pre-miRNA Information | |
---|---|
pre-miRNA | hsa-mir-4524a |
Genomic Coordinates | chr17: 69099564 - 69099632 |
Description | Homo sapiens miR-4524a stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Mature miRNA | hsa-miR-4524a-5p | ||||||||||||
Sequence | 6| AUAGCAGCAUGAACCUGUCUCA |27 | ||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||
Experiments | Illumina | ||||||||||||
SNPs in miRNA |
|
||||||||||||
Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene Symbol | AKT3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | MPPH, MPPH2, PKB-GAMMA, PKBG, PRKBG, RAC-PK-gamma, RAC-gamma, STK-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | AKT serine/threonine kinase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_005465 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_181690 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on AKT3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of AKT3 (miRNA target sites are highlighted) |
>AKT3|NM_005465|3'UTR
1 GTCTCTTTCATTCTGCTACTTCACTGTCATCTTCAATTTATTACTGAAAATGATTCCTGGACATCACCAGTCCTAGCTCT
81 TACACATAGCAGGGGCACCTTCCGACATCCCAGACCAGCCAAGGGTCCTCACCCCTCGCCACCTTTCACCCTCATGAAAA
161 CACACATACACGCAAATACACTCCAGTTTTTGTTTTTGCATGAAATTGTATCTCAGTCTAAGGTCTCATGCTGTTGCTGC
241 TACTGTCTTACTATTATAGCAACTTTAAGAAGTAATTTTCCAACCTTTGGAAGTCATGAGCCCACCATTGTTCATTTGTG
321 CACCAATTATCATCTTTTGATCTTTTAGTTTTTCCCTCAGTGAAGGCTAAATGAGATACACTGATTCTAGGTACATTTTT
401 TAACTTTCTAGAAGAGAAAAACTAACTAGACTAAGAAGATTTAGTTTATAAATTCAGAACAAGCAATTGTGGAAGGGTGG
481 TGGCGTGCATATGTAAAGCACATCAGATCCGTGCGTGAAGTAGGCATATATCACTAAGCTGTGGCTGGAATTGATTAGGA
561 AGCATTTGGTAGAAGGACTGAACAACTGTTGGGATATATATATATATATATAATTTTTTTTTTTTAAATTCCTGGTGGAT
641 ACTGTAGAAGAAGCCCATATCACATGTGGATGTCGAGACTTCACGGGCAATCATGAGCAAGTGAACACTGTTCTACCAAG
721 AACTGAAGGCATATGCACAGTCAAGGTCACTTAAAGGGTCTTATGAAACAATTTGAGCCAGAGAGCATCTTTCCCCTGTG
801 CTTGGAAACCTTTTTTCCTTCTTGACATTTATCACCTCTGATGGCTGAAGAATGTAGACAGGTATAATGATACTGCTTTT
881 CACCAAAATTTCTACACCAAGGTAAACAGGTGTTTGCCTTATTTAATTTTTTACTTTCAGTTCTACGTGAATTAGCTTTT
961 TCTCAGATGTTGAAACTTTGAATGTCCTTTTATGATTTTGTTTATATTGCAGTAGTATTTATTTTTTAGTGATGAGAATT
1041 GTATGTCATGTTAGCAAACGCAGCTCCAACTTATATAAAATAGACTTACTGCAGTTACTTTTGACCCATGTGCAAGGATT
1121 GTACACGCTGATGAGAATCATGCACTTTTTCTCCTCTGTTAAAAAAAATGATAAGGCTCTGAAATGGAATATATTGGTTA
1201 GAATTTGGCTTTGGGAGAAGAGATGCTGCCATTTAACCCCTTGGTACTGAAAATGAGAAAATCCCCAACTATGCATGCCA
1281 AGGGGTTAATGAAACAAATAGCTGTTGACGTTTGCTCATTTAAGAATTTGAAACGTTATGATGACCTGGCAACAAAAAGT
1361 AATGAAGAAAATTGAGACCTGAGTGAAGATAAGAAATGATCTTTACGTGGCAAAATGAACACATCTTGAGTATTTAGGAA
1441 ATGGGCAGTGAAGGCTAAGAACCTGGTGTGTTTCTTGGGATCATGGTACATTTATCACTGAATTAAGCCATCAGGGAAAA
1521 AACAACAAAAAAAGAGAACACCTCCAGCTTTTCTTTTTCTGTATATACTCATGTCCCCCAGATTCCAACATTTCTCACTG
1601 AAAGGGGGCATGTATGCAAACCTCATCTTTCTCCTTCATTAATGATGATCTTCAGATTAAACCCTTTGGTGCTAGGAGCT
1681 GACAATTTCCAAAGCAGCCTGTGAAGTCCTAGGGGCTGGGGGCCACTCTTGCGGCAAGCAGAAGGCCATCCTACTCCGCG
