACAAGAGC 3681 CTTGTAGGCCCCTCTCCTTCATTTCCCACCAGCCTCTTATCAGGCGGGCTTTCCACCATACACCCAGGAGGCCACGGTCT 3761 GAGGAACAACCAAACCCATGCAAAGGGCCGGGCGCGATAGCTCACGCCTGTAATGCCAGCACTTTGGGAGGCTGGGGCAG 3841 GCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCGAGACCTGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATT 3921 AGCCGGGCGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCG 4001 GAGGTTGCGGTGAGCCGAGATGGCACCACTGCACTCCAGCCTCGGCAACAAGAGCGAAACTCTGTCTAAAACAAAAACAA 4081 ACAAACAAACAAAAAAACCCAGGCAAAGTTTCCTTGCAGCCAAGGTGACAGAACTGGGCTGAGGGTGGAAAAGAAACAGA 4161 ACCAGTGCTCCAGGTGTTTTTTAATTTTTTAATTTATTTTTATTTTTTTTGTATATGTATATATATGTATGTATATTTTA 4241 GAGGACCAGGGTCTCACTATGTTGCCTAGGCCAGACTCAAACTCCTGTGCTCAAGCAATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTA 4321 GCTGGGATTACAGGCATGCACAAACAATGCCCAGCTCTCCAAATGTTTTCTGTCACTACCTGAAGTGTTGCATCGGTACT 4401 TCCTACGGAAAGAAAACTAAATAGAAGTGTCTCTCCCGTGAGCCCCCACCACTACCACCAGAAAAAAAAAAGAGAGAAAA 4481 TGAACTCATCAGTCTTTAGTTTCCTCAAGTTATTCTCCCAAAAAGACATTCGCCTTGGCACAGATAAGCCAGCTAATCTT 4561 ATGCTTTATGACCCACTGTGAGCTGTTCCTGACACAGCTTCTGACTTTGTCAGTGACAAAATTTCTCACCTTTTAAATGC 4641 AGTGCTTAACATTTTGTTAGGCCCATACTCAAAATCGGCCAGATATAAAATGACCTCAGATTTTGATCTCCTAGGCTCAA 4721 ACAATCCTCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCACACCACCATGCACAGCTAATTTTTTTTGTATTTTT 4801 CTGCAGAGATGGCGTTTCGCCATACTGCCCAGGCTAGTCTCAAAATCCTGGGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCAGCCTCC 4881 CAAAGTGCTGGAACTACAGGCAAGAGCCACTGCGCCCAGCCACAACCTCAGATTTCTTTGGCAAACAGAAATGTTTAAAA 4961 ACACAAAATTTTGCTCAGGTGAAACACTGTGTTACTATCAAATCTCACATCCACATAAAGTTTTTCTTTTCGGCTTTGTT 5041 TCGTGAGGAACAGACAGAACAAAGTTTTTCCAGGTAGCATCTGTATCACTATTATTCTCCTATTTCCTGTACCACCCCCA 5121 CCTCCCCAAGCCCTACTGAATGTGAGGTTTAGAATGTTTTAAGGAGGGTCAGGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAG 5201 CACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACCTGAGTTTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCTGTC 5281 TCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 5361 TCGCTTGAACCCAGGAGGAGGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACT 5441 CCATCTCGAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGACG 5521 CAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCATTGCAATCCAGCCTGGACAACAGA 5601 GTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGTTTTAAGGAAAAAAATAGTACTGTTACATATAATCCCAGGTGA 5681 TAAGACCACAATGGAAATGTTTAAGTCCTCACTTTAAAGAGTACCCCACTGAGAAGAGGTATGTTGGACTCTAGCAGAGA 5761 TTTGGAAACTCTGGGACACTCAAGATGTGAAAGAGCCTGGCTATCTGAGGACTCAAAGAGTCAGCATCGGGACTTGTGAG 5841 CTCAAGAAGAGAAAAGGGAGTGGTGAAACTTTGTCCTAAAAGTTAGCACCAGGAACAGAAGAAAAAAACCCGATATATAG 5921 TGATACCTCATCTTTTAGAGAATGGGAAGCTATTTTTGTGTTCACACAGAAAGTATAGTTCAAAAAACCTCTATATCCAG 6001 AGTTCAGACAAGGAGAATGATTTGAGATATAAGTGCCGATGAAGGAGGTCAATTTTGATCTGAAACCAGCAGCTGGACCT 6081 GGGCCACCTCAGGAAAAGGACTCTGTTCTCCAAGGCAGCACGACTGAATGGTTCTGAGAATAAGCCAGGGTTCAGGACTC 6161 CTGACCCTTTAGGACCATGGACTCAGAAGAGCCTGAAGGACAATTGTGGGCTTTAAACTTCTGAGAGCTTGTAAAGTAAC 6241 ACAAGACTGTGCCTCTCCCTTGCCCCAGCTGTAGATAGTCTTTGCCCCACCATTGTTATGAAGATACACAGGGTTTTGCA 6321 GTTTGAATAAATTGGATACAAGTTTCCTCTTTTTTTTTTTCTTTTTGAGACAAAGTCTCGCTCTGTTTCCCCAGGCTGAG 6401 TGCAGTGGCACAATCAAGGCTTACTTGCCGCCTCAACCTCCTGGGCTCAAGCAACGAGCCATCCTCCCGTCTTAGCCTCC 6481 CAACTAGCTGAGACTACAGGCGTGGGTCACCACACCCAGCTAATTTTTGTACTTTTTGTAGAGACAGGGTCTCACCATGT 6561 TGCCCAGGCTGGTCCTGAACTCCTGGGCTCAAGTAATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGTTGGGGTTACAGGCGTGA 6641 GGCACCGCGGCTGGCCTGAGTTTCTTCTTAATACTGTATCACAATTGTGGGCTGTCTTATGTGTTGATATCGATTGAGCT 6721 ATTTGAAATAGGAATGTTAATGGGTGTATTAAATTTTTGTAAGGATATAACAATATCTACCTTCCAAGGATGTTGTGAGG 6801 TTTTCCATGATTTTGTATATGAGCTAATGTTACCTTTGAGGGGTGGTGTGCATTATGTTGGATGATTGTAAATTTTCAGT 6881 GGAAAATGTACCGTGTCCTAAATTTAAAGACATGAAAAATATCCCAAGATCATACTAGATCATAATAGCAATTCCTTTAC 6961 AAATGAATTATGGAGGTAACTGATCTCTAACAGTTTCCTTCATGTTGTTTTAATGCACAAGGGCAGAGGATCTGCTGACC 7041 CTTGGAACCAGCGTGAGCTAACCACGTGCTATAGACACTTCATGGTGTCGCACCCAGGGAAGTCAAAGCGCTTTGCTCCC 7121 TCACTGTCTGTGAGTCCTCAGCCATTAGTACCCCACCCCCCGCTGCTCCAAAACTTGAGTTATTTCAAATGTTTCTCACT 7201 GTTCATCTCTCCACTGACCCCACTCCAGAAAGCCTGGAGAGAGTCCCAAGATGCCACCCACCTTCCCCAATCCCTCGCCA 7281 CAGATCTGTGTCTATCTCACACTCTGTAAGTGCCGCTTTGCTTCTTCCTCTCTTGAAAAGACTGAGAACACACATTTTAA 7361 CATGTTAGGAAAATGGGGCAGCCTAAAAAATGACTGATCCCACCGCCAGTGACTCATGTATACTCCAGGCTAGCAGACAA 7441 GGCCCTTTTTGGTGGGCCTGCTTCTGTGGGTTCACAGAAACCAAATTACTGTGGGTTGCAAAGAATTAGCAGGTCATTTA 7521 CAAAGCAGACATCCCTTCACCCAGACTGTGGTTTTGCATGCTCAGGTTCTCAGTCTATGAGCTTTGGTGCAGGATCATTT 7601 TGGCTACTGGAAAAACCATAGCTTATTTTAAATTTCTGGTTGCCAAAGCCACCACACGTGTGGTCTGTGGATGACCATTG 7681 TCTGCAGAATGACGAGGAAGGAACAGAATGTGGTTTGGGGCTCAGGGTGGCCTTCCCACTGGGAGGGAAGGCGGGAGGGA 7761 GCCCTTGCCCTGGGTTTTGACACAGCCTGTGCTCACAGCCTCTCCTCTCATCTGCATTTCTCAGAAATGCCCTCCCTGCC 7841 CAGTGGTGACTTTCCCTCGTCACTCCTATGGAGTTCTACCTGGAGCCCAGCCATGTGTGGAACTGTGAAGTTTACTCCTC 7921 TGTAAAGATGGTTTAAAGAAAGTCAGCTTCTGAAATGTAACAATGCTAACCCTTGCTGGAACCCTGTAAGAAATAGCCCT 8001 GCTGATAGTTTTCTAGGTTTATCATGTTTGATTTTTACACTGAAAAATAAAAAAATCCTGGTATGTTTGAAATTAAAAAA 8081 AAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | TZM-bl | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
PAR-CLIP data was present in GSM1462574. RNA binding protein: AGO2. Condition:TZM-bl ami BaL
... - Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al., 2013, mBio. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al. - mBio, 2013
