pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-6515 |
Genomic Coordinates | chr19: 12940484 - 12940540 |
Description | Homo sapiens miR-6515 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-6515-3p | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 38| UCUCUUCAUCUACCCCCCAG |57 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | PRELID2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | PRELI domain containing 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_138492 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_182960 , NM_205846 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on PRELID2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of PRELID2 (miRNA target sites are highlighted) |
>PRELID2|NM_138492|3'UTR 1 AGAATCATCAGAGAGCTGTATCCATGTCTACTTATTTATTTATTTATTTTTTTTTTGAGAATCACTTCTTGGCCACAGCA 81 CATCACAGACACAGTTTCTGGAATACAGGTTTGAGGATACAGTGTTGGCAGCTTCAAGAAGAGAAGACCTTCTTGCCAGG 161 ACATAAAATGATACCCTCCTCTGGGAGCCTGCTTCGAATAGTGGGACTCAGGGAGATAAGACCTTCTTGCTGGATTTTTA 241 TGACACAATCTCTTTATAATTTTACAAATAAAGGAAAAAAGAACCATGTAAGATATGTGTGCCCTTCCTCAGGGTGTTCT 321 GCTGGTTGTCTGATGATGGTGTCAGGGCAGCTAAGGACAGGATAAAGGCCTGGAGAGGGTGCTTGTGCCCTTATGTTATC 401 AGCACCGTTGTTCCTAGGATTCGTGAGGGGATTCTGGAACCAATAAGGGAGTTGAACTGGTACCTGATTCACGGGTGGAC 481 TGGAACAAACAGGAATGTACCAGACCTATGTTGAAGCTAAGCCGTATTTATAACAATGTTTAAGATTCTCAGAAATCAGG 561 AGATTTTTATCCTATCCATAAGTAATATGTAACTGCCATAAGTATAGCTTTTAGAATGTAATATGTAAACTGTGATTTGG 641 TCCTCTGGAAAAAAAAAAATGAAATGAAGAGTGGGAAGGCAGTTTCTTTTCTGCTAATTCGTTCTGTGATGGTGAGCAAG 721 CAAATCATTAACCTCTCTGTTTTTTATTGGGCAAATGGGGATAATCAGGCACAGGTCTTTCCGCCAATGCGTTATGATGA 801 TTAAAGAAGGTAATTTTGTGCAGGGTTTTAAGTCAACAGACAGACCTGGGTTTGAATCCAAGTGCTGGCACCTACTTGCT 881 CAGTGATCATGAACACAATTTTAAATCTTTCTGAATCTCATTTAAAAAAATTTGTGAAACAAGATGATAGAATTAATTTT 961 GTGAGATTGTTGGACTGATTTGAGATCATGCCTATGAAGTACCTAGCACACTGCCTAGTACATAGTAGAAGTCCAGGAAA 1041 TGGAAGCCATTATTATGTAAAACATTTTGCAAAGGTACTTTTTAACTGTAACGTAAAGTGGTACTACTGTTTGAAACTTA 1121 GATGGCAGTAGTTTGCATTTCTCGTGATCAGAAGCCAAAATATAAATACATACTACCTAAAAAATCTTGAAGAGAGGTAA 1201 TAATTTGAAATTCATCTTCTTAAGATAAAAATCAGGGCAGGGTGTGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAG 1281 GCCGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATA 1361 CAAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCTAGCTACTTGGGAGTCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAAC 1441 TCAGGAGGTGAAGGTTGCAGTAAGCTGAGATTGTGCCACTGCACCCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCACAAA 1521 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCAGGCCGTTACTGGAGAGTCTTGGGGAAATTTTTTTTTAAAATGTCTGAAAATTTTT 1601 CCACTTAATCCATTGATGAATTTCAAAGCAATTGTATTTTTTCATACAAGCCTGCCACTGTGAGCCTGTTCTTATTGTAT 1681 CTGAGCTCTTTGTGCTGCCTGAATTTTGTCTCTTAATTTCTTTTCAGCTTCATAGTGTTTCATTCTTCAATTGTGTTGGA 1761 GGGAAAAATAATGGTAGAAACTAAAACACACTTTGACCTTTTTTTTCCAATTTGTAGATGGCATTTGGTAGGCTTTTGGA 1841 GTAATAGCCTATTTCAAAAAATAAAAGGTGATGCAAATTATTGTGGAAGTGAGAGGCAAGAAATTTGTATTTGGAGGTTG 1921 ACATTAGAGTAAGTTTAACCCTTCACACTCAAAAACTCCCATCCTCTGAAGGCAGGAGTTCTCAACCTTGGCTGTCTGTT 2001 AGGATTGCTTGGGGAGCTTTCTGCAATTCTGATGCCTGGGTTGCTTCTCAGACCAAAAATCAGAATCTCAGGTAGTGGAA 2081 CCAAGGCATCAGCTTTAAAAAAAACTCCTTTGGTAGTTCCAGTGGGCAGCTAAGAACACTACAGTGACTTTTAGGTATTT 2161 GCAGACAATATTTAATTTTTTTCTTAATATCTCTGTGGTTGGAAAGGATCTTTGTAGCAGGAATTTTTTTATTAGAAATA 2241 GACCAAGGCACAGAGAGGTTGAATTTCTGCCTTGTGTGCCCGGTTCCAGCACAGTGCGGTTGTGTCGTTGGTCTTTTTTA 2321 GTATTTCCTATTTCCAATTTTCTAAGAAAAGACAGAATTAAAAAAAAAATCTCCTAGTTTTTTATTGGCAACCAATTCAG 2401 AATTGTTTAAAACATTGTGCTGGCCAAAACAAAAAACATGTTTGCCAGCCAGTAGTTTTTAGCCTCTGCTTCCAGAGTGT 2481 TAAGGACAGGCCTAAACATCCTGGCCAAGCTTTAATGGATTTGCATTTTTGTACTCTGGATGTAAGTTTTATTCTGCCTC 2561 TCCTCTAAGACTACTTTTAGATGTATCTTCCTCCTCATTCCTAAATAATCCTCAGGGATTACTTTTCCTCACTCAGTAAT 2641 TTTCCCCCTGCAGGCAGCTATTGCTTCCAGCTTCACATATATGGCTTAGAAATTTTATGGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTC 2721 ATTTACTTTTTTTTGAGATAGGGTCTCACTATGTTTATCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGGCCTCAAATGATCCTCCTGCC 2801 TCTGCCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACTGTGTCTGTCCTCTTTTTGGAATTAATTAGGGCTT 2881 GTTAATTTTTTTAAATTATATGTTTTGTGATAAAACATTTAGAAGTCCATGTTTTTTATTCTGTACTGTGTAGCTTAAGA 2961 AATGTCAAAACCAGGAGTACAGGCTTATTGGGCACACTAGAAACAAGAGTGGGAAAGGGTTAATTCACAGACCTGGCCAG 3041 TCTCCTCCTGTCTTCAAGGCGATGATTTACCCTGTGATTCTCAGACTTCACATGTACCAGAAATCTTTGGGGCAACGTGC 3121 TAACGTGCAGGTTCTCAGTCCCTTTCCCCAGCGATTCTGATTCGTGGAATTTCAGTTGATCATTCAGGACACAGTATAAA 3201 GTTCTTATGCAGAGAGAAGCTGACTTGAACTATCCCTATATGACTGAGGTGCTTTTACCAGGAAGGGGCTTTTATAGTTT 3281 CAGTCATATATGGATGAAAAAGGTGCTGTATTCTTTTTCTATGAACTACTTTGTGTATTTTATAAGCAGTATATATGTAC 3361 TGATACTTGTTTATCAGACATTGTGCGGTGCATGGTGTAGAAAACTCAAGGTTATTCTTTTAACTTGCACATCTTTTTTA 3441 CTTTATTTCAATCATTTACATCAAACTATTTCTTAATTTAGTATACATTTCTCTGCTTTTGCAAACACAGTCTACTGGGG 3521 ATAATTAAATCTTTTCAGAGTCGTCATATATGTTTTTAATTCTTTCAGGCCCTACTTAGTTTTGTTAAAGTCCCTACACT 3601 GAAGGCTCCAGATACATTTGCTCTTTGAGTTCTACCATGGTTTTTAGAGTTTTTCTTTTCCCTCACTTTTATCTGTCATT 3681 TATCTCTCCCATTACTGTGCCTACCTCTAGGAAGCTTTCTCTAATTTGCCCTGGGGTTGGGAAATTGTGTAACTGCATAC 3761 TATATGTTGAATAAGAGTAGAGAGGATTTGAATGAGGTTTTGAGAGGCTGTTCTAGCAATAAAAATGAATGTACTTTGCT 3841 ACATTGACTTGGTGACATTATTTCAGTGGCTCAACTCTCTTCCCCTAACTTACTTCTTTATCCTCATCTGCAGTTGTCAT 3921 ATTTGTGAACTCGCGGCAAGTGAGATATTGCTAGAAATAATTTCTCTTGATCAATAAACCATTGTCTCCCCCAGCTGTGT 4001 TAGTGTTTTTGTGTATTCAGTTCTATAATGTGAAACTTAAGAGGATTAAAACTCAAAAAATGATCAGGCCAAATTTTTAT 4081 GTGGGATGAAGTGTTTCTGATTCAGTGTTATTGTGATATAGAGCTATAAATTAGTTGTTTACCTATGAAATTCCTTCCTG 4161 CAGTCATTCTGAAATAAAGTTGTTACAGCTGA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | EF3D-AGO2 | ||||||
