pre-miRNA Information | |
---|---|
pre-miRNA | hsa-mir-3152 |
Genomic Coordinates | chr9: 18573306 - 18573379 |
Description | Homo sapiens miR-3152 stem-loop |
Comment | Berezikov et al. proposed this sequence as a miRNA candidate based on the RAKE method . |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Mature miRNA | hsa-miR-3152-3p | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 45| UGUGUUAGAAUAGGGGCAAUAA |66 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | DRVs in miRNA |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene Symbol | BCAT1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BCATC, BCT1, ECA39, MECA39, PNAS121, PP18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | branched chain amino acid transaminase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001178091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_001178092 , NM_001178093 , NM_001178094 , NM_005504 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on BCAT1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of BCAT1 (miRNA target sites are highlighted) |
>BCAT1|NM_001178091|3'UTR 1 ATGGAAAATAGAGGATACAATGGAAAATAGAGGATACCAACTGTATGCTACTGGGACAGACTGTTGCATTTGAATTGTGA 81 TAGATTTCTTTGGCTACCTGTGCATAATGTAGTTTGTAGTATCAATGTGTTACAAGAGTGATTGTTTCTTCATGCCAGAG 161 AAAATGAATTGCAATCATCAAATGGTGTTTCATAACTTGGTAGTAGTAACTTACCTTACCTTACCTAGAAAAACATTAAT 241 GTAAGCCATATAACATGGGATTTTCCTCAATGATTTTAGTGCCTCCTTTTGTACTTCACTCAGATACTAAATAGTAGTTT 321 ATTCTTTAATATAAGTTACATTCTGCTCCTCAAACAAATGCAATTTTTTGTGTGTGTTTGAAAGCTAATTTGAGAAAATT 401 TCATAGGTTACATTTCCTGCAGCCTATCTTTATCCACAGAAAGTGTTTTCTTTTTTTTAAATCAAGACTTTTAAAACTGG 481 ATTTCCTCCCATCACTGTTTTTTGAAGGTCCTCCAAGTCCGTGTTAAGGTAAATATCTGTTTTCTTCCTGATGTCACAGC 561 CTGAGCATACTCTGTGCATTAGGAAGACCTGAGTGCATTTCCCACCATTGTCCTTTCCACATTATGTTGTAGCTGGCTGG 641 CTGTCAGGCGACTACAAGACTGAGGGTCTTGTGCCTTATAGATCTTTGTATCCCCCATGGCTGACATATAGTAGGTACTC 721 AGTAAATGGTTTTATAATGAATCAGTGAACATTTTGCTTCTATAGAAGTGTACCTTCTTTGTTTCTATATTATGAAACCT 801 CTTTATTAGAATTTGTGATTGATTCTGACAGTGTATAGATTTACCTTATATTGTCTTTATTTTCCATGAGCTACTAAGTC 881 ATTAGAGATACTCTGAAGCATAGTTAGTTTAGGAAATCACTTCATATTGATTGTATTAGAATTATCTTGGAATTGAAGAT 961 ATATCCCTAGAGCAGGGGACCCCAACCCCCAGGCCATGGGCCACACAGCAGGAAGAGGTGAGTGGTGGGCCATTGAGGAG 1041 CTTCATCTGTATTTATGGCTACTTCCCATCACTCGAATTACCACCTGAACTCCACCTCTTGTCAGCTCAGTGGCAGCATT 1121 