UNLABELLED: The question of how HIV-1 interfaces with cellular microRNA (miRNA) biogenesis and effector mechanisms has been highly controversial. Here, we first used deep sequencing of small RNAs present in two different infected cell lines (TZM-bl and C8166) and two types of primary human cells (CD4(+) peripheral blood mononuclear cells [PBMCs] and macrophages) to unequivocally demonstrate that HIV-1 does not encode any viral miRNAs. Perhaps surprisingly, we also observed that infection of T cells by HIV-1 has only a modest effect on the expression of cellular miRNAs at early times after infection. Comprehensive analysis of miRNA binding to the HIV-1 genome using the photoactivatable ribonucleoside-induced cross-linking and immunoprecipitation (PAR-CLIP) technique revealed several binding sites for cellular miRNAs, a subset of which were shown to be capable of mediating miRNA-mediated repression of gene expression. However, the main finding from this analysis is that HIV-1 transcripts are largely refractory to miRNA binding, most probably due to extensive viral RNA secondary structure. Together, these data demonstrate that HIV-1 neither encodes viral miRNAs nor strongly influences cellular miRNA expression, at least early after infection, and imply that HIV-1 transcripts have evolved to avoid inhibition by preexisting cellular miRNAs by adopting extensive RNA secondary structures that occlude most potential miRNA binding sites. IMPORTANCE: MicroRNAs (miRNAs) are a ubiquitous class of small regulatory RNAs that serve as posttranscriptional regulators of gene expression. Previous work has suggested that HIV-1 might subvert the function of the cellular miRNA machinery by expressing viral miRNAs or by dramatically altering the level of cellular miRNA expression. Using very sensitive approaches, we now demonstrate that neither of these ideas is in fact correct. Moreover, HIV-1 transcripts appear to largely avoid regulation by cellular miRNAs by adopting an extensive RNA secondary structure that occludes the ability of cellular miRNAs to interact with viral mRNAs. Together, these data suggest that HIV-1, rather than seeking to control miRNA function in infected cells, has instead evolved a mechanism to become largely invisible to cellular miRNA effector mechanisms.
LinkOut: [PMID: 23592263]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1462574 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | TZM-bl / TZM-bl ami BaL |
Location of target site | ENST00000346872.3 | 3UTR | UUGCCCAGGCUGGUCCUGAACUCCUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23592263 / GSE59944 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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256 hsa-miR-4433a-3p Target Genes:
Functional analysis:
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Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT088097 | SEPT2 | septin 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT143134 | MGRN1 | mahogunin ring finger 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT153912 | NCOA3 | nuclear receptor coactivator 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT154894 | GNAS | GNAS complex locus | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT200996 | ZNF805 | zinc finger protein 805 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT215729 | C5ORF51 | chromosome 5 open reading frame 51 | ![]() |
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2 | 10 | ||||||
MIRT235593 | POFUT1 | protein O-fucosyltransferase 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT263250 | SGPL1 | sphingosine-1-phosphate lyase 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT317951 | CDC5L | cell division cycle 5 like | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT325572 | HIATL1 | major facilitator superfamily domain containing 14B | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT354739 | LSM3 | LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT444552 | UBE2D3 | ubiquitin conjugating enzyme E2 D3 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT446978 | SUSD5 | sushi domain containing 5 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT451036 | ZNF610 | zinc finger protein 610 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT451596 | TRPM7 | transient receptor potential cation channel subfamily M member 7 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT452025 | NLRP6 | NLR family pyrin domain containing 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT452594 | CA6 | carbonic anhydrase 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT452768 | TCEA3 | transcription elongation factor A3 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT452959 | ZNF844 | zinc finger protein 844 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT453191 | ACSF2 | acyl-CoA synthetase family member 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT453382 | RHD | Rh blood group D antigen | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT453685 | CEBPD | CCAAT/enhancer binding protein delta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT455272 | DDX39B | DExD-box helicase 39B | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT455346 | BAMBI | BMP and activin membrane bound