Gene Symbol |
ZDHHC21
|
Synonyms |
DHHC-21, DHHC21, DNZ1, HSPC097 |
Description |
zinc finger DHHC-type containing 21 |
Transcript |
NM_178566
|
Expression |
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Putative miRNA Targets on ZDHHC21 |
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3'UTR of ZDHHC21 (miRNA target sites are highlighted) |
>ZDHHC21|NM_178566|3'UTR
1 ACAGATGGATGGTGGGCACAGATGGGTCCTCCATGCTGGCAATGCGTTACAGGTTTTATGATAATAGAACTATGACAGTC
81 TTCAAGTCAATTAAAATCCACCCACCAGTCTTAGGCATCATAATGTGCCCCAGGCTTTATTTTAATAGTGATCTTGATCC
161 TGTTGTGGGACTAATACAAGATCTATATTTAAGTTTTAAAGCATGTTTACTTTCAAATTAGCTTTCCACAGGGATTTCTT
241 GAAATGCTTTTGTTATTAAACTCAAAAGGCAGTGATTAGGATGAAATAATTGTACATAATTTATTTTAGTACTGACAGTG
321 TTACAGATTCTAATTTATGGTAAATTTCAGATGTTTATTTAAAATTTTCACTTTTAAACAGTAACCAAATCTAAATTTAA
401 TTATTCAGGTTTTACAAAAGTTGATACACCTTCTTATAGTATAGGTAAATTTTCTTTTTCAAATCCAATTTAAAATAACC
481 TTTCCTTTTAAATGTGCTGCAACGTTTTTAAAAATGCAGCAGCATAGGAGTGAACAACAGCAACACAAAACGGGCATTGG
561 TTTCTTAGGAGTGGCTTGCTTACGTTTTCTTCTTTTTTCTTCACCAAAACCAACATGAAAGTACCACTGAAGTAAAACAC
641 CAACTACCTACCTTACTATAAAGGAAATGTTAAAATTTTTTTCACAATAATTTTTTCAATTTTCACTATTACTGTTGTAA
721 TTATTGATTGTGATTAAAATATTTGCTCCCAGGAGAACTCCTGACCAGTGGGCATGTATTCCTATTTTATCCTAAGATTT
801 TAATGAGCAAAAAGGGGAGAGAATTTGCAATAACTTCACAATTACCTTTTCTAGTGCAGTTATATTAGAATGCATATGTT
881 TTTAAAATGCTAGTATAACTAGATAGTATATAATGTACAGTATAAAGAGGAATATTGTGCTTTTGAAAAGAGTATACTTT
961 TTACTTTTATTTATGTACTAGTAGATGTAAAATTTCACATTGAAGGTTTATATATATTGGCCAACTCATATAGAAATTTT
1041 ATTTATAGGAAGCTACTACTAAAAAAAGTCACTAACTTTGTGTACCTATAATCCCTAAATTAAAATTAAATTTTAATTGG
1121 CTGGCTGTAATTTGCATTGAGAGACCTTTTACTAGTAGCTAGTGTTAGGAAGTGAACCTAAAATAAGAAAATATAATGAT
1201 CTGTGTTTATCATTAGCCTTGTACAAATGTAAATTACTAATAGTGATGTTCTTTTGCAAGGCATAGAACATTTGTATGAA
1281 AAGACATTTAGTATGCTTTGAAAAAAACTCAGCTTTTAGTTTTTTTCCATTAGAATACTGCAAAACCCATATATCTTTTT
1361 AAAAAATTTATGTACTCACAGTCTTTCCCTTGAAGAGAAGATTGAAAAAGTCTACTGTTCATAAACCATGCTAACATTTT
1441 CCTTTTAGCTAGTTTTGAAAGTAAGGAACAATACCTGGGAAATAATTAAACAGAAGGTTACCATTGTCAGCCAGTTGGCT
1521 ATACTGTGGTTAGTTCTTTCAGAAATTGTAAATATCTTGTAGCATATTCTGAAATAATAGAGTAAGTTCTTCTCAGAGAT
1601 GTTAATATCATGTTTTTCATGTTCTAATTAGAATACTTTATTACTTACAAACTCAGAAATACGAACAGAAATACAGCAGA
1681 CGAACATATTTATTGGTACTGAAAAGAGACGTAGTAAATTAAATAGAAGAAATATATTTATAAAGCTTAGTGAAACACAA
1761 AATTAGAATGTTCATGTCAGGCACAAGGGTTTGGATTTTGTGCAAGCTAATTTGGCCACATTTGGCCTGGTGACAGAACT