Disease | MIMAT0025487 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
"PAR-CLIP data was present in GSM1020021. RNA binding protein: AGO2. Condition:EBV B95-8-infected
... - Skalsky RL; Corcoran DL; Gottwein E; Frank et al., 2012, PLoS pathogens. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Skalsky RL; Corcoran DL; Gottwein E; Frank et al. - PLoS pathogens, 2012
Epstein-Barr virus (EBV) is a ubiquitous human herpesvirus linked to a number of B cell cancers and lymphoproliferative disorders. During latent infection, EBV expresses 25 viral pre-microRNAs (miRNAs) and induces the expression of specific host miRNAs, such as miR-155 and miR-21, which potentially play a role in viral oncogenesis. To date, only a limited number of EBV miRNA targets have been identified; thus, the role of EBV miRNAs in viral pathogenesis and/or lymphomagenesis is not well defined. Here, we used photoactivatable ribonucleoside-enhanced crosslinking and immunoprecipitation (PAR-CLIP) combined with deep sequencing and computational analysis to comprehensively examine the viral and cellular miRNA targetome in EBV strain B95-8-infected lymphoblastoid cell lines (LCLs). We identified 7,827 miRNA-interaction sites in 3,492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs. 24 PAR-CLIP-identified miRNA:3'UTR interactions were confirmed by reporter assays. Our results reveal that EBV miRNAs predominantly target cellular transcripts during latent infection, thereby manipulating the host environment. Furthermore, targets of EBV miRNAs are involved in multiple cellular processes that are directly relevant to viral infection, including innate immunity, cell survival, and cell proliferation. Finally, we present evidence that myc-regulated host miRNAs from the miR-17/92 cluster can regulate latent viral gene expression. This comprehensive survey of the miRNA targetome in EBV-infected B cells represents a key step towards defining the functions of EBV-encoded miRNAs, and potentially, identifying novel therapeutic targets for EBV-associated malignancies.
LinkOut: [PMID: 22291592]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1020021 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | EF3D-AGO2 / EBV B95-8-infected, 4-thiouridine, RNase T1 |
Location of target site | ENST00000334744.4 | 3UTR | UUGGCAGCUUCAAGAAGAG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 22291592 / GSE41437 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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181 hsa-miR-6515-3p Target Genes:
Functional analysis:
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Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT059268 | CELF1 | CUGBP Elav-like family member 1 | ![]() |
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MIRT063207 | ADIPOR2 | adiponectin receptor 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT118973 | SOWAHC | sosondowah ankyrin repeat domain family member C | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT234292 | PIP4K2B | phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 beta | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT305089 | SRPRB | SRP receptor beta subunit | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT316916 | ATXN1 | ataxin 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT320191 | ITGB8 | integrin subunit beta 8 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT366351 | SCML2 | Scm polycomb group protein like 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT443924 | ZNF99 | zinc finger protein 99 | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT445622 | CLIC4 | chloride intracellular channel 4 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT447378 | AGPAT5 | 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 5 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT463191 | ZNF275 | zinc finger protein 275 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT472656 | NAA25 | N(alpha)-acetyltransferase 25, NatB auxiliary subunit | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT478997 | COLGALT1 | collagen beta(1-O)galactosyltransferase 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT497221 | MORC2 | MORC family CW-type zinc finger 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT498343 | PRELID2 | PRELI domain containing 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT498362 | PRMT3 | protein arginine methyltransferase 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT501097 | SLC5A6 | solute carrier family 5 member 6 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT505086 | ZBTB18 | zinc finger and BTB domain containing 18 | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT507527 | DSTN | destrin, actin depolymerizing factor | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT525793 | SOD2 | superoxide dismutase 