pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4307 |
Genomic Coordinates | chr14: 26908642 - 26908725 |
Description | Homo sapiens miR-4307 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4307 | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 56| AAUGUUUUUUCCUGUUUCC |74 | |||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||||||||
Experiments | SOLiD | |||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | ZBTB34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ZNF918 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | zinc finger and BTB domain containing 34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001099270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on ZBTB34 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of ZBTB34 (miRNA target sites are highlighted) |
>ZBTB34|NM_001099270|3'UTR 1 GATGGTAAAGAAGTGCACCCAAACAAAGCACATTAATCAATGCATATTTGTGATTTGCTTTGTTGTAATCTTTGGTTTTC 81 CCAACCATCTGGAAATCTCTTGGTCTCTTGGCAGTTTTTCTAAAGTTTCTGGATGGAACACTTCGTTGTGTTTATCCTTT 161 CCCCTGCCCTCCCTCCCCGAAGGAGCTCAAAGCATGAAGGGCAACGCATCCAGGGAAAACACAGGCTGACAGTATTCCTC 241 TTTGGCTGAACTCTTAATCCAAAATCTGCCAGTGATTTAGCTATGCCAACTGGTTGACCCTCCATTCTCTGCCAAGAGGC 321 ATACTCTTTCTCATTGTGTGCGCTGGCAGCAGTGCACTTCCACGGAGGGAGATTAGGATGCCGTCAGCTGATACAAATGG 401 GTAACCTTTTCTAATTTAAAATTCCTTTTAGGGGGTAGTTAGACAATTTATATATATATATAATAAAACTATTATTATAT 481 ATATAGTATATATACATTTTCAAATTTGATTTTATTCTGGTTGAGGTGAATGTAAGAGGAATATATAATTTAATACAATG 561 TGAACAGGGCTTCTGAGTCTATCTCATCCCTACCTAATATGTTAGGGTTTTGCCCCTTCATTTCCCTTACAAAAGAATGT 641 TAGTAGGTTTATATTAATCATTGTGTCCAAAAGCAAGCAAAGCAAATCACAGTGTTCACAGCTCTGCTTCATAACAAATA 721 CATAAACCAAATGCCATAAAATTTCTTCAACTCTAGTTGGAAACCGTTTGGAATTTTTGTTAGTTGTCCAGCAGGTAAGC 801 TGGATGACCTGTGGTGCTGACCTTTTTACATAGTGTAGTGTTATATTAGCCAACCCCAAAGGAGCAGTGGTTTTCAAGGT 881 TTTTACTGGCCTACAAATCTACCTTCATTCCGTACTGTAGAAACATACATACCAGGTAACTAAATCGAATCACTCTCTAT 961 CATGAGTTAGTACTCACTCGCACTTAAGGAAAGGGATTTGTAGTTCTGTCTACAAAATTCTCCAAGCAGTGTTGTGGTTT 1041 TTTTTGTTTTTGTTTTTTTTCTTTCTCTTTTCAAACAGCCAGTTCAGGTGCACAGCAACTTTTTCTACATGCAGTTCCCA 1121 GGGAAACTGCAGAACTTAGAATTTGTACTTTTTGTAAAGCTATACTCTATGGGAATTGCAAGCAATATATCTATCTTAGT 1201 ATTGTGTGTGCTAATGAGAGCCTCAGTGGCTCCCCCACTCTCTCAGTGTTTCCTGCTTAAAGAACCAACAGTTTAAAAGC 1281 CCTCTAAGATACTCTGTGTGTCACCAAATCTGTGTGTCACCATTTTTTGGTCATGTGGTGCTATTTTTGTTAAGTGTCTT 1361 TTTAGGTCAGTATAGTTGTAGAAAATGTGAAATCTGATGGTAATAATGAATTATAATTGTTTTCCTCTCTTGAGTTCATA 1441 GCTTGAAAAGAGACCTCAAAAGCATGTGCTGGCAAACACGTTACTGTATGAAAACATACCTGAGTCCATTTGAATAATGT 1521 TTTATTAGTACTTTCGGAAATGTCTTCAGTTCTGTATTGTGTTCACATACACAAACAGGCTTTACAAGATTGCTTCGGTA 1601 CTGTAAACTCTGGCAGAGAGTAATTTTGTAGGCAGTTTGGTGGTGAGTTTGTGCTGCAGGCTGCCTGTGGGATGTCAGCG 1681 TTCTGGTATCTGCCTGAGAACCTGGGCTCTGAGACGCACAACCAGTGCACCTCCATAGGAGAACAGTGCAGCCACCTAAA 1761 AGAAAAACGAACGAAGGACCAGCCTCAGAGGCTAGAAGTTAAAGGAATACAGAATTAGATGTTTGCTGGTTTTCTGTGCT 