AGATTCTCATAGGAGCACAAATCCTATTGTGAACTCTGCATGCAAGGGATCTAGGCTATGCGCTCCTTATGAGAATCTAA 1201 TGCTTGATGACCTGAGGTGTAACAGTTTCATCCTGAAACCACCCTTCACCCTGCAGTCTGTGGAAAAATTGTCTTCCACA 1281 AAACTGGTCCCTGGTGCCAAAAATGTTGGGGACCACTGCTCTAGAGAGAGGTCATGATATCATACCAACCAAATGGAAAT 1361 GACAAATGTTTTATGTCAAGTGTTAATTGCAGAAATAAATCTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAAACAAAGAGGCATACT 1441 CTGATTTTTATACTCTGTTTTTGCAGGTGCTCTTTTCTTTGAATGGAGATTTGATGAGCAAGTGGTTAGGATGCAGGGAG 1521 AGCTACTATGGGTGATATTTTCCTTGTTTAGGAGCTGTGAGTTAAAATTGTATCCTTTGTGGTTTATCTAAGGAAAGTCA 1601 AATCTTGACAGAAAACATTTTTCCTTGGAAGGTCAACTCTCAGACATTGTATTTTGGTTTCCCTCAGTCCTCATAACTTC 1681 CTTCTTGCTGAACATATTTTATTCTCTTTTCAGAGAAGGAAAATAAAAAGGATTCTAAAAGTTTGATGCATTGGAAAAAT 1761 TTCCTTGAGGCATTTAGCAACACATAGAAAATGGGCTTTGATTCTTTTCCAAAACTTTTAGCCATAGGGTCTTTTATAGA 1841 CAGGGATAGTAAAATGAAAATTGAGAAATATAAGATGAAAAGGAATGATAAAAATATCTTTTAGGGGGCTTTTAATTGGT 1921 GATCTGAAATCTTGGGAGAAGCTGTTCTTTTCAGGCCTGAGGTGCTCTTGACTGTCGCCTGCGCACTGTGTACCCCGAGC 2001 AACATTCTAAGGGTGTGCTTTCGCCTTGGCTAACTCCTTTGACCTCATTCTTCATATAGTAGTCTAGGAAAAAGTTGCAG 2081 GTAATTTAAACTGTCTAGTGGTACATAGTAACTAAATTTCTATTCCTATGAGAAATGAGAATTATTTATTTGCCATCAAC 2161 ACATTTTATACTTTGCATCTCCAAATTTATTGTGGCGAGACTTGTCCATTGTGAAAGTTAGAGAACATTATGTTTGTATC 2241 ATTTCTTTCATAAAACCTCAAGAGCATTTTTAAGCCCTTTTCATCAGACCCAGTGAAAACTAAGGATAGATGTTTAAAAA 2321 CTGGAGGTCTCCTGATAAGGAGAACACAATCCACCATTGTCATTTAAGTAATAAGACAGGAAATTGACCTTGACGCTTTC 2401 TTGTTAAATAGATTTAACAGGAACATCTGCACATCTTTTTTCCTTGTGCACTATTTGTTTAATTGCAGTGGATTAATACA 2481 GCAAGAGTGCCACATTATAACTAGGCAATTATCCATTCTTCAAGACTTAGTTATTGTCACACTAATTGATCGTTTAAGGC 2561 ATAAGATGGTCTAGCATTAGGAACATGTGAAGCTAATCTGCTCAAAAAGATCAACAAATTAATATTGTTGCTGATATTTG 2641 CATAATTGGCTGCAATTATTTAATGTTTAATTGGGTTGATCAAATGAGATTCAGCAATTCACAAGTGCATTAATATAAAC 2721 AGAACTGGTGGCACTTAAAATGATAATGATTAACTTATATTGCATGTTCTCTTCCTTTCACTTTTTTCAGTTTCTACATT 2801 TCAGACCGAGCTTGTCAGCTTTTTTGAAAACACATCAGTAGAAACCAAGATTTTAAAATGAAGTGTCAAGACAAAGGCAA 2881 AACCTGAGCAGTTCCTAAAAAGATTTGCTGTTAGAAATTTTCTTTGTGGCAGTCATTTATTAAGGATTCAACTCGTGATA 2961 CACCAAAAGAAGAGTTGACTTCAGAGATGTGTTCCATGCTCTCTAGCACAGGAATGAATAAATTTATAACACCTGCTTTA 3041 GCCTTTGTTTTCAAAAGCACAAAGGAAAAGTGAAAGGGAAAGAGAAACAAGTGACTGAGAAGTCTTGTTAAGGAATCAGG 3121 TTTTTTCTACCTGGTAAACATTCTCTATTCTTTTCTCAAAAGATTGCTGTAAGAAAAAATGTAAGACAAAAAAAAAAAAA 3201 AAAAACAAACAGAGGCAGAGGCAGGCAGTAGCAAGAAAGCAGAGCGTAACATCAGCTAGATGGTAACATGCAATGTCAGC 