1841 GTTCATAAGGAAGTAATATATAGATAAGGTAGGTAGATATCAGTTGAATGCCTTATATTGTATACATTCCTTTCAAATAA
1921 AGACCTTGAGAAAACAGCAGAGCCAAGTGAAGATCACCTAAAGAACTTTGTGGCTAATTTATACTTCATGTAGTAGCAGT
2001 GGGTACTGGGCAGGGTCTCTTTCCCACTCTGATGATTTGTGCTCTTATTTTTCCTAGATTTACCTCATCTAGGGCATATT
2081 CTTTTCCCTCTTCCTCTTTACCTTTCCTGGTCCTGATCCCTCTGTACTCAGTTCCCCTAAATTATTGGACTACAAACTAA
2161 TATACTAGAAAAGCATACACTTATTTTATTTGAATGCAGAAATGCTATCTATCAGTATATATACATAAGAATGTATATTA
2241 CAGTATATCTATATATACTTAACACTGTAACTTTCAGTATTCCCCAGTTAGCGTACCTAACTCTCCTGTGGGTTTTGTTA
2321 ATTCTTATTAGACTACTAGAGAAAAACCAACTGGCAGTTTGCTAAGCATATCTACTGGTGTTGTTTCTGCGCCCTCTTTT
2401 GGCTAATTGATGTAATTATACTGGCTCTAAAGATTTACTGCCCCATAAGTAAATAGTATAGCCACATTCTGAACATATCA
2481 AAAGTACAAACTTAGGAGGAGTGTATGTACAAAAATGTAAAATTTTATGAAAATGAACATGTTTTTATGATGTTATTTCT
2561 AGTTCATAAGAATGTGATGACTGCTTTGCTTCATTTATGTACGTTCCCATTATATTCTTGCTGTCAATCAATCACAAATT
2641 TATATCAGATTAGGATAAACTAAGCCATTTTATGTATTTTATTTTAAACCTTATTTTGGCAGAGTAATTCCTTAGAATTG
2721 GAAAAGCTGTTACTTTGAAATTACCAATTTATTACAAAACATAGAAATGTATTGTAGCTACAAAGACAACCAAGCATTTT
2801 CTGTGTTTTAATGAATATCTAAAAAACTACATTTAGTTTATTTTACTCAGTTTTGAAATGATTTTTTTACTGGCTCTATT
2881 GCCTTAAAATAACTAAGAGATTAATGATTCTTTGTATAATTTTCCTTTTCTTTGTTCTTTTTTTTACATTTCGCAGAGTT
2961 ATATCTATAGTTTTAGTAACAATTTCTTATGTATTCTGGATAACTGAAAACAACTAAAGGTGTTGGGCATTAGAAAATAA
3041 TTGTGAGCAGTAAGATTACTGATGTAATATGTATGTTGGACTGAAGTATTTCTTTATAAACATTCTATTTGATTTTAAGC
3121 AAAATGTATGTTAAAGCATGTTTTTACATCAGTAAAGTCATTTGTCGACCTTCTGGAAATGAAAGGTTTTTACCTAGATA
3201 CTGTAAGTTACACCTCCTTAACAATCATATTTGTCATTGTTGTTTTCTGCAAACAAAAATGTTTATGGGCTTCATGTAGG
3281 CTTAAGATTGTAGGCAAAAATGGACTGAGTTCAGGACCCTTCAAGCAGTAGGCATTCAGTTACAGAGCAGTTGGTACTTT
3361 GTAACCCAGACTTACAGTTTAAAAATATCAAGTTAGCTGATGTTTCATTATAATAAAAATACTATTTTGCTTAAGAGTTG
3441 TATTACAAATATTTGTGCTTAACATTAGAAATAGCTGTTTTAAATTGTAGTTAACATATTAACTTTTTCAGAAAAAAAGC
3521 ATGGTTTATTTTTAATAATGAAATAGAGAACATAATACGTAATGTTCAGTATAACAGCTGAGTTAAAACATCTGCCAGGA
3601 TTAACATCAGTGCGTTTTTGCCAATGCATAGAGGCATTTTTCTCTAAGTATGATGGCTAATGATAACTATTCTTTGTTAC
3681 ACATTCAAGTCACTCCCATACAAGTAACTAGTGGGTGATATGTTTCACTCCAAAGGGTGTATTAATTCTGAATGCTAATC
3761 ATGAAGACTTAAGTTAGGACAACACTTCAAACCAGGAAGTGTGAACTGATTTAGATTATAGCTACACAATTTTCTGTGTG
3841 TTAGATCATGGGGTAGTTTGAGTGTTTTCACATGTATTGCTATAAAATCACAATGTACCAAGCTCTGGTTTAATATGCCA
3921 TTAATACTAATTAATAGAGCTGCTAGTCTCTCTCTGGACTTTTCTCTAGTCTCTGCTTCTCTTGCGCTTCCTGTATCAAT
