pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-552 |
Genomic Coordinates | chr1: 34669599 - 34669694 |
Synonyms | MIRN552, hsa-mir-552, MIR552 |
Description | Homo sapiens miR-552 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | |
Associated Diseases |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-552-5p | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | 25| GUUUAACCUUUUGCCUGUUGG |45 | ||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | ||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | SCAMP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SCAMP, SCAMP37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | secretory carrier membrane protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_004866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on SCAMP1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of SCAMP1 (miRNA target sites are highlighted) |
>SCAMP1|NM_004866|3'UTR 1 GAATCTTCAAACAATACACTGTTACCTTTTGACTGTACCTTTTTCTCCAGTTACTGTATTCTACAAATATTTTTATGTTC 81 AAAACACACAGTACAGACAGCATGGATATTTCCTGTTCACTTGTGCATGGGCTAAAACCAGGAAAACTTCCTTGTCTTAT 161 TACTTTACCTAATAGTTTCTTAATATTTCAGTGCCCCTTGCAGAAAAAATATTACATGCTAAATAAATATTCTCCATATT 241 TTTGGGGGATGACATTCAGTGAATTATTTCAGTGGTGACCCACTGAAAATTAATAATGGTACTTATGATTAAAAACGCAT 321 TTAATACTAACTGCAGTAGTTCTTTCAAGAATCTTTAGAGATAAGGATTGCACATTGGAAAAGTAAACCATGTTTCATTC 401 CTTTTTCCCTATTTATATTGAAAGAAATAGGCCAGCAGAGACTTAGGGATTTTAAATTGGCTTGCTTTTTAGCTGTTTCA 481 GTCACCAGTGAAGAGCCTATGTGCATTTTGTAGTAGATAATGTAAAATTTGTCATCTTTTTCTTTTCTTTTTTTTAGAAT 561 AGCTGATATTTTGATAACAATCTCTAATTTGCATGGGCACCACATTTCTTATATTAAAAGAATTAGTGTTTTGGCTTCTG 641 TACTGCTTATGGTTGTAGGATTCAGGGGTTAATGGAATCACAGAAATGATATTCTGCAAGAATTTCTTTTAAATAAAAAG 721 TTTGGGGGTGCAATATAAGAAGTTTATATAATATGCAGTACATTATCCAAAAGAGAAGGTAGTTAATGCAGTAGAAAGTA 801 GTGGTAATAATTCCTTTTTAAAAAAATTTCGGTAGTCATATAGTAACATTTTGCTATATGAAAACTTTGGTATATTCTGT 881 GGTTACAACTAAGATTGTGTCTGGCAGCTCTTTTTTGGGGATGTGTGTGTGTGATTTTTAACAGAGGTATTAAAGGCTAG 961 CCTAACTGTTGTCTAAAAAGATTGTACAGTATTTAAGGGATTTTCCTTTTAGCTTTTCATCTCCAGTGGCATTAAACATA 1041 AAAAGACCCTGGCATTTTTTCACATACTTGAATCCCTAAATGCACCTGTCTTTCACTTTTTGAGACAGACTGAATATATC 1121 TAAAATTTCCAGCAATAAAAAAAAAAGCATTTAACTTGCACCAAGCAAGAAAATATAAATACAGTTAACTGCATTAAGAT 1201 AATCACGTTAAAATTGTTACTATGCAGCACAGAACTTCATTCTTATAGTATTCTTGGGTTCAACCTTTGAATCAATTTTA 1281 CCACTGATTAAATAAATGACTCAAAGACATCTGTAAGTCATGCTGCTGTGTTTTGAAAGTCTTTAACTAAATTAAGATTG 1361 CAGAATGATAGTGATTATTCAATTAGATTTTAAGTAAGGATTGTGATATTAGAGGCTGGAAATCCTTATTTTTTAAAAAA 1441 TCAGATAGGCATAAATAGTTAAATCACTTTCATTCTCCCCAAACCTGTAGTTACAGAAAAAGTTTTATGCTAGAGGTGGG 1521 ATGCCAAGTTTTCACTATCCATGAAGCAGCGCTGCATGTCACTAGGTAACACAGATCCATCCAGATGGTGTTTACATTTG 1601 ATTTATTTGGGATCTTATTGACATCAGGTATACTTGGAAGACATTTCTTTTATTCTTCAGCGTATGAATTTAAAGCTATT 