1761 GAGTGATCATGGAAATGTATTTTAGTTAAACTCTGACAGCTCCCAAACGGAAGACTACAGCATGACGTAGTATTATGATT
1841 GCATTGTATGAAAGAGCAAGTGACTTTCTAAGTAGGATGAATCATATTCATATGCAGATGTCTTAGCCTCTTGACGCTGG
1921 AAGTGTGGATTTATAGCTATGAAACCACTGCTGGCAGTGGGTGGGCCACTGGGACTGACGGGGGTTAAAGGGCATTTTAC
2001 TAAGGCAGCTAAGACATATTCAGACATCAACGTTATCCTTCTTTTTCATATTTCTACCTGAGTGAAGTTCATCCTTAGTA
2081 TTGAGTAGGAAGTTACAGTAAATGGTAGTTCATTCTTACTTACACACATAGCTAATCTTTTTTTTTTCACTTGGAATTAT
2161 GTTGAATGTTTCATTTTGACAAAAAAGTAGACTAGAAGGTATGTTCTTTAAGTTGTCTTGCATCCATTATATAAGAAAGA
2241 AACAGGTGAGAGGAAGAGCAGAAAGCTGAGACTGGCTGATGTTCAGAGCACTTACTCCTCTAGAGGGAAAGCATGACACC
2321 GAACACTAAGCACACAGCTTTTTGTTGTTTTGGTTTTTTCTCCCGCAAATCTTAAAGTGATTCCCATGACCTTGGCCAAG
2401 GACACTTCTTAAAGATTAATGACTGGCACTGACATTGCCCCAGGCGGGCCACTCCTCACACTGGCTCTCAGTTCCCAGCC
2481 ATGCCTGGGGCTCAGTCACTTCTATTCCACCCTCTGAGACTCCATTGGTGTCACACAAGGTGTCTTCTTGGCTTTGATTT
2561 TGAGAATCCCCTATTTTCACTTCCAGATCTGTCAGCTGCCATGGAGGAATAATAGAAAACCAGAAATGCGTGTAGAGGGA
2641 GATTTCTAAAACTTCCCTTGTGTCGCCCATAGTTGTAGTTTTGGGTTCTGGCAGGTGGAACACCCTGAAACCTGGAATCA
2721 TTCTATGAGAATACAGTTCAGACTTTGCAGACTCCAGCCCATACTAACTGTCATGAAGCTTGACTTCTTGTCATAATGCA
2801 GCCATCTTGGAGGAAATTGGCCATTTCTGCTTAGATGGTTGGCAGGGTCGCGCTCAGCTTTGCTTTCTACACTAATTACA
2881 TAGCATTATTCAAGTATTGTTTTCCATTTCCCATCCCTGATTTCCAGCTTCTTAAAGCTGACTGTTCTTGCAGGGGCCAC
2961 TTGCTTCTCCTAGAGTACAAAAGTAAGGGCCTTCCTTACTAACTGCAGGGTCTCTCTATTACACCTCAACATACACACTT
3041 TGCTGCTACTGTTTGTACTGTCTACAGTAGAATTTCCTTATCTTGCTCCTGGTAGTGCATTACAGGCAAGCATGAAATGT
3121 AAAGTATTTATTTAAATAAAAAGAAAACCTCTAAATTGGTAATTGAATTACCTCCCTGTAGCTTTATAGTTTGTGACATT
3201 TCTTGACCTTGCTAGTTCTTTCATTAGATCTGCGCAAGATCTAGTCATCTGGTTAAGGATTTTAAGCAGATGCAACTATA
3281 AACCCAAGAAACTGTATTACTATTACTGTTGGTCATACTAAACCTGTCTATTTCCTGAAGTATATGACCCACAAGGATGT
3361 GGAATAACTAGGAGAAACTGTTTTTGTACACTGTACATCCTTAGTATTTTTACACGTATATGATAGGGATGAACATGATT
3441 TTCCTTCGTACAGACAGCTTAAATAAAGCACTATGTCAATCTGCTACTTCTCTGTTTATTGTTGTTGGATGTGGTTCTAT
3521 AATCCCCCCAAATTAAATCTTCTTTAATGAAAACATGATTTTTAATAGCCCCAGCTGGTATTAACCTACCTTGTATAAAA
3601 TGTGACAGGAAAATATAGAAATAATTCCTTGTAGCTCACACACACACACATAGGGGATCATTTTTACTTCAGTGAAATGG
3681 CAGTAGTGCGGTTGTGCAAACTTTGATGAACGGCTGCTTCTGAGGGGAAACGCTGACCTCTCAGCACTGGATTTAGGATG
3761 GATGTACTGTGAAGCCAGGGATGAAGGAGGTCTCAGACCCTGGGGACATTCAGACCCGAATCATCTATACAACACACGGT
3841 TTGGACCCAGAATCTGAAGGAATGTAGCTTTTCATTAACGTCTTCCTGATAATGTACTGCTCTGCATATTTCCTTTCTTA
3921 GAGTGTATTTCTAACAACATGTCATGGCAAATTAACAAACTTAGACGTGGGTGATGTAGATGGGTAGGATGGCTGGACTG
4001 CAGTCTGACTTCACGTTGAATCATTCTGGATGGGGCCTTTTTCTGATTTTACCTCATAAAGCTACTATTGTAGAAACTTG
4081 GCTTTGCTCCTGTGACGAAGCCAGACAGAGGAATGGCTTTTGGGACCAGAGTGAGTCAAGCATGTATGTGTATGTCACAC
4161 GGCCAAATTTGAGGGCATTCTCACATGTGCTCTTCTCTCAAAACCACTGGGGTTGACAGATCCAGGAGGCTAAAAAAAAG
4241 TGACCTCTATAATTCTTTAAAGGTGCTATTTTTAGAATATTGTATAATTTATTCACAGTATATCTAAAACAGAATTAAGG
4321 ACAATTAAAATATCTTATGTGACAGCCTTTATGTCTAGCACATTTGATGAAATAAAAAACTTCTGAATCTGAATAGAAGT