1841 TTTTTGGCTCCTAAAATACCAATGGTGGATTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTGAGAAATAAAAAGTCATTCAAGCC 1921 CTTTGTGTGTAATAGCCCCCAGGGGTGGCAGCTGTGCAGTCGCATCTCTTTGGCACACAGGATCTGTTCACGTGTGAACT 2001 GCTGCGCTACACATCAGTGTTAACTCCCTACAGATTACACTCTAATCCCGCTGCTCCCGAGGAGCGGCTTTGCTAAATCG 2081 GGTATATAGTATATGCCTTTTTCCTCGTCAAACTGCCTAAGTAGGGGTTCGTTCTCTCCCTGAAGCACTTGTTCAACTCC 2161 TGTTAAAGCCGCGTGCCTCAAGGGGAGGCTGGACCCCAAGTGTTTACCCACTTAAATATGTTCTGGGGTTTCAGGTAAAT 2241 GTTTGTGGGTTTTTTTTTCCTTACATGAATAAGTTTGGTTTTGATTTTTTTTTAATTGAATGCAAAAAATTTGTGTTGTG 2321 ATACAAATTAAGTTTGTGACAAGAAATGCCCAAATCCAAGGACATAAGAGGTCAAGCTCAGGGAAGGAACCTCCTTTTCA 2401 CTCAGGCTTGGGGCCTCCAGCGAGGTTTCCAGAGCATTCCATGGTATGAGAGACAGTGAGGAGGGAGGGCACCTGGCGCG 2481 GGCACTTCCAGCGTCCTGGCTCTTGGCATTGTCCGTCTTAACCTTATTTACATGGAGTTCTTTGTATTTGTGAATCTGTT 2561 TAACTGGTTTGAGTTTACCAAAGAGTGACTTATCCAAAATTGTCTTTGACAAAAATATCCATTGCTTTGATTGTACAGTT 2641 CAGGTTCAAACATTGTAATGGGACTGTTAAGGGGCAGAAAATTGATTGAGTTTCTCTCTAAGAATCATGATTCCACATTT 2721 TGCAAGTTCCACTTGCTCCCATTCGTGTTGCTAACACTTTACCCTTTCCACTGCTCGCAGTGTTAAGAATGAATTCTCAA 2801 GCCATAACACAGTACTGTAAAGTTCCGCAGGGCTTCGAGGGAGGCAGCGCCTAGGCCAGCACGGAGCTGTGTAGCCTCTC 2881 TGAGCGTTCGCACTGTCATGCTTCCCAGGGGTGTGACTGGTGAGAGATTAACTCCATTCAGATCGGGCAGCAGCAATTAA 2961 TTGTGCCTTGCCGCATGAGGATGTGTCAGGAGGATTAACATGACCACAGAACCGAAACATTCTCTCCCTGAAGTTCACTT 3041 CACGTCTCCGCAGACGAAGTACGCTGTGTAACTCCTTAGAGCAACTCTTTTTGGAAAGCAAAGTCCCTATTTCTGTACAG 3121 TTTTAGGTTAGGTGTTTCATTTATAACAGATGCAGAAATCAATTAAGATAAAGTGATATGTGAAGAAATCTTTTACAGTA 3201 AAATATATCCTGAATTCATATAGGCTTGTTCATAATTGAGTCTCTTCTTGAGCTACCTTTTCAATATTAGACAATGTGAA 3281 GACAGTGACAGCGTCCTTTTCTAGAGATATTTAGCCTGTTATTACAAACTGTGAAGACAAAGAATTTTATACTTTTACTA 3361 ATGTTTGTGGTTTTAAACAGTTATTTTCATTCTAATCAGTTCTCTACCCTCTAATTTCTACTAAAGCTGTAAATACATTT 3441 AGAAATTATATTTGTAAATACAGTATATGGAGACAAGTTAATTTTTTGGTCAGTGGAAAAAGCCTCCCAACCAATTGGCC 3521 CTGCCTTGGCAGTTGTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTAGTTTAGTTTTTTTTTTTAAACAGCAGAAAGGATACT 3601 GTCGGTTCACTGTTGAGCAGAATATACTGTAGAACGAAAATGATAATTTTTAAATCTTCCAGAGCATGAGTAAATGTCTT 3681 TTCTAATGATAGCAAATATAACCAACTCTTTGTTTTTCCCTTAGCCCAGACCATATAGACCTGCGTATTTTGTGTGTGGT 3761 TTTGTTTTTATTTTTGTTCTTACAGCCTAGACCCTAGGAAAAATTTGCAGGAACACGAAACAAGGGCTGGGGGGAAAATC 3841 ATCTATGTGAATGAGCTTTACTTTAAAGAGATCAATGTATTTTATTTTATCAACTTTTTCTCTTAGTTACTGTGATTTTT 3921 GTTGTTGTTGTCCTCGTTATTGTTAAATTCTGTAATGGTTTCCTGTGAAGCCTCCACTGAAAGGGACTCAAATATGCAAC 4001 ACCTAAACTATTTTCCAAGGGCACATGCCCCTTGAATGGTGCTTCTAGACTGGTCAGGGTTATTTATTAAATTTTATATA 4081 TGAAAGTATTGGGGAATTATGTAAATTCTTTATATGAAACTATCTAGTTCATAAATCATAGATTTCATATTACTCAGTGC 4161 AACTGAACTAAAAGTTCAGAAAAGTCATTCACATTGTTCCAAATTTGTAATGGTTGTCACATGTCACATGCGTCTTTTTC 4241 AGTAAGTGCCAGAGTGTTCCCACTGTTTCTGCCCAGTGCTTGACTTCTCGGCCCGGAAGAGAACCTGCTTTCTCTGGTTT 4321 CCTTCCTGAGTCTGGCACAGACGGGGCTATTGTAGTTCTTGATCAAGTCCTGGAGTCAGCCTTGCCTGGCTCTCCTTGTA 