Gene Symbol |
DNAL1
|
Synonyms |
C14orf168, CILD16 |
Description |
dynein axonemal light chain 1 |
Transcript |
NM_031427
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on DNAL1 |
|
3'UTR of DNAL1 (miRNA target sites are highlighted) |
>DNAL1|NM_031427|3'UTR
1 TGCCACGCTTTCCACTGTGTGTTAACTTATTTAAATGTCATAAGAACAATAGATAAATTTTATATAATTGTCTATTTTAA
81 AGATTCTGTATGGGACAAAAGTTTCTTAAGATAAAACAGATCACTCATTCTCATCTTTTTTTTTCCTTTAACTTATTCAG
161 TGTTTCTCCCCAAAACTGGTAATGCCAACCTTATATATCCTATTTCTCTTTTTAGAAACCACAAATTTTCGATTTTTGTC
241 TTCAGTCTCAGTTACGTACTGTGTAGCCCCATCTACTAAAACAAAACCTTTGTAGACCAGTCATTTTTAATAACAAAGGA
321 ACAAATGTTTTTTTCAGTTTGTTCATTTTTTTTAGGTTAGACATTTTAAAAGATGTACATTTGAAAATTCAGAACATTTT
401 TCCTGAAGGTCTGTCTCTGTACAATTCAGAAGCACATGCCTTTAGCTCAGAAGGCAGCATGGTGATGGGAAGAGTTCCTC
481 TTAGAAATACAGCAGGTCCGGAACCAAGACTCCAAAGTTCCATTGGAAAAGATATGGTGAAAAAAGGAAAAAGTAGTATC
561 TCAGAGACCTTCTAGTCTATATTATACTTATTTGTTTTTCCAAAAATGTGCACATTGTCAACTGGAATTTAGGTTGTTTT
641 TATATGCATGGCCACTTGAGTCATTGTGTACAGTCATTCTGTGATCTCAGTTAGTGGTTAAAATGACTGTCATGATCATT
721 TCTTTGACTGATAATGTGGCAATGTTACTCATGTGGACCTCGCCTTAAGCACACATTTTGGTTTTATAGTTCCTTATGTG
801 TTTAAAGCATTAGTTATATTTGAATTCCTAGACTAAATGCTGGCCATTGATGTATGTCAAAATTTACCCTAATTATTTGG
881 TCTGGTGACCCTCATTGTTGGGAAAAGTGACTACCATGGTTATAAGTAAGGGTATAATGAAACTTAGTATTTCAAAATAT
961 ATTTTTTGAGAAGTTCTAAGTTAAACAGCTCTTAAAATGTATTATGTACGTGGTTGTGGAGGGAAGGGAGATGTTTCATT
1041 ATGAGATCCCAGGCAAATGGCAATATGTTTGAGGATTGTCTCCTACATAAAGCAGTGTAGGTGATTTAACCTCAAAATTG
1121 CAAAGCAATAGTTAGATGCAGAGGTTAGAATTTATCATGTAAACAAAAAATCCTTCAGGAAAATGTAAGACATTGTAGTC
1201 AGTAAGCAGATGAGGTCATAGGAGGCCATGGCTGGATCACTATTAGATTGCAGAAAAGAAGTCAGGGGCCCTCTGCCAAA
1281 TTGTGCCTAAAGTCCCTCAGAGACTGTTGATTCTGGTTTCCCCATCTACTTGTGTGATTTTACTTGCATAAAATCACAGT
1361 GAAAGAGGGAAGAATCATCTTTAAAAAGTGATTGCATAAGTAGTCCTGGGTTTCAGAAGATTTCAGCTATCATTTACATA
1441 GGAATTACTTGATTTTTCTAAGTTACTCTGATCAAAAGGGACCACTGCTTTGACAATCAACTCTAAATACAAACAAGAGG
1521 CCAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTCATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCATCTGAGATCAGGAGTTCAA
1601 GACCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGTCCTGGTGGTGGGCGCCTGTA
1681 GTCCCAACTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCATTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCC
1761 ATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCGAGACTCCATATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGAAAACTTGGTCTA
1841 ACACCCTTTTAGTTTTCTTTTCTCTCTTCTTTTCAATCTGATAGGAAGAAACCTTATTCTACTCTAGCTGGTTTATGCAT