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT544401 | ZSCAN12 | zinc finger and SCAN domain containing 12 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT558808 | CDK6 | cyclin dependent kinase 6 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT559126 | C11orf57 | chromosome 11 open reading frame 57 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT566474 | PEG10 | paternally expressed 10 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT607261 | GRAMD1B | GRAM domain containing 1B | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT609251 | LIN52 | lin-52 DREAM MuvB core complex component | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT610065 | MYBPC1 | myosin binding protein C, slow type | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT610135 | FOXI2 | forkhead box I2 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT610280 | PLCXD3 | phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT611285 | PAGR1 | PAXIP1 associated glutamate rich protein 1 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT611353 | KIAA2018 | upstream transcription factor family member 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT611812 | FCRL4 | Fc receptor like 4 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT611898 | TRPC3 | transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT612749 | MYOCD | myocardin | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT614180 | FAM53B | family with sequence similarity 53 member B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT614825 | PVRL4 | nectin cell adhesion molecule 4 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT616702 | UBXN2A | UBX domain protein 2A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT616970 | HMGB1 | high mobility group box 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT616992 | COL19A1 | collagen type XIX alpha 1 chain | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT617132 | ZNF556 | zinc finger protein 556 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT617595 | NUDT5 | nudix hydrolase 5 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT617997 | KSR2 | kinase suppressor of ras 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT619451 | NUP214 | nucleoporin 214 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT619507 | TXLNB | taxilin beta | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT619547 | GABRG2 | gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT619719 | FCF1 | FCF1, rRNA-processing protein | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT619806 | CDC42EP4 | CDC42 effector protein 4 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT619939 | C8orf33 | chromosome 8 open reading frame 33 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT620456 | CENPN | centromere protein N | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT621054 | DGKD | diacylglycerol kinase delta | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT622730 | PITPNM3 | PITPNM family member 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT623010 | ONECUT3 | one cut homeobox 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT623432 | KIAA1161 | myogenesis regulating glycosidase (putative) | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT624379 | CDH4 | cadherin 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT624493 | CABP4 | calcium binding protein 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT625740 | MTSS1 | MTSS1, I-BAR domain containing | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT627048 | HOXA13 | homeobox A13 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT630857 | ENTPD5 | ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT632232 | VTA1 | vesicle trafficking 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT632978 | E2F2 | E2F transcription factor 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT635721 | CCL16 | C-C motif chemokine ligand 16 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT636489 | GRIN2B | glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT637743 | POLR3K | RNA polymerase III subunit K | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT639610 | SLC25A32 | solute carrier family 25 member 32 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT639878 | STC1 | stanniocalcin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT640507 | ANTXR1 | anthrax toxin receptor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT640910 | RAB13 | RAB13, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT641864 | STOML1 | stomatin like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT641989 | OXSR1 | oxidative stress responsive 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT642897 | CASP1 | caspase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT643210 | TYW3 | tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT643970 | FHL2 | four and a half LIM domains 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT644517 | TADA2A | transcriptional adaptor 2A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT644564 | SPOP | speckle type BTB/POZ protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT644738 | CCDC174 | coiled-coil domain