pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4640 |
Genomic Coordinates | chr6: 30890883 - 30890972 |
Description | Homo sapiens miR-4640 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4640-5p | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | 9| UGGGCCAGGGAGCAGCUGGUGGG |31 | ||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | ||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Biomarker Information |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | ANKRD52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ANKRD33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | ankyrin repeat domain 52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_173595 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on ANKRD52 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of ANKRD52 (miRNA target sites are highlighted) |
>ANKRD52|NM_173595|3'UTR 1 CCCCCTCCAGTGTCCCTCCCCCGCCGGTGGCTTGATATCTAATTCTATTTATTTAGAAAAAGTCTAAACATTTAGGGCAC 81 TTTAAAGGAGAACACGACTGGGTGGAGGGGGCGGAGGGGAAGGAAGCCCTGGGGAGCAGCTGCTCACCCCTTTGCCACAC 161 CATCTTGGCCTGGCAGGGGTCTGGGACTGACAGGGAGCACCCCAGGCCCTTGGTACCCCCAGGGCGACCCCTTCTGCCAA 241 GTGTCCCAAAATGATTGCTAAATGCCTGGCTCCCCCACTCTTTGACTCCATCTCTTGGTTCCCTCTTTCTGCTGCCAGCT 321 CCCCCGACTCTTCCCTGGGGACTCCTCTCTGTGTCCCCCTTCTCCCCTGCCCCTACTGCCAGGCAGATCCCCTCTTCTTC 401 CATACCCATCACTGCCTCCCTGCTCGGCCGGTCCCTCCATCCCCGCAGCAGTGAGAAGCCTTAATTTCTGGTACTGTGTG 481 AGCACTCTGGGGGTGTCCCCCTCCCCCCTTCAGGGGCAGCTAGAGGATGAGGGGGGAGGATATTTAGCACTGGGGCCTGG 561 AGCTTTTTCCCCACTTCTGTACCCTATCACCCCTAAAGTTCAAATGCAAAACACTTGAAGCAGCAACTACTGTACCTGGG 641 CCCCAATCCTGCACTCTCCCCTGGCTCCTCATATGCAAATCAAGGGCTGGTTCTGCCCCCACAGCCTGCCCCCTCCCCAT 721 TCCCTCCCACTCCTAGCCTGGCCCCTAACCACGCACTTTAACCTTGCTTCTTTCTTTTATCTTCTTTTGGGAGGGCAGAG 801 CCTGTGGTCATTCCTGCCCTGGCTCTCCTTCCCTTGAACTTTGAGGCTTGTCATGAATTTTTAAGTAAGCGTTTTATCCT 881 TTAGGGGAAGAAACAAATTAATTTCCTGCCCATTTCAAAACCACAGCCCTAGTATGTCCACTGTGTTTCAGGCATGTGTT 961 TGCATGTATATGGAGGGAGGGACCATGTTCTTCCTCCTGTGCCGCCAAGCCCATAGTTTATCTGTGCTCCCTATCTGCCT 1041 CCACCTTCCGTTATGTCCAAGAGTACCCACTGCCCCAGTCACTCCTGATCTGAAGCCAAAGATGGTAGGAGGGGCAGGGC 1121 CGACAAGGGACCGTGGCTACTCGGGACCCAGGCTTCCCCTCCAGTGTGAGGAAGAAGCTCTGACCTAGAGAGAGATGAAT 1201 AGGTACTGGGGCTTGGTCCCTGCCTTCCCAGCAGGGAGGAAAGATGGGATTGAGCTGGGGGCTGCACTGATAAGATTTCT 1281 AAAGTCGCACCCCAAAAGCCAAACTGGGCTGGAGTGAAGAGGGGGCAGTTTTCTCTCTAAATGTAGCATTGAATTTGGCC 1361 CTGGTCCCTTTAAGTGCTCTGTCCACCCATCTCCTAGTGCAGCCTCCTGGACAGTTGGACCCACTCCTGCAGCCCAGTGT 1441 TCCCTTCCTCACACTCAATACCTCAGCCAGGGGCCAAGACACAGAACTTGAATAGAGGTCATGCCCCCTCCGCCCCCACA 1521 CTGCATCCTTGCCCAGTTTGGCTGCCATCAGTATTGTCCCCTGAGAACTGGACAGGCTTCGTTTACACAGTACAGGGTCT 1601 CCCCTGAGGGGGGATCCTTCAGCCTCCCTCCCCTACTCAAGTTTGCTTTATTCACAGTCTTACCCATCTTTTAGTTGTAT 1681 ACCCTGAATGTCTTGCCACCCTTGTCAAGGGTGGGCTGAGGGGAGGGGGGCGTCCCAGGGACCCCCTCCCTCCCCAACGG 1761 ATACCTTTAACCATACCTCATGCTGGTTTCCAGAAGCCTGGGGTGTTGTCCAAGTCCTTATCTTTTCATGGTCCCTTTTG 1841 ATCCCCTGTCTCTCTGTGTTTTGCTTCTCCCAACCCTCAGTTCCTAAATCATTTCAAGGCTTCCAAATGACCATTATTGA 1921 TGAGAAGGATTGTGCAGCTTTTAGTTTTTATTTTTATTTTCAAAGCCAAAGGGCCTTGTGACGCCCCTCTTGCCCACCTC 2001 CCTCCACACCGTGTCCTCCCCTATATGACAATCAATGTGACCTCTCTTAAGGGCTGCAGCCCCCATCCCCAACCCTGCTG 2081 GCTCTGCAAAGCTTGCCTTCCCTTCAATTCTCTCTCCTGAAATCTTCCCATTCCACCCCCTCCCTCTCATCTTGGTGCTG 2161 GGAATTAGGTGGTGGGGGGCAAGGGGAGTGAGAAGATGGGTCCTCCAGAGAGAACTTGCCGGGTGTGAGTCGTGTTCTCC 2241 TTTCGTGATGTTTGGTGATGGCGGGAAGCGTCTGAGTGTCAGAGCCCCGTTGTCTTGCTAGATGAGATTTCTGGGGGCTG 2321 TCTGCGCCCTGCTGCCCTCAGCGCACTGTCAGCAGTGCTGGGAGGTGGTGGGGAGTCCTCTGTCCCTCCATATGTGGCTG 2401 TGAGGAAGCCTGGGGGACAAGCAGCCTCCTCTCCTTATGCCAAAGGAAACCCCACGCCCCACCCTGGGCTCCCCAGCCCT 2481 