1921 TCAAAGCCTTTGGACATTTCTTTTATGAACCATAGGCAATGAGCCTTCATTCTCCTTGGTGATGTTTTAAGTTCCATAAA
2001 CTGAGAGGGAAGATGATCTTCTTAAAGTTTGCACTTCCTTCAGTAGGCAAGCTTGAAGCCATGTTGATATGGATATGTTT
2081 TCTAAAAGTAACCCTGGAAGTGAATATAATAGGAAGTAAGTGATTTCATATTGAATTTATTTGTAAAATGGCTTAGAGTT
2161 TTGGTGTTTGTTTTTTCTGAATTCTGTAATATAGAAACTGGTTCTCTTTCTCCTTGTTTCTCAATGACTTTTAATTACAG
2241 GTAGTTCTCAGACAAATGTAAGATACTTTTCTCTGTCCATTTCATGCAAAATTCATATTCAGTATCATTCAACAAATCTT
2321 TGAATGACTTCTATGCATCCCTGTTCATGGAACCCATGCCATTAGAAAATGGCAGTTGGGATGTATGAAGAAATGTAGGA
2401 TATTCTCTCAAATCATTCCCTAAATTATCCTTTACTGCTGCAAATTTAGCTGATAAAACTGCCTTTGGTTTATGCCTCTT
2481 GGATCAGATATTTGACCTATGTGGAATAGATTATCTCTGTGCTTCCGGTTTAAGACATTACGCCATTTTAGTGGATCATT
2561 TAAATTTTTTCTATTCTGTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTAAACAGAGTCTCACTCCCGAGTAGCTGGGACC
2641 ACAGGCACGTGCCATCATGCCTGGCCTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTTGTCT
2721 TGAACTCCTAACTTCAGATGACCTGCCCACATCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGC
2801 CAAATTTCTTCTATTCTTGTAAGTGATGGTAAAACTCTGGAATCAGTCCAGTATTTTAGTTTTTCACAGCAAATTTGATT
2881 TTAGTCTACCAAGGAGTTTAACTTTTCTATGTTCCCTAACTCTAAGATTAGGGCTGTATTACCTAGACAGGCCTTAAAAG
2961 GTTTTTGTGTTGTTCTCTGTTAATAAGAATTTGTTCCTTTAAACCAGAGGATCAACCTTGGAACTATTAACATTTTGGGA
3041 TTGATAATTCATTGTTGTTGGGGGCTGTCCTGTGTGCTTAGGATGTTCAGCTGCAGCCCTGGCCTCTACCCACTAGATTC
3121 CAGTAGACCCCCTCCTCAGCCATGACAACAAAGATATCTCCAGACATTGCCATCTGTCCCTTGGGTAGGAGGGTGGGAAC
3201 AAATTCTCCCTTAGTTGTACTTTTTATACCAACATCACTTGTGTCCAGGGTCCATTTATTTTCAGTCTGTAGCCATGTGC
3281 CACTTGAATTGTTATATGAGAGAAGGTGATGTATTCAGTAATCATGGATGGAAAGAAATGGTCACTGGTATTTTTTGTAA
3361 TGCTCATTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCAGCTCACT
3441 GCAACCTCCGTCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTCTGCCTCCGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACGCGCCACCAT
3521 GCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACGGCGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTG
3601 ATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACTGCGACTGGCTTAATGCTCATTTTCATAAT
3681 TTTCATGTAATATTAGAAACTCAGGGCTGGAAGGTTCAACTTCTCTTTTTTGAAGCAGGGTCTCAACTTTTATTTCTAAG
3761 CATTCTTGCTTATCTTAGGACAGTGATTATTAACCTACCTCTCTGTTTCTATCAACAGAAGCCAACTTTATGATAGATTT
3841 TGCTTTGTCTCTAAAGTTTAATATTTTGAGTGTACTTTAGAAAATAGGTCATCATTCTTTAAGCGTCATTCATTGTCTAA
3921 TCACATAATTTTGCAGACCATGGCAGTCATTAAATACAGAAAAATACTGTGTAAAATTTGATAATCTTGTAGGAAAGTTA