1681 TTTTGTAAATATTTCTAATCAGCGATAATTTCTACCTATGTTCTCAACCAACTTAGCCAGTTTGTTTTTCAGAGCCTGTA 1761 GTCTTATTGGAAATCTATTTTATCAGTGTGCTTTATTGAGTGTGGATTTTGCATACATTCAAAACATTAACCACAAAATA 1841 CAGCAAGTGCACCTATATTCACCATTAACTTATATCCCAAGTCCATTTTTTCCTGTACACTACAAACAAAAGATATATTA 1921 GAGACTTTTGAAAAATGCTGAAATACTTTGCTTCAGAATTGGAATGTTTATATTATGTAGAAATCTTCAAAGGTAGCATT 2001 ATTAAATAGCAAAGAATAATTAGAACCCACATATCTTTTTTTGTGTGGATGGGGAAAATGTTTTAAAATCCAGTTATTTA 2081 ATATGAGTTTGAGAGAGAAAATTGTTTTTTAAAAATATATGTGCATTGAAATGATGGCAATGCTTATAGTATGATCAAGT 2161 ATGAAAGGAACTTTAAATTCTTATATTTACTTTTCTCTCAGTAAATTGTTAAATTTTCACTCAGCAAAAGATTGGCATTT 2241 GTTAAGTGTTCTATATTTAGTACTAAAATCACAGTCATGAAATCATAGTCATAAAATGGTCTTCACACAGCAGTCATCCG 2321 TGTCATTTATCATTTTGTAATATTAAATTATGGCAATTTTATTTCAAACTAAAGTTTGAACACCGGAAAGTCATTACTCA 2401 GTGATTTGTAATTTGGGACTTGGATTATTTATCTAGAGATGTTTGTATATTTTGTCAGTAACTAATACTGCGCTGCCATC 2481 ATGGTGACTGTCATGGTTCTACAGAAATGCCCTCCATGTGTCCCTCTAATGTTGCATGTTTCAGTGGGTTGGAAGTTTTG 2561 TATATTTATTGTATTAACACAGAGTGTCATAAAATAAAATGCTGTTTACTGGATGTTTGTTTGTATAATTTTGAACACTA 2641 TAATAGCAATTCAGAGACAGACATTGTTAAAGGTTTGATGTATATAGAAATTCCATGTTTGATTTTTTAAAATATGTGTA 2721 TAAGTCTGTCATGTGCTAAACAAAATAATATGAAAGACCTAGTTAAAAATTCTAACCAATGTAAAATGACCATTTTTCTG 2801 TTGCATTAGACCTTTACAGGTAATGGAACATGAGCTTCACCCATATTAAATATTTTGGCCCCTTTAAGGTCAAAATACAG 2881 ATCATCTAGAAGTTAGATTCAAAATGGAAAACCTATTCATGGCTCAGATTTTTCATTGTGGGTTAAAAATGGGTGTCTCT 2961 GTACTAGTATTGTATTTATTCAATTGAACTTGTATTCTGATTTCTATCCTTGCTACCTATTGCTGTTTTATGTACTGATG 3041 AAAGTACCTATTTGTGTATATTGGATTTTTCACTTGGTTAGCTAAAGAAGATGTAAAAATATCTAAAATAATGTTCATGG 3121 TGAATCTTATTTTGAGAAATACATGTTAAAAAAGGAACAGTATTCTTTATTTTCTGGGTGTTATATTTAAAAAAGCAAGT 3201 TTGGATTTTTACACCTAATTTACTAGGAAAATATTTTATTCTGTAATTCATGTTAAGATTATGTATGGTTTGCATTTTAA 3281 GGGGATTTATGTTAGGTTAATTAGTTGTTTCTGTAAATCATTTGTAATAGCATAGTGCTTTTTACTCATTGCTGTATCTT 3361 TTTCTGAAAACACTGTTGTTAACATCTAATTCAGTATCCTTATTGGTACAAATCTGTGTTTGGCATGACTGTTTATATAC 3441 AGAATTTGTTACATTTTGAGCATTTTTTCCCCTGCTTATGTATACCTTAGAGTTACCATGGCTGTCATATACCATTTCAC 3521 TATATCTCCTTTCAGTTTTTCCTTAAGGAAAATGTTTAGAGGAATTTGTTCATTTCATGTGATTAAGCCCTTTAGAGATG 3601 AAATAAGATTGGTTAATTTTAAAAAAATTGAGGATGGTTAAAAAATAGAAAACACCTTACTTTGATACATTTTAAAGTAC 3681 AATAGTATACATTTATTTAGAGTAGACTAATGTGTTTAAAACATGAGTTGTTTTAAATACTTTTTTATTGAGCTAAAAAG 3761 TTTTATCTCACATATTAAGTATTACAGAAAGTGAAGTATTTTGGCTAGAATTTTAGGGCATATTTTATAAAGCAGCATGC 3841 CTGTAATATTGGTGGGTATTTTTAAACTTTAGGACTTTATCACAGTATGTAGAGAGCTAGAAATAAATCTAGAAACTTTC 3921 TAAGCCAGGTATTGCCACTAACCTGTCTTATATAAGCAGATACCTCTTATTTGAAGATTGTAGGAAAATAGAGAAAGACT 4001 GTTCTCCAGTTTTCTCACCCCCGCTGTGGGTTTTATATTTACAATTTAACTTTGGGGTTTGGGTAAGACAAACATTTAAT 4081 GTATAGGATTTTGGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACGAGG 4161 TCAGGAGATCGAAACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAATTAGCTGAGCAT 4241 GGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGACGTGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAG 4321 TGAGCCGAGATCTCTCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAGAAAAAAAAAAAAGAATTTTC 4401 ATTAGTGCTGGCCGTGTTTCAAATGGCAAGGGAACATGGGAACTATCATGTGGCAATGTAGTGAGTGTTAAACTTTGTGT 4481 TTGTCCAAATCCTGATTTATTTTTCAGTTCATATCTTTCTGGGCTTGACATGGCTGATGGTGTAGCTGAAACCCTCCTAA 4561 CACTAAAAGCCATTTAATCTTTTCTGTAATAGGAGCAGAAAATAGTTAATCATCCACCTAGTAATATAAGATTACTGTGA 4641 ATATTATCTTCTATACATTAAAACAGTTCTAGTTTGTAGAATAATACCATACAAGTTTTATTTTTAAATTCTAGTTATTT 4721 TCAGTGCTTACTTAAATGTAATTCTAGAATTCCTCCACAACTTTTAATATTTTGTATGCCAGTGATTCTCAAGATAAATC 4801 ATGATTGTAGTAGTTGTTACTGTTGGCAGTTTGTAGTAGTATTCAGGTATTTTGGGGATGGGGGAAAACACCAAAAATCA 4881 GTGTCTTTTATCTGGTGATCACTGTGGTATCTACAGTATTCTAGTCTCCTGCACAAAAACTGAACCCACTGGGCCTATGC 4961 ATCCCTCACACTTTTTTTCTAGTATAAAAGCAATACATAATGTGTTGTAGAACAATTAAAAATTCAGAAAGTGATACATG 5041 AGAAAATAAAAATAAATCCTTAATTCTGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | HEK293 |
Disease | 9522.0 |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
"PAR-CLIP data was present in GSM1065668. RNA binding protein: AGO1. Condition:4-thiouridine
"PAR-CLIP data was present in GSM1065670. RNA binding protein: AGO2. Condition:4-thiouridine
... - Memczak S; Jens M; Elefsinioti A; Torti F; et al., 2013, Nature. |
Article |
- Memczak S; Jens M; Elefsinioti A; Torti F; et al. - Nature, 2013
Circular RNAs (circRNAs) in animals are an enigmatic class of RNA with unknown function. To explore circRNAs systematically, we sequenced and computationally analysed human, mouse and nematode RNA. We detected thousands of well-expressed, stable circRNAs, often showing tissue/developmental-stage-specific expression. Sequence analysis indicated important regulatory functions for circRNAs. We found that a human circRNA, antisense to the cerebellar degeneration-related protein 1 transcript (CDR1as), is densely bound by microRNA (miRNA) effector complexes and harbours 63 conserved binding sites for the ancient miRNA miR-7. Further analyses indicated that CDR1as functions to bind miR-7 in neuronal tissues. Human CDR1as expression in zebrafish impaired midbrain development, similar to knocking down miR-7, suggesting that CDR1as is a miRNA antagonist with a miRNA-binding capacity ten times higher than any other known transcript. Together, our data provide evidence that circRNAs form a large class of post-transcriptional regulators. Numerous circRNAs form by head-to-tail splicing of exons, suggesting previously unrecognized regulatory potential of coding sequences.