4401 TCTACTGTTTCAGGCTTGAACCTTTTACATGCTCAAGAGATTCAAATGGTCTCTGTGTGTAGATCATGCCACCGCCTCCA
4481 AAGCCTAATCCACATCACTTCTGAGAGGCAAGGCTGAGCATATGGTGACATCAGCTCTGTGTTGAGATGGTGATGAGGAT
4561 GATGGCTCGCTGGCCAGGCAGGGCAGCCGAAGGTCAGGGACCTGTCCTAACTAACTGCAGCCTTGCCTTTAGTGTTTGTC
4641 ATTCTCAGATACAACACGGTATGTCCAGTGTCCGTTTTTATTACTTTAAAGCATTTGAGGGCTTAATTGTGTATAGTAGA
4721 AATACTATTTTAGACAAATAATTATCTGTGTACAGATATTTGATATACTCTAAGTAAATTTTCTAATTTCACTAAGTACG
4801 TTTTTAGGCTCCTCTCAAATACTGCGTATTGAAGAAAAAAATCTGACACCACCGAGCCAAAGATGCTTTTTTGTCTGTTT
4881 TCGTTGTTTAACAGAATGGAAAGAGTAATGCATAGTGCTTCCTGGTGTCTCCTGATTGATTGATTGTGCACAAAGTAGGA
4961 CGATAAATAAATAAAATGGAGTCTGATGGGACATTGATTAAAGGTGAAGGATGATTGATATATAGATCATGAAAAGAAAA
5041 ATGAATGGCAGGAAAAAAAGTTTGGTCCTTAATATACTTTGGCCTAGTTAAAATATGTGCCTTTTTGGTGTGTTTTGTTC
5121 ATCACTACAAGATAAAAAGGAAACATTACAACTCAAGTCTTTAAAAAGTTCATTTATTGAAAATCATATGTATAACCTAG
5201 CATACGAATGAGCAGATTTAAACACATAACTTCAAGCCATTTCTGAAAACATACACCAGGAGCTCTGCTCAGCTAGAGTC
5281 AGACTCCAGCTCCAGCCCGACTGCGTGCGGGGACAGCGCCCGCGTTGATGAGGACCAGCCCCACTGCAGGCTGAGGCGGT
5361 GTCACCCTGGGAAGGTCGTGGTGCGTTGTGGCATATTAAGTCTAAACCAGATGAATGTAAATATCTCTTTGTAAATCATT
5441 TATTTCACTCTGTTCCATCCAGGTCAGCAATCAGATTGTGGCATGCTGGGTAACTGGAAAAAATAATAAAAAGTAAGTTT
5521 CAATAGCTCAAAAAAAAAA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DRVs in gene 3'UTRs |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in gene 3'UTRs |
|
Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
|
||||||
Conditions | HEK293 | ||||||
Disease | 10000.0 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
"PAR-CLIP data was present in GSM714644. RNA binding protein: AGO2. Condition:completeT1
... - Kishore S; Jaskiewicz L; Burger L; Hausser et al., 2011, Nature methods. |
||||||
miRNA-target interactions (Provided by authors) |
|
||||||
Article |
- Kishore S; Jaskiewicz L; Burger L; Hausser et al. - Nature methods, 2011
Cross-linking and immunoprecipitation (CLIP) is increasingly used to map transcriptome-wide binding sites of RNA-binding proteins. We developed a method for CLIP data analysis, and applied it to compare CLIP with photoactivatable ribonucleoside-enhanced CLIP (PAR-CLIP) and to uncover how differences in cross-linking and ribonuclease digestion affect the identified sites. We found only small differences in accuracies of these methods in identifying binding sites of HuR, which binds low-complexity sequences, and Argonaute 2, which has a complex binding specificity. We found that cross-link-induced mutations led to single-nucleotide resolution for both PAR-CLIP and CLIP. Our results confirm the expectation from original CLIP publications that RNA-binding proteins do not protect their binding sites sufficiently under the denaturing conditions used during the CLIP procedure, and we show that extensive digestion with sequence-specific RNases strongly biases the recovered binding sites. This bias can be substantially reduced by milder nuclease digestion conditions.
