pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-6132 |
Genomic Coordinates | chr7: 117020211 - 117020319 |
Description | Homo sapiens miR-6132 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-6132 | |||||||||||||||
Sequence | 21| AGCAGGGCUGGGGAUUGCA |39 | |||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | AKAP11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AKAP-11, AKAP220, PPP1R44, PRKA11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | A-kinase anchoring protein 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_016248 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on AKAP11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of AKAP11 (miRNA target sites are highlighted) |
>AKAP11|NM_016248|3'UTR 1 AGCAAACCCCAAACCAGTATATTTTAGTATTTGTTTGGGGAGGGGAACAAGCCAATAAAGATGTTTAGGATAAAATTTGA 81 ATAGTGAATATTAACATCGTAAGTCAGTTGGGAGGCAAGTAAATATAGCTTTCTGAGCGCTTTGTGTTATCACTCGGTGT 161 ATATAGTTCATACTTTTGTAATCTGTCAAAATACTACCTTCATTTATTCTTCTATACACATGTGTAGTGTGTCAAGACCC 241 TAAGAACATGTATTTGAAGGAAGGTCTAACCAGGGGGTTTTCAGGGGCATTGTCTGACCACATTCTTTTTGTATCCAAAT 321 AGTGCTGCTAGAAACTGCACTGAAGTGGCTGAGGATAGGTTCCAGTGATAGAGTTATAATTTTGCTCCTTTGCAAACAAA 401 TGGTATCTAATTAATAACTAGTCTGACATCAGAAAATAAAATTGAGGCTGATTTTTAAAAATTTCTAGTAGATTTTTGGC 481 CTTTCCTGTTTTTAAAAATCAGTTTCATTTTCATATTTCATAGATCAGCTATTGGTAGCTTTTTGATTTCCCCAAACTAT 561 TTAATTTCTTAGCAGAAACATTAGTATTTTAGGTTTCTATAAACACTATAAGTGATAGTTTCCCCCATCCTTTCATTGAC 641 ATTATTTGCCAATGCTGCCAGTCATTCTGGCATGAAAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 721 GTAAGGGAGTACTTTAACCTTGCCAGTTTGTTCCCTCTTTTATTTTACTGTTTTCTTTTTAGAAACCCACTGTTAAAATT 801 TAAAAAGGTGCTTTAAAATAAAACGCCTATAAAGATTGTGCAGTAAGAATTTTTATTGACAATAATTAAAATTTTTTTTG 881 ACAATTTTGGGTTCCCAACTTATCTTACAAGTGAAAACTTAAATTGTAAAACATGTTGAAATTTTAAAAATTAATGTTAA 961 TATGGAAATGCATTTAGAGAAGCCCAGTAGTTTTTATTGTTGGATTTTTGAAAAAACCTCTACCAAGAATGTGGTGTTTT 1041 TTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTAGAAAAATTGGGATTTCCCCCCACCCCGCCCCACCCAGATAAACTATATCTACAC 1121 TGTCTCGTCAAGTTCTCTGACACGATCTTTCTGGGCTCTACATTTCCTACTAGTTTGTGTCCAGAAACTGCAAGTTGACA 1201 TGAATAGAGGACAAAGGTTGTGTCTTGCTTTTGTCTCTCTCTTCCCTCCCTGCAACTCTCTCTCCCCTCCTCCCACTCTC 1281 TTCCCCCTCCCCCCTCCTCCCACTGTCTCTCACCTCCCCCACCCCCCACTCTCTCTCATCTCTCGCTGTGTCCTGTGTAT 1361 GTGTGGGTGTGTGTGTATTTGGGTGTGTAAATGTTGGTTCTTCCACTACTGGATTTTGTAATCTAGGATAAATCACTTTT 1441 TTTGGGGACTTTGATTTTGCTCCATTACGTTTTCATTTTTTCTGAGCACTGACTGTTCTGAAAGCTGCACAAAACGTAGA 1521 AAGAAGACATAGCGCCTGCCAGGGAATAGGAAATGAGGGCACTTACACATTAATGTGAATTAGTAATTGTGGTATAGAAA 1601 TGTTTTATAGTGAAAGATTCAAATTTGCTTTTCAAGAAAAATGCCAAAAGCTATTTAAATAATTCGAGGTTACATCGTAG 1681 