AGTGTTTTTTGAAGCATTTTGACCATTCTCATGGCCACTGCATATTTATTTTAATGTTAAGATTTTTTTTAAACCTCTTT 2561 GACTTAAACGGGTGTGGAGAAGTAAAACAGGCAGAATGCCCCCCAGTCTTCATGGGGGAGGGCGGGGAGGGAACAGCGCC 2641 TTCCCTTTGCCCTCCCCCTCCCCCCTCTCCCCACCGCAGCCCTAAAGCACTTGCTTCAAGTAATAAGCACTTTTGTGAAA 2721 AGGCCTATTTTAAGCGAGGACCCTGGGAGCAGCCCCAGGTCCCAGCAAAGGAAACAGAGCGAGGGCGACATAGGAGACAG 2801 GGAAACAGACGTGTGAATCAGAGGGTGAGATGGAAAGAGCCAGTTTTTAGTTTCTGATTTTGGGGGAGCTATTTCTGATT 2881 GGGCGGTGGCTCTGGTAGGGTCATATACTATCCTTCAGAAAAACGAATGGCACAAACCGTGGGTCCCAGGAAGGACCAGC 2961 AGACCCGGGTCACTGCCACTGTCCACTGAGACTGACGGGCCACCTCCCCTGCCCCGTGGCCCCCTGAGCCATAGGACTGC 3041 TGAAAACCACTGAATGTACAGCCCAGGTTGGGGTGGGGAGCAGCCCCTGGGGGAGGGGGCTTCTCCTTTTGTTTGGTGCT 3121 GTGGGGCGTGGGAGAGAAAAGACTGAGGGACTGCCACCCCACGTAGATGTGTTTCTTGGGGTGGAGGGGCTGAGGAGGGC 3201 CTACCTCCCTCTCCAACCCCAGCCATGGCCCCTCTTCCTTCCTCACCCCTATCCGTTTTGACTGTAAGTCCAGCTCACCT 3281 TTGCCTTCAATATGTAACCAAAGGAAAACTCAATACTGTTTCCACCACTGTCTGCCCACCCGAGCACCTTCTTACTCCCT 3361 GGACCTAGAAGGGGAGAAGAGGCTGGAGGTGGGGTGGATGGGGCCAGAGTGAACGGTTCTACAGCTGTATCCCCAGAACC 3441 TCCTCCAGGGTCTTGGAAGGAGTCCTGAGAGGTGGGATTGGGGCCGGGCTGGCAGGGCTGAGTTTGCGCACTGTGTATCT 3521 TATGCACATGAGTGTTTTTGTCTAAATGACTCCAGTGACTGCTCCAGCGGGGAGGCCCCTTCCTCCTTCCCTCTCAGCCA 3601 TTTCTCACCCACTTCCCATACCCAGTGTTCATCCCCTACCTCCCCTTCCCACCGCAAAGGAAAATAGCCTTACAGACCCT 3681 AGCCCAGAAACCCTACTCCTGGGGCAAACCAGTATGGGCCCCCATCCCGCCTAGTTTGAACCCTACCTTTTAAGAAGGAG 3761 GGATAAGGAACAAAGCAGCCCCTTCCCCTCTAATTGTGGTGGCTCCAGCCTTCTGCAGCCTTGACCCAGGTTGGGCAAGG 3841 GCGGAGGTGAGGAATCTTTGAGGACCAAGCCCAGTGGTCTGGGAATCGGGAGGTAGAGAGGGAAGGGTCTGCCTTGGGGG 3921 CTCCCTCCTCCCAACCCAACCCCTAGAGAAGCGACCAAATCCCAGAGATGGGGTGAAGCTGGGGTGGGGAGGGTCTGCTC 4001 TTTGAATTACTTGAAGGTACTGACTCCAAGGCTGCTGTTGCCCACTTAGGTGTGAGGGGGACACTGTCACTGCATTTGGG 4081 AGGGCAGAGGGTGGCGGGTAACCAGAGGATCCACCTTGGCCCTCACCCACTCCTGCTAGGCCCTTTCCCTGGGGAATCTG 4161 GAAGCCTGACTTTGCCCCCAGGGAAGTTGGGGACCGCCTTCCCTCCCTTCTCCACCTCTCACTCTGGGCACCCTCTCCAA 4241 TTGCACTAAAGTAGCTGTTGTGCCAGTCTGCCCCCCACAAGGGGGGAGGTCTCTGCTTCCAGTCTTCTTCCCCCGCTGCC 4321 TCCGCTCCCACCCTGGACAATCTCCTTGTTTCCCTTGTGTTCCTGGATAGCTCAGCTTTGTATGTGTGTTTGGGGGGTGG 4401 GGGTGGGTTCTGGCTTGAGTGGGTTTGGCAGGGGTTTGGGAAGGGTTAGGGGAGGATGGAGGATGAAGTCTCCTACCCCC 4481 TTCTCCAGCTCCAGGCCACAGAAGCCTGGGAAGGGAGGGTGCCTACTCTCGCTGCTGTGTGTCTTGCAGATGTGCCAAAA 4561 TGGGGGTGGGTGGGAGGGGAGGGTGCCTGGCAGAGCAGCCCCTGGGGTGGCTCTCTCAAAGCAATATAGTTCCCCTGCGG 4641 GGGACAGCAAGACAGGGGAGAGGGTTGGGGTGGGGACCTGGGGGTTCCCCATGTACAGCTATGTATATTCAGGGGTGTTC 4721 TCCGTCTGGTACCCGCTGTGGGCATCTATGTGTGTGTGAACCTCCCCTTCCCCATGCCCTGCATGACCTGTGATGCTGCA 4801 GACACCACCATCCTGTGTGCAGGTGTGTGTTGGGGGGCACGGAGGGGCATGTTCCATGTCCTGTTGCACCCTCCACCCTG 4881 TGACCCATGTACTCGGTTGTAGGAAGTAAAGAGAACTGAGCACAATTCACTGGATTCTAGTGGAATCTTTCTCTAAGCAA 4961 TTTTCCCATTCCTGCCTCTCCCTGCCCCGGAACCACCTGTGGTGCTAGTGTTGGGATCGGGGGCGTTTAACGCTGGTGGG 5041 CAGCAATAAGGGGCAGATGTGCCCAGATGCCTGCATCCCCAGGGTGCCGAGGGCAGCAGGAAAAAGTGGGGACCTCGGTG 5121 CATTTGCCCCACCCCTCCCCTCCCTGGGCTAAAGCACAATGTTCTCCCCGCAGATTAATGACCCTGCACCCTCCAGGCCC 5201 CTACTCACATCCTCCCCCAACCGGCTTCGGGTCCTCCCACCACACTCTGGTTTTCTATGCTGTTTTGGTGCAAGTACAAC 5281 TGTCGTAGTCATGGCTTTGGGATGGGTTCTGTTTATTAAAATCCTATTGCTCCTA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | HEK293 | ||||||
Disease | 283373.0 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
"PAR-CLIP data was present in GSM1065670. RNA binding protein: AGO2. Condition:4-thiouridine
... - Memczak S; Jens M; Elefsinioti A; Torti F; et al., 2013, Nature. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Memczak S; Jens M; Elefsinioti A; Torti F; et al. - Nature, 2013