4401 GCAGATTCAGTCCACAGACCTCTTGCTGCCCCTCAGTGACAAGTATGCTGTGAATTCAACCTTTGGACTTGCTGCCCAAG 4481 CCTTTGGTTGCTGCCCTGACTATTGTAAGAGGTAAACTTACCTGGTTTGTTTGAGAATGACCATTTTCCTAATGTGAAAA 4561 CCATCTCTCTCACCACTTTTATTAGTAGGGCTAACATTTTTTTCCGTTATAAATGGTTGAGCAATTTGAATGACTTAACA 4641 CAGTGTCATTATCTTGCAATATAAACTGGTAACCTCACAACTCCACACTTCATCACCATATGAAGTAAATGAAGCTAGCT 4721 AAGCGGATGCTGTATCAACTAGTAACTTGCCATTAAGGATTATTTTATAGCATGAATTTAAGACTATTTATTCAAATGAT 4801 ATTTTACTCTTGTATTCACTTTGTTTTAGATTTGTGACATGAATATTTCAGTGCTGCTTAATTTTGTTCTGAATTCTTGT 4881 TTCTTGCTTGTAAATGGCTTTTTTATGGTATAAATAAAGTCAATGGACATTGCTGTTTGTAAATAAAAATGCTGCTAGAG 4961 CAAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | MCF7 |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
PAR-CLIP data was present in SRR1045082. RNA binding protein: AGO2. Condition:Untreated
... - Farazi TA; Ten Hoeve JJ; Brown M; et al., 2014, Genome biology. |
Article |
- Farazi TA; Ten Hoeve JJ; Brown M; et al. - Genome biology, 2014
BACKGROUND: Various microRNAs (miRNAs) are up- or downregulated in tumors. However, the repression of cognate miRNA targets responsible for the phenotypic effects of this dysregulation in patients remains largely unexplored. To define miRNA targets and associated pathways, together with their relationship to outcome in breast cancer, we integrated patient-paired miRNA-mRNA expression data with a set of validated miRNA targets and pathway inference. RESULTS: To generate a biochemically-validated set of miRNA-binding sites, we performed argonaute-2 photoactivatable-ribonucleoside-enhanced crosslinking and immunoprecipitation (AGO2-PAR-CLIP) in MCF7 cells. We then defined putative miRNA-target interactions using a computational model, which ranked and selected additional TargetScan-predicted interactions based on features of our AGO2-PAR-CLIP binding-site data. We subselected modeled interactions according to the abundance of their constituent miRNA and mRNA transcripts in tumors, and we took advantage of the variability of miRNA expression within molecular subtypes to detect miRNA repression. Interestingly, our data suggest that miRNA families control subtype-specific pathways; for example, miR-17, miR-19a, miR-25, and miR-200b show high miRNA regulatory activity in the triple-negative, basal-like subtype, whereas miR-22 and miR-24 do so in the HER2 subtype. An independent dataset validated our findings for miR-17 and miR-25, and showed a correlation between the expression levels of miR-182 targets and overall patient survival. Pathway analysis associated miR-17, miR-19a, and miR-200b with leukocyte transendothelial migration. CONCLUSIONS: We combined PAR-CLIP data with patient expression data to predict regulatory miRNAs, revealing potential therapeutic targets and prognostic markers in breast cancer.