containing 174 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645518 | ZWINT | ZW10 interacting kinetochore protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645597 | MRPS15 | mitochondrial ribosomal protein S15 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT646262 | IBA57 | IBA57 homolog, iron-sulfur cluster assembly | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT646467 | PRDM10 | PR/SET domain 10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT646623 | CENPL | centromere protein L | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT646797 | EVC2 | EvC ciliary complex subunit 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT647188 | ANKRD45 | ankyrin repeat domain 45 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT647254 | PTGDR2 | prostaglandin D2 receptor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT647895 | EPN2 | epsin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648129 | SEMA3E | semaphorin 3E | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT648133 | JAGN1 | jagunal homolog 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648361 | AKIP1 | A-kinase interacting protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648574 | CAPN13 | calpain 13 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648622 | CYB561A3 | cytochrome b561 family member A3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT649441 | HIBADH | 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT649456 | WDR70 | WD repeat domain 70 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT649479 | CLDN16 | claudin 16 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT649552 | FAM20B | FAM20B, glycosaminoglycan xylosylkinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT650060 | CCDC134 | coiled-coil domain containing 134 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT650272 | KLF2 | Kruppel like factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT650290 | PYCARD | PYD and CARD domain containing | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT651327 | ZCCHC2 | zinc finger CCHC-type containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652194 | TRIM39 | tripartite motif containing 39 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652284 | TNS4 | tensin 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652386 | TMEM55A | phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652702 | THBS2 | thrombospondin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652782 | TEAD1 | TEA domain transcription factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT653087 | SSR3 | signal sequence receptor subunit 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT653836 | SHISA9 | shisa family member 9 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT654147 | RPAP2 | RNA polymerase II associated protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655016 | PLA2G16 | phospholipase A2 group XVI | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655065 | PKIA | cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655217 | PFKM | phosphofructokinase, muscle | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655267 | PER2 | period circadian clock 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655772 | NPTX1 | neuronal pentraxin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655791 | NOVA2 | NOVA alternative splicing regulator 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT656556 | LZIC | leucine zipper and CTNNBIP1 domain containing | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT656831 | KLF8 | Kruppel like factor 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT656887 | KIF1C | kinesin family member 1C | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657295 | HOXB5 | homeobox B5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657346 | HNRNPC | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C (C1/C2) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657967 | GAPVD1 | GTPase activating protein and VPS9 domains 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT658082 | FOXR2 | forkhead box R2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT658133 | FMN1 | formin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT658163 | FCHSD1 | FCH and double SH3 domains 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT658787 | EIF2B2 | eukaryotic translation initiation factor 2B subunit beta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT658928 | DPY19L1 | dpy-19 like C-mannosyltransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT659989 | C2CD2L | C2CD2 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT660012 | C1orf115 | chromosome 1 open reading frame 115 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT660295 | BICC1 | BicC family RNA binding protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662571 | IL2RA | interleukin 2 receptor subunit alpha | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT664406 | AQP3 | aquaporin 3 (Gill blood group) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT667402 | MIB1 | mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT667621 | LIMCH1 | LIM and calponin homology domains 