LinkOut: [PMID: 21572407]
|
Experimental Support 2 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
|
||||||
Conditions | TZM-bl | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
PAR-CLIP data was present in GSM1462574. RNA binding protein: AGO2. Condition:TZM-bl ami BaL
... - Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al., 2013, mBio. |
||||||
miRNA-target interactions (Provided by authors) |
|
||||||
Article |
- Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al. - mBio, 2013
UNLABELLED: The question of how HIV-1 interfaces with cellular microRNA (miRNA) biogenesis and effector mechanisms has been highly controversial. Here, we first used deep sequencing of small RNAs present in two different infected cell lines (TZM-bl and C8166) and two types of primary human cells (CD4(+) peripheral blood mononuclear cells [PBMCs] and macrophages) to unequivocally demonstrate that HIV-1 does not encode any viral miRNAs. Perhaps surprisingly, we also observed that infection of T cells by HIV-1 has only a modest effect on the expression of cellular miRNAs at early times after infection. Comprehensive analysis of miRNA binding to the HIV-1 genome using the photoactivatable ribonucleoside-induced cross-linking and immunoprecipitation (PAR-CLIP) technique revealed several binding sites for cellular miRNAs, a subset of which were shown to be capable of mediating miRNA-mediated repression of gene expression. However, the main finding from this analysis is that HIV-1 transcripts are largely refractory to miRNA binding, most probably due to extensive viral RNA secondary structure. Together, these data demonstrate that HIV-1 neither encodes viral miRNAs nor strongly influences cellular miRNA expression, at least early after infection, and imply that HIV-1 transcripts have evolved to avoid inhibition by preexisting cellular miRNAs by adopting extensive RNA secondary structures that occlude most potential miRNA binding sites. IMPORTANCE: MicroRNAs (miRNAs) are a ubiquitous class of small regulatory RNAs that serve as posttranscriptional regulators of gene expression. Previous work has suggested that HIV-1 might subvert the function of the cellular miRNA machinery by expressing viral miRNAs or by dramatically altering the level of cellular miRNA expression. Using very sensitive approaches, we now demonstrate that neither of these ideas is in fact correct. Moreover, HIV-1 transcripts appear to largely avoid regulation by cellular miRNAs by adopting an extensive RNA secondary structure that occludes the ability of cellular miRNAs to interact with viral mRNAs. Together, these data suggest that HIV-1, rather than seeking to control miRNA function in infected cells, has instead evolved a mechanism to become largely invisible to cellular miRNA effector mechanisms.