LinkOut: [PMID: 23446348]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1065668 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO1 |
Cell line / Condition | HEK293 / 4-thiouridine, ML_MM_7 |
Location of target site | ENST00000538629.1 | 3UTR | AAAAUAAUAUGAAAGACCUAG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23446348 / GSE43573 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM1065670 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / 4-thiouridine, 3_ML_LG |
Location of target site | ENST00000538629.1 | 3UTR | AAAAUAAUAUGAAAGACCUAG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23446348 / GSE43573 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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118 hsa-miR-552-5p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT060509 | PPP6R3 | protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT061011 | C1ORF21 | chromosome 1 open reading frame 21 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT090823 | MBNL1 | muscleblind like splicing regulator 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT126569 | MASTL | microtubule associated serine/threonine kinase like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT147688 | CBX4 | chromobox 4 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT191746 | ELMSAN1 | ELM2 and Myb/SANT domain containing 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT202397 | GPCPD1 | glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT231334 | XRRA1 | X-ray radiation resistance associated 1 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT241355 | SLC16A1 | solute carrier family 16 member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT280627 | BCL11B | B-cell CLL/lymphoma 11B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT287408 | GPATCH8 | G-patch domain containing 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT314310 | FCHO2 | FCH domain only 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT321751 | ANKRD46 | ankyrin repeat domain 46 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT329335 | ETF1 | eukaryotic translation termination factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT346611 | PMAIP1 | phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT349189 | ZNF557 | zinc finger protein 557 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT357416 | HNRNPA0 | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT359670 | NUS1 | NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442751 | PLAG1 | PLAG1 zinc finger | 2 | 6 | ||||||||
MIRT446639 | SPTY2D1 | SPT2 chromatin protein domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT450820 | KCNB1 | potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT452304 | EIF5AL1 | eukaryotic translation initiation factor 5A-like 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT468814 | RSRC2 | arginine and serine rich coiled-coil 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT471878 | NUFIP2 | NUFIP2, FMR1 interacting protein 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT472681 | MYCBP | MYC binding protein | 2 | 4 | ||||||||
MIRT473123 | MLLT10 | MLLT10, histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT477434 | EML4 | echinoderm microtubule associated protein like 4 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT501254 | SECISBP2L | SECIS binding protein 2 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT501586 | PLCG1 | phospholipase C gamma 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT503371 | SCAMP1 | secretory carrier membrane protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT504358 | ARID1B | AT-rich interaction domain 1B | 2 | 6 | ||||||||
MIRT504421 | SHC4 | SHC adaptor protein 4 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT505497 | SRSF1 | serine and arginine rich splicing factor 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT505792 | RSBN1 | round spermatid basic protein 1 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT506471 | NAA25 | N(alpha)-acetyltransferase 25, NatB auxiliary subunit | 2 | 4 | ||||||||
MIRT507372 | EPS8 | epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT510850 | RAN | RAN, member RAS oncogene family | 2 | 8 | ||||||||
MIRT510986 | PER1 | period circadian clock 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT512987 | SEZ6L | seizure related 6 homolog like | 2 | 4 | ||||||||
MIRT514937 | GPR141 | G protein-coupled receptor 141 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT522131 | NRBF2 | nuclear receptor binding factor 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT524300 | CTC1 | CST telomere replication complex component 1 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT526363 | LSAMP | limbic system-associated membrane protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT526441 | RBM48 | RNA binding motif protein 48 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT526534 | MDM2 | MDM2 proto-oncogene | 2 | 4 | ||||||||
MIRT528065 | HES2 | hes family bHLH transcription factor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT531043 | TIPARP | TCDD inducible poly(ADP-ribose) polymerase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT532313 | FKBP9 | FK506 binding protein 9 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT533196 | WASF3 | WAS protein family member 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT535701 | NAV1 | neuron navigator 1 | 2 | 5 | ||||||||
MIRT536791 | HNRNPA2B1 | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2/B1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT537228 | GALNT7 | polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 7 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT538247 | CUX2 | cut like homeobox 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT538476 | CLOCK | clock circadian regulator | 2 | 2 | ||||||||
MIRT538798 | C2CD5 | C2 calcium dependent domain containing 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT539031 | ATXN7L1 | ataxin 7 like 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT542043 | SLC25A46 | solute carrier family 25 member 46 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT543093 | TNFRSF11A | TNF receptor superfamily member 11a | 2 | 2 | ||||||||