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT668421 | FAM217B | family with sequence similarity 217 member B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT668524 | ESRRG | estrogen related receptor gamma | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT668680 | DR1 | down-regulator of transcription 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT695383 | NSA2 | NSA2, ribosome biogenesis homolog | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT702511 | KDELR1 | KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT709032 | KBTBD13 | kelch repeat and BTB domain containing 13 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT710831 | PLEKHO2 | pleckstrin homology domain containing O2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT710967 | CMKLR1 | chemerin chemokine-like receptor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT711145 | TMEM174 | transmembrane protein 174 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT711176 | EMCN | endomucin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT711205 | SMIM14 | small integral membrane protein 14 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT711589 | SETD1A | SET domain containing 1A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT711751 | DTX1 | deltex E3 ubiquitin ligase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT712258 | PTPRN2 | protein tyrosine phosphatase, receptor type N2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT712376 | MTPN | myotrophin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT713780 | ZNF460 | zinc finger protein 460 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT714560 | LMTK2 | lemur tyrosine kinase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT714983 | RAB21 | RAB21, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT716253 | PALM2 | paralemmin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT716362 | RPS9 | ribosomal protein S9 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT716485 | SAMD7 | sterile alpha motif domain containing 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT716640 | DPY19L4 | dpy-19 like 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT717034 | KRTAP4-9 | keratin associated protein 4-9 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT717422 | SURF6 | surfeit 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT717891 | GBP4 | guanylate binding protein 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT718646 | NKPD1 | NTPase KAP family P-loop domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT719230 | ARL11 | ADP ribosylation factor like GTPase 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT719279 | SETD7 | SET domain containing lysine methyltransferase 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT719353 | GDF7 | growth differentiation factor 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT719513 | TMEM175 | transmembrane protein 175 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT719618 | CRISPLD2 | cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT719882 | NECAB3 | N-terminal EF-hand calcium binding protein 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT720184 | CMC4 | C-X9-C motif containing 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT720249 | FAM83F | family with sequence similarity 83 member F | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT720343 | BACE2 | beta-site APP-cleaving enzyme 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT720487 | TMEM178B | transmembrane protein 178B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT720937 | PPP1R3E | protein phosphatase 1 regulatory subunit 3E | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT721168 | NSG1 | neuronal vesicle trafficking associated 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT721499 | THRB | thyroid hormone receptor beta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT721518 | DKK3 | dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT721570 | SLC5A12 | solute carrier family 5 member 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT721865 | CENPJ | centromere protein J | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT721871 | RHOH | ras homolog family member H | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT722330 | PKHD1 | PKHD1, fibrocystin/polyductin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT722494 | PNKD | paroxysmal nonkinesigenic dyskinesia | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT722775 | KCNK5 | potassium two pore domain channel subfamily K member 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT723967 | GPR146 | G protein-coupled receptor 146 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT724488 | CSNK1A1 | casein kinase 1 alpha 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT724748 | ZNF391 | zinc finger protein 391 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT725274 | OSTM1 | osteopetrosis associated transmembrane protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT725373 | MTF2 | metal response element binding transcription factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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