4001 AGATTACTTAGCTCAAGTTTACCAAGTTTAATAACCTATAGTTACTTTATTGAATAAGTTTCTGACATGACCTCTAATAT
4081 ACATAGATATATCTAGAATTTATTTGATAAAATTCACACATACAAACATTGAGTAGTTTGCTAATAGATACAAATATTAG
4161 ATTTTCACACAACTCTACTACTGCTTTAAAAATATAAGTATTGGTAAGTGTAGCAAATAAGCCATGTACATTTAATGTGT
4241 TCTACTTGCTAGTATTAACTGTATGATTAATGAATGTGTTATTTAATGCCCAAGTTTGTTAACTTTTATTCTAGAAATCA
4321 TCCTCTGAATTTATTATAAATCACAGATTTCATTGTGCTCTATATTTAGTCATTCTCAGTTGAATTCTAGAATATTCCAC
4401 AGTACAGTATAAGAAAGTATTAGAACCAACTTGCTTGAACTATTTTGAACCAGTGTTGTAATTCTATATGTTAATCAGTA
4481 TTTAGCATTTCTGCTCCTTTTGAGATGATGATGGTTTAACTTCAGGAAAGTGACTTTTCTGACTTCTTTTATTATCATTG
4561 TGCAATTTTTAGCAACAAAACTCACTATATCTTTGTCAGTTCTTCAGATGTTACAATACTGCCTGCTAATTTGAAACAGA
4641 AATAACAATGGTATTTTAAAAAGTCATTGATATTACTGATACTTTCCATTATCATTATATTTTTTACTATTATTATGTTC
4721 TTTTTGCCTTGTCCACCCTAGAGAATAGGTACAAATGAGTAGTGAGTATCCACAAACTTACTAAGATGGAGAGAAGGCTA
4801 GATGGTGCATGAATAATCAGCATCTCAGCAACAGAGTTGACTGGAGCCAGTTTCTGACATCAGAGAATCTCTTTGCTGTA
4881 ATCATTTTAGCCTTATCTCTTATTTATACCATTTTTATGGGAAGAGTTGTTAGTGCATATAAGCATTTAGTTTGAATTAT
4961 TTAACTTAAAGAATTTATATTGCGGTTTCTCTTCAGTTGGTCAGATGCCTTTTATAAATATTTTAGTTTTAAATATAATT
5041 GTGTAGAGTATGATCATGTGAAGTGTTAAAAATAATGTGGAAAACTCAGCTATTTAATGCAGAGGAGAAATGAATAGGTT
5121 GACCAAAGTTTGAAAAAACTGGCACCTTTTCTGGAAATCTCTTATTGCAAAGAAAAGATACTGAGTGTATAGAAAATTTT
5201 GTCACCAGAGGAAAAATAAACAATATATAAGGGTGGCTTTCACTTTAACATTTGGGATATTTTGGAGTTCTTGATACCTC
5281 GAAGGTCTCCATTTCTATTGGTATTTTGAATATCTGTAACATGTAATGTCGTTCTTATAACAGTTCAACACTGATTTTTT
5361 TGGTATCGATAGCTTTATATATAAACAAAGATGCGGACAAAATAGCTTAACAGAAGTTGTGGGCTTTTTTGTGGCTTTGC
5441 CTGCCTGTTTGACCAAATACAGGGTTTAATTGTTTGCAGGCTGTTAACTAAAGGGAAAGCTTACCTGCGTATTGCAAGCT
5521 ATATATTCTTGCCAGTATACATTGGATGATATTTTAACCTACTGGTGCCTGAAGTTCGTGTTTTATAACCTCAACAACTA
5601 TAAAACATCCTGGTGCTATTCACTTTAGCATTGAGTGACATTTTTAATTCCTGTACCAAAGAGTTAATTTTCTTTTTGGT
5681 TGACTGAGTTTTCTTCTCACATCGTTGTGTATTTATAAAGTAGAATTTAATGTTACTAAGAACAGTTTGATTAACAGATC
5761 TTATTTTTTGCATGCTGCTCTGGCAATTTAATGGATTTTAAATGTTTCTCATTTGGATTTTTTTTTAGGTAGGCATGTAT
5841 GGATTTTAATTTTGTATTTTAATATAGCTTGGCTACTTTAAAAGGTAGTTTGATAGGCTGAAATTACAAAAGATAATTGA
5921 AGCACTTTTCACAAGTTGTTTTATTTCTGCAACAATGAATAAAAAGGTAAGAACTCTAATTTATATAAATGAACTATATA
6001 GCTTATTGGGCACTTTAGTGAATACTGAAACAAAATACTAAGATGAAGAGTTAAGGTTCGTTCTCATTACAAATCGAGTT
6081 CAGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAATCTTTAGTGGCTTTAAAGAATAATATTGCCATTTGT