4001 GCTGATGTAGACATCAATTTTGGATGTGATCAGAAGAATGTCTGCTTAAGATAACTGGTCAATAACTTGGTATGGCTACT
4081 GGATTCATTCCACATATGGTAGTATAAGGCACTTAAATGTGTTTCCTGATTGGGCACTGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA
4161 GCACTTTGGGAGGCCGTGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGGCCAGCCTGGCCAACGTGGTGAAACCCCAT
4241 GTCTACCAAAAATATAAAAAGATAGCCGGGCGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA
4321 GAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGCTTCAGTGAGCCGAAATAGTGTGACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTAAG
4401 TCTCCGTCTCAAAAAGAAAAAAAAAAATGTGGTTCTTTTGTGGAAAGAGGAATTTGAACTTGAATAAACACTTCTTTTGA
4481 CACCTTTTACCAGTGGTCTGAAGCAGAATAAGGAAGAATAAGAAATGAATCTTGACTGTTGACTTATTCTGAGAATTGGT
4561 GATGTGTAAAGAGAGTTGGAATCTTCTACCTGGGTTTTTCTCAGGGCTAAATGGAAAAGCACAGGGCCCAGAAAGGTTGG
4641 AGTTAATCATTCACTTAAAAGCATTAGGAGGAAGTGTCAAAGCATCAGTCATGAATAGATTATGTCTCTCTGACTACAGT
4721 CAGACCATCAATTCACTAAGACCTTATACTCTGTAAGTGTTGGTAAAGGAAGAAAACTGCTAAATTGCATGTTACCCTTT
4801 ACTAGAAATTCATTCCTTTGGCACAGATTTTATTTATTTGGGGCTGTTTAATGTGTCTGTAAATCATGAAATATAAAAGC
4881 AAGATTCAGTGTAGCAGAGTTGGTGCTTCTTCTGACAAGCTAACTTGACCATATTTCTTTATCTGTGCTCTAACATGTGT
4961 CATATTGTTTTCTTTTTGTAAACCATAAAATGGGTGAACTTCCAAAAATCAAGGGTCATGTTTTAAAATCATGGAACTTT
5041 TAGAAATACCATATCTGTATCTCTATTCCTGCATTTTATAAATCTGTAAAGGAAGAAAACTGAAAGGAAGAACTAGACTG
5121 AGTCTTACCTTTCTCTGACCTAAGATAAACTGATAAAACTTTTTACTTGATATTTGGAGAAGTCATTAACTGGATTCTAG
5201 TTAATTTCCCATATTGGGCAGTTTAGAGGAGACCCAGCCAACCAAATTATGATCTAGCAAATTTAACATAGGGGAAGAGG
5281 GATAGTAAACTATTTTTCAGTAGATTTGCACTTTAAACTTAGGAACTGGATGTTGGTGGAAAGGACTTCCATAGGGCAGA
5361 TGGGTAAATATCTAGCCTGCACTTGGATGTTAGAGAATCAAACCTCACCCTTGCTCGTTCTAAACCCACATGAGTAGTTA
5441 ACTGTCTTTTGACATAATCAGAGTCAGGATTTCCCTTTTTCCCTACTTGAGTCGTCTTCCATGTCTGTTACATCCAAGAT
5521 CATCCCTCTGGGGGATGTGTCAAGTAGTTCTCCTACTCAGAATAGAAGCTTTGCGAATTATCATTCCCACCTCTAGATTT
5601 TAAATGAATGTAGAGTTGTCTAACATTATATGGGTGGGAGGCTCTTTGCCTCTGTGATCAGTAGGGTACCTGCCTCTGAG
5681 GTGCTACTGCCTGGAGGGATCACTCCCATCAAAAGACTGGTGAGTTGGAAGCTAAGAGCACATGCGCATAGCCAGCTCCT
5761 CTCCCAGGCTGGCAGTCATGATTACGAGCATCATTCCAGAATCTTTGGCTTCTAGAACCAACTCCATTCTGAAGAACATT
5841 TTAACATCTATGAATACCTTGGTAATAATCTTTTATACACAGGAGTTTTGTAGCATGACTTTATGACTAAACTTATTGTG
5921 AATTAAGTTATTTAGAAATGTTGAGTTTCTGAATGTTATTTTGTGATTTGTTTCAAAATGGTAATAAATTGTGTTATTTT
6001 GTAAAAAAAAAAAAAAGTATATTTTTGGTACATGATTATTAGTTTTAGCTAATATAGAGCAATTATATAAACTTCTAGTG
6081 ATATTCAGTCCAAAGAAATTCAGCCTTTGGATAACATGTACCATGCAGTTTGTGTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