inhibitor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT456494 | SERAC1 | serine active site containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT456585 | NID1 | nidogen 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT456888 | DDA1 | DET1 and DDB1 associated 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT457123 | APOLD1 | apolipoprotein L domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT457852 | ZNF324B | zinc finger protein 324B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT457987 | APAF1 | apoptotic peptidase activating factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT459278 | APOBEC3F | apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT459625 | SLC25A33 | solute carrier family 25 member 33 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT459715 | SGK494 | uncharacterized serine/threonine-protein kinase SgK494 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT460057 | RPL22L1 | ribosomal protein L22 like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT460182 | UNK | unkempt family zinc finger | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT460288 | PDE11A | phosphodiesterase 11A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT460841 | EGF | epidermal growth factor | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT460860 | TBC1D19 | TBC1 domain family member 19 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT461519 | EMC7 | ER membrane protein complex subunit 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT461729 | SLC27A1 | solute carrier family 27 member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT461821 | SNAP23 | synaptosome associated protein 23 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT462066 | CCDC77 | coiled-coil domain containing 77 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT462084 | MSANTD2 | Myb/SANT DNA binding domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT462508 | MTFMT | mitochondrial methionyl-tRNA formyltransferase | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT464239 | VCP | valosin containing protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT465316 | TRAF5 | TNF receptor associated factor 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT466549 | TBL1XR1 | transducin beta like 1 X-linked receptor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT467128 | SRGAP1 | SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT468091 | SHCBP1 | SHC binding and spindle associated 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT469630 | RAD21 | RAD21 cohesin complex component | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT471097 | PIK3C2B | phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT472704 | MYBL1 | MYB proto-oncogene like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT472830 | MTMR10 | myotubularin related protein 10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT472872 | MTHFD2 | methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT472895 | MTDH | metadherin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT473728 | MAPK1 | mitogen-activated protein kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT473859 | MAP2K4 | mitogen-activated protein kinase kinase 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT474047 | LONRF1 | LON peptidase N-terminal domain and ring finger 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT474297 | LAMC1 | laminin subunit gamma 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT474658 | KLF13 | Kruppel like factor 13 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT475234 | IKZF3 | IKAROS family zinc finger 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT475500 | HSP90B1 | heat shock protein 90 beta family member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT475742 | HERPUD1 | homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT475793 | HDGF | heparin binding growth factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT477254 | ERGIC2 | ERGIC and golgi 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT478228 | DDX52 | DExD-box helicase 52 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT478393 | DCTN5 | dynactin subunit 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT478754 | CS | citrate synthase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT478827 | CRKL | CRK like proto-oncogene, adaptor protein | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT480234 | C9orf41 | carnosine N-methyltransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT480597 | BTRC | beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT484121 | C14orf142 | GON7, KEOPS complex subunit homolog | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT484689 | PACSIN1 | protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT486331 | C11orf54 | chromosome 11 open reading frame 54 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT488599 | FAM3C | family with sequence similarity 3 member C | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT488833 | MRRF | mitochondrial ribosome recycling factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT492523 | RAB15 | RAB15, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT493632 | HIC2 | HIC ZBTB transcriptional repressor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT500026 | ABCF2 | ATP binding cassette subfamily F member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT501075 | SMAD7 | SMAD family member 7 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT503094 | BTG2 | BTG anti-proliferation factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT503336 | MMAB | methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblB type | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT505465 | STMN1 | stathmin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT505726 | SERTAD3 | SERTA domain containing 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT509333 | MS4A4A | membrane spanning 4-domains A4A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT509978 | KCNMB1 | potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT513068 | CHST6 | carbohydrate sulfotransferase 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT513446 | EMP1 | epithelial membrane protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT513736 | PSD3 | pleckstrin and Sec7 domain containing 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT513996 | CENPQ | centromere protein Q | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT516538 | MIXL1 | Mix paired-like homeobox | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT517606 | SAV1 | salvador family WW domain containing protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT518064 | CEP89 | centrosomal protein 89 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT518119 | RNMTL1 | mitochondrial rRNA methyltransferase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT518325 | WDR92 | WD repeat domain 92 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT519048 | ABCB11 | ATP binding cassette subfamily B member 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT520972 | SPPL2A | signal peptide peptidase like 2A | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT521359 | RPL35A | ribosomal protein L35a | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT523359 | GTF3C6 | general transcription factor IIIC subunit 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT523801 | FAM63A | MINDY lysine 48 deubiquitinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT524622 | C7orf73 | short transmembrane mitochondrial protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT525550 | PHB2 | prohibitin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT529709 | ZBTB49 | zinc finger and BTB domain containing 49 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT531605 | PLEKHA6 | pleckstrin homology domain containing A6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT532387 | UMPS | uridine monophosphate synthetase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT534468 | SCD | stearoyl-CoA desaturase | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT537546 | ETNK1 | ethanolamine kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT541619 | C11orf31 | selenoprotein H | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT548380 | ENPP5 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (putative) | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT549523 | HDDC2 | HD domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT549774 | SOD2 | superoxide dismutase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT550578 | SLC2A5 | solute carrier family 2 member 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT551498 | CENPN | centromere protein N | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT552301 | ITGA3 | integrin subunit alpha 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT555400 | PPM1L | protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT556399 | LUC7L | LUC7 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT557047 | HOXB3 | homeobox B3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT558072 | ERO1L | endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha | ![]() |
1 | 2 | |||||||
MIRT559659 | AHCYL2 | adenosylhomocysteinase like 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT561239 | ZNF354B | zinc finger protein 354B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT566899 | LRIG2 | leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT568786 | FAM120B | family with sequence similarity 120B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT574014 | MRPL12 | mitochondrial ribosomal protein L12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT574885 | Dnajc6 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT575243 | Serping1 | serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade G, member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT576194 | Vsig2 | V-set and immunoglobulin domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT576309 | Acbd7 | acyl-Coenzyme A binding domain containing 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT576484 | Lhx4 | LIM homeobox protein 4 | ![]() |
![]() |
2 | 3 | ||||||