3281 TCTCTTGAAGACATGGGAAACCTAAGTTACACCTTGGGTTAAAATTCTTCACCATATTAGTTTTGTTGCTTCATAAAATT 3361 TACCTAAGCAAGTGGTCTTGCTTGCCTCAAATCCAAGCAGTCTTGAACACTTGGAGGCAATTAATGAGTATATCTTAGTC 3441 AAAAGAATTGTTGGAGCTTTTTATTAAAGCTACAGTTTCAGTTCTGCTTTTGGGGAATTGTGCTATGAAAGCAGCTGCCA 3521 AAATAAGCTCATTTATTTTCTTCAATCCCACTCAGTGCTCAGTCACTATATTCTGTTTCCTTTTTTTTTTTCAAGTTGCA 3601 TATTTGGTTTCCCCTTATGATTGGGAAAGATGAATTTTCAGCAGAAAACATTGTTTGTTCACTTTCAAAGAGTGATAGTT 3681 TCTAAAACATTTAGAGCAATAAATATTCATCAGAGGTACCAAGTAAGCCGGCAGAAGAGTTAAGGGTTAGAGAAATCCCT 3761 TATTTCATGTCTTGACTCTAAAATTATCAAAGTACTTTTCCTTGTAATGTGGATTTCTTCTTATGCGGATATGCAAAAAC 3841 TTCAGTTATACGTAGTAATGCTAGCAGGTAATTTTAGTAGACATTTTATAACAACTGTCACTTTGTTTCGCCACATGTAG 3921 AGTTTGTTCAGCTATTTTCCAGATATCTCCCCACAAAAGGAGGCAAAGGGTACCAGCTTTTCAATGAGCATTACCTATTA 4001 CTTGGCAAAGATGATGAAGACTCTATTAATAGTTCATTTGATAAATGTTGACATAACCAACAATAGAGATTAGGAAGTTA 4081 GTTTTAAGAAATCAATGGCATATAGACATTACCCTCATGGAGTTTGTATTCTACTACTTGAACTGATTGTAGCTATAAAA 4161 GCATAGTTAGATAGCTGAATAGTTAGATCATAAGCAAAGAAGGCCAGAACACATCTCTTATCAAGAAATCAATGAATAGT 4241 TTATCTCATTTTTAAAGCAACTTTATCCTTCTTTAATTCCTTCCTTTCTTCTAGTGCAAAACTACTTAATAAGGTTGGTG 4321 TTTAGGTTAGTGTTCACACCATTCCTCATCTGGTGTGAATTACCTTCTCTTTCTTTACTATTTACTACCAACCTAGTACA 4401 TGTGTTGACTGAATTCTTTTCAAACAATGTTGAGTTATCATGGTGCACCTAATAAATTAACACCACAGATTACAGCATCC 4481 TTGCTGATTTTCTCAGCAAAGCCAGATTAGATGGAAATAAACAAAGAAAATGATCCTAGAGTGAATTTTTCTAGAAAATA 4561 TCTATTATGAACCATGCTGTTTAAAGTATTAGCTTGAAGGTGATGGATCCAGCTATTCAGAAAATAACTTTCATATAACC 4641 ATGATTTTGCACAGTATGAGGTCTTAAATGTGTGGAAAGAGATAAATTTTTTATCATTACCACAAACCCCTTTTAAAGAT 4721 TCAAAGGTGGAAGAAAGTGATTTATTTTTTCTCTTCAGCATACATATATAAAAGACTTGTCAGATGTTTAATTTGGGGAG 4801 GTTGATAATGAAACATATCAACAGAGTATAGTAGTTATAGTAGTGTTTGTGGGTAAATAATTTCCTGGGGTCAGACATAT 4881 ATAAACATATTTGCTTCAAAATGATAAAGGCATGAAATCAGTCTTAAAAATTGAAATGGGGGTGATGGGGGAGAAAAAGA 4961 AGAACAAATTTGAAGTGCCCTTTCAAATCTGCTGGATACAAGTATTGAAGTTTTAAGTCATCTTATTCTGTCTGAAAGTG 5041 TATTTTTCATTCTACAATAGACCCAATCAACAAGACGTATAACTTGAGTTGCATGATGTTCAGTTTATGTAATCTACTGT 5121 TGGGATGGTAAGAATTGATGTAGGCTGTGGTGTAAGAATGAATTAAAATATAGTTTCACTGGCTTTTCTCTACATATCCA 5201 CTATCACAATGGCTAGGTTTCCTGTTGCTCACTATTGGATTCTGGAGAAAAATTTAATGAAAGATGATATCAGAGGAAGA 5281 ATAAGTGGAGGTAGAGAAGAAAGGAATGATAGAGGAGGGGAAAAAAACAAAACATATTTTTGTGTTATCCAAAGGAGCTT 5361 TTTCCTTATTCTGTCAAGCATTGAGATCTTCTTCAGCTTTCAATGTAGTTGCTAAATACAAATAATGCTACTAGGTAGTG 