pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4680 |
Genomic Coordinates | chr10: 110898090 - 110898155 |
Description | Homo sapiens miR-4680 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4680-5p | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 5| AGAACUCUUGCAGUCUUAGAUGU |27 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | HIC2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HRG22, ZBTB30, ZNF907 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | HIC ZBTB transcriptional repressor 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_015094 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on HIC2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of HIC2 (miRNA target sites are highlighted) |
>HIC2|NM_015094|3'UTR 1 AAGCCAAAGACCCGCGGGCGCCCTCTGCCACCTTGCTCCCCGGGAACCCATGGAAGGAGAAGCGAGGTGATGCAGCAGCA 81 GGGGCAAGACCCTGGGTCCAGTGGAGGCTCCGGGTGGCCCCTCTGGCCCCCACTGCCCACACCCAGAGCTTTAATGGACA 161 GTCCGTACCAAGCAGAGCCGAGAGGAGGGAAGCCAGGGGTCCCAGCCCGTCTACCTCCCCATCCCACCCAGGCCCCCAGC 241 TCCCCGCGGGGGCCACCGCAGGGCCTGTGGGCTGGGTCACGTGGGTCTCGCTGGGACCTGGTCCCTTTGTTGCAGGCGGC 321 TTGGAGAAAGGGCAGTGGGACGCTGGCCACGGCCAGGGTGGTGTCGGGAGCAGGCCTCACCCCGCTGGCCGTGTCTGTGT 401 GTGTGCACGTGTGCTTGTGTCTGTGCGGGCGCGTGCAGCCCTGGTTCTGCAGGGAACAGGTGCTGGGGGTGCAGATCCCT 481 CCCTCCTTGAGCCAGGGTGGCACTGTTCACTGGCGCTGGGACAGTCAGGGTGACCCCACCGCCTACCTCTCTACATCTAA 561 AGAGCCCTCTGGGCCTGTGTTGCTGTTATTCCTACTGATCTGTTCCTCTGTTTTTCTTTTTGATTTTTGTTTTTTAAACC 641 AAAACAGACAATAGCTTATTTTCTTTCCGCCCCCTCCGGGGCTGAGCCTGGGTCTGAAGACTGAATGTAACAGGGGCCGC 721 TGGCACTCCTGCGCGTCCCCCGGCTCTGGCGCTGCAGGGGTGTCGGCGCGCCACCTCTCCAGGCCCCAGAAGCCCTTCTT 801 GCCCAAAGGCTTCCCTGGTCCCTGAGCCCTGCCTCGGCTGCCTCAGGGGAGAGTGCTTTTCCTGTAGTTTCCAAGGAATA 881 TTCTTTGTTTAGAGGTACTTGTTTTTTATTAAGAGAAAAACCAGTGTAACGTTTATGTGACTGTTTGAACTGGAAGGTCT 961 GGGGTTCCGGGGGGTGGGGGGAGGCTAGACTCAATGCCGGGGCCGTCGGTACTCTTGTTTTCATTTGTGTGTGCGTGCGT 1041 GTGTGTGTGTGTATGTGCGTATGTGTGTGTCTATGTGTGGTGTGTGCCGTATGCATGGGCAGATGTTTCGCTTTCCCTCC 1121 TTCCTCGCTGAACAAGGTGGAGACTTCTGACCTTTTGCTACCTCTTGAATTCATGACAACGATATGTTGGTGACTGGCAG 1201 TGGAAGCCCTTGACACTCTTGTTTTCCTTCGCTTAGCACCTAGGAAGTCGTGTGCAGGAGCCAGCAGGGCGCCAAGTGGC 1281 CCAGTGCCTGCAGCTCACCTGTGGGTTTTCCCTTTGAGCCTTTGGCCACATCCACCTCGAGGGGACCCTGGCACCCCGGG 1361 CACACAAACCTCTGTGGTATAGGTGAGGGGTGTGAGGCCCCAGCCTGGAGCCAGGCACTGGGTGCTGACAGGGGAACCAT 1441 GAGGAGGGTGGCAGGTCTTTGCAGCTCCCGGCCAGGGTGAGGCGGAAGTGAGCCCTCATCCTGCCACTCCTATCCTCCAT 1521 TCCTGCAAGAGTTTTAAGCTTGAGAGAGCTGACCACAGGGCCCCCCGGGGAACAGGGATGGCACTTCCCTGAGCAGTCCT 1601 GGCCCCCGGCCACTGTCTCGGGGCCCACCTCTCGCCCCTCATCTTGGTAATTAGCCAGCCTCAGATACTTCTGTGGGCCC 1681 TGAAGTGGGCTCTCAAGGTCAGACCAAGGTTGCTGATCTCAGTCCCACTGTCTTCAGCCAGCTGAAGCTGTGGGGCTGGG 1761 CTGGCAGCCTTTATTGTCATCTTGCTTCACCATTTTTTTTTCTCTCTCTTTTCATTCTATTTTAAGTTTAGACCAAAAAA 1841 ATACAGAGTCATCCCCTACCCCCACCCCTCTAGAGACCCTCCAGCTAAAAACAGAGCCTGAGTTCAGGGACCCAAGTGGT 1921 GAGCGGCGTCTTTTGGGGGTGAGGGAGCTTGGGTAGATGAGGCTCCTGGCTGAGCCCTCCCTGTGGTGATCCCAGCCTAA 2001 GATGGCCCCTCTTCCCTCCTGGTGGGAGACAGAGGACTGGACCCTGGGTCTCAGGTTCCAGCAAGTCAGGCTAGGGACCT 2081 GGGGGGAGGAGACCCATGGACTTCACCCATACTCAGTGAGGGGGCTCCTGCCGTCCTGACGCCACCCCGCCCCATCAGCA 2161 CTTAAGCCACATGACACAAAGTCTGTACCGCACGGGAAATGTTCACGCGCCTGGCCGTGTGCATGGCCTCCCGGGCTGTG 2241 GGCAGCCGCATCTGTGAGGTGACTCGTGAAAGTAGGTGATTCCTTTGCAGAACTTCAGGGACTGGGAGCAGAGGCCCCTC 2321 ACTCAACGACGTTTGTGCGACATAGTATTGTATCCACCTTAGTATTGTATCGAGCCTTTTCTGTGTTTTAATGAGAAAGC 2401 AGAACACTAGTTTCCTATTTAAGACTTTAAGGGTTTGTGGGGCGGGGCGGGATTAACACAACATTTGGCTTTGTTTTCTT 2481 TTTCCTTTGATTTCCACATCAGGTGTGTGCGAGTGTGTGTGTGTGGAGATGTTAAGAGCCTCACAAGGAAACTGGGTTAT 2561 TGGAGGCCAAGGCGGCTTACAGTTCTCTGCGTTCGTCACTTAATTCCTGAATGTTTCAGAGAAACAGGAATCAGAAAATA 2641 GCAGATATCATGTAGGAAAGAGAGGATAAACAAAGAAAAAAGAAAAAAAAATAAGCTCATACCCAAATTCACAAAGCCTA 