MIRT543545 | INTS2 | integrator complex subunit 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT554332 | SH3GLB1 | SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT556070 | MRFAP1 | Morf4 family associated protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT558125 | ENPP4 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4 (putative) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT559132 | BTG3 | BTG anti-proliferation factor 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT559423 | ASF1A | anti-silencing function 1A histone chaperone | 2 | 2 | ||||||||
MIRT560026 | ZNF780A | zinc finger protein 780A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566128 | RACGAP1 | Rac GTPase activating protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566441 | PHF13 | PHD finger protein 13 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT568541 | AKT3 | AKT serine/threonine kinase 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT568626 | ACVR2A | activin A receptor type 2A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT576599 | Nav1 | neuron navigator 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT609438 | USP27X | ubiquitin specific peptidase 27, X-linked | 2 | 2 | ||||||||
MIRT611441 | NRIP3 | nuclear receptor interacting protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT613007 | GABRB1 | gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT614149 | CEP97 | centrosomal protein 97 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT614580 | LHX1 | LIM homeobox 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT615631 | ATF6 | activating transcription factor 6 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT616115 | NDUFS1 | NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT620351 | WDR75 | WD repeat domain 75 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT621733 | TNPO2 | transportin 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT623718 | HACE1 | HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT626107 | MYLIP | myosin regulatory light chain interacting protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT630779 | CRLS1 | cardiolipin synthase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT632585 | PLCL1 | phospholipase C like 1 (inactive) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT635161 | HOXD12 | homeobox D12 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT635878 | SIX3 | SIX homeobox 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT636941 | LIMS3 | LIM zinc finger domain containing 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT637007 | LIMS3L | LIM zinc finger domain containing 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT639202 | LRRC9 | leucine rich repeat containing 9 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT639388 | PKHD1 | PKHD1, fibrocystin/polyductin | 2 | 2 | ||||||||
MIRT639543 | SMCR7L | mitochondrial elongation factor 1 | 1 | 1 | ||||||||
MIRT642071 | FUT11 | fucosyltransferase 11 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT642567 | GDPGP1 | GDP-D-glucose phosphorylase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT643035 | SNX24 | sorting nexin 24 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT648372 | SMPD1 | sphingomyelin phosphodiesterase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT648529 | KIAA1143 | KIAA1143 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT652184 | TRIM44 | tripartite motif containing 44 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT652945 | SYNC | syncoilin, intermediate filament protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT657012 | KCNK5 | potassium two pore domain channel subfamily K member 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT658993 | DIP2C | disco interacting protein 2 homolog C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT659629 | CDKN2AIP | CDKN2A interacting protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT659769 | CCBE1 | collagen and calcium binding EGF domains 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT660527 | ARIH1 | ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT668526 | ERP44 | endoplasmic reticulum protein 44 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT687184 | PRKAR1A | protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha | 2 | 2 | ||||||||
MIRT696280 | IER3IP1 | immediate early response 3 interacting protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT697673 | WASL | Wiskott-Aldrich syndrome like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT697716 | VKORC1L1 | vitamin K epoxide reductase complex subunit 1 like 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT699719 | SESTD1 | SEC14 and spectrin domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT701220 | OGDH | oxoglutarate dehydrogenase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT701436 | NFYA | nuclear transcription factor Y subunit alpha | 2 | 2 | ||||||||
MIRT701554 | NANOS1 | nanos C2HC-type zinc finger 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT707559 | CLVS2 | clavesin 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT707925 | PPP1R3D | protein phosphatase 1 regulatory subunit 3D | 2 | 2 | ||||||||
MIRT711148 | NAA15 | N(alpha)-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT719256 | CD44 | CD44 molecule (Indian blood group) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT719810 | TXNDC17 | thioredoxin domain containing 17 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT722650 | SIGLEC14 | sialic acid binding Ig like lectin 14 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT723901 | PEX11A | peroxisomal biogenesis factor 11 alpha | 2 | 2 |
miRNA-Drug Associations | ||||||||||||||||||
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miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||
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