MIRT576646 | Mill2 | MHC I like leukocyte 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT576708 | Kras | Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT576855 | Socs6 | suppressor of cytokine signaling 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT576950 | Aldoa | aldolase A, fructose-bisphosphate | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT617133 | ZNF556 | zinc finger protein 556 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT617928 | ZNF783 | zinc finger family member 783 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT618981 | MRPS16 | mitochondrial ribosomal protein S16 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT621100 | SIX3 | SIX homeobox 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT624537 | BROX | BRO1 domain and CAAX motif containing | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT625663 | C2orf48 | chromosome 2 open reading frame 48 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT627059 | DCTN6 | dynactin subunit 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT628319 | CLPB | ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT630859 | ENTPD5 | ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT632295 | TMEM65 | transmembrane protein 65 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT634115 | ZNF207 | zinc finger protein 207 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT634736 | CYP20A1 | cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT635655 | NDST3 | N-deacetylase and N-sulfotransferase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT635772 | PDCL3 | phosducin like 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT635911 | LILRA2 | leukocyte immunoglobulin like receptor A2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT636365 | OGFRL1 | opioid growth factor receptor like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT637251 | GLRX2 | glutaredoxin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT638705 | FZD4 | frizzled class receptor 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT639640 | PREX2 | phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT639676 | PPEF2 | protein phosphatase with EF-hand domain 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT642267 | SMIM17 | small integral membrane protein 17 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT642372 | ZNF581 | zinc finger protein 581 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT643545 | SLC25A17 | solute carrier family 25 member 17 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT647994 | PDE12 | phosphodiesterase 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT649094 | NOM1 | nucleolar protein with MIF4G domain 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT650993 | ZNF770 | zinc finger protein 770 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT651956 | UBE2N | ubiquitin conjugating enzyme E2 N | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652977 | SUN2 | Sad1 and UNC84 domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT654389 | RBM12B | RNA binding motif protein 12B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655637 | OLFML2A | olfactomedin like 2A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655729 | NRXN3 | neurexin 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT658171 | FCHSD1 | FCH and double SH3 domains 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT660937 | ACOX1 | acyl-CoA oxidase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662112 | CERKL | ceramide kinase like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662302 | MPV17L | MPV17 mitochondrial inner membrane protein like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662993 | TMEM59 | transmembrane protein 59 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663071 | SFR1 | SWI5 dependent homologous recombination repair protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663704 | ABHD17B | abhydrolase domain containing 17B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663864 | MUC20 | mucin 20, cell surface associated | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT665185 | HAUS5 | HAUS augmin like complex subunit 5 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT665402 | WEE1 | WEE1 G2 checkpoint kinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT665688 | TNPO3 | transportin 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT665795 | TMEM170A | transmembrane protein 170A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT665847 | TIAL1 | TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT666999 | PDPN | podoplanin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT667598 | LIPC | lipase C, hepatic type | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT668576 | ELMSAN1 | ELM2 and Myb/SANT domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT670960 | UGGT1 | UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT671187 | ZNF891 | zinc finger protein 891 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT671739 | ZNF451 | zinc finger protein 451 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT672745 | ZNF585B | zinc finger protein 585B | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT673446 | ZNF583 | zinc finger protein 583 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT679843 | GPR75 | G protein-coupled receptor 75 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT680556 | ZNF584 | zinc finger protein 584 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT680661 | C1orf210 | chromosome 1 open reading frame 210 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT681285 | RFC2 | replication factor |