LinkOut: [PMID: 24398324]
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CLIP-seq Support 1 for dataset SRR1045082 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | MCF7 / Untreated |
Location of target site | ENST00000319119.4 | 3UTR | AAACAUACAUACCAGGUAACUAAAUCG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 24398324 / SRX388831 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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107 hsa-miR-4307 Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT091681 | RARB | retinoic acid receptor beta | 2 | 6 | ||||||||
MIRT097311 | AGGF1 | angiogenic factor with G-patch and FHA domains 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT099878 | SOX4 | SRY-box 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT114514 | ARF6 | ADP ribosylation factor 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT163479 | WNT5A | Wnt family member 5A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT186633 | COX20 | COX20, cytochrome c oxidase assembly factor | 2 | 8 | ||||||||
MIRT194921 | TNRC6A | trinucleotide repeat containing 6A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT230189 | AKAP17A | A-kinase anchoring protein 17A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT281397 | MAPK6 | mitogen-activated protein kinase 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT328018 | RLIM | ring finger protein, LIM domain interacting | 2 | 2 | ||||||||
MIRT354896 | SEC62 | SEC62 homolog, preprotein translocation factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT361422 | PNRC1 | proline rich nuclear receptor coactivator 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442526 | MOB3B | MOB kinase activator 3B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442629 | NUDT12 | nudix hydrolase 12 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442685 | SLC39A9 | solute carrier family 39 member 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT444131 | BRCA2 | BRCA2, DNA repair associated | 2 | 2 | ||||||||
MIRT444174 | RBM7 | RNA binding motif protein 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT446045 | TPR | translocated promoter region, nuclear basket protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT447984 | LINC00598 | long intergenic non-protein coding RNA 598 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT460527 | S100A11 | S100 calcium binding protein A11 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT466861 | STX6 | syntaxin 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT468806 | SAP18 | Sin3A associated protein 18 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT480269 | C8orf4 | chromosome 8 open reading frame 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT493119 | MKNK2 | MAP kinase interacting serine/threonine kinase 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT499168 | YRDC | yrdC N6-threonylcarbamoyltransferase domain containing | 2 | 8 | ||||||||
MIRT500507 | ZBTB34 | zinc finger and BTB domain containing 34 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT503021 | CAND1 | cullin associated and neddylation dissociated 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT505314 | TOR1AIP2 | torsin 1A interacting protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT506123 | PMAIP1 | phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT509346 | CYP20A1 | cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT509446 | POU2F2 | POU class 2 homeobox 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT509598 | PEX26 | peroxisomal biogenesis factor 26 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT516008 | GPN2 | GPN-loop GTPase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT516120 | SRPX2 | sushi repeat containing protein, X-linked 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT522126 | NELL2 | neural EGFL like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT523018 | IL1RAPL1 | interleukin 1 receptor accessory protein like 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT524015 | DONSON | downstream neighbor of SON | 2 | 2 | ||||||||
MIRT526307 | JAKMIP2 | janus kinase and microtubule interacting protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT526789 | SGCD | sarcoglycan delta | 2 | 2 | ||||||||
MIRT529141 | CLCC1 | chloride channel CLIC like 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT531336 | GDPD1 | glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT531573 | ILDR1 | immunoglobulin like domain containing receptor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT531831 | MTPAP | mitochondrial poly(A) polymerase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT534994 | PRR11 | proline rich 11 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT535419 | PDZD8 | PDZ domain containing 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT535534 | PAK2 | p21 (RAC1) activated kinase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT536649 | INIP | INTS3 and NABP interacting protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT543498 | MDM2 | MDM2 proto-oncogene | 2 | 4 | ||||||||
MIRT545392 | PM20D2 | peptidase M20 domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT545881 | ZNF200 | zinc finger protein 200 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT547931 | HNRNPR | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R | 2 | 2 | ||||||||