GTTTTGATTTTTCTCAATTTAAGATACAGAAATACAGCAAGCCTTAATATAAAGTTTCCTAAAGTTTCTTCAAGTATTTT 1761 TTAAGGTGGAGAAATGCAGGAATTGTATAACCAGAATTGTTCCTGCCTTTAGCTTTTCAGAACTTGAGATGTGGCAGCAC 1841 TGGACTGGGTTTTTTTAAATGTTAGGACTAGGAATGTTTGCTCTTGTTAATTATGAATTAATTGATTATTAAGTTTAGAA 1921 TGCATTTTTACAAGTATCTAACTATCAAATTGTGTTTAGTAACTTGAGTGTATGCACAAGTTTGATCAACAGCAAAATAG 2001 AGTTCTGAATTTCTTTTAAAGTGATGATATATTATTTTGTGAAACTTTGTGTTTGAAAATGTTTATTTCTGTTTATGGTG 2081 TAATCATTCTGAGGTGAGGCTTTTCTTATTTCCTTTGCATTTTGCTAGAGCTGTGCTGAGTTCAGCATTTGCTTATTTAA 2161 CCACTACATAATGACAGACCAGTTATTAGGTATTAGCATGTGTGGTAATAATAATAGTGGAACTTCACACTTACATCAAT 2241 TCAGTGCAGGGGCATAGAATAAAATATTAAATATTGGCAGATGTATGAAAAGAAGTGTGAGTTAAAAATATTGAATATTG 2321 GCAGGTGTGAAAACAAGTGTCAAAATTCCTCATATAGAGAAAATAATTTTGAGTTTAGAGTATTATCTTTTAATTAAGTG 2401 TAGTCTAAACTTAACTTTCTGTAAAGGCACTTTGTGGTTTTTCCAAAGATGTTCTAGATCTATTTGGTTGCTCTATAGTC 2481 AAACAGCTCTTTTGAAGACAACTGTCTTATTTTATTACAAATTGGCTTGACATATTTATACTGTAACATTGTAATATTGC 2561 TGTGCTGTACATTTTGGCCCTTACGAAATACGTCTTTTTCAGAACTGTTAAAGTTTTGATGTACATCGAGCTGAATTCTG 2641 TTTTTACCAGTTTCAAAACCTTCAAGTGATATGTGGAAAAAAGTGAATGAGACCTCTGATAGGGGGTTTTCAGAACCTTG 2721 TTCACACCAAAATGTGACAGTTCTTTCATGTTTTCCTAAACCAAGTTAAAATTACATGTATATTTTGGTGTTAAGGTTGA 2801 TTTTTAAGATACTTCTGATTTGTACAAAAGGAATGTTTCCTTTATAAATCACAGAAGAAAATGACAATATCTGTTGGATA 2881 TTTGATATAATTTAATGGTGTTATAAAACCTTTAAGAGGATTCATGGTGAATATATGTGATAACATCTTTATACTTTGAA 2961 AAATGTTCCACTTACCCTTCAGATATTTGTTGTAAGTTAATTCAATTCTTAATACTTTAATTTTGCTCCAACAAGGGCTT 3041 TATGTTGCTGGTAAGAGAATTTATTTACTAAATGCACTATGTATAAAGTGAAAGATAGTTTACTTATCTGACTTTGATAT 3121 TAGATGGCTGACATTAGTGCACATAATGCAGAGTTTAACCTTGATTCTTCAACAGAGTCCAGATTTAAATGTCTACTTAG 3201 TTAATTAGTTAGCTGATATTCTTCCACAATTAATATATTCAATTTCCCATCAGTATATCACTTTAAATTTTATGTTTTTC 3281 TAAGGAAACTTTCCACAGAATTTTAAACAACTGATGCATCCATACTCAGGGTGTAGGGAGAATACTTTGCATTTAAAAAC 3361 CCTGTCCACCTGTCACCAGCACAAGAGAATTAGAGCTTCAGTGAGAATTTAGAAAAATTATACTAAAGTGAGATGCATTT 3441 TTTCTCATTTTCAGCAAGACTCCTCTAAGCATTTACTCATTTACTGTATTCCTGCTCTGAAGATGTGGATACAGAATTAG 3521 TCACTCTTGTCACTTTATTTATTTATTGGTTTTTTTTTAACCATCTGTGTACATTCCTTTCATAGGGTAGAGTTCTAGTT 3601 CTAGAAGTTCTTATTTTGTTTTTGTTGTAATGTTTGAATACTATTTAATATCCGGTTTTAATATTGCTGGATTTGCTACC 3681 TTTGGTTACTTGTGCAGTGTTAAAAGTAATCCACTTTCTTGTTTAATATACCAGATACATAGCAAAAGCAGCTTGGAATA 3761 ATTATAGCTGTTTATTTGGCTGTGCTCAGTTACTATATTAAGATCTTGTACTGTGTAACAGTAACTCTTTTTTGCTTTTC 3841 AGTAATTTAATATGTTCACTTAACAAAATACGAACTTTGAGATGCACTAAAGTTTTGTTTCAGCAGTGGCTCAAAAAATT 3921 TCAGAAATTACTTTTGTAATTATTTGCAATTAATTGTTCTTTTATCTTACAATTGTTTAAGCCTGTGATCTTTCTTCTCC 4001 CAGCTAAGAGTTCTTCAATAAATTTAAGAAATACCTGGTAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | C8166 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
