pre-miRNA Information | |
---|---|
pre-miRNA | hsa-mir-4316 |
Genomic Coordinates | chr17: 77396984 - 77397054 |
Description | Homo sapiens miR-4316 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Mature miRNA | hsa-miR-4316 | |||||||||
Sequence | 11| GGUGAGGCUAGCUGGUG |27 | |||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||
Experiments | SOLiD | |||||||||
SNPs in miRNA |
|
|||||||||
Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
---|---|
Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene Symbol | ACTG1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ACT, ACTG, DFNA20, DFNA26, HEL-176 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | actin gamma 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001614 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on ACTG1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of ACTG1 (miRNA target sites are highlighted) |
>ACTG1|NM_001614|3'UTR 1 ACGGACTCAGCAGATGCGTAGCATTTGCTGCATGGGTTAATTGAGAATAGAAATTTGCCCCTGGCAAATGCACACACCTC 81 ATGCTAGCCTCACGAAACTGGAATAAGCCTTCGAAAAGAAATTGTCCTTGAAGCTTGTATCTGATATCAGCACTGGATTG 161 TAGAACTTGTTGCTGATTTTGACCTTGTATTGAAGTTAACTGTTCCCCTTGGTATTTGTTTAATACCCTGTACATATCTT 241 TGAGTTCAACCTTTAGTACGTGTGGCTTGGTCACTTCGTGGCTAAGGTAAGAACGTGCTTGTGGAAGACAAGTCTGTGGC 321 TTGGTGAGTCTGTGTGGCCAGCAGCCTCTGATCTGTGCAGGGTATTAACGTGTCAGGGCTGAGTGTTCTGGGATTTCTCT 401 AGAGGCTGGCAAGAACCAGTTGTTTTGTCTTGCGGGTCTGTCAGGGTTGGAAAGTCCAAGCCGTAGGACCCAGTTTCCTT 481 TCTTAGCTGATGTCTTTGGCCAGAACACCGTGGGCTGTTACTTGCTTTGAGTTGGAAGCGGTTTGCATTTACGCCTGTAA 561 ATGTATTCATTCTTAATTTATGTAAGGTTTTTTTTGTACGCAATTCTCGATTCTTTGAAGAGATGACAACAAATTTTGGT 641 TTTCTACTGTTATGTGAGAACATTAGGCCCCAGCAACACGTCATTGTGTAAGGAAAAATAAAAGTGCTGCCGTAACCAAA 721 AAAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DRVs in gene 3'UTRs |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in gene 3'UTRs |
|