2721 TTTTTTAAACCAAAGCACATTTTGAATGAGTATGGAACCTCCATGGGCTCAGAAAAAAGATGCTAATATATTTATCTCAT 2801 TGTTTACATAAGCTTTTACAGTTTCAGACCTCAGCAGCTGTAAGGCCAGTCCAGGGAACCCTCCCCTGCTGCTGGAAACC 2881 CTTCTGAGTTGGCCCTGGAGTGGCTCACGGGCAGAGAAGGGTAGCCCTGGGGCTGGGGGAGGGATTGGAAGCCTCCCTGG 2961 AGTCACCTGAGCCCTCGTCCCCATTCCCAGGGCCCCTCCAAGCCCAGCTGGCACCAAAGAGCTTGGGCCCGTGCTGACCA 3041 GCCCCCAAGGCCCTCTGGCCGGACCATGCTGGTCCTGACCAGCTAGCCTACGCGGGGATGGCCGTCAGTTCTGGCCACAG 3121 GACCCGAGTCTGGGCTTGGGTCCCCCTGCTGCTCTGCCCGTGACCCTTGGGGATGGGTTGATGCGAGGGTCCCACTCAAG 3201 CCAAAAAGCCGGGACCTTTGCGCAGCTCTGTCGACTCTGGTGGGTCCCCACTCCTGGGGCCCCCTAACCCCACCCCAGGC 3281 AGCGGAAGGGGCTGACTGGGTCTGGTCCTTACCAACATAGACGGTGCAAACACTCTTAACAGTGTTGTTTTTGTATCAAT 3361 ATGTTTGTGCAGTGATGAATGTATTTATTTCTCAGACTTGGGGCGAGTGAGCGGGTGGCAGGCCGGGCTCCGCCACTGCA 3441 TGCTCCCGCCGGACCGAGCCCCAGCAAGGGCTCCTCCAGGATTGCAAAAAAAAAAGGAAGAGAAAAGATGAACCTTTAAG 3521 CAAATAAGAATCTCAGAGACTCGCAGCATAGCCATACACCTCAGCCTGTGAAATGAACGATCCGGACCCTCACCAACTTT 3601 CCCCACCTCAGGCAGCCCTGTGTGTTTACCGTTCATCACCACTCGGGGGCACCGGGCCGCCCACCCACTCCCAAAATCCG 3681 TCAGTATTCACTGGACCTCAGGCCCTGTGCAGGAGTGCGATCCGGGCTGGGCCGCTGGGCAGGCTGACCCCCTGCCCTCC 3761 TGCGGCCATCCTGAGTTGGGGTGAGGCCTGGGCAGCCGGAGGGCAGGGCTCAGGGAGCAGGAGGCTGCATCCGTCCACCC 3841 CCAGGCGTGGGGGACAAAAGCCAAAGGTGCCAGGCCTTAGAGCAGACAAGGGCTCTCAGCCCTGGCATGCCCCCTAAAGG 3921 GACCAAGGTCCTCCTATTTCCCAGAACCCCGTTGGGGCAGATGTTACTGAACCTGTGAATCAGACGCCAGGAGTGAGGGC 4001 TGGGGAGGGACCTAACTGGAGCCTCAGTCTGACATTCCACGCCGGGGTGGGGGTGGGCATGAGCGGTGGGAACTGAGGCT 4081 GCCCAGGACCCCCTTCCTAGGATGCCCCGGCTTCAGTCACCCCACTTTAACTTTCTACCAGGACCCCCTCCCCCTACCTC 4161 ACCTTGCTATTTATTGCTGTAATTTATTGACCTCAAAAATGCTGCATAACAGACCTCACTGGGGCAGGGAGGATCCCCAG 4241 GGCTCCCACCCTCCACTTGGCGGGCCCCGTGGGGCCAGGTGCTGAGGGGAGCCTCTCTACCCCACCCATCACTAGCTTCC 4321 CTCTGCCCTCTCCCACCCCGGGGGGGACCCAGGTTGGGCACTGGCTCATTTCTCGCAAATACCTCGAAGGGGAGGGGGGA 4401 GGGATGGGGTTATAGCTGTTTTGTTTAATTGGAACTGGAAGAGGGATCATGTTTTGTTTTATGCCCTTCCCAGAAGGGGG 4481 GAGGGACACCGGGATCGCACTCCTGTACTGGCCACCGCCGCTGTCACTTGTCACATTGAGTTCATGTCCCTTGAGAGTTT 4561 GTATAAATTCAGGTCAGAGCTGCAGCTACACAGCTGCCCAGTGTCATAGAAAAGCAATTCACCAACGACTGATCTCTCCA 4641 TTCAGAAGTGTGCAGTCTTAAATGTACAGCGATAAGAAACTGTTATTTTATGATCTTTTCATTAAAAGCTTGATTGAAAA 4721 AAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | C8166 |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
PAR-CLIP data was present in GSM1462572. RNA binding protein: AGO2. Condition:C8166 NL4-3
... - Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al., 2013, mBio. |
Article |
- Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al. - mBio, 2013
UNLABELLED: The question of how HIV-1 interfaces with cellular microRNA (miRNA) biogenesis and effector mechanisms has been highly controversial. Here, we first used deep sequencing of small RNAs present in two different infected cell lines (TZM-bl and C8166) and two types of primary human cells (CD4(+) peripheral blood mononuclear cells [PBMCs] and macrophages) to unequivocally demonstrate that HIV-1 does not encode any viral miRNAs. Perhaps surprisingly, we also observed that infection of T cells by HIV-1 has only a modest effect on the expression of cellular miRNAs at early times after infection. Comprehensive analysis of miRNA binding to the HIV-1 genome using the photoactivatable ribonucleoside-induced cross-linking and immunoprecipitation (PAR-CLIP) technique revealed several binding sites for cellular miRNAs, a subset of which were shown to be capable of mediating miRNA-mediated repression of gene expression. However, the main finding from this analysis is that HIV-1 transcripts are largely refractory to miRNA binding, most probably due to extensive