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PAR-CLIP data was present in GSM1462572. RNA binding protein: AGO2. Condition:C8166 NL4-3
... - Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al., 2013, mBio. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Whisnant AW; Bogerd HP; Flores O; Ho P; et al. - mBio, 2013
UNLABELLED: The question of how HIV-1 interfaces with cellular microRNA (miRNA) biogenesis and effector mechanisms has been highly controversial. Here, we first used deep sequencing of small RNAs present in two different infected cell lines (TZM-bl and C8166) and two types of primary human cells (CD4(+) peripheral blood mononuclear cells [PBMCs] and macrophages) to unequivocally demonstrate that HIV-1 does not encode any viral miRNAs. Perhaps surprisingly, we also observed that infection of T cells by HIV-1 has only a modest effect on the expression of cellular miRNAs at early times after infection. Comprehensive analysis of miRNA binding to the HIV-1 genome using the photoactivatable ribonucleoside-induced cross-linking and immunoprecipitation (PAR-CLIP) technique revealed several binding sites for cellular miRNAs, a subset of which were shown to be capable of mediating miRNA-mediated repression of gene expression. However, the main finding from this analysis is that HIV-1 transcripts are largely refractory to miRNA binding, most probably due to extensive viral RNA secondary structure. Together, these data demonstrate that HIV-1 neither encodes viral miRNAs nor strongly influences cellular miRNA expression, at least early after infection, and imply that HIV-1 transcripts have evolved to avoid inhibition by preexisting cellular miRNAs by adopting extensive RNA secondary structures that occlude most potential miRNA binding sites. IMPORTANCE: MicroRNAs (miRNAs) are a ubiquitous class of small regulatory RNAs that serve as posttranscriptional regulators of gene expression. Previous work has suggested that HIV-1 might subvert the function of the cellular miRNA machinery by expressing viral miRNAs or by dramatically altering the level of cellular miRNA expression. Using very sensitive approaches, we now demonstrate that neither of these ideas is in fact correct. Moreover, HIV-1 transcripts appear to largely avoid regulation by cellular miRNAs by adopting an extensive RNA secondary structure that occludes the ability of cellular miRNAs to interact with viral mRNAs. Together, these data suggest that HIV-1, rather than seeking to control miRNA function in infected cells, has instead evolved a mechanism to become largely invisible to cellular miRNA effector mechanisms.