5441 ACTAAATATAGCAAACACTTCATCAGATATTAGAATTAGGTCACACTATTGAGGTTATAATCTGAAGGTTGTGTTACATA 5521 GAAACCACTTTAGATTATTATCAACTTGGACTAGGCTTTATTTTATAATAGCATAGTAAGTAATATCTATTGTGTCATTT 5601 CTTCAACCATTTTATTCTAAGATCCATGAAGCTTCTTGAGGCCAAATAAAATAATAAGTTTAGACAAGAAGTAGATTGTG 5681 ACTTTTTTCCCTTAGAGATACTATTTACTATCTCCTATCCTGATAGGTGGAAGGTTTACTGAATTGGAAATTGGTTGACT 5761 ATTAGTTTTTAACTAAAATGTGCAATAACACATTGCAGTTTCCTCAAACTAGTTTCCTATGATCATTAAACTCATTCTCA 5841 GGGTTAAGAAAGGAATGTAAATTTCTGCCTCAATTTGTACTTCATCAATAAGTTTTTGAAGAGTGCAGATTTTTAGTCAG 5921 GTCTTAAAAATAAACTCACAAATCTGGATGCATTTCTAAATTCTGCAAATGTTTCCTGGGGTGACTTAACAAGGAATAAT 6001 CCCACAATATACCTAGCTACCTAATACATGGAGCTGGGGCTCAACCCACTGTTTTTAAGGATTTGCGCTTACTTGTGGCT 6081 GAGGAAAAATAAGTAGTTCGAGGAAGTAGTTTTTAAATGTGAGCTTATAGATAGAAACAGAATATCAACTTAATTATGAA 6161 ATTGTTAGAACCTGTTCTCTTGTATCTGAATCTGATTGCAATTACTATTGTACTGATAGACTCCAGCCATTGCAAGTCTC 6241 AGATATCTTAGCTGTGTAGTGATTCTTGAAATTCTTTTTAAGAAAAATTGAGTAGAAAGAAATAAACCCTTTGTAAATGA 6321 GGCTTGGCTTTTGTGAAAGATCATCCGCAGGCTATGTTAAAAGGATTTTAGCTCACTAAAAGTGTAATAATGGAAATGTG 6401 GAAAATATCGTAGGTAAAGGAAACTACCTCATGCTCTGAAGGTTTTGTAGAAGCACAATTAAACATCTAAAATGGCTTTG 6481 TTACACCAGAGCCATCTGGTGTGAAGAACTCTATATTTGTATGTTGAGAGGGCATGGAATAATTGTATTTTGCTGGCAAT 6561 AGACACATTCTTTATTATTTGCAGATTCCTCATCAAATCTGTAATTATGCACAGTTTCTGTTATCAATAAAACAAAAGAA 6641 TCCTGTTTGTGTGGTTTCATGAAATCAGCATTGTTGAATGCATGAAGTAATAATGCTAAATTAACATTTTTATGATGTCT 6721 CAAGGTTTCTGGTCAAGGGAAGTAAATGTAGGATAGTATTTTTACACCAAAATGACACAGAGAGAATTGAGCACACCAGA 6801 AAGACCAGAAACCACACCACTGGATAGAGATTCAATATGTTTCTTTTTCAAACATTTGGACAAGAAAAAAATGGGCATTT 6881 AAAAATTCTTCCTTCCCCTGGTTATGGATTTATCTGTAGTAAAACTTAGCTTTGTCGTTTGAGATTTGCACAGAATGGGG 6961 GGAGTAGATTACCTCTTCCCATTCATTGTCATAATGGATCTACATCACTGATAAACACCATACTTCTATATGTGGTTAAC 7041 TAGCTTTAGAATAAAAGACACTTTAAAAAGTAAAAGGCCTAGAGATCTTCAATGAAGTGTCCCTTTTAGCCAAACCAGGC 7121 CTTGCAGAAATTGTCCTCAAAAGCACCAAGGGAGAACAAAGCCAAGTGCAGAATTACCCAAGGGTCACACATTTTGTATT 7201 CATTTTCTTATAATTTGCCCAAATGATTTGAAGTACAGCAAAACCTGAAGTTTTGCAAAGAGTTACTGTAAACTGAACTT 7281 AAAAATGTCAGAGTGCTCGGTGACCCACTTCTCCAGACCCTGTCAACCTGTGAAAATATTGGCCTTTATTCAGATCTCTC 7361 AAGAAGTTACGCGCAGAGTTTGGAAGGTCTAGGCAAAGGTTATTAGTCAAGTGTTCTTACAGTGTCAACGCTCAATTCCC 7441 ACAAGCGTGAGAAAGAGAGACCTGTCATTCCTGAGGGTGATGACATACATTTACTGGAGCTTATATAATTTATCAGATAA 7521 GACAGCAGTTTCCTTCAGGGTAGAAAGTGTGTTTTCTACATTGATTTAGTACAAAACAAAAAGAAAAGGGGATATTTCAA 