viral RNA secondary structure. Together, these data demonstrate that HIV-1 neither encodes viral miRNAs nor strongly influences cellular miRNA expression, at least early after infection, and imply that HIV-1 transcripts have evolved to avoid inhibition by preexisting cellular miRNAs by adopting extensive RNA secondary structures that occlude most potential miRNA binding sites. IMPORTANCE: MicroRNAs (miRNAs) are a ubiquitous class of small regulatory RNAs that serve as posttranscriptional regulators of gene expression. Previous work has suggested that HIV-1 might subvert the function of the cellular miRNA machinery by expressing viral miRNAs or by dramatically altering the level of cellular miRNA expression. Using very sensitive approaches, we now demonstrate that neither of these ideas is in fact correct. Moreover, HIV-1 transcripts appear to largely avoid regulation by cellular miRNAs by adopting an extensive RNA secondary structure that occludes the ability of cellular miRNAs to interact with viral mRNAs. Together, these data suggest that HIV-1, rather than seeking to control miRNA function in infected cells, has instead evolved a mechanism to become largely invisible to cellular miRNA effector mechanisms.
LinkOut: [PMID: 23592263]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1462572 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | C8166 / C8166 NL4-3 |
Location of target site | ENST00000407464.2 | 3UTR | CCUGUACUGGCCACCGCCGCUGUCACUUGUCACAUUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23592263 / GSE59944 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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133 hsa-miR-4680-5p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT378771 | MACC1 | MACC1, MET transcriptional regulator | 2 | 2 | ||||||||
MIRT393867 | ZDHHC21 | zinc finger DHHC-type containing 21 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT446684 | C2CD2 | C2 calcium dependent domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT447600 | MRPL3 | mitochondrial ribosomal protein L3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT450708 | RNF152 | ring finger protein 152 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT450784 | PAPOLG | poly(A) polymerase gamma | 2 | 2 | ||||||||
MIRT454623 | COL23A1 | collagen type XXIII alpha 1 chain | 2 | 8 | ||||||||
MIRT461620 | PTCD3 | pentatricopeptide repeat domain 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT462695 | SNRPD3 | small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide | 2 | 2 | ||||||||
MIRT475530 | HOXA3 | homeobox A3 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT475739 | HERPUD1 | homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT489676 | CYP1A1 | cytochrome P450 family 1 subfamily A member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT490610 | SLC47A1 | solute carrier family 47 member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT493628 | HIC2 | HIC ZBTB transcriptional repressor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT496152 | RPS15A | ribosomal protein S15a | 2 | 2 | ||||||||