6161 GTGCACGTGCATGAGAGAGAGTGAAAGAGAGAGGTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTTGCC
6241 CAGGCTGGAGTGCACTGGCACAATCTCGGCTTACTGCAACCTCCACCTCCCGTGTTCAAGCGAGTCTCCTGCCTCAGCCT
6321 CCCGAGTACTGGGACTACAGGCGCACACCACCATGCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAAGTTTCACCATG
6401 CTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCTTGACCTCGTGATCTGCCCGCCACAGCCTCCCAAAGAGCTAGGATTACAGGCACGAG
6481 CCACCGCGCACGGCCAGAGGCATTCATTTCTTTAGCTAAGTTTTTTTTTCTTAGTAGGTTTTTTTCTCCCAGGCTTGTAA
6561 CTCTTCCCCAGTTCTTTGGGCACTATTTCAAATTATTAGGCTTCTGGAAAGAGTGCTTCCAGGGACAGCAAGTTACTACT
6641 GCACTTGACCATTCCTAGTCCTCACCTGATTACCAGAAGGTACGCAAGGTAAAAGTTAGCTGATAGGCCCTGAATTGAGA
6721 AAAAGGAATCACCAAGCAATATCCGTAACATTACACATTTTGCCAGCACATTTTCTATGCTATCAGCTAAAACGTAATTT
6801 TGGTCACAAAATAGGGCTGTAGTGTAGTTTCTACTTCTTATTCCAGTTGTTTGATTATGAGGATACATTTCTTGCTGCTG
6881 TCCTCCACTAAACAGCAGACAAATTGCCAGGTGTGCTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTGCTTTGGGAGGCCAAGGCAGG
6961 AGTTTGAGACCAGCCTAGGCAACATCGTGAGACCCCATCTCTACAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAATTAGTTGGGCAT
7041 GGCAATGCCGCCTGTGGTCCTAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGATTGCTTGAACCCAGAAGTTTGAGGTTACAGTGAG
7121 CTATGATCATGTCACTGCAAGACCCTGTCCCTAAAAAAAGGAAAAACAAATAGAAGACAAATTTCAATTTCTGAGTTTAT
7201 ACAAAGAAAGCCTTAATTCAGATCATAAATATCCCATTGTTATTTTTAGTTCATTGTTTCCTAGAACAAAGGATGGACAT
7281 TTAGGATCCTCACATTGATTTATGTCATATATATGTATTGCATTGAATATATATATACGCATGTAGATACATACAATTGT
7361 TATATATAATTAAAAGTCAGAATCTTAGGTGATAACTGTCAGACCTCTGAGCCCAAGCTAAGCCATCGCATCCCCTGTGA
7441 CTTGCACGTATACATCCAGATGGCCTGAAGTAACTGAAGATCCACAAAAGAAGTAAAAATAGCCTTAACTGATGACATTC
7521 CACCATTGTGATTTGTTCCTGCCCCACCCTAACTGATCAATGTACTTTGTAATCTCCCCCACCCTTAAGAAGGTTCTTTT
7601 TAATTCTCCCCACCCTTGAGAATGTACTTTGTGAGCTCCACCCACTGTCTGCAAAACATTGCTCTTAACTTCAGCGCCTA
7681 TCCCAAAACCTATAAGAACTGATGATAATCCACCACCCTTTGCTGACTCTCTTTTCGGACTCAGCCCGCCTGCACCCAGG
7761 TGAAATAAACAGCCATGTTACTCACAAAAAAAAAAAAAAA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' acccgaaagaUCAGAGUCGAGa 5'
| |||||||||
Target 5' gcagtggcgcAATCTCAGCTCa 3'
|
3417 - 3438
|
152.00 |
-16.10 |
2
|
miRNA 3' acCCGAAAG--AUC-AGAGUCGAga 5'
|| |||| || |:||||||
Target 5' ctGGGTTTCAGAAGATTTCAGCTat 3'
|
1406 - 1430
|
142.00 |
-16.50 |
3
|
miRNA 3' acccGAAAGAU-C-AGAGUCGAga 5'
:|||||| | | ||||||
Target 5' cacaTTTTCTATGCTATCAGCTaa 3'
|
6767 - 6790
|
142.00 |
-11.90 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|