MIRT548109 | GDAP2 | ganglioside induced differentiation associated protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT549370 | ANKS1A | ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT549934 | RPL7L1 | ribosomal protein L7 like 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT550455 | MYADM | myeloid associated differentiation marker | 2 | 4 | ||||||||
MIRT550640 | AR | androgen receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT550815 | FAM229B | family with sequence similarity 229 member B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT551258 | OPCML | opioid binding protein/cell adhesion molecule like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT551768 | MED21 | mediator complex subunit 21 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT552214 | ATP5S | ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex subunit s (factor B) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT555472 | POGZ | pogo transposable element derived with ZNF domain | 2 | 2 | ||||||||
MIRT556008 | MZT1 | mitotic spindle organizing protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT557878 | FEM1B | fem-1 homolog B | 2 | 4 | ||||||||
MIRT558486 | DBN1 | drebrin 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT560859 | GAL3ST3 | galactose-3-O-sulfotransferase 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT561521 | AZF1 | azoospermia factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT562090 | KIAA0895 | KIAA0895 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT563065 | ZNF28 | zinc finger protein 28 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT563487 | ZWINT | ZW10 interacting kinetochore protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT564286 | CTCF | CCCTC-binding factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT565627 | SLC16A1 | solute carrier family 16 member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566508 | PAWR | pro-apoptotic WT1 regulator | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566978 | LBR | lamin B receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT567180 | IGFBP5 | insulin like growth factor binding protein 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT568432 | GDNF | glial cell derived neurotrophic factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT570092 | KANSL1L | KAT8 regulatory NSL complex subunit 1 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT570565 | PABPC1 | poly(A) binding protein cytoplasmic 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT571385 | JKAMP | JNK1/MAPK8-associated membrane protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT572053 | GPATCH8 | G-patch domain containing 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT572333 | CACNA1A | calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT574528 | PEG10 | paternally expressed 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT575818 | Igfbp4 | insulin-like growth factor binding protein 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT608587 | PPP2R1B | protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta | 2 | 4 | ||||||||
MIRT610442 | TSPAN15 | tetraspanin 15 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT614994 | GABRB1 | gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT615014 | ERGIC2 | ERGIC and golgi 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT615078 | CISD3 | CDGSH iron sulfur domain 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT616180 | SYT7 | synaptotagmin 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT617191 | CDH13 | cadherin 13 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT617287 | GTF2H3 | general transcription factor IIH subunit 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT618714 | ESD | esterase D | 2 | 2 | ||||||||
MIRT621825 | TIMM8B | translocase of inner mitochondrial membrane 8 homolog B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT624139 | DLX3 | distal-less homeobox 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT625991 | IBA57 | IBA57 homolog, iron-sulfur cluster assembly | 2 | 2 | ||||||||
MIRT626344 | BLOC1S4 | biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT634899 | ZNF701 | zinc finger protein 701 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT637848 | SLC2A9 | solute carrier family 2 member 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT639514 | FYB | FYN binding protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT642468 | RSL1D1 | ribosomal L1 domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT653670 | SLC26A7 | solute carrier family 26 member 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT655192 | PHAX | phosphorylated adaptor for RNA export | 2 | 2 | ||||||||
MIRT657011 | KCNMB4 | potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT661008 | ABCB11 | ATP binding cassette subfamily B member 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT665816 | TMEM161B | transmembrane protein 161B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT683852 | ZNF208 | zinc finger protein 208 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT700436 | PURB | purine rich element binding protein B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT700517 | PTPN14 | protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 14 | 2 | 2 |
miRNA-Drug Associations | ||||||||||||||||||
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miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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