MIRT499232 | VAV3 | vav guanine nucleotide exchange factor 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT501496 | PRICKLE2 | prickle planar cell polarity protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT507163 | GAS2L3 | growth arrest specific 2 like 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT512389 | MTRNR2L1 | MT-RNR2-like 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT514626 | MTRNR2L7 | MT-RNR2-like 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT517474 | PEX26 | peroxisomal biogenesis factor 26 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT525332 | CNGB1 | cyclic nucleotide gated channel beta 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT526685 | BAK1 | BCL2 antagonist/killer 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT527317 | CCR2 | C-C motif chemokine receptor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT527608 | EYS | eyes shut homolog (Drosophila) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT528794 | RAB32 | RAB32, member RAS oncogene family | 2 | 2 | ||||||||
MIRT531048 | TIPARP | TCDD inducible poly(ADP-ribose) polymerase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT532254 | TBPL2 | TATA-box binding protein like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT533801 | TMED7 | transmembrane p24 trafficking protein 7 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT535887 | MLEC | malectin | 2 | 2 | ||||||||
MIRT540704 | PDPK1 | 3-phosphoinositide dependent protein kinase 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT544645 | PHF8 | PHD finger protein 8 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT545760 | HS3ST1 | heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT555310 | PPP2R5C | protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma | 2 | 2 | ||||||||
MIRT555877 | PAFAH1B2 | platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT559507 | ARID5B | AT-rich interaction domain 5B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT560448 | SLC30A7 | solute carrier family 30 member 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT561262 | ZIK1 | zinc finger protein interacting with K protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT561795 | PAWR | pro-apoptotic WT1 regulator | 2 | 2 | ||||||||
MIRT567007 | KLHL15 | kelch like family member 15 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT569298 | SURF6 | surfeit 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT570606 | MTRNR2L11 | MT-RNR2-like 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT572888 | ADCY2 | adenylate cyclase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT573119 | ADAMTS18 | ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT608332 | ZNF670 | zinc finger protein 670 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT614942 | KCNK5 | potassium two pore domain channel subfamily K member 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT615324 | ERN1 | endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT618441 | ZNF800 | zinc finger protein 800 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT620110 | HARBI1 | harbinger transposase derived 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT626008 | ZNF517 | zinc finger protein 517 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT626626 | SLC30A6 | solute carrier family 30 member 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT627842 | POU3F1 | POU class 3 homeobox 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT628386 | CACNB2 | calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT629305 | PTPLAD2 | 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT629864 | GATAD1 | GATA zinc finger domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT630444 | IDE | insulin degrading enzyme | 2 | 2 | ||||||||
MIRT631854 | PIGG | phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class G | 2 | 2 | ||||||||
MIRT633173 | AGO3 | argonaute 3, RISC catalytic component | 2 | 2 | ||||||||