LinkOut: [PMID: 23592263]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1462572 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | C8166 / C8166 NL4-3 |
Location of target site | ENST00000025301.2 | 3UTR | UCUCUCUUCCCUCCCUGC |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23592263 / GSE59944 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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82 hsa-miR-6132 Target Genes:
Functional analysis:
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Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT067294 | NECAP1 | NECAP endocytosis associated 1 | ![]() |
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2 | 10 | ||||||
MIRT100110 | ABT1 | activator of basal transcription 1 | ![]() |
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2 | 8 | ||||||
MIRT358583 | CANX | calnexin | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT445247 | SEMA5A | semaphorin 5A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT445764 | CCND3 | cyclin D3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT452388 | LY6E | lymphocyte antigen 6 family member E | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT452829 | FAM131B | family with sequence similarity 131 member B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT453450 | GLG1 | golgi glycoprotein 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT455435 | ID3 | inhibitor of DNA binding 3, HLH protein | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT460629 | IGFBP4 | insulin like growth factor binding protein 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT461607 | DPH2 | DPH2 homolog | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT461989 | PACSIN1 | protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT464258 | VCL | vinculin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT465713 | TNFAIP1 | TNF alpha induced protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT466475 | TECPR2 | tectonin beta-propeller repeat containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 7 | ||||||
MIRT467119 | SRGAP1 | SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT468299 | SFT2D2 | SFT2 domain containing 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT469696 | RAB5B | RAB5B, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT469904 | PTRF | caveolae associated protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT470015 | PTPLB | 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT471385 | PDPR | pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT471409 | PDP2 | pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT471719 | OTUB1 | OTU deubiquitinase, ubiquitin aldehyde binding 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT473608 | MARK2 | microtubule affinity regulating kinase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT476328 | GLTSCR1L | BRD4 interacting chromatin remodeling complex associated protein like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT479448 | CDK6 | cyclin dependent kinase 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT482032 | AMER1 | APC membrane recruitment protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT482360 | AGO2 | argonaute 2, RISC catalytic component | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT484661 | HOXD3 | homeobox D3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT486828 | NDOR1 | NADPH dependent diflavin oxidoreductase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT487069 | CLASP1 | cytoplasmic linker associated protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT487196 | NFASC | neurofascin | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT487448 | TFAP2B | transcription factor AP-2 beta | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT487517 | GXYLT2 | glucoside xylosyltransferase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT487640 | BRSK2 | BR serine/threonine kinase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT487755 | SKI | SKI proto-oncogene | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT489944 | CPLX1 | complexin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT491101 | MSI1 | musashi RNA binding protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT491181 | LAMA5 | laminin subunit alpha 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT492355 | SEMA7A | semaphorin 7A (John Milton Hagen blood group) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT493918 | FAM127B | retrotransposon Gag like 8A | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT493932 | FAM127A | retrotransposon Gag like 8C | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT494679 | ARID3A | AT-rich interaction domain 3A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT494814 | AKAP11 | A-kinase anchoring protein 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT494835 | ADCY9 | adenylate cyclase 9 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT495455 | PNMAL2 | paraneoplastic Ma antigen family member 8B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT496962 | MAP1LC3B | microtubule associated protein 1 light chain 3 beta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT526228 | MTRNR2L5 | MT-RNR2-like 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT531028 | TDGF1P3 | teratocarcinoma-derived growth factor 1 pseudogene 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT557110 | HOXA3 | homeobox A3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT560514 | POGK | pogo transposable element derived with KRAB domain | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT567753 | DLC1 | DLC1 Rho GTPase activating protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT569608 | TRIM29 | tripartite motif containing 29 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT570242 | CPNE5 | copine 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT572327 | HSPB6 | heat shock protein family B (small) member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT572373 | ATOX1 | antioxidant 1 copper chaperone | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT575024 | Tecpr2 | tectonin beta-propeller repeat containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 5 | ||||||
MIRT576146 | Hmox1 | heme oxygenase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT612443 | SMOC2 | SPARC related modular calcium binding 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT615404 | VDAC2 | voltage dependent anion channel 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT629114 | CYCS | cytochrome c, somatic | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT631362 | FOXI2 | forkhead box I2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT639322 | THBD | thrombomodulin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT643797 | ABCC12 | ATP binding cassette subfamily C member 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT669687 | ABLIM1 | actin binding LIM protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT670595 | LLGL1 | LLGL1, scribble cell polarity complex component | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT691190 | NIF3L1 | NGG1 interacting factor 3 like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT691688 | FLOT2 | flotillin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT697127 | OTUD5 | OTU deubiquitinase 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT700814 | PHLDA2 | pleckstrin homology like domain family A member 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT701248 | NUP35 | nucleoporin 35 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT702362 | KLHL15 | kelch like family member 15 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT703325 | GDPD5 | glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT706060 | PKD1 | polycystin 1, transient receptor potential channel interacting | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT710475 | CDH5 | cadherin 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT713018 | SLC4A2 | solute carrier family 4 member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT716427 | RAB15 | RAB15, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT718093 | ABHD12 | abhydrolase domain containing 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT718542 | PIGQ | phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class Q | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT719122 | CACFD1 | calcium channel flower domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT721393 | LDLRAD4 | low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT736283 | CDC42 | cell division cycle 42 | ![]() |
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2 | 0 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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