LinkOut: [PMID: 23592263]
|
CLIP-seq Support 1 for dataset GSM714644 | |
---|---|
Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / completeT1, repA |
Location of target site | ENST00000366539.1 | 3UTR | UCUCUCUAUUACACCUCAACAUACACACUUUGCUGCUACUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 21572407 / GSE28865 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM1462574 | |
---|---|
Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | TZM-bl / TZM-bl ami BaL |
Location of target site | ENST00000366539.1 | 3UTR | UCUCUCUAUUACACCUCAACAUACACACUUUGCUGCUACUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23592263 / GSE59944 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
180 hsa-miR-4524a-5p Target Genes:
Functional analysis:
ID![]() |
Target | Description | Validation methods |
![]() |
![]() |
|||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
|||||
MIRT055251 | CNNM2 | cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT055826 | PLEKHA1 | pleckstrin homology domain containing A1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT060573 | CCND1 | cyclin D1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT061013 | C1ORF21 | chromosome 1 open reading frame 21 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT064694 | CCND2 | cyclin D2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT075268 | SNTB2 | syntrophin beta 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT079668 | NAPG | NSF attachment protein gamma | ![]() |
![]() |
2 | 12 | ||||||
MIRT081651 | CCNE1 | cyclin E1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT082996 | PNPLA6 | patatin like phospholipase domain containing 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT083463 | RALGAPB | Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT085755 | RIF1 | replication timing regulatory factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT086022 | UBR3 | ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 (putative) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT087431 | ZNRF3 | zinc and ring finger 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT088786 | SOCS5 | suppressor of cytokine signaling 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT089221 | ACTR2 | ARP2 actin related protein 2 homolog | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT093696 | PI4K2B | phosphatidylinositol 4-kinase type 2 beta | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT095090 | SEC24A | SEC24 homolog A, COPII coat complex component | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT096249 | CANX | calnexin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT100215 | PPP1R11 | protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT100746 | VEGFA | vascular endothelial growth factor A | ![]() |
![]() |
2 | 12 | ||||||
MIRT100904 | CD2AP | CD2 associated protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT102647 | UBN2 | ubinuclein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT103882 | FOXK1 | forkhead box K1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT104246 | DMTF1 | cyclin D binding myb like transcription factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT106310 | ZFHX4 | zinc finger homeobox 4 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT107696 | RECK | reversion inducing cysteine rich protein with kazal motifs | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT114943 | CHAC1 | ChaC glutathione specific gamma-glutamylcyclotransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT117671 | SCAMP4 | secretory carrier membrane protein 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT133799 | SKI | SKI proto-oncogene | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT140167 | SPRED1 | sprouty related EVH1 domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT142279 | DCTN5 | dynactin subunit 5 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT143288 | N4BP1 | NEDD4 binding protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT165939 | CREBRF | CREB3 regulatory factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT175251 | PSAT1 | phosphoserine aminotransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT186381 | PNRC2 | proline rich nuclear receptor coactivator 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT191470 | PPM1A | protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT196480 | TAOK1 | TAO kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT201470 | SNRPB2 | small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B2 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT204615 | HSPE1-MOB4 | HSPE1-MOB4 readthrough | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT204646 | MOB4 | MOB family member 4, phocein | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT204749 | BZW1 | basic leucine zipper and W2 domains 1 | ![]() |
![]() |
2 | 12 | ||||||
MIRT206031 | NUP50 | nucleoporin 50 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT211196 | FGF2 | fibroblast growth factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT229353 | ZNF449 | zinc finger protein 449 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT247138 | WEE1 | WEE1 G2 checkpoint kinase | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT249461 | ZNF691 | zinc finger protein 691 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT256314 | CDC42SE2 | CDC42 small effector 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT258419 | WIPI2 | WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT265083 | CHEK1 | checkpoint kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT270561 | SETD1B | SET domain containing 1B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT274749 | RAB3IP | RAB3A interacting protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT277515 | PPP2R5C | protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT289642 | CBX2 | chromobox 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT301001 | MTMR3 | myotubularin related protein 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT307149 | CTDSPL | CTD small phosphatase like | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT309021 | USP53 | ubiquitin specific peptidase 53 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT314100 | PIK3R1 | phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT319338 | CAPZA2 | capping actin protein of muscle Z-line alpha subunit 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT320619 | ZNRF2 | zinc and ring finger 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT324285 | LURAP1L | leucine rich adaptor protein 1 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT446498 | ASCC1 | activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT448437 | TLL1 | tolloid like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT461537 | ACTR3B | ARP3 actin related protein 3 homolog B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT463162 | ZNF367 | zinc finger protein 367 | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT463493 | ZC3H10 | zinc finger CCCH-type containing 10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT465154 | TSC22D2 | TSC22 domain family member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT466418 | TFAP2A | transcription factor AP-2 alpha | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT468278 | SFT2D2 | SFT2 domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT469399 | REL | REL proto-oncogene, NF-kB subunit | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT471941 | NR6A1 | nuclear receptor subfamily 6 group A member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT473688 | MAPK8 | mitogen-activated protein kinase 8 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT479618 | CDC25A | cell division cycle 25A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT482098 | AKT3 | AKT serine/threonine kinase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT483995 | ATAD5 | ATPase family, AAA domain containing 5 | ![]() |
![]() |
2 | 12 | ||||||
MIRT485205 | PRKAR2A | protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit alpha | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT498763 | C3orf38 | chromosome 3 open reading frame 38 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT498961 | ORC4 | origin recognition complex subunit 4 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT499440 | ODF2L | outer dense fiber of sperm tails 2 like | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT500080 | L2HGDH | L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT500305 | ZNF622 | zinc finger protein 622 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT500410 | ZMAT3 | zinc finger matrin-type 3 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT500789 | TLK1 | tousled like kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT500930 | SRPR | SRP receptor alpha subunit | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT500943 | SREK1 | splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT501068 | SMAD7 | SMAD family member 7 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT501711 | PARD6B | par-6 family cell polarity regulator beta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT502627 | DDX3X | DEAD-box helicase 3, X-linked | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT502910 | CDCA4 | cell division cycle associated 4 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT502935 | CDC37L1 | cell division cycle 37 like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT504531 | ZNF620 | zinc finger protein 620 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT505106 | YTHDC1 | YTH domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT505337 | TMEM245 | transmembrane protein 245 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT505383 | TMEM100 | transmembrane protein 100 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT505678 | SESTD1 | SEC14 and spectrin domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT506157 | PLAG1 | PLAG1 zinc finger | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT506183 | PHKA1 | phosphorylase kinase regulatory subunit alpha 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT506475 | MYO5A | myosin VA | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT506826 | KIF23 | kinesin family member 23 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT507160 | GAS2L3 | growth arrest specific 2 like 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT507511 | DYNLL2 | dynein light chain LC8-type 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT507845 | CCNE2 | cyclin E2 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT510403 | ZNF507 | zinc finger protein 507 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT518078 | TRIM35 | tripartite motif containing 35 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT518982 | NNT | nicotinamide nucleotide transhydrogenase | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT521045 | SLC2A3 | solute carrier family 2 member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT521190 | SBNO1 | strawberry notch homolog 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT522088 | NUFIP2 | NUFIP2, FMR1 interacting protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT524846 | ARPP19 | cAMP regulated phosphoprotein 19 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT527787 | TMEM44 | transmembrane protein 44 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT537803 | EFNB2 | ephrin B2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT540830 | GNAT1 | G protein subunit alpha transducin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT541140 | PISD | phosphatidylserine decarboxylase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT541419 | CBX4 | chromobox 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT543517 | PRSS21 | protease, serine 21 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT543824 | GSG1 | germ cell associated 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT544959 | UGT2B4 | UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT545179 | MAP4K2 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT545335 | CCDC83 | coiled-coil domain containing 83 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT545518 | RSL24D1 | ribosomal L24 domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT545670 | DECR1 | 2,4-dienoyl-CoA reductase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT545931 | ZBTB44 | zinc finger and BTB domain containing 44 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT546102 | USP48 | ubiquitin specific peptidase 48 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT546598 | SALL1 | spalt like transcription factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT546626 | RTN4 | reticulon 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT547651 | KPNA3 | karyopherin subunit alpha 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT547987 | HCFC2 | host cell factor C2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT548717 | CRK | CRK proto-oncogene, adaptor protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT548931 | CDK17 | cyclin dependent kinase 17 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT549067 | CACUL1 | CDK2 associated cullin domain 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT549266 | ASH1L | ASH1 like histone lysine methyltransferase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT550460 | OSCAR | osteoclast associated, immunoglobulin-like receptor | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT550806 | FAM229B | family with sequence similarity 229 member B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT552024 | DNAJC10 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT552334 | ZNF704 | zinc finger protein 704 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT552732 | YRDC | yrdC N6-threonylcarbamoyltransferase domain containing | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT553795 | SZRD1 | SUZ RNA binding domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT554694 | RNF149 | ring finger protein 149 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT555133 | PTPRD | protein tyrosine phosphatase, receptor type D | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT555264 | PRDM4 | PR/SET domain 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT556848 | KANK1 | KN motif and ankyrin repeat domains 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT557474 | GPR27 | G protein-coupled receptor 27 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT558018 | EXT1 | exostosin glycosyltransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT558498 | CYP26B1 | cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT558579 | CREBL2 | cAMP responsive element binding protein like 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT558610 | COX6B1 | cytochrome c oxidase subunit 6B1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT558650 | CNKSR3 | CNKSR family member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT558986 | CA8 | carbonic anhydrase 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT559141 | BTN3A3 | butyrophilin subfamily 3 member A3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT559327 | ATP5G3 | ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex subunit C3 (subunit 9) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT562021 | LANCL1 | LanC like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT562869 | KIAA1456 | KIAA1456 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT563074 | SLC25A12 | solute carrier family 25 member 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT563496 | DLGAP3 | DLG associated protein 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT563890 | RAPH1 | Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT564311 | CCNT1 | cyclin T1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT564942 | XKR7 | XK related 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT564979 | WNK3 | WNK lysine deficient protein kinase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT565423 | TEF | TEF, PAR bZIP transcription factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT566824 | MAP3K7 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT571961 | KIF5B | kinesin family member 5B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT575877 | Cask | calcium/calmodulin-dependent serine protein kinase (MAGUK family) | ![]() |
![]() |
2 | 3 | ||||||
MIRT576523 | Txlna | taxilin alpha | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT614693 | TRAK1 | trafficking kinesin protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT616065 | ZC3H14 | zinc finger CCCH-type containing 14 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT618838 | ASAH2B | N-acylsphingosine amidohydrolase 2B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT624626 | ATXN2 | ataxin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT624652 | ASAH2 | N-acylsphingosine amidohydrolase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT640314 | MMAB | methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblB type | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT659248 | CUL3 | cullin 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT680972 | DCAF17 | DDB1 and CUL4 associated factor 17 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT682261 | RS1 | retinoschisin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT682505 | GLP2R | glucagon like peptide 2 receptor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT693904 | HNRNPA1L2 | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT699214 | SLCO3A1 | solute carrier organic anion transporter family member 3A1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT699373 | SLC30A6 | solute carrier family 30 member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT699451 | SLC16A9 | solute carrier family 16 member 9 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT701230 | OCRL | OCRL, inositol polyphosphate-5-phosphatase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT702849 | HNRNPA1 | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT706163 | CASK | calcium/calmodulin dependent serine protein kinase | ![]() |
![]() |
2 | 3 | ||||||
MIRT718990 | UTP15 | UTP15, small subunit processome component | ![]() |
![]() |
2 | 2 |