7601 ATTTTATAATTATTTTTCTGCTAAGCTGATTCAGTGTGATTTAAGCATATTTTTCAAATCATGAATCTGATTCCATATAC 7681 ATATGTGCCTTATATTGTGATAATTTATTTTTAAGTGAAATATGCTATCATAGCCTGACTTTATGTATAGTGGTGACAAC 7761 TTGCAGGATCGCATTTCTGTAACCAAACGGCCGACAGCTGAGGTGTAGATGCTTCCTATGGTCTGTAGAATAATCACTGG 7841 GCTTGTTCTCTAGCTATGTCTGTATGCAATCGCGACAGTGTTGATCAAAACCCATGATCATTCTCTCCAAAGGTCTTTGT 7921 CACTAAGCCACTAGGGATTCTGAAAAGTTCGTGAGCTGAAACAAATAAATTGAGTTGGAAGATTAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DRVs in gene 3'UTRs |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in gene 3'UTRs |
|
Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
---|---|
miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
|
Conditions | HEK293 |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
PAR-CLIP data was present in GSM545214. RNA binding protein: AGO3. Condition:Control
PAR-CLIP data was present in GSM545216. RNA binding protein: AGO2. Condition:miR-124 transfection
PAR-CLIP data was present in GSM545217. RNA binding protein: AGO2. Condition:miR-7 transfection
... - Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al., 2010, Cell. |
Article |
- Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al. - Cell, 2010
RNA transcripts are subject to posttranscriptional gene regulation involving hundreds of RNA-binding proteins (RBPs) and microRNA-containing ribonucleoprotein complexes (miRNPs) expressed in a cell-type dependent fashion. We developed a cell-based crosslinking approach to determine at high resolution and transcriptome-wide the binding sites of cellular RBPs and miRNPs. The crosslinked sites are revealed by thymidine to cytidine transitions in the cDNAs prepared from immunopurified RNPs of 4-thiouridine-treated cells. We determined the binding sites and regulatory consequences for several intensely studied RBPs and miRNPs, including PUM2, QKI, IGF2BP1-3, AGO/EIF2C1-4 and TNRC6A-C. Our study revealed that these factors bind thousands of sites containing defined sequence motifs and have distinct preferences for exonic versus intronic or coding versus untranslated transcript regions. The precise mapping of binding sites across the transcriptome will be critical to the interpretation of the rapidly emerging data on genetic variation between individuals and how these variations contribute to complex genetic diseases.