MIRT633477 | ZNF724P | zinc finger protein 724 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT634395 | PLSCR1 | phospholipid scramblase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT635538 | TRIM72 | tripartite motif containing 72 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT635821 | OPA3 | OPA3, outer mitochondrial membrane lipid metabolism regulator | 2 | 2 | ||||||||
MIRT636169 | TIMM8A | translocase of inner mitochondrial membrane 8A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT636797 | CYB5D1 | cytochrome b5 domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT637952 | IVD | isovaleryl-CoA dehydrogenase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT645136 | HES2 | hes family bHLH transcription factor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT645667 | ADK | adenosine kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT646148 | FLVCR1 | feline leukemia virus subgroup C cellular receptor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT647004 | NCR3LG1 | natural killer cell cytotoxicity receptor 3 ligand 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT648187 | C2orf68 | chromosome 2 open reading frame 68 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT650090 | TERF2 | telomeric repeat binding factor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT650329 | RTN2 | reticulon 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT654224 | RNF165 | ring finger protein 165 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT654545 | RAB1A | RAB1A, member RAS oncogene family | 2 | 2 | ||||||||
MIRT656457 | MAPK14 | mitogen-activated protein kinase 14 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT656828 | KLF8 | Kruppel like factor 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT657112 | ITPRIPL2 | inositol 1,4,5-trisphosphate receptor interacting protein like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT657930 | GATSL2 | cytosolic arginine sensor for mTORC1 subunit 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT659375 | CREG2 | cellular repressor of E1A stimulated genes 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT659833 | CARHSP1 | calcium regulated heat stable protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT662108 | LACTB | lactamase beta | 2 | 4 | ||||||||
MIRT662789 | TBC1D25 | TBC1 domain family member 25 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT669501 | ARL3 | ADP ribosylation factor like GTPase 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT669759 | ZNF101 | zinc finger protein 101 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT669800 | GAN | gigaxonin | 2 | 2 | ||||||||
MIRT670050 | RPP14 | ribonuclease P/MRP subunit p14 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT670299 | RBBP4 | RB binding protein 4, chromatin remodeling factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT670388 | EMP2 | epithelial membrane protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT672862 | C22orf29 | retrotransposon Gag like 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT672890 | FXN | frataxin | 2 | 2 | ||||||||
MIRT673210 | C10orf76 | chromosome 10 open reading frame 76 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT674001 | KCNN3 | potassium calcium-activated channel subfamily N member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT674163 | BLOC1S3 | biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT674502 | TIRAP | TIR domain containing adaptor protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT675470 | NUBPL | nucleotide binding protein like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT675671 | TMOD2 | tropomodulin 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT676006 | CRKL | CRK like proto-oncogene, adaptor protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT676074 | TIMM50 | translocase of inner mitochondrial membrane 50 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT676386 | SEC24D | SEC24 homolog D, COPII coat complex component | 2 | 2 | ||||||||