Circular RNAs (circRNAs) in animals are an enigmatic class of RNA with unknown function. To explore circRNAs systematically, we sequenced and computationally analysed human, mouse and nematode RNA. We detected thousands of well-expressed, stable circRNAs, often showing tissue/developmental-stage-specific expression. Sequence analysis indicated important regulatory functions for circRNAs. We found that a human circRNA, antisense to the cerebellar degeneration-related protein 1 transcript (CDR1as), is densely bound by microRNA (miRNA) effector complexes and harbours 63 conserved binding sites for the ancient miRNA miR-7. Further analyses indicated that CDR1as functions to bind miR-7 in neuronal tissues. Human CDR1as expression in zebrafish impaired midbrain development, similar to knocking down miR-7, suggesting that CDR1as is a miRNA antagonist with a miRNA-binding capacity ten times higher than any other known transcript. Together, our data provide evidence that circRNAs form a large class of post-transcriptional regulators. Numerous circRNAs form by head-to-tail splicing of exons, suggesting previously unrecognized regulatory potential of coding sequences.
LinkOut: [PMID: 23446348]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1065670 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / 4-thiouridine, 3_ML_LG |
Location of target site | ENST00000267116.7 | 3UTR | CCCCUAACCACGCACUUUAACC |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23446348 / GSE43573 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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87 hsa-miR-4640-5p Target Genes:
Functional analysis:
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Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT100106 | ABT1 | activator of basal transcription 1 | ![]() |
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2 | 8 | ||||||
MIRT248144 | LMBR1L | limb development membrane protein 1 like | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT327062 | KLHL15 | kelch like family member 15 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT347231 | GATAD2A | GATA zinc finger domain containing 2A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT450221 | CENPN | centromere protein N | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT451264 | NDUFA11 | NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A11 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT452701 | C1orf226 | chromosome 1 open reading frame 226 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT453212 | CERS1 | ceramide synthase 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT454822 | POLR2J3 | RNA polymerase II subunit J3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT454883 | RAD50 | RAD50 double strand break repair protein | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT455783 | TAF8 | TATA-box binding protein associated factor 8 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT455858 | TMEM254 | transmembrane protein 254 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT457615 | UPK3BL | uroplakin 3B like 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT457822 | ITPRIP | inositol 1,4,5-trisphosphate receptor interacting protein | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT458344 | NOC2L | NOC2 like nucleolar associated transcriptional repressor | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT458376 | ITM2C | integral membrane protein 2C | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT458928 | SAMD4B | sterile alpha motif domain containing 4B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT459066 | WFIKKN2 | WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT460138 | ASB16 | ankyrin repeat and SOCS box containing 16 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT460818 | FSTL4 | follistatin like 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT461285 | COX10 | COX10, heme A:farnesyltransferase cytochrome c oxidase assembly factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT462738 | EFNB1 | ephrin B1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT464556 | UBTF | upstream binding transcription factor, RNA polymerase I | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT477910 | DUSP2 | dual specificity phosphatase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT479073 | CNNM4 | cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 4 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT479534 | CDC5L | cell division cycle 5 like | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT485628 | EEPD1 | endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT489896 | PPIC | peptidylprolyl isomerase C | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT490737 | SRCIN1 | SRC kinase signaling inhibitor 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT491201 | MLLT1 | MLLT1, super elongation complex subunit | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT492681 | PHYHIP | phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT494593 | ATG7 | autophagy related 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT495061 | PADI3 | peptidyl arginine deiminase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT496623 | TMEM67 | transmembrane protein 67 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT497177 | ZBTB40 | zinc finger and BTB domain containing 40 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT498217 | TLN2 | talin 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT498306 | BCL11B | B-cell CLL/lymphoma 11B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT499668 | NPHP3 | nephrocystin 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT508080 | ANKRD52 | ankyrin repeat domain 52 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT509707 | ANKRD23 | ankyrin repeat domain 23 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT509841 | FOS | Fos proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT512814 | ARRDC2 | arrestin domain containing 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT513353 | SLIT1 | slit guidance ligand 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT514293 | FXYD5 | FXYD domain containing ion transport regulator 5 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT516598 | FAM89A | family with sequence similarity 89 member A | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT516616 | DARS2 | aspartyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT518348 | CCL5 | C-C motif chemokine ligand 5 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT520130 | WSB1 | WD repeat and SOCS box containing 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT522072 | ORAI2 | ORAI calcium release-activated calcium modulator 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT526461 | OSBPL5 | oxysterol binding protein like 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT528278 | MBL2 | mannose binding lectin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT534844 | RAB15 | RAB15, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT542245 | HSPA4L | heat shock protein family A (Hsp70) member 4 like | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT543299 | ZNF585B | zinc finger protein 585B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT552456 | ZNF410 | zinc finger protein 410 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT553641 | TJAP1 | tight junction associated protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT557103 | HOXA3 | homeobox A3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT570782 | FANCA | Fanconi anemia complementation group A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT630912 | ZMAT2 | zinc finger matrin-type 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT631034 | ZNF878 | zinc finger protein 878 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT639017 | AAK1 | AP2 associated kinase 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT648596 | ZYG11B | zyg-11 family member B, cell cycle regulator | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT648939 | ATP5A1 | ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, alpha subunit 1, cardiac muscle | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT652834 | TACO1 | translational activator of cytochrome c oxidase I | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT659347 | CSRP1 | cysteine and glycine rich protein 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT664163 | APOBEC3F | apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT670511 | ZSCAN22 | zinc finger and SCAN domain containing 22 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT671246 | TMEM41B | transmembrane protein 41B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT672120 | ATP6V0A2 | ATPase H+ transporting V0 subunit a2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT672313 | CD3D | CD3d molecule | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT672543 | BRMS1L | breast cancer metastasis-suppressor 1 like | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT673036 | SGPL1 | sphingosine-1-phosphate lyase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT673814 | DARS | aspartyl-tRNA synthetase | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT674858 | GINM1 | glycoprotein integral membrane 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT674970 | SH3BP2 | SH3 domain binding protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT675185 | KIF1C | kinesin family member 1C | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT675219 | UGDH | UDP-glucose 6-dehydrogenase | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT675558 | MED16 | mediator complex subunit 16 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT682566 | EIF4EBP1 | eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT684640 | PDE4C | phosphodiesterase 4C | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT689722 | ATXN2 | ataxin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT693594 | SLC39A1 | solute carrier family 39 member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT704745 | CDKN2B | cyclin dependent kinase inhibitor 2B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT712779 | ZNF154 | zinc finger protein 154 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT718118 | OTOF | otoferlin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT720115 | SAMD4A | sterile alpha motif domain containing 4A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT720275 | EIF1AD | eukaryotic translation initiation factor 1A domain containing | ![]() |
![]() |
2 | 2 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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