LinkOut: [PMID: 20371350]
|
Experimental Support 2 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
|
||||||
Conditions | HEK293 | ||||||
Disease | 586.0 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
"PAR-CLIP data was present in GSM1065670. RNA binding protein: AGO2. Condition:4-thiouridine
... - Memczak S; Jens M; Elefsinioti A; Torti F; et al., 2013, Nature. |
||||||
miRNA-target interactions (Provided by authors) |
|
||||||
Article |
- Memczak S; Jens M; Elefsinioti A; Torti F; et al. - Nature, 2013
Circular RNAs (circRNAs) in animals are an enigmatic class of RNA with unknown function. To explore circRNAs systematically, we sequenced and computationally analysed human, mouse and nematode RNA. We detected thousands of well-expressed, stable circRNAs, often showing tissue/developmental-stage-specific expression. Sequence analysis indicated important regulatory functions for circRNAs. We found that a human circRNA, antisense to the cerebellar degeneration-related protein 1 transcript (CDR1as), is densely bound by microRNA (miRNA) effector complexes and harbours 63 conserved binding sites for the ancient miRNA miR-7. Further analyses indicated that CDR1as functions to bind miR-7 in neuronal tissues. Human CDR1as expression in zebrafish impaired midbrain development, similar to knocking down miR-7, suggesting that CDR1as is a miRNA antagonist with a miRNA-binding capacity ten times higher than any other known transcript. Together, our data provide evidence that circRNAs form a large class of post-transcriptional regulators. Numerous circRNAs form by head-to-tail splicing of exons, suggesting previously unrecognized regulatory potential of coding sequences.
LinkOut: [PMID: 23446348]
|
CLIP-seq Support 1 for dataset GSM545214 | |
---|---|
Method / RBP | PAR-CLIP / AGO3 |
Cell line / Condition | HEK293 / Control |
Location of target site | ENST00000261192.7 | 3UTR | UUUUUAACUAAAAUGUGCAAUAACA |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 20371350 / GSE21578 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM545216 | |
---|---|
Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / miR-124 transfection |
Location of target site | ENST00000261192.7 | 3UTR | UUUUUAACUAAAAUGUGCAAUAACAC |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 20371350 / GSE21578 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 3 for dataset GSM545217 | |
---|---|
Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / miR-7 transfection |
Location of target site | ENST00000261192.7 | 3UTR | UUUUAACUAAAAUGUGCAAUAAC |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 20371350 / GSE21578 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 4 for dataset GSM1065670 | |
---|---|
Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / 4-thiouridine, 3_ML_LG |
Location of target site | ENST00000261192.7 | 3UTR | UUUUUAACUAAAAUGUGCAAUAACACAUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23446348 / GSE43573 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
60 hsa-miR-3152-3p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT068760 | RB1 | RB transcriptional corepressor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT142268 | DCTN5 | dynactin subunit 5 | 2 | 8 | ||||||||
MIRT179443 | TBRG1 | transforming growth factor beta regulator 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT221382 | DNAJB6 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT332510 | CD81 | CD81 molecule | 2 | 2 | ||||||||
MIRT442419 | KCNN3 | potassium calcium-activated channel subfamily N member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT445519 | PLXDC2 | plexin domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT464185 | VMA21 | VMA21, vacuolar ATPase assembly factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT467933 | SLC16A6 | solute carrier family 16 member 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT468378 | SETD5 | SET domain containing 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT468486 | SESN3 | sestrin 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT468928 | RPS24 | ribosomal protein S24 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT478171 | DENND5B | DENN domain containing 5B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT490447 | GLUD1 | glutamate dehydrogenase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT494675 | ARL5B | ADP ribosylation factor like GTPase 5B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT502287 | GNG5 | G protein subunit gamma 5 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT506078 | PPP2CA | protein phosphatase 2 catalytic subunit alpha | 2 | 6 | ||||||||