MIRT676764 | SNX2 | sorting nexin 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT676896 | GABPB1 | GA binding protein transcription factor beta subunit 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT676978 | ZNF708 | zinc finger protein 708 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT677236 | C15orf40 | chromosome 15 open reading frame 40 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT677369 | HSPA4L | heat shock protein family A (Hsp70) member 4 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT677464 | PDLIM3 | PDZ and LIM domain 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT678081 | EIF2A | eukaryotic translation initiation factor 2A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT678093 | ATCAY | ATCAY, caytaxin | 2 | 2 | ||||||||
MIRT678324 | FBLIM1 | filamin binding LIM protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT678417 | ANKRD36 | ankyrin repeat domain 36 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT678521 | ZNF347 | zinc finger protein 347 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT678700 | TRIP11 | thyroid hormone receptor interactor 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT678829 | PDE6A | phosphodiesterase 6A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT679991 | RUNDC1 | RUN domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT680751 | PSD4 | pleckstrin and Sec7 domain containing 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT681249 | ZNF383 | zinc finger protein 383 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT681422 | GTF3C6 | general transcription factor IIIC subunit 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT681948 | SLC19A3 | solute carrier family 19 member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT689278 | C5AR2 | complement component 5a receptor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT690389 | PARP15 | poly(ADP-ribose) polymerase family member 15 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT691845 | OSCAR | osteoclast associated, immunoglobulin-like receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT693863 | IYD | iodotyrosine deiodinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT696002 | DNAJC10 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT701930 | MLLT1 | MLLT1, super elongation complex subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT702341 | KLHL7 | kelch like family member 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT703557 | FKBP14 | FK506 binding protein 14 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT705033 | CACUL1 | CDK2 associated cullin domain 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT706341 | STAC2 | SH3 and cysteine rich domain 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT709671 | RGP1 | RGP1 homolog, RAB6A GEF complex partner 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT711212 | EFHB | EF-hand domain family member B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT718342 | PURA | purine rich element binding protein A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT722755 | SIRPB2 | signal regulatory protein beta 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT723535 | NFATC2IP | nuclear factor of activated T-cells 2 interacting protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT724498 | BFAR | bifunctional apoptosis regulator | 2 | 2 |