pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4524a |
Genomic Coordinates | chr17: 69099564 - 69099632 |
Description | Homo sapiens miR-4524a stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | |||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4524a-5p | ||||||||||||
Sequence | 6| AUAGCAGCAUGAACCUGUCUCA |27 | ||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||
Experiments | Illumina | ||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | SESTD1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SOLO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | SEC14 and spectrin domain containing 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_178123 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on SESTD1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of SESTD1 (miRNA target sites are highlighted) |
>SESTD1|NM_178123|3'UTR 1 TAGCTACCAGCTACCTACAGATTTGCAGTTCATAATCCCGCATGTTGTCAACATACTACAGCATTAGCCACCACACCTTA 81 AGATGCATTTCACAGCCAAAATAAGTCTCATTTCTTTTCATGACACATTTCTCTTTACATGTTAACACCTTGCTACTACC 161 AAGGCATAATTACTTAACATGCTTCGAGGCTGTAGATTCCAAGTATCTTAAAAGAAGGAACTATAAACATTGCACTGAAA 241 ACTTGCTTTAAAGCTTTACCTGACCTGTCAGTTTGTAGACAAACAACTGATAATAAGCTTTGAATGGTGCTAATAAGAGT 321 AGGAATTCTCTCTATTAAAAAGAAAAAAAAAAGTTGCCCTTCCTCCACAGGTGATTTAGTAAATTTAGACAGTAGTTAAA 401 CTCTTGTTAGTAGACAGTGGTGTCCTCAAAATTTTACTTTGTAATTCTTCAGAATTGATTATTTTTATTGTGTCAATACA 481 GAGAAAGCCTTTCAGATCTTTGATATATCATAGTCATTAAAAGACCTTTTCCTATTTGTATTGATAATGTATTAAAAGTT 561 GTTTGTGCTTAATAAAAGACTTCTTTAAACATCTTATTTAATTTAGTAGTTACATCCTATTTCCAAACATGAGTGCCTTA 641 TTTAAAAGGGCATTCTTAGGACTGTGAGGATGGTTTAATATTTGTTTTTTCATGGTGGTTGCATGTATTTTAGACAGGAA 721 ATACATATGTAAGCATGTGTATATAATAAATAAGCATGTTTTATCATGAAAAATTATTGTGAACAATTTAGATCTTTAAG 801 AACTTATTAATAATGGAATACTATTTCTAATTTTTCTCTTTTTCAACTTGAAAAATATTCTCAAAATTATTAACTACCCT 881 GAAGATACTTTGTCTTTAGGGGAGGAGGGCTGAGGAAGAAGGCATACATAATTACTTCAGTGTAATCCTTTATATCAGAG 961 TAATCTTTCAGGAACTAAAATAGCAATTGTTAATAAAATTTAGTTTCTCATTATAGTCTAAAAGCAAAATAAATTCTGAA 1041 GTAGTCCAATAACAGAACTGTATGACCCCTTTAGAAATAAAATTTATCATGAAATGCTAGTTCTTTTAAGTTTGTATTAA 1121 GTTTAAATGGTAAAATGCATATAATTTAAATTTTATGTATTTTTATTTCAGAACATTTTTTAAAATATTAAAAATTATTT 1201 TTTAGTCTTGTAGTCATTACAAAATTATAAACGAGTTGTATACTGGTTCCTTTTTGAGGTCTACAAACATGCTCGTGTAT 1281 CTTCCAATGCAAAAAAAAAACCCCTCCCTTTTAACCTGCTAGTTTTTCCAGCCTTCTTCACTGACTGACAGACTTCTTGG 1361 AGAAATCCACATCCAGTGCCCCTACATCCTCATCACTCACTACTCAGCACCTTGCAGTCTGGTTTTACACAGCACTCTAC 1441 TGAAACTGTTCTTTTGAAAGTCAGCAATGGCCTCCCAGTTACCAAACTGAATGGTTTTTTTCTCCGTCTGAATCCCTTAC 1521 CCTTTTCTCTGCAACATTTACACCATTGAGCAACCTTTCCTAGACAGTGTCTCCTTCCTTGAAGATGCTATCCTCTGAAA 1601 TAACTGTGAGTACAGTCGCATAACCCTAATTTAAGATGTGCCTGCTGAACATGTGCTCTCTCAGATCCTGTCCTCAGAAT 1681 GCTTTTGGCTCTTTTCTCGGTATCTCATCCTTAGAGTTTTTATTTTATACCAATGTTCTGGATTACATACCTGGTCCAGA 1761 AATCTAGACTTGTACTTCTTTTTAATTGCCTAGTTGACATTTCAACCTTGATTAAAGATTGACAATATTTATCACCTTTT 1841 CCTCCTGGAACAATTTAGGTTAATGGTGCAGCCTTTTTTCCTAGTCAAACATGCCAGGAAGTTCAGGGCAAAGTTCAACT 1921 GCTCCCTCTTGTCTTATGTGGTCACTGCTTCTGAGAACATCCAGGAAGTTCTTTCTATACTTGAATCATCTTCTCAGTCC 2001 TTTGGGGCTTTACTGCTATGAGTATGAACTTTTGTGATTATTTATTTCAGTCTTCATGATGGTGCTATCACATTCTACAG 2081 TTGTTTATGTCTGTACCCAGTAAGCTCTTTTGAGGGAAGGAATCTTGTCTTCTCCTATTCCCAGTCTTGCTCATGCATAA 2161 CAGATGCCCATTCCTCCTAAATATGAATGCTGTATTATAGGCATTAGTAATAATCCCTGTTACATTGCAGTCTGAAGTAT 2241 GTTTTAAACATACTTTTTTAAAGTTAGAACTGACTTACAAGTGAATCTATTCTTAGATTCTTAGATACTAACTACTTTAG 2321 ATATTTAGTTATACTCAATAACTAAATATCAATACTCAATATCTGTTTCTTCTGAATTTCAGAGTAGTTAGAATGTTTTT 2401 CTTAAGACTTTGCTAGAAAGGAACTGGTTTGTTAGTAATTCTGCCATCAACTCATGGAGTTATAATTGCCAAATGAGTTA 2481 ATTTTTATATACCTTAAGCTATCTTGCCTACAAAAAGTAAAATAAGGCAGGATTCATAAATGTTACTTGTAAATTGAGTG 2561 TTTCACATGAGGCCAAGTATGATTTTAACATAATGAATATCATTGCTCCTCATCTGTAAATTTGCTGCTGCTTTCATATG 2641 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TTGACCCTCAAAGGCAACCACTGTTCCTTTTTCTACCATAAGATTTTTCTGTTCTAAAACTTTATATAAATAGAGTCACG 6241 CAACATGTACGCTTTTCTACAAGGCTTCATTTTTTTATTGCTGTTCTTTTTTATTGCTGAGTAGTATTCCACTGTATGAC 6321 AATATTACAGTTTGTTTTCTTAATTTCCTATTATTGATAGATACCTGGGCTGTTTCCAGGATTGGCCATTATAAATAAAG 6401 CTGCTATGACCATTCTTACGTAAGTCTTTGTGAACATAGGTTTTCATTTCTTTGCAGTAAATTCCTTGGATTAGAATTGC 6481 TGGGTCACAGGGTAGTTTTAAAAGAAACTGCCATACCTTTTTCCAGTTCAGTTTTATTGTGCCCTGTATTTTGTATTTTG 6561 ATGTGCATAAAGGTGTAAACTATTTTTATGATCCATATTGAAGTATTAGAAGAAGTGAGTTTGGAATAACAATGGCATTG 6641 TTCATGGTCAAGGATGACAATTGGAACTATCTGAGGAAAGCAAAGACCTGTCTGCCCCAGACAGCTCCTCAAGGGGTTCC 6721 TATGCCTGAAACTTTAGCAATATTTCACTCCTTGAAAGGTTAAAGCCCAACCATGGTGATATGTTAGCTAGAAGAAACAG 6801 CACTGGTTTGTTTATGTTACTAACTTTCACCACCCGTTTTCAGTAGGTAAAGTAAGACTGATCATTGAACAGAAAAGGTT 6881 ATTTCTGTGATGAGGTTGAGGGGGTAGTGGAAAGCATGTATTGCTAGTAAGCCCCAGGTACAGCTATGTGAGAGAGAGTC 6961 ACCTGGACAGGGAAGTCCCCCAAATGGTGGCCAGAAGAGCAGAAAACGGGGTGGGAAAAATTCTACCTCACAGTTTTGCA 7041 TAGGGGATAGCTATGCTTTTACGGGACATTTTAGCGTTTAAAAATATTTTCAATATTGTCTCTTTATTCAATACCACCCA 7121 GCTGTAGTTTTTTCACACTCTGATGACTCTCTTATCCACTCTTTTACCTCTCCCAGCTGTTCTATTACATACAGCATTCA 7201 CCTGTATTAGTCTATAGAATTATAATCATCTGTGTGTTTCTAATGCTCATTTTCAAAAATATGTATGGTTTATTCGATTT 7281 TTCCTATTAAAATTTTAAGGGCTGGGAAATTTGGCTTCTACTGTAAATCCTTATAATGTTCCACACATTGTAAATATGCA 7361 ATAAAAATGTTAACAACTATAATGGCAGCAGGTTTTGGTATGTATTTCTTTGATATATTGTCACTTTGGACAATAAGTTT 7441 GATTTCTGTTAATAAAAGTTGTTCATAAAATCTAGGGAGAATTAAGTCACACTGGTCTCTATAAGATAATCTGATGAATT 7521 CTGCATCTTTGAATCAATTTGAGTTATTTTTTGTAAAGGTTTAAATTGTTTCTAACAGTGTTACCTAAAACCTTTCATTA 7601 AATCAAAAATGTAACTTGTATATTCTGAAATAACCTGGAGTCTTAGAAGACAGAGGCTTCTGCTTCCCTCTCCCGTGACC 7681 CCAACAATCCCTTCCCACAGGCTTGGCACAGAAGTTCAGTGCTTTCTCTACGTCTCATGTTGTCAGAAATAGGTTCTCAC 7761 CATAATAGACAGTGGTGAAATTTCCATTGTTCCTACTGAGAAGTCCATTTTTAAGGCATCAAAGGTGAATGTGTATTTAG 7841 GGATGGAGGAGGCATATTACAACAAAGCTGTATTTAAAATAACACAATCATATCATGCTATAAACAATAGCAGTTCCAGA 7921 ATGGCTACTAAGGATTTTGGACTGCCAGACTTTGGAAATTGGCAAGCCTTATACCTTGTCCAATGAAGTTAAGTACATTT 8001 GAGTGACAGTTCAACATACAAGCAAAAAAATATATAGAAGACATTGTACATTTGTTATTAATGGACATGTTTACTTTACA 8081 TGTTAGAGTATCCATCCATCTCTAGGTTTTCCATTAGATGCTTCATTGTATCCACAAACCTGTTTCAAACCATTGAAGTG 8161 ATCTTACCATTGTGTTTGTTCAAAATAAAATTGGGAGAAAATGTGAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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