6161 CTACTTTGCAAATAAAGATAACAGAACACCTTTAAAATATATGTATGTGTACATATGTGTGTGTAGATATATAGAGAGAG
6241 AGATACGGAGAGACAGACAGACAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGATGCTTTCCCAAGAGGAAATGCATATGTACCTTGAT
6321 TTAAGCAAAACTGATAACAGAAAATTGAACTTAATGAAAGAAAAAAGTCTGGATATGGTTACTCACTTTACATAGAGTAA
6401 GATTTTTAAAACTAATTTTGCTTAGTAGTTAATTTTACAAAAATGAAGAGAAACACCCTTTAAGTGTACTCGTAATTTAA
6481 AACACCTTTGAAATGTAATTGTCCAAATGTAATGCTGCTATGTATATTATTTGGGTTCCAGATTTTTCCCTTTAAAATTC
6561 TCAAAACACTCAGTGTCCTTACAACTGCAGCTAAAATGGTTAATCATTCTGGCAAGAAGGTGACAGTGTGTATATTGGAA
6641 AGGCAGACATTCACATTTGAAAATATTTTGCATTATTGTTAGCTAAAATCAACCTCTCCTTGAATGTAGATACAATATAT
6721 GGTTTTGCAGTCAATTCTGAATGGAAAAAAAGAATCAAGTCTGAAATTTATGTGAAATGTGGCTTCAGATCATTTGAACG
6801 ATATGTAGAAATCTAGATGAACATATCATTAGAGGTGAAAGCAAAATTTGAAAGCCTAATGAGATGAAGCAACATTATCT
6881 CTCTCTAATCTGCCAACAATATTCCCTAGATTGTGTTGCCACTGTATTGATTCTGAGTAATTTGGCTTGTTTATGCGTGA
6961 TTTAAATGCATGTGGCTGAATGCAGTAATTTTTCAAGTTATTGAGTAGTAGAGAATTCACCACTATTCACTGTCTCCCAG
7041 AGATGAACATATAAAAGAAAAAAAATTCTACTTCATATATGTAAGAATAAAGCAACTAAATGATACAAAAGTAAAAACTT
7121 CCACCAGAATCAGAGATATTCCGACAAGTGAATTGTGAGTCTAACACGGGAGGACAAAGCTAGGCTCTTGCAAGGACAGA
7201 GCACACGTGGATCATGCTGTATGAGCTCACTTTGTGTCCCTGGAATTAGTGTTTTTTTGTGTGTGATCTAACTGGCAAGT
7281 TTAATGAATAGCCAAAATCTATGTTATTCTTGAGGCTCCTAAAATTATGTGTGAACCCCAAGTTCTGTCTAGTATTATAT
7361 CCCTAAAATGCTTTTAATAGTGGTATGTTACAAGTGGCATAAGAAGATCCTGTTTTTAAATTTGTCAGGCATTTTATTAT
7441 TCAGTACATAATATGTATAGATCTGAGTGCTGTTTTCCTTGCATTGTCTATTATTTTTACCTTGTCTTTCCCCTAAGAGA
7521 ATTTGAAGAAAATCTTCACCAATATTTCTAGTGTTGATGGTAATTAGGAAAATAGTAGTTGAGAGATGTAAGAATAGTTT
7601 GAGAAGAGTGAGTAAAATGGGTGAAATGACAAGTGGGAACCATGTAGCTGAGATGTATTTGTTTAGATGAAAAGTCTACA
7681 CTGGTTCTTAATGTGAAAATCAAACCATGTATCTACCTTAAGAACAATGTTGTTGTTTTTAATTTATTGTAGCGATTTAG
7761 TTTTTTTCACGTAATATTTCTATTTTCTTTGCAGATTGTTTTTAATTTAAATTGTGGAATTTTTACTTCTCAAAATGTAT
7841 TAAGTACTGTATTTTTTGAAATCTTATTTTTAAATAAATATTTTTTAAAAACGTA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' agUUAGAGUCGGAUGAAUCGUu 5'
|| || | ::|:|||||:|
Target 5' taAAACTAATTTTGCTTAGTAg 3'
|
6407 - 6428
|
148.00 |
-11.90 |
2
|
miRNA 3' aguUAGAGUCGG--AUGAAUCGUu 5'
|| |:| :| ||:||||||
Target 5' tatATGTTAATCAGTATTTAGCAt 3'
|
4465 - 4488
|
145.00 |
-10.80 |
3
|
miRNA 3' aguUAG-AGUCGGAUGAAUCGuu 5'
||| :|| :||||||||
Target 5' tgtATCAATAGATTACTTAGCtc 3'
|
3992 - 4014
|
143.00 |
-12.50 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|