MIRT508008 | BCAT1 | branched chain amino acid transaminase 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT508760 | IPP | intracisternal A particle-promoted polypeptide | 2 | 2 | ||||||||
MIRT509091 | SYNPO2L | synaptopodin 2 like | 2 | 4 | ||||||||
MIRT511968 | EIF1AX | eukaryotic translation initiation factor 1A, X-linked | 2 | 4 | ||||||||
MIRT515210 | CRCP | CGRP receptor component | 2 | 2 | ||||||||
MIRT516377 | TRAF3IP2 | TRAF3 interacting protein 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT517047 | ZNF678 | zinc finger protein 678 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT521125 | SHROOM4 | shroom family member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT521277 | RTF1 | RTF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component | 2 | 2 | ||||||||
MIRT522772 | LAMP2 | lysosomal associated membrane protein 2 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT524419 | CNKSR3 | CNKSR family member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT529398 | ICK | intestinal cell kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT529965 | PHF7 | PHD finger protein 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT530189 | TIGD2 | tigger transposable element derived 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT533716 | TMEM30A | transmembrane protein 30A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT543170 | FICD | FIC domain containing | 2 | 2 | ||||||||
MIRT548496 | E2F8 | E2F transcription factor 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT555020 | RAB23 | RAB23, member RAS oncogene family | 2 | 2 | ||||||||
MIRT560728 | ZNF529 | zinc finger protein 529 | 2 | 10 | ||||||||
MIRT564890 | YTHDF3 | YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT567327 | HMGB1 | high mobility group box 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT568035 | CLIP4 | CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT574763 | FLVCR1 | feline leukemia virus subgroup C cellular receptor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT620811 | SLC26A2 | solute carrier family 26 member 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT622456 | RNF19B | ring finger protein 19B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT636240 | SIM1 | single-minded family bHLH transcription factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT643231 | MUC15 | mucin 15, cell surface associated | 2 | 2 | ||||||||
MIRT646319 | CAPZA2 | capping actin protein of muscle Z-line alpha subunit 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT646674 | CCDC69 | coiled-coil domain containing 69 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT650043 | VHL | von Hippel-Lindau tumor suppressor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT652533 | TM9SF3 | transmembrane 9 superfamily member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT663022 | CD40LG | CD40 ligand | 2 | 2 | ||||||||
MIRT667465 | MAPK10 | mitogen-activated protein kinase 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT668620 | EEA1 | early endosome antigen 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT675678 | SLC35F5 | solute carrier family 35 member F5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT681814 | N4BP2L2 | NEDD4 binding protein 2 like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT682674 | CPM | carboxypeptidase M | 2 | 2 | ||||||||
MIRT701447 | NFIC | nuclear factor I C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT706222 | C20orf144 | chromosome 20 open reading frame 144 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT707510 | PPP1R16B | protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT710466 | ASTN2 | astrotactin 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT712957 | SGCD | sarcoglycan delta | 2 | 2 | ||||||||
MIRT723030 | MYLIP | myosin regulatory light chain interacting protein | 2